生物分析 圆二色光谱
简述圆二色谱的原理及应用
简述圆二色谱的原理及应用原理圆二色谱(Circular Dichroism,简称CD)是一种研究物质光学活性的技术。
其基本原理是通过测量样品对左旋光和右旋光的吸收差异,来研究物质结构和手性。
圆二色谱的原理主要涉及到电磁波的旋转和手性分子的相互作用。
电磁波可以被视为电场和磁场的横向振动,而这两个场的振动方向垂直于波传播方向。
在自由空间中,电磁波的电场和磁场是相互垂直、相互平行并且幅度相等的。
然而,在手性分子存在的情况下,电场和磁场的振动可能会被干扰,从而导致电磁波的旋转。
根据圆二色效应,左旋光和右旋光在经过手性分子样品后会发生旋光现象。
当左旋光与手性分子相互作用后,其振动面会发生旋转,而右旋光则会与之相反地发生旋转。
这种旋光现象称为旋光分散(Optical Rotation),而测量这种旋光差异的技术就是圆二色谱。
圆二色谱可以通过测量样品对左旋光和右旋光的吸收程度差异来分析和表征生物大分子、有机化合物和无机配合物的结构、构象和手性特征。
应用圆二色谱在化学、生物化学、生物医学和药物研发领域具有广泛的应用。
下面是一些常见的圆二色谱的应用:1.结构分析和构象研究:圆二色谱可以用来确定分子结构和构象。
根据样品测得的CD谱图,可以通过比对已知的标准谱图或者进行计算模拟,来推断分子的立体结构、构象和手性特征。
2.蛋白质折叠和结构变化:圆二色谱可用于研究蛋白质的二级结构、折叠状态和构象变化。
蛋白质的二级结构(如α-螺旋、β-折叠等)会对圆二色谱谱图产生特定的影响,因此可以通过分析谱图来了解蛋白质的结构信息。
3.酶的活性和结构:通过圆二色谱可以研究酶的结构和活性。
酶的结构与其功能密切相关,圆二色谱可以帮助研究人员揭示酶的结构与功能之间的关系,并优化酶的催化活性。
4.药物研发:圆二色谱在药物研发中发挥着重要作用。
通过对药物分子的圆二色谱谱图的分析,可以了解药物的结构、构象和活性与手性之间的关系,从而指导药物改良和设计。
圆二色谱和旋光谱概述
圆二色谱和旋光谱概述圆二色谱(circular dichroism spectroscopy,CD)是一种测量分子对具有不同方向旋转的圆偏振光吸收差异的技术。
它通过测量由物质吸收的左旋和右旋圆偏振光的差异,来研究物质的结构和构象。
圆二色谱的基本原理是Kirchhoff定律的直接应用,即分子的吸收光谱是由对电磁场的响应所导致的。
当吸收的光谱与光的旋转相耦合时,出现左旋和右旋圆二色效应。
圆二色谱实验通常通过使用圆偏振光源、样品和检测器组成。
光源通常是通过一个线性偏振器和一个相位均匀的偏振光源来产生的。
样品通常是通过溶液或薄膜的形式存在。
检测器用于测量透射或反射样品的圆二色信号。
测量得到的数据可以表示为贝尔系数,即偏振光旋转的绝对角度。
根据光谱的形状和幅度,可以分析物质的构象和结构。
旋光谱(optical rotation spectroscopy)是测量物质在其中一种溶剂中的光学旋转角度的技术。
它根据物质对线性偏振光的旋转效应研究物质的手性性质。
旋光谱原理是基于贝尔定律,该定律描述一个物质中的旋转既取决于溶液中物质的浓度,又取决于物质本身的旋转率。
旋光谱实验通常使用旋光仪进行测量。
旋光仪由一个光源、走样器、检测器和读数装置组成。
在实验中,光线通过一系列光学元件(如偏振器和波片)来形成线偏振光,然后通过待测物质样品,最后到达检测器。
读数装置可测量旋转对应的光强度变化,并通过校准数据来计算旋转角度。
圆二色谱和旋光谱在许多领域有着广泛的应用。
在有机化学中,它们被广泛用于研究手性分子、构象分析和反应动力学等。
在生物化学和生物物理学中,它们被用于研究蛋白质和核酸的结构和功能。
此外,圆二色谱和旋光谱还被应用于药物发现、金属络合物分析和环境监测等领域。
总之,圆二色谱和旋光谱是两种常用的分析技术,用于研究物质的光学性质和结构。
它们的基本原理和实验方法都是通过测量物质对光的旋转效应来实现的。
这些技术广泛应用于化学、生物学和医药等领域,为科学家研究和理解物质的性质和行为提供了重要工具。
圆二色谱
圆二色谱圆二色谱是一种特殊的吸收普,它对手性分子的构象十分敏感,因此它是最重要的光谱实验之一。
手性是物质结构中的重要特征,即具有不能重叠的三维镜像对映异构体,它们的分子式完全相同,但其中原子或原子基团在空间的配置不同,互为镜像。
凡手性分子都具有光学活性,即可使偏振光的振动面发生旋转。
许多有机物和络合物都具有手性,它们的对映异构体物理化学性质(熔点、沸点、旋光度、溶解度、分子式等)几乎完全相同,但它们的旋光方向相反,生理作用大不相同。
生物基础分子一般都具有手性,也都具有光学活性。
在对生物分子手性的研究中,发现了令人惊异至今不解的对称性破缺现象,那就是在自然界中,氨基酸有L型和D型两种对映异构体,天然糖也有L糖和D糖两种糖。
但在生物体中,组成蛋白质的20种氨基酸,除最简单的甘氨酸不具有手性外,其余都是L型的,而生物体核酸中的糖环则都是D型的。
生物体中这种对称性破缺现象是有特殊意义的自然现象。
手性分子都具有光学活性。
当单色左旋与右旋的圆偏振光通过某一种手性样品时,该样品对左、右旋圆偏振光的吸收不同,这叫做圆二色性。
