实验室信息管理系统(LIMS)
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1.实验室信息管理系统(LIMS)主要功能
1)样品的管理(Sample Management)
是指样品进入实验室到分配检测项目直至完成并认可检测结果出具证书的过程。样品被登录到LIMS 后,系统将严格按照预先定义好的有关规范对其实行管理。样品登录后,系统将自动分配一个按照一定规则命名的sample ID作为该样品在实验室中唯一的标识,并打印出条码。所有与样品有关的信息在样品登录时都将被记录下来,如送样单位付款单位接收报告单位的信息、需要出报告的日期、检测的项目及要求、样品的状态及描述、接收样品的日期部门及人员等。样品登陆后,根据检测项目的不同会自动给相关的技术小组下达工作任务,即自动分配样品。检测结果可以从仪器直接传输或者人工键盘输入,并且会有三级审核认可的过程,只有通过认可的结果才可以进行发布和产生分析证书。
2) 质量控制的管理(Quality Control Management)
LIMS 应该提供相关的功能模块为实验室建立一套完善的质量管理体系,对影响实验室质量的诸要素进行有效的管理和控制,并严格规范实验室的标准操作流程(SOP)。为了保证分析数据的准确性、分析结果的可靠性和监测测试仪器的稳定性,过程质量控制中的数据进行统计分析。并通过对质控样品的数据分析,自动评价实验室总体或者个体的质量状况。通过对一定时间内样品关键质量数据的分析,预测其质量的趋势。
3) 仪器集成(Instrument Interface)
将测试仪器跟LIMS 集成,实现从测试仪器到LIMS 的自动数据传输代替测试和质量控制结果的键盘输入,从而大大提高工作的效率和减少错误率,缩短样品在实验室中的生命周期。
4)统计报表。
提供报表软件,生成准确反应实验室需求的报表,包括统计、计算等。通过开放式数据库连接,同时保持数据的一致性和安全性。
5) 厂家的管理。
包括厂家基本信息、厂家意见反馈、厂家送样历史记录、厂家样品监测信息、厂家与实验室业务往来统计、费用统计和厂家信誉额度等信息。
6)实验室资源的管理。
包括对实验室人员、分析检测仪器和相关设备、检测报告、供应商的管理,从而实现对实验室的全面管理。
7)安全管理。
主要是指防止信息泄露给未授权的用户(或者攻击者),并且保证数据的完整性和可用性。完整性是指防止信息被未授权用户更改;可用性是指不拒绝授权用户的访问。并且具有审计跟踪的功能,即系统对关键的数据进行审核,自动记录什么人在什么时候因为什么原因修改了何种数据,从而保证数据的可追溯性。
根据上述需求分析,LIMS 项目主要可划分为以下四个模块,可以按照实施计划安排实施。
1) 业务流程模块
包括样品登录,检测项目的分配,样品的处理,仪器分析,结果输入和审核,证书的生成与发布。主要是围绕样品及检测结果的管理。
2)仪器连接
主要功能是连接LIMS 与实验室内重要测试仪器,用于提取实验结果。
3) 实验室内部管理模块
包括样品的财务核算,仪器设备的管理,厂家信息的维护,质量控制体系的质量保证,以及整个系统的安全设置(包括系统安全和应用程序安全)。
4) 信息查询模块
主要功能就是对LIMS 系统应用后产生的数据资源进行开发和利用,为实验室的日常运行提供报表材料,为决策层的决策提供数据支持,为实验室的质量体系提供保障。
在该LIMS 中,样品的管理系统为核心部分。围绕样品的管理,为了保证分析结果的准确及时地发送给厂家,该系统提供了实验室内部的管理块。不管对于实际的实验操作人员还是对于实验室的决策层来说,基于实验室数据的查询时不可或缺的工具。
4.样品工作流设计和实现
为了规范样品检测分析的工作流程,对样品分析的每一个环节进行监控和管理,减少人为因素造成的分析误差,提高样品分析质量和人员工作效率,建立起一套完善的质量保证体系,对影响实验室质量的要素进行有效的管理和控制,并严格规范实验室的操作规程,采用工作流技术,结合数据库技术和网络技术,对样品进行全方位的管理。从而建立一个以实验室为中心的管理体系,提供完善的质量保证体系,实现检验数据的网络化共享、无纸化记录与办公、资源与成本管理和人员量化考核,为实验室管理水平的整体提高和实验室全面管理提供先进的技术支持。
4.1 工作流概述
所谓工作流(workflow),是将实验室分析检测业务的部分或者整体在计算机应用环境下的自动化。即在网络、服务器、多台计算机厂家端和测试仪器的硬件平台上,样品检测业务过程按照预先设定的规则并借助应用程序和人对相关数据的处理而完成。例如,样品送到实验室后,需要先把样品的基本信息登录到LIMS 中,然后根据厂家要求把检测任务下达到各个技术小组,技术小组按照他们接收到的检测任务检测样品,并把检测结果输送给报告组成员,报告组把结果汇总并产生分析报告发送给厂家。这样,就形成了一个样品在实验室中的生命周期。对于这样的情况,我们可以使用工作流技术来控制和管理样品。这就可以称之为工作流。
4.2 检验业务流程的概述
LIMS采用先进的工作流技术,结合数据库技术和网络技术为实验室提供了一个对实验室各类工作尤其是分析测试业务进行全方位管理的一个平台。样品在系统中生命周期为: 样品登录、样品分配、样品分析、分析结果复核、报告生成、报告发布。该周期以实验室先进的管理经验为依据,结合样品在实验室中的实际检测流程而设计,从而实现样品从登录到报告输出的全过程实时监控。其业务流程如图4-3所示:
图4-3:实验室工作流
4.2.1 样品登录
样品登录是实验室工作流的第一步,也是非常关键的一步。登录样品的目的是为了实现样品的追踪和样品的管理。样品登录要求在友好的人机界面下快速、方便地采集所有必要的信息。
顾名思义,在这个过程中将涉及样品信息的登记:记录谁在什么时候什么地点如何收到什么样的样品,这个样品来自哪个厂家,需要在什么时候提交给哪个厂家报告,该样品需要检测的项目是什么,等等。这些需要采集的信息是通过设置多个登录字段实现的。字段的类型包括字符型、数值型、布尔型、日期时间型、编码型和连接型这几种。样品登录并不是简单的数据录入,根据实验室的一些相关规定,样品在登录时需要进行如下计算和操作。
1)检查厂家信用额度