琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤DNA的琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术,用于分析DNA 的大小和纯度,以及进行DNA分子的分离和纯化。
凝胶电泳实验可以帮助我们确定DNA样本的大小和获得纯化的DNA片段供进一步研究使用。
下面是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的原理和操作步骤。
【原理】DNA琼脂糖凝胶电泳是根据DNA分子在电场中的不同迁移速率来分离大小不同的DNA片段。
琼脂糖凝胶是一种凝胶状物质,其孔隙大小能够将DNA分子限制在一定范围内,较大的DNA分子迁移速率较慢,而较小的DNA分子迁移速率较快。
琼脂糖凝胶通常是在平均浓度为1%至2%之间的范围内制备,以便在不同大小的DNA分子之间提供适当的分辨率。
实验中,DNA样品通过切割酶或PCR等方法获得,样品经过核酸电泳缓冲液稀释,并在琼脂糖凝胶板上进行电泳。
凝胶板两侧连接电源,DNA 的带电粒子将在电场的作用下从负极迁移到正极,迁移过程中形成DNA的“条带”,条带的位置和长度反映了DNA的大小。
通常,DNA条带由荧光染料或核酸染料标记,以便在电泳结束后进行可视化。
【操作步骤】以下是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的一般操作步骤:1.制备琼脂糖凝胶板:a.准备琼脂糖粉末和核酸电泳缓冲液(通常为TAE或TBE缓冲液)。
b.按照说明书将琼脂糖粉末溶解于核酸电泳缓冲液中。
c.将溶液加热至沸腾并搅拌,使琼脂糖完全溶解。
d.将溶液倒入预先准备好的电泳仓中,插入梳子或制备好的孔板,使其凝固。
2.样品制备:a.提取DNA样品并测定其浓度。
b. 将DNA样品稀释到适当浓度,通常为10-50 ng/μL。
c. 添加适当的加载缓冲液,通常是一些染料和甘胺酸(glycine)或其他添加剂。
3.DNA加载和电泳:a.打开琼脂糖凝胶仓盖,将DNA样品负载于凝胶孔内。
b.将DNA负载区域和样品标注在电泳仓中,以便在电泳结束后可以准确识别DNA带。
c.关闭盖子,将电泳仓放入电泳设备中。
琼脂糖凝胶电泳-完整整理
基因组分析
分子诊断
用于分离和鉴定基因组DNA片段,如限制 性片段长度多态性分析、基因突变检测等 。
用于检测和鉴定基因突变、病原微生物DNA 等,如聚合酶链式反应(PCR)产物电泳、 单链构象多态性分析等。
基因克隆
测序
用于分离和纯化目的基模板,如末端测 序、全基因组测序等。
达差异。
04 琼脂糖凝胶电泳实验问题 与解决
常见问题
条带弥散
由于点样量过多或电压过高,导致条带弥散。
条带过宽
由于凝胶浓度不合适或样品浓度过高,导致 条带过宽。
条带拖尾
样品中蛋白质降解或核酸酶污染,导致条带 拖尾。
条带不亮
由于染料浓度过低或曝光时间过短,导致条 带不亮。
问题分析
条带弥散
可能是由于点样量过多或电压过高, 导致DNA在凝胶中扩散。
琼脂糖凝胶电泳-完 整整理
目录
CONTENTS
• 琼脂糖凝胶电泳介绍 • 琼脂糖凝胶电泳实验操作 • 琼脂糖凝胶电泳结果分析 • 琼脂糖凝胶电泳实验问题与解决 •凝胶电泳的定义
01
琼脂糖凝胶电泳是指在琼脂糖凝 胶中进行的电泳技术,主要用于 分离、鉴定和纯化DNA片段。
浓度比较
通过条带亮度,比较不同 样品中目标DNA片段的浓 度。
纯度评估
根据条带的亮度与背景噪 音的比例,评估DNA片段 的纯度。
结果应用
基因克隆
01
通过琼脂糖凝胶电泳检测目的基因是否被正确克隆到载体中。
突变分析
02
利用电泳结果判断是否存在基因突变或点突变。
基因表达分析
03
通过比较不同组织或细胞系中目的基因的表达水平,分析其表
01
条带分析
生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、步骤、试剂配制、结果分析分析
凝胶冷却至50°C,加EB至终浓度0.5μg/ml
铺
胶
凝胶凝固后取出梳子
加电泳缓冲液
准备样品
点
样
电
泳
注意观察溴酚蓝染液的迁移
紫外灯下观察电泳结果
照
相
DNA琼脂糖凝胶电泳
实验原理
琼脂糖为链状多糖 →绳状琼脂糖束→大网孔型凝
胶 ——分离、鉴定、纯化DNA
在 pH 值为 8.0~8.3 时,核酸分子碱基几乎不解
离,磷酸全部解离,核酸分子带负电,在电泳时 向正极移动。
采用适当浓度的凝胶介质作为电泳支持物,在分
子筛的作用下,使分子大小和构象不同的核酸分
子泳动率出现较大的差异,从而达到分离核酸片 段检测其大小的目的。
实验原理
当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙啶(Ethidium
bromide, EB)染色, 在紫外光下至少可以检出110ng的DNA条带, 从而可以确定DNA片段在凝胶 中的位置。
此外, 还可以从电泳后的凝胶中回收特定的DNA
条带, 用于以后的克隆操作。
状DNA>开环DNA
DNA片段越长,泳动速度越慢
在低电压时,泳动速度与电场强度成正比
不同浓度琼脂糖分离DNA分子的范围
琼脂糖浓度(W/V,%) 分离范围(kb)
0.3
0.6 0.7 0.9 1.2
5-60
1-20 0.8-10 0.5-7 0.4-6
1.5
2.0
0.2-4
0.1-3
DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。
胶浓(%) 0.6 溴酚蓝 b 0.15kb
2kb
1.6kb
操作步骤
琼脂糖凝胶的制备:溶化,冷却,EB 凝胶板的制备:加梳子,倒胶 样品的制备:样品+1/5体积溴酚蓝
琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法
琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法[实验原理]电泳是现在用于分离和纯化DNA片段的最常用技术。
包含电解质的多孔支持介质----“胶”并把它置于静电场中。
则DNA分子将向阳极移动,这是因为DNA分子沿其双螺旋骨架两侧带有含负电荷的磷酸根残基。
当DNA长度增加时,来自电场的驱动力和来自凝胶的阻力之间的比率就会降低,不同长度的DNA片段就会表现出不同的迁移率。
因而就可依据DNA分子的大小来使其分离。
该过程通过把示踪染料(Purple Loading Dye)或分子量标准参照物(Ladder)和样品(DNA&RNA)一起进行电泳而得到检测。
分子量标准参照物也可以提供一个用于确定DNA片段大小的标准。
琼脂糖凝胶适用于分离大小在0.2-50Kb范围内的DNA片段。
[实验用品]1.琼脂糖 1.0%1.0g琼脂糖+100ml电泳缓冲液(TAE),微波炉中火30秒至沸腾,熔化的琼脂物冷却至60℃时可加入10mg/ml溴化乙锭10μl,充分混匀,将温热的凝胶倒入已置好梳子(鉴定胶用细密点的梳子;回收胶用粗稀的梳子)的胶膜中在室温下放置30-45min后现进行电泳。
1.5%:琼脂糖1.5g。
2.电泳缓冲液50×TAE Tris 乙酸 Tris 242g 终2 mol/L乙酸57.1ml 终1mol/L0.5M EDTA200ml pH8.0 终100mmol/LdH2O 补足至1000ml使用时稀释1×TAE。
5×TBE Tris 硼酸 Tris 54g 终445mmol/L硼酸27.5g 终445mmol/L0.5M EDTA20ml pH8.0 终10mmol/LdH2O 补足至1000ml使用时稀释10倍成0.5倍如50ml贮存液+450ml水→500ml工作液。
[实验内容与方法]1.移取适量的琼脂糖(如制备1%的琼脂糖胶液就移1g的琼脂糖溶于100ml TAE缓冲液中)微波炉加热使其溶于TAE缓冲液中。
血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳原理和操作
血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳原理和操作血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生化分离和分析技术,主要用于血清中脂蛋白的分析。
其原理是利用琼脂糖凝胶电泳的分离特性,将血清中的脂蛋白按照分子大小进行分离,从而获得脂蛋白的电泳图谱。
琼脂糖凝胶是由琼脂糖溶液制备而成的凝胶。
琼脂糖分子之间通过氢键结合,在溶液中形成网状结构,能够阻碍大分子的迁移,使分子在凝胶中按照分子大小逐渐分离。
根据琼脂糖凝胶的浓度和凝胶体积,可以调整分离脂蛋白的范围和分辨率。
血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳的操作步骤如下:1. 样品制备:将要分析的血清样品进行离心,将清除过量脂蛋白颗粒。
取适量样品于离心管中,加入适量凝胶缓冲液,混匀。
2. 制备凝胶:根据所需的凝胶浓度,称取相应质量的琼脂糖溶解于电泳缓冲液中,并加热至溶解。
待溶液温度降至室温后,加入凝胶稳定剂并混匀。
3. 填充凝胶孔:将凝胶溶液倒入电泳池,待凝胶凝固后,用专用的样品载体或者微量移液器将样品填充到凝胶孔中。
注意不要将样品液面超过凝胶表面。
4. 电泳分离:将电泳池连接电源,设定合适的电泳条件,如电压和电流。
在电泳过程中,离子在电场作用下沿着琼脂糖凝胶的移动方向迁移,分离出不同迁移速度的脂蛋白组分。
5. 染色和观察:电泳结束后,取出凝胶,进行染色和观察。
目前常用的染色方法有银染、共伴染色和乳化状胶体金染色等。
在染色后,可以使用分子影像仪或者专用的凝胶分析系统进行图像捕捉和分析。
血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳可以用于分析血清中各种脂蛋白的分布和比例,如低密度脂蛋白(LDL)、高密度脂蛋白(HDL)、极低密度脂蛋白(VLDL)等。
通过分析脂蛋白的电泳图谱,可以得到脂蛋白的相对含量和分子大小的分布情况,进一步了解脂质代谢的状态以及与某些疾病的关联。
总之,血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生化分离和分析技术,主要用于血清脂蛋白的分离和分析。
通过其原理和操作步骤的了解,我们可以更好地利用该技术进行实验和数据解读,为脂质相关疾病的研究提供有力的支持。
实验琼脂糖凝胶电泳的原理和方法
实验琼脂糖凝胶电泳的原理和方法实验琼脂糖凝胶电泳(Agarose gel electrophoresis)是一种常用的分离DNA和RNA分子的技术。
它基于琼脂糖凝胶电泳原理,利用琼脂糖凝胶的孔隙大小和电泳电场的力对DNA和RNA分子进行分离。
琼脂糖是一种高分子多糖,当加热溶解后冷却凝固时,形成一个多孔的凝胶网络。
这个凝胶网络中的孔隙大小是可以调控的,通过改变琼脂糖的浓度可以得到不同孔隙大小的凝胶。
1.制备琼脂糖凝胶:按照实验需要,称取适量琼脂糖加入缓冲液中,搅拌使其溶解,然后加热至溶解。
等溶液冷却至约50℃时,在一个电泳板间夹两块玻璃片或塑料片,将琼脂糖凝胶溶液倒入电泳板中,并将梳子插入凝胶中,让凝胶固化。
2.样品制备:将要检测的DNA或RNA分子提取和纯化,并用缓冲液稀释合适浓度。
添加适量的DNA荧光染料或核酸染色剂,使其在紫外光下可见。
3.样品加载:将样品加入琼脂糖凝胶的凝胶孔口中,注意不要将样品推到凝胶中。
4.电泳分离:将凝胶板放入电泳槽中,加入适量缓冲液,注意保证电泳液中缓冲液位置高于凝胶。
