生物奥赛培训生物信息学
高中生物竞赛生物信息学课件
三：序列格式
数据库中包含有大量的蛋白质及核酸序列的详细描述，在 文本格式中碱基序列和氨基酸序列都用一个字母来表ห้องสมุดไป่ตู้。但 他们需要通过特定的共用算法表达出来。
四：生物信息学中的XML格式
可扩展标记语言XML是一种在文本文件中组织数据的语 言，一个XML文件代表一个嵌套的信息树。
差异，分子系统发育分析是研究核酸序列与蛋白质 序列的发育问题。
在具体分析时，会选择某段核内核酸序列等进行多 个生物种类相关序列的同源性分析，查明这些种类 的亲缘关系及进化程度，构建进化树。
六：蛋白质结构预测 目前测定特定性质蛋白质结构的手段主要依靠X射线晶
体衍射与核磁共振。这两种方法只能测定特定性质蛋白 质结构，跟不上核酸测定的速度。
四：研究方法
DNA序列测定是人类基因组计划中最基本任务， 在探索有效的测序方法时，先将有关方法应用到其 他生物基因组测序，再将成功方法运用到人类基因 组。
酿酒酵母基因组第一个被测序真核生物， 12100000个碱基对；线虫基因组第一个被测序动 物基因组，97000000个碱基对。
基因组测序概观：选择生物→从细胞中分离基因 组DNA→把基因组DNA切割成合适的可相互重叠 的DNA片段→把DNA片段插入载体中大量克隆→ 测出每个DNA片段的序列→根据片段间重叠，把 序列组装成最终基因组序列
生物学实验很多，比如免疫共沉淀法、荧光扫描共振能 量转移、双分子荧光互补技术。 （六）生物系统模拟 （七）代谢网络建模分析
代谢网络设计生化反应途径、基因调控和信号转到过程 （蛋白质的相互作用） （八）计算生物学 （九）生物多样性研究 （十）合成生物学
补充内容： 人类基因组计划
生物奥赛培训个人计划
生物奥赛培训个人计划一、目标设定1.参加生物奥赛的初衷作为对生物学兴趣的学生，我对生物奥赛的参加并非出于追求荣誉或者奖励，而是出于对生物学知识的深入学习和探索的热爱。
参加生物奥赛可以让我更全面地了解生物领域的知识和技能，拓宽自己的学术视野，增加自己的综合素质。
同时，通过参加生物奥赛培训，我也希望能够获得更深入的生物学知识，提高自己在这个领域的竞争力，为未来的生物学研究和学习打下坚实的基础。
2.目标与计划在参加生物奥赛培训的过程中，我定下了以下两个目标：（1）全面掌握生物学的基础知识，包括生物化学、细胞生物学、生物遗传学、分子生物学、生态学等方面的知识；（2）培养解决问题的能力，包括分析思考、实验操作、数据处理和结果推断等方面的能力。
为了实现以上目标，我制定了以下具体的学习计划：（1）每天安排专门时间进行生物学知识的学习和复习，包括课本知识、学习资料的阅读和整理，以及生物实验的操作和观察。
（2）参加生物奥赛培训班，听取专业老师的讲解，参加相关的实验操作，进行小组讨论和交流。
（3）积极参加生物学相关的竞赛和活动，不断提高自己的综合素质和竞争力。
二、学习计划安排1.生物学基础知识学习（1）了解生物学的基本概念和发展历史，理解生物学在整个科学体系中的地位和作用。
（2）学习生物化学的基本知识，包括生物大分子的结构和作用，代谢过程的调控机制，细胞能量代谢和物质转运等内容。
（3）系统学习和掌握细胞生物学的基础知识，包括细胞结构和功能、细胞分裂和生命周期、细胞信号传导等内容。
（4）深入学习和了解生物遗传学的理论和实践知识，包括遗传信息的传递和功能的分子基础、遗传变异及其调控等内容。
（5）积极了解和学习分子生物学的知识，包括DNA和蛋白质的结构和功能、基因表达和调控机制、基因工程技术的原理和应用等内容。
（6）拓展自己对生态学的了解和认识，包括生态系统的结构和功能、生物多样性和生态平衡的维持机制、人类活动对生态环境的影响和保护等内容。
中学生生物学奥林匹克竞赛培训与学习计划
