T细胞受体基因重排
t细胞淋巴瘤tcrγ基因重排特征的分析及检测方法优化
Ｔ细胞淋巴瘤ＴＣＲＴ基Ｎ重排特征分析及检测方法的优化摘要研究背景与目的淋巴瘤在组织和细胞形态学方面与高度反应增生性淋巴组织的鉴别诊断十分困难，容易造成误诊。
淋巴瘤病理诊断是临床病理工作的难题之一。
目前国内主要依靠以形态学为主、免疫组化为辅的诊断手段。
随着分子生物学的发展，从基因水平研究和分析诊断疾病的技术不断出现并且日趋成熟，为淋巴瘤诊断提供了有效工具。
淋巴瘤是由单克隆淋巴细胞增生所致，而反应增生性淋巴组织则来自于多克隆淋巴细胞，这是二者的重要区别。
编码免疫球蛋白（Ｉｇ）或Ｔ细胞受体（ＴＣＲ）的基因经过重排以后，不同克隆之间的重排基因互不相同，因此，基因重排对淋巴瘤的诊断具有特异性价值。
以ＰＣＲ技术为基础的方法以其简便、高效、廉价及适用面广而在淋巴瘤基因重排研究方面越来越受重视。
但不同研究文献中所采用的引物、ＰＣＲ条件、ＰＣＲ产物检测方法等都不尽相同，结果也有差异。
因此，难以找到适于常规临床病理诊断之用的标准程序。
Ｊｕｒｋａｔ细胞是Ｔ细胞淋巴瘤基因重排研究中常用的阳性对照细胞，但有关Ｊｕｒｋａｔ细胞基因重排的详细情况也未见报道。
假基因是Ｉｇ和ＴＣＲ胚系ＤＮＡ中常见的基因，有关假基因参与重排的情况以及在设计引物方面是否应将假基因包括在内也未见有关研究报道。
本实验以ＴＣＲ基因重排为研究对象，通过优化引物选择、ＰＣＲ条件及ＰＣＲ产物的检测方法等，分析Ｔ细胞淋巴瘤基因重排检测的最佳方法。
同时，分析ＴＣＲ基因重排的特点，为进一步研究ＴＣＲ基因重排提供理论和技术支持。
方法１以ＴＣＲｙ基因重排为研究对象，选用通用引物ＴＶＧ、ＶｖＩ及ＴＣＲ７家族特异性引物为工具。
用正交设计实验优化ⅥＩ引物的ＰＣＲ条件。
另选一对ＴＣＲ［ｊ通用引物作为ＴＣＲｙ引物的补充和比较。
２利用ＰＣＲ和测序研究Ｊｕｒｋａｔ细胞基因重排情况，分析ＴＣＲ基因重排的基本特点。
３ＰＣＲ产物检测方法①利用ＴＣＲ通用引物检测淋巴瘤克隆性基因重排阳性率，分别用琼脂糖电泳和ＳＳＣＰ分析ＰＣＲ产物；②将ＰＣＲ产物分别进行直接测序和克隆后测序，分析ＴＣＲ基因重排的特点及探索测序方法在基因重排检测中的应用；⑧分析ＰＣＲ产物中ＤＮＡ的克隆数与ＳＳＣＰ中条带数目的关系。
分子生物学考试名词解释与考点(精要)
一，名词解释1.（Northern blot）Northern印迹杂交。
这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。
Northern 印迹杂交的RNA吸印与Southern印迹杂交的DNA吸印方法类似，RNA印迹技术正好与DNA相对应，故被称为Northern印迹杂交。
（Southern blot）Southern印迹杂交是一种常用的DNA定量的分子生物学方法。
一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段，将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上，经干烤或者紫外线照射固定，再与相对应结构的标记探针进行杂交，用放射自显影或酶反应显色，从而检测特定DNA分子的含量。
2.（cis-acting element）顺式作用元件。
存在于基因旁侧序列中能影响基因表达的序列，它们的作用是参与基因表达的调控，本身不编码任何蛋白质, 仅仅提供一个作用位点, 要与反式作用因子相互作用而起作用。
(trans-acting factor)反式作用因子。
是指能直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上参与调控靶基因转录效率的蛋白质。
3. (VNTR )可变数目串联重复多态性。
可变数目串联重复序列是重复单位为9~24bp，重复次数变化大，呈高度多态性的DNA序列，又称小卫星DNA，拷贝数10~1000不等。
（STR）短串联重复序列。
又称微卫星DNA，是一类简单的寡核苷酸串联重复序列，其重复单位为2~6bp，重复次数10~60次左右，其长度通常小于150bp，分布在所有染色体中。
4.（viral oncogene）病毒癌基因。
病毒（大多是逆转录病毒）具有的一种可以使宿主细胞发生癌变的基因。
源自细胞中的正常基因。
(cell-oncogene)细胞癌基因。
