蛋白质SDS-PAGE电泳注意事项.doc
SDS-PAGE蛋白电泳标准操作规程
SDS-PAGE蛋白电泳标准操作规程----(纯度检测)一.目的:检测蛋白质的纯度是否达到生产抗体的要求。
二.依据:《分子克隆手册》,Ab-mart公司内部标准。
三. 职责:质量控制部。
四.试剂与水:所有试剂为分析纯(AR);水为蒸馏水或超纯水。
五. 器皿与耗品:所有玻璃器皿使用前用玻璃清洁剂清洗, 80℃烤干。
tube、tip一次性使用。
六. 仪器设备:电泳仪(电源1--300V)电泳槽灌胶模具染色具凝胶扫描仪七. 环境要求:相对洁净环境,室温。
八. 溶液的配置:1.A液:1.5MTris·HCl pH8.8称取18.15gTris碱(分析纯)加适量的超纯水溶解,用浓盐酸(分析纯)调pH值至8.8,加超纯水定容至100 ml。
贴上标贴,4℃保存。
此溶液有效使用期限为三个月。
(溶液配置台帐见附件)2.B液: 1MTris·HCl pH6.8称取12.1gTris碱(分析纯)加适量的超纯水溶解,用浓盐酸(分析纯)调pH值至6.8,加超纯水定容至100 ml。
贴上标贴,4℃保存。
此溶液有效使用期限为三个月。
(溶液配置台帐见附件)3.C液: 30%丙烯酰胺称取29.2g丙烯酰胺(分析纯),0.8gN,N’-甲叉双丙烯酰胺(分析纯), 加适量的超纯水溶解,再定容至100 ml,用滤纸过滤,。
贴上标贴,避光4℃保存。
此溶液有效使用期限为三个月。
(溶液配置台帐见附件)4.D液:10%SDS称取10gSDS(分析纯),用超纯水溶解至100 ml.贴上标贴,室温储存。
此溶液有效使用期限为三个月。
(溶液配置台帐见附件)5.E液:10%过硫酸胺称取10g过硫酸胺(分析纯), 用超纯水溶解至100 ml。
贴上标贴,-20℃保存。
此溶液有效使用期限为三个月。
(溶液配置台帐见附件)6.F液:TEMED(amersco)7.电泳缓冲液(10X)称取60.57g Tris碱(分析纯),288.268g甘氨酸(分析纯),20gSDS(分析纯),加超纯水定容至2000ml,临用前加超纯水稀释10倍,贴上标贴,室温储存。
SDS—PAGE凝胶电泳(细致分析)
SDS-PAGE电泳的基础原理和实验步骤1.名称:SDS-PAGE(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis)十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳2.原理:此项技术的原理,是根据样品中蛋白质分子量大小的不同,使其在电泳胶中分离。
不同的蛋白质在不同的pH值下表现出不同的电荷,同时蛋白质具有不同的大小和形状。
为了使蛋白在电泳中的迁移率只与分子量有关,我们在上样前,通常会进行一些处理。
上样缓冲液由Tris-HCl (pH6.8)、甘油,10%SDS、β-巯基乙醇、0.1%溴酚蓝以及蒸馏水组成。
其各自的作用如下述:SDS 即十二烷基硫酸钠,是一种阴离子表面活性剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级和三级结构;β-巯基乙醇是强还原剂,它可以断开半胱氨酸残基之间的二硫键。
由于SDS和巯基乙醇的作用,蛋白质完全变性和解聚,解离成亚基或者单个肽链,因此测定结果只是亚基或者单个肽链的分子量。
同时,SDS与蛋白质结合引起蛋白质的构象改变,形成长椭圆棒状,不同蛋白质短轴长度都一样,长轴随蛋白分子量不同而不同,这样就消除了性状的影响。
另外,解聚后的氨基酸侧链和SDS结合成蛋白- SDS胶束,所带的负电荷大大超过了蛋白原有的电荷量,这样就消除了不同分子间的电荷差异和结构差异。
甘油用以增大样品液密度,使加样时样品溶液可以快速沉入样品凹槽底部。
样品处理液中通常还加入溴酚蓝染料,用于监控整个电泳过程。
SDS-PAGE一般采用的是不连续缓冲系统,与连续缓冲系统相比,能够有较高的分辨率。
浓缩胶的作用是有堆积作用,凝胶浓度较小,孔径较大,把较稀的样品加在浓缩胶上,经过大孔径凝胶的迁移作用而被浓缩至一个狭窄的区带。
