生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、步骤、试剂配制、结果分析共27页文档
琼脂糖凝胶电泳-完整整理
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基因组分析
分子诊断
用于分离和鉴定基因组DNA片段,如限制 性片段长度多态性分析、基因突变检测等 。
用于检测和鉴定基因突变、病原微生物DNA 等,如聚合酶链式反应(PCR)产物电泳、 单链构象多态性分析等。
基因克隆
测序
用于分离和纯化目的基模板,如末端测 序、全基因组测序等。
达差异。
04 琼脂糖凝胶电泳实验问题 与解决
常见问题
条带弥散
由于点样量过多或电压过高,导致条带弥散。
条带过宽
由于凝胶浓度不合适或样品浓度过高,导致 条带过宽。
条带拖尾
样品中蛋白质降解或核酸酶污染,导致条带 拖尾。
条带不亮
由于染料浓度过低或曝光时间过短,导致条 带不亮。
问题分析
条带弥散
可能是由于点样量过多或电压过高, 导致DNA在凝胶中扩散。
琼脂糖凝胶电泳-完 整整理
目录
CONTENTS
• 琼脂糖凝胶电泳介绍 • 琼脂糖凝胶电泳实验操作 • 琼脂糖凝胶电泳结果分析 • 琼脂糖凝胶电泳实验问题与解决 •凝胶电泳的定义
01
琼脂糖凝胶电泳是指在琼脂糖凝 胶中进行的电泳技术,主要用于 分离、鉴定和纯化DNA片段。
浓度比较
通过条带亮度,比较不同 样品中目标DNA片段的浓 度。
纯度评估
根据条带的亮度与背景噪 音的比例,评估DNA片段 的纯度。
结果应用
基因克隆
01
通过琼脂糖凝胶电泳检测目的基因是否被正确克隆到载体中。
突变分析
02
利用电泳结果判断是否存在基因突变或点突变。
基因表达分析
03
通过比较不同组织或细胞系中目的基因的表达水平,分析其表
01
条带分析
生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理步骤试剂配制结果分析分析
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生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理步骤试剂配制结果分析分析DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物化学分离和分析方法,可以根据DNA片段的大小进行分离和鉴定。
它通过将DNA样品加载在琼脂糖凝胶孔隙中,利用电场的作用使DNA片段沿电场方向迁移,从而实现分离和鉴定。
以下是关于DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、步骤、试剂配制和结果分析的详细解释。
原理:DNA琼脂糖凝胶电泳原理是根据DNA片段的大小和电荷来进行分离。
琼脂糖凝胶是一种大分子网状结构,DNA片段在凝胶中迁移时受到阻碍,较短的DNA片段能够比较快速地通过凝胶,而较长的DNA片段迁移速度较慢。
步骤:1.准备琼脂糖凝胶:将琼脂糖粉溶解在缓冲液中,加热,混合均匀后倒入电泳槽。
插入槽糖待凝固。
2.准备DNA样品:将待测的DNA样品加入到琼脂糖样品缓冲液中。
可加入染料以便可视化DNA迁移。
3.加载DNA样品:将DNA样品缓冲液均匀地加载到琼脂糖凝胶孔隙中。
4.进行电泳:将电泳槽两端连接上电源,设定合适的电场强度和电泳时间,使DNA片段在凝胶中迁移。
5.可视化DNA片段:停止电泳后,将琼脂糖凝胶转移到紫外可视化仪中,或者使用DNA染料染色,然后观察和记录DNA片段的迁移位置。
试剂配制:1. 缓冲液(TAE缓冲液):配制1X TAE缓冲液的方法是将0.4 MTris(pH 8.0)、0.2 M醋酸和0.01 M EDTA混合,在加75 ml水至1 L,将该缓冲液与琼脂糖按比例混合。
2. DNA染料:可以使用SYBR Green I等DNA染料,按照厂家说明进行稀释。
结果分析:DNA琼脂糖凝胶电泳的结果主要通过观察和记录DNA片段的迁移位置来进行分析。
根据DNA片段的大小,可以判断不同样品中的DNA片段是否存在,或者根据已知大小的DNA片段作为标记物,来确定未知DNA片段的大小。
通常,较小的DNA片段迁移得更快,迁移距离较大,而较大的DNA片段迁移得更慢,迁移距离较短。
生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、步骤、试剂配制、结果分析分析
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凝胶冷却至50°C,加EB至终浓度0.5μg/ml
铺
胶
凝胶凝固后取出梳子
加电泳缓冲液
准备样品
点
样
电
泳
注意观察溴酚蓝染液的迁移
紫外灯下观察电泳结果
照
相
DNA琼脂糖凝胶电泳
实验原理
