分子生物学检验技术-第五章 核酸的分离与纯化
《核酸的分离纯化》课件

《核酸的分离纯化》课件课程目标:1. 理解核酸分离纯化的意义和重要性。
2. 掌握核酸分离纯化的基本原理和步骤。
3. 学习核酸分离纯化的实验操作技巧。
4. 了解核酸分离纯化在科学研究和临床诊断中的应用。
第一部分:核酸分离纯化的意义和重要性1. 核酸的定义和功能核酸是生物体内携带遗传信息的分子,包括DNA和RNA。
核酸在遗传信息的传递、基因表达调控和疾病发生中起着重要作用。
2. 核酸分离纯化的意义核酸分离纯化是研究核酸结构和功能的基础。
核酸分离纯化有助于研究基因表达调控、基因突变和基因功能。
核酸分离纯化在临床诊断和疾病治疗中具有重要意义,如病原体检测、基因突变筛查和个体化治疗。
第二部分:核酸分离纯化的基本原理和步骤1. 核酸分离纯化的基本原理根据核酸的物理化学性质,如大小、电荷、亲和性和稳定性等,进行分离纯化。
常用的分离纯化方法包括离心、电泳、亲和色谱和质谱等。
2. 核酸分离纯化的基本步骤样品处理:收集含有核酸的样品,如细胞裂解、核提取等。
核酸释放:通过机械或化学方法将核酸从样品中释放出来。
核酸沉淀:通过盐析、酒精沉淀等方法将核酸从溶液中沉淀下来。
核酸洗涤:去除沉淀中的杂质,如蛋白、RNA等。
核酸纯化:通过柱层析、亲和色谱等方法进一步纯化核酸。
核酸鉴定:通过紫外线吸收、琼脂糖凝胶电泳等方法检测核酸的质量和数量。
第三部分:核酸分离纯化的实验操作技巧1. 样品处理技巧细胞裂解:使用酶或化学方法裂解细胞,释放核酸。
核提取:使用盐水或缓冲液提取核酸。
2. 核酸沉淀技巧盐析:加入高盐浓度使核酸沉淀。
酒精沉淀:加入酒精使核酸沉淀。
3. 核酸洗涤技巧离心:使用离心机去除沉淀中的杂质。
洗涤缓冲液:选择适当的洗涤缓冲液去除杂质。
4. 核酸纯化技巧柱层析:使用固定相和流动相进行核酸纯化。
亲和色谱:利用核酸与特定配体之间的亲和力进行纯化。
5. 核酸鉴定技巧紫外线吸收:测量核酸在紫外线波段的吸光度。
琼脂糖凝胶电泳:将核酸样品在琼脂糖凝胶上进行电泳,观察核酸的迁移率和条带形状。
核酸的分离纯化技术

核酸的分离纯化技术从细胞中提取核酸后,仍混杂着蛋白质、多糖和各种大小分子核酸同类物。
除去这些“杂质”的过程,也就是核酸提纯过程。
在核酸的分离纯化时,为防止核酸大分子的变性降解,必须在0~4℃的低温条件下操作。
核酸酶的水解作用,是过去制备具有活性核酸大分子的严重障碍,现普遍采用加入去污剂或加入EDTA、8-羟基喹啉、柠檬酸钠以除去核酸酶的激活剂Mg2+,就可以抑制核酸酶的活性,保证在提纯过程中核酸大分子的完整。
关于核酸分离纯化阶段中除去多糖、蛋白质及不同类型核酸之间分离的一些方法,分别介绍如下:(1)肝糖元、淀粉及粘多糖,由于其物理化学性质与核酸有许多相似之处,常在提取液中残存下来。
除去的方法常有:①取材前尽量减少组织中多糖的含量,如先使动物饥饿数天然后杀死,可使细胞内肝糖元大大减少。
②加入淀粉酶,将大分子多糖分解为小分子,在以后纯化步骤中逐渐被除去。
③在浓磷酸盐存在下,以2-甲氧基乙醇抽提核酸提取液,使多糖溶于下层水相,核酸在上面有机层中。
④以钙盐沉淀DNA,再以草酸钾处理,使之形成DNA钾盐回收,然后用离子交换法吸附DNA,使之与多糖分离。
(2)蛋白质的除去:由于核酸在细胞内以核蛋白体形式存在,不论采用哪种方法提取核酸,蛋白质都不同程度地存在于体系中。
因此,除去蛋白质是核酸分离纯化不可避免的步骤。
常用方法有下列几种:①加入去污剂如硫酸十二脂钠,从提取到分离纯化各阶段均可反复使用此法。
去污剂与氯仿法或苯酚法结合使用,效果更加理想。
②氯仿-戊醇或辛醇对提取液摇荡抽提,蛋白质在氯仿-水界面形成凝胶,离心后除去,核酸留在水溶液中。
此法在分离纯化中也常反复使用。
③苯酚水溶液抽提,在对氨基水杨酸等阴离子化合物存在下,DNA或RNA都可以进入水相,蛋白质则沉淀于酚层,然后取水相加入乙醇或2-乙氧基乙醇沉淀RNA 或DNA,残余的酚可用葡聚糖凝胶G-10或G-25除去。
(3)不同类型核酸的分离:两种类型核酸的制备过程中,DNA制品中混杂着少量RNA或RNA制品中混杂着少量DNA是经常发生的。
核酸分离纯化

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概述