中学生生物学奥林匹克竞赛培训与学习计划1994--2006年9月一、培训与学习范围严格按照国际奥林匹克竞赛（IBO）纲要规定的内容、范围进行培训与学习。
根据国家冬训队要求，下列科目为第二阶段的重点内容：细胞生物学，生物化学，遗传与进化，生态学，动物行为学，动、植物生理学，分子生物学和拉丁文，微生物学；需要进一步加强辅导的科目有：脊稚动物起源及演化、植物分类等科目；这些科目，要着重结合学科的实验内容进行培训与学习。
实验培训、学习根据国际奥赛纲要的内容进行。
实验培训过程中，要着重培养学生实验的科学工作技能（观察、测量、数据处理、实验预测、归纳结论、实验设计等工作方法和思想方法）和操作技能（仪器使用、徒手切片、装片制作、动植物解剖、测量操作、检索表应用）。
仪器使用方面，对哪些先进的实验仪器要了解它们的使用原理和方法。
二、培训方法培训采用自学，辅导课，实验训练，综合解题训练，考核与讲评等方式进行。
具体的做法是：1、自学（月）选手按照培训纲要细目，学习国际奥赛纲要的全部内容和规定的教材。
每一个科目将进行考核或考试。
这一阶段要求选手广泛阅读参考书和做有关练习，在知识积累方面要达到相应的优秀本科生水平。
考核试卷与评定由教练组负责。
（进度与考核见附件一）2、辅导课（月—月）对各学科的基础知识由教练归纳、概括，使其条理化，以便选手对知识的熟练掌握和融汇贯通。
辅导课提倡讨论，并与实验培训和解题训练交叉进行。
每学科辅导完毕均进行一次较高难度的考核或考试。
（具体安排见附件二）3、考试和讲评由各科辅导教师分单元进行命题、评卷和讲评。
通过考核、讲评检查培训质量，进行查漏补缺（具体安排见附件二）三、培训纲要细目（仅作参考，以IBO纲要为准）（一）细胞生物学1、理论1）细胞（1）细胞膜：化学组成、结构与生理特点、物质运输方式，细胞连接（2）细胞质：A细胞器：线粒体、内质网、核糖体、高尔基体、溶酶体、液泡、前质体、质体（叶绿体、有色体、白色体）。
国赛生物竞赛培训方案
国赛生物竞赛培训方案国赛生物竞赛是一个综合性较强、难度较大的赛事，对于参赛选手的知识储备、实验能力和思维能力都提出了很高的要求。
为了有效提高选手的竞赛水平，制定一个科学合理的培训方案是非常重要的。
以下是一个国赛生物竞赛的培训方案，供参考。
一、目标定位1.提高学生的基础知识水平，夯实基本功。
2.培养学生的实验技能，提高操作能力。
3.锻炼学生的综合素质，加强思维和分析能力。
4.激发学生的兴趣，培养学生对生物学的热爱和探求精神。
二、培训内容与安排1.理论课程（1）复习基础知识：细胞生物学、遗传学、生态学等。
（2）学习竞赛专业知识：生物技术、分子生物学、生物工程等。
（3）解析竞赛案例：分析历年国赛生物竞赛试题，讲解解题思路和答题技巧。
2.实验课程（1）基础实验：细胞培养、染色体检测、酶活性测定等。
（2）创新实验：设计和开展与生物学相关的自主实验项目，培养学生的独立思考和创新能力。
3.团队合作组织学生进行小组合作学习，共同解决问题和完成实验，培养学生的团队协作和沟通能力。
4.竞赛模拟定期组织竞赛模拟考试，让学生熟悉竞赛规则和操作流程，提高应试能力和临场发挥。
三、教学方法和手段1.讲授相结合通过课堂教学和讲解复习基础知识，引导学生进行知识的整理与复习。
2.实践操作安排实验课程，让学生亲身参与实验操作，提高实验技能和操作能力。
3.案例分析通过解析竞赛案例，引导学生独立思考和分析问题，培养解决实际问题的能力。
4.讲座和实践交流邀请相关领域的专家学者举行讲座，组织学生进行实践交流，开展学术讨论和互动。
四、考核与评价1.定期测试设置定期测试，检测学生对基础知识的掌握情况，并及时进行补充和强化。
2.实验报告评估评估学生实验报告的质量和科学性，检验学生实验技能和实践能力。
3.模拟考试通过模拟考试，评估学生解决问题的能力和竞赛水平，提供个人化的辅导和指导。
五、教师角色与责任1.教师要注重理论与实践的结合，提高教学内容的针对性和实用性。