样品液和浓缩胶中Tris-HCl均为pH6.8,上下槽缓冲液含Tris-甘氨酸(pH8.3),分离胶含Tris-HCl(Ph8.8).电泳启动时,蛋白样品处于pH6.8 的上层,pH8.8 的分离胶层在下层,上槽为负极,下槽为正极。
SDS-PAGE电泳标准操作规程(SOP)rosoftOfficeWord文档
SDS-PAGE电泳标准操作规程(SOP)rosoftOfficeWord文档SDS-PAGE电泳标准操作规程(SOP)一.仪器装置1.电泳仪2.夹心式垂直电泳槽3.玻璃板:长14.5×11.5×2mm、短14.0×11.5×2mm4.可调微量移液器5.微量进样器6.转移脱色摇床二.试剂配制1.丙烯酰胺液(30%T/2.7%C)用天平分别称取58.4g丙烯酰胺(Acr)和1.6g N,N’-亚甲双丙烯酰胺(Bis),溶于120ml温热(37℃左右,以利于溶解Bis)的去离子水中,然后转移至200ml容量瓶中,补加去离子水至刻度,摇匀,用滤纸过滤后,检查其pH值应不大于7.0,贮存在棕色瓶中,4℃保存。
每隔2个月重新配制。
小心:丙烯酰胺具有神经毒性,操作时应戴手套。
如不慎接触皮肤,应立即用水和肥皂清洗。
2.分离胶缓冲液(1.5M Tris-HCl,pH8.8)用天平称取36.3g三羟甲基氨基甲烷(Tris),溶于160ml去离子水中,用HCl调pH 值至8.8~8.9(先加5ml浓HCl,再逐滴加1M HCl调节),用去离子水定容至200ml,置棕色瓶中4℃保存。
3.浓缩胶缓冲液(0.5M Tris-HCl,pH6.8)用天平称取12.1g Tris,溶于160ml去离子水中,用HCl调pH 值至6.7~6.8(先加8ml浓HCl,再逐滴加1M HCl调节),用去离子水定容至200ml,置棕色瓶中4℃保存。
4.10% 十二烷基硫酸钠溶液用天平称取20.0g 电泳级十二烷基硫酸钠(SDS),加180ml去离子水,68℃水浴使溶解后,用去离子水定容至200ml,室温保存。
5.10% 过硫酸铵溶液用天平称取0.50g过硫酸铵(APS),溶于5ml去离子水中,分装Eppendof管冰冻保存。
6.四甲基乙二胺(TEMED)液7.分离胶覆盖液((0.375M Tris-HCl,pH8.8,0.1% SDS)取分离胶缓冲液25ml、10% SDS溶液1.0ml,混匀,加去离子水定容至100ml,室温保存。
在用SDS-凝胶电泳法测定蛋白质分子量时,应注意以下几个问题
1.如果蛋白质-SDS复合物不能达到1.4克SDS/1克蛋白质的比率并具有相同的构象,就不能得到准确的结果。
影响蛋白质和SDS结合的因素主要有以下3个:(1)二硫键是否完全被还原:只有在蛋白质分子内的二硫键被彻底还原的情况下,SDS才能定量地结合到蛋白质分子上去,并使之具有相同的构象。
一般以巯基乙醇作还原剂。
在有些情况下,还需进一步将形成的巯基烷基化,以免在电泳过程中重新氧化而形成蛋白质聚合体。
(2)溶液中SDS的浓度:溶液中的SDS的总量,至少要比蛋白质的量高3倍,一般需高达10倍以上。
(3)溶液的离子强度:溶液的离子强度应较低,最高不能超过0.26,因为SDS在水溶液中是以单体和分子团的混合体而存在的,SDS结合到蛋白质分子上的量,仅决定于平衡时SDS单体的浓度而不是总浓度,在低离子强度的溶液中,SDS单体具有较高的平衡浓度。
2.不同的凝胶浓度适用地不同的分子量范围,Weber的实验指出,在5%的凝胶中,分子量25,000—200,000的蛋白质,其分子量的对数与迁移率呈直线关系;在10%的凝胶中,10.000—70,000分子量的蛋白质呈直线关系;在15%的凝胶中,10,000—50,000分子量的蛋白质呈直线关系;3.33%(以上各种浓度的凝胶,其交联度都是2.6%)的凝胶可用于分子量更高的蛋白质。
可根据所测分子量范围选择最适凝胶浓度,并尽量选择分子量范围和性质与待测样品相近的蛋白质作标准蛋白质。
标准蛋白质的相对迁移率(蛋白质的电泳迁移距离除以染料迁移距离即为相对迁移率,详见后)最好在0.2—0.8之间均匀分布。