琼脂糖为链状多糖 →绳状琼脂糖束→大网孔型凝
胶 ——分离、鉴定、纯化DNA
在 pH 值为 8.0~8.3 时,核酸分子碱基几乎不解
离,磷酸全部解离,核酸分子带负电,在电泳时 向正极移动。
采用适当浓度的凝胶介质作为电泳支持物,在分
子筛的作用下,使分子大小和构象不同的核酸分
子泳动率出现较大的差异,从而达到分离核酸片 段检测其大小的目的。
实验原理
当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙啶(Ethidium
bromide, EB)染色, 在紫外光下至少可以检出110ng的DNA条带, 从而可以确定DNA片段在凝胶 中的位置。
此外, 还可以从电泳后的凝胶中回收特定的DNA
条带, 用于以后的克隆操作。
状DNA>开环DNA
DNA片段越长,泳动速度越慢
在低电压时,泳动速度与电场强度成正比
不同浓度琼脂糖分离DNA分子的范围
琼脂糖浓度(W/V,%) 分离范围(kb)
0.3
0.6 0.7 0.9 1.2
5-60
1-20 0.8-10 0.5-7 0.4-6
1.5
2.0
0.2-4
0.1-3
DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。
胶浓(%) 0.6 溴酚蓝 b 0.15kb
2kb
1.6kb
操作步骤
琼脂糖凝胶的制备:溶化,冷却,EB 凝胶板的制备:加梳子,倒胶 样品的制备:样品+1/5体积溴酚蓝
琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法
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琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法[实验原理]电泳是现在用于分离和纯化DNA片段的最常用技术。
包含电解质的多孔支持介质----“胶”并把它置于静电场中。
则DNA分子将向阳极移动,这是因为DNA分子沿其双螺旋骨架两侧带有含负电荷的磷酸根残基。
当DNA长度增加时,来自电场的驱动力和来自凝胶的阻力之间的比率就会降低,不同长度的DNA片段就会表现出不同的迁移率。
因而就可依据DNA分子的大小来使其分离。
该过程通过把示踪染料(Purple Loading Dye)或分子量标准参照物(Ladder)和样品(DNA&RNA)一起进行电泳而得到检测。
分子量标准参照物也可以提供一个用于确定DNA片段大小的标准。
琼脂糖凝胶适用于分离大小在0.2-50Kb范围内的DNA片段。
[实验用品]1.琼脂糖 1.0%1.0g琼脂糖+100ml电泳缓冲液(TAE),微波炉中火30秒至沸腾,熔化的琼脂物冷却至60℃时可加入10mg/ml溴化乙锭10μl,充分混匀,将温热的凝胶倒入已置好梳子(鉴定胶用细密点的梳子;回收胶用粗稀的梳子)的胶膜中在室温下放置30-45min后现进行电泳。
1.5%:琼脂糖1.5g。
2.电泳缓冲液50×TAE Tris 乙酸 Tris 242g 终2 mol/L乙酸57.1ml 终1mol/L0.5M EDTA200ml pH8.0 终100mmol/LdH2O 补足至1000ml使用时稀释1×TAE。
5×TBE Tris 硼酸 Tris 54g 终445mmol/L硼酸27.5g 终445mmol/L0.5M EDTA20ml pH8.0 终10mmol/LdH2O 补足至1000ml使用时稀释10倍成0.5倍如50ml贮存液+450ml水→500ml工作液。
[实验内容与方法]1.移取适量的琼脂糖(如制备1%的琼脂糖胶液就移1g的琼脂糖溶于100ml TAE缓冲液中)微波炉加热使其溶于TAE缓冲液中。
dna琼脂糖凝胶电泳原理
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dna琼脂糖凝胶电泳原理DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离、纯化和分析DNA分子的方法。
它基于DNA分子在电场下的迁移速度与其分子大小和形态之间的关系,利用琼脂糖凝胶的孔隙结构来分离DNA分子。
在这篇文章中,我将深入探讨DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、方法和应用,并分享我的个人观点和理解。
一、DNA琼脂糖凝胶电泳的原理DNA分子是生物体内存储遗传信息的重要分子,其大小可在数百至数千碱基对之间。
DNA琼脂糖凝胶电泳是基于电荷分离的原理进行的。
DNA分子在电场中会带有负电荷,因此会受到电场力的作用而迁移。
琼脂糖凝胶是一种多孔性凝胶,可以形成一些微小的孔隙,这些孔隙能够根据DNA分子的大小和形态来筛选DNA分子。