存在于正常的细胞基因组中，与病毒癌基因有同源序列，具有促进正常细胞生长、增殖、分化和发育等生理功能。
在正常细胞内未激活的细胞癌基因叫原癌基因，当其受到某些条件激活时，结构和表达发生异常，能使细胞发生恶性转化。
基因重排名词解释
基因重排名词解释
基因重排（Gene Rearrangement）是指在某些生物体的基因组中，由于基因片段的移动、插入、删除或倒位等现象，导致基因在DNA分子上的排列顺序发生改变。
基因重排是基因组进化中的一个重要机制，可以增加基因组的多样性和复杂度，同时也可能对生物体的适应性和健康产生影响。
下面是一些与基因重排相关的名词解释：
1. 基因片段（Gene Segment）：指编码蛋白质的DNA序列中的一段区域，通常具有特定的功能和序列特征。
2. 重组酶（Recombinase）：一类催化基因重排的酶，能够切割DNA链并促使基因片段的互相重组。
3. V(D)J重排（V(D)J Rearrangement）：在脊椎动物免疫系统中，负责生成抗体和T细胞受体的基因由不同的V、D和J基因片段
组成，通过V(D)J重排来产生不同的抗原识别结构，以应对不同的病原体。
4. 染色体易位（Chromosome Translocation）：指两个染色体之间的基因重排，通常发生在染色体的两端或中间，可能影响基因的表达和功能。
5. 基因分化（Gene Divergence）：由于基因重排等机制，在不
同物种或个体之间，基因片段序列和组合会发生变化，导致基因的结构和功能差异增加，称为基因分化。
T细胞性淋巴瘤诊断中TCR基因重排检测的应用
T细胞性淋巴瘤诊断中TCR基因重排检测的应用潘鑫艳;杨长绍;黎贵芸;杨举伦;王丽【摘要】目的：探讨T细胞受体( T cell receptors, TCR)基因重排检测对T细胞性淋巴瘤诊断的价值。
方法收集T细胞性淋巴瘤30例和淋巴反应性增生组织30例,提取DNA,应用BIOMED-2引物系统中的56条引物进行PCR扩增,核酸分子异源双链凝胶电泳分析结果。
结果30例T细胞性淋巴瘤标本中TCRβ、TCRγ、TCRδ的检出率分别为83．3%(25/30)、93．3%(28/30)、13．3%(4/30),三者联合检测的检出率为96．7%(29/30),30例淋巴反应性增生组织中均未检测出TCR 基因重排。
结论利用BIOMED-2引物系统检测TCR 基因重排可作为T细胞性淋巴瘤的辅助诊断工具。
%Purpose To discuss the TCR gene rearrangements in the diagnosis of T-cell lymphomas. Methods Formalin-fixed and paraffin-embedded samples including 30 cases of T-cell lymphomas and 30 cases of reactive lymphoid hyperplasia were chosen for ex-tracting genomic DNA and PCR amplification using 56 BIOMED-2 primers. PCR products were analyzed by heteroduplex and polyacryl-amide gel electrophoresis. Results In all 30 cases of T-cell lymphomas, 25 cases (83. 3%) showed TCRβ gene monoclonal rear-ran gements, 28 cases (93. 3%) of TCRγ gene monoclonal rearrangements, 4 cases (13. 3%) of TCRδ gene monoclonal rearrange-ments. 29 cases (96. 7%) with TCRβ+TCRγ+TCRδ gene monoclonal rearrangements were detected. but no clonal TCR gene rear-rangements were found in 30 cases of reactive lymphoid hyperplasia. Conclusions The detection of TCR gene rearrangements using BIOMED-2 primers is a useful assistant method for the diagnosis of T-cell lymphomas.