然后将负极电极和正极电极分别连接到电泳槽的两端,开启电源,施加适当电压使DNA或RNA分子在电场力的作用下进行电泳分离。
5.染色和可视化:电泳结束后,取出凝胶板,并用染色剂对DNA或RNA分子进行染色。
染色剂与DNA或RNA结合后,用紫外光照射凝胶,通过相应设备观察凝胶上的条带形成。
实验琼脂糖凝胶电泳的原理是基于DNA和RNA分子在电场下按照大小进行分离的特性。
在电场作用下,DNA或RNA分子荷负性被引向正极(阴极)方向移动。
琼脂糖凝胶的孔隙大小可以根据需要调控,大分子难以通过,小分子易于通过。
因此,DNA或RNA分子根据其大小不同,通过孔隙大小的限制,从而形成条带,完成了对DNA或RNA的分离。
实验13琼脂糖凝胶电泳的原理和方法
1983年,Schwartz等人根据DNA分子弹性弛豫 时间(外推为零的滞留时间)与DNA分子大小有关的 特性,设计了脉冲电场梯度凝胶,交替采用两个垂 直方向的不均匀电场,使DNA分子在凝胶中不断改 变方向,从而使DNA按分子大小分开。后来,Carle 等改进了电泳技术,并发现周期性的反转换电场 (periodic inversion of the electric field)亦能使大 分子DNA通过电泳分开。电泳系统是由一个水平式 电泳槽和两组独立,彼此垂直的电极组成,一组电 极负极为N,正极为S;另一组负极为W,正极为E 。
不同构型DNA的移动速度次序为:共价闭环 DNA(covalently closed circular,简称cccDNA)>直线 DNA>开环的双链环状DNA。当琼脂糖浓度太高时,环状 DNA(一般为球形)不能进入胶中,相对迁移率为0(Rm=O), 而同等大小的直线双链DNA(刚性棒状)则可以 长轴方向 前进(Rm>O),由此可见,这3种构型的相对迁移率主要 取决于凝胶浓度,但同时,也受到电流强度、缓冲液离 子强度等的影响。
琼脂糖凝胶电泳的 原理和方法
一、电泳方法的分类
按支持物的物理性状不同,区带电泳可为: 滤纸及其他纤维(如醋酸纤维、玻璃纤维、 聚氯乙烯纤维)薄膜电位; 粉末电泳,如纤维素粉、淀粉、玻璃粉电 泳; 凝胶电泳,如琼脂、琼脂糖、硅胶、淀粉 胶、聚丙烯酰胺凝胶等; 丝线电泳,如尼龙丝、人造丝电泳。
DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应 和分子筛效应。DNA分子在高于等电点的pH溶液 中带负电荷,在电场中向正极移动。在一定的 电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛 效应,即DNA分子本身的大小和构型。
12
13
在凝胶中,DNA片段迁移距离(迁移率)与碱 基对的对数成反比,因此通过已知大小的标准 物移动的距离与未知片段的移动距离进行比较, 便可测出未知片段的大小。
RNA琼脂糖凝胶电泳实验原理、试剂配制方法及操作流程
本实验的主要目的是掌握RNA琼脂糖凝胶电泳的操作技术,总结了RNARNA琼脂糖凝胶电泳的原理、实验材料、试剂及器具、操作步骤及注意事项。
一、实验目的学习RNA琼脂糖凝胶电泳的使用技术。
二、实验原理RNA可以使用非变性或变性凝胶电泳进行检测。
在非变性电泳中,可以分离混合物中不同分子量的RNA分子,凡是无法确定分子量。
只有在变性情况下,RNA分子完全伸展,其泳动率才与分子量成正比。
判断RNA提取物的完整性是进行电泳的主要目的之一。
完整的未降解的RNA制品的电泳图谱应可清晰看到18s rRNA、28s rRNA、5s rRNA的三条带,且28s rRNA的亮度应为18s rRNA的两倍。
三、材料、试剂及器具1、材料总RNA提取物。
2、试剂(1)0.1%DEPC水:200ml双蒸去离子水加0.2mlDEPC焦炭酸、二乙酯混匀,室温放置过夜,高压灭菌。
(2)10x电泳缓冲液。
吗啉代丙烷磺酸(MOPS) 0.4mol/L(pH 7.0)NaAc 0.1mol/L乙二胺四乙酸(EDTA) 10mmol/L(3)50mL变性琼脂糖凝胶(1%)(4)10x电泳缓冲液5 mL琼脂糖0.5 g0.1%DEPC水36.5 mL加热溶解,稍冷却,加入8.5 mL 37%甲醛。
(5)上样缓冲液:50%甘油,1mmmol/LEDTA,0.4% 溴酚兰,0.4%二甲苯蓝。
(6)甲酰胺(去离子)。
3、器具(1)电泳系统(2)紫外透视仪四、操作步骤1、将制胶用具用70%乙醇冲洗一遍,晾干备用。
2、制胶:称取0.5g琼脂糖粉末,加入放有36.5mL的DEPC水的锥形瓶中,加热使琼脂糖完全溶解。
稍冷却后加入5mL的10x电泳缓冲液、8.5mL的甲醛。
然后在胶槽中灌制凝胶,插好梳子,水平放置待凝固后使用。
3、加样:在一个洁净的小离心管中混合以下试剂:电泳缓冲液(10x)2μl、甲醛3.5mL、甲酰胺10mL、RNA 样品3.5μl。
混匀,置60℃保温10min,冰上速冷。
琼脂糖凝胶电泳技术的原理和方法
(3)溴化乙锭为扁平状分子,在紫外光照射下发射荧光。EB可与DNA分子形成 EB-DNA复合物,其荧光强度与DNA的含量成正比。据此可判断DNA分子量大小
和粗略估计样品DNA浓度。
三 仪器、材料与试剂
1.质粒样品、酶切样品和PCR样品。 2.凝胶电泳系统和电泳图像分析系统(凝胶成像系统)等。 3.琼脂糖、 1XTAE电泳缓冲液、Goldview、 6X载样缓冲
2.凝胶成像分析系统
3.Marker
一个已知分子质量的 DNA 样品做最对照,用来确定待 测样品的相对分子质量。
4.常用电泳缓冲液
缓冲液
TAE
TBE TPE
缓冲容量 最低 很高
Байду номын сангаас迁移速度 最快
(高10%)
较慢
分辨率
用途
高度复杂DNA混 高分子量高 合物;超螺旋
DNA
低分子量高
价格昂贵,不常 用
5.上样缓冲液