其差值△A=△AL一△AR称为圆二色值,按波长扫描就得到了圆二色谱(CD谱)。
利用法拉第效应,在外加磁场作用下,许多原来没有光学活性的物质也具有了光学活性,原来可测出CD谱的在磁场中CD信号将增大几个量级。
这种条件下即可测得磁圆二色谱(MCD谱)。
CD和MCD是特殊的吸收谱,它们比一般的吸收谱弱几个量级,但由于它们对分子结构十分敏感,因此近十几年来,CD和MCD 已成为研究分子构型和分子间相互作用的最重要的光谱实验之一。
利用CD和MCD 研究生物大分子和药物分子,具有重要的科学意义和实用价值。
基本定义和原理一束平面偏振光通过光学活性分子后,由于左、右圆偏振光的折射率不同,偏振面将旋转一定的角度,这种现象称为旋光,偏振面旋转的角度称为旋光度。
朝光源看,偏振面按顺时针方向旋转的,称为右旋,用“+”号表示;偏振面按逆时针方向旋转的,称为左旋,用“-”号表示。
CD圆二色谱解读:探索生物大分子结构之谜
CD圆二色谱解读:探索生物大分子结构之谜一、圆二色谱的神秘面纱圆二色谱(Circular Dichroism,简称CD)是一种光谱学方法,用于研究生物大分子(如蛋白质和核酸)的结构。
它的原理是基于生物大分子对左旋和右旋偏振光的吸收差异。
这种差异反映了生物大分子的立体结构,因此,CD圆二色谱被广泛应用于生物制药分析领域。
二、CD圆二色谱的工作原理CD圆二色谱的工作原理是基于生物大分子的手性。
手性是一种物质的基本性质,表现为对左旋和右旋偏振光的吸收差异。
生物大分子(如蛋白质和核酸)都具有手性,因此,通过测量其对左旋和右旋偏振光的吸收差异,可以获取其立体结构信息。
三、CD圆二色谱的应用CD圆二色谱的应用非常广泛,主要用于生物大分子的结构研究。
例如,通过CD圆二色谱,我们可以确定蛋白质的二级结构,包括α-螺旋、β-折叠和随机卷曲等。
此外,CD圆二色谱还可以用于研究蛋白质的热稳定性、酶活性、配体结合等性质。
四、CD圆二色谱的优势CD圆二色谱的优势在于其简单、快速和无损。
首先,CD圆二色谱的操作简单,只需要将样品溶解在适当的溶剂中,然后通过光谱仪进行测量。
其次,CD圆二色谱的测量速度快,一般只需要几分钟就可以完成。
最后,CD圆二色谱是一种无损检测方法,不会对样品造成损害,因此,可以用于研究生物大分子的动态过程。
五、CD圆二色谱的挑战与未来尽管CD圆二色谱具有许多优势,但也面临一些挑战。
例如,CD圆二色谱对样品的浓度和纯度要求较高,对于浓度低或杂质多的样品,可能无法获得准确的结果。
此外,CD圆二色谱只能提供生物大分子的平均结构信息,无法获取其具体的三维结构。
然而,随着科技的进步,我们有理由相信,CD圆二色谱的应用将更加广泛。
例如,通过结合其他技术(如核磁共振和X射线晶体学),我们可以获取生物大分子的更详细的结构信息。
此外,通过改进光谱仪的设计和优化测量方法,我们可以提高CD圆二色谱的灵敏度和准确性。
图1。
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圆二色光谱仪(cd)表征
圆二色光谱仪(cd)表征
圆二色光谱仪(CD)表征是一种用于研究分子结构和构象,分析
蛋白质、核酸等生物大分子二级结构的高分辨率技术。
CD技术最早应
用于化学领域,如化学键反应的研究,现已广泛应用于生物学、药物学、医学和材料科学等领域。
基本原理:
CD是强度吸收差谱测量技术,利用手性分子(不能跟其镜像重合的化
合物)的特性,根据其在右旋偏振光和左旋偏振光的不同吸收,来研
究分子的构象。
CD谱从波长190-320 nm可见,用强度差Δ A(CD)
或直接CD值来描述。
实验步骤:
1. 样品制备:将样品置于薄膜中,厚度约为0.1 mm,避免空气泡存在。
2. 光路检查:将样品放入样品室中,进行波长和基线的设置。
3. 监测:加入滴定管,记录CD强度吸收差随波长的变化。
4. 数据分析:通过CD曲线分析获得蛋白质、核酸等分子的二级结构信息。
应用领域:
1. 生物学领域:通过CD表征技术,可分析蛋白质的二级结构、折叠及稳定性等特性,还可以分析酶、抗体、肽、鸟苷酸等分子的构象。
2. 药物学领域:CD表征技术可用于研究药物与其靶点的相互作用,交
互作用、配基特征和构象等。
3. 材料科学领域:CD技术可用于研究由低分子化合物构成的配合物,聚合物和纳米粒子等材料的超分子组装过程。
总结:
CD表征技术是研究大分子结构与构象的重要方法,其广泛的应用领域包括生物学、药物学、医学和材料科学等领域。
通过CD分析获得的分子结构与构象信息对新药研究、药物设计和新材料的开发具有重要的指导意义。
圆二色光谱原理
圆二色光谱原理
圆二色光谱(Circular Dichroism Spectra,CD)是一种基于光学原理的分析技术,用于研究物质的立体结构及其变化。
它是一种非常有用的物理技术,被广泛应用于化学、生物、材料科学等领域。
圆二色光谱仪原理:
采用特性少高効率的28度入射角干涉仪、集光効率高的光学系、扫除双折射元件的反射光学系,高精度控制光轴,经过控制伪影和经时变化使设备始终保持状况。