【期刊名称】《临床与实验病理学杂志》【年(卷),期】2015(000)004【总页数】4页(P400-403)【关键词】T细胞性淋巴瘤;基因重排;BIOMED-2;TCR基因【作者】潘鑫艳;杨长绍;黎贵芸;杨举伦;王丽【作者单位】成都军区昆明总医院病理科，昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科，昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科，昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科，昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科，昆明 650032【正文语种】中文【中图分类】R733.4非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma，NHL)包括B细胞性淋巴瘤(B-cell lymphoma)和T细胞性淋巴瘤(T-cell lymphoma)，因T细胞性淋巴瘤种类繁多，分类复杂，病理诊断较难。
淋巴瘤的分子生物学诊断知识点
淋巴瘤的分子生物学诊断知识点淋巴瘤是一种以淋巴细胞增生异常为特征的恶性肿瘤，包括多种亚型，具有不同的生物学特征和临床表现。
分子生物学诊断技术在淋巴瘤的分类、预后评估和治疗选择等方面起到了重要的作用。
本文将介绍淋巴瘤分子生物学诊断的一些重要知识点。
一、免疫组织化学检测（IHC）免疫组织化学检测通过检测肿瘤细胞表面或细胞内的特定分子标志物，帮助确定淋巴瘤的亚型和对应的治疗策略。
例如，CD20和CD79a是B细胞标志物，CD3是T细胞标志物，CD30是霍奇金淋巴瘤的标志物等。
免疫组织化学检测可以通过染色的强度和分布情况来判断特定标志物的阳性率，并结合其他临床和病理学特征进行综合分析。
二、基因重排检测淋巴瘤的发生和发展与基因重排异常密切相关。
通过检测重排的免疫球蛋白（Ig）和T细胞受体（TCR）基因，可以帮助确定淋巴瘤的亚型和起源。
例如，典型的霍奇金淋巴瘤患者常存在免疫球蛋白基因的重排。
PCR和Southern blot是常用的基因重排检测方法，可以通过扩增和分析特定基因区域的DNA序列来判断重排情况。
三、染色体异常检测淋巴瘤中常伴随着染色体异常，如染色体重排、整倍体性改变和部分染色体缺失等。
通过检测染色体异常，可以帮助确定淋巴瘤的亚型、预后风险和治疗选择。
常用的染色体异常检测方法包括常规染色体核型分析、荧光原位杂交（FISH）和比较基因组杂交（CGH）等。
FISH 可以通过探针标记的染色体特定区域来检测染色体重排和缺失。
而CGH则可以全基因组范围内分析基因拷贝数变异。
四、新一代测序技术随着新一代测序技术的发展，淋巴瘤分子生物学诊断也得到了进一步的提升。
新一代测序技术可以高效地获得淋巴瘤患者的全基因组、外显子组、转录组和甲基化组等信息。
这些信息可以帮助识别新的突变驱动基因和疾病相关的生物学过程，为个体化治疗提供重要依据。
总结：以上介绍了淋巴瘤分子生物学诊断的一些重要知识点，包括免疫组织化学检测、基因重排检测、染色体异常检测和新一代测序技术。
基因重排和突变对细胞凋亡的影响
基因重排和突变对细胞凋亡的影响细胞凋亡是生物体内维持正常生理功能的主要方式之一，在人体的许多生理和病理过程中都扮演着重要的角色。
基因重排和突变是细胞凋亡发生的两个主要原因，它们对细胞凋亡的影响如何，是近年来生物学研究中的热点问题之一。
基因重排是指基因组中发生重排，使某个基因的片段与另一个不同的基因的片段拼接在一起，形成新的基因，这种现象在人类淋巴细胞中特别常见。
研究表明，基因重排可以促进细胞凋亡的发生。
由于基因重排的不可逆性和多样性，一些与肿瘤抑制基因或调控凋亡相关的基因发生重排后，往往会失去正常的功能，有可能导致肿瘤的发生。
但是在某些情况下，基因重排也会促进细胞的正常发育，例如对免疫细胞发育中B细胞产生的抗体和T细胞产生的受体的产生起到了重要的促进作用。
突变是指基因组中某一位置的DNA序列发生改变，可能是碱基替换、插入或缺失。
