ncbi中文说明书
怎样使用NCBI
怎样使用NCBINCBI（National Center for Biotechnology Information，国家生物技术信息中心）是一个提供生物医学和基因组学相关信息和工具的资源中心，为全球研究人员提供了公共数据库和计算工具。
NCBI不仅提供了各种数据库（如PubMed、GenBank和BLAST等），还提供了多种工具和程序包，可以帮助用户在完整的基因组中、分析和解释生物信息。
1. PubMedPubMed是NCBI最受欢迎的数据库之一，它提供了全球各领域生物医学和生物科学研究的相关文献。
用户可以在框中输入关键词来相关的医学文献，也可以使用高级功能来筛选文献。
在结果中，用户可以找到文献的摘要、全文和相关信息。
2. GenBankGenBank是NCBI的核心数据库之一，它收集和存储了全球各领域基因组学研究的DNA序列数据。
用户可以通过框中输入基因名、序列ID或其他相关信息来特定的DNA序列数据。
结果会提供序列的相关信息、注释、变异等。
3.BLASTBLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一种用于在NCBI数据库中相似序列的工具。
BLAST可以用来比对一段DNA或者蛋白质序列与数据库中的其他序列进行比对，用户可以通过输入序列或者上传文件的方式使用BLAST。
BLAST结果会给出匹配的序列、相似度和其他相关信息。
4. Primer-BLASTPrimer-BLAST是一个用于设计引物（primers）的工具，该工具可以帮助用户设计用于PCR扩增特定DNA区域的引物。
用户可以在框中输入目标基因的序列，Primer-BLAST会自动生成一对合适的引物，并提供引物的相关信息和参数。
除了上述常用的NCBI工具和数据库外，NCBI还提供了其他许多强大且有用的工具和资源，如ClinVar（帮助研究人员了解基因变异与遗传疾病的关系）、Entrez（提供了多个数据库的交叉功能）和PubChem（提供化合物信息和化学数据库）等。
ncbi使用方法
ncbi使用方法（原创版4篇）《ncbi使用方法》篇1CBI（National Center for Biotechnology Information）是美国国家生物技术信息中心的缩写，它提供了许多生物学和生命科学相关的数据库和工具。
以下是使用NCBI 的一些基本方法：1. 核酸序列数据库（Nucleotide Sequence Database）：在NCBI 主页上，可以选择核酸序列数据库，输入序列名称或序列号，然后点击“Search”按钮即可查询序列信息。
2. 蛋白质序列数据库（Protein Sequence Database）：在NCBI 主页上，可以选择蛋白质序列数据库，输入蛋白质名称或蛋白质号，然后点击“Search”按钮即可查询蛋白质信息。
3. 基因组数据库（Genome Database）：在NCBI 主页上，可以选择基因组数据库，输入基因组名称或基因组号，然后点击“Search”按钮即可查询基因组信息。
4. 代谢通路数据库（Metabolic Pathway Database）：在NCBI 主页上，可以选择代谢通路数据库，输入代谢通路名称或代谢通路号，然后点击“Search”按钮即可查询代谢通路信息。
5. 生物投影数据库（BioProject Database）：在NCBI 主页上，可以选择生物投影数据库，输入生物投影名称或生物投影号，然后点击“Search”按钮即可查询生物投影信息。
6. 序列比对工具（Sequence Alignment Tool）：NCBI 提供了一款名为“Clustal Omega”的序列比对工具，可以在NCBI 主页上使用该工具进行序列比对。
7. 基因表达数据库（Gene Expression Database）：NCBI 提供了一款名为“GEO”的基因表达数据库，可以在NCBI 主页上查询基因表达数据。
8. 蛋白质结构数据库（Protein Structure Database）：NCBI 提供了一款名为“RCSB PDB”的蛋白质结构数据库，可以在NCBI 主页上查询蛋白质结构信息。
NCBI使用手册上
The NCBI Handbookstudent will submit questions for a classroom assignment, providing a special outreach opportunity to young scientists.Because of the genetic focus of many of NCBI resources, we receive a number of questions from the general public regarding medical issues. The NCBI Help Desk staff can neither provide direct answers to medical questions nor give medical advice or guidance. However,we do provide suggestions on how to search our resources for information on the gene or condition of interest and refer users to the National Library of Medicine (NLM) customer service group for further assistance with PubMed (Chapter 2), MEDLINEplus, and . We also refer them to outside organizations that can provide information on such topics as support groups and sources of medical advice.Questions about PubMed are handled by a separate customer service group within the NLM.Their direct address is custserv@, and their phone number is 1-888-FIND-NLM.PubMed questions that are received at the NCBI Help Desk are forwarded to NLM.Development of User Support Materials Because of its ongoing personal contact with our users, the User Services group plays an important role in communicating with database development and production teams, making suggestions, testing new releases and new features, and keeping them informed of problems that people are having with the services. The team also collaborates with developers in creating help documents, frequently asked questions (FAQs), tutorials, and workshop materials.Tutorials on the Web Web-based tutorials for BLAST, Entrez, Cn3D, and PubMed are currently available, with additional topics under development. Tutorials are produced on a collaborative basis by database development and User Services staff.About NCBI In keeping with the “plain language initiative” at NIH, the About NCBI section of the NCBI Web site presents many fundamentals of NCBI's bioinformatics tools and databases, including a science primer covering such topics as molecular genetics, genome mapping, Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) (Chapter 5), and microarray technology (Chapter 6). A model organism guide presents various model organisms and their uses in laboratory settings.As an introduction and orientation to NCBI's multifaceted Web site, the About NCBI section appeals to the general public, educators, and researchers alike.NCBI Site Map The NCBI Site Map serves as a guide to NCBI resources. It provides a comprehensive, linked list of resources, along with a brief description of each resource. An effective way to locate a resource of interest within