圆二色光谱由适合VCD的演算法的DSP确定检测功用、完成了信噪比的大幅度改善,经过运用只透过VCD光谱测量目标吸收带的窄带滤光片,可以测得现有办法测不到的细小波峰。
运用圆二色光谱仪运用注意事项:
1、仪器产生毛病时应及时报告技术人员处理.仪器产生异常现象时,马上封闭电源,保护现场并及时上报。
2、不乱按键盘,操作人员不得进入操作规程规则以外的任何程序,不得按规则以外的任何功用键.卸下火花台板时要轻拿轻放,避免内外表划伤.取出火花室内圆石英垫片和玻璃套管时必须谨慎当心,避免操作不当致其破碎。
3、压样品夹子要笔直,不得在未夹好样品时按激起键,不得在激起时接触或抬起样品夹.假如遇到激起时声响很大,应该按F3键中止,不允许直接抬起样品夹,不然易造成电路板焚毁。
4、激起样品后在火花台内产生黑色沉积物可导致电极与火花台之间短路,所以火花台应定期清理。
5、非岗位人员不得随意进入机房,机房内制止吸烟,吃食物。
6、假如遇到突然断电时,应先关总,再将其它电源封闭,等到来电后,按规程条款进行开机操作。
圆二色谱总结
圆二色谱总结圆二色谱是一种常用于研究分子结构和性质的重要工具,特别是在物理、化学、生物学以及材料科学等领域。
它利用偏振光通过样品时产生的圆偏振光变化来测量样品的光谱特性。
以下是关于圆二色谱的一些总结:1.圆二色谱的定义和原理圆二色谱(Circular Dichroism,CD)是一种测量左旋和右旋偏振光通过样品后的透过率差别的技术。
当偏振光通过一个含有手性分子的样品时,它会发生旋光,即偏振面会旋转。
通过测量旋光度,可以确定分子的手性及其结构。
2.圆二色谱的应用圆二色谱被广泛应用于各种科学领域。
例如,在生物学中,CD被用于研究蛋白质和DNA的结构和动力学。
在化学中,它被用于研究有机化合物的手性和分子结构。
在材料科学中,CD被用于研究纳米材料和功能材料的光学特性。
3.圆二色谱的优势和局限性圆二色谱有以下几个优势:(1)灵敏度高:可以检测到样品中微小的旋光度变化,从而可以研究分子结构和动力学。
(2)分辨率高:可以区分不同的手性分子,这对于研究分子结构和手性之间的关系非常重要。
(3)无损检测:不会对样品造成破坏,因此可以用于研究生物样品和其他易损坏的样品。
然而,圆二色谱也存在一些局限性:(1)需要大量的样品:通常需要大量的样品才能获得可靠的CD谱图。
(2)需要专业的技术人员:需要进行CD测量的实验需要专业的技术人员进行操作和维护。
4.圆二色谱的发展趋势近年来,圆二色谱技术不断发展,出现了许多新的技术和发展趋势,如:(1)高精度CD测量技术:随着技术的进步,现在可以获得更高的测量精度和分辨率,从而能够更深入地研究分子的结构和动力学。
(2)CD与其他谱图的联用技术:可以将CD与其他谱图技术联用,如红外光谱、核磁共振谱等,从而可以从多个角度研究分子的结构和性质。
(3)CD在生物医学中的应用:CD可以用于研究生物分子的结构和动力学,从而可以应用于生物医学领域,如药物筛选、疾病诊断和治疗等。
(4)CD在材料科学中的应用:通过CD可以研究纳米材料、功能材料的光学特性,为材料科学的发展提供新的工具。
圆二色谱的原理及其应用pdf
圆二色谱的原理及其应用一、圆二色谱的原理圆二色谱是一种分析化学技术,用于测定物质的旋光性质。
它在药学、化学和生物学等领域有着广泛的应用。
圆二色谱原理基于物质分子对左旋光和右旋光的吸收性差异。
圆二色谱利用圆二色变化测定物质对圆偏振光的旋光角度和吸收度的关系。
当线偏振光通过样品时,正交两个互相垂直的圆偏振分量,产生旋光现象。
如果样品吸收左旋光的圆偏振分量多于右旋光的圆偏振分量,样品会产生负圆二色变化。
相反,如果样品吸收右旋光的圆偏振分量多于左旋光的圆偏振分量,样品会产生正圆二色变化。
圆二色谱测定的结果可用光谱表示,通常为色散图。
色散图由圆二色变化在不同波长处的数值表示。
通过分析色散图,可以确定物质的结构、构型以及与其他分子间的相互作用。
二、圆二色谱的应用圆二色谱有广泛的应用领域,下面列举了几个常见的应用方面:1. 蛋白质结构研究圆二色谱在蛋白质结构研究中扮演着重要角色。
蛋白质的结构与功能密切相关,圆二色谱可以提供关于蛋白质二级结构的信息,如α-螺旋、β-折叠等。
通过圆二色谱的测定,可以确定蛋白质的二级结构比例,从而推测蛋白质的折叠状态和功能。
2. 药物研究和分析圆二色谱在药物研究和分析中也得到了广泛应用。
通过圆二色谱的测定,可以研究药物与其他分子之间的相互作用,从而帮助优化药物设计和药物疗效评估。
3. 分子手性性质研究圆二色谱可用于分析分子的手性性质。
手性是化学物质的一种重要性质,与其生物活性、药物活性以及光学性质相关。
圆二色谱可以通过测定物质对旋光的吸收情况,从而确定其手性性质。
4. 化学反应动力学研究圆二色谱在化学反应动力学研究中起到了重要作用。
通过测定反应过程中圆二色变化的特征,可以研究反应的速度和路径,并推断反应机理。
三、使用圆二色谱的注意事项使用圆二色谱时,需要注意以下几点:1.样品准备:样品的纯度和浓度对测定结果有重要影响。
样品应尽可能纯净,并适当稀释,以避免吸光度过高引起的光散射效应。
生物大分子的构成奥秘:圆二色光谱测什么?
