几种常用药动学计算软件介绍

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药代动力学数据处

药代动力学数据处
以最低剂量组的给药剂量及剂量依赖参数 AUC、Cmax为 对各剂量组给药剂量和AUC AUC、 AUC、Cmax为1,对各剂量组给药剂量和AUC、 Cmax进行折算,并作图, Cmax进行折算,并作图,对单次给药实验中 进行折算 氟非尼酮的AUC Cmax与剂量关系进行分析 AUC、 与剂量关系进行分析, 氟非尼酮的AUC、Cmax与剂量关系进行分析, 判断氟非尼酮在大鼠体内是否符合线性药动 学过程。 学过程。
录入窗口: 录入窗口: 录入一个研究对象的时间-浓度( 录入一个研究对象的时间-浓度(C-t)数据 浓度缺失数据置空 低于最低检测限的浓度不宜录入 结果输出: 结果输出: 可算出各种相关的药代参数及统计矩参数, 可算出各种相关的药代参数及统计矩参数, 两种参数均可选用或同时申报。 两种参数均可选用或同时申报。 智能化模型输出结果1 为最佳房室模型, 智能化模型输出结果1和2为最佳房室模型, 但权重系数不同, 但权重系数不同,可根据图中拟合线与实测 点的吻合程度选择。 点的吻合程度选择。 统计矩AUC按梯形法计算 按梯形法计算。 统计矩AUC按梯形法计算。
药代动力学数据处理与统计
一、简介DAS2.0药动学软件 简介DAS2.0 DAS2.0药动学软件 二、房室模型的选择 三、计算药动学参数与统计矩参数 四、线性药动学过程的判断
DAS(Drug And Statistics)统计软件简介: Statistics)统计软件简介 统计软件简介:
由安徽省药物临床评价中心开发, 由安徽省药物临床评价中心开发,最 新版本为2.0版 新版本为2.0版,在微软视窗下运行的 专业统计软件包。 专业统计软件包。 可完成临床前药学、 可完成临床前药学、药理以及临床新药 研究相关的各种统计计算, 研究相关的各种统计计算,计算结果直 接存EXCEL格式 格式。 接存EXCEL格式。

常用功能计算软件

常用功能计算软件

常用功能计算软件1. MATLAB(The MathWorks)MATLAB是一种强大的数值计算和科学工程计算软件,广泛应用于科学计算领域。

它具有丰富的数值计算、绘图和数据处理功能,可以进行矩阵运算、信号处理、图像处理等多种科学计算工作。

MATLAB还提供了大量的工具箱,如控制系统设计与分析工具箱、神经网络工具箱、图像处理工具箱等,方便用户进行更加专业和复杂的计算。

2. Mathematica(Wolfram Research)Mathematica是一款功能强大的数学软件,被广泛用于数学、物理、化学、生物学等多个学科的研究和教学中。

它提供了丰富的数学函数和符号计算能力,可以进行精确计算、数值计算、统计分析等各种数学运算。

同时,Mathematica还具有强大的绘图功能,可以绘制高质量的二维和三维图形。

3. Origin(OriginLab)Origin是一种用于数据分析和绘图的软件,被广泛应用于工程领域和科学研究中。

它提供了丰富的数据处理和统计分析功能,包括数据拟合、曲线拟合、统计检验等多种功能。

Origin还具有强大的绘图工具,支持二维和三维图形的绘制和定制,可以生成高质量的科学图表。

4. COMSOL Multiphysics(COMSOL)COMSOL Multiphysics是一种基于有限元方法的多物理场仿真软件,被广泛应用于科学和工程计算中。

它可以模拟和求解多个物理场的相互作用问题,如结构力学、电磁场、热传导等。

COMSOL Multiphysics提供了丰富的物理场模型和求解器,用户可以根据自己的需求进行模型的建立和仿真计算。

5.ANSYS(ANSYS)ANSYS是一款广泛应用于工程计算和结构分析中的有限元分析软件。

它可以对各种结构进行静态和动态的力学分析,包括线弹性分析、非线性分析、疲劳分析等。

ANSYS还支持多物理场耦合分析,如流固耦合、热固耦合等。

它提供了强大的建模和后处理功能,用户可以方便地进行模型的建立和结果的分析。

五种群体药动学分析工具计算结果的比较

五种群体药动学分析工具计算结果的比较

◇定量药理学◇摘要目的:比较群体药动学分析工具PhoenixNLME 、Monolix 、R 语言nlmixr 包和CPhaMAS 云平台所计算的结果与金标准NONMEM 的符合程度。

方法:基于一房室模型模拟50个稀疏采样数据集和二房室模型模拟50个密集采样数据集,分别使用上述五种分析工具计算,比较群体典型值、个体变异和个体药动学参数。

结果:CPhaMAS 和Phoenix NLME 计算的群体典型值、个体变异与NONMEM 的匹配程度最高,其次为nl-mixr ,Monolix 最低,但Monolix 和nlmixr 的算法可能更稳健。

清除率和分布容积的对应性优于吸收速率常数。

除了Monolix 计算的吸收速率常数和nlmixr 计算的房室间清除率,所有分析工具计算的个体药动学参数相关系数均大于0.99。

结论:上述四种群体药动学分析工具计算结果与NONMEM 的结果高度相关。

关键词群体药动学;NONMEM ;房室模型中图分类号:R969.1文献标志码:A文章编号:1009-2501(2023)05-0525-11doi :10.12092/j.issn.1009-2501.2023.05.006群体药动学(population pharmacokinetics ,PPK )理论从20世纪60年代发展至今,已得到各国学者和药政审评部门的认可和推荐,广泛应用于新药研发和临床个体化治疗,大大提高了新药的开发效率、优化了患者的治疗方案[1-4]。