• 核酸的分类、分布及意义
• 核酸分离纯化的意义 • 核酸的存在方式:DNP、RNP
• 核酸的结构特征
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核酸分离的技术路线
ETOH ppt
Phenol
ProtK
SDS
Spin
Chloro
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DNA样品的纯化: 1. 分子大,容易断裂 2.容易污染其它来源的DNA
纯化方法: 1.透析
2.层析
3.选择性沉淀
4.凝胶电泳
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Agarose Gel Electrophoresis
_
+
片段回收
核酸的浓缩、沉淀与洗涤: 1.浓缩:提高样品浓度; 2.沉淀:常用的浓缩方法,如醋酸钠、
醋酸铵等 3.洗涤:除去共沉淀的盐,常用70%-
75%的乙醇。
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三、核酸的鉴定与保存
浓度鉴定: 1. 紫外分光光度法:
原理:紫外吸收特性
粗略定量:1 OD相当于 50g/ml双链DNA, 38g/ml单链 DNA或单链RNA,33g/ml单链寡聚核苷酸;
tissue
Paper Towels
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1
第一节 核酸分离与纯化的原则
• 材料与方法的选择原则 • 技术路线的设计 • 核酸的鉴定与保存
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一、材料与方法的选择
实验要求: 1.质量高:完整性、产量、纯度和浓度符 合实验要求; 2.方法好:简便快速、安全、经济; 3.标本易得:血液、尿液、组织切块、培 养的细胞和细菌等。
医学课件-核酸的分离与纯化

课程背景
化学组成
核酸是由核苷酸构成的,包括脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)两种。
结构特征
DNA的双螺旋结构以及RNA的单链结构是核酸的典型结构特征。
核酸简介
获得高纯度核酸
提高核酸检测灵敏度
研究和开发需求
分离与纯化的目的
02
核酸的分离
将生物样品处理成匀浆或细胞裂解液,以便释放其中的核酸。
要点一
要点二
自动化和智能化
未来的核酸分离和纯化技术将更加注重自动化和智能化,能够实现自动化操作、减少人为误差和增加批量化生产的能力。
应用领域的拓展
随着生命科学和医学的不断发展和进步,核酸分离和纯化技术的应用领域也将不断拓展,将会有更多的应用场景和用途被发现和应用。
要点三
谢谢您的观看
THANKS
xx年xx月xx日
医学课件-核酸的分离与纯化
CATALOGUE
目录
引言核酸的分离核酸的纯化核酸的鉴定实验方案设计总结与展望
01
引言
核酸是生物体内的重要遗传物质,对于研究基因组、基因表达、基因功能等生物学核心问题具有重要意义。
生物学研究需求
随着生物学和生物技术学的不断发展,不断有新的核酸分离与纯化方法和技术出现,推动了医学和生物医学领域的发展。
步骤
将细胞裂解后,加入酚氯仿混合液,充分混匀,离心,取上清液,再加入氯仿充分混匀,离心,取上清液,最后加入异戊醇沉淀核酸。
实验方案设计一:酚氯仿抽提法
原理
乙醇沉淀法是一种利用乙醇沉淀核酸的方法。
步骤
将细胞裂解后,加入乙醇,充分混匀,离心,弃去上清液,再加入乙醇洗涤沉淀,离心,弃去上清液,最后干燥沉淀得到核酸。
核酸的分离与纯化

实验室常见样本核酸提取方法
——痰标本提取方法:
Saccomno液:每50毫升固定液中含50% 乙醇48 mL,2%聚乙
二醇1 mL、0.3利福平1 mL ;
DTT (二硫苏糖醇)液: 0.1g DTT、0.78g NaCl、0.02g KCl、
核酸提取方法——分离与纯化
——盐析法
产量较低,但方法简单,比较酚氯仿方法无化学危害; 同样不适合大规模自动化提取。 提取好的DNA用蛋白酶处理纯度会提高。
核酸提取方法——分离与纯化
——硅胶吸附法
1、细胞裂解和酶处理同前述;