the Site Map is to perform a Find in Page search, a function that is built into all commonly used Web browsers.Publications The NCBI News is a quarterly newsletter that includes articles on new services, new features,and basic research at NCBI, as well as how to use selected resources for common applications.The newsletter is available free of charge and is offered online and by print subscription.The User Services group also prepares fact sheets, brochures, and other public information materials to describe and illustrate NCBI services. A list of available materials is provided in the About NCBI section of the Web site, under News.The NCBI HandbookThe NCBI HandbookThe NCBI HandbookThe NCBI HandbookOverview articles entitled GenBank and Database Resources of the NCBI have also been published recently in the annual database issues of Nucleic Acids Research (1-3).Outreach NCBI's continuing emphasis on outreach to the scientific community is evident in its multifaceted program that includes exhibiting its services at scientific meetings, offering a variety of training courses, and developing Web-based tutorials and workshops.Exhibits at Scientific Meetings NCBI exhibits at approximately 15 scientific meetings per year, providing an opportunity for a wide range of researchers, students, and teachers to see demonstrations of NCBI resources and interact directly with NCBI staff. The current exhibit schedule is posted on the NCBI Web site in the About NCBI section, under NCBI at a Glance .Workshops are offered at select scientific meetings and include the standing workshops described below in the Training section, but workshops also can be customized for particular audiences. Meeting organizers who would like to invite NCBI to offer a workshop are encouraged to do so.Training Courses NCBI has a growing training program consisting of full-day, half-day, and two-hour courses that are usually a combination of lecture and computer-based formats. There are also advanced courses that are given over a more extended time period. Each is described briefly below, and further information on the training programs can be found in the Education section of the Web site, under NCBI Courses.A Field Guide to GenBank and Other NCBI Resources A Field Guide to GenBank and NCBI Molecular Biology Resources is a training course offered in a lecture format, followed by hands-on computer sessions. It is designed as a basic but broad introduction to NCBI tools and resources.Field Guide topics include the following: description and scope of the primary database,GenBank (Chapter 1); derivative databases, such as UniGene (Chapter 21), Entrez Gene (Chapter 19), and Reference Sequence (RefSeq) (Chapter 18); effective database searching using Entrez; NCBI structure databases and the structure viewer, Cn3D; sequence similarity searching using the BLAST programs; the Conserved Domain Database (CDD) and associatedsearch engine; and genome resources, including the NCBI assembly of the draft human genome, access to both finished and unfinished microbial genomes, and the genome Map Viewer.The course is offered by invitation at academic institutions as well as at selected scientific conferences. If you are interested in hosting a course at your institution or conference, write to info@, and your request will be routed to the course coordinator.The course is also offered four times a year at the NLM on the NIH campus in Bethesda,Maryland, and is free and open to anyone who would like to attend.More information on this course is available in the Education section of the NCBI Web site,under NCBI Courses . The Web site includes the course handout, slide presentations, and problem sets with answers. A schedule of planned courses at NLM and elsewhere is posted under Upcoming Courses .The NCBI HandbookThe NCBI HandbookThe NCBI HandbookThe NCBI HandbookMolecular Biology Information Resources This course is designed primarily for medical and science librarians or other professionals who are providing support services for molecular biology information resources. It provides an introduction to four categories of molecular biology information available from NCBI:nucleotide sequences, protein sequences, three-dimensional structures, and complete genomes and maps. An overview of search systems available at the NCBI, particularly Entrez and BLAST, emphasizes how search skills related to other types