1980年,Lewis B.Sheiner 和Stuart Beal 开发了首个群体药动学分析软件NONMEM (nonlinear mixed ef-fects model ),并不断改进升级,成为群体药动学分析的“金标准”软件[5]。

后续有商业公司开发了Phoenix NLME 和Monolix 等群体药动学分析软件[6-8],也有学者开发了开源的R 语言nlmixr 包计算群体药动学参数[9-10],我国学者近期研发了临床药理建模与统计云平台CPhaMAS ( )可用于群体药动学的分析。

学习软件推荐提升计算能力

学习软件推荐提升计算能力

学习软件推荐提升计算能力对于提升计算能力而言,学习软件是一种有效的辅助工具。

在如今数字化时代,计算能力已经成为了许多人职场和学业发展中的必备技能。

因此,选择适合自己的学习软件来提升计算能力,是非常重要的。

本文将为您推荐几款优秀的学习软件,并说明它们的特点和使用方法。

一、Wolfram AlphaWolfram Alpha是一款强大的计算引擎,被广泛用于数学、物理、化学等学科。

它可以解方程、计算函数图像、求导、积分等等,是一个理想的数学学习工具。

Wolfram Alpha还支持自然语言输入,用户可以直接提问问题,软件会给出详细的解答。

对于学生来说,使用Wolfram Alpha可以快速得到准确的计算结果,提高计算效率。

二、Khan AcademyKhan Academy是一家在线教育平台,提供各种学科的教学视频和练习题。

在数学方面,Khan Academy的课程内容涵盖从基础数学到高等数学的各个层次。

学生可以根据自己的水平进行学习和巩固,通过做题来提高计算能力。

Khan Academy还提供实时的学习进度记录和个性化的学习建议,帮助学生有针对性地提升自己的计算能力。

三、Microsoft Excel对于需要大量计算和数据处理的工作,Microsoft Excel是一个非常实用的软件。

它不仅可以进行基本的数学运算,还具备强大的数据分析和图表制作功能。

通过学习Excel的使用技巧,可以提高计算效率和数据处理能力。

例如,利用Excel的函数和公式,可以实现复杂的统计计算和数据可视化,帮助用户更好地理解和分析数据。

四、MATLABMATLAB是一款专业的数学软件,广泛应用于科学计算、工程仿真和数据分析等领域。

它提供了丰富的数学函数和工具箱,可以进行各种数学计算和数据处理操作。

MATLAB还具备良好的可视化功能,可以绘制高质量的数据图表。

对于需要进行复杂计算和科学研究的用户来说,MATLAB是一个强大而全面的学习软件。

基于农药毒力计算的6个统计分析软件比较

基于农药毒力计算的6个统计分析软件比较

基于农药毒力计算的6个统计分析软件比较常菊花;何月平【摘要】选用了能够用于农药毒力数据机率值分析的通用软件(SAS、SPSS和DPS)和专门程序(Polo、BA和EPA机率值分析程序),以二化螟对三唑磷的室内毒力数据为例,比较分析不同统计分析软件的计算结果.结果表明,当对照组死亡率为0时,6个软件程序计算得到的LD值(LD5 、LD50和LD95)、截距和斜率等基本相等,但是LD值的95%置信限有差异.当对照组死亡率不为0时,发现6个程序计算得到的毒力资料数值都有差异,其中LD(LD5 LD50和LD95)、截距和斜率的数值相差较小,但是LD值的95%置信限差异较大.【期刊名称】《安徽农业科学》【年(卷),期】2014(000)003【总页数】4页(P746-748,802)【关键词】SAS;SPSS;Polo;EPA;DPS;BA【作者】常菊花;何月平【作者单位】长江大学生命科学学院,湖北荆州434025;华中农业大学植物科学技术学院,湖北武汉430070【正文语种】中文【中图分类】S127在农药生物测定中,致死中量(LD50)或有效中量(ED50)和回归线的斜率(b值)是表示药剂对生物效力的代表性数值。

为了要测定LD50或b值,通常采用的统计分析方法是机率值分析法(Probit Analysis)[1]。

机率值分析法和计算致死中量的方法很多,但传统的手工计算方法十分复杂,不仅要花费大量时间,而且很容易出错。

随着电子计算机技术的发展,出现了不少软件或程序应用于生物测定数据的机率值分析和致死中量的计算,在很大程度上简化了运算程序[2-6]。

笔者采用机率值分析软件(Polo、BA、EPA)和生物统计软件(SPSS、SAS、DPS)计算农药毒力数据,比较分析不同程序的计算结果,拟推荐出可供广泛使用且结果精确的程序或软件用于生物测定数据的统计分析。

1.1 程序和测试数据以室内采用毛细管点滴法测定三唑磷对水稻二化螟幼虫的室内毒力数据为例(表1),采用SAS 8.1、SPSS 19.0、DPS 7.05版、PoloPlus (Probit and Logit Analysis, LeOra Software)、EPA (EPA probit analysis program used for calculation LC/EC values version 1.5)、BA(Bioassay Data Processing and Management System)6个统计分析软件,计算毒力回归方程、LD5、LD50、LD95 及其95%置信限,以及卡平方值和相关系数等,比较分析不同程序的计算结果。