当DNA样品通过琼脂糖凝胶电泳时,较小的DNA分子会迁移更快,而较大的DNA 分子会迁移更慢。
通过对琼脂糖凝胶上DNA分子的分离和检测,我们可以得到DNA分子的大小分布信息,进而进行DNA的纯化、分析和定性等研究。
二、DNA琼脂糖凝胶电泳的方法1. 准备琼脂糖凝胶:我们需要制备一定浓度的琼脂糖溶液,并加热融化。
我们将琼脂糖溶液倒入电泳槽中,在上下两端放置电极,形成一个电场。
2. 准备DNA样品:将需要进行分析的DNA样品与染料混合,使之具有一定的负电荷,并进行预处理,如加热变性。
3. 进行电泳分离:将DNA样品施加在琼脂糖凝胶孔隙上方,开启电源,使电场通过琼脂糖凝胶。
DNA分子会在电场力的作用下从样品孔隙处迁移到相反电极的方向。
迁移的速度与DNA分子的大小和形态有关,较小的DNA分子迁移较快,而较大的DNA分子迁移较慢。
4. 可视化和分析:凝胶电泳结束后,我们可以使用染料或放射性示踪剂来可视化DNA分子的分离结果,如荧光染料或放射性探针。
通过观察凝胶上的DNA条带,我们可以推测DNA分子的大小分布,进而对样品进行纯化、分析和定性等进一步研究。
三、DNA琼脂糖凝胶电泳的应用DNA琼脂糖凝胶电泳技术在分子生物学、遗传学和犯罪学等领域都有广泛的应用。
生物化学实验二:DNA的琼脂糖凝胶电泳
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生物化学实验二:DNA的琼脂糖凝胶电泳指导教师:李玉芹一、目的通过本实验学习琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法和技术。
二、原理琼脂糖凝胶电泳是分离鉴定和纯化DNA片段的常用方法。
DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应,DNA分子在高于等电点的pH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。
由于糖磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速度向正极方向移动。
在琼脂糖溶液中加入低浓度的溴化乙锭(ethidum bromide ,EB),在紫外光下可以检出 10ng的DNA条带,在电场中,pH8.0条件下,凝胶中带负电荷的DNA 向阳极迁移。
琼脂糖凝胶有如下特点:(1) DNA的分子大小在凝胶基质中其迁移速率与碱基对数目的常用对数值成反比,分子越大迁移得越慢。
(2) 琼脂糖浓度一个特定大小的线形DNA分子,其迁移速度在不同浓度的琼脂糖凝胶中各不相同。
DNA电泳迁移率(u)的对数与凝胶浓度(t)成线性关系。
(3) 电压低电压时,线状DNA片段迁移速率与所加电压成正比。
但是随着电场强度的增加,不同分子量DNA片段的迁移率将以不同的幅度增长,随着电压的增加,琼脂糖凝胶的有效分离范围将缩小。
要使大于2kb的DNA片段的分辨率达到最大,所加电压不得超过5v/cm。
(4) 电泳温度DNA在琼脂糖凝胶电泳中的电泳行为受电泳时的温度影响不明显,不同大小的DNA片段其相对迁移速率在4℃与30℃之间不发生明显改变,但浓度低于0.5%的凝胶或低熔点凝胶较为脆弱,最好在4℃条件下电泳。
(5) 嵌入染料荧光染料溴化乙锭用于检测琼脂糖凝胶中的DNA,染料嵌入到堆积的碱基对间并拉长线状和带缺口的环状DNA,使其刚性更强,还会使线状迁移率降低15%。
(6) 离子强度电泳缓冲液的组成及其离子强度影响DNA电泳迁移率。
在没有离子存在时(如误用蒸馏水配制凝胶,电导率最小,DNA几乎不移动,在高离子强度的缓冲液中(如误加10×电泳缓冲液),则电导很高并明显产热,严重时会引起凝胶熔化。
DNA的琼脂糖凝胶电泳DNA实验技术方法
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DNA的琼脂糖凝胶电泳DNA实验技术方法琼脂糖凝胶电泳(Agarose gel electrophoresis)是一种常用的分离和分析DNA分子的技术方法。
本文将对DNA的琼脂糖凝胶电泳实验技术方法进行详细介绍。
1.原理琼脂糖凝胶电泳是一种基于DNA分子大小的分离方法。
DNA分子在电场的作用下,由于带负电荷,会向阳极移动。
由于琼脂糖凝胶的孔径不同,不同大小的DNA分子会被琼脂糖凝胶所阻碍,大分子相对较慢,小分子相对较快地通过凝胶孔隙。
通过电泳,可以将不同大小的DNA分子分离开来,形成一条条带状。
2.实验步骤(1)制备琼脂糖凝胶:将适量的琼脂糖加入1×TAE缓冲液中,加热溶解,冷却至约60℃时加入适量的乙溴酸溶液,振荡均匀后倒入电泳槽中,插入梳子形成孔洞。
(2)样品制备:将待测DNA溶解在缓冲液中(常用缓冲液为1×TBE或1×TAE),加入适量的显色剂(如溴化乙锭),混合均匀。
(3)装料和电泳:将样品倒入琼脂糖凝胶的样品槽中,注意避免气泡的产生。