2、处理好的裂解液转入硅胶离心柱,高速离心,利用硅胶可以吸附核酸 而不能与其它物质如蛋白质,脂类等结合的特点,洗脱这类杂质;
STE 等)
在一定的p H 环境下,表面活性剂或强离子剂可使细胞裂解、蛋 白质和多糖沉淀,核酸释放到水相;某些缓冲液中的一些金属离 子螯合剂( EDTA 等) 可螯合对核酸酶活性所必须的金属离子 Mg2+ 、Ca2+ ,从而抑制核酸酶的活性,保护核酸不被降解。
核酸提取方法——细胞裂解
——酶作用(生物作用):
实验室常见样本核酸提取方法
——血清样本核酸提取方法:
血清中微生物来源RNA提取方法: 1、 酚氯仿法; 繁琐,手工操作重复性较差
2、磁珠法; 方便,易于自动化,重复性很好,成本较高
实验室常见样本核酸提取方法
——血清样本核酸提取方法:
血清中循环核酸提取方法: 1、酚氯仿法;
2、磁珠法;
人类基因组、发生肿瘤时异常升高;-孕妇的循环核酸亦可来源于 胎儿。
主要是通过加入溶菌酶或蛋白酶(蛋白酶K、 植物蛋白酶或链酶蛋白酶) 以使细胞破裂,核 酸释放。
核酸的分离与纯化

荧光光度法: 原理:核酸的荧光染料溴化乙锭(EB)嵌入碱基平面后,使本身无荧光的核酸在紫外线 激发下发出检红色的荧光,且荧光强度积分与核酸含量呈正比。 灵敏度:1-5ng
核酸的分离与纯化
基本知识回顾
核酸(nucleic acid):以核苷酸为基本组成单位 的生物 核酸 信息大分子
具有复杂的结构
DNA 天然存在的核酸 RNA
重要的功能 信息的载体 信息的储存、传递与表达
基本知识回顾
DNP-脱氧核糖核蛋白 RNP-核糖核蛋白 真核生物-染色体DNA和细胞器DNA 原核生物-双链环装质粒DNA
三、鉴定与保存
2.纯度鉴定: 2.纯度鉴定: 纯度鉴定
紫外分光光度法
DNA:在TE缓冲液中,纯DNA的A260/A280比值为1.8 蛋白质(280nm)与酚(270nm)使比值下降 RNA(260nm)使比值升高
RNA:在TE缓冲液中,纯RNA的A260/A280比值为2.0,但由于RNA二级 结构不同,其读数可能在1.8-2.1之间波动。 鉴定RNA纯度所用溶液的pH会影响A260/A280读数。
1.DEAE纤维素膜插片电泳法:阴离子交换;500bp-5kb 2.电泳洗脱法:切胶纯化 3.冷冻挤压法:液氮冷冻挤压;<5kb 4.低熔点琼脂糖凝胶挖块回收法:切胶纯化;PFGE高分子量DNA
从聚丙烯酰胺凝胶中回收DNA 从聚丙烯酰胺凝胶中回收DNA片段 DNA片段
压碎与浸泡法:能较好回收<1kb的DNA,回收率依分子量不同为30-90%, DNA纯度高,无酶抑制剂,是小片断DNA回收的较好方法。
医学课件-核酸的分离与纯化

xx年xx月xx日
目 录
• 核酸的分离与纯化概述 • 核酸的分离与纯化技术 • 核酸的分离与纯化步骤 • 核酸的分离与纯化挑战及解决方案 • 核酸的分离与纯化展望
01
核酸的分离与纯化概述
核酸的分离与纯化的定义和重要性
定义
核酸的分离与纯化是生物学和医学研究中的一项基本技术, 主要是通过一系列的离心、过滤、萃取等步骤将样品中的核 酸与其他大分子物质、小分子物质、细胞结构等进行分离, 同时进一步纯化核酸的过程。
核酸的鉴定和检测
核酸鉴定
利用紫外吸收光谱、分子量测定、凝胶电泳等方法,对纯化的核酸进行鉴定 ,确认其是否为目标核酸。
核酸检测
利用特异性引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,检测目标核酸的存在和含量 。
04
核酸的分离与纯化挑战及解决方案
样品中核酸的降解和损失问题
稳定性差
核酸在体内易被核酸酶降解,影响分离效果。
鉴定方法选择
采用多种鉴定方法,如琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳等,以确保鉴 定结果的准确性。
标准化操作
通过使用标准化的操作流程和试剂盒,减少操作误差。
05
核酸的分离与纯化展望
核酸的分离与纯化技术的发展趋势
高效分离方法
在核酸分离方面,开发高效、快速、安全的分离方法将是未来的发展趋势,例如 ,改进离心技术、色谱技术等,提高分离效率和纯度。
生物技术应用
核酸的分离与纯化在生物技术领域也具有很大的应用潜力, 例如,用于基因工程、细胞工程和蛋白质工程等领域。通过 核酸分离,可以获得特定基因序列,用于基因克隆、基因敲 除和蛋白质表达等研究。