of information resources also apply to molecular biology databases. The course concludes with a discussion of various levels of molecular biology information services provided by librarians.The Medical Library Association approves this course for eight continuing education credit hours. The course has been given at 24 locations since May 1997. Because of the increase in NCBI services, courses are being revised and are not being scheduled at this time.More information on this course is available in the Education section of the NCBI Web site,under NCBI Courses . The Web site includes the course materials used for the lecture and a set of exercises.NCBI Advanced Workshop for Bioinformatics Information Specialists A new 5-day advanced course on NCBI resources has been developed as part of a collaborative project with a group of scientists and librarians who currently provide bioinformatics support services at their universities. The course provides detailed descriptive information as well as hands-on experience with handling a wide range of user questions. The course is designed for bioinformatics support staff based in university medical libraries so that they can, in turn, assist students, faculty, staff, and clinicians at their institutions in the use of molecular biology information resources. Additional information on this course is available in the Education section of the NCBI Web site.Specialized Mini-Courses The Service Desk staff also offers four mini-courses: BLAST QuickStart, Unmasking Genes in the Human Genome, Making Sense of DNA and Protein Sequences, and GenBank and PubMed Searching. Each is described briefly below. The purpose of the mini-courses is to focus on specific research application areas and address how to use multiple NCBI resources together to answer a research question. Additional problem-oriented mini-courses are under development.The courses are 2 hours each in length. An overview is given during the first hour in lectureformat, followed by a 1-hour hands-on session. Although primarily given on the NIH campus,NCBI is beginning to offer these workshops at outside institutions as well. Although the mini-courses were originally designed to be presented by an instructor, they are constructed in an online notebook format; therefore, it is possible to take the course on your own. Revisions to augment the online notebooks with lecture material and make the courses completely self-guided are currently under way.BLAST QuickStart!This mini-course is a practical introduction to the BLAST family of sequence-similarity search programs. Exercises range from simple searches to creative uses of the BLAST programs.Unmasking Genes in the Human GenomeThis mini-course covers how to find genes, promoters, and transcription factor-binding sites in human DNA sequences. It is designed around a program developed within User ServicesThe NCBI HandbookThe NCBI HandbookThe NCBI HandbookThe NCBI Handbookcalled Greengene, which integrates the output of several gene-finding tools and allows a coding sequence and accompanying protein translation to be assembled from the exons detected by these programs. Because the output of several programs is integrated, there is increased reliability in exon selection.Making Sense of DNA and Protein Sequences In this course, participants find a gene within a eukaryotic DNA sequence. They then predict the function of the derived protein by seeking sequence similarities to proteins with documented function using BLAST and other tools. Finally, a 3D modeling template is located for the protein sequence using the Conserved Domain Search (CDD-Search).During the first hour, an instructor walks the class through an analysis of an uncharacterized Drosophila melanogaster genomic sequence from a GenBank record. During the second hour,participants perform the same analysis independently, using a different genomic sequence.GenBank and PubMed Searching This mini-course provides an overview of literature searching and sequence retrieval using the PubMed and Entrez database search interfaces. Exercises illustrate advanced search tips for using Entrez, many of which explore the use of the Preview/Index options for specifying parameters to limit the search results. The course also features 21 self-scoring exercises for GenBank.The NCBI Learning Center In addition to communication by email and phone provided through the