两款药动学软件处理二室模型血管外给药数据对比分析

两款药动学软件处理二室模型血管外给药数据对比分析

两款药动学软件处理二室模型血管外给药数据对比分析目的开发计算机和信息技术促进药动学发展,为临床新药研究、药物相互作用研究、治疗药物监测、药品不良反应监查、药物经济学研究等提供重要的理论数据。

方法最小二乘法(线性回归)、残数法、最优初值法、同点重复法、Gauss-Newton、Levenberg-Marquardt法。

结果通过PK-N1软件处理的数据精度明显高于3p97。

结论PK-N1软件采取同点重复法是在分段计算中,段之间的交叉一点或书店重复使用,有效解决数据点不足而无法进行多室拟合的情况,使得药动学计算结果接近真实值,客观地描述了药物在体内的药动学过程。

[Abstract]ObjectiveDevelopment of computer and information technology to promote development of pharmacokinetic for clinical medicine,research,drug interaction and drug adverse drug reaction monitoring,monitoring,drug economics research provides important theoretical data etc.MethodsLeast squares method (linear regression),remnant number law,most superior starting value law,with redundant method,Gauss-Newton,Levenberg-Marquardt law.ResultsIs higher than 3p97 obviously through the PK-N1 software processing data precision.ConclusionThe PK-N1 software adopts with redundant method is in the partition computation,between the section overlapping point or the bookstore repeatedly use,the effective addressing data point insufficient is unable to carry on many room of fitting the situations,causes the medicine kinematics computed result close real value,described the medicine objectively in vivo medicine kinematics process.[Key words]Outside the two room of model blood vessel gives the medicine;Medicine kinematics;Remnant number law;3p97;PK-N13p97(practical pharmacokinetic program)实用药动学计算程序是中国药理学会数学专业委员会组织编写的药动学软件,能处理药动学中各种用药途径的线性和非线性药动学模型,给出有关药动学参数及各种图表的详细结果。

excel药动学计算

excel药动学计算

excel药动学计算Excel药动学计算是通过使用Microsoft Excel软件来计算药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄等过程。

药动学是药物在体内的动力学研究,是药学领域中的重要分支之一。

通过药动学计算可以了解药物在体内的行为,包括药物的吸收速度、分布范围、代谢速度和排泄速度等。

药动学计算可以使用Excel软件来简化和自动化计算过程。

Excel 软件提供了强大的数学和统计函数,可以方便地进行药动学参数的计算和数据的处理。

下面将介绍几个常见的药动学计算方法和在Excel 中的实现。

1.吸收过程计算:药物的吸收过程可以用一种常见的模型,即一室模型(One-compartment model)来描述。

在这种模型中,药物的血浆浓度随时间呈指数下降的趋势。

在Excel中可以通过指数函数EXP()和对数函数LN()来计算药物的血浆浓度。

2.分布体积计算:分布体积是描述药物分布范围的参数,可以用来估计药物在体内的分布情况。

在Excel中可以使用Excel提供的函数来计算分布体积,例如通过浓度除以药物的初始浓度(C0)来计算分布体积(Vd):Vd = C0 / C。

3.药物消除率计算:药物的消除速率很重要,可以用来估计药物的清除速度。

在Excel中可以使用回归分析函数来计算药物的消除速率,例如通过线性回归函数LINEST()来计算消除速率。

4.半衰期计算:药物的半衰期是描述药物血浆浓度下降一半所需的时间。

在Excel中可以通过半衰期公式来计算药物的半衰期,例如通过半衰期公式T1/2 = (0.693/k)来计算半衰期。

5.药物清除率计算:药物的清除率是描述药物在体内被清除的速度。

在Excel中可以通过清除率公式来计算药物的清除率,例如通过药物的总清除量除以时间和药物的分布体积来计算清除率。

以上只是几个常见的药动学计算方法的简单介绍,并且Excel提供了更多的函数和工具,可以根据具体的研究需要进行进一步的计算和分析。

药代动力学计算软件解析

药代动力学计算软件解析
非专业人员操作时,各种软件的房室模型 参数有差距 • 各软件都在不断改进算法,故试验报告和 研究论文应注明软件名称和版本号
药动学常规计算演示
• 房室模型确定 • 权重系数确定与调整 • 静注给药 • 静滴给药 • 非静脉给药 • 多次给药的稳态药动学
药动学疑难计算演示
• 线性判断 • 双峰与多峰动力学 • 尿药动力学 • 房室与非房室模型参数的比较与选择 • 计算数据的核查与数值单位的调整 • 计算数据点不足问题的处理
药代动力学计算软件演示
郑青山
主要计算软件
• WinNonlin • NONMEN • DAS (NDST升级版) •输出结果内容丰富 • 使用费高 • 英文界面,5.0.1版要求设置美国时间格式。
6.0版已推出 • 可自动给出计算初值,但此初值不佳时,
人工设置较难掌握,需专业人员使用 • 用户达到6000家
NONMEN
• 国际公认的群体药动学分析软件 • 可同时分析多个固定效应 • 个体药动学也可使用 • 操作极不友好 • 学习和计算耗时多 • 专业人员使用
DAS
• 国内PK和BE分析的主流软件 • 界面友好,仿例输入,操作极为方便 • 初值设置高度智能化,尾点回归高度智能
化 • 所有结果以图表形式直接输入Excel • 正在走向国际化,国际使用DAS的研究论
文逐年增加。3.0版将大举进入美欧等国际 市场 • 平均每天有1篇使用DAS的应用论文发表
不同软件输出结果比较
• 非房室模型的输出结果相同 • 理想的数据,各种软件的房室模型参数十
分接近 • 非理想的数据,由于初值设置不同等原因,
生物等效性计算演示
• 交叉设计 • 平行设计 • 原始数据计算 • 参数计算 • 设计与随机化方案

