ThermoScientificMaxima第一链cDNA合成试剂盒适用于RT-qPCR
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产品信息
Thermo Scientific
Maxima第一链cDNA合成试剂盒(适用于RT-qPCR)#K1641,#K1642
/onebio
分析证书
经验证,在两步法RT-qPCR中,对于不同起始量(5 ng-0.5 fg)的RNA逆转录产物,使用Thermo Scientific Maxima SYBR Green/ROX qPCR 预混液进行qPCR扩增。其反应效率在90-110%之间,曲线斜率在-3.09和-3.58之间,且相关系数>0.99。
质量授权人:Jurgita Zilinskiene
目录页码
试剂盒组分 (4)
贮存条件 (4)
产品描述 (4)
重要提示 (5)
RT-qPCR实验方案 (6)
对照反应 (6)
疑难解答 (7)
参考文献 (8)
试剂盒组分
贮存条件
所有试剂盒成分都应贮存于-20 °C。
产品描述
Thermo Scientific Maxima第一链cDNA合成试剂盒是合成cDNA第一链的方便系统,适用于两步法实时定量RT-PCR(RT-qPCR)中的cDNA合成。试剂盒采用先进的Maxima 反转录酶(RT),该酶源自M-MuL V 逆转录酶的体外进化。这种酶相比M-MuL V逆转录酶热稳定性高,扩增效果强劲且具有更高的cDNA合成效率。Maxima第一链cDNA合成试剂盒能够在较高温度下(55-65℃),在很宽的总RNA量范围内(从1 pg到5 μg)合成cDNA。合成反应能在15-30分钟内完成。
Maxima第一链cDNA合成试剂盒的各组分经预混合,以节约时间和减少移液错误。试剂盒由Maxima Enzyme Mix、5×反应混合液、无核酸酶的水三部分组成。
Maxima Enzyme Mix包含Maxima反转录酶和Thermo Scientific Ribolock RNase抑制剂。重组的Ribolock RNase抑制剂能有效保护RNA模板在高于55℃时不被RNase A、B和C降解。
5×反应混合液包含剩余的反应组分:反应缓冲液、dNTPs、Oligo(dT)18和随机引物。
无核酸酶的水用于反应体系的配制和RNA样本的溶解。已通过相关检验证明其中不含脱氧核糖核酸内切酶、脱氧核糖核酸外切酶、核糖核酸酶和磷酸酶。
重要提示
避免核糖核酸酶污染
RNA的纯度和完整性对于合成全长cDNA至为重要。RNA能够被RNase A降解,而在任何实验环境中都能发现这种稳定的污染物。本试剂盒中所有成分都经过严格检测,确保其不含RNase。为了避免污染,实验环境以及所准备的试剂溶液都必须不含RNase。
避免RNase污染的一般建议:
∙使用确保无核酸酶的实验器具,或者用DEPC水处理cDNA合成中所用到的反应管和枪头等。
∙整个实验过程中请戴手套,因为皮肤是RNA酶的一个常见来源。同时实验过程中注意经常更换手套。
∙使用无核酸酶的试剂,包括高纯度的水(如无核酸酶的水,#R0581)。
∙未使用试剂盒时请严格密封保存。在反转录过程中,所有反应管要确保扣严。
模板RNA
通过标准方法分离的总细胞RNA适用于该试剂盒。纯化的RNA需确保不含盐分、金属离子、乙醇和苯酚,以防其抑制cDNA合成反应。
对于RT-PCR,模板RNA需确保没有DNA污染。在cDNA合成之前,可先用无核酸酶的DNase I(#EN0521)去除痕量DNA。
实验中需要逆转录酶负对照反应。该反应含有除Maxima Enzyme Mix以外的所有其他RT反应组分。
RNA样本质量
在合成cDNA之前需对RNA的完整性进行评估。真核生物总RNA能够通过琼脂糖凝胶电泳后进行EB染色来分析检测。如果总RNA电泳后有18S和28S rRNA的锐利条带,可认为RNA是完整的。28S RNA条带的亮度大约为18S rRNA条带的两倍。rRNA条带出现任何拖尾现象都表示mRNA存在降解。如果这种情况发生,需重新制备总RNA样品。另外,也可用生物分析仪器(如Agilent 2100)分析总RNA,该仪器能对RNA样本的大致状况,RNA的完整数(RIN)(2)进行定量。内参基因/目的基因3’:5’完整性分析(3)也能用于检测RNA样本的完整性。
引物
Maxima第一链cDNA合成试剂盒包含Oligo(dT)18引物和随机引物,以引导第一链cDNA的合成。该引物混合物可确保检测低拷贝转录物时的高灵敏性。
RT-qPCR实验方案
开始前请阅读本手册的重要提示部分(第5页)。
第一链cDNA合成
第一链cDNA合成反应可以以单个反应进行,而对于不同的RNA模板,也可以进行一系列的平行反应。因此,反应混合液既可以通过将各组分溶液单独混合,也可以将RT反应中除了RNA模板外的所有组分制成预混液。
解冻后,轻轻涡旋并短暂离心试剂盒所有组分。冰上放置。
1.的反应管中。
2.
3.25℃孵育10分钟,之后再50℃孵育15分钟。
注:若RNA模板量大于1 μg,则延长反应时间至30分钟。若RNA模板富含GC或含有大量的二级结构,可将反应温度提高至65℃。
4.85℃加热5分钟以终止反应。
该反转录反应产物能够直接用于qPCR,或者在-20℃条件下存放一周。如需长时间贮存,推荐贮存于-70℃。另外应避免cDNA的反复冻融。
qPCR
第一链cDNA合成的产物能够直接用于qPCR。加入的合成的cDNA第一链产物体积不应超过PCR反应总体积的1/10。通常情况下,在25 μl体系的qPCR反应中加入2 μl合成的cDNA第一链作为模板。Maxima第一链cDNA合成试剂盒适于和Maxima qPCR master mixes (#K0221、#K0231、#K0241、#K0251、#K0261)搭配使用。
对照反应
实验中应利用如下负对照来确认第一链cDNA合成的结果。
Reverse transcriptase minus(RT-)负对照:RT-PCR和RT-qPCR中应利用此负对照来检验RNA样本中基因组DNA的污染情况。此负对照RT-反应含有除Maxima Enzyme Mix 以外的所有组分。
无模板负对照(NTC):此负对照用来检验试剂污染情况。NTC反应含有除模板以外的所有组分。