奥林匹克生物竞赛 培训
奥林匹克生物竞赛培训奥林匹克生物竞赛培训随着生物科学的快速发展，生物竞赛在学界和科研界越来越受到关注。
奥林匹克生物竞赛作为世界上最高水平的生物竞赛之一，吸引了众多年轻学子的参与。
为了提高学生的竞赛水平，培养学生的创新思维和实践能力，许多教育机构纷纷开设奥林匹克生物竞赛培训课程。
奥林匹克生物竞赛培训的主要目标是提高学生对生物学知识的理解和应用能力，培养学生的逻辑思维和问题解决能力。
在培训过程中，学生将学习生物学的基本概念和原理，掌握实验技巧和数据分析方法。
同时，培训还将注重培养学生的团队合作精神和沟通能力，通过集体讨论和合作实验，培养学生的合作意识和团队协作能力。
奥林匹克生物竞赛培训的内容丰富多样。
课程设计通常包括理论课、实验课和模拟竞赛等环节。
在理论课上，学生将学习有关生物学的基本知识，包括细胞生物学、遗传学、生态学等方面的内容。
通过讲解和讨论，学生将加深对这些知识的理解和掌握。
实验课是培训的重要组成部分，通过实际操作和观察，学生将掌握实验技巧和数据分析方法。
模拟竞赛环节将让学生接触到真实的竞赛题目，提高他们的解题能力和应对压力的能力。
奥林匹克生物竞赛培训注重培养学生的实践能力和创新思维。
在培训中，学生将参与到各种实验和研究项目中，通过自主设计和实施实验，学生将培养自己的实验能力和创新意识。
培训还将组织学生参加各种科学竞赛和学术交流活动，让学生有机会与其他学生交流和合作，提高自己的学术水平和竞赛能力。
奥林匹克生物竞赛培训不仅仅是为了参加竞赛，更重要的是培养学生的综合素质和科学精神。
培训过程中，学生将学会如何提出科学问题、进行科学探究和解决科学问题的方法。
培训还将注重培养学生的科学道德和科学精神，让学生理解科学的本质和价值，培养他们对科学的热爱和追求。
奥林匹克生物竞赛培训对学生的未来发展具有重要意义。
通过参加培训，学生将积累丰富的科学知识和实践经验，为将来从事科研和教学工作打下坚实的基础。
同时，培训还将提高学生的综合素质和能力，培养他们的创新精神和实践能力，为学生的未来发展提供更多选择和机会。
高中生物竞赛社团培训计划
高中生物竞赛社团培训计划1. 培训目标本次培训旨在帮助学生达到以下目标：1）全面掌握高中生物基础知识，包括植物、动物、生物分子、细胞等领域的知识。
2）提高生物学习的兴趣，增强对生物学的热爱和好奇心。
3）培养解题能力和分析问题的能力，为参加生物竞赛做好充分的准备。
2. 培训内容本次培训将涵盖以下内容：1）生物基础知识：包括生物的基本概念、细胞的结构与功能、生物分子的结构与功能、遗传与进化等领域的知识。
2）生物实验技能：掌握基本的生物实验技能，培养学生观察、实验设计和数据分析的能力。
3）生物解题技巧：针对生物竞赛考试题型，介绍解题技巧和方法，帮助学生更好地应对竞赛题目。
3. 培训方式本次培训将采用多种方式进行：1）课堂教学：老师将进行系统的讲解和教学，帮助学生全面掌握生物基础知识。
2）实验操作：组织学生进行生物实验，帮助他们掌握实验技能。
3）解题训练：通过解题训练，培养学生的解题能力和分析问题的能力。
4）讨论交流：组织学生进行小组讨论和交流，促进学生之间的合作和交流。
4. 培训进度安排本次培训将在每周末举行，每次培训为2小时。
培训内容和进度安排如下：第一周：植物的结构与功能第二周：动物的结构与功能第三周：生物分子的结构与功能第四周：细胞的结构与功能第五周：遗传与进化第六周：生物实验技能第七周：生物解题技巧及模拟考试5. 培训师资本次培训将有资深生物老师担任授课老师，老师具有丰富的生物教学经验和竞赛指导经验，在生物竞赛领域有一定的知名度和影响力。
同时，我们还将邀请曾参加过生物竞赛并取得优异成绩的学长学姐担任助教，他们将为学生提供更多的学习经验和指导建议。