核酸的分离与纯化技术的未来研究方向
新技术的研发
核酸的分离与纯化讲解

• 二.质粒和噬菌体DNA的提取和纯化
• (一)质粒DNA的提取 • 基本步骤 • 1.细菌的培养 • 2.细菌的收集与裂解 • 3.质粒DNA的纯化 • 提取方法
• 煮沸法: • 碱法:最常用的质粒DNA提取方法。 • SDS法:
• (二)噬菌体DNA的提取
• 1.细菌培养 • 2.细菌的感染及裂解 • 3.噬菌体的沉淀及纯化 • 4.噬菌体DNA的提取
• 图1 玻璃砂研磨提取总DNA的电泳结果
• 1-4孔为低pH值法,5-8孔为CTAB法,9-12孔为苯酚法 • 1,2为西洋参;3.鲜品布渣叶;4.干品布渣叶
• 图2 氧化铝研磨提取总DNA的电泳结果
• 1-4孔为低pH值法,5-8孔为CTAB法,9-12孔为苯酚法 • 1,2为西洋参;3.鲜品布渣叶;4.干品布渣叶
一、概述
• 核酸分离提取的原则 • 常用方法及基本原理 • DNA的分离纯化 • RNA的分离纯化
第一节 核酸分离提取的原则
• 一、基本原则
• 1.保证核酸一级结构的完整性。 • 2.排除其它分子的污染。
• 二、注意事项
• 1.简化操作步骤,减少对核酸的破坏。 • 2.避免过酸(碱)等化学因素的影响(pH4~10)。 • 3.减少物理因素对核酸的降解。 • 4.防止核酸的生物降解。
• ③分离浮力密度不同的DNA分子或其他分子颗粒, 如图1。
图1 氯化铯梯度纯化λ噬菌体
噬菌体在1.45g/ml与1.50g/ml氯化铯界面之间形成一肉眼可 见的带。在1.45g/ml与1.50g/ml氯化铯界面之间可看到一个 由噬菌体颗粒形成的浅蓝色带。
• ④纯化DNA分子。在中性CsCl溶液中,DNA的 浮力密度为1.7g/ml,RNA为2.0g/ml,蛋白 质的浮力密度为1.3~1.4g/ml。在起始密度 为1.7g/ml的CsCl溶液中进行超速离心,可 以很好地将三者区分开。蛋白质浮在上层液 面,DNA分子在离心管中间形成区带,RNA沉 于管底,从而达到从DNA样品中去除微量RNA 和蛋白质的目的。
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二、技术路线的设计
总技术路线: 核酸的释放
核酸的分离、纯化(包括粗分离和细分离)
核酸的浓缩、沉淀与洗涤 核酸的鉴定与保存
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计—核酸的释放
(一)核酸的释放
分离提取某一生物大分子,首先要求生物大分 子从原来的组织或细胞中以溶解的状态释放出 来,并保持原来的天然状态和生物活性。
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计—核酸的鉴定与保存
浓度测定方法: 10ul DNA+990ul双蒸水,测A260值。 记录A值,通过计算确定DNA浓度, 公式如下: dsDNAg/ml=50×A260 × 稀释倍数
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计—核酸的鉴定与保存
第五章 核酸的分离与纯化
生物大分子分离纯化设计总原则
应遵循的总原则: 一是保持生物大分子序列的完整性 二是保证生物大分子制品的纯度
核酸分离纯化的设计及原则
第一节 核酸分离纯化的设计及原则
应遵循的原则: 一是保持核酸序列的完整性 这是是结构 研究和基因诊断的基本要求。通常要求得 到的片段的长度不小于100-200kb。 二是保证核酸制品的纯度 尽量排除其它 分子对后续研究的干扰。
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计—核酸的鉴定与保存
(四)核酸的鉴定与保存
核酸的鉴定: 浓度鉴定 纯度鉴定 完整性鉴定
核酸分离纯化的设计及原则—技术度法: 由于嘌呤碱和嘧啶碱具 有共轭双键结构,具有 独特的紫外线吸收光谱, 一般在260nm左右有最大 吸收峰,可以作为核酸 及其组份定性和定量测 定的依据。检测灵敏度 0.25ug/ml(250ng/ml)。
核酸分离纯化的设计及原则—材料与方法选择
一、材料与方法的选择
(一)材料与方法的选择 可选择的生物标本:体液(血液、尿液、唾液、痰 液、胸腹水)、组织块、培养细胞等。