突变可以影响蛋白质的编码，改变蛋白的结构和功能，从而引发细胞凋亡。
最近的研究表明，一些突变会导致从细胞周期的G1期到S期转变时通常发生的误差引起DNA损伤和细胞凋亡。
这可能解释了为什么许多癌症患者的细胞中会有这类突变。
研究表明，突变也可以直接通过影响凋亡相关基因的表达来影响细胞凋亡。
例如，压抑性基因p53是控制凋亡、DNA修复和细胞周期进程的重要基因，常常受到突变的影响。
p53精细的调控网络可以使细胞在面临外部或内部的应激情况下进入凋亡，从而防止肿瘤的发生。
总体上来说，基因重排和突变是细胞凋亡发生的两个主要原因，它们通过改变基因组的DNA序列和蛋白质的结构和功能，影响细胞凋亡的发生和效率。
但是，在我们理解不同种类的基因重排和突变导致的细胞凋亡的过程中，还有许多需要研究探索的空间。
皮肤T细胞淋巴瘤皮损和外周血T细胞受体γ基因重排的研究
溶液以 Ｔ Ｅ缓 冲液 １ ５ ： ０稀 释混 匀 后 ， 紫 外 分 在 光光 度计 （ 国 Ｓ ｅｔ ｎ ｉ Ｇ ｎ Ｓｓ 产 品 ， ） 美 ｐｃｒ ｎ ｅ ｅ ｙＴ ｏ ｃ Ｍ ２型
下测 定 Ｄ Ａ溶 液在 ２ ０ ｎ Ｎ ６ ｍ和 ２ ０ ｎ 的光 密度 ８ ｍ
组织 化学诊 断证实 的 Ｉ 期 ＭＦ患者 ｌ Ｉ ４例 ， 周抗 外 凝血标 本及皮 损标本各 １ 。可疑 ＭＦ患者 （ ４份 最 后发展 为 Ｍ ） １ 。非 ＭＦ患者 ： 疹 ８例 ； Ｆ ：７例 湿 神
健康人血作为对照。结果 ： Ｆ患者皮损 Ｔ Ｒ一 基因重排总 阳性率 为 ７ ． ％ ． Ｍ Ｃ ８６ 夕 周血 总阳性 率为 ３ ．％ ； ５ ７ ＭＦ 患者皮损和血液中有 ３例患者同时出现 Ｔ Ｒ一 基因重排 ， Ｃ ２例在皮损 中无基因重排 的情况下血 液单独 出现 Ｔ Ｒ一 Ｃ 基 因重排。可疑 ＭＦ皮损总阳性率为 ４ ． ％ ， １２ 血液总 阳性率为 １ ．％ 。神经性皮炎 、 ７６ 湿疹 、 巴瘤样丘 淋 疹病 、 红皮病患者皮损 和外周血及正常皮损和健康人血中无 Ｔ Ｒ— 基 因重 排。结论 ： Ｃ 皮损 Ｔ Ｒ一 Ｃ 基 因重排 可作为辅助诊 断的手段之一 ， 血液中的 Ｔ Ｒ一ｙ Ｃ －基因重排 与 ＭＦ疾病进展关系有待于进一步研究 。
（ ． ５ ｒ 一硼 酸 ，． ｌＭ Ｅ Ｔ 、 ｒ 饱 和 酚 ０ ４ Ｍ Ｔｉ ｓ ０ Ｏ Ｄ Ａ） Ｔ ｉ ｓ
的临床 、 组织病 理和免疫 表 型的额外诊 断标准 ， 且
可 以用 于 ＭＦ的鉴别 诊断 ¨ 。虽 然 Ｂ ｎ ｊＶ ｅ Ｊ ｕ ｎ 、 ｅ｝ 一
（ａ ａ ａ产 品 ） ＾ ＴＫ Ｒ 、ｙ—Ｔｑ Ｄ Ａ 聚 合 酶 （ 京 ａ Ｎ 北
医学免疫学 抗原识别受体的基因重排及受体多样性的产生
多样性机制之三：基因片段结合处的变化
基因重排和轻重链随机组合理论上仅能 产生1.9x106个不同抗原特异性的抗体， 远远低于实际抗体数。基因片段在结合处 的变化大大增加了多样性。
多样性机制之四： 体细胞高突变（Somatic Hypermutation, SHM)
对抗体可变区的序列分析
抗体的亲和力成熟 (affinity maturation)
IFNg诱导组成性表达的蛋白酶体成免疫蛋白酶体 （immunoproteosome）
b1￫b1i (LMP2) b5￫b5i (LMP7) b2￫b2i (MECL-1) PA28a PA28b
免疫蛋白酶体更能将蛋白降解成抗原肽
免疫蛋白酶体将蛋白降 解成正确的C末端肽，它 们再被一些酶降解成可 提呈的肽
Aaron Ciechanover
Avram Hershko Irwin Rose
细胞用泛素(ubiquitin)/蛋白酶体(proteasome) 系统降解蛋白质
泛素是76个氨基酸组成的多肽，负责给要降 解的蛋白加上标签。
泛素加标签的步骤：
1、泛素末端羧基通过硫酯 键与泛素活化酶（E1)结合。
1. 单链DNA上的胞苷在 AID的作用下转变为尿苷， dC:dG形成 dU:dG错配
2. uracil-N-glycosylase （UNG)除去dU
3. APE1（脱嘌呤/脱嘧啶 核酸内切酶1）使DNA的一 条链形成缺口
4. Mismatch repair (MMR) 蛋白识别G-U错配碱基或 G-缺失碱基
三、TCR的基因结构和多样性的产生