配制多大浓度的琼脂糖凝胶,要根据被检的DNA分子大小来确定。琼 脂糖是一种线性多糖聚合物。浓度越高,孔隙越小,其分辨能力就越强。
表1 琼脂糖凝胶的浓度与DNA分子大小的关系
琼脂糖浓度(%) 0.3 0.6 0.7 0.9 1.2 1.5 12.0
线型DNA分子的分离范围(Kb) 5~60 1~20 0.8~10 0.5~7 0.9~6 0.2~3 0.1~2
液 ( 6X loading buffer)和DNA分子量标准(Marker ) 等。
1.凝胶电泳系统
美国Bio-rad伯乐 小型水平电泳槽Mini-Sub Cell GT Cell
DYY-6C型 双稳定时电泳仪电源(北 京六一) 输出范围(显示分辨率): 6-600V(1V) 4-400mA (1mA) 240W
实验二 琼脂糖凝胶电泳实验
实验二琼脂糖凝胶电泳实验【实验目的】(1)学习琼脂糖凝胶电泳的基本原理;(2)掌握使用水平式电泳仪的方法;(3)学习在含有甲醛的凝胶上进行RNA电泳的方法。
【实验原理】琼脂糖凝胶电泳是基因工程实验室中分离鉴定核酸的常规方法。
核酸是两性电解质,其等电点为pH2-2.5,在常规的电泳缓冲液中(pH约8.5),核酸分子带负电荷,在电场中向正极移动。
核酸分子在琼脂糖凝胶中泳动时,具有电荷效应和分子筛效应,但主要为分子筛效应。
因此,核酸分子的迁移率由下列几种因素决定:(1)DNA的分子大小。
线状双链DNA分子在一定浓度琼脂糖凝胶中的迁移速率与DNA分子量对数成反比,分子越大则所受阻力越大,也越难于在凝胶孔隙中移动,因而迁移得越慢。
(2)DNA分子的构象。
当DNA分子处于不同构象时,它在电场中移动距离不仅和分子量有关,还和它本身构象有关。
相同分子量的线状、开环和超螺旋质粒DNA在琼脂糖凝胶中移动的速度是不一样的,超螺旋DNA移动得最快,而开环状DNA移动最慢。
如在电泳鉴定质粒纯度时发现凝胶上有数条DNA带难以确定是质粒DNA不同构象引起还是因为含有其他DNA引起时,可从琼脂糖凝胶上将DNA带逐个回收,用同一种限制性内切酶分别水解,然后电泳,如在凝胶上出现相同的DNA图谱,则为同一种DNA。
(3)电源电压。
在低电压时,线状DNA片段的迁移速率与所加电压成正比。
但是随着电场强度的增加,不同分子量的DNA片段的迁移率将以不同的幅度增长,片段越大,因场强升高引起的迁移率升高幅度也越大,因此电压增加,琼脂糖凝胶的有效分离范围将缩小。
要使大于2kb 的DNA 片段的分辨率达到最大,所加电压不得超过5v/cm。
(4)离子强度影响。
电泳缓冲液的组成及其离子强度影响DNA的电泳迁移率。
在没有离子存在时(如误用蒸馏水配制凝胶),电导率最小,DNA几乎不移动;在高离子强度的缓冲液中(如误加10×电泳缓冲液),则电导很高并明显产热,严重时会引起凝胶熔化或DNA变性。
琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳是一种凝胶电泳方法,用于生物化学、分子生物学、遗传学和临床化学,以分离琼脂糖基质中的大分子混合群,例如DNA、RNA 或蛋白质。
琼脂糖是从海藻中提取的天然线性聚合物,当在缓冲液中加热并冷却时,通过氢键形成凝胶基质。
它们是分离中、大型核酸最常用的介质,分离范围广。
琼脂糖凝胶电泳实验常用以DNA 切胶回收,DNA 分离和用于佐证DNA 是否重组、质粒等是否切开。
今天我们就来聊聊琼脂糖凝胶电泳实验的一些小技巧小细节。
第一步:胶液的制备称取0.4g 琼脂糖,置于200ml 锥形瓶中,加入50ml 0.5×TBE 稀释缓冲液,放入微波炉里加热,直到琼脂糖全部熔化,取出摇匀,此为0.8%琼脂糖凝胶液。
总液体量不宜超过锥瓶的50%容量。
否则会溢出来的。
毛博就吃过这个亏。
还要擦洗微波炉。
加热过程中要不时摇动,使附于瓶壁上的琼脂糖颗粒进入溶液。
加热时应盖上封口膜,以减少水份蒸发。
第二步:胶板的制备倒胶时的温度不可太低,否则凝固不均匀。
东一块西一块的。
果冻做出来就不好看啦。
速度也不可太快,否则容易出现气泡。
果冻做出来里面都是气泡。
怎么吃呀?待胶完全凝固后拨出梳子,注意不要损伤梳底部的凝胶。
第三步:加样注意上样时要小心操作,避免损坏凝胶或将样品槽底部凝胶刺穿。
果冻下面被戳个窟窿,还怎么吃呀?第四步:电泳加完样后,合上电泳槽盖,立即接通电源。
控制电压保持在60-80V,电流在40mA 以上。
当溴酚蓝条带移动到距凝胶前沿约2cm 时,停止电泳。
第五步:染色未加EB 的胶板在电泳完毕后移入0.5μg/ml 的EB 溶液中,室温下染色20-25 分钟。
第六步:观察和拍照在波长为254nm 的长波长紫外灯下观察染色后的或已加有EB的电泳胶板。
DNA 存在处显示出肉眼可辨的桔红色荧光条带。
紫光灯下观察时应戴上防护眼镜或有机玻璃面罩,以免损伤眼睛。
除这些细节之外,还有一些注意事项:1. 酶切时所加的DNA 溶液体积不能太大,否则DNA 溶液中其他成分会干扰酶反应。
dna琼脂糖凝胶电泳
DNA琼脂糖凝胶电泳介绍DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物技术实验方法,用于分离DNA分子并确定其大小。
它基于DNA分子的电荷和大小不同,通过应用电场使DNA分子在琼脂糖凝胶中迁移,从而实现分离。
原理DNA琼脂糖凝胶电泳的基本原理是:DNA分子带负电荷,当置于电场中后,电场将使DNA分子向正电极移动。
然而,DNA分子在琼脂糖凝胶中的迁移速度取决于它的大小。
较长的DNA分子由于受阻力较大,迁移速度较慢,而较短的DNA分子迁移速度较快。
因此,琼脂糖凝胶电泳可以将DNA分子根据大小进行分离。
实验步骤1. 样品处理将待测DNA样品与凝胶电泳缓冲溶液混合,并加入负荷样品的染料来增加样品的重量和使其可见。
一般使用表现著名的溴化乙锭(Ethidium Bromide)来染色DNA分子。