Help Desk, a regular research consultation service provides one-on-one support for researchers in the NIH community. The consults are available by appointment and are provided in 1-hour time slots at the NIH Library as well as the NCBI training facility. Because of the success of the program,this type of service may be offered by appointment at selected scientific meetings in the future.CoreBio An innovative training program that began in 2001 aims to train molecular biologists for a new type of career as bioinformatics specialists who provide institutional support for users of computational biology tools. The NCBI Core Bioinformatics Facility (referred to as the CoreBio program) currently functions to train and support a network of bioinformatics specialists serving individual Institutes at NIH. NCBI's CoreBio facility trains Core members identified by their respective institutes in the use of its bioinformatics tools. The Core members,in turn, support the use of NCBI tools and databases by researchers at their institutes.The training is provided over a 9-week period, with students attending lectures and completing practical exercises in the morning and returning to their regular workplace in the afternoon.The coursework centers on one major topic each week and follows the rough schedule given below:WEEK 1: Introduction to the Sequence Databases WEEK 2: BLASTWEEK 3: The Human Genome WEEK 4: Genomic Biology WEEK 5: Molecular ModelingThe NCBI HandbookThe NCBI HandbookThe NCBI HandbookThe NCBI HandbookWEEK 6: Web Page Development WEEK 7: Setting Up a BLAST Web Server WEEK 8: Interaction with Users WEEK 9: Practicum During week 9, the students pursue an institute-related project with the assistance of NCBI instructors. These projects run the gamut from the compilation of specialized datasets and data mining to the creation of novel BLAST interfaces and the construction of new data display tools. Students also develop a Web page to support the services they are developing for the respective Institutes at the NIH.Although currently a NIH-based program, other organizations are welcome to consider using the program as a model for development of similar initiatives to meet their bioinformatics support needs.Conclusion At NCBI, we encourage our users to contact us with questions, suggestions, and requests for training or presentations on NCBI services. We invite feedback on tutorials, FAQs, and other support materials and welcome suggestions regarding additional materials that would be useful in guiding users through the wide range of services offered by NCBI.References 1. Benson DA, Karsch-Mizrachi I, Lipman DJ, Ostell J, Rapp BA, Wheeler DL. GenBank. Nucleic Acids Res 2002;30:17–20.99127 [PubMed: 11752243]2. Wheeler DL, Church DM, Lash AE, Leipe DD, Madden TL, Pontius JU, Schuler GD, Schriml LM,Tatusova TA, Wagner L, Rapp BA. Database resources of the National Center for Biotechnology Information: 2002 update. Nucleic Acids Res 2002;30:13–16.99094 [PubMed: 11752242]3. Wheeler DL, Church DM, Lash AE, Leipe DD, Madden TL, Pontius JU, Schuler GD, Schriml LM,Tatusova TA, Wagner L, Rapp BA. Database resources of the National Center for Biotechnology Information. Nucleic Acids Res 2001;29:11–16.29800 [PubMed: 11125038]The NCBI Handbook The NCBI Handbook The NCBI Handbook The NCBI Handbook。
一步一步教你使用 NCBI
一步一步教你使用NCBI 查找DNA、mRNA、cDNA、Protein、promoter、引物设计、BLAST序列比对等作者：urbest2007-8-1苏州大学生命科学学院最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用BLAST进行序列比对……，这些问题在NCBI上都可以方便的找到答案。
现在我就结合我自己使用NCBI的一些经历（经验）跟大家交流一下BCBI的使用。
希望大家都能发表自己的使用心得，让我们共同进步！我分以下几个部分说一下NCBI的使用：Part one 如何查找基因序列、mRNA、PromoterPart two 如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列Part three 运用STS查找已经公布的引物序列Part four 如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性特别感谢本版版主，将这个帖子置顶！从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的（以及想给我投票却暂时不能投票的）各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友！请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。
关于NCBI其他方面的使用也请水平较高的战友给予补充First of all，还是让我们从查找基因序列开始。
第一部分 利用Map viewer查找基因序列、mRNA序列、启动子（Promoter）下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤1．打开Map viewer页面，网址为：/mapview/index.html 在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。
操作完毕如图所示：2．点击“GO”出现如下页面：3．在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene 前面的小方框里打勾，然后点击Filter. 出现下图：说明一下：1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。