可选择的分离方法:酚抽提法、甲酰胺解聚法;异 硫氰酸胍-酚-氯仿法等。 方法选择原则:在满足研究或检测对核酸完整性和 纯度要求前提下,尽可能考虑核酸制备的时间、成 本、实验室安全性。
分离对象的基本情况
核酸存在形式 核蛋白(nucleoprotein) DNA + 蛋白质(deoxyribonucleoprotein, DNP ) RNA + 蛋白质(ribonucleoprotein, RNP ) 核酸的细胞定位、结构 真核生物核酸的分布: 核内染色体DNA、细胞器DNA;细胞质RNA 原核生物核酸的分布: “染色体”DNA、质粒DNA 病毒核酸: DNA、RNA病毒 单、双链(环或线状) 核酸的理化性质 基因组大小:病毒、原核、真核生物基因组 化学性质:在一定pH范围内 DNA对碱相对稳定 RNA对酸相对稳定
分离纯化核酸的第一步 的过程。
裂解细胞、释放核酸
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计—核酸的释放
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计—核酸的释放
裂解细胞的方法
机械法裂解细胞: 机械 电动捣碎机 匀浆器破碎 石英砂研磨 高压挤压 物理 超声波破碎 液氮冷冻研磨 可用于植物细胞和细菌细胞的裂解。 由于机械法损坏高分子量的线性DNA分子,一般不 提倡。
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计—核酸的浓缩与洗涤
(三)核酸的沉淀浓缩与洗涤
浓缩提取液中核酸 ,同时进一步除去杂质和无机离 子的过程。
浓缩方法: 有机溶剂沉淀 是浓缩核酸和进一步去除杂质的最 好方法,是必不可少过程。 常用:盐类(醋酸铵) + 有机溶剂(乙醇)沉淀法。
洗涤 70-75%乙醇洗涤是同时沉淀核酸和去除盐类 的方法。
核酸分离纯化的设计及原则—保持核酸完整性和纯度
(二)保持核酸的完整性和纯度
影响完整性的因素: 物理 机械力、高温、辐射等 化学 强酸、强碱、有机溶剂 生物学 DNA酶(DNase) 、RNA酶(RNase)
核酸分离纯化的设计及原则—保持核酸完整性和纯度
措施: 为了得到完整的大分子核酸,一般要注意3点 : 1.保持低温(0º ~4℃),避免剧烈搅拌,避免辐射。 2.防止过酸、过碱。 缓冲液pH 4-10(DNA的pH8.3,RNA的pH4.5-5.5) 3.防止核酸酶的作用。 DNase抑制剂-- EDTA络合 Ca++,Mg++二价阳离子; Rnase抑制剂— 异硫氰酸胍等。
核酸分离纯化的设计及原则—保持核酸完整性和纯度
影响纯度的因素: 核酸污染 如外源核酸 蛋白质、多糖、脂类物质的污染 化学试剂污染…… 措施: 在建立和选择有效的分离纯化方法基础 上,避免污染:所有器皿清洁消毒、无 菌操作;用于分离不同核酸的器材应分 开,尽量采用一次性用品;增加纯化步 骤。
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计—核酸的鉴定与保存
吸光度换算为浓度: 1.000A260=50ug/ml ds-DNA(双链DNA) 1.000A260=33ug/ml ss-DNA (单链DNA) 1.000A260=40ug/ml ss-RNA (单链RNA)
背景扣除: A260- A310(盐吸光度)
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计—核酸的释放
非机械法裂解细胞: 干燥法 溶胞法 化学试剂与蛋白水解酶裂解细 胞,方法温和,有较高得率和较好核酸 完整性,普遍采用,如SDS-PK裂解细胞。
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计—核酸的释放
核酸分离纯化的设计及原则—技术路线的设计—核酸的分离与纯化
(二)核酸的分离与纯化
分离与纯化:利用一个或多个理化性质上的区别从 复杂的细胞裂解物中提取核酸或除去污染物的过程。 应去除的三类污染物: 1、非核酸的大分子污染物 蛋白质、多糖、脂类; 2、非需要的核酸分子; 3、对后续研究与诊断有影响的溶液与试剂。
步骤越多,纯度越高;步骤越少,结构完整性越好。