南京中医药大学生物化学复习资料教材
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第一章蛋白质的结构与功能
1.等电点:在某一PH溶液中,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,所带的正电荷和负电荷相同,其净电荷为零,此溶液的PH值即为该蛋白质的等电点。
2.蛋白质的一级结构:N-端到C-端氨基酸排列顺序。
由肽键维持
3.蛋白质的二级结构:蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,也就是肽链主链骨架原子的相对空间位置。
由氢键维持
3.蛋白质的三级结构:整条肽链中全部aa残基的相对空间位置,整条肽链所有原子在三维空间的排布。
由氢键、盐键、疏水键、范德华力等非共价键以及二硫键维持。
4.变性:在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构像被破坏,也即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质的改变和生物学活性的丧失,称为蛋白质变性。
5.中性溶液中带正电的氨基酸(碱性氨基酸):赖氨酸,精氨酸,组氨酸。
6.中性溶液中带负电的氨基酸(酸性氨基酸):天冬氨酸、谷氨酸。
第二章核酸的结构与功能
1.增色效应:DNA变性后,双链螺旋被破坏,分子内部的碱基暴露,DNA在260nm处紫外吸收增强。
2.Tm值:指使50%的DNA变性,也就是A260达到最大值的50%时的温度。
3.DNA的一级结构:核苷酸自5’端至3’端的碱基排列序列。
4.DNA的二级结构:双螺旋结构(DNA由两条多聚脱氧核苷酸单链组成,反向平行,直径2.73nm,螺距3.54nm;核糖与磷酸在外侧;DNA双链间形成互补碱基对)由疏水堆积力和氢键维持
5.DNA的三级结构:超螺旋结构(原核:环状;真核:核小体为基本单位)
6.tRNA含有多种稀有碱基,tRNA含有茎环结构,二级结构似三叶草(氨基酸臂、反密码环、二氢尿嘧啶环、T-Ψ环、额外环),三级结构是倒L形。
第三章酶
1.全酶:酶蛋白和辅助因子结合在一起成为全酶。
2.辅酶:凡是酶蛋白结合疏松,可以用透析或超滤除去的称辅酶。
3.辅基:与酶蛋白结合紧密,不易用透析或超滤除去的称辅基。
4.同工酶:指催化相同的化学反应,但酶蛋白的分子结构,理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。
5.Km值:等于酶促反应速率为最大反应速率一半时的底物浓度,是酶的特征性常数,在一定条件下可表示酶对底物的亲和力。
6.(不)可逆性抑制剂:不可逆性抑制剂与酶活性中心的必需基团共价结合,使酶失活。
可逆性抑制剂与酶非共价可逆性结合,使酶活性降低或消失。
7.酶原激活:酶原向酶的转变过程称为酶原的激活,实质是酶的活性中心形成或暴露。
8.竞争性抑制:抑制剂和酶的底物在结构上相似,可与底物竞争结合酶的活性中心,从而阻碍酶与底物形成中间产物,这种抑制作用称为竞争性抑制作用。
9.磺胺类药物抑菌机制:对酶的竞争性抑制作用。
10.酶的专一性分类:绝对专一性,相对专一性,立体异构专一性。
11诱导契合:酶与底物相接近时,结构上相互诱导、相互变形、适应,进而形成酶-底物复合物的过程。
作用:具有相对特异性的酶结合一组结构不全相同的底物,酶构象有利于结合,并让底物变为不稳定过渡态,易受酶催化转为产物。
第五章维生素
1.维生素:人体内不能合成,或合成量甚少,不能满足机体的需要,必须由食物供给,维持正常生命活动过程所必需的一组低分子量有机化合物。
2.维生素A前体:β胡萝卜素。
第六章糖代谢
1.六条代谢途径:糖的消化吸收与转运、糖的无氧氧化、糖的有氧氧化、磷酸戊糖途径、糖原的合成与分解、糖异生。
2.糖异生:由非糖化合物转变为葡萄糖或糖原的过程称糖异生。
3.糖异生的主要原料:丙酮酸、乳酸、甘油、生糖氨基酸。
4.糖酵解的关键酶:己糖激酶、磷酸果糖激酶、丙酮酸激酶。
5.磷酸戊糖途径关键酶:葡糖-6-磷酸脱氢酶
6.血糖的来源:
(1)食物消化吸收提供血糖
