Poly结构或者重复序列
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Poly结构或者重复序列
1.Poly T 导致此区域后面产生非特异套峰;
2.Poly A导致此区域后面产生非特异套峰;
3.GT重复序列导致此区域后面产生非特异套峰;
4.AT重复序列导致此区域后面产生非特异套峰;
可能的原因:
重复序列会导致酶的滑动,所以造成套峰。
解决方案:
1.现有的Sanger测序技术无法确保重复序列测序时酶的忠实性;
2.从另一个方向测序;
3.如果客户的目的就是测出重复序列,只能建议其更换测序方法;
4.用锚定引物结合重复序列及其后的序列。
此种方法也不会测出准确的重复序列;
5.在偏短的PCR片段中,重复序列的问题尤为突出。
可以将片段克隆到载体上增加测序长度已降低酶滑动的几率。