在凝胶电泳中,影响迁移率的因素较多,而在制胶和电泳过程中,很难每次都将各项条件控制得完全一致,因此,用SDS-凝胶电泳法测定分子量,每次测定样品必须同时做标准曲线,而不得利用另一次电泳的标准曲线。
3.有许多蛋白质,是由亚基(如血红蛋白)或两条以上肽链(如α-胰凝乳蛋白酶)组成的,它们在SDS和巯基乙醇的作用下,解离成亚基或单条肽链。
SDS-PAGE电泳注意事项.docx
SDS是阴离子去污剂,作为变性剂和助溶试剂,它能断裂分子内和分子间的氢键,使分子去折叠,破坏蛋白分子的二、三级结构。
强还原剂如巯基乙醇,二硫苏糖醇能使半胱氨酸残基间的二硫键断裂。
在样品和凝胶中加入还原剂和SDS 后,分子被解聚成多肽链,解聚后的氨基酸侧链和SDS 结合成蛋白 - SDS胶束,所带的负电荷大大超过了蛋白原有的电荷量,这样就消除了不同分子间的电荷差异和结构差异。
浓缩胶的作用是有堆积作用,凝胶浓度较小,孔径较大,把较稀的样品加在浓缩胶上,经过大孔径凝胶的迁移作用而被浓缩至一个狭窄的区带。
聚丙烯酰胺凝胶由单体丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺聚合而成,催化聚合的常用方法有两种:化学聚合法和光聚合法。
化学聚合以过硫酸铵( AP)为催化剂,以四甲基乙二胺(TEMED)为加速剂。
不连续体系由电极缓冲液、浓缩胶及分离胶所组成。
浓缩胶是由AP催化聚合而成的大孔胶,凝胶缓冲液为的 Tris-HCl。
分离胶是由 AP 催化聚合而成的小孔胶,凝胶缓冲液为Tris-HCl。
电极缓冲液是Tris-甘氨酸缓冲液。
2 种孔径的凝胶、 2 种缓冲体系、 3 种 pH 值使不连续体系形成了凝胶孔径、 pH 值、缓冲液离子成分的不连续性,这是样品浓缩的主要因素。
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳经常应用于提纯过程中纯度的检测,纯化的蛋白质通常在SDS电泳上应只有一条带,但如果蛋白质是由不同的亚基组成的,它在电泳中可能会形成分别对应于各个亚基的几条带。
注意问题1.样品处理上样缓冲液的作用:形成 SDS-蛋白复合物,使其带负电;SDS和巯基乙醇使蛋白质解离,综上两点为了在电泳中,只根据分子量来分离。
SDS作用:去蛋白质电荷、解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠,还有助溶剂的作用。
2.SDS-PAGE电泳凝胶中各主要成分的作用(1)浓缩与分离胶凝固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关。
3.提高 SDS-PAGE电泳分辨率的途径待凝胶在室温凝固后,可在室温下放置一段时间使用。
SDS-PAGE蛋白质电泳常见问题分析
SDS-PAGE蛋白质电泳常见问题分析日期:2012-05-25 来源:互联网作者:青岚点击:2218次摘要:SDS-PAGE电泳主要利用聚丙烯酰胺的分子筛效应分离蛋白质和核酸,SDS-PAG 蛋白质电泳分析可从蛋白质亚基分子量的大小就分离蛋白质。
找产品,上生物帮>> >>SDS-PAGE电泳主要利用聚丙烯酰胺的分子筛效应分离蛋白质和核酸,SDS-PAG 蛋白质电泳分析可从蛋白质亚基分子量的大小就分离蛋白质。
几乎所有蛋白质电泳分析都在聚丙烯酰胺凝胶上进行,而所有条件总要确保蛋白质解离成单个多肽亚基并进可能减少其相互间的聚集,最常用的就是SDS-PAGE电泳技术,关于大家在此过程中经常遇到的问题进行一些讨论:Q:SDS-PAGE电泳的基本原理?A:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS(十二烷基硫酸钠),SDS会与变性的多肽,并使蛋白带负电荷,由于多肽结合SDS的量几乎总是与多肽的分子量成正比而与其序列无关,因此SDS多肽复合物在丙稀酰胺凝胶电泳中的迁移率只与多肽的大小有关,在达到饱和的状态下,每克多肽可与1.4g去污剂结合。