2. 准备琼脂糖凝胶制备琼脂糖凝胶液,并根据实验需要将其倒入电泳槽中,并形成一个凝胶。
此过程需要使用琼脂糖凝胶制备缓冲液,一般为Tris–醋酸–EDTA缓冲液,简称TAE缓冲液。
3. 样品加载使用微量吸管或特殊的样品加载微孔将样品加载到琼脂糖凝胶上。
每个微孔能够承载一定量的样品,因此要根据样品的数量进行安排。
通常还会在凝胶上加载一个DNA分子大小标记(Marker)作为参考,以便确定未知样品的大小。
4. 电泳将凝胶放入电泳槽中,并将正负电极接入电源。
通过给定的电流和时间来进行电泳实验。
电流的选择取决于琼脂糖凝胶的密度和样品的大小范围。
5. 可视化和分析凝胶电泳完成后,通过紫外线照射或荧光成像系统来观察结果。
DNA分子在凝胶上能够与染料结合产生发光,从而可在琼脂糖凝胶上看到DNA分子的大小分布。
通过与已知DNA分子大小标记的对比,可以确定未知样品DNA分子的大小。
应用领域1. 分子生物学在分子生物学研究中,DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的手段。
它可以用于检测DNA分子的大小、评估PCR反应的效果、验证基因敲除和插入等分子操作的成功性等。
DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理及超详细步骤
DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理及超详细步骤实验原理:琼脂糖凝胶电泳是利用DNA分子的电荷和大小差异来分离DNA分子的一种方法。
DNA分子在电场作用下,会向阳极移动,移动速度与DNA分子的大小呈反比。
琼脂糖凝胶是一种聚合物,可以形成一种网络结构,在凝胶中进行电泳分离。
DNA分子在凝胶孔隙中相互碰撞,分子大小不同的DNA分子会在不同的速度下向阳极移动,从而实现了DNA分子的分离。
实验步骤:1.实验前的准备:a.制备琼脂糖凝胶:取一定量的琼脂糖粉末加入缓冲液中,加热溶解后冷却至大约50℃左右,倒入琼脂糖凝胶板中,插入梳子,待凝固。
b.缓冲液的制备:根据需要准备TAE缓冲液或TBE缓冲液。
2.DNA样品制备:a.将待测DNA样品加入试管中,用适当的缓冲液稀释样品。
b.使用嵌入剂将DNA样品加入琼脂糖凝胶中,通常将样品加入凝胶中的槽道。
3.凝胶电泳操作:a.将琼脂糖凝胶板放入电泳槽中,加入足够的缓冲液,使凝胶完全浸泡在缓冲液中。
b.将阴极和阳极电极连接到电泳槽中。
c.将样品和一些DNA分子大小标准物质分别加入凝胶中,用以测量DNA的大小。
d.打开电源,设定电流和电压,并进行电泳分离。
4.凝胶染色和成像:a.完成电泳分离后,关闭电源,取出琼脂糖凝胶板。
b.将琼脂糖凝胶板放入DNA染色剂中,染色一段时间后,取出凝胶板。
c.在紫外灯下观察琼脂糖凝胶板,可以看到DNA分子的条带。
5.数据分析:a.使用图像分析软件或标尺对琼脂糖凝胶板上的DNA条带进行测量,得到DNA分子的大小。
b.根据标准物质的条带大小,将待测DNA分子的大小与标准物质进行对比,计算DNA分子的大小。
c.根据DNA条带的强度和大小,可以估算DNA的浓度。
需要注意的是,具体的实验步骤可能因实验设备和试剂的不同而有所差异,所以在进行实验之前最好仔细阅读实验操作手册,并参考实验室老师或资深研究人员的指导。
琼脂糖凝胶电泳
分辨率与凝胶浓度的关系? 3、DNA荧光染料的发光原理?
DNA分子在碱性环境中带负电荷,在外加电场作用下向正极泳动。DNA分 子在琼脂糖凝胶中泳动时,有电荷效应与分子筛效应。不同DNA,其分 子量大小及构型不同,电泳时的泳动率就不同,从而分出不同的区带。 琼脂糖凝胶电泳法分离DNA,主要是利用分子筛效应,迁移速度与分子 量的对数值成反比关系。
溴化乙锭(EB)为扁平状分子,在紫外光照射下发射荧光。EB可与DNA分 子形成EB-DNA复合物,其发射的荧光强度较游离状态EB发射的荧光强度 大10倍以上,且荧光强度与DNA的含量成正比。用肉眼观察,可检测到5 ng以上的DNA。
(一)制胶
1、称取1.5g琼脂糖加入盛有100 ml 0.5TAE电泳缓冲液的250 ml三角瓶中, 摇匀,在微波炉上加热至琼脂糖完全溶 解。冷却到约60℃后,加入10 l的EB, 并摇匀。
2、将溶解的琼脂糖(约50℃)倒入制胶模 具中,直至厚度为4-6 mm,插入适当的 梳子,在室温下冷却凝固。
五、实验用具
移液器 吸管头若干 加样板 量筒100 ml1 三角瓶500 ml1
六、试剂
琼脂糖 50TAE电泳缓冲液 6 载样缓冲液 (loading buffer) 溴化乙锭(EB) DNA分子量标准(DNA marker):Marker III
七、实验步骤
(一)制胶(1% agarose gel) (二)点样 (三)电泳 (四)观察
实验三、琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳是分子克隆的核心技术之一,用于分 离、鉴定和纯化DNA片段。凝胶中DNA的位置可以用 低浓度的荧光插入染料染色直接观察。
DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理及超详细步骤
DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理及超详细步骤DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理及超详细步骤物品准备⽔平电泳槽、电泳仪、微波炉、紫外透射仪、锥形瓶、琼脂糖、电泳缓冲液(1xTBE) 溴化⼄锭(EB)溶液、上样缓冲液等实验原理DNA分⼦在琼脂糖中泳动时有电荷效应和分⼦筛效应,但主要为分⼦筛效应。
在pH值为8.0- 8.3时,核酸分⼦碱基⼏乎不解离,磷酸全部解离,核酸分⼦带负电,在电泳时向正极移动。