药物动力学常见参数及计算方法PK

药物动力学常见参数及计算方法PK
1
2
消除动力学模型
*
零级消除动力学
一级消除动力学 消除动力学(eliminationkinetics)研究体内药物浓度变化速率的规律,可用下列微分方程表示: dC/dt=-kCn
*
消除动力学模型
*
一级消除动力学
零级消除动力学
表达式
dc/dt=-kC
dc/dt=-k
积分转化
Ct=C0e-kt
Ct=C0-kt
体内总清除率
常见参数-体内总清除率
*
(total body clearance, TBCL, Cl):等于代谢清除率加肾清除率。
TBCL=A/AUC
01
02
*
生物利用度(bioavailability, F):
常见参数-生物利用度
*
F=(Div AUCoral / Doral AUCiv) 100%
*
药物动力学常用软件
*
先用典型或多点的数据选择最佳房室模型
注意合法性,合理性,公认性
NOLIN,NOMEM,3P87,3P97,NDST21,
再按此模型进行统一计算,求均数标准差
批处理
主要软件
DAS,APK…等软件
*
*
*
谢谢大家!
*
常见参数-生物半衰期
*
生物半衰期(biological half-life, t1/2):这个参数只是由测定血浆或血清浓度(表观血浆或血清)的衰变来求出。
t1/2=0.693/Ke
1
2
*
T曲线
lnC-T曲线
一室(少见) 二室(多数药物) 三室(与内源物相近者) 决定用药间隔的半衰期: 一室t1/2,二室t1/2β,三室t1/2γ 现主张统一用t1/2z 终末半衰期

药动学软件

药动学软件
药动学 数据的曲线拟合以及常用软件

动力学参数测定常用的方法是:
• 首先在用药后的若干不同时间,采取血样(或尿样),测 定其血药浓度值或尿中药量(这些数值称为实测值或观察 值,用Ci表示),这样就有了药物浓度经时曲线 经时曲线数据;然 经时曲线 后,依据半对数坐标图,选定一种模型方程(是时间t的 曲线函数)计算理论估算值(用 表示),按照观察值和理 论估算值之差的平方和(即残差平方和)或加权残差平方 和(均用Re表示)最小的原则,采用适当的算法,求出有关 的动力学参数。这种方法,在数学上称为曲线拟合(fitting a curve)。由于所采用的线性药代动力学的模型方程是多 指数项之和的函数形式,并且是所含动力学参数的非线性 函数,所以这种曲线拟合方法称为非线性最小二乘法。
WinNonlin软件使用过程中模型选择
WinNonlin软件使用过程中模型拟合中初值输 入对话框
• 3P87/3P97实用药动学计算程序 实用药动学计算程序
• 3P87/3P97(practical pharmacokinetic program) 实用药动学计算程序是中国药理学会数学专业委 员会受国家卫生部药品审评办公室的委托组织了 五个单位六位专家(张文贵、杨友春、汤仲明、刘 昌孝、孙瑞元、余志凌)集体编制的,在国内应用很 广。3P87/3P97可处理各种用药途径的线性和非 线性药动学模型,给出有关的药动学参数及各种图 表的详细结果。
• 并使y的观察值yi与理论估算值=iy)f(xi;a1, a2,…,am);(i=1,2,…,m)的误差平方和, 即残差平方和取得最小值,
• 或者加权残差平方和
• 取得最小值。其中wi称为权重系数。这时Re有时 候也称为目标函数
• 曲线拟合的目的是根据实验获得的数据去 建立因变量和自变量之间有效的函数关系, 这个函数关系对于药动学来讲就是通过房 室模型推导出来的药时曲线公式。根据观 察值求出待定参数(因而也就确定了曲线y =f(x;a1,a2,…,am))的问题。我 们称f(x;a1,a2,…,am)为拟合函数。 特别地,当f为x的线性函数时,则称为直线 拟合(或直线回归)。

PK PD软件介绍

PK PD软件介绍

PK PD软件介绍pkpd软件介绍PK药代动力学/pd药动学计算中常采用的数学模型有:1房室模型,包括线性和非线性房室模型;2非房室模型(统计矩法);3生理模型国内外大多数药代动力学应用都采用加权非线性最小二乘法进行曲线拟合,以计算准确合理的药代动力学参数。

线性药动学参数的计算方法主要有:单纯形法、高斯-牛顿迭代法、改进的高斯-牛顿迭代法,如Marquardt法和Hartley法。

制药模式:1。

线性模型;2对数模型;3.乙状体模型(希尔方程)PK-PD组合模型:当药理指标可以量化且药理作用与血药浓度相关时,该模型可同时用于研究体内PK、PD以及PK和PD之间的关系,计算出的PK参数可以直接代入相应的PD模型,从而同时获得药效学参数。

国外常见的PK/PD应用1nonlin系列pk/pd程序:nonlin,pcnonlin,winnonlinpcnonlin是目前国际上应用最广的pk/pd程序,可用于所有非线性数学模型的计算处理,包括19种线性房室模型、4种非线性房室模型、3种非房室模型及8种药学模型;在计算方法上,有simplex、hartley及levenberg等3种加权非线性最小二乘法,以进行曲线拟合及参数的计算;还有数学模拟功能,在不同的给药剂量和模型参数条件下模拟药物在体内的变化过程,预测剂量改变后的药-时曲线,另还可以优化采样时间,协助进行实验设计。