6. 培训费用本次培训对于学生是免费的，社团将通过学校赞助和社团成员的捐赠来支持本次培训。
7. 培训评价为了确保培训效果，我们将对学生的学习情况进行跟踪评估，包括平时的学习情况、作业完成情况、考试成绩等。
同时，我们还将组织模拟考试，全面评估学生的学习情况，并为学生提供个性化的指导和建议。
奥赛经典生物奥林匹克教程
奥赛经典生物奥林匹克教程【原创实用版】目录1.奥赛经典生物奥林匹克教程概述2.生物奥林匹克竞赛的历史和意义3.奥赛经典生物奥林匹克教程的内容和特点4.教程的使用对象和适用范围5.奥赛经典生物奥林匹克教程的价值和影响正文一、奥赛经典生物奥林匹克教程概述奥赛经典生物奥林匹克教程是一本针对中学生生物奥林匹克竞赛的辅导教材。
该教程汇集了历年来生物奥林匹克竞赛的试题和相关知识点，旨在帮助学生更好地掌握生物学知识，提高其在生物奥林匹克竞赛中的竞争力。
二、生物奥林匹克竞赛的历史和意义生物奥林匹克竞赛起源于苏联，后来逐渐传播到世界各地。
我国自1992 年开始组织全国中学生生物奥林匹克竞赛，旨在选拔和培养优秀的中学生生物学人才，激发学生对生物学的兴趣和创造力，为国家未来的生物科学发展奠定基础。
三、奥赛经典生物奥林匹克教程的内容和特点奥赛经典生物奥林匹克教程主要包括生物学基础知识、生物实验技术、生物信息学等方面的内容。
教程的特点如下：1.知识点全面：教程涵盖了生物学的各个领域，既有基本的生物学概念，也有前沿的研究成果。
2.题目典型：教程收录了大量历年生物奥林匹克竞赛的典型题目，有利于学生了解竞赛的命题规律和解题方法。
3.重点突出：教程对重点知识点进行了深入讲解，有助于学生更好地掌握生物学的核心内容。
4.实用性强：教程提供的实验操作方法和技巧，能够帮助学生提高实验能力，更好地应对竞赛中的实验环节。
四、教程的使用对象和适用范围奥赛经典生物奥林匹克教程适用于中学生生物奥林匹克竞赛的辅导和自学。
无论是对于初学者还是有一定基础的学生，该教程都能提供有针对性的帮助。
此外，教程还可作为生物学教师的教学参考书，帮助教师更好地开展生物奥林匹克竞赛的辅导工作。
五、奥赛经典生物奥林匹克教程的价值和影响奥赛经典生物奥林匹克教程的出版，对于推动我国中学生生物奥林匹克竞赛的发展具有重要价值。
通过使用该教程，许多学生在生物奥林匹克竞赛中取得了优异成绩，为我国生物科学事业做出了贡献。
生物课件生物奥赛全套课件细胞生物学
2 细胞的大小
❖ 细胞的体积很小;肉眼一般是看不见的;需要借助显微镜才能看到 在显 微技术和电镜技术中常用的单位有：微米μm或μ 纳米又叫毫微米nm 和埃三种 1m＝102cm＝106μm＝109Å
显
保持稳定;是因为它也像磷脂分子那样具有亲水和疏水两个部分 暴露在水介质中的部分由亲水性氨基酸组成;而嵌在脂质在的蛋
微
白质部分主要是由疏水性氨基酸组成的 现在已能分离出某些内 在性蛋白;发现它们的疏水性氨基酸含量显著多于亲水性氨基酸;
结
而外在性蛋白的这两类氨基酸的比例是大体相等的 多糖只分布于膜和外侧;表现出不对称性 脂质在膜中的分布也是
细
们的抗原蛋白质是在融合细胞膜中互相分开存在的 但在 37℃下保温40分钟后;两种颜色的荧光点就呈均匀分布
胞
的
亚
显
微
结
这说明抗原蛋白质可以在细胞膜中移动而重新分布 这一过
构
程基本上不需能量;因为它不因缺乏ATP而受抑制 膜蛋白的运动受很多因素影响 膜中蛋白质与脂类的相互作
用 内在蛋白与外在蛋白相互作用 膜蛋白复合体的形成 膜
的
不同种类细胞的质膜功能有关;少者几种;多者可 能有数十种 由于分离提纯困难;迄今提纯的膜蛋
亚
白还为数不多 从分布位置看;质膜的蛋白质可分
显
为两大类 一类只是与膜的内外表面相连;称为外 在性蛋白或周缘蛋白 另一类嵌入双脂质内部;有
微 结
的甚至还穿透膜的内外表面;称为内在性蛋白 分 高外在性蛋白比较容易;但内在性不易分一般外在 性蛋白占全部胰蛋白的比例较小;而内在性蛋白所