采⽤适当浓度的凝胶介质作为电泳⽀持物,在分⼦筛的作⽤下,使分⼦⼤⼩和构象不同的核酸分⼦泳动率出现较⼤的差异,从⽽达到分离核酸⽚段检测其⼤⼩的⽬的。
核酸分⼦中嵌⼊荧光染料(如EB )后,在紫外灯下可观察到核酸⽚段所在的位置。
实验步骤(1)准备制胶架,⽤蒸馏⽔将电泳槽和梳⼦冲洗⼲净,放在⽔平桌⾯上,并架好梳⼦(2)配制琼脂糖凝胶及倒胶,琼脂糖凝胶浓度与线形DNA的最佳分辨范围a.以1%的胶为例,三⾓瓶内0.6g琼脂糖+60ml(0.5xTBE)煮胶溶解冷却⾄60C(不烫⼿)b.加⼊溴化⼄锭溶液(终浓度0.5ug/ml)或按照1ul/30mL的⽐例加⼊DNAgreen 染料,并充分混匀。
c.倒板,⼩胶倒⼊25-30ml左右琼脂糖溶液,⼤胶则60-70ml左右,若需切胶回收,凝胶可适当加厚。
d.室温下充分凝固,⼤约30分钟-1⼩时e.垂直向上拔出梳⼦f.将胶板放⼊电泳槽g.向电泳槽中加⼊0.5xTBE缓冲液⾄刚没过凝胶表⾯1-2nm.(3)加样将DNA样品(5ul)与6X上样缓冲液( 1ul)混匀后,⽤微量加样枪⼩⼼加⼊样品孔内,上样量根据样品浓度可适当调整,若DNA含量偏低,则可依上述⽐例增加上样量,但总体积不可超过样品槽容量(⼀般⼩孔40ul为上限,⼤孔200ul为上限,具体和制胶膜规格相关)。
注意加样枪的枪头不可插⼊过深,以免刺穿凝胶,导致样品外溢。
每加完⼀个样品要更换枪头,以防⽌EB污染。
(4)电泳接通电源,⼀般红⾊为正极,⿊⾊为负极,切记DNA样品由负极往正极泳动(靠近加样孔的⼀端为负),电压为5V/cm (长度以两个电极之间的距离计算),⼀般控制电压保持在110v,电流在40mA以上。
DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理和方法步骤
DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理和方法步骤实验原理:DNA是带有负电荷的分子,当在电场力作用下,可以根据分子的大小和形状移动到琼脂糖凝胶上。
琼脂糖凝胶的作用是形成一个微孔状的网状结构,可以筛选DNA根据大小进行分离。
较小的DNA片段能够通过网状结构移动较快,而较大的DNA片段则移动较慢。
通过观察DNA在凝胶上的迁移距离和与各种标准DNA片段的比较,可以确定样品中DNA片段的大小。
方法步骤:准备工作:1.准备琼脂糖凝胶:按照产品说明书或实验方案将琼脂糖溶解在适量的缓冲液中,同时加热至完全溶解。
2.准备电泳槽:将琼脂糖凝胶倒入电泳槽中并插入电极,确保凝胶充分固化并全部覆盖缓冲液。
样品处理:1.提取DNA样品:根据实验需求,从细胞或组织中提取DNA。
2.消化DNA:将DNA溶液加入适量的限制性内切酶反应缓冲液,并在适当的温度下孵育一段时间,以消化DNA并产生DNA片段。
3.加入标记:对DNA样品进行标记,如使用荧光染料或放射性同位素。
4.加入加载缓冲液:将DNA样品与适量的加载缓冲液混合,以便在电泳过程中均匀加载样品。
电泳:1.装载样品:将标记好的DNA样品加载到琼脂糖凝胶的孔上。
可以使用微量吸管或特殊的装载器具,确保每个孔中加载相同数量的DNA。
2.加载DNA标准:在其中一个孔中加载大小已知的DNA标准,以用于分析和确定样品中的DNA片段大小。
3.电泳运行:将电泳槽连接到电源,并设定合适数值的电流和电压。
运行电泳直到DNA杂质和标准DNA片段迁移到适当位置(通常为30分钟至数小时)。
染色和可视化:1.染色:将琼脂糖凝胶浸入DNA染色剂溶液中,以便可视化DNA片段。
2.可视化和记录:使用紫外光或其他适当的光源照射琼脂糖凝胶,观察DNA片段的迁移情况,并使用相机、成像系统或适当的分析软件记录和分析结果。
解释结果:通过比较标准DNA片段的迁移速度和位置,可以判断样品中DNA片段的大小。
较小的DNA片段会迁移至凝胶上更远的位置,而较大的DNA片段则更接近插孔。
琼脂糖凝胶电泳技术的原理和方法
琼脂糖凝胶电泳技术的原理和方法一、原理:琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离和分析生物大分子的方法。
其原理是利用琼脂糖凝胶作为固定相,通过电场作用将待分离物质在凝胶中进行分离。
琼脂糖凝胶是一种具有多孔结构的凝胶介质,可以根据待分离物质的尺寸和电荷特性进行分离。
二、方法:1. 准备琼脂糖凝胶:首先,按照所需的凝胶浓度和体积配制琼脂糖溶液。
然后,在琼脂糖溶液中加入缓冲液,并搅拌均匀。
将混合液倒入凝胶板中,待其凝固后,准备好使用的琼脂糖凝胶。
2. 样品制备:将待分离的样品进行处理,如蛋白质样品可以经过蛋白质提取和纯化步骤,DNA样品可以进行酶切等处理。
3. 样品加载:将处理好的样品加载到琼脂糖凝胶中。
可以使用样品井或样品孔进行加载,确保每个样品均匀地加载到凝胶中。
4. 电泳条件设置:根据待分离物质的特性和需求,设置适当的电泳条件。
包括电场强度、电泳时间和缓冲液pH值等。
5. 电泳分离:将凝胶板放入电泳槽中,连接电源,进行电泳分离。
在电场的作用下,待分离物质会在凝胶中进行迁移,根据其尺寸和电荷特性进行分离。
6. 结果分析:电泳结束后,可以通过染色等方法观察凝胶板上的带状图案。
根据不同的染色方法,可以观察到不同的待分离物质,如蛋白质带、DNA带等。
三、应用:琼脂糖凝胶电泳技术在生物科学研究中具有广泛的应用。
其中,常见的应用有以下几个方面:1. 蛋白质分离与鉴定:可以通过琼脂糖凝胶电泳技术对蛋白质进行分离和鉴定。
蛋白质在电泳过程中根据其分子量的不同而分离成多个带状条带,通过染色或Western blotting等方法可以对目标蛋白质进行定性或定量分析。
2. DNA分析:琼脂糖凝胶电泳技术在DNA分析中也有重要应用。