2、下面参考序列给出了三个，是不同的部门做出来的，经我验证，序列有微小的差异，但总体来说基本相同。
NCBI使用方法介绍
NCBI使用方法介绍一、Map viewer查找基因序列，RNA，启动子下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤1、A. 打开Map viewer页面，网址为在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。
2、B. 点击“GO”：C. 在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene前面的小方框里打勾，然后点击Filter：说明一下：1.1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。
1.2、下面参考序列给出了三个，是不同的部门做出来的，经我验证，序列有微小的差异，但总体来说基本相同。
尽管你分别点击后，序列代码、序列代码等有所差异，但碱基基本一致，不影响大家研究分析序列。
现在普遍采用的是最上面的那个序列，这一条是世界范围的生物科学家用计算机合成的一个序列。
我也推荐大家使用这个序列。
1.3、点击上述三条序列第一条序列（即reference）对应的"Genes seq"，出现新的页面，1.4、点击上图出现的“Download/View Sequence/Evidence ”，即下载查看序列等功能，先对上面这张图做点简要的说明，在Sequence Format（序列输出格式）后面是一个下拉式选择菜单，默认的为FASTA格式，还有一个是GenBank 格式。
我推荐大家选择GenBnak格式，因为这个格式提供了很多该基因的信息，而FASTA格式只有基因序列。
1.5、在Sequence Format后选择GenBank，然后点击下面的Display，目的基因的相关信息和序列就出现在眼前了。
在上述打开的网页中，你可以看到基因长度，基因序列，以及这个基因是如何被报道出来的等各种信息。
你会看到: mRNA join(3598..3678,3841..4031,5090..5203,5911..6057, 7803..8394) 这代表了从基因的3598位开始就是转录区了，即我们常说的mRNA 片断，由于内含子的存在，所以mRNA在DNA序列上分成了几段。
NCBI使用方法
NCBI使用方法NCBI (National Center for Biotechnology Information), 美国国家生物技术信息中心[url]/[/url]NCBI是NIH的国立医学图书馆（NLM）的一个分支。
NCBI提供检索的服务包括：1．GenBank（NIH遗传序列数据库）：一个可以公开获得所有的DNA序列的注释过的收集。
GenBank是由NCBI受过分子生物学高级训练的工作人员通过来自各个实验室递交的序列和同国际核酸序列数据库（EMBL和DDBJ）交换数据建立起数据库的。
它同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。
这三个组织每天交换数据。
其中的数据以指数形式增长，最近的数据为它已经有来自47000个物种的30亿个碱基。
2．Molecular Databases（分子数据库）：Nucleotide Sequence（核酸序列库）：从NCBI其他如Genbank数据库中收集整理核酸序列，提供直接的检索。
Protein Sequence （蛋白质序列库）：与核酸类似，也是从NCBI多个不同资源中编译整理的，方便研究者的直接查询。
Structure（结构）-——关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问三维蛋白质结构的分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。
MMDB：分子模型数据库—一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。
Taxonomy（分类学）——NCBI的分类数据库，包括大于7万余个物种的名字和种系，这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。
其目的是为序列数据库建立一个一致的种系发生分类学。
3．Literature Databases（文献数据库）（1）PubMed是NLM提供的一项服务，能够对MEDLINE上超过1200万条的上世纪六十年代中期至今的杂志引用和其他的生命科学期刊进行访问，并可以连接到参与的出版商网络站点的全文文章和其他相关资源。
NBCI介绍与使用方法
NBCI介绍与使用方法2012-02-25 21:35:32| 分类：书籍学术| 标签：nbci blast 基因组测序 dna |字号大中小订阅NCBI (National Center for Biotechnology Information), 美国国家生物技术信息中心[url]/[/url]NCBI是NIH的国立医学图书馆（NLM）的一个分支。
NCBI提供检索的服务包括：1．GenBank（NIH遗传序列数据库）：一个可以公开获得所有的DNA序列的注释过的收集。
GenBank 是由NCBI受过分子生物学高级训练的工作人员通过来自各个实验室递交的序列和同国际核酸序列数据库（EMBL和DDBJ）交换数据建立起数据库的。
它同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。
这三个组织每天交换数据。
其中的数据以指数形式增长，最近的数据为它已经有来自47000个物种的30亿个碱基。
2．Molecular Databases（分子数据库）：Nucleotide Sequence（核酸序列库）：从NCBI其他如Genbank数据库中收集整理核酸序列，提供直接的检索。
Protein Sequence （蛋白质序列库）：与核酸类似，也是从NCBI多个不同资源中编译整理的，方便研究者的直接查询。
Structure（结构）-——关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问三维蛋白质结构的分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。
MMDB：分子模型数据库—一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。
Taxonomy（分类学）——NCBI的分类数据库，包括大于7万余个物种的名字和种系，这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。
其目的是为序列数据库建立一个一致的种系发生分类学。
3．Literature Databases（文献数据库）（1）PubMed是NLM提供的一项服务，能够对MEDLINE上超过1200万条的上世纪六十年代中期至今的杂志引用和其他的生命科学期刊进行访问，并可以连接到参与的出版商网络站点的全文文章和其他相关资源。
ncbi使用手册
NCBI 资源介绍本文目录：NCBI（美国国立生物技术信息中心) 简介NCBI 站点地图NCBI癌症基因组研究NCBI－Coffee BreakNCBI－基因和疾病NCBI－UniGeneCluster of Orthologous Groups of proteins（COG）介绍Gene Expression Omnibus （GEO）介绍LocusLink介绍关于RefSeq：NCBI参考序列NCBI(美国国立生物技术信息中心)简介介绍理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。
通过只有四个字母来代表DNA化学亚基的字母表,出现了生命过程的语法，其最复杂形式就是人类。
阐明和使用这些字母来组成新的“单词和短语"是分子生物学领域的中心焦点.数目巨大的分子数据和这些数据的隐秘而精细的模式使得计算机化的数据库和分析方法成为绝对的必须.挑战在于发现新的手段去处理这些数据的容量和复杂性，并且为研究人员提供更好的便利来获得分析和计算的工具，以便推动对我们遗传之物和其在健康和疾病中角色的理解。
国立中心的建立后来的参议员Claude Pepper意识到信息计算机化过程方法对指导生物医学研究的重要性，发起了在1988年11月4日建立国立生物技术信息中心(NCBI）的立法。
NCBI是在NIH的国立医学图书馆（NLM）的一个分支。
NLM是因为它在创立和维护生物信息学数据库方面的经验被选择的，而且这可以建立一个内部的关于计算分子生物学的研究计划.NCBI的任务是发展新的信息学技术来帮助对那些控制健康和疾病的基本分子和遗传过程的理解。
它的使命包括四项任务：建立关于分子生物学，生物化学，和遗传学知识的存储和分析的自动系统实行关于用于分析生物学重要分子和复合物的结构和功能的基于计算机的信息处理的，先进方法的研究加速生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。
全世界范围内的生物技术信息收集的合作努力。
美国国家生物信息中心使用介绍
NCBI (National Center for Biotechnology Information), 美国国家生物技术信息中心[url]/[/url]NCBI是NIH的国立医学图书馆（NLM）的一个分支。
NCBI提供检索的服务包括：1．GenBank（NIH遗传序列数据库）：一个可以公开获得所有的DNA序列的注释过的收集。
GenBank是由NCBI受过分子生物学高级训练的工作人员通过来自各个实验室递交的序列和同国际核酸序列数据库（EMBL和DDBJ）交换数据建立起数据库的。
它同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。
这三个组织每天交换数据。
其中的数据以指数形式增长，最近的数据为它已经有来自47000个物种的30亿个碱基。
2．Molecular Databases（分子数据库）：Nucleotide Sequence（核酸序列库）：从NCBI其他如Genbank数据库中收集整理核酸序列，提供直接的检索。