将电泳槽连接电源,接通电源,设定适当的电压(通常为100-150V)进行电泳。
(4)分析结果:电泳结束后,关闭电源,取出凝胶,放入紫外光透射仪中观察凝胶上的DNA带状条带,并进行照相或记录。
3.实验注意事项(1)凝胶制备:凝胶溶液要充分均匀,避免不均匀分布造成的电泳结果不准确。
(2)样品制备:样品在加入缓冲液中时要充分混匀,避免DNA在样品中的不均匀性造成的电泳结果不准确。
(3)电泳条件:电泳条件包括电压、时间、缓冲液等。
较高的电压可以加快电泳速度,但会产生较多的带展平现象。
合适的电压应根据实验需要调整。
(4)结果分析:在紫外光透射仪下观察DNA带状条带时,要小心操作,避免DNA样品受到过长时间的紫外线照射。
4.应用领域琼脂糖凝胶电泳广泛应用于分离和分析DNA分子。
常见的应用领域包括:DNA片段的分子量测定、PCR产物分析、DNA测序结果的验证、突变检测等。
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤
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一、实验目的琼脂糖凝胶电泳是常用的检测核酸的方法,学习DNA琼脂糖凝胶电泳的使用技术,掌握有关的技术和识读电泳图谱的方法.二、实验原理琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA、RNA分子混合物的方法,这种电泳方法以琼脂凝胶作为支持物,利用DNA分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的。
DNA分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动。
在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即分子本身的大小和构型是主要的影响因素。
DNA分子的迁移速度与其相对分子量成反比。
不同构型的DNA分子的迁移速度不同。
如环形DNA分子样品,其中有三种构型的分子:共价闭合环状的超螺旋分子(cccDNA)、开环分子(ocDNA)、和线形DNA分子(IDNA).这三种不同构型分子进行电泳时的迁移速度大小顺序为:cccDNA>IDNA>ocDNA核酸分子是两性解离分子,pH3。
5是碱基上的氨基解离,而三个磷酸基团中只有一个磷酸解离,所以分子带正电,在电场中向负极泳动;而pH8。
0-8。
3时,碱基几乎不解离,而磷酸基团解离,所以核酸分子带负电,在电场中向正极泳动.不同的核酸分子的电荷密度大致相同,因此对泳动速度影响不大.在中性或碱性时,单链DNA与等长的双链DNA的泳动率大致相同。
影响核酸分子泳动率的因素主要是:1、样品的物理性状即分子的大小、电荷数、颗粒形状和空间构型。
一般而言,电荷密度愈大,泳动率越大。
但是不同核酸分子的电荷密度大致相同,所以对泳动率的影响不明显。
对线形分子来说,分子量的常用对数与泳动率成反比,用此标准样品电泳并测定其泳动率,然后进行DNA分子长度(bp)的负对数——泳动距离作标准曲线图,可以用于测定未知分子的长度大小。
DNA分子的空间构型对泳动率的影响很大,比如质粒分子,泳动率的大小顺序为:cDNA>I DNA>ocDNA但是由于琼脂糖浓度、电场强度、离子强度和溴化乙锭等的影响,会出现相反的情况.2、支持物介质核酸电泳通常使用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶两种介质,琼脂糖是一种聚合链线性分子.含有不同浓度的琼脂糖的凝胶构成的分子筛的网孔大小不同,是于分离不同浓度范围的核酸分子。
琼脂糖凝胶电泳实验报告
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琼脂糖凝胶电泳实验报告一、实验目的琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术,用于分离和分析DNA、RNA 等核酸分子。
本次实验的目的是:1、掌握琼脂糖凝胶电泳的基本原理和操作方法。
2、学会制备琼脂糖凝胶,并能够正确上样和进行电泳。
3、能够通过电泳结果判断核酸样品的质量、大小和浓度。
二、实验原理琼脂糖是一种从海藻中提取的多糖,加热溶解后冷却可形成凝胶。
琼脂糖凝胶具有多孔的网状结构,能够起到分子筛的作用。
核酸分子在电场中会向正极移动,由于其分子大小、形状和电荷密度的不同,在琼脂糖凝胶中的迁移速度也不同。
小分子的核酸迁移速度快,大分子的核酸迁移速度慢,从而实现分离。
DNA 和 RNA 分子在琼脂糖凝胶中的迁移速度主要取决于以下因素:1、分子大小:分子越大,迁移速度越慢。
2、分子构象:超螺旋 DNA 比线性 DNA 迁移速度快,而线性DNA 又比开环 DNA 迁移速度快。