可以通过电泳分离来检测DNA片段的长度和纯度,如测序片段、PCR产物等。
3. RNA分析:琼脂糖凝胶电泳技术也可以用于RNA的分析。
通过电泳分离可以检测RNA的大小、纯度和相对含量等。
4. 蛋白质-核酸相互作用研究:通过琼脂糖凝胶电泳技术,可以研究蛋白质与核酸之间的相互作用。
琼脂糖凝胶电泳实验原理及步骤
实验三琼脂糖凝胶电泳一、实验原理琼脂糖凝胶电泳是分离和纯化DNA 片段的常用技术。
把DNA样品加入到一块包含电解质的多孔支持介质(琼脂糖凝胶)的样品孔中,并置于静电场上。
由于DNA分子的双螺旋骨架两侧带有含负电荷的磷酸根残基,因此在电场中向正极移动。
在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应。
具有不同的相对分子质量的DNA片段泳动速度不一样,因而可依据DNA分子的大小来使其分离。
凝胶电泳不仅可分离不同分子质量的DNA,也可以分离相对分子质量相同,而构型不同的DNA分子。
在电泳过程中可以通过示踪染料或相对分子质量标准参照物和样品一起进行电泳而得到检测。
相对分子质量标准参照物相对可以提供一个用于确定DNA片段大小的标准。
在凝胶中加入少量溴化乙锭(ethidium bromide, EB),其分子可插入DNA的碱基之间,形成一种络合物,在254~365nm波长紫外光照射下,呈桔红色荧光,因此也可对分离的DNA 进行检测。
一般琼脂糖凝胶电泳适用于大小在0.2kb~50kb范围内的DNA片段。
本实验介绍琼脂糖凝胶的制备以及琼脂糖凝胶电泳在DNA片段分离中的应用方法。
二、仪器及试剂1.仪器及耗材:水平电泳槽、电泳仪、凝胶成像分析系统、微波炉、微量移液器、透明胶带、点样板或parafilm、100 ml或250 ml锥形瓶、量筒、吸头等。
2.试剂及配制:50×TAE缓冲液的配制:2 mol/L Tris-乙酸,0.05 mol/L EDTA(pH8.0)配制1000 mlTris 242 g冰乙酸 57.1 ml0.5 mol/L EDTA 100 ml加入600 ml去离子水后搅拌溶解,将溶液定容至1 L后。
高温高压灭菌,室温保存。
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和方法步骤
⑸100倍电泳缓冲液的配制:
4mol/LTris-HCl(pH8..0),2mol/L醋酸钠,200mmol/LEDTA
称取,无水乙酸钠,,先用400ml双蒸水加热搅拌溶解后,再用冰乙酸调pH至(大约加入冰乙酸50ml),然后定容至500ml。用时稀释100倍。
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和方法步骤
琼脂糖凝胶电泳是用于分离、鉴定和提纯DNA片段的标准方法。琼脂糖是从琼脂中提取的一种多糖,具亲水性,但不带电荷,是一种很好的电泳支持物。DNA在碱性条件下(pH8 0的缓冲液)带负电荷,在电场中通过凝胶介质向正极移动,不同DNA分子片段由于分子和构型不同,在电场中的泳动速率液不同。溴化乙锭(EB)可嵌入DNA分子碱基对间形成荧光络合物,经紫外线照射后,可分出不同的区带,达到分离、鉴定分子量,筛选重组子的目的。…
4、待琼脂糖胶凝固后,在电泳槽内加入电泳缓冲液,然后拔出梳子。
5、加样
将DNA样品与加样缓冲液(loading buffer)按4:1混匀后,用微量移液器将混合液加到样品槽中,每槽加10-20μl,记录样品的点样次序和加样量。
6、电泳
安装好电极导线,点样孔一端接负极,另一端接正极,打开电源,调电压至3-5V/cm,电泳1-3hr,当溴酚蓝移到距凝胶前沿1-2cm时,停止电泳。
2、琼脂糖凝胶的制备
称取琼脂糖溶解在电泳缓冲液中,(按的琼脂糖含量,1-25kb大小的DNA用1%的凝胶,20-100kb的DNA用%的凝胶,200-2000bp的DNA用%的凝胶)置微波炉或沸水浴中加热至完全溶化(不要加热至沸腾),取出摇匀。
3、灌胶
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤
一、实验目的琼脂糖凝胶电泳是常用的检测核酸的方法,学习DNA琼脂糖凝胶电泳的使用技术,掌握有关的技术和识读电泳图谱的方法。
二、实验原理琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA、RNA分子混合物的方法,这种电泳方法以琼脂凝胶作为支持物,利用DNA分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的。
DNA分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动。
在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即分子本身的大小和构型是主要的影响因素。
DNA分子的迁移速度与其相对分子量成反比。
不同构型的DNA分子的迁移速度不同。
如环形DNA分子样品,其中有三种构型的分子:共价闭合环状的超螺旋分子(cccDNA)、开环分子(ocDNA)、和线形DNA分子(IDNA)。
这三种不同构型分子进行电泳时的迁移速度大小顺序为: cccDNA>IDNA>ocDNA核酸分子是两性解离分子,pH3.5是碱基上的氨基解离,而三个磷酸基团中只有一个磷酸解离,所以分子带正电,在电场中向负极泳动;而 pH8.0-8.3时,碱基几乎不解离,而磷酸基团解离,所以核酸分子带负电,在电场中向正极泳动。
不同的核酸分子的电荷密度大致相同,因此对泳动速度影响不大。
在中性或碱性时,单链DNA与等长的双链DNA的泳动率大致相同。
影响核酸分子泳动率的因素主要是:1、样品的物理性状即分子的大小、电荷数、颗粒形状和空间构型。
一般而言,电荷密度愈大,泳动率越大。
