PCR反应及琼脂糖电泳实验报告

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10x Buffer
50 μ L
MgCl2 dNTP mixture 上游引物 ( 引物 I) 下游引物 ( 引物 II) 模板 DNA ddH2O
50 μ L 20μ L 25μ L 25 μ L 25 μ L 290μ L
原有的 Taq DNA 聚合酶有 15ul ,此时混合液体系共计 500ul, 此步骤由第一、 二组同学 合作完成。(在实验老师的监督指导下操作,确保此后其他同学的实验顺利进行)
温度控制
引物
一小段单链 DNA或
为 DNA聚合酶提供 引物 I 引物 II
RNA
合成的 3’端起点
此外,试验中用到的还有 Mgcl2, Mg2+能激活酶的活性; 10* Buffer 酶提供合适的 PH条件。
缓冲液,为 Taq
2、 PCR反应条件
PCR利用了 DNA的热变性原理, 通过控制温度来控制双链的解聚与结合, 仪实质上也是一台能够自动调控温度的仪器。
(3)待胶凝固后,去掉胶带纸,小心移去梳子,注意不要破坏加样孔。将倒胶槽至于
水平电泳槽内,梳井(点样孔)一端朝负极方向。向电泳槽中缓缓倒入
1x 电泳缓冲液,以
没过胶面 2 mm为宜。
(5)将 80ul 的 6xLoading Buffer 加入到 80ul 的核酸荧光染料中,按 1:1 比例混合。
(6)移液器枪头插入到扩增出的样品离心管的底部,吸取
(3) 共分 25 组,第一、二组的同学并入其他小组进行实验。每组取
20ul 的上述混合液
于的离心管中,加入 15ul 的液体石蜡封闭体系,以防止在加热过程中蒸发。
(4) 对自己组的离心管上进行标记之后,放到
PCR仪上进行 DNA扩增。
2、琼脂糖凝胶电泳检测 DNA
(1)用蒸馏水将电泳槽和梳子冲洗干净,放在水平桌面上,并架好梳子。
(8)取出凝胶块,在 DNA图谱观察仪中观察电泳带及其位置,判断扩增产物的情况。 3、紫外分光光度计检测 DNA含量 (1)最后 1 组取 2ulPCR 反应液,加入 98ul 蒸馏水,将样品稀释 50 倍。 (2)以蒸馏水作为空白对照,在波长 260nm处,将紫外分光光度计的读数调节至零。 (3)加入 DNA稀释液 100ul 至比色杯中,测定 260nm处的光吸收值。 (4)根据下面的公式计算 DNA含量:
(2)配制浓度为 1%( 1 g/100 mL )的琼脂糖凝胶 2 块。在锥形瓶中,称取 1g 的琼脂 糖粉,加入 100ml 1x 电泳缓冲液,用封口膜封住瓶口后在微波炉内加热,使琼脂糖粉熔化, 然后冷却至 60 ℃,倒入电泳槽中(每块胶 50ml),插好梳子,待其凝固。(电泳槽首先用 透明胶带将两端封住再进行倒胶)
现在使用的 PCR
PCR一般经历三十多次循环,每次循环可以分为三个基本步骤──变性、复性和延伸。
(!) 变性(模板 DNA解旋)
模板 DNA经加热至 90℃以上。一定时间后,使模板 于它与引物结合,为下轮反应作准备。
DNA双链解离,使成为单链,以便
(2) 复性(退火)
模板 DNA经加热变性成单链后,温度降到 配对结合。
相关,与电压强度成正比,因此可以分离不同长度的
DNA。在有 DNAmarker (不同已知碱基
对大小的 DNA片段的混合物) 的条件下, 由于不同碱基大小的 DNA片段在琼脂糖凝胶上涌动
的速度不同, 因此电泳完毕后会出现在胶块的不同位置。 通过将扩增出的 DNA片段与已知的
条带做比较, 可以大概推测出该片段的碱基对的大小。 如果要进一步检测其大小, 可以换另
50℃左右,引物与模板 DNA单链的互补序列
(3) 延伸
DNA模板-引物结合物在 TaqDNA聚合酶的作用下以脱氧核苷酸为原料,
按碱基互补配对的原则与半保留复制的原理,合成一条新的
DNA链。
以母链为模板,Leabharlann Baidu
循环数
变性
复性
延伸
第一次(预变
94° C,