3、琼脂糖浓度:琼脂糖浓度越高,凝胶孔径越小,对分子的阻碍作用越大,迁移速度越慢。
4、电场强度:电场强度越大,迁移速度越快,但过高的电场强度可能导致发热和条带扭曲。
在电泳过程中,通常使用溴化乙锭(EB)或其他核酸染料对核酸分子进行染色,以便在紫外灯下观察和拍照。
三、实验材料和仪器1、材料DNA 样品:已知大小的 DNA 标准品、待测 DNA 样品。
琼脂糖:电泳级琼脂糖。
电泳缓冲液:常用的有 TAE(Tris乙酸EDTA)和 TBE(Tris硼酸EDTA)缓冲液。
核酸染料:溴化乙锭(EB)或其他安全的核酸染料。
上样缓冲液:通常含有甘油、溴酚蓝等成分,用于增加样品密度和指示电泳进程。
2、仪器电泳仪:提供稳定的电场。
水平电泳槽:用于容纳琼脂糖凝胶和进行电泳。
微波炉:用于加热溶解琼脂糖。
紫外透射仪:用于观察和拍照电泳结果。
移液器:用于准确量取和移取液体。
四、实验步骤1、制备琼脂糖凝胶称取适量的琼脂糖粉末,加入一定量的电泳缓冲液,在微波炉中加热至琼脂糖完全溶解,溶液澄清透明。
琼脂糖凝胶电泳实验报告
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琼脂糖凝胶电泳实验报告一、实验目的琼脂糖凝胶电泳是分子生物学实验中常用的技术之一,其目的主要包括以下几个方面:1、分离和鉴定 DNA 片段:通过电泳可以将不同大小的 DNA 片段在琼脂糖凝胶中按照分子量大小进行分离,从而能够直观地观察到DNA 样品的组成和纯度。
2、检测 DNA 的质量:通过观察电泳图谱中 DNA 条带的亮度、清晰度和完整性,可以评估 DNA 样品的质量,判断是否存在降解、杂质污染等情况。
3、定量分析 DNA 浓度:结合已知浓度的 DNA 标准品,通过比较样品条带与标准品条带的亮度,可以对 DNA 样品的浓度进行大致的估算。
二、实验原理琼脂糖是一种从海藻中提取的线性多糖聚合物。
当琼脂糖溶液加热到沸点后冷却凝固,会形成网状的凝胶结构。
由于琼脂糖凝胶具有分子筛效应,DNA 分子在电场中会向正极移动,其迁移速度取决于 DNA 分子的大小和构象。
较小的 DNA 分子在凝胶中受到的阻力较小,迁移速度较快;较大的 DNA 分子受到的阻力较大,迁移速度较慢。
因此,不同大小的 DNA 分子在琼脂糖凝胶中会被分离成不同的条带。
在电泳过程中,通常使用溴化乙锭(EB)等荧光染料对 DNA 进行染色。
EB 能嵌入DNA 分子的碱基对之间,在紫外线照射下发出荧光,从而使 DNA 条带得以显现。
三、实验材料与设备1、实验材料DNA 样品:本次实验使用的是经过提取和纯化的λDNA 样品。
琼脂糖:选用高纯度的琼脂糖粉末。
电泳缓冲液:5×TBE 缓冲液(Tris硼酸EDTA),使用时稀释至1×TBE 工作液。
上样缓冲液(Loading Buffer):含有甘油、溴酚蓝等成分,用于增加样品密度,便于样品沉入加样孔,并指示电泳进程。
核酸染料:溴化乙锭(EB)溶液。
2、实验设备电泳仪:提供稳定的直流电源,用于产生电场。
水平电泳槽:放置琼脂糖凝胶,容纳电泳缓冲液。
凝胶成像系统:用于观察和拍摄电泳结果。
DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理及超详细步骤
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DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理及超详细步骤物品准备水平电泳槽、电泳仪、微波炉、紫外透射仪、锥形瓶、琼脂糖、电泳缓冲液(1xTBE) 溴化乙锭(EB)溶液、上样缓冲液等实验原理DNA分子在琼脂糖中泳动时有电荷效应和分子筛效应,但主要为分子筛效应。
在pH值为8.0- 8.3时,核酸分子碱基几乎不解离,磷酸全部解离,核酸分子带负电,在电泳时向正极移动。
采用适当浓度的凝胶介质作为电泳支持物,在分子筛的作用下,使分子大小和构象不同的核酸分子泳动率出现较大的差异,从而达到分离核酸片段检测其大小的目的。
核酸分子中嵌入荧光染料(如EB )后,在紫外灯下可观察到核酸片段所在的位置。
实验步骤(1)准备制胶架,用蒸馏水将电泳槽和梳子冲洗干净,放在水平桌面上,并架好梳子(2)配制琼脂糖凝胶及倒胶,琼脂糖凝胶浓度与线形DNA的最佳分辨范围a.以1%的胶为例,三角瓶内0.6g琼脂糖+60ml(0.5xTBE)煮胶溶解冷却至60C(不烫手)b.加入溴化乙锭溶液(终浓度0.5ug/ml)或按照1ul/30mL的比例加入DNAgreen 染料,并充分混匀。
c.倒板,小胶倒入25-30ml左右琼脂糖溶液,大胶则60-70ml左右,若需切胶回收,凝胶可适当加厚。