BCR和TCR都是识别抗原，那么TCR的 基因结构和多样性的产生究竟是否和 BCR相似呢？
（1）TCR和BCR的相似之处
TCR重排
TCR重排一、临床意义：近年来小儿急性淋巴细胞白血病的发生日趋增多, 并且在成年人的发病率也呈增长的趋势, 虽然部分患者经过化疗或干细胞移植, 能够达到临床或血液学的完全缓解( Complete Remission, CR) , 但白血病微小残留病(Minimal Residual Disease, MRD) 导致白血病复发的问题一直困扰着医务人员。
目前检测MRD 的手段很多, 如流式细胞仪检测白血病细胞、RT-PCR 检测白血病基因等方法, 其中白血病基因检测具有灵敏度高的特点具有很高的参考价值。
然而淋巴细胞白血病因为不具有高特异性的白血病基因, 所以在MRD 的监测上比较困难。
1、TCR基因重排技术是检测淋巴细胞克隆性增生的金标准，应用于恶性淋巴瘤的早期诊断和鉴别诊断有重大意义，特别是对于经常规HE、免疫组化检测仍不能确诊的病例有较好的用途和前景。
非霍奇金淋巴瘤是发生于单一亲本细胞的单克隆恶性增殖，瘤细胞的基因重排高度一致。
而正常淋巴组织和良性淋巴组织增生性疾病呈多克隆性，因此可作为非霍奇金淋巴瘤的基因标志。
TCRγ或TCRβ基因重排常作为T 细胞淋巴瘤的基因标志，阳性率可达70%～80%。
为非霍奇金淋巴瘤的诊断、分型及评估预后提供参考依据。
由此可见TCR 基因重排是淋巴细胞恶性增生的特异性标志。
2、我们通过对T 细胞受体(Tcell receptor , TCR) 检测以及它们在监测MRD 中的临床意义的研究, 观察到这种TCR基因重排的检测持续阳性的患者, 更容易导致白血病的早期复发。
因而在ALL 病程中对TCR基因重排进行动态监测, 极大的提高MRD 检出的特异性和敏感性,对ALL患儿的预后、复发的判断及制定相应的个体化治疗方案有重要的指导意义,可以使患儿最大程度的长期无病生存,减少化疗所致的远期不良反应。
二、检测方法：1、S outhern杂交技术（印迹杂交）优点是稳定、可靠, 被称为基因重排的金标准,缺点是成本较高, 需要较多新鲜组织、操作复杂和费时, 且国内收费标准较低, 无法广泛应用于淋巴瘤的鉴别诊断。
抗原识别受体的基因重排以及受体多样性的产生
Tonegawa的设想：
BCR胚系基因
X
经过重排的基因 X
XX X
X 限制性内切酶酶切位点
9
重排现象的实验证明
10
对小鼠胚系DNA和骨髓瘤细胞V和C基因的DNA 做序列分析，发现在重排后的V区和C区基因不 是直接拼接在一起的，由此发现了J (joining) 基因片段和D（diversity）基因片段。
七核苷酸－12/23核苷酸的随机序列－九核苷酸
17
转录方向相同的VJ是主 要形式，环出的片段形 成signal joint，保留在 染色体上的片段形成 coding joint.
18
V区基因的重组由几种V(D)J重 组酶协调完成，负责剪切和连 接工作。
RAG1/RAG2：重组活化基因 Ku70/Ku80：DNA修复因子 DNA-PK：DNA依赖蛋白激酶K Artemis：核酸酶 TdT：末端脱氧核糖核酸转移酶 DNA ligase IV：DNA连接酶IV XRCC4：DNA修复蛋白
抗原识别受体的基因重排 以及受体多样性的产生
1
淋巴细胞抗原识别特点： T、B细胞都用其抗原识别受体识别抗原
B细胞：B cell receptor (BCR) T细胞：T cell receptor (TCR)
2
究竟什么样的病原微生物能够突破机体 的天然免疫屏障并不能预料。为了能够防御 所有可能的病原微生物的感染，特异性免疫 应答系统必须形成一个巨大的抗原受体库， 以便能够识别所有可能的外来抗原物质。
22
SHM在抗体的可变区发生
小鼠和人类的SHM的频率是10-5至10-3，比其他 基因的自发突变高1百万倍。 为什么能够发生高频突变？
需要AID (Activation-induced cytidine deaminase， 活化诱导激活的胞嘧啶核苷脱氨酶)
检测T细胞受体重排切除环的意义及应用研究
检测T细胞受体重排切除环的意义及应用研究
刘竞丽;李劲频
【期刊名称】《国外医学：免疫学分册》
【年(卷),期】2002(025)004
【摘要】T细胞受体重排切除环是T细胞受体基因重排过程中切除的DNA环，可作为新近从胸腺迁出者的标记，应用于胸腺功能的评价。