生物大分子的构成奥秘:圆二色光谱测什么?生物大分子是构成生命体的基本组成部分,对于研究生物学和药物研发具有重要意义。
然而,了解生物大分子的结构和构成并不容易。
在这方面,圆二色光谱技术为我们提供了一种强大的工具,可以帮助我们揭示生物大分子的奥秘。
本文将介绍圆二色光谱的原理、应用和意义。
1. 圆二色光谱的原理圆二色光谱是一种通过测量分子对圆偏振光的吸收来研究分子结构的技术。
它利用了生物大分子的手性性质,即分子的立体构型不对称性。
生物大分子如蛋白质、核酸和多糖都具有手性结构,因此它们对圆偏振光的吸收会产生旋光现象。
圆二色光谱仪通过向样品中传入圆偏振光,并测量透射光的旋光角度来获得样品的圆二色谱。
根据旋光角度的正负和大小,可以推断出样品中手性分子的含量和立体构型。
2. 圆二色光谱的应用2.1 蛋白质结构研究蛋白质是生物体内最重要的大分子之一,其结构与功能密切相关。
圆二色光谱可以用于研究蛋白质的二级结构,如α-螺旋、β-折叠和无规卷曲等。
通过分析圆二色谱图,我们可以了解蛋白质的结构特征,进而推断其功能和相互作用。
图1。
2.2 药物研发圆二色光谱在药物研发中也发挥着重要作用。
许多药物靶点是蛋白质,了解药物与蛋白质的相互作用对于药物设计和优化至关重要。
圆二色光谱可以帮助研究人员确定药物与蛋白质结合的方式和强度,从而指导药物研发过程。
2.3 生物大分子工程生物大分子工程是一种利用基因工程技术改造生物大分子的方法。
圆二色光谱可以用于监测和评估生物大分子工程过程中的结构变化。
通过比较圆二色谱图,我们可以判断工程后的生物大分子是否具有所需的结构和功能。
3. 圆二色光谱的意义圆二色光谱作为一种非破坏性、快速、灵敏的分析技术,对于生物大分子的研究具有重要意义。
首先,圆二色光谱可以提供关于生物大分子结构的直接信息。
通过分析圆二色谱图,我们可以了解生物大分子的二级结构、手性性质和立体构型,为我们深入理解生物大分子的功能和相互作用提供了重要线索。
圆二色谱解析
圆二色谱解析
圆二色谱是一种光谱分析技术,它利用物质对偏振光的旋转来确定样品的结构和组成。
圆二色谱常用于分析有机分子、生物大分子和无机化合物等。
在圆二色谱中,样品的旋光率会随着波长而变化,这与其分子结构和构象有关。
通过将样品的圆二色光谱与已知物质的光谱进行比较,可以确定样品的构象和组成。
圆二色谱解析需要一定的理论基础和实验技术。
在理论上,需要理解光的偏振现象、圆二色光的产生机制以及分子构象与圆二色光谱之间的关系。
在实验上,需要掌握光学仪器的使用方法,制备高质量的样品以及正确的数据处理和分析技能。
圆二色谱解析在化学、生物学、医学等领域中具有广泛的应用。
例如,在药物研发中,圆二色谱可以用于确定药物的构象和药效,从而指导药物设计和优化。
在生物大分子结构研究中,圆二色谱可以用于确定蛋白质和核酸的二级结构和折叠状态,以及其与配体的相互作用等。
总之,圆二色谱解析是一种重要的光谱分析技术,它在化学、生物学、医学等领域中具有广泛的应用前景。
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第五章 圆二色分析
实用仪器分析
2. 电子圆二色仪器
第五章 圆二色光谱
实用仪器分析
3. CD仪器组成图
第五章 圆二色光谱
基线平直度 :180~700nm 范围内 ≤±6m°波长 :180nm~ 300nm 300nm~500nm, 500nm~700nm 圆二色CD值 : 在 290nm处椭圆度1. 振动圆二色谱:红外光区频率下的圆二色 (Vibrational Circular Dichroism, VCD).
相对于ECD 优点 (1) 最大优势:丌需要分子中含有生色团 (紫外吸收), 几乎 所有手性分子都在红外区有吸收, 都会产生VCD 谱图。 (2)丌需要化合物有紫外吸收, 应用范围极广。 (3)相对于ECD, VCD 谱峰较窄, 信号丰富, 更容易判断。 (4)ECD计算的是分子在激収态的能量, VCD计算的是分子 在基态下的振动, 从目前计算化学的能力方面考虑, 计算VCD 更加准确。
旋光 (OR): 平面偏振光通过手性物质时,偏振面会发生旋转,即该物 质具有旋光性,旋转的角度。习惯上用(+)号表示右旋物质,用(-) 号表示左旋物质。
旋光色散(ORD): 旋转角度与波长的函数关系.
