中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版-系统帮助A

图42
附录1：常用色谱工作站AIA（*.cdf）格式文件的导出
本软件系统的相似度运确实是按照峰的积分面积进行的。建议用户从色谱工作站导出AIA（*.cdf）数据文件之前，先对需要导出的数据进行积分处理，如此能够确保导出的AIA（*.cdf）数据文件包含积分数据信息。
Agilent色谱工作站
1.打开Agilent色谱工作站；
附录2：本软件涉及术语的注释，新增功能和常见咨询题及解答
简介
1．版本介绍：
本软件系统包括两个应用版本：研究版（2004 A）和检验版（2004 B）。研究版要紧用于科学研究工作，具有生成对比图谱功能。检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作，功能简化，不具有生成对比图谱的功能。
2．系统运行环境要求：
(1).最低配置：CPU主频533 MHz以上，内存64M，硬盘剩余最小空间100M，操作系统Windows 98以上，屏幕辨论率800×600。
为了使用户尽快找到色谱峰的峰位置，进行匹配点的设置，能够点击“谱图处理”中的“显示色谱峰”（详见“3谱图处理中（5）显示色谱峰”，图20），如此所有样本图谱的所有色谱峰全部显示出来。
样本图谱数量较多时，有些峰面积较大峰的设置较为不变；或者所有样本图谱匹配点设置完毕，但又觉得某些样本图谱匹配点的设置不够理想，这时能够采纳“单谱显示”模式（详见工具栏中“单谱显示”按钮），逐个图谱进行设置和修正。
差不多流程图如下（图29）：
图29
1样本图谱数据导入（AIA格式（*.cdf）,图30和31）
图31
图32
2设参照图谱（图33）
图34
3自动匹配
图35自动匹配结果
4多点校正
图36多点校正设定
图37多点校正后自动匹配结果(图谱)
图38匹配数据结果
5对比图谱生成
图39
6相似度运算结果
图40
7打印报告
图41
工具栏按钮如图所示(图26)。
其中大部分按钮的功能在前面差不多介绍过，不再赘述。那个地点将重点介绍“数据复原”，“匹配数据”，“图谱间距”和“单谱显示”功能。
（1）数据复原
“数据复原”功能是使当前处理结果复原到图谱数据刚刚导入的状态。
（2）匹配数据：
“匹配数据”按钮可使用户直截了当观看峰匹配的结果（图27）。
图2
图3
图4系统主界面
系统主界面中(图4)，文件信息区（即图谱列表）显示样本编号（如（S1））及文件的路径名称等信息，绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号（如（S12））。
1文件打开
（1）打开文件（全谱导入）（图5）：
图5
本系统支持三种格式文件的导入：AIA(即*.cdf)文件，文本文件（*.txt）和Scp(*.Scp)格式文件的导入（图5）。建议采纳通用的AIA（*.cdf）格式文件导入。注意AIA（*.cdf）文件中应包含样本图谱的峰面积信息，在色谱工作站导出AIA（*.cdf）文件前应现进行积分。否则导出的AIA（*.cdf）文件可能因不包含峰面积信息而无法导入。为了方便用户的使用，附录中给出了要紧色谱工作站的（AGILENT，WATERS，和SHIMADZU）AIA(*.cdf)数据格式的文件导出介绍。
图14参数设）：
系统支持“多点校正”功能。点击“谱图处理”“色谱峰匹配”中的“多点校正”（或直截了当点击状态栏中的“多点校正”按钮），系统进入“多点校正”模式，这时鼠标变成“＋”。用户按照需要直截了当在图谱上设置匹配点（匹配点数不限，设置后的匹配点为红色点表示，详见图36和37）进行多点校正。若设置结果不中意，能够再次点击设置的匹配点即可取消已设置的匹配点。
图21
图22相似度运算结果
（2）打印报告：
用户通过“打印报告”功能将分析结果打印出来（图21）。打印报告中包括报表信息输入（图23）和分析报告两部分（图24和25）。其中分析报告包括原始指纹图谱，匹配后图谱和相似度评判结果。
图23
图24
图25
5关心
为方便用户使用，本系统提供简洁完整的联机关心。
6工具栏按钮简介：
2.进入数据处理（View>>Data Analysis）；
3.调入要输出的色谱文件（File>>Load Signal…）；
4.进入数据输出窗口（File>>Export File>>AIA File…），进入方式如下图所示：
在弹出窗口中指定导出路径及文件名，确定。可导出AIA格式文件。
5.若选择输出文本格式文件（File>>Export File>>CSV File…），会弹出数据输出窗口。在数据输出窗口中，选中Signal选项，在File Name输入框中输入相应的文件名及文件储存路径。点击OK。