Protein Sequence （蛋白质序列库）：与核酸类似，也是从NCBI多个不同资源中编译整理的，方便研究者的直接查询。
Structure（结构）-——关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问三维蛋白质结构的分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。
MMDB：分子模型数据库—一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。
Taxonomy（分类学）——NCBI的分类数据库，包括大于7万余个物种的名字和种系，这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。
其目的是为序列数据库建立一个一致的种系发生分类学。
3．Literature Databases（文献数据库）（1）PubMed是NLM提供的一项服务，能够对MEDLINE上超过1200万条的上世纪六十年代中期至今的杂志引用和其他的生命科学期刊进行访问，并可以连接到参与的出版商网络站点的全文文章和其他相关资源。
一步一步教你使用NCBI
一步一步教你使用NCBI 查找DNA、mRNA、cDNA、Protein、promoter、引物设计、BLAST序列比对等作者：urbest2007-8-1苏州大学生命科学学院最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用BLAST进行序列比对……，这些问题在NCBI上都可以方便的找到答案。
现在我就结合我自己使用NCBI的一些经历（经验）跟大家交流一下BCBI的使用。
希望大家都能发表自己的使用心得，让我们共同进步！我分以下几个部分说一下NCBI的使用：Part one 如何查找基因序列、mRNA、PromoterPart two 如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列Part three 运用STS查找已经公布的引物序列Part four 如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性特别感谢本版版主，将这个帖子置顶！从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的（以及想给我投票却暂时不能投票的）各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友！请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。
关于NCBI其他方面的使用也请水平较高的战友给予补充First of all，还是让我们从查找基因序列开始。
第一部分 利用Map viewer查找基因序列、mRNA序列、启动子（Promoter）下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤1．打开Map viewer页面，网址为：/mapview/index.html 在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。
操作完毕如图所示：2．点击“GO”出现如下页面：3．在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene 前面的小方框里打勾，然后点击Filter. 出现下图：说明一下：1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。
2、下面参考序列给出了三个，是不同的部门做出来的，经我验证，序列有微小的差异，但总体来说基本相同。
NCBI使用方法详解(中文)
一步一步教你使用NCBI 查找DNA、mRNA、cDNA、Protein、promoter、引物设计、BLAST序列比对等作者：urbest2007-8-1苏州大学生命科学学院最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用BLAST进行序列比对……，这些问题在NCBI上都可以方便的找到答案。
现在我就结合我自己使用NCBI的一些经历（经验）跟大家交流一下BCBI的使用。
希望大家都能发表自己的使用心得，让我们共同进步！我分以下几个部分说一下NCBI的使用：Part one 如何查找基因序列、mRNA、PromoterPart two 如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列Part three 运用STS查找已经公布的引物序列Part four 如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性特别感谢本版版主，将这个帖子置顶！从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的（以及想给我投票却暂时不能投票的）各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友！请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。
关于NCBI其他方面的使用也请水平较高的战友给予补充First of all，还是让我们从查找基因序列开始。
第一部分 利用Map viewer查找基因序列、mRNA序列、启动子（Promoter）下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤1．打开Map viewer页面，网址为：/mapview/index.html 在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。
操作完毕如图所示：2．点击“GO”出现如下页面：3．在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene 前面的小方框里打勾，然后点击Filter. 出现下图：说明一下：1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。
2、下面参考序列给出了三个，是不同的部门做出来的，经我验证，序列有微小的差异，但总体来说基本相同。
NCBI使用攻略
NCBI使⽤攻略（⼀）DNA序列⽐对分析⼀）两个DNA序列的相似性⽐对分析1．进⼊NCBI主页（/doc/3aaa537f0066f5335a8121c7.html ）2. 点击所有资源（All Resources）3．点击⼯具栏⽬（Tool）点击进⼊。
5. 找到Specialized BLAST，点击Align two (or more) sequences using BLAST (bl2seq)6. 将序列1复制、黏贴到Enter Query Sequence框中。
7. 将序列2复制、黏贴到Enter Subject Sequence框中。
8. 在Program Selection下⾯，选择Highly similar sequences (megablast) （⾼度相似序列）或其他分析程序9、点击BLAST按钮，进⾏⽐对分析。
10、观察、记录和分析两序列⽐对结果。
⼆）待查DNA序列与国际基因数据库中已有DNA序列的相似性⽐对分析。
1、进⼊NCBI主页（/doc/3aaa537f0066f5335a8121c7.html ）2、点击所有资源（all resources）3．点击⼯具栏⽬（Tool）点击进⼊。
5．在Basic BLAST下，找到nucleotide blast（Search a nucleotide database using a nucleotide query），点击进⼊。
6. 将DNA序列复制、粘贴到Enter Query Sequence下⾯的⽅框中。
7. 在Choose Search Set栏⽬下，选择others数据库8. 选择Highly similar sequences (megablast)或其他程序。
9. 按BLAST按钮。
10. 观察、记录和分析DNA序列与国际基因库已有序列的⽐对结果。
（⼆）DNA序列开放阅读框的分析1．进⼊NCBI主页（/doc/3aaa537f0066f5335a8121c7.html ）2．点击所有资源（all resources (A-Z) ）3．点击⼯具栏⽬（Tool）4. 找到Open Reading Frame Finder (ORF Finder)，点击进⼊。
NCBI使用方法
NCBI使用方法默认分类 2008-03-24 15:14 阅读2903 评论12字号：大中小NCBI (National Center for Biotechnology Information), 美国国家生物技术信息中心[url]/[/url]NCBI是NIH的国立医学图书馆（NLM）的一个分支。
NCBI提供检索的服务包括：1．GenBank（NIH遗传序列数据库）：一个可以公开获得所有的DNA序列的注释过的收集。
Gen Bank是由NCBI受过分子生物学高级训练的工作人员通过来自各个实验室递交的序列和同国际核酸序列数据库（EMBL和DDBJ）交换数据建立起数据库的。
它同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。
这三个组织每天交换数据。
其中的数据以指数形式增长，最近的数据为它已经有来自47000个物种的30亿个碱基。
2．Molecular Databases（分子数据库）：Nucleotide Sequence（核酸序列库）：从NCBI其他如Genbank数据库中收集整理核酸序列，提供直接的检索。
Protein Sequence （蛋白质序列库）：与核酸类似，也是从NCBI多个不同资源中编译整理的，方便研究者的直接查询。