当分子量在15KD到200KD之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为常数,若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。
Q:配胶缓冲液系统对电泳的影响?A:在SDS-PAGE不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris-HCL缓冲系统,浓缩胶是pH6.7,分离胶pH8.9;而电泳缓冲液使用的Tris-甘氨酸缓冲系统。
在浓缩胶中,其pH环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而CL离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。
SDS-PAGE电泳注意事项
SDS-PAGE电泳的操作规程一、样品处理取适量体积的样品溶液(样品含约为0.5-5ug),加入5×样品缓冲液,用振荡器混匀,于95℃水浴中煮5分钟,并于离心机中12000r/min离心5分钟待上样用,煮完后室温冷却。
非还原不用煮。
二、配制凝胶溶液和灌胶A、预先计算好所需浓度胶的体积及配胶所需要的各种试剂的体积,按这些数据依次加入试剂并混匀,然后灌入预先装好并且用双蒸水试漏过的板层中(先是分离胶),在胶的上面加一小层水饱和的异丁醇,置于平整的桌面让其自然凝固。
B、待分离胶凝固后(以胶与异丁醇界面有折射为准),到掉上层的异丁醇,用双蒸水冲洗三次并用吸水纸吸干。
然后灌入预定浓度的、按步骤A配制的浓缩胶,插入加样梳(注意赶走气泡),平置于水平桌面,自然凝固。
C、待凝固后,放置1小时使胶充分交联凝固。
三、电泳1、拔掉梳子,用双蒸水冲洗加样孔,去除杂质及未凝固的胶溶液,然后装好电泳装置,加入电泳缓冲液(如阴阳极缓冲液不同,需要分别加入相应的缓冲液,另外,阴阳极电泳缓冲液不要混在一起)2、用20ul的微量加样枪上样。
3、电泳开始时,恒压模式下用80V的电压电泳,待指示剂溴酚蓝进入分离胶时,把电压提高到130-150V左右,直到溴酚蓝快走出分离胶时,终止电泳,切断电源,拆下凝胶分别切下上、下角标记胶的方向及区别是哪一块胶。
4、清洗胶架、玻璃及其他附件。
四、染色、脱色及结果的分析与保存1、把剥下的胶浸入染色液中,放在脱色摇床上摇1小时。
2、取出凝胶块,用蒸馏水冲洗干净,然后置于脱色液中脱色,摇荡脱色直到底色基本脱完。
3、脱完色的胶用凝胶成像系统照相并进行数据分析处理。
一、试剂的使用与管理1、30%的丙烯酰胺贮存液(棕色瓶中保存)、pH8.8的缓冲液、PH6.8的缓冲液、10%的AP、TEMED用完后请放回4℃冰箱。
2、2×上样缓冲液,用完后请存放于-20℃冰箱的指定位置。
3、中分子量marker请按照说明书配制,配制后于95℃水浴中煮5分钟,冷却后离心,分装到eppendorf管中,每管10 U L。
SDS-PAGE全细胞蛋白电泳
2.2.5 SDS全细胞蛋白电泳提取蛋白质:用Ependorf管离心收集菌体(对数生长期),称其重量,并用样品缓冲液(sample buffer)裂解细胞,使其浓度达到150 mg⋅ml-1,放入-20℃冰箱中,临用前在95℃下加热10 min,并以4000 rpm/min离心2 min,待用。
电泳:用DYCZ-24D双垂直电泳槽,10%的分离胶,5%的浓缩胶。
先灌分离胶,等其凝固后再灌入浓缩胶,同时插好梳子。
电泳前将2.1.2.5中样品取出溶化后在95℃下加热10 min放在冰上冷却后即可点样,第一个孔点buffer,第二个孔点marker,其余每孔点样7 μl,电泳时恒流30 mA,视其指示剂溴酚兰到达胶的底端为止。
胶的染脱色及判读:电泳完把胶取下放在大小适合的盒子里,放入染色液在37℃摇床振荡30 min,然后用脱色液脱色,遵循少量多次原则(约5次),直到背景蓝色褪去。
把胶放在紫外成像仪上照相观察,把条带相同的归为一类。