近年来由于免疫重建研究的缘故，检测T细胞受体切除环受到了重视。
本文拟从T细胞受体切除环产生及应用的意义、方法上作一综述。
【总页数】3页(P218-220)
【作者】刘竞丽;李劲频
【作者单位】重庆医科大学神经病学研究所，重庆400016;广西医科大学一附院神经内科，南宁530021
【正文语种】中文
【中图分类】R392.11
【相关文献】
1.T细胞受体基因VγI-Jγ重排检测在血液病中的临床意义 [J], 潘胜美;陈国安
2.T细胞受体重排删除环定量检测及其在慢性乙型肝炎中的应用 [J], 史慧慧;张小楠;张占卿
3.毛细管电泳基因扫描和凝胶电泳异源双链分析在免疫球蛋白/T细胞受体基因重排检测中的应用研究 [J], 陈杰;郑可;张文燕;孙林雍;唐源;严嘉琦;赵莎;刘卫平
4.TaqMan-MGB探针实时荧光PCR法检测T细胞受体重排删除环评估慢性乙型
肝炎患者胸腺近期输出功能 [J], 潘克女;张永乐;张钧;左中宝;俞哲;刘寿荣
5.T细胞受体删除环定量检测的意义及应用现状 [J], 韩素芳
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TCR测序，怎么哪哪都有你？
TCR测序，怎么哪哪都有你？T细胞受体，即T细胞抗原受体(T cell receptor，TCR): 是T细胞特异性识别和结合抗原肽-MHC分⼦的分⼦结构，通常与CD3分⼦呈复合物形式存在于T细胞表⾯。
⼤多数T细胞的TCR由α和β肽链组成，少数T细胞的TCR由γ和δ肽链组成。
β链的CDR3区的多样性使得T细胞能识别各种各样的抗原。
CDR3多样性主要是T细胞在重组酶RAG1和RAG2催化作⽤下，通过体细胞V(D)J基因重排产⽣。
TCRα链通过VJ重组产⽣，⽽β链通过VDJ重组产⽣。
V、D、J基因⽚段本⾝具有多样性，此外在重排的过程中，在V-D及D-J的连接区经常有⾮模板的核苷酸随机插⼊或删除，进⼀步增加了CDR3区的多样性，以识别不同的抗原。
TCR的复杂度和多样性不仅影响肿瘤细胞的识别、与免疫治疗相关，异常的TCR多样性还影响⾃⾝免疫疾病、免疫缺陷疾病、过敏反应、器官移植排斥等多种疾病的发⽣、发展。
今天我们就来说⼀说TCR测序的应⽤。
对治疗的反应监控、评估· 监控联合使⽤免疫检查点抑制剂（PD-1和CTLA-4）对治疗爆发性⼼肌炎、⿊⾊素瘤（Fulminant Myocarditis）效果。
Fulminant Myocarditis with Combination Immune Checkpoint Blockade.November, 2016TCR beta sequencing to determine clonal T-cell populations in melanoma patients undergoing immunotherapy. ICI 2016 | August, 2016· 监测免疫检查点抑制剂CTLA-4治疗前列腺病（ prostate cancer）、早期乳腺癌（breast cancer）的效果。
Clonal expansion of CD8 T cells in the systemic circulation precedes development of ipilimumab-induced toxicities. PNAS | October, 2016 Deep Sequencing of T-Cell Receptor DNA as a biomarker of clonally expanded TILs in breast cancer after immunotherapy. Cancer ImmunologyResearch | September, 2016· 评估PD-1抑制剂对免疫系统副作⽤反应。
基因重排技术在皮肤淋巴增生性疾病中的应用
【 ｅ ｏｄ 】 Ｌ ｍ ｈ ｍ ；Ｒ ｃｐｏ； ｅｅ ｅｒ ｎｅ ｅｔ Ｋ ｙｗ ｒｓ ｙ ｐ ｏ ａ ｅｅｔ Ｇ ｎ ；Ｒ ａｒ ｇｍ ｎ ｒ ａ
ｌ 基 因重 排原理
中的多 基 因 片段 。单 一 基 因 片 段 经 过 选 择 性 编 码 ， 并 由 Ｄ Ａ重排 组 成 功能 性 基 因 。在 Ｂ淋 巴 细 胞 分 Ｎ 化期间， 重链 基 因首选 组 合 ， 若在 一 染 色体 上 重 排 成 功 ， 另一染 色体 上基 因片 段 的重 排 即被 抑 制 ． 则 同时 激 发轻链 ｖ区基 因重排 ； 若重 链 基 因重排 失 败 ， 试 则 图在第 ２个 染 色 体 上 进行 成 功 的重 排 （ 等 位 基 因 即 排除 现象 ）２ Ｌ ］