d.室温下充分凝固,大约30分钟-1小时e.垂直向上拔出梳子f.将胶板放入电泳槽g.向电泳槽中加入0.5xTBE缓冲液至刚没过凝胶表面1-2nm.(3)加样将DNA样品(5ul)与6X上样缓冲液( 1ul)混匀后,用微量加样枪小心加入样品孔内,上样量根据样品浓度可适当调整,若DNA含量偏低,则可依上述比例增加上样量,但总体积不可超过样品槽容量(一般小孔40ul为上限,大孔200ul为上限,具体和制胶膜规格相关)。
注意加样枪的枪头不可插入过深,以免刺穿凝胶,导致样品外溢。
每加完一个样品要更换枪头,以防止EB污染。
(4)电泳接通电源,一般红色为正极,黑色为负极,切记DNA样品由负极往正极泳动(靠近加样孔的一端为负),电压为5V/cm (长度以两个电极之间的距离计算),一般控制电压保持在110v,电流在40mA以上。
dna琼脂糖凝胶电泳
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DNA琼脂糖凝胶电泳1. 简介DNA琼脂糖凝胶电泳(DNA agarose gel electrophoresis)是一种常用的分离和分析DNA片段的技术。
它利用琼脂糖凝胶作为分离介质,通过电场作用,将DNA片段按照大小进行分离。
这种技术广泛应用于基因测序、基因突变检测、DNA片段扩增等领域。
2. 原理DNA琼脂糖凝胶电泳的原理基于DNA的带负电荷特性和凝胶电泳的原理。
DNA分子是由带负电荷的核苷酸单元组成,当施加电场时,DNA会向阳极迁移。
琼脂糖凝胶是一种由聚糖组成的网状结构,可以形成孔隙,使得不同大小的DNA片段能够在凝胶中移动。
在琼脂糖凝胶中进行电泳时,首先需要制备琼脂糖凝胶。
通常使用琼脂糖粉末溶解在缓冲液中,并加热至溶解。
将溶解的琼脂糖倒入电泳槽中,并插入电泳槽两端的电极。
待琼脂糖凝固后,形成凝胶。
凝胶制备完成后,将待分析的DNA样品与DNA加载缓冲液混合,并加热至退变。
退变是为了使DNA样品中的双链DNA转变为单链DNA,便于在电泳过程中进行分离。
将退变后的DNA样品加载到琼脂糖凝胶孔上,并施加电场。
在电泳过程中,由于琼脂糖凝胶的孔隙结构不同大小,不同大小的DNA片段会以不同速率迁移。
较小的DNA片段会迁移得更快,而较大的DNA片段则迁移较慢。
通过控制电场强度和时间,可以使得不同大小的DNA片段达到预期的分离效果。
3. 实验步骤3.1 准备工作•准备琼脂糖粉末和缓冲液。
•准备电泳槽、电极和样品孔模具。
•配置DNA加载缓冲液。
3.2 制备琼脂糖凝胶•将适量的琼脂糖粉末加入缓冲液中,并加热搅拌至完全溶解。
•将溶解的琼脂糖倒入电泳槽中,插入电极,待凝固。
3.3 退变DNA样品•将待分析的DNA样品与DNA加载缓冲液混合,并加热至退变温度(通常为95°C)。
•快速冷却样品至4°C。
3.4 装载样品•在琼脂糖凝胶孔上注射适量的退变后的DNA样品。
•加载DNA分子量标记物到一侧孔隙作为参考。
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和方法步骤
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⑸100倍电泳缓冲液的配制:
4mol/LTris-HCl(pH8..0),2mol/L醋酸钠,200mmol/LEDTA
称取,无水乙酸钠,,先用400ml双蒸水加热搅拌溶解后,再用冰乙酸调pH至(大约加入冰乙酸50ml),然后定容至500ml。用时稀释100倍。
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和方法步骤
琼脂糖凝胶电泳是用于分离、鉴定和提纯DNA片段的标准方法。琼脂糖是从琼脂中提取的一种多糖,具亲水性,但不带电荷,是一种很好的电泳支持物。DNA在碱性条件下(pH8 0的缓冲液)带负电荷,在电场中通过凝胶介质向正极移动,不同DNA分子片段由于分子和构型不同,在电场中的泳动速率液不同。溴化乙锭(EB)可嵌入DNA分子碱基对间形成荧光络合物,经紫外线照射后,可分出不同的区带,达到分离、鉴定分子量,筛选重组子的目的。…
4、待琼脂糖胶凝固后,在电泳槽内加入电泳缓冲液,然后拔出梳子。
5、加样
将DNA样品与加样缓冲液(loading buffer)按4:1混匀后,用微量移液器将混合液加到样品槽中,每槽加10-20μl,记录样品的点样次序和加样量。
6、电泳
安装好电极导线,点样孔一端接负极,另一端接正极,打开电源,调电压至3-5V/cm,电泳1-3hr,当溴酚蓝移到距凝胶前沿1-2cm时,停止电泳。
2、琼脂糖凝胶的制备
称取琼脂糖溶解在电泳缓冲液中,(按的琼脂糖含量,1-25kb大小的DNA用1%的凝胶,20-100kb的DNA用%的凝胶,200-2000bp的DNA用%的凝胶)置微波炉或沸水浴中加热至完全溶化(不要加热至沸腾),取出摇匀。
3、灌胶
DNA的琼脂糖凝胶电泳分析
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❖ 3、琼脂糖