所需试剂:样品缓冲液:4 ml 水;1 ml 0.625 M Tris-HCl,pH 6.8;0.8 ml 甘油;1.6 ml 10% SDS;0.4 ml β-巯基乙醇;0.2 ml 1%百里溴酚兰。
电泳缓冲液:3.03 g Tris base,14.41 g 甘氨酸,1 g SDS;加水到1000 ml;pH 8.4+0.1。
下胶缓冲液:18.17 g Tris Base,2 ml 20%SDS溶液,pH 8.8,加水到100 ml。
上胶缓冲液:6.06 g Tris Base(1.5 M), 2 ml 20%SDS溶液,pH 6.8,加水到100 ml。
10ml 10% 分离胶:2.5 ml 下胶缓冲液;3.4 ml H2O;4.1 ml Acry/biscrylamide (24.2%, 30:1) ; 30 μl 10%的过硫酸铵; 20 μl TEMED。
5 ml5% 浓缩胶:1.25 ml 上胶缓冲液; 2.25 ml 水; 1 ml Acry/biscrylamide(24.2%); 30 μl 10% 的过硫酸铵; 20 μl TEMED。
蛋白质的SDSPAGE电泳
无法分析疏水性蛋白质
02
SDS-PAGE电泳主要适用于分析带有强负电荷的蛋白质,对于疏
水性蛋白质,其分离效果可能不佳。
对样品要求高
03
为了获得准确的电泳结果,需要确保样品的纯度和浓度,这可
能需要耗费较多的时间和精力。
感谢您的观看
THANKS
01
02
03
丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺: 用于制备凝胶的交联剂。
过硫酸铵和TEMED (N,N,N',N'-四甲基乙二 胺):促进凝胶聚合。
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05
考马斯亮蓝染料:用于染色 蛋白质条带。
03 电泳技术
聚丙烯酰胺凝胶的制备
制备凝胶前的准备
配制凝胶溶液
清洗玻璃板、准备试剂和工具,确保实验 环境干净整洁。
脱色
染色完成后,将凝胶从染色液中取出 ,进行脱色处理,以去除背景颜色, 使蛋白质条带更清晰可见。常用的脱 色液有乙醇和醋酸。
结果观察与解读
观察
通过观察凝胶上的蛋白质条带,可以判断蛋白质的大小、数量和浓度等信息。
解读
根据蛋白质条带的颜色深浅、迁移率和电泳行为等特征,可以对蛋白质的性质 进行初步判断。
根据所需的浓度和孔径大小,准确称量丙 烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺,加入适量的水 和缓冲液,混合均匀。
灌制凝胶
聚合凝胶
将凝胶溶液倒入玻璃板间的凹槽中,确保 没有气泡和缝隙,然后插入梳子以固定凝 胶。
将灌制好的凝胶放入恒温箱中,保持一定 的温度和时间,使凝胶聚合。
样品处理与加样
01
02
03
样品准备
根据实验需求,将蛋白质 样品进行适当的稀释和变 性处理。
实验步骤
样品制备
将待测蛋白质样品与SDS和β-巯基乙 醇混合,使蛋白质完全变性并带上等 量的负电荷。
SDS-PAGE电泳测定蛋白质相对分子质量
SDS-PAGE电泳测定蛋白质相对分子质量实验目的了解SDS-PAGE垂直板型电泳法的基本原理及操作技术。
学习并掌握SDS-PAGE法测定蛋白质相对分子量的技术。
实验原理SDS-PAGE电泳法,即十二烷基硫酸钠—聚丙烯酰胺凝胶电泳法,。
1.在蛋白质混合样品中各蛋白质组分的迁移率主要取决于分子大小和形状以及所带电荷多少。
2.在聚丙烯酰胺凝胶系统中,加入一定量的十二烷基硫酸钠(SDS),SDS是一种阴离子表面活性剂,加入到电泳系统中能使蛋白质的氢键和疏水键打开,并结合到蛋白质分子上(在一定条件下,大多数蛋白质与SDS 的结合比为1.4gSDS/1g蛋白质),使各种蛋白质—SDS复合物都带上相同密度的负电荷,其数量远远超过了蛋白质分子原有的电荷量,从而掩盖了不同种类蛋白质间原有的电荷差别。
此时,蛋白质分子的电泳迁移率主要取决于它的分子量大小,而其它因素对电泳迁移率的影响几乎可以忽略不计。