Structure（结构）-——关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问三维蛋白质结构的分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。
MMDB：分子模型数据库—一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。
Taxonomy（分类学）——NCBI的分类数据库，包括大于7万余个物种的名字和种系，这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。
其目的是为序列数据库建立一个一致的种系发生分类学。
3．Literature Databases（文献数据库）（1）PubMed是NLM提供的一项服务，能够对MEDLINE上超过1200万条的上世纪六十年代中期至今的杂志引用和其他的生命科学期刊进行访问，并可以连接到参与的出版商网络站点的全文文章和其他相关资源。
NCBI使用方法详解
一步一步教你使用NCBI 查找DNA、mRNA、cDNA、Protein、promoter、引物设计、BLAST序列比对等作者：urbest2007-8-1苏州大学生命科学学院最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用BLAST进行序列比对……，这些问题在NCBI上都可以方便的找到答案。
现在我就结合我自己使用NCBI的一些经历（经验）跟大家交流一下BCBI的使用。
希望大家都能发表自己的使用心得，让我们共同进步！我分以下几个部分说一下NCBI的使用：Part one 如何查找基因序列、mRNA、PromoterPart two 如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列Part three 运用STS查找已经公布的引物序列Part four 如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性特别感谢本版版主，将这个帖子置顶！从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的（以及想给我投票却暂时不能投票的）各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友！请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。
关于NCBI其他方面的使用也请水平较高的战友给予补充First of all，还是让我们从查找基因序列开始。
第一部分 利用Map viewer查找基因序列、mRNA序列、启动子（Promoter）下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤1．打开Map viewer页面，网址为：/mapview/index.html 在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。
操作完毕如图所示：2．点击“GO”出现如下页面：3．在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene 前面的小方框里打勾，然后点击Filter. 出现下图：说明一下：1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。
2、下面参考序列给出了三个，是不同的部门做出来的，经我验证，序列有微小的差异，但总体来说基本相同。
NCBI使用手册
clin exp immunol
布尔逻辑运算式： (运算符须大写）如 ：
Stem [ti] AND neuroscience
自动转换检索词（automatic term mapping）
自动对照规范词表,期刊名表，短语， 著者名索引, 依次寻找转换 短语寻找转换 单词转换 在所 单词在上述四个字段寻找转换 有字段中转换
引文匹配器 （Citation Matcher）:
输入题录信息，查找特定文献进行 补缺。 刊名要准确，缩写要标准 著者姓名大小写不敏感 如查找：Taiwan I Hsueh Hui Chih由 Chang PY（taiwan yi xue hui za zhi ) 撰写、 1975 发表文献的其他著者
NCBI生物信息整合系统 EnenBank, EMBL等数据库的核酸序 列； 获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质 序列；从核酸序列翻译到蛋白质的序 列；
蛋白质三维结构数据及大分子模式 （MMDB）等其他生物信息数据库检索
因特网上检索免费MEDLINE
()
Healthgate Medline
()
PubMed
数据类型：期刊论文、综述、以
及与其他数据资源链接。
特点：
1.免费提供题录和文摘 2.可与提供原文的网址链接 (部分免费获取） 3. 提供检索词自动转换匹配 4. 操作简便、快捷
如：输入stem[ti] AND neuroscience Details显示：
(stem[ti] AND ("neurosciences"[MeSH Terms] OR neuroscience[Text Word]))
截词检索：treat* 强迫短语检索：“brca 1”（不再 自动转换匹配和扩展检索）
ncbi中文说明书
NCBI (National Center for Biotechnology Information), 美国国家生物技术信息中心[url]/[/url]NCBI是NIH的国立医学图书馆（NLM）的一个分支。
NCBI提供检索的服务包括：1．GenBank（NIH遗传序列数据库）：一个可以公开获得所有的DNA序列的注释过的收集。
GenBank是由NCBI受过分子生物学高级训练的工作人员通过来自各个实验室递交的序列和同国际核酸序列数据库（EMBL和DDBJ）交换数据建立起数据库的。
它同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。
这三个组织每天交换数据。
其中的数据以指数形式增长，最近的数据为它已经有来自47000个物种的30亿个碱基。
2．Molecular Databases（分子数据库）：Nucleotide Sequence（核酸序列库）：从NCBI其他如Genbank数据库中收集整理核酸序列，提供直接的检索。
Protein Sequence （蛋白质序列库）：与核酸类似，也是从NCBI多个不同资源中编译整理的，方便研究者的直接查询。
Structure（结构）-——关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问三维蛋白质结构的分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。
MMDB：分子模型数据库—一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。
Taxonomy（分类学）——NCBI的分类数据库，包括大于7万余个物种的名字和种系，这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。
其目的是为序列数据库建立一个一致的种系发生分类学。
3．Literature Databases（文献数据库）（1）PubMed是NLM提供的一项服务，能够对MEDLINE上超过1200万条的上世纪六十年代中期至今的杂志引用和其他的生命科学期刊进行访问，并可以连接到参与的出版商网络站点的全文文章和其他相关资源。
ncbi使用指导
ncbi使用指导【原创实用版】目录1.NCBI 的简介和重要性2.NCBI 的使用方法和资源3.NCBI 的数据库和工具4.NCBI 的应用领域和未来发展正文CBI（National Center for Biotechnology Information）是美国国家生物技术信息中心的简称，是一个提供生物学和医学信息的权威机构。
NCBI 的使命是提高生物学和医学的研究水平，为科学家和医生提供最好的信息资源和服务。
CBI 的使用方法和资源非常丰富。
首先，可以通过搜索框搜索感兴趣的关键词，找到相关的文献、基因、蛋白质等信息。
其次，可以使用各种数据库，如基因序列数据库、蛋白质序列数据库、基因组数据库等，进行深入的研究。
此外，NCBI 还提供了各种工具，如 BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）用于基因序列比对，Cn3D 用于三维结构可视化，以及各种统计和分析工具。
CBI 的数据库和工具非常丰富。
基因序列数据库中包含了所有已知的基因序列，可以进行基因序列比对和分析。
蛋白质序列数据库包含了所有已知的蛋白质序列，可以进行蛋白质序列比对和分析。
基因组数据库则包含了各个物种的基因组信息，可以进行基因组组装和分析。
此外，还有诸如文献数据库、药物数据库、代谢物数据库等。
CBI 的应用领域非常广泛，涉及到生物学、医学、药学、环境科学等各个领域。
科学家和医生可以使用 NCBI 的资源和工具进行研究，提高研究的效率和质量。
同时，NCBI 的资源和工具也为教育工作者和学生提供了学习和研究的重要资源。
随着生物技术和生物信息的发展，NCBI 的未来发展前景广阔。
将会有更多的数据库和工具被开发和应用，为科学家和医生提供更好的服务。
同时，NCBI 也将面临更多的挑战，如数据量的增长、数据质量的保证等。
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NCBI (National Center for Biotechnology Information), 美国国家生物技术信息中心[url]/[/url]NCBI是NIH的国立医学图书馆（NLM）的一个分支。
NCBI提供检索的服务包括：1．GenBank（NIH遗传序列数据库）：一个可以公开获得所有的DNA序列的注释过的收集。
GenBank是由NCBI受过分子生物学高级训练的工作人员通过来自各个实验室递交的序列和同国际核酸序列数据库（EMBL和DDBJ）交换数据建立起数据库的。