性)
30s
30 次
94 ℃, 20s
52℃, 20s
DNA的解旋和聚
1、 PCR反应组分
条件
细胞内 DNA复制条件分析:
参与的组分
在 DNA复制中
实验条件 / 材
的作用

模板
DNA的两条单链
提供复制的模 板
模板 DNA
原料
四种脱氧核苷酸
合成 DNA子链 的原料
dNTP mixture
催化合成 DNA
Taq DNA 聚合

DNA聚合酶
子链


解旋酶
打开 DNA双链
80V,大大
DNA含量( ul/ml ) =50* ( 260nm的读数) x 稀释倍数
五、注意事项
1 离心机上盖没有锁,在离心机运转时,转速最高可达
16000r/min ,如果这时打
开离心机上盖,里面的离心管就会甩出,对人身造成危险,切忌等全部停下来之后再
打开上盖取出离心管。另外,离心管一定要对称放置。
2 水平电泳槽在电泳时一定要盖上上盖,此时的缓冲液电压可以达到 超过了人体的安全电压,切忌不能用手触碰缓冲液或者是电源两端接头。
外规格的 DNA marker 继续电泳。核酸荧光染料可以与 DNA嵌合,一起电泳, DNA图谱观察
仪可以激发特定的蓝色光源, 荧光染料在该光照射下可见到荧光, 荧光的亮度与 DNA大小成
正比。
三、实验仪器及试剂
7 种 PCR组分 微量可调移液器 离心管 PCR仪 水平电泳槽 电泳仪电源 紫外分光光度 计 250ml 锥形瓶 ( 封口膜 ) 记号笔 卫生纸
72℃,20s
最后一次(保 温)
72℃,30s
3、 PCR产物的检测
(1) 紫外分光光度计
DNA在 260nm的紫外波段有一强烈的吸收峰, 可以通过与蒸馏水的对比进而计算扩增出 DNA的含量。
(2) 琼脂糖凝胶电泳
DNA在电厂作用下, 可以由电源的负极向正极泳动, 泳动的速度与 DNA片段的长度成负
多聚酶链式反应( PCR)扩增 DNA片段及 琼脂糖凝胶电泳产物检测
一、实验目的:
1、了解 PCR技术的基本操作 2、理解 PCR的原理 3、讨论 PCR的应用
二、实验原理:
PCR是一种在体外模拟细胞内环境进行迅速扩增
DNA片段的技术,这一技术需要模板、
四种脱氧核苷酸等组分条件外,还需要不同温度环境以进行
四、实验步骤
1、 DNA体外扩增
(1) 将所有试剂管瞬时离心一次( 4000r/min,1min ),使管壁没有残留药品,在引物 I 和引物 II 的离心管内用移液器各加入 40ul 双蒸水( ddH2O),混匀后瞬时离心一次。所 有的离心管都摆到双面板上。
(2) 向装有 Taq DNA 聚合酶的离心管按下表加入以下成分:
20ul 样品于另一的离心管
中,注意不要吸到液体石蜡,再加 1ul 的染料混合液,充分振荡混匀。用移液器吸取
10ul
缓慢加入梳井内,枪头抵到梳井口, 以防止样液被缓冲液冲散,此外, 为防止手抖将凝胶破
坏,可以用左手扶住右手的手腕。
(6)盖上电泳槽盖,接通电源,电压为 80 V ,电流最大。
(7)当指示剂移动到凝胶中间时,断开电源,终止电泳。
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