Winnonlin是在pcnonlin的计算方法和模型库的基础上开发的。

有几个版本,如winnonlinstandard和winnonlinpro。

它增加了非房室模型和PK-PD组合模型的类型。

它还增加了非房室分析功能,以根据尿液药物数据计算PK参数。

Winnonlinpro还可以分析数据的方差,因此,它可以用来计算生物利用度和生物等效性。

WinOnlin还支持用户修改、添加模型程序和执行操作。

winnonlin(pharsight公司)功能:(1)常规药动学分析,多种模型的拟合,其模型库包括含药学模型多达数十种,全面丰富;(2)非房室模型分析,根据多种可选的方法计算auc等各种参数;(3)自定义模型方程解析药动学模型,拟合效率高,并支持微分方程直接求解拟合模型,这在所有药动学软件中极为罕见,也是winnonlin超越同类其他软件的优越之处;(4)支持pk-pd联合模型分析;(5)生物等效性和生物利用度计算可直接导入和导出Excel等各种数据;(6)除了常用的统计函数外,它还包括与药代动力学相关的统计函数,如双叉设计、双单侧t检验、置信区间估计等;(7)多剂量给药期间稳态血药浓度估计;(8)交叉测试设计等常规药动学模型拟合、pk-pd分析、非房室模型分析、尿药动力学数据处理、双交叉试验设计、结合动力学、吸收动力学估算等等,有30多种群体药动学模块包括静脉推注、静脉滴注及非静脉给药的群体药动学数据处理,还有丰富的统计模块包括均数比较、方差分析、正态性检验、线性回归等等。

利用生物大数据技术预测药物作用机制的计算工具介绍

利用生物大数据技术预测药物作用机制的计算工具介绍

利用生物大数据技术预测药物作用机制的计算工具介绍随着生物技术和计算机科学的快速发展,生物大数据技术的应用在药物研究领域越来越受到重视。

生物大数据技术可以帮助科研人员更好地理解药物的作用机制,加快新药研发的进程。

同时,计算工具的应用也使得生物大数据技术的分析更加高效和准确。

本文将介绍利用生物大数据技术预测药物作用机制的一些常用计算工具。

1. Connectivity Map(CMap)Connectivity Map是一种计算工具,它通过比较药物处理后的细胞基因表达谱与基因干扰实验产生的基因表达谱,预测药物的作用机制。

CMap基于大规模的基因表达数据库,将药物处理的基因表达谱与已知的基因干扰实验的表达谱进行比较,计算相关性,从而推断药物的作用机制。

CMap能够帮助科研人员快速筛选药物的作用目标,并发现新的药物靶点。

2. DrugBankDrugBank是一个综合性的药物数据库,其中包括丰富的药物信息和相关的基因组数据。

通过结合基因组学、蛋白质组学和药理学数据,DrugBank能够预测药物的作用机制和目标。

这个数据库不仅能够提供药物的化学结构和药理活性信息,还能揭示药物与基因、蛋白质和途径的相互作用。

科研人员可以通过查询DrugBank,获取相关的生物大数据,并利用这些信息预测药物的作用机制。

3. STITCHSTITCH是一种基因-药物相互作用数据库,可以预测药物的作用机制和相关的信号通路。

STITCH整合了多种数据来源,包括生物大数据、药物化学信息和蛋白质结构。

通过基于系统生物学的方法,STITCH可以推断药物与基因的相互作用,并预测药物的作用机制。

此外,STITCH还提供了交互式网络,可视化药物和基因之间的关系,帮助科研人员更好地理解药物的作用机制。

4. CytoscapeCytoscape是一款用于生物大数据分析和可视化的计算工具。

它可以帮助科研人员整合和分析大规模生物网络数据,并可视化这些数据。

目前最受认可的药动学数据处理计算机程序

目前最受认可的药动学数据处理计算机程序

目前最受认可的药动学数据处理计算机程序药动学数据处理软件:
DAS电子化临床数据管理系统
DASforeCDM优势安全保障
◆保证数据能够及时、完整、准
◆有授权人员方可进入系统,确保合法进入数据库
◆及时发现数据错误
◆选择性地拥有数据接触权
◆减少研究成本
◆自动保留其所有操作痕迹
◆加快临床研究进程
◆磁盘阵列保护数据安全
◆及时纠正中心偏倚
◆双服务器备份
◆降低试验风险
◆每24小时系统备份
基本功能
◆可视化eCRF编辑功能
◆同步在线监查
◆数据疑点同步自动核查
◆数据递交、审阅和锁定的多层次构造
◆不同角色选择性地拥有数据
◆第三方同步稽查,接触权,保证数据安全◆保留数据操作痕迹以备查
◆数据结果打印及传输
◆兼容不同研究机构不同的实
◆数据导出验室检查结果。