❖ 4、溴化乙锭(EB)10mg/ml:取EB0.10g完全溶 解100ml水中,避光室温保存。
❖ 5、DNA分子量标准品
实验操作
❖ 1、制备琼脂糖凝胶:称取1g琼脂糖粉,放入 锥形瓶中,加入100ml×TAE电泳缓冲液,置 微波炉或水浴内加热熔化,取出摇匀即为1% 琼脂糖凝胶液。待凝胶液冷却至60℃后加入 溴化乙锭5ul,使其终浓度为0.5ul/ml。
性DNA大小 60~5 20~1 0.8 0.7 0.4 0.2 0.1 范围(kb)
❖ 3、DNA分子在琼脂糖中泳动时有电荷效应 和分子筛效应,但主要是分子筛效应。在 pH8.0~8.3时,核酸分子剪辑几乎不解离, 磷酸解离,核酸分子带负电,在电泳时向正 极移动。采用适当浓度的凝胶介质作为电泳 支持物,在分子筛的作用下,使分子大小和 构象不同的核酸分子泳动率出现较大差异, 从而达到分离核酸片段检测其大小的目的。 核酸分子中嵌入荧光染料(如EB)后,在 紫外灯下可观察到核酸片段所在的位置。
❖ 一般情况下,梳子越薄而长,条带越好看 ;
❖ 上样量不宜过多,会造成条带的相互挤压;
❖ 如果点样孔多余,将样点到中间,尽量避免边缘 效应 ,中间电场比较均匀 ;
❖ 做胶的缓冲液和跑胶的缓冲液浓度应该一致;
❖ 加样时不要太快,让其自然沉底,均匀分布在电 泳孔内 ;
❖ 电泳开始时可以采用低电压使其跑出孔后,再调 高电压。
其中的溴酚蓝在不同浓度琼脂糖凝胶和不同电泳缓冲液中的迁移率不同其迁移位置可作为dna条带电泳位置的参照11加样缓冲液可以增大样品密度以确保dna均匀进入样品孔内还可以使样品呈现颜色从而使加样操作更为便利
DNA的琼脂糖凝胶电泳分析
制作小组:杜金红王成强 汪强
琼脂糖凝胶电泳dna的原理
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琼脂糖凝胶电泳DNA的原理介绍琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离和分析DNA的方法。
它基于DNA分子在电场中的迁移速度与其分子大小的关系,通过凝胶电泳技术将DNA分子按照大小分离,从而实现对DNA分子的分析和研究。
凝胶电泳的基本原理凝胶电泳是一种利用电场作用将DNA分子分离的方法。
其基本原理是利用琼脂糖凝胶作为分离介质,通过电场使DNA分子在凝胶中迁移,根据DNA分子的大小将其分离开来。
凝胶电泳实验通常包括以下步骤: 1. 制备琼脂糖凝胶:将琼脂糖加入缓冲液中,加热溶解后冷却成凝胶。
2. 加载DNA样品:将待分析的DNA样品与荧光染料混合后加载到琼脂糖凝胶槽中。
3. 施加电场:将琼脂糖凝胶槽两端连接电源,施加电场使DNA分子在凝胶中迁移。
4. 可视化分析:通过荧光染料或其他染色方法可视化DNA分子的迁移情况。
凝胶电泳的凝胶介质凝胶电泳中常用的凝胶介质有琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶。
琼脂糖凝胶是最常用的凝胶介质之一,它是由琼脂糖和缓冲液混合制备而成的。
琼脂糖凝胶的优点是制备简单、成本低廉,适用于大多数常规实验。
聚丙烯酰胺凝胶则具有更高的分辨率和分离能力,适用于对DNA分子大小差异较小的分析。
凝胶电泳的电场条件凝胶电泳中的电场条件对分离效果有重要影响。
电场的强度和方向决定了DNA分子的迁移速度和方向。
通常情况下,较强的电场可以加快DNA分子的迁移速度,但也会导致分离效果较差。
因此,在实际操作中需要根据样品的要求和实验目的选择合适的电场条件。
凝胶电泳的分析结果解读凝胶电泳的分析结果通常通过可视化观察凝胶上DNA分子的迁移情况来解读。
根据DNA分子在凝胶中的迁移距离和参照物(如DNA长度标记物)的位置,可以确定DNA分子的大小范围和相对浓度。
通过与已知大小的DNA分子进行比较,可以进一步确定未知DNA分子的大小。
凝胶电泳的应用领域凝胶电泳广泛应用于分子生物学、遗传学、生物医学等领域。
它可以用于DNA片段的分离和纯化、基因重组技术中的DNA构建和鉴定、PCR产物的分析等。
dna琼脂糖凝胶电泳原理
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dna琼脂糖凝胶电泳原理DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术,广泛应用于DNA分离、鉴定和纯化方面。
它是利用DNA分子在电场中的迁移差异,将DNA按照大小进行分离的方法。
本文将介绍DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、操作步骤和应用。
DNA琼脂糖凝胶电泳的原理主要由三部分组成:琼脂糖凝胶、电场和DNA分子。
首先,琼脂糖凝胶是一种高分子聚合物,具有三维网孔结构,能够限制DNA在电场中的迁移。