(2).举荐配置：PVI以上CPU，内存128M，硬盘空间20G，操作系统Windows 2000以上，屏幕辨论率1024×768
安装方法
点击setup.exe后，进入安装程序，如果无其他专门需要，能够直截了当点击下一步至安装终止。
图1
功能
本软件系统包括文件导入，数据库治理，谱图处理，分析检验和关心等功能。安装完本系统后，运行“中药色谱指纹图谱相似度评判系统”执行程序，进入登陆界面（图2），这时需要用户输入用户名和相应的密码（现暂无设置密码）。点击确定进入启动界面（图3），三秒钟后自动进入本系统运行主界面。若用户不想在启动界面等待三秒钟，能够直截了当点击启动界面（图3），如此能够快速进入系统主界面（图4）
图8
2数据库功能：
数据库治理包括药材信息建档（图9）、制剂信息建档（图10）和参照图谱建档功能（图11），便于用户信息治理。
图9
图10
图11
3谱图处理：
数据剪切
数据剪切功能可使用户选择一定时刻范畴内的色谱数据进行匹配。
点击“谱图处理”中的“数据剪切”功能，系统会提示用户是否需要复原原始数据，点击确定后进入“数据剪切”功能对话框，如图（12）：
放大和缩小
本系统提供了两种图谱放大和缩小功能。一种为“信号放大一倍和缩小一倍”（图13），另一种为信号的直截了当拖放放大。那个地点只介绍“信号放大一倍和缩小一倍”功能。
“信号放大一倍和缩小一倍功能”使得当前显示图谱的沿y轴方向成比例放大和缩小一倍，便于用户观看图谱信号的整体概貌和细节部分。连续点击“信号放大一倍”两次，立即原始图谱沿y轴方向放大四倍。
图6
（3）导出图象
将导入绘制的色谱图谱能够图象形式存放，文件格式为*.bmp（图7）。
图7
（4）图谱删除
本系统提供谱图删除功能（图8）。能够选中某一图谱删除（“删除当前图谱”功能），也可将导入的图谱全部删除（“清除所有图谱数据”）。在文件信息区选中某一样本图谱，然后在文件菜单栏中点击“删除当前图谱”，即可将选中的样本图谱删除。若点击“清除所有图谱数据”，所有样本图谱全部删除。
图13谱图处理包含的功能
（3）色谱峰匹配
色谱峰匹配包括指定参照峰，指定基准峰和自动匹配。下面逐一介绍：
指定参照图谱：用户能够任意选择一条色谱图谱作为指定参照图谱。点击“谱图处理”“色谱峰匹配”中的“指定参照图谱”，弹出如图14所示的对话框，选择参照图谱编号“确定“后即可将该编号对应的图谱指定为参照图谱。图谱颜色变为红色，以区不于其他图谱。
图28
（4）单峰显示
“单峰显示”可使选中的图谱单个显示，便于用户观看和分析单个样本图谱。
四卸载
能够采纳本系统提供的卸载程序进行卸载。也可在操纵面板中，采纳添加/删除程序卸载本程序。
五应用实例
为方便用户快速把握本系统，我们以一例子加以介绍。
例：对猎取的色谱指纹图谱建立对比图谱，进行相似度评判，并打印报告。
文本文件（*.txt）的导入需要采纳专门的格式，能够参考本系统导出的文本文件格式。Scp(*.Scp，即Standard Chromatographic Project的简写)是本系统为生成的对比图谱的导入提供的一种专门的文件格式。
（2）导出文件（储存图谱）
本系统支持将导入的图谱数据文件以文本文件（*.txt）导出储存（图6）。
在Signal Export窗口下，选中Times axis及Y axis两选项，点击OK后即可。
若对所有样本图谱设置的匹配点（Mark峰）不中意，期望重新设置，能够通过以下两种方法实现：
①直截了当点击右键，弹出对话框（图15）
图15
点击“确定”后即可取消所有样本图谱差不多设置的匹配点，然后再重新设置。
②点击工具栏中“数据复原”按钮(图16)，
图16
点击“是”后，样本图谱复原到匹配点设置往常的状态。
一样情形下，若导入的样本图谱视觉上排列整齐，较为相似，能够直截了当进行自动匹配。
（4）生成对比图谱、单独显示对比图谱及导出对比图谱
对比图谱的生成需要先进行谱峰匹配然后才能生成对比图谱。其生成方法包括均值法和中位数法。用户能够按照需要选择合适的方法生成对比图谱（能够在图14所示的对话框中选择方法。生成对比图谱的编号为R见图18中图谱），并可单独显示（点击“谱图处理”中的“单独显示对比图谱”，见图19），便于用户观看。生成的对比图谱以专门格式导出（对比图谱不能在“文件”菜单中以“导出文件”导出，必须以图13所示菜单中“导出对比图谱”）。关于注射剂建议采纳均值法产生对比指纹图谱；关于中药材，建议采纳中位数法产生对比指纹图谱。
图27匹配数据结果
在匹配结果中，共有峰（白色）和非共有峰（灰色）以不同颜色表示，便于用户观看。匹配结果也可储存为文本文件，或拷贝到剪贴板上，再粘贴到Excel表格中以方便用户使用（类似于“相似度运算”结果）。
（3）图谱间距
“图谱间距”能够调剂绘制图谱间的距离，便于用户观看和分析。点击工具栏上“图谱间距”按钮，弹出“设置谱图间距”对话框（图28），输入相应数值以调整谱图间距。