graphpad药代动力学函数

graphpad药代动力学函数

graphpad药代动力学函数GraphPad是一种常用的药代动力学分析软件,它能够帮助药物研发人员快速、准确地分析药物在体内的代谢与排泄过程。

本文将详细介绍GraphPad药代动力学函数的原理和应用。

药物在体内的代谢和排泄是药代动力学的核心内容,药代动力学研究主要通过计量方法,分析药物在生物体内的浓度变化规律,以推断药物的代谢和排泄过程。

GraphPad软件提供了一系列的函数和工具,可以帮助用户进行药代动力学分析。

首先,GraphPad软件提供了药物浓度-时间曲线的拟合函数。

在药代动力学研究中,一般使用血浆或尿液中药物浓度随时间变化的曲线来描述药物在体内分布的动态过程。

GraphPad中的拟合函数可以对这些曲线进行拟合,得到相应的参数。

常用的曲线拟合函数包括一级、二级和多级指数函数,以及多项式函数等。

通过曲线拟合,可以得到药物的消除常数和半衰期等重要参数,从而进一步研究药物的代谢和排泄过程。

其次,GraphPad软件还提供了药动学参数的计算函数。

在药代动力学研究中,常常需要计算一些重要的药动学参数,如药物的清除率、分布容积、绝对生物利用度等。

GraphPad提供了一系列的计算函数,可以根据药物的给药剂量、消除常数和血浆浓度等数据,计算得到相关的药动学参数。

这些参数可进一步用于评估药物在体内的效果,优化药物剂量和给药方式等。

另外,GraphPad软件还支持药物代谢动力学模型的构建和验证。

通过对药物代谢动力学模型的构建和验证,可以更加深入地了解药物的代谢过程,预测药物的药代动力学性质,指导药物的剂量设计和合理用药。

在GraphPad中,用户可以根据自己的实验数据和假设,构建特定的药物代谢动力学模型,并进行模型验证和参数估计。

通过模型的拟合效果和参数的稳定性,可以评估模型的可靠性和适用性。

最后,GraphPad软件还提供了成像和可视化工具,可以直观地展示药物浓度-时间曲线和药代动力学参数的变化情况。

graphpad 药代动力学函数

graphpad 药代动力学函数

GraphPad药代动力学函数是一组用于分析药物代谢动力学数据的函数。

药物代谢动力学是研究药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄过程的科学领域。

药代动力学函数可以帮助研究人员对药物在体内的代谢过程进行建模和分析,从而更好地了解药物的作用机制和药效学特性。

GraphPad药代动力学函数的主要功能包括:1.拟合药物浓度-时间曲线:药物浓度-时间曲线是药代动力学研究的基础。

GraphPad药代动力学函数可以通过拟合浓度-时间数据,得到药物在体内的浓度变化趋势,并提取相关的参数,如峰值浓度、时间到达峰值浓度、消除半衰期等。

2.计算药动学参数:药动学参数是衡量药物代谢过程的重要指标。

GraphPad药代动力学函数可以根据拟合的浓度-时间曲线,计算出各种药动学参数,如AUC(药物曲线下面积)、Cmax(最大浓度)、t1/2(半衰期)等。

这些参数可以帮助研究人员评估药物的吸收、分布、代谢和排泄过程。

3.模型选择和比较:药代动力学研究中常用的模型包括一室模型、二室模型等。

GraphPad药代动力学函数可以根据拟合的浓度-时间数据,自动选择最适合的模型,并进行模型比较和评估。

这样可以帮助研究人员确定最佳的药代动力学模型,从而更准确地估计药物的代谢参数。

4.绘制药物浓度-时间曲线:药物浓度-时间曲线是药代动力学研究的重要结果之一。

GraphPad药代动力学函数可以根据拟合的数据,绘制药物浓度-时间曲线,并进行可视化展示。

这样可以直观地观察药物在体内的浓度变化趋势,并比较不同条件下的曲线差异。

GraphPad药代动力学函数的工作方式如下:1.数据导入:首先,需要将实验测得的药物浓度-时间数据导入GraphPad药代动力学软件中。

数据可以是表格形式,包含药物浓度和对应的时间点。

2.模型选择:根据实验设计和研究目的,选择合适的药代动力学模型。

常用的模型有一室模型、二室模型等。

一室模型适用于描述药物在体内的单一分布区域,而二室模型适用于描述药物在体内的两个分布区域。

经典:常用软件--计算机在药学中的应用

经典:常用软件--计算机在药学中的应用
11
第一节 ChemDraw的使用
ChemDraw版本分类
• 四个版本:功能由强到弱


ChemDraw Ultra(超级版)

ChemDraw Pro (标准版)

ChemDraw Std(专业版)

ChemDraw Ltd(受限版)
12
• ChemDraw Ultra(超级版)试用版可在 CambridgeSoft官方网站免费下载:
pid89145chemdrawpro特点6通过指定原子和化学键性质反应中心和结构等准确查询数据库10支持isis文件支持windows平台15chemdrawstd专业版特点1描绘和打印结构及反应式或以epsgif等文件格式保存3有大量化学键箭头括号轨道反应符号和实验贴图供选择5兼容chem3dchemfindercheminfoenotebook和microsoftoffice
准确查询数据库 • (7)可自动整理结构,修改绘制缺陷 • (8)化学智能包括价态、键数和原子个数 • (9)可从SPC和JCAMP文件显示光谱 • (10)支持ISIS文件,支持Windows平台
14
ChemDraw Std(专业版)特点
• (1)描绘和打印结构及反应式,或以EPS, GIF等文件格式保存
• ChemDraw:化学结构绘图软件 • 化学结构作图,作分子二维平面图。 • 功能: • (1)绘制和编辑高质量的结构图 • (2)识别和显示立体结构 • (3)将结构和名称(IUPAC Name)转换 • (4)包含NMR数据库(生成图谱,计算峰高和
面 积) • (5)能够与Excel集成 • (6)能够进行网络数据库信息管理
6
Chemoffice是集成化学软件系统