型 特 征 和 受 体 基 因重排 方 式 。 受 体基 因重排 克 隆性 分析 技 术 为 解 决这 些 问题 提 供 了一 条 途 径 ， 为 辅 助诊 断 的 重要 手段 成
【 关键词 】 淋 巴瘤； 受体 ； 因； 基 重排
中 图 分 类 号 ： ３３ ２ １Ｒ ５ ４ Ｒ ６ ． ： ５７ ． 文献标识码 ： Ａ ｄ ｉ１． ９９ ｊｉ ｎ １０ — ３０ ２ １ ．４ ０ ８ ｏ ： ３ ６／．ｓ ．０ ２ １ １．０ ２ ０ ．０ ０ ｓ
１２ Ｔ Ｒ基 因重排 ． Ｃ Ｔ Ｒ 基 因重 排 是 指 Ｔ细 胞 的 Ｃ
基 因重 排 过 程 是 一 个 正 常 的 过 程 ， 常 淋 巴细 正 胞 在 发育 中是 多克 隆性 质 ， 淋 巴造 血 系 统 肿 瘤 所 但 具有 的是 单 克 隆性 重 排 ， 就 是 全 部 肿 瘤 细 胞 具 有 也 个 相 同的免 疫 球 蛋 白或 Ｔ细 胞 受体 基 因重 排 ． 这
基因组重排在细胞增殖和疾病中的作用
基因组重排在细胞增殖和疾病中的作用基因组重排是指染色体内部的一些片段在不同染色体之间或同一染色体上发生了移动、插入或删除等事件，导致基因组的结构发生改变。
这种结构变化是细胞增殖和发育的重要因素之一，在疾病的发生和发展中也起着重要作用。
一、基因组重排在细胞增殖中的作用1.增加基因组多样性基因组重排可以在基因组中创造新的基因型，从而使新兴物种具有某种适应性和竞争的优势。
例如在哺乳动物的免疫系统中，基因组重排使得B细胞和T细胞能够产生成千上万种抗体和T细胞受体，以抵御不同的病原体，保障身体免疫系统的稳定和健康。
2.帮助细胞适应环境基因组重排可以导致基因的拆分、移动和复制，从而调节细胞中的信号转导途径和基因表达水平，使细胞能够适应环境的变化。
肿瘤细胞中的基因组重排事件就是这样一种现象，它可以在肿瘤细胞生长和扩散过程中发挥重要作用。
3.促进基因家族的扩张和演化基因组重排还可以促进某些基因家族的扩张和演化。
例如在智人的基因组中，ALU元件是重要的基因重排产物，它可以在基因组中扩张并产生新的功能序列，在人类智力和行为等方面扮演重要角色。
二、基因组重排在疾病中的作用1.发生突变或失活基因组重排可以导致染色体中部分区域的基因突变或失活，从而导致某些疾病的发生。
例如在新生儿中，缺少染色体的一部分或染色体上的某个基因被删除可能会导致儿童发生先天性缺陷的风险增加。
2.导致癌症发生基因组重排是肿瘤细胞中的常见现象，特别是恶性肿瘤。
它可以导致肿瘤抑制基因的缺失、癌症相关基因的激活等突变事件，而这些变化在一定程度上促进或加速肿瘤细胞的增殖和扩散。
3.影响药物代谢基因组重排可以影响药物代谢时酶的表达或功能，从而导致药物代谢产物积累或者药物作用失灵。
例如，在一些亚洲人种中，CYP2D6重复竞争和插入等基因重排事件会增加这一基因的拷贝数，大幅度地影响肝脏中药物代谢酶的功能和药物代谢产物的积累。
4.改变基因表达水平基因组重排还可以改变基因的表达模式和水平，从而有可能产生疾病。
皮肤外周t细胞淋巴瘤评价标准
皮肤外周T细胞淋巴瘤（PTCL）是一种罕见的恶性淋巴瘤，起源于皮肤外周T细胞。
这种病症在临床上表现为皮肤病变，并且可能在淋巴结和其他器官中出现转移。
对于这种疾病，评价标准的制定十分重要，能够帮助医生进行诊断和治疗，也可以为临床研究提供统一的参照标准。
下面我们将对皮肤外周T细胞淋巴瘤的评价标准进行详细的探讨。
一、临床表现1. 皮肤病变PTCL患者通常表现为皮肤上的肿块、红斑或溃疡等病变，这些皮肤症状往往是该病的早期表现，对于鉴别诊断非常重要。
2. 淋巴结肿大有些患者在淋巴结区域出现肿大，这可能表明疾病已经向淋巴系统内部发展。
3. 全身症状患者可能出现发热、乏力、体重减轻等全身症状，这些症状一般伴随着病情的进展而逐渐加剧。
二、影像学检查1. 化疗前后CT检查在评估治疗效果时，CT检查可以帮助医生确定病灶的大小和数量的变化，对于评估治疗效果至关重要。
2. PET-CT检查PET-CT检查能够更准确地评估病灶的新陈代谢活性，对于评估疾病的活动程度和治疗效果具有一定的指导意义。