(2)肝糖原分解补充血糖
(3)非糖物质通过糖异生补充血糖。
7.血糖的去路:
(1)有氧氧化分解供能
(2)合成肝糖原和肌糖原储备
(3)转变为其它糖
(4)转变为脂肪或者氨基酸。
8.ATP计算:1mol葡萄糖彻底氧化生成CO2和H2O,可净生成30mol(FADH2氧化呼吸链)或32molATP(NADH氧化呼吸链)。
第七章脂质代谢
1.软脂酸完全氧化分解的四个阶段:
(1)脂肪酸活化
(2)肉毒碱转运脂酰CoA进入线粒体
(3)脂酰CoA的β氧化过程
(4)三羧酸循环和氧化磷酸化
共产生ATP:7*(3+2)+8*12-2=129
2.酮体:乙酰乙酸、β羟丁酸和丙酮,三种物质的总称。
合成原料来自脂类代谢。
3.酮体利用途径的关键酶:琥珀酰CoA转硫酶、乙酰乙酸硫激酶。
4.软脂酸合成碳源、氢源:
碳源:乙酰CoA(线粒体)糖代谢
氢源:NADPH磷酸戊糖通路
其他:CO2
5.血浆脂蛋白的分类:
(1)密度法:乳糜微粒、极低密度脂蛋白、低密度脂蛋白、高密度脂蛋白
(2)电泳法:乳糜微粒、前β-脂蛋白、β-脂蛋白、α-脂蛋白
6.9.柠檬酸丙酮酸循环:P151
第八章生物氧化
1.生物氧化:糖、脂类和蛋白质有机物在体内经过一系列的氧化分解,最终生成二氧化碳和水并释放出能量,这一过程称为生物氧化。
2.呼吸链:参与氧化还原的组分由含辅助因子的多种蛋白酶复合体组成,形成一个连续的传递链,因此称为氧化呼吸链。
Cytb → Cytc (III
Cyt aa3 → 1/2 O2 (IV)
FADH2:Cytb → Cytc (III)
Cyt aa3 → 1/2 O2 (IV)
6.氧化磷酸化偶联机制是产生跨线粒体内膜的质子浓度。
7.抑制剂在呼吸链中的阻断部位
FMN → CoQ, Cytb → Cytc1, Cytaa3Fe3+(2+) → 1/2O2
第九章氨基酸代谢
1.8种必需氨基酸(缬、异亮、亮、苏、甲硫、赖、色、苯丙)、12种非必需氨基酸
2.氨基酸代谢途径:书P202 图
3.脱氨方式:转氨基作用、氧化脱氨基作用(常用酶:L-谷氨酸脱氢酶)、联合脱氨基作用(主要途径)、非氧化脱氨基作用
4.联合脱氨基作用:转氨基作用和谷氨酸脱氢作用的结合
5.谷氨酸代谢途径
(1)合成蛋白质
(2)氧化脱氨基生成α-酮酸和氨。
前者进入柠檬酸循环代谢放能或异生成糖,后者在肝脏中进行尿素循环生成尿素排出体外
(3)与氨结合生成谷氨酰胺,运输氨
(4)联合脱氨基,合成嘌呤,或者其它氨基酸
第十章核苷酸代谢
1.嘌呤核苷酸的从头合成途径:利用磷酸核糖、氨基酸(天冬氨酸、甘氨酸、谷氨酰胺)、一碳单位及CO2等简单物质为原料,经过一系列酶促反应,合成嘌呤核苷酸的过程。
一般为合成的主要途径。
2.嘌呤核苷酸的补救合成途径:利用体内游离的嘌呤或嘌呤核苷,经过简单的反应过程,合成嘌呤核苷酸的过程。
3.嘌呤碱合成的氮源是天冬氨酸、甘氨酸、谷氨酰胺,碳源是甲酰基
4.嘌呤核苷酸分解代谢终产物是尿酸
5.嘧啶核苷酸分解代谢终产物有CO2、NH3和H2O
第十一章非营养物质代谢
1.生物转化:来自体内外的非营养物质在肝进行氧化还原、水解和结合反应,降低药性、毒性,增加水溶性的过程。
2.第一相:氧化、还原、水解,第二相:结合反应(常见的结合物:葡萄糖醛酸、硫酸)
3.血红素合成原料:琥珀酰CoA、甘氨酸和Fe2+
ALA合酶是血红素合成途径的关键酶
第十二章生物代谢的转换
1.糖、脂、蛋白质三大营养物质代谢途径各不相同,但都有共同的中间产物——乙酰辅酶A。
柠檬酸循环和氧化磷酸化是糖、脂、蛋白质最后分解的共同代谢途径,释放的能量均以ATP形式储存。
2.各物质代谢途径的联系:书P256 图
葡萄糖可转变为脂肪酸
葡萄糖与大部分氨基酸可以相互转变
氨基酸可转变为多种脂质但脂质几乎不转变为氨基酸
一些氨基酸、磷酸戊糖是合成核苷酸的原料
第十四章DNA的生物合成
1.参与DNA复制的酶
DnaA蛋白辨认复制起点
拓扑异构酶松弛双链超螺旋,克服解旋中的打结缠绕解链酶(DnaB蛋白)解开双链,活化引物酶
引物酶合成RNA引物
SSB 稳定解开的单链
DNA pol I 校正错配,切除引物
DNA pol II 催化磷酸二酯键的合成
DNA连接酶连接DNA片段。