生物奥赛培训教程
抗毒素：机体抵抗外毒素而产生的抗体 。
毒素：
二、放线菌
放线菌是丝状单细胞原核生物，革兰氏染色阳性反应，以孢子繁殖，陆生性较强，其他结构与细菌基本相同。
营养生长阶段，菌丝内无隔，故一般呈多核的单细胞状态。
01
02
抗生素主要由放线菌产生,而其中90%又由链霉菌属产生。如链霉素、土霉素、抗真菌的制霉菌素、卡那霉素等都是链霉菌的次级代谢产物。（青霉素、头孢霉素、灰黄霉素等抗生素是真菌产生）
2. 特殊结构
（二）鞭毛 (flagellum)
许多细菌在菌体上附有细长并呈波状弯曲的丝状物，称为鞭毛，是细菌的运动器官。 鞭毛需用电子显微镜观察，或经特殊染色法使鞭毛增粗后才能在光镜下看到。
芽孢
芽胞的形成与发芽
细菌形成芽胞的能力是由菌体内的芽胞基因决定的。
一个细菌只形成一个芽胞，一个芽胞发芽也只生成一个菌体，细菌数量并未增加。 因而芽胞不是细菌的繁殖方式，而是细菌的休眠体。
在细菌中与抗热、抗紫外线和抗化学物质有关的结构是： 芽孢 B．荚膜 细胞壁 D．包含体
鞭毛菌分类
单毛菌 双毛菌 丛毛菌 周毛菌
鞭毛是运动器官。
01
鞭毛有抗原性。
02
鞭毛的功能
2.特殊结构
（三）菌毛 (filus/fimbriae)
STEP4
STEP3
STEP2
STEP1
菌毛：许多革兰阴性菌和少数革兰阳性菌菌体表面存在着一种比鞭毛更细、更短而直硬的丝状物，与细菌的运动无关。
菌毛蛋白具有抗原性。
染色体DNA的复制与分离 细胞壁扩增 细胞分裂
外毒素：革兰氏阳性菌生长过程中不断向外界环境分泌的一种毒性蛋白。
类毒素:用0.3% —0.4%甲醛溶液对外毒素进行脱毒处理，可获得失去毒性担仍保留其原有免疫原性（抗原性）的生物制品。
信息学竞赛中的生物信息学与基因工程
信息学竞赛中的生物信息学与基因工程生物信息学和基因工程是现代生物科学领域中不可或缺的重要分支，它们在信息学竞赛中扮演着重要的角色。
本文将从生物信息学和基因工程的概念、应用领域以及在信息学竞赛中的相关内容展开论述。
一、生物信息学生物信息学是一门综合性的学科，它将生物学、计算机科学、数学和统计学等交叉领域的知识相结合，旨在理解和解释生物系统中的信息。
生物信息学的研究内容包括基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等。
生物信息学通过大数据的处理和生物信息的分析，帮助我们了解生物体内的分子组成和功能。
生物信息学在信息学竞赛中的应用十分广泛。
例如，在算法设计的竞赛环节中，生物信息学中的字符串匹配算法和序列比对算法经常被应用于DNA序列分析和基因组比较。
另外，生物信息学中的机器学习和人工智能算法也能够应用于基因表达的模式识别和预测。
因此，对于参与信息学竞赛的选手来说，熟悉生物信息学的基本概念和常用算法是非常重要的。
二、基因工程基因工程是通过改变生物体的遗传信息来实现特定目的的一种技术。
它可以用来创建新的基因、调控基因的表达和修复缺陷基因等。
基因工程的应用领域包括医药、农业、环境等多个方面。
近年来，基因工程在肿瘤治疗、农作物抗逆性改良以及工业废水处理等方面取得了重大突破。
在信息学竞赛中，基因工程的相关知识通常与遗传算法和优化问题有关。
遗传算法是一种基于进化思想的优化算法，在信息学竞赛中经常被用来解决复杂的优化问题。
同时，遗传算法的设计灵感也来源于生物体的基因组突变和选择过程。
因此，了解基因工程的基本原理和应用，对于理解和应用遗传算法具有重要意义。
三、生物信息学与基因工程在信息学竞赛中的综合应用生物信息学和基因工程在信息学竞赛中通常会结合使用，形成综合的问题。
例如，在竞赛中可能需要设计一个基于遗传算法的模型，来实现对基因组序列的优化选择。
同时，基于生物信息学中序列比对和基因表达的分析结果，可以辅助设计出更精确的遗传算法。
