白血病
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白血病融合基因临床信息汇总查询
PML-RARα融合基因
绝大多数急性早幼粒细胞白血病(APL) 患者具有涉及17q21上维甲酸受体基因α(RARα)的染色体重排。其中最常见的为t(15;17)(q22;q21),该易位使得17号染色体上的RARα基因与15号染色体上的PML基因发生重排,形成PML-RARα融合基因,成为APL特异的分子标志。PML-RARα融合基因对APL诊断具有高度特异性,也是APL治疗的分子生物学基础。此外,少数APL病人也存在其它罕见的染色体易位,分别形成PLZF-RARα、NPM1-RARα、STAT5b-RARα、PRKAR1A-RA Rα、MLL- RARα、FIP1L1- RARα、NuMA-RARα和ZBTB16- RARα等融合基因。实时定量PCR检测PML-RARα融合基因可用于APL患者完全缓解(CR)后微小残留病变(MRD)的检测,对监测复发、判断预后和确定停药时机均有重要的意义。
BCR-ABL融合基因
95%的CML和部分Ph+-ALL患者有BCR-ABL融合基因的表达。BCR-ABL融合基因主要有三种类型,即b2a2/b3a2(P210)、e1a2(P190)和e19a2(P230)。CML中主要为b2a2/b3a2型, 而Ph+-ALL中e1a2型多于b2a2/b3a2型。通过定量检测BCR-ABL 融合基因的相对表达量可定量测定CML和Ph+-ALL患者的MRD水平,从而判断疗效、预测复发,并进行早期干预。研究表明,CML患者的骨髓和外周血均可用于MRD检测,但部分患者两种标本的检测结果并不一致。
AML1/ETO融合基因
t(8;21)(q22;q22)是AML中最常见的染色体易位之一(约占15%),多见于FAB分型中的M2,易位结果是位于8号染色体上的ETO基因与21号上的AML1基因融合, 形成了位于8号染色体上的AML1-ETO融合基因。≥75%的t(8;21)(q22;q22)患者伴有性染色体丢失及del(9q)等附加染色体异常,通常伴性染色体丢失不影响预后,而伴del(9q)提示预后不良。该类患者治疗缓解率高且中位生存期较长,预后良好。但近年来的研究结果显示大约30%伴有t(8;21)(q22;q22)的患者存在c-KIT基因的突变,这些患者的复发率增高,预后不佳。
CBFβ/MYH11融合基因
inv(16)(p13q22)及t(16;16)(p13;q22)阳性患者约占AML的5%,形态学主要为M4Eo 亚型。inv(16)(p13q22)/t(16;16) (p13q22)可形成CBFβ/MYH11融合基因。由于16号染色体较小以及带型的限制,inv(16)(p13q22)难以被常规核型分析所检出。RT-PCR
检出CBFβ-MYH11融合基因成为诊断的重要依据。近年来发现部分该类患者存在c-KIT 基因的突变,其复发率增高,预后不佳。
MLL基因重排
约8%的儿童AML和3%的成人AML患者可检出累及MLL基因的染色体异常,在婴儿AML 和继发性AML患者中发生率更高。该类异常最多见于AML中的M4和M5亚型。目前报道的涉及MLL的染色体易位有104种,已经明确的MLL伙伴基因有64种,常见的有包括编码核转录因子的AF-4(4q21)、AF-9(9p22)、AF-10(10p12)、ENL(19p13)以及编码胞浆蛋白的AF-1P(1p32)、AF-6(6q27)等。MLL的不同伙伴基因也可能提示不同的预后,通常认为占AML患者11q23异常40%的t(9;11)为中危组,而其余的11q23异常则归为高危组。
MLL基因的部分串联重复(MLL-PTD)
大约5%的AML患者可检出MLL基因的PTD,在正常核型或伴有三体11的AML中更为常见。突变导致5号外显子至11号或12号外显子之间的串联复制,但保留了MLL所有的功能性结构域,可能通过表观遗传学修饰使野生型MLL持续失活。有报道采用巢式PCR 自部分正常个体的外周血中可检出较低水平的MLL-PTD,其中的原因并非是MLL基因存在基因重组,更可能是异常剪切的结果。大约30-40%伴有MLL-PTD的AML患者可检出FLT3-ITD,而CEBPA和NPM1基因突变较为少见。多项研究显示伴有MLL-PTD的AML 患者缓解期短,通常预后不良,可作为独立的预后因素。
TLS/ERG融合基因
t(16;21)(p11;q22)是急性白血病中一种较常见的再现性染色体异常,该易位导致位于16p11的FUS基因和21q22的ERG基因相互易位,形成一个新的融合基因FUS-ERG。主要见于AML,偶见于CML急变、B-ALL和尤文氏肉瘤患者。TLS/ERG融合基因阳性的急性白血病患者通常预后不良。