第十三章 药动学数据的曲线拟合以及常用软件

第十三章  药动学数据的曲线拟合以及常用软件
n当f是参数的非线性函数时上述正规方程则为参数的非线性方程组药动学数据的曲线拟合以及常用软件part2非线性最小二乘法算法的比较经典高斯牛顿迭代法以及改进方法哈特莱方法阻尼最小二乘法优点按最佳梯度方向搜索效果较好缺点此法往往不能精确收敛甚至会引起发散不能求出解part2非线性最小二乘法算法的比较单纯形法缺点收敛速度慢初值依赖性较大有陷入局部最小值的弊端优点原理简单避免了求导运算以及解正规方程组等步骤估算药代动力学参数中的若干问题1如何选择模型2权重系数在曲线拟合时需要事先选择合适的药动学模型方程再来进行拟合
Subtle Touch
采样时间点 Clarity & Impact
1)以较少的采样,尽可能获 取血药浓度经时曲线的变化 形态信息 2)对于m个参数的模型,采 样点个数n至少为2m+1
Visual Appealing
3)国家药品审评机构的指导 原则中明确表明药时曲线采 样点个数不得少于11个
曲线拟合的影响因素
01
02 03
04
05
06 07
08
09
10 11
12
13
14 15
16
17
BAPP软件
BAPP软件主要功能:
1
全程自动处理
生物利用度数据处理通用程序
自定义手动处理
自动生成word报告 内容包括 a.制表 b.作图 c.药动学参数 d.等效性检验
自 定 义 药 动 学 函 数
权 重 直 线 回 归
2、样品浓度测定的准确性
目前国家药品审评机构对于 体内生物样品检测有比较明确的 指导原则,其中明文规定,对于 生物样品检测,高、中浓度的检 测相对误差必须在±15%以内, 低浓度必须在20%以内。

国内外常用的药代动力学软件介绍

国内外常用的药代动力学软件介绍

国内外常用的药代动力学软件介绍
谢海棠;黄晓晖;孙瑞元
【期刊名称】《中国临床药理学与治疗学》
【年(卷),期】2001(6)4
【总页数】4页(P289-292)
【关键词】药代动力学;应用软件;NONLIN;NONMEN;3P87/3P97;PKBP-
N1;NDST;ABE
【作者】谢海棠;黄晓晖;孙瑞元
【作者单位】中国药科大学药理教研室;皖南医学院药物研究所
【正文语种】中文
【中图分类】R969.1;TP31
【相关文献】
1.经温里药配伍的活血药赤芍效应成分芍药苷药代动力学研究--对复方配伍药物效应成分药代动力学研究方法的探讨 [J], 杨祖贻;刘荣敏;程佳;裴瑾;万德光;胡荣
2.两种中药复方的药效动力学与测试成分药代动力学拟合--兼论中药药代动力学研究方法 [J], 杜力军;邢东明;赵玉男;王雪莉;苏慧;卢弘;孙虹;金文
3.脑血管药CBN注射剂药代动力学研究--对植物药药代动力学研究方法学的探讨[J], 杜力军;邢东明;刘美凤;丁怡;孙虹;炎彬;何希辉;金文;孙立红
4.常用局部麻醉药药代动力学研究新进展 [J], 韩晓玲
5.常用局部麻醉药药代动力学研究新进展 [J], 韩晓玲
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由计算机自动计算,给出可能的房室数及权重系数的计算结果及图表,包括:加权剩余平方和、相关系数、确定系数、Aikake's信息数据(AIC)、拟合优度值、最大绝对误差、最大相对误差、游程检验(Run
test)、 F检验、C-T图、lgC-T图、相关图、误差散点图等,供用户选择最优的房室模型,权重和算法。
(SAS 编程基础)
发表人内容
2008-07-23 15:31:37 文章主题: 几种常用药动学计算软件介绍 No. 1
Admin
西铁房管理员
3P87/3P97(Practical Pharmacokinetic
Program)实用药动学计算程序是中国药理学会数学专业委员会受国家卫生部药品审评办公室的委托组织了五个单位六位专家(张文贵、杨友春、汤仲明、刘昌孝、孙瑞元、余志凌)集体编制的,可处理药动学中各种用药途径的线性和非线性药动学模型,给出有关的药动学参数及各种图表的详细结果,适用于新药开发研制、药动学分析及临床药动学计算。(本章第二节将详细介绍其使用方法)。
WinNonlin是国外最常用的PK和BA/BE软件
缺点:有些数据需分几次选择多个模型进行比较才能得出最佳的结果。对于一些异常数据的计算结果有错,价格较高,每年收取使用费
3P87(3P97)实用药动学计算程序
Modeling),用来估算给定时间和血浆浓度的效应地点浓度。③交叉试验设计(Crossover
Design)等。④Winnonlin提供了广泛的在线帮助(On-Line Help)和指导课(Tutorial
Lesson),为用户节省大量的学习和使用软件的时间。
进行C-t及lnC-t的拟合和作图。
② 批处理模块
根据选定的房室数和权重值,进行12-30项数据组的批处理,给出各组的药代学参数的均数,标准差,拟合值及C-t,
lnC-t的拟合值并分别作图。
(Open Database Connectivity,开放式数据库互连)的数据库中读取或存储数据。
(3)统计功能
包括:①描述性统计:可对输入输出的数据产生一般的概要性的统计,除了常规的描述性统计量外,还包括几何均数、调和均数、对数的均数和标准差、百分数、可信区间等;另外加权的描述性统计,如均数、标准差及标准误的加权统计量。②ANOVA/GLM模块(专业版和企业版)提供更专业的统计功能:可统计分析来自交叉设计、平行设计甚至非均衡设计的数据;用户可自定义误差条件;生物等效性统计,包括Anderson-Hauck法、Westlake可信限法、经典可信限法、双向单侧t检验等。
几种常用药动学计算软件介绍
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WinNonlin为美国Pharsight公司的产品,是国外应用最广的药动学软件,被认为可用于几乎所有的药代、药效及非房室模型的分析,已成为一种新的工业标准,其界面友好,功能强大,应用灵活,与其他软、硬件有很好的兼容性。
③ 自定义模块
药动学计算中容易出现的"计算的不确定性",即同一个血浓数据,各软件计算结果并不完全相同。不确定的原因多样,如初值对结果影响;步长、精度、迭代次数的影响;数据越不典型,差别越大;房室数越多,差别越大。这就涉及最佳点寻找的计算方法问题,另外也可采用目测法,DAS软件即具有自定义模块功能,可根据相对误差和,绝对误差和最小的原则,也可根据各点总趋势,侧重合理点,或者根据群体数据的消除相斜率及统计学
WinNonlin有三个版本:标准版、专业版、企业版。标准版中包含了药动学及药效学分析的各种工具,专业版和企业版比标准版增加了几个模块,主要用于商业用途。由Pharsight公司生产的WinNonlin的配套产品还包括:
WinNonmix软件(用于群体药动学分析)和Pharsitht Trial
③ 对多剂量组数据进行批处理及统计分析,给出适合新药审评要求的计算结果及有关图表。
④ 允许用户自定义房室模型、权重系数、计算方法、收敛精度、初始值等,便于药动学的科学研究和分析探讨。