3. 当蛋白质的分子量在15000~200000之间时,电泳迁移率与分子量的对数值呈直线关系,符合下列方程:1gMr =K―bm R式中:Mr为蛋白质的分子量;K为常数;b为斜率;mR为相对迁移率。
在条件一定时,b和K均为常数。
若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量的对数作图,可获得一条标准曲线。
未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。
仪器、原料和试剂仪器:垂直板型电泳槽;直流稳压电源;50或100μl微量注射器、玻璃板、水浴锅,染色槽;烧杯;吸量管;常头滴管等。
原料:低分子量标准蛋白质按照每种蛋白0.5~1mg·ml-1样品溶解液配制。
可配制成单一蛋白质标准液,也可配成混合蛋白质标准液。
试剂:(1)分离胶缓冲液(Tris-HCl缓冲液 PH8.9):取1mol/L盐酸48mL,Tris 36.3g,用无离子水溶解后定容至100mL。
(2)浓缩胶缓冲液(Tris-HCl缓冲液 PH6.7):取1mol/L盐酸48mL, Tris 5.98g,用无离子水溶解后定容至100mL。
SDS-PAGE
在用SDS-凝胶电泳法测定蛋白质分子量时,应注意以下几个问题:1.如果蛋白质-SDS复合物不能达到1.4克SDS/1克蛋白质的比率并具有相同的构象,就不能得到准确的结果。
影响蛋白质和SDS结合的因素主要有以下3个:(1)二硫键是否完全被还原:只有在蛋白质分子内的二硫键被彻底还原的情况下,SDS才能定量地结合到蛋白质分子上去,并使之具有相同的构象。
一般以巯基乙醇作还原剂。
在有些情况下,还需进一步将形成的巯基烷基化,以免在电泳过程中重新氧化而形成蛋白质聚合体。
(2)溶液中SDS 的浓度:溶液中的SDS的总量,至少要比蛋白质的量高3倍,一般需高达10倍以上。
(3)溶液的离子强度:溶液的离子强度应较低,最高不能超过0.26,因为SDS在水溶液中是以单体和分子团的混合体而存在的,SDS结合到蛋白质分子上的量,仅决定于平衡时SDS单体的浓度而不是总浓度,在低离子强度的溶液中,SDS单体具有较高的平衡浓度。
2.不同的凝胶浓度适用地不同的分子量范围,Weber的实验指出,在5%的凝胶中,分子量25,000—200,000的蛋白质,其分子量的对数与迁移率呈直线关系;在10%的凝胶中,10.000—70,000分子量的蛋白质呈直线关系;在15%的凝胶中,10,000—50,000分子量的蛋白质呈直线关系;3.33%(以上各种浓度的凝胶,其交联度都是2.6%)的凝胶可用于分子量更高的蛋白质。
可根据所测分子量范围选择最适凝胶浓度,并尽量选择分子量范围和性质与待测样品相近的蛋白质作标准蛋白质。
标准蛋白质的相对迁移率(蛋白质的电泳迁移距离除以染料迁移距离即为相对迁移率,详见后)最好在0.2—0.8之间均匀分布。
在凝胶电泳中,影响迁移率的因素较多,而在制胶和电泳过程中,很难每次都将各项条件控制得完全一致,因此,用SDS-凝胶电泳法测定分子量,每次测定样品必须同时做标准曲线,而不得利用另一次电泳的标准曲线。
3.有许多蛋白质,是由亚基(如血红蛋白)或两条以上肽链(如α-胰凝乳蛋白酶)组成的,它们在SDS和巯基乙醇的作用下,解离成亚基或单条肽链。
(完整版)SDS-PAGE蛋白电泳方法
SDS-PAGE一. 实验原理SDS 是一种阴离子表面活性剂,在蛋白质溶液里加入 SDS 和巯基乙醇后,巯基乙醇能使蛋白质分子中的二硫键还原, SDS 能使蛋白质的氢键、疏水键打开并结合到蛋白质分子上,形成蛋白质-SDS 复合物。
在一定条件下,SDS 与大多数蛋白质的结合比例为 1.4:1。
由于十二烷基磺酸根带负电,使各种蛋白质的SDS-复合物都带上相同密度的负电荷,它的量大大超过了蛋白质原有的电荷量,因而掩盖了不同种类蛋白质间原有的电荷差别。
SDS与蛋白质结合后,还引起了蛋白质构象的改变。
蛋白质-SDS复合物的流体力学和光学性质表明,它们在水溶液中的形状,近似于雪茄烟形的长椭圆棒,不同蛋白质的 SDS 复合物的短轴长度都一样,约为 1.8nm ,而长轴则随蛋白质的 Mr 成正比的变化。