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NCBI
分子生物学数据类型
物种
RNA表达
DNA模体 RNA序列 蛋白质序列
蛋白质结构
基因组图谱 DNA序列
RNA结构
蛋白质模体
NCBI
在RNA水平上使用DNA微阵列检测变异
一个芯片上包含酵母基因组全序列
红色点： RNA 表达水平增加的基因 绿色点： RNA表达水平降低的基因
De Risi et al, Science 278:680 /pbrown/
蛋白质结构
DNA序列 RNA结构
蛋白质模体
NCBI
药物设计
与抑制因子结合的HIV-1蛋白酶复合体
PDB entry 1DIF A.M.Silva, R.E.Cachau, H.L.Sham, J.W.Erickson
NCBI
底物
组织和细胞
分子生物学数据类型 物种
RNA表达 蛋白质表达
DNA模体 RNA序列
分子生物学数据类型 物种
基因组图谱
PDB entry 1CIS P.Osmark, P.Sorensen, F.M.Poulsen
RNA序列
DNA序列 RNA结构
蛋白质序列 蛋白质结构
NCBI
分子生物学数据类型
核酸结构模体： 转录因子结合位点(CBF1:CCGNC ) (TACCGACAT ) RNA 催化模体
NCBI
通用蛋白质数据库
SWISS-PROT
基因组图谱
RNA序列 蛋白质序列
DNA序列
...TRLRPLLALLALWPPPPARAFVNQHLCGSHLVEA...
NCBI
分子生物学数据类型 物种
基因组图谱
RNA序列
DNA序列 RNA结构
蛋白质序列
NCBI
E. coli small subunit rRNA
Gutell R.R. (1994) Collection of small subunit (16S- and 16Slike) ribosomal RNA structures Nucleic Acids Res 22:3502
NCBI
种群
突变/多形性
分子生物学数据类型 物种
组织和细胞 底物
RNA表达 蛋白质表达DNA模体 RNA序列 Nhomakorabea蛋白质序列
代谢途径
抑制因子和药物
蛋白质结构
基因组图谱 DNA序列
RNA结构
蛋白质模体
NCBI
种群
突变/多形性
组织和细胞 底物
RNA表达 蛋白质表达
物种 DNA模体
RNA序列 蛋白质序列
代谢途径
Entries
碱基
物种
2217460 1556595261
553872 260818221
77205 177824883
123758 133950582
72565 117022315
87138 47136422
80507 42049391
14403 30390617
61001 26060656
5240
蛋白质序列
基因组图谱 DNA序列
RNA结构
NCBI
代谢途径
抑制因子和药物
蛋白h质tt结p:/构/
蛋白质模体
种群 组织和细胞 底物
代谢途径
分子生物学数据类型 物种
RNA表达 蛋白质表达
抑制因子和药物
DNA模体 RNA序列
蛋白质序列 蛋白质结构
基因组图谱 DNA序列
RNA结构
蛋白质模体
物种 DNA模体
蛋白质模体： 结构模体 保守区(D/N-R-X-G-R-R/K;
I-X2-R-X3-G-X3-G ) NAD+结合区含有一个保守的模体
[G]-[X]-[G]-[X2]-[G] (GSGAWA)(D. salina) 活性位点等
RNA序列 蛋白质序列
蛋白质结构
基因组图谱 DNA序列
RNA结构
NCBI
分子生物学数据类型 物种
基因组图谱
NCBI
小鼠X染色体
来源于小鼠基因组计划 /
分子生物学数据类型 物种
RNA序列
基因组图谱 DNA序列
NCBI
...AATGGTACCGATGACCTGGAGCTTGGTTCGA...