其次,电场是通过两端施加相反电荷,形成电荷差从而产生的带电迁移力。
最后,DNA分子由于其带负电荷特性,会在电场中受到迁移力的作用,从而在琼脂糖凝胶上呈现出不同大小的迁移距离。
整个琼脂糖凝胶电泳操作过程分为几个关键步骤。
首先是制备琼脂糖凝胶,将琼脂糖溶解在缓冲液中并加热,使其溶解均匀。
然后,在电泳槽中注入制备好的稳定琼脂糖溶液,并在其上部留出一个小孔,用于样品孔的填充。
接下来,将待测的DNA样品与DNA标记物混合,分别加入到琼脂糖凝胶孔内。
在加样过程中,需要注意不要在琼脂糖上方产生气泡。
当电源开启后,断续供电,电泳开始进行。
此时,DNA分子会在电场作用下从孔口逐渐迁移进入琼脂糖凝胶内部。
较小的DNA片段迁移速度较快,迁移距离较长,而较大的DNA片段迁移速度较慢,迁移距离较短。
经过适当时间后,关闭电源,取出琼脂糖凝胶进行染色观察。
DNA琼脂糖凝胶电泳在分子生物学研究中有着广泛的应用。
首先,它可以用于DNA分离和纯化。
通过电泳分离DNA片段,可以将特定大小的DNA纯化出来,为后续的实验提供基础。
其次,琼脂糖凝胶电泳可以用于分析DNA复制结果。
通过观察DNA片段的迁移情况,可以了解DNA复制的准确性和效率。
此外,琼脂糖凝胶电泳还可以用于遗传疾病的诊断和基因工程的相关研究。
综上所述,DNA琼脂糖凝胶电泳是一种重要的分子生物学技术,可以用于DNA分离、纯化和分析。
通过掌握其原理和操作步骤,我们能够更好地应用该技术,推动科学研究的进展。
实验琼脂糖凝胶电泳的原理和方法
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目前国内外有多种核酸、蛋白质印迹转移的电泳装置出售,使印迹 转移速度快、效率高、重复性好,应用更加广泛,仪器的使用方法可参 照厂家说明书。聚丙烯酰胺凝胶也可用于印迹转移电泳,但转移蛋白质 时,凝胶中不可含有SDS、尿素等变性剂。用于转移电泳的支持膜亦有 多种选择,近些年用尼龙膜较多,因为尼龙膜机械性能好,烘烤不变脆
CM
β
前β α
正常
Ⅰ型
Ⅱa型
Ⅱb型
Ⅲ型
Ⅳ型
Ⅴ型
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琼脂糖凝胶电泳的缺点: (1) 机械强度差,易破碎,浓度不能太低。
(2) 易被细菌污染,不易保存,临用前配制。
(3) 琼脂糖支持层上的区带易于扩散,电泳后必须 立即固定染色。
(4) 与PAGE相比,分子筛作用小,区带少。
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目前,琼脂糖凝胶电泳常用于分离、鉴定核酸,如DN A鉴定,DNA限制性内切酶图谱制作等。由于这种方 法操作方便,设备简单,需样品量少,分辨能力高,已 成为基因工程研究中常用实验方法之一。
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在凝胶中,DNA片段迁移距离(迁移率)与碱基对 的对数成反比,因此通过已知大小的标准物移动的 距离与未知片段的移动距离进行比较,便可测出未 知片段的大小。 但是当DNA分子大小超过20kb时,普通琼脂糖 凝胶就很难将它们分开。此时电泳的迁移率不再 依赖于分子大小,因此,应用琼脂糖凝胶电泳分 离DNA时,分子大小不宜超过此值。
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26、要使整个人生都过得舒适、愉快,这是不可能的,因为人类必须具备一种能应付逆上进的力量,才是成功的保证。——罗曼·罗兰
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28、知之者不如好之者,好之者不如乐之者。——孔子
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29、勇猛、大胆和坚定的决心能够抵得上武器的精良。——达·芬奇
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30、意志是一个强壮的盲人,倚靠在明眼的跛子肩上。——叔本华
谢谢!
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生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电 泳的原理、步骤、试剂配制、结果分
析
51、山气日夕佳,飞鸟相与还。 52、木欣欣以向荣,泉涓涓而始流。
53、富贵非吾愿,帝乡不可期。 54、雄发指危冠,猛气冲长缨。 55、土地平旷,屋舍俨然,有良田美 池桑竹 之属, 阡陌交 通,鸡 犬相闻 。
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