基于上述原因,蛋白质-SDS 复合物在凝胶电泳中的迁移率,不再受蛋白质原有电荷和形状的影响,而只与椭圆棒的长度有关,也就是蛋白质 Mr 的函数。
二. 试剂器材30%凝胶贮液(100mL):称取试剂Acr 29.2g和Bis 0.8g置于100mL烧杯中,向烧杯中加入约60mL双蒸水,充分搅拌溶解后加双蒸水定容至100mL,置于棕色瓶内4℃贮存,每过1-2个月应重新配制;注意:丙稀酰胺具有很强的神经毒性,并可通过皮肤吸收,其作用有积累性,配制时应戴手套和口罩等。
分离胶缓冲液(1.5 mol/L Tris-HCl,pH 8.8,100mL):称取Tris 18.2g 溶于约80mL 双蒸水,用6mol/L的HCl 调整pH值至8.8,加双蒸水定容到100mL,4℃ 贮存;堆积胶缓冲液(0.5 M Tris-HCl,pH 6.8,100mL):称取Tris 6.0g溶于约80mL双蒸水,用1mol/L的HCl 调整pH值至6.8,加双蒸水定容到100mL,4℃ 贮存;电泳缓冲液(1L):称取试剂Tris 3.03g和甘氨酸 14.4g置于500mL烧杯中,向烧杯中加入约400mL双蒸水充分溶解,再加入10%SDS溶液1.0mL,以双蒸水定容至1L (自然pH值为8.3,无需再调),4℃ 贮存,可重复使用5-6次;2×加样缓冲液(10mL):取下列试剂置于10mL塑料离心管中0.5mol/L Tris-HCl缓冲液(pH6.8) 2.0mL10%SDS溶液 4.0mL甘油 2.0mL巯基乙醇 2.0mL溴酚蓝 0.02g,混匀后1mL分装,-70℃可贮存6个月;10%AP:称取(NH4)2S2O3 1.0 g,溶于10.0mL双蒸水中,分装成每份1mL,-20℃贮存;TEMED:分装成每份1mL,4℃避光贮存;水饱和正丁醇(100mL):在玻璃瓶中加入50mL双蒸水和50mL正丁醇,振摇。
实验十 聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分离蛋白质
实验十聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分离蛋白质【实验目的】1. 了解和掌握聚丙烯酰胺凝胶电泳的技术和原理;2. 掌握用此法分离蛋白质组分的操作方法。
【实验原理】在生物化学、分子生物学和基因(遗传)工程实验中,常常要进行蛋白质和核酸的分离工作。
聚丙烯酰胺凝胶电泳(Polyacrylamide Gel Electrophoresis, PAGE)是以聚丙烯酰胺凝胶作为支持介质进行蛋白质或核酸分离的一种电泳方法。
聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺单体(acrylamide,简称ACR)和交联剂N,N-甲叉双丙烯酰胺(N,N-methylene bisacrylsmide 简称BIS)在催化剂的作用下聚合交联而成的三维网状结构的凝胶。
通过改变单体浓度与交联剂的比例,可以得到不同孔径的凝胶,用于分离分子量大小不同的物质。
聚丙烯酰胺凝胶聚合的催化体系有两种:(1)化学聚合:催化剂采用过硫酸铵,加速剂为N,N,N,N-四甲基乙二胺(简称TEMED)。
通常控制这二种溶液的用量,使聚合在1小时内完成。
(2)光聚合:通常用核黄素为催化剂,通过控制光照时间、强度控制聚合时间,也可加入TEMED 加速反应。
聚丙烯酰胺凝电泳常分为二大类:第一类为连续的凝胶(仅有分离胶)电泳;第二类为不连续的凝胶(浓缩胶和分离胶)电泳。
一般地,不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳有三种效应:①电荷效应(电泳物所带电荷的差异性);②凝胶的分子筛效应(凝胶的网状结构及电泳物的大小形状不同所致)。
③浓缩效应(浓缩胶与分离胶中聚丙烯酰胺的浓度及pH的不同,即不连续性所致)。
因此,样品分离效果好,分辨率高。