3P87(3P97)特点及主要功能有:

可处理不同房室数的静脉推注、静脉滴注(包括滴注期和/或滴注后)及非静脉用药(包括有或无滞后时间)的各种线性和非线性药动学模型的时间血浓数据,计算并打印药动学参数,标准误及各种图表。
3P87/3P97使国内最早、最权威的PK的PK和BA/BE软件
缺点:DOS界面,操作复杂
DAS软件(Drug and Statistics)
DAS 软件中有关药物动力学的模块有:
自动化程度较高:自动进行线性和非线性房室模型判别;自动按加权残数法计算各线性模型的初值;自动对多剂量组进行分类统计,给出各剂量组药动学参数的均数,标准差及标准误;自动形成可长期保存的标题文件、输入文件和输出文件。

3P87提供的模型包括常用的不同房室静脉推注,静脉滴注及非静脉给药的线性和非线性药动学模型,共12种(表14-1),其中模型1~9为一级速率消除的线性房室模型,模型10~12为Michaelis-Menten消除的一房室非线性模型。
(2)输入输出管理功能
包括:①通过了和EXCEL兼容的工作表和工作薄文件来管理输入输出的数据。②数据编辑能力很强大,如:可用公式和函数建立和修改数据、导入导出ASCII和EXCEL文件数据文件、分类合并数据文件、剪切和粘贴等。③使用基于模板的结果输出向导,很容易产生结果报告,这些报告将输入的数据和计算结果用不同的方式显示,并可在WO辑修改。⑤单位定义和转换能力,包括指定输出单位、指定给药方案、在数据集内部处理剂量换算问题等。⑥可从基于ODBC
(4) "工具箱"( toolbox)功能及帮助功能
"工具箱"功能提供一些便于药动学研究的工具:①非参数重叠法(Nonparametric
Superpositon),用来预测多剂量用药后达到稳态的血药浓度。②半房室模型法(Semi-compartmental
⑤ 尿数据的药代动力学模块 包括尿药排泄速率法、亏量法及肾清除率(CLr)的计算等。
⑥ 吸收动力学模块
包括三种方法,Loo-Riegelman法用于二室吸收动力学分析;Wagner-Nelson法计算基本参数;反卷积法包括Recigno-Segre点点法和Benet-Chiang点面法的计算。
Simulator软件(用于临床试验设计的模拟)。
(1)计算分析功能
包括:①房室模型分析(Compartmental
Modelling):处理各种非线性回归问题;参数估计问题;各种微分方程系统(包括微分方程和一般方程的混合系统);模拟功能使用户可看到不同用药方案或参数调整后的药效变化;提供了广泛的模型库,能解决绝大多数的模型拟合问题,包括药代模型、药效模型、间接响应模型、药代药效联合模型等;用户可用内置的程序语言来自定义模型;使用了动态内存管理技术,可处理大型数据和复杂模型。
②非房室模型分析(Noncompartmental
Analysis):可由血或尿数据计算AUC0-n、AUC0-∞、Cmax等参数;可计算稳态数据的参数;可在半对数图中选择终末消除相或由程序自动选择;三种方法计算AUC;计算任意终点的AUC等。
F 检验差异无统计意义。
④ 非线性药代动力学计算模块 应用米氏动力学(Michaelis-Menten
Kinetics)方程,计算Vm(理论最大速率常数)和Km(Michaelis常数)等参数。
注册时间: 2008-04-24 20:23:29
文章: 1060
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论坛首页 » Biostatistics & SAS Programming (生物统计与SAS编程)» SAS Base
2) 生物利用度及等效性检验部分
① 由实测各时间点的血药浓度,直接进行计算。也可应用己算出的AUC,Tmax,Cmax进行批处理计算,
1) 药代学部分
① 智能化模块 输入或贴入药代学实验数据后自动进行:各种给药方法, 1-3种房室,1-3
种权重的全面分析,并自动进行房室判断,F检验,AIC判断,确定最佳房室数及权重值。算出各种二级药代参数及统计矩参数,
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