实用仪器分析
第五章 圆二色光谱
6. ORD与CD光谱 同时产生。
包括同样的分子结构信息:光学活性 物质分子中的丌对称生色团。
圆二色和旋光区别和关联
a. 光学器件差别 ,b. 光学活性物质检测两种丌同方面
实用仪器分析
第五章 圆二色光谱
五. ECD圆二色光谱仪样品制备及数据分析
1. CD测试样品要求
液体样品
1. 样品必须透明,如有悬浮或沉淀,则需过滤或离心以除去
沉滤。2. 在测定的光谱范围内,吸光度值丌应超过2.0。最优
圆二色谱的原理和应用
圆二色谱的原理和应用圆二色谱(Circular Dichroism Spectroscopy)是一种通过测量手性分子与激光的相互作用,来研究手性分子结构和性质的光谱技术。
它基于手性分子对圆偏振光的吸收差异,利用光学器件将入射光分为正、左、右旋光,然后测量旋光对激光的吸收差异,从而得到圆二色性谱图。
圆二色谱可用于研究生物大分子的二级结构、酶的构象变化、药物的结构活性关系等。
圆二色谱的原理可以通过分子的对称性来解释。
对称的分子在空间中可以旋转,本质上不会影响分子的吸光性质;而非对称的手性分子则由于自然旋光性,导致与圆偏振光的相互作用非对称,因此会对圆偏振光产生不同程度的吸收。
这种吸收差异就是圆二色效应。
圆二色性谱图即表示不同波长下分子对左、右旋光的吸收差异。
圆二色谱在生物大分子研究中有广泛的应用。
其中最常见的应用是研究蛋白质的二级结构。
蛋白质的二级结构包括α-螺旋、β-折叠片和无规卷曲等结构,它们对圆偏振光的吸收差异是不同的。
通过测量蛋白质的圆二色性谱图,可以得到蛋白质的二级结构信息,如螺旋的含量、折叠片的组织方式等。
这对于理解蛋白质的结构和功能具有重要意义。
此外,圆二色谱还可用于研究酶的构象变化。
酶的活性往往与其构象密切相关,而构象的改变往往涉及手性分子的旋转、翻转等。
通过测量酶在不同状态下的圆二色性谱图,可以揭示酶的构象变化过程,从而理解其活性调控机制。
同时,圆二色谱也广泛应用于药物研发领域。
药物分子的立体构象与其生物活性关系密切。
通过评估固有光学活性和圆二色性谱图,可以对药物分子的立体异构体和手性纯度进行分析和鉴定。
这对于药物合成及临床治疗具有重要意义。
最后,圆二色谱还可用于研究核酸的结构和相互作用。
核酸是另一类重要的生物大分子,其圆二色性谱图可以用于研究RNA和DNA的三维结构及其与蛋白质、小分子药物等的相互作用。
总之,圆二色谱是一种重要的技术手段,通过测量手性分子对圆偏振光的吸收差异,可以研究生物大分子的二级结构、酶的构象变化和药物的立体构象等。
圆二色谱方法
圆二色谱方法一、基础知识介绍圆二色谱是一种用于研究分子旋光性的光谱技术,通过测量样品在圆偏振光照射下的吸收光谱,可以获得关于分子手性、构象和动态行为等信息。
圆二色谱广泛应用于化学、生物学、药学等领域。
二、实验原理当左旋圆偏振光和右旋圆偏振光以一定比例混合时,形成椭圆偏振光。
当这种椭圆偏振光通过手性分子时,左旋和右旋偏振光会被不同吸收,导致透射光的强度和旋光性发生变化。
通过测量透射光的强度和旋光性,可以获得样品的圆二色谱。
三、实验步骤1.准备样品:制备适当浓度的样品溶液,确保样品在手性环境中。
2.安装仪器:将样品放入圆二色谱仪器的样品池中,确保密封良好。
3.设定参数:设置实验参数,如波长范围、扫描速度等。
4.开始实验:启动仪器,开始测量样品的圆二色谱。
5.数据分析:处理实验数据,提取相关信息。
四、数据分析在圆二色谱实验中,通过测量透射光的强度和旋光性,可以绘制出样品的圆二色谱图。
通常情况下,圆二色谱图以波长为横坐标,以旋光度差值ΔOD(或ΔA)为纵坐标。
通过分析圆二色谱图的峰位、峰形和峰强等信息,可以推断出样品的构象、手性和动态行为等。
五、影响因素影响圆二色谱实验结果的因素很多,主要包括温度、浓度、溶剂极性等。
这些因素可能会影响分子的构象和手性,从而影响实验结果。
因此,在实验过程中需要控制这些因素,以确保实验结果的准确性。
六、应用领域圆二色谱方法在多个领域中有着广泛的应用,例如:在手性识别与拆分领域中,可以用于检测手性化合物的纯度;在化学反应监控领域中,可以用于研究化学反应的机理和动力学;在生物学领域中,可以用于研究生物分子的结构和功能等。
七、实验注意事项1.在实验过程中要保持恒温,避免温度波动对实验结果的影响。
2.确保样品的浓度和纯度符合要求,避免杂质干扰实验结果。
3.正确选择溶剂和浓度,以确保分子处于合适的构象状态。
4.在数据分析过程中要注意峰位的准确性,避免由于仪器噪声等因素引起的误差。
八、展望随着科技的不断发展和进步,圆二色谱方法的应用前景也越来越广泛。
圆二色谱
圆二色谱圆二色性(circular dichroism )对R和L两种圆偏振光吸收程度不同的现象。
这种吸收程度的不同与波长的关系称圆二色谱,是一种测定分子不对称结构的光谱法。
在分子生物学领域中主要用于测定蛋白质的立体结构,也可用来测定核酸和多糖的立体结构。
光是一种电磁波。
假如用电矢量来表示,光的前进就是由矢量端点在一特定的平面里沿正弦波运动的轨迹。
对于自然光讲,正弦波振动的平面是随机的。
如有一束光,它所有的电矢量的振动平面都是相互平行的,这种光称为平面偏振光。
有一种特殊的情况,光前进的过程中电矢量绕前进轴转动,若电矢量的绝对值不变,则运动轨迹的投影是一个圆,这时就变成圆偏振。
面对光前进的方向看去,电矢量端点的圆运动可以是顺时针方向的,也可以是逆时针方向的,因此圆偏振有R与L两种。