它同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。
这三个组织每天交换数据。
其中的数据以指数形式增长，最近的数据为它已经有来自47000个物种的30亿个碱基。
2．Molecular Databases（分子数据库）：Nucleotide Sequence（核酸序列库）：从NCBI其他如Genbank数据库中收集整理核酸序列，提供直接的检索。
Protein Sequence （蛋白质序列库）：与核酸类似，也是从NCBI多个不同资源中编译整理的，方便研究者的直接查询。
Structure（结构）-——关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问三维蛋白质结构的分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。
MMDB：分子模型数据库—一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。
Taxonomy（分类学）——NCBI的分类数据库，包括大于7万余个物种的名字和种系，这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。
其目的是为序列数据库建立一个一致的种系发生分类学。
3．Literature Databases（文献数据库）（1）PubMed是NLM提供的一项服务，能够对MEDLINE上超过1200万条的上世纪六十年代中期至今的杂志引用和其他的生命科学期刊进行访问，并可以连接到参与的出版商网络站点的全文文章和其他相关资源。
（2）PMC/PubMed Center：也是NLM的生命科学期刊文献的数字化存储数据库，用户可以免费获取PMC的文章全文，除了部分期刊要求对近期的文章付费。
（3）OMIM（孟德尔人类遗传）：有关人类基因和无序基因的目录数据库由Victor A.McKusick和他的同事共同创造和编辑的，由NCBI网站负责开发，其中也包括对MEDINE众多资源和Entrez系统的序列记录，以及NCBI中其他有关资源的链接。
（4）Books：NCBI的书库不断收集生物医学方面的书籍，提供这些书籍的出版信息、摘要、目录和全文的连接，用户可以直接在检索文本框内输入一个观念就可以查询。
4．NCBI提供的附加的软件工具有：开放阅读框寻觅器（ORF Finder），电子PCR，和序列提交工具Sequin和BankIt。
所有的NCBI数据库和软件工具可以从WWW或FTP来获得。
NCBI还有E-mail服务器，提供用文本搜索或序列相似搜索访问数据库一种可选方法。
NCBI网站上还提供了一些诸如研究热点问题、研究小组情况、教育培训、联系方式等信息，还提供了到NIH、NLM等的链接。
使用方法:用户可以免费登陆NCBI的网站，NCBI为使用者提供了方便的检索系统和检索方法：1．Entrez是NCBI为用户提供整合所有数据库的访问序列，定位，分类，和结构数据的搜索和检索工具系统，同时也提供序列和染色体图谱的图形视图。
用户进入系统或者进入任意一个数据库，都会看到简单检索的界面，选择数据库输入关键词即可进行查询。
Entrez也提供条件限制和高级检索、布尔逻辑查询。
使用新的Linkout服务，外部资源可以被链接到Entrez记录。
2．BLAST是一个NCBI开发的序列相似搜索程序，还可作为鉴别基因和遗传特点的手段。
BLAST能够在小于15秒的时间内对整个DNA数据库执行序列搜索。
NCBI Education/Education/index.html网址详情:这是NCBI在线教育资源的索引页，从这里出发你会找到NCBI提供的教学资源，这些教程不仅囊括了NCBI网站提供的最常用的工具和数据库（BLAST，Entrez， PubMed， NCBI News，Resource publications ，Map Viewer exercises，Structure ，NCBI Handbook）的使用方法和信息,还有一些相关的分子生物学的基础入门知识(NCBI science primer...)。
教程大多不仅有文字图片还有动画，直观易懂，目的就是一个让大家尽可能快而有效的掌握好NCBI的使用，在这个聚宝盆里淘到真金。
当然您如果想对所有NCBI的数据库和工具有更透彻深入的了解，请绝对不要错过共24章的NCBI手册(NCBI Handbook)[url]/books/bv.fcgi?rid=handbook[/url]GenBank数据库简介1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。
是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。
GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。
唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图谱，分类学浏览器，同国立癌症研究所合作的癌症基因组剖析计划（CGAP）等数据库。
GenBank以指数形式增长，核酸碱基数目大概每14个月就翻一个倍。
2. 纪录样本 - 关于GenBank的各个字段的详细描述，以及同Entrez搜索字段的交叉索引。
3. 访问GenBank - 通过Entrez Nucleotides来查询。
用accession number，作者姓名，物种，基因/蛋白名字，还有许多其他的文本术语来查询。
关于Entrez 更多的信息请看下文。
用BLAST来在GenBank和其他数据库中进行序列相似搜索。
用E-mail来访问Entrez和BLAST可以通过Query和BLAST服务器。
另外一种选择是可以用FTP下载整个的GenBank和更新数据。
4. 增长统计 - 参见公布通知的2.2.6（每个分类的统计），2.2.7（每个物种的统计），2.2.8（GenBank增长）小节。
5. 公布通知，最新 - 最近和即将有的变化，GenBank的分类，数据增长统计，GenBank的引用。
6. 公布通知，旧 - 同上相同，是过去公布的统计。
7. 遗传密码 - 15个遗传密码的概要。
用来确保GenBank中纪录的编码序列被正确的翻译。
向GenBank提交数据：1. 关于提交序列数据，收到accession number，和对纪录作更新的一般信息。
2. BankIt - 用于一条或者少数条提交的基于WWW的提交工具软件。
（请在提交前用VecScreen去除载体）3. Sequin - 提交软件程序，用于一条或者很多条的提交，长序列，完整基因组，alignments，人群/种系/突变研究的提交。
可以独立使用，或者用基于TCP/IP的“network aware”模式，可以链接到其他NCBI的资源和软件比如Entrez和PowerBLAST。
（请在提交前用VecScreen去除载体）4. ESTs - 表达序列标签，短的、单次（测序）阅读的cDNA序列。
也包括来自于差异显示和RACE实验的cDNA序列。
5. GSSs - 基因组调查序列，短的、单次（测序）阅读的cDNA序列，exon trap 获得的序列，cosmid/BAC/YAC末端，及其他。
6. HTGs - 来自于大规模测序中心的高通量基因组序列，未完成的（阶段0，1，2）和完成的（阶段3）序列。
（注意：完成的人类的HTG序列可以同时在GenBank 和Human Genome Sequencing页面上访问。
）7. STSs - 序列标签位点。
短的在基因组上可以被唯一操作的序列，用于产生作图位点。
8. 注：SNPs - 人类的和其他物种的遗传变异数据可以提交到NCBI数据库的单核苷酸多态性库中（dbSNP）。
国际核苷酸序列数据库合作组织：1. GenBank，DDBJ，EMBL - 合作计划的概述，并链接到相应的主页。
GenBank，DDBJ（DNA Data Bank of Japan），and EMBL （European Molecular Biology Laboratory）数据库共享的数据是每天都交换的，因此他们是相等的。
数据纪录的格式和搜索方式可能会不一样，但是accession number，序列数据和注解都是一模一样的。
即，你可以用accession number U12345在GenBank，DDBJ或EMBL中查找相应纪录，得到的结果是完全一样的序列数据，参考内容等等2. DDBJ/EMBJ/GenBank特性表—特性表格式和标准被合作数据库用在序列记录的注释上，使得数据共享成为可能，包括详细的描述生物特性和特性限定语的附录，以及IUPAC规定的核苷酸和氨基酸的代号。
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式—参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。
2. ASN.1格式—摘要句法记号1，国际标准组织（ISO）数据表示格式，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。
3. FASTA格式—定义行号后只跟随序列数据（示例），参见描述数据库的readme文件，包括nt.Z（每天更新的非冗余BLAST核酸数据库，包括GenBank+EMBL+DDBJ+PDB序列，但是不包括EST, STS, GSS, or HTGS序列），nr.Z（每日更新的非冗余蛋白质），est.Z, gss.Z, htg.Z, sts.Z,和其它文件。
分子数据库：1. 核酸序列1、 Entrez核酸：用accession number,作者姓名，物种，基因/蛋白名字，以及很多其它的文本术语来搜索核酸序列记录（在GenBank + PDB中）。
更多的关于Entrez的信息见下。
如果要检索大量数据，也可使用Batch Entrez（批量Entrez）。
2、 RefSeq ： NCBI数据库的参考序列。
校正的，非冗余集合，包括基因组DNA contigs，已知基因的mRNAs和蛋白，在将来，整个的染色体。
Accession numbers用NT_xxxxxx, NM_xxxxxx, NP_xxxxxx, 和NC_xxxxxx的形式来表示。