三、病理学检查1. 病变组织病理学检查通过病理学检查，可以观察到肿瘤细胞的形态特点和组织学结构，帮助医生进行准确的诊断。
2. 免疫组化检查通过对肿瘤组织标记特定的免疫组化标记物，可以帮助确定肿瘤的类型和来源，为治疗方案的选择提供依据。
四、分子生物学检查1. T细胞受体基因重排对于皮肤外周T细胞淋巴瘤，T细胞受体基因的重排检测结果有助于确定肿瘤细胞的来源和克隆性，对于诊断和分析病情具有重要意义。
2. 并行测序技术利用高通量测序技术对患者的肿瘤组织进行基因组学分析，有助于发现特定的基因突变和异常，为个体化治疗方案的制定提供依据。
五、分期和风险评估1. Ann Arbor分期采用Ann Arbor分期对PTCL患者进行分期，根据淋巴瘤的累及部位和范围进行分期，有助于评估患者的病情严重程度。
2. PIT评分系统PIT评分系统是根据患者发病时的生理状况、芳龄和淋巴瘤分期等因素进行综合评估，有助于判断患者的不良预后因素和生存率。
基因重排和错配的DNA修复机制研究
基因重排和错配的DNA修复机制研究DNA在生命体中具有非常重要的作用，是遗传信息的载体。
但是，DNA的遗传信息有时会受到突变或损伤的影响，这会导致基因重排和错配，从而对生物的正常生理和生化过程造成不利影响。
DNA修复机制是一种复杂的过程，通过重组、修复和复制等机制来保护DNA的完整性和稳定性。
近年来，关于基因重排和错配的DNA修复机制的研究已经成为生命科学研究的一个热点。
一、基因重排的DNA修复机制基因重排是指在DNA分子内部或不同的DNA分子之间某些基因序列的改变。
基因重排产生的DNA序列改变可以影响基因的功能，甚至是产生新的基因。
基因重排通常涉及两种机制：1. VDJ 重排机制VDJ重排机制是在人和哺乳动物的免疫系统中广泛存在的一种基因重排机制。
该机制用于产生T细胞和B细胞的免疫受体。
这种免疫受体是由特定的遗传元件编码，并在发育过程中将它们排列成不同的序列。
VDJ重排机制由数种不同的酶来协同完成，如RAG1、RAG2和TdT。
在这些酶的协同作用下，DNA序列从基因组中选择、剪切并重新组合，以产生T细胞和B细胞的免疫受体。
2. 转座子重排机制转座子重排机制在许多生物中都广泛存在。
转座子是指具有转座编码酶的移动基因序列，它们可以从一个基因位点跳到另一个基因位点。
转座子重排机制的产生将使DNA的关键区域发生改变，从而对生物的功能产生影响。
这种基因重排机制涉及到许多因素，如酶、转座编码元件、DNA损伤等。
在这些基因重排的过程中，DNA在局部区域可以受到必须修复的损伤。
免疫系统的细胞具有高效和快速的DNA修复系统，可以在极短的时间内完成损伤的修复。
二、DNA错配的修复机制DNA错配是指DNA链中碱基配对发生错误的现象。
DNA错配可以通过几种机制进行修复，其中最常见的是Mismatch Repair（MMR）系统、Base Excision Repair（BER）系统和Nucleotide Excision Repair（NER）系统。
浆细胞和效应t细的遗传物质组成和功能
浆细胞和效应t细的遗传物质组成和功能
浆细胞和效应T细胞是人体免疫系统中非常重要的细胞类型，它们分别具有不同的遗传物质组成和功能。
浆细胞是一种特殊的B细胞，其主要功能是分泌抗体。
在免疫应答过程中，B细胞会被激活并分化为浆细胞，浆细胞会大量分泌抗体，以对抗入侵体内的病原体。
浆细胞的遗传物质组成与B细胞相似，都包括基因重排和突变等过程。
在基因重排过程中，B细胞会随机组合其基因库中的V、D、J基因片段，形成一个完整的免疫受体基因。
而在突变过程中，B细胞会在免疫应答过程中不断地突变其免疫受体基因，以增加其抗原识别的多样性。
这些基因重排和突变的过程都是由一系列酶和调节因子控制的。
效应T细胞是一种能够直接杀伤病原体和感染细胞的免疫细胞。
在免疫应答过程中，T细胞会被激活并分化为效应T细胞，这些细胞会释放细胞毒素和细胞因子，以对抗入侵体内的病原体。
效应T细胞的遗传物质组成与B细胞和浆细胞有所不同，其免疫受体是由T 细胞受体基因组成的。
T细胞受体基因包括α和β两个链，这些链的基因重排和突变过程也是由一系列酶和调节因子控制的。
总的来说，浆细胞和效应T细胞在免疫应答过程中发挥着不可替代的作用。
它们的遗传物质组成和功能都是由一系列复杂的生物学过程控制的，这些过程的研究对于深入理解免疫系统的功能和疾病的发生机制具有重要意义。