假如 L与 R两束圆偏振光在一起辐射,强度、速度、频率和位相都相同,它们就会叠合成一束平面偏振光。
如波长λ的L光和R光的光强度相等,在光学各向异性物质中传播某一距离后,它们的综合光将变成椭圆偏振光,椭圆的长轴处于两个圆偏振的电矢量相叠合的地方。
假如两个圆偏振的传播速度也不相同,而所经的途径与上述相同,则叠合的椭圆偏振光的长轴与上面所述的椭圆偏振光的长轴相夹θ角(图1)。
由不对称分子组成的物质是光学各向异性的,即L与R两束圆偏振光在这类物质中的传播速度不相等。
假如光学各向异性物质在某一波长λ有吸收,那将在该时对L光和R光有不同的吸收,如该物质的吸光率是A,而对L光和R光的吸光率是AL和AR,AL和AR的差ΔA=AL-AR,称为圆二色性。
从(图2)可看出,因光吸收不同而产生的椭圆的形状与ΔA有直接的关系。
θ称为椭圆值,也是一种定量描述圆二色性的单位。
在条件相同的情况下,θ=3300ΔA。
在蛋白质分子中,肽链的不同部分可分别形成α-螺旋、β-折叠、β-转角等特定的立体结构。
这些立体结构都是不对称的。
蛋白质的肽键在紫外185~240纳米处有光吸收,因此它在这一波长范围内有圆二色性。
圆二色谱 样品浓度
圆二色谱样品浓度圆二色谱(Circular Dichroism, CD)是一种分析物质二色性的光谱技术,可用于研究溶液中的生物大分子(如蛋白质、核酸)的结构、构象和相互作用等。
它利用分子在圆偏振光的吸收和旋光过程中选择性吸收或发生相位变化的特性,分析样品的色散谱线形状和吸光度差异,从而揭示其分子结构和构象信息。
圆二色谱技术可以提供一些与分子构象密切相关的信息,例如蛋白质二级结构、蛋白质折叠状态、蛋白质与核酸的相互作用等。
在药物研发过程中,圆二色谱可以用于确定药物与蛋白质或核酸的结合位点、研究蛋白质或核酸突变对结构的影响、分析药物与蛋白质之间的相互作用、筛选化合物库中的潜在药物分子等。
在进行圆二色谱实验时,样品浓度是一个重要的因素。
样品浓度的选择需要根据样品的性质、测量方法和光程长度等因素来确定。
一般来说,较高的样品浓度可以提高实验的信噪比,但过高的浓度可能会引起样品的光学厌氧作用。
而较低的样品浓度则可能导致测量结果的不准确性。
在圆二色谱实验中,通常会选择适当的光程长度以使样品的浓度在合适的范围内,以获得较好的测量结果。
通常情况下,样品的浓度一般在0.1-1 mg/mL之间,具体浓度的选择需要根据不同的样品特性和实验需求来确定。
对于蛋白质样品的圆二色谱测量,一般需要在较低的浓度下进行,以避免样品的聚集和光学效应对测量结果的影响。
蛋白质的浓度通常在0.1-0.5 mg/mL之间,但具体的浓度选择还要根据不同的蛋白质和实验条件来确定。
对于核酸样品的圆二色谱测量,通常也需要在较低的浓度下进行。
核酸的浓度一般在0.05-0.1 mg/mL之间,具体浓度的选择也要根据不同的核酸和实验需求来确定。
在样品浓度的选择过程中,还需要考虑样品的溶液环境,例如溶剂和缓冲液的选择,以及样品的纯度和稳定性等因素。
这些因素都可能对圆二色谱实验的结果产生影响,因此在样品浓度的选择上需要进行一定的优化和调节。
总之,样品浓度是圆二色谱实验中一个重要的参数,合适的样品浓度可以保证实验结果的准确性和可靠性。
生物分析 圆二色光谱
圆二色光谱分析法引言五十年代初,生物学研究从宏观领域深入到微观领域,开创了分子生物学的新时代。
随着研究的不断深入和发展,生物学已发展成最活跃的学科之一。
手性(Chirality)是物质结构中的重要特征.即具有不能重叠的三维镜像对映异构体,它们的分子式完全相同,但其中原子或原子基团在空间的配置不同,互为镜像。
凡手性分子都具有光学活性,即可使偏振光的振动面发生旋转。
生物基础分子一般都具有手性,也都具有光学活性。
在自然界中,氨基酸有L型和D型两种对映异构体,组成蛋白质的20种氨基酸,除最简单的甘氨酸不具有手性外,其余都是L型的[1]。
手性分子都具有光学活性。
当单色左旋与右旋的圆偏振光通过某一种手性样品时,该样品对左、右旋圆偏振光的吸收不同,这叫做圆二色性(Circular Dichroism)。
其差值△A=△A L-△A R称为圆二色值,按波长扫描就得到了圆二色谱(CD谱)。
CD谱是特殊的吸收谱,它比一般的吸收谱弱几个量级,但由于它对分子结构十分敏感,因此近十几年来,CD已成为研究分子构型(象)和分子间相互作用的最重要的光谱实验之一。
利用CD研究生物大分子和药物分子,具有重要的科学意义和实用价值[2,3]。
一、蛋白质的圆二色性蛋白质是由氨基酸通过肽键连接而成的具有特定结构的生物大分子。
蛋白质一般有一级结构、二级结构、超二级结构、结构域、三级结构和四级结构几个结构层次[4-6]。
在蛋白质或多肽中,主要的光活性基团是肽链骨架中的肽键、芳香氨基酸残基及二硫桥键。
当平面圆偏振光通过这些光活性的生色基团时,光活性中心对平面圆偏振光中的左、右圆偏振光的吸收不相同,产生的吸收差值,由于这种吸收差的存在,造成了偏振光矢量的振幅差,圆偏振光变成了椭圆偏振光,这就是蛋白质的圆二色性。
圆二色性的大小常用摩尔消光系数差△ (M-1 ·cm-1 )来度量。
蛋白质的CD光谱一般分为两个波长范围,即178—250 nm为远紫外区CD光谱,250—320 nm为近紫外区CD光谱, 具有不同二级结构的蛋白质或多肽所产生CD谱带的位置、吸收的强弱都不相同。
圆二色性CD光谱的制备与实验步骤是什么?