但是不同核酸分子的电荷密度大致相同,所以对泳动率的影响不明显。
对线形分子来说,分子量的常用对数与泳动率成反比,用此标准样品电泳并测定其泳动率,然后进行DNA分子长度(bp)的负对数——泳动距离作标准曲线图,可以用于测定未知分子的长度大小。
DNA分子的空间构型对泳动率的影响很大,比如质粒分子,泳动率的大小顺序为:cDNA>ID NA>ocDNA但是由于琼脂糖浓度、电场强度、离子强度和溴化乙锭等的影响,会出现相反的情况。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法
[实验原理]
电泳是现在用于分离和纯化DNA片段的最常用技术。
包含电解质的多孔支持介质----“胶”并把它置于静电场中。
则DNA分子将向阳极移动,这是因为DNA分子沿其双螺旋骨架两侧带有含负电荷的磷酸根残基。
当DNA长度增加时,来自电场的驱动力和来自凝胶的阻力之间的比率就会降低,不同长度的DNA片段就会表现出不同的迁移率。
因而就可依据DNA分子的大小来使其分离。
该过程通过把示踪染料(Purple Loading Dye)或分子量标准参照物(Ladder)和样品(DNA&RNA)一起进行电泳而得到检测。
分子量标准参照物也可以提供一个用于确定DNA片段大小的标准。
琼脂糖凝胶适用于分离大小在0.2-50Kb范围内的DNA片段。
[实验用品]
1.琼脂糖 1.0%
1.0g琼脂糖+100ml电泳缓冲液(TAE),微波炉中火30秒至沸腾,熔化的琼脂物冷却至60℃时
可加入10mg/ml溴化乙锭10μl,充分混匀,将温热的凝胶倒入已置好梳子(鉴定胶用细密点的梳子;回收胶用粗稀的梳子)的胶膜中在室温下放置30-45min后现进行电泳。
1.5%:琼脂糖1.5g。
2.电泳缓冲液
50×TAE Tris乙酸Tris 242g终2 mol/L
乙酸57.1ml 终1mol/L
0.5M EDTA200ml pH8.0终100mmol/L dH2O 补足至1000ml
使用时稀释1×TAE。
5×TBE Tris硼酸Tris 54g 终445mmol/L
硼酸27.5g 终445mmol/L
0.5M EDTA20ml pH8.0终10mmol/L dH2O 补足至1000ml
使用时稀释10倍成0.5倍如50ml贮存液+450ml水→500ml工作液。
[实验内容与方法]
1.移取适量的琼脂糖(如制备1%的琼脂糖胶液就移1g的琼脂糖溶于100ml TAE缓冲液中)微波炉加热使其溶于TAE缓冲液中。
熔化的琼脂物冷却至60℃时可加入10mg/ml溴化乙锭10μl,充分混匀。
2.缓慢地将琼脂糖胶液注入一个带有“梳子”的胶床中(避免气泡产生),若有气泡产生用塑料移液管移去。
3.根据胶的大小让胶凝固20-60min.
4.当胶正凝固时,准备DNA样品,取适量的DNA如10μlDNA+2μl(6X)Purple Loading Dye混合.(加样液中包含染料如溴酚蓝BPB)
5.胶凝之后轻轻移去梳子。
将胶床放在电泳槽内,加样孔一侧靠近阴极黑末端,注入适量的TAE 缓冲液,通常缓冲液高于胶面1cm。
或加溴化乙锭EB 至TAE缓冲液中并使之混匀EB的终浓度是1μg/ml。
EB也可加到胶中即将琼脂糖在微波炉加热然后冷却至60℃再加入EB。
6.加DNA样品及进行电泳使吸管与加样孔垂直使吸管尖端刚好在加样孔开口之下缓慢将DNA样品加入加样孔中.
7.加样完毕后正确连接电泳槽和电源黑的连阴极红的连阳极在打开电源之前设定好电压和时间电压150V, 时间10min.
8.通过检查加样孔附近的铂线来检测接线柱是否连接良好。
若连接良好负极附近的铂丝会有气泡产生。
9.电泳过程要进行一个合适的霎时间。
电泳时间的选择取决于胶的长度和电压的大小。
胶越长,电压越低,所需时间越长.然而使用高电压时,大的DNA片段的分辨率很低。
10.凝胶摄影
[注意事项]
1.TAE和TBE都是常用的缓冲液TBE相对于TAE而言有较高的缓冲量。
2.电泳中溴酚蓝和0.5Kb大小的DNA一起移动这可给泳动最快的DNA片段提供一个指征。
3.DNA的迁移依赖如下因素
DNA分子越小迁移越快。
琼脂糖其浓度越低迁移越快。
DNA的构象环状切口DNA比线状DNA 迁移快。
两电极间每厘米的电压。
电压越高迁移越快。
所需加水的μl数.一般PCR反应中的引物终浓度为0.2~1.0μmol.L
3.根据胶的大小让胶凝固20-60min.
4.当胶正凝固时准备DNA样品并取适量的DNA如5μl加1μl加样缓冲液混合加样液中包含染料如溴酚蓝BPB。
5.胶凝之后轻轻移去梳子。
将胶床放在电泳槽内加样孔一侧靠近阴极黑末端注入适量的TAE缓冲液通常缓冲液高于胶面1cm。
或加溴化乙锭EB至TAE缓冲液中并使之混匀EB的终浓度是1μg/ml。
EB也可加到胶中即将琼脂糖在微波炉加热然后冷却至50℃再加入EB。
6.加DNA样品及进行电泳
使吸管与加样孔垂直使吸管尖端刚好在加样孔开口之下缓慢将DNA样品加入加样孔中7.加样完毕后正确连接电泳槽和电源黑的连阴极红的连阳极在打开电源之前设定好电压和时间电压150V, 时间10min.
8.通过检查加样孔附近的铂线来检测接线柱是否连接良好。
若连接良好负极附近的铂丝会有气泡产生。
9.电泳过程要进行一个合适的霎时间。
电泳时间的选择取决于胶的长度和电压的大小。
胶越长电压越低所需时间越长.然而使用高电压时大的DNA片段的分辨率很低。
10.凝胶摄影
[注意事项]
1.TAE和TBE都是常用的缓冲液TBE相对于TAE而言有较高的缓冲量。
2.电泳中溴酚蓝和0.5Kb大小的DNA一起移动这可给泳动最快的DNA片段提供一个指征。
3.DNA的迁移依赖如下因素
DNA分子越小迁移越快。
琼脂糖其浓度越低迁移越快。
DNA的构象环状切口DNA比线状DNA迁移快。
两电极间每厘米的电压。
电压越高迁移越快。