分子生物学数据类型 物种
DNA模体 RNA序列 蛋白质序列
蛋白质结构
基因组图谱 DNA序列
RNA结构
蛋白质模体
KEGG database, http://kegg.genome.ad.jp/kegg/
NCBI
底物 代谢途径
分子生物学数据类型 物种
基因组图谱
RNA表达 蛋白质表达
抑制因子和药物
DNA模体 RNA序列 蛋白质序列
生物奥赛培训生物信 息学
生物信息学-数据库
生物学已经积累了相当丰富多样和复杂的数据。这些数据可以被分类，但相当难于综合以及用公式进行描述。 随着生物学知识大量增加，要完成对数据的处理只能使用计算机。
NCBI
生物信息学-数据库
目标: ➢ 在分子生物学和基因组学中常见数据类型的概述 ➢ 介绍主要序列数据库，比较它们包含的数据内容和注释质量的区别 ➢ 数据库接受数据的形式(文本搜索，相似性搜索，浏览和交叉索引) ➢ 序列与非序列数据库介绍以及它们的用途 ➢ 一级序列与结构数据库介绍
Eukaryotae; mitochondrial eukaryotes; Fungi; Ascomycota;
Euascomycetes; Plectomycetes; Eurotiales; Trichocomaceae;
Emericella.
1 (bases 1 to 3042)
Saleeba,J.A., Cobbett,C.S. and Hynes,M.J.
Characterization of the amdA-regulated aciA gene of Aspergillus
nidulans
Mol. Gen. Genet. 235 (2-3), 349-358 (1992)
93101140
2 (bases 1 to 3042)
Saleeba,J.A.
• EST数据库，高通量基因组序列 • 用途：发现新基因
对特定对象的数据库
• RDP, G-蛋白偶联受体数据库等 • 用途：视数据库而定，通常用于获取特定领域的信息
NCBI
主要数据库:
• GenBank (美国) • EMBL (欧洲) • DDBJ (日本)
通用核酸数据库
NCBI
GenBank - 按物种分类
NCBI
GenBank记录起始 IV: 序列
ANACIAG A.nidulans aciA gene for AciA protein Seq: ANACIAG Length: 3042 Sun Jan 19 21:10:37 1997 Check: 422 ..
1 AAGCTTACTT GTGTCCATTT TCTGGATTCC AGACTCAAGA CCAGTGCTAA 51 AGAAAACCCC TAGATTACTA TTTCAACCAT ATTATTTTTT TCCTTGCCAG 101 AATTTAATCG CGAGCGTAGA AGCCAACTAT ACTACAAACA GGCTGTCCCA 151 ATGAAACTGT AGATTTCTAT CGAGTGCTTC TACTTTTACC AAAATTTATT 201 ATTACTTATC TCCTTTTGTC AATTCCACGC TCTGAGCTGG GGCTTTTTGC 251 TGACAGTCAA GTGAGGGGGA GGGGCGGGAG TTTACCCCTC ATGCGGGGAA 301 GACCGTGTGT TGTAGATCAT ACTGACAGCC AGCGACAAAG TATGTCGGCC 351 AGTTTGCAAG TCAACCTGAG GCAGCAGAGA CGATTGGAAG AGC…….
NCBI
FEATURES source
mRNA exon
mRNA exon
CDS
GenBank记录起始 III: 特征
Location/Qualifiers 1..3042 /organism="Emericella nidulans" /strain="Glasgow" /chromosome="Segment of chromosome 1" join(969..1263,1318..1493,1553..2624) /gene="aciA" 969..1263 /gene="aciA" /number=1 join(1205..1263,1318..1493,1553..2624) /gene="aciA" 1205..1263 /gene="aciA" /number=1 join(1249..1263,1318..1493,1553..2495) /gene="aciA" /codon_start=1 /product="AciA" /db_xref="PID:g5545" /db_xref="SWISS-PROT:Q03134"
Direct Submission
Submitted (24-JAN-1992) Jennifer A. Saleeba, Department of
Genetics, University of, Melbourne, Grattan Street, Parkville,