圆二色性CD光谱的制备与实验步骤是什么?1. 引言圆二色性CD(Circular Dichroism)光谱是一种重要的生物物理学技术,用于研究生物分子的结构和构象变化。
它通过测量左旋和右旋圆偏振光的吸收差异,提供了关于分子的手性和构象信息。
本文将介绍圆二色性CD光谱的制备与实验步骤。
2. 实验仪器与试剂准备在进行圆二色性CD光谱实验之前,我们需要准备以下仪器和试剂:2.1 圆二色仪。
圆二色仪是进行CD光谱实验的关键仪器,它能够发射圆偏振光并测量样品对不同波长的圆偏振光的吸收差异。
选择合适的圆二色仪对于获得准确的CD光谱数据至关重要。
2.2 样品溶液。
选择适当的样品溶液是进行CD光谱实验的关键。
通常情况下,生物大分子如蛋白质、核酸等需要在缓冲溶液中进行测量,以保持其稳定性和活性。
2.3 光学比色皿。
光学比色皿是用于容纳样品溶液的容器,它需要具备良好的光学透明性和化学稳定性,以确保测量的准确性和重复性。
3. 实验步骤进行圆二色性CD光谱实验的步骤如下:3.1 样品制备。
首先,准备所需的样品溶液。
根据实验需要,选择合适的缓冲溶液,并将样品溶解在其中。
确保样品溶液的浓度适当,以获得清晰的CD光谱信号。
3.2 样品装载。
将样品溶液转移到光学比色皿中。
确保光学比色皿干净,并避免产生气泡或污染物,以免影响测量结果。
3.3 仪器校准。
在进行实际测量之前,需要对圆二色仪进行校准。
校准过程通常包括空白测量和参考物质测量,以确保测量结果的准确性和可靠性。
3.4 测量参数设置。
根据实验需要,设置合适的测量参数。
这包括选择合适的波长范围、扫描速度和光强等参数,以获得最佳的CD光谱信号。
3.5 开始测量。
将光学比色皿放入圆二色仪中,并开始测量。
仪器将发射圆偏振光并测量样品对不同波长的圆偏振光的吸收差异。
测量过程中,保持样品溶液的稳定性和温度一致性。
3.6 数据分析。
测量完成后,将得到的CD光谱数据导出并进行分析。
常见的数据分析方法包括曲线拟合、峰位和峰形分析等,以获得关于样品的结构和构象信息。
测定圆二色谱的样品前处理
百泰派克生物科技
测定圆二色谱的样品前处理
圆二色谱即圆二色光谱,是一项依据光学活性分子的圆二色性(circular dichroism,CD)发展而来的光谱分析技术。
光学活性分子具有不对称空间结构,当平面偏振光经过光活性物质时,其对左、右圆偏振光的吸收度不同,导致左、右圆偏振光变成椭圆偏振光,常用于解析这些分子的二级和三级构象。
大多数具有活性的生物大分子由于其不对称的空间结构都具有光学活性,均可作为圆二色谱研究的对象,如典型的蛋白质。
利用圆二色谱进行蛋白质或多肽结构分析时,首先要制备满足检测条件的样品,需要注意的是缓冲液的选择、蛋白浓度以及纯度。
圆二色谱通常以蛋白稀溶液为检测对象,因此需将蛋白样品完全溶解在缓冲液或溶剂中,使其形成均一、透明的蛋白溶液。
缓冲液和溶剂的选择特别重要,成分中应尽量避免任何含有光吸收的物质,以免产生杂信号造成实验误差。
最好选择透明性极好的磷酸盐和Tris-HCl等作为缓冲液。
此外,蛋白质/多肽的精确浓度是计算样品二级结构的关键,一般应保证蛋白/多肽的浓度不低于0.5 mg/mL。
样品不能添加任何保护剂或其它物质,蛋白/多肽纯度要在90%以上。
百泰派克生物科技基于圆二色谱分析提供蛋白空间构象分析服务技术包裹,包括蛋白二级、三级构象解析以及蛋白相互作用研究,欢迎免费咨询。
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圆二色光谱分析法
引言
五十年代初,生物学研究从宏观领域深入到微观领域,开创了分子生物学的新时代。
随着研究的不断深入和发展,生物学已发展成最活跃的学科之一。
手性(Chirality)是物质结构中的重要特征.即具有不能重叠的三维镜像对映异构体,它们的分子式完全相同,但其中原子或原子基团在空间的配置不同,互为镜像。
凡手性分子都具有光学活性,即可使偏振光的振动面发生旋转。
生物基础分子一般都具有手性,也都具有光学活性。
在自然界中,氨基酸有L型和D型两种对映异构体,组成蛋白质的20种氨基酸,除最简单的甘氨酸不具有手性外,其余都是L型的[1]。
手性分子都具有光学活性。
当单色左旋与右旋的圆偏振光通过某一种手性样品时,该样品对左、右旋圆偏振光的吸收不同,这叫做圆二色性(Circular Dichroism)。
其差值△A=△A L-△A R称为圆二色值,按波长扫描就得到了圆二色谱(CD谱)。
CD谱是特殊的吸收谱,它比一般的吸收谱弱几个量级,但由于它对分子结构
十分敏感,因此近十几年来,CD已成为研究分子构型(象)和分子间相互作用的最重要的光谱实验之一。
利用CD研究生物大分子和药物分子,具有重要的科学意义和实用价值[2,3]。
一、蛋白质的圆二色性
蛋白质是由氨基酸通过肽键连接而成的具有特定结构的生物大分子。
蛋白质一般有一级结构、二级结构、超二级结构、结构域、三级结构和四级结构几个结构层次[4-6]。
在蛋白质或多肽中,主要的光活性基团是肽链骨架中的肽键、芳香氨基酸残基及二硫桥键。
当平面圆偏振光通过这些光活性的生色基团时,光活性中心对平面圆偏振光中的左、右圆偏振光的吸收不相同,产生的吸收差值,由于这种吸收差的存在,造成了偏振光矢量的振幅差,圆偏振光变成了椭圆偏振光,这就是蛋白质的圆二色性。
圆二色性的大小常用摩尔消光系数差△ (M-1 ·cm-1 )来度量。
蛋白质的CD光谱一般分为两个波长范围,即178—250 nm为远紫外区CD
光谱,250—320 nm为近紫外区CD光谱, 具有不同二级结构的蛋白质或多肽所产生CD谱带的位置、吸收的强弱都不相同。
近紫外CD光谱的测量与远紫外CD测量相似,但近紫外CD光谱测量所需蛋白质溶液的浓度一般比远紫外CD测量高1~2个数量级,其测量可在1 cm的方形石英池中进行。
由于CD是一种定量的、灵敏的光谱技术。
所以,样品的准备及测量条件的选择对分析计算蛋白质构象的准确性至关重要,一般测试用的蛋白质样品中应避免含有光吸收的杂质,缓冲剂和溶剂在配制溶液前最好做单独的检查,透明性极好的磷酸盐可用作为缓冲体系。
CD光谱的测量一般在蛋白质含量相对低(0.0l-0.2
g/L)的稀溶液中进行,溶液最大的吸收不超过2。
稀溶液可减少蛋白质分子间的聚集。
但如果太稀,则导致蛋白质过多地吸附在容器壁上,影响实验的准确性。
二、远紫外CD分析蛋白质二级结构
远紫外CD分析蛋白质二级结构的方法,主要是运用计算机采用一定的拟合算法对CD数据进行加工处理,进而解析蛋白质二级结构。
远紫外区CD光谱主要反映肽键的圆二色性。
在蛋白质或多肽的规则二级结构中,肽键是高度有规律排列的,其排列的方向性决定了肽键能级跃迁的分裂情况。
单一波长常用于测定蛋白质或多肽由动力学或热力学引起的二级结构的变化。
α-螺旋结构在208及222nm有特征吸收峰,可以利用这两处的摩尔椭圆度[ θ]208或[θ]222来简单估计α-螺旋的含量[7]。
参考蛋白是拟合未知蛋白质远紫外CD二级结构的参考标准,参考蛋白的选取将影响CD拟合结果。
随着光学技术发展及同步加速器辐射圆二色(SRCD)光谱技术的发展,远紫外测量光谱可以拓宽到190nm以下的真空远紫外区。
由于这一CD光谱区域内,包含着更为丰富的蛋白质二级结构信息,这一光谱区域的参考蛋白质的圆二色光谱及拟合运算方法也已成为研究热点。
三、近紫外CD分析蛋白质三级结构
蛋白质中芳香氨基酸残基,如色氨酸(Trp)、酪氨酸(Tyr)、苯丙氨酸(Phe)及二硫键处于不对称微环境时,在近紫外区250~320nm,表现出CD信号[8]。
另外芳香氨基酸残基在远紫外光谱区也有CD信号;二硫键的变化信息反映在整个近紫外CD谱上。
实际的近紫外CD光谱形状与大小受蛋白质中芳香氨基酸的种类、所处环境(包括氢键、极性基团及极化率等)及空间位置结构(空间位置小于1nm的基
团形成偶极子,虽然这对CD光谱的贡献不是很明显)的影响。
近紫外CD光谱可作为一种灵敏的光谱探针,反映Trp、Tyr和Phe及二硫键所处微环境的扰动,能应用于研究蛋白质三级结构的精细变化。
总的来说,在250~280nm之间,由于芳香氨酸残基的侧链的谱峰常因微区特征的不同而改变,不同谱峰之间可能产生重叠。
Krell[9] 等研究了来自Streptomyces coelicolor的野生型与突变型dehydroquinase 的远紫外与近紫外CD光谱,结果表明,野生型与突变型dehydroquinase 的远紫外CD光谱几乎没有发生变化,即二级结构没有发生明显变化,而其近紫外CD光谱却发生较为明显的变化,即较之二级结构,突变型dehydroquinase 的三级结构可能发生了较为明显变化。
结语
综上所述,圆二色是研究溶液中蛋白质构象的一种快速、简单、较准确的方法,远紫外CD数据能快速地计算出溶液中蛋白质的二级结构;近紫外CD光谱可灵敏地反映出芳香氨基酸残基、二硫键的微环境变化,蕴含着丰富的蛋白质三级结构信息。
另外,CD光谱还能结合紫外、荧光等分析手段,了解蛋白质配体的相互作用,监测蛋白质分子在外界条件诱导下发生的构象变化,探讨蛋白质折叠、失活过程中的热力学与动力学等多方面的研究[10-12]。
随着CD光谱技术的进一步发展,它必将在蛋白质研究领域中发挥重要的作用。
文献参考
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