SDS即十二烷基硫酸钠(Sodium Dodecyl Sulfate,简称SDS)是阴离子表面活性剂,它能以一定比例和蛋白质结合,形成一种SDS-蛋白质复合物。
这时,蛋白质即带有大量的负电荷,并远远超过了其原来的电荷,从而使天然蛋白质分子间的电荷差别降低仍至消除。
实验指导教案:使用SDSPAGE分离蛋白质
实验指导教案:使用SDSPAGE分离蛋白质实验指导教案:使用SDS-PAGE分离蛋白质一、实验背景和目的在细胞的组成中,蛋白质是一种非常重要的组成成分,不仅仅参与到细胞的结构,还参与到细胞的生命活动过程中。
蛋白质的功能和结构是非常复杂的,不同的蛋白质有着不同的结构,而且在不同的情况下,它们的功能也会不同。
因此,想要深入了解蛋白质,不仅要知道它们的结构和功能,而且还要知道如何将它们进行分离。
SDS-PAGE(聚丙烯酰胺凝胶电泳)是一种广泛应用于生物化学、细胞学和分子生物学等领域的分析技术。
它是一种分离蛋白质的电泳技术,适用于各种不同类型的蛋白质,研究者可以借助这种技术对蛋白质的分子量和纯度进行准确的测定。
因此,本次实验的目的是通过SDS-PAGE技术来分离目标蛋白质,进一步了解该蛋白质的纯度和分子量,为后续的研究提供基础。
二、实验原理SDS-PAGE技术是一种电方法,适用于分离已经经过处理的蛋白质,可以获得较高的分辨率。
该技术常用于分子生物学、生物化学、分析化学和临床诊断等各种领域。
该技术的操作过程如下:1. 选择需要分离的蛋白质样品,并进行处理。
通常需要将样品加入SDS和β-巯基乙醇等胶原化剂进行处理,使其在电泳时保持单价态,并对蛋白质的电荷进行修饰。
2. 制作凝胶。
可以采用手动制作凝胶或购买预制凝胶进行操作。
目前较为常用的是8-12%的聚丙烯酰胺凝胶,由于样品的大小和形状不同,可以根据需要调整凝胶的浓度和尺寸。
3. 加载样品并进行电泳。
将处理好的样品加入凝胶孔中,在外加电场作用下,样品会受到分子大小、形状和电性质的影响,从而在凝胶中形成带状分离。
4. 石蜡染色。
使用染料对蛋白质的带状分离进行染色。
常用的染色方法有共振染色法(Coomassie蓝染色)和银染色法。
5. 图像鉴定和分析。
使用专业的图像分析工具对分离后的蛋白质带进行定量和分析。
三、实验准备1. 熟悉SDS-PAGE技术原理和操作方法,具备基础的实验技能。
蛋白质SDS-PAGE电泳注意事项.doc
匀浆:1.匀浆缓冲液含有多种蛋白酶抑制剂,降低蛋白酶活性,以防蛋白降解。
2.SDS在匀浆以后再加入,以防起沫。
3.所有操作尽量在冰上进行。
4.94℃水浴(或沸水浴)处理的作用是为了是蛋白变性,以防降解(水浴锅事先要打开升温)。
5.PMSF是有毒试剂,处理时注意。
6.操作过程尽量带上手套,以防人手表面的蛋白和脂肪的污染。
7.热水浴后,离心是用的可以控温的离心机,使用前15分钟打开使温度降到4℃,即可。
8.离心后分装,可以用枪头先把表面的一层吸走,换取新的枪头在分装。
9.SDS,DDT,PMSF是用时临时加入缓冲业的,根据母液的浓度计算所需的量。
制胶:10.APS和TEMED是促凝的,根据温度加入的量是可以变动,一般不超过30%。
11.玻璃板一定要洗干净,否则制胶是会有气泡。
12.丙烯酰胺是有毒的,操作时注意安全。
(凝胶以后,聚丙烯酰胺毒性降低。
)13.1.5mm的玻璃板有黑色条带封低,1mm的玻璃板用白色条带封底。
(封紧以防漏胶)14.凝胶的时间要严格控制好,一般在20-30min。
15.样品处理时,沸水浴使蛋白充分变性以防在电泳时产热蛋白质降解。
一般要5-10分钟。
而且要注意把样品的管口封好,以防沸水浴时冲开(出错了)。
16.点样时,如果孔比较多,尽量点在中央。
(点在边上时,跑出的带是斜的)17.点样前要排尽胶底部的气泡,防止干扰电泳。
18.开始电泳时,电压调到80V,当跑过浓缩胶时电压调到100V。
19.电泳结束后,取胶时,小心把玻璃板翘起(防止再次落下)20.脱色时,尽量多次进行换水。
21.上样量不宜太高,蛋白含量每个孔控制在10μg-50μg,,一般<15μl.22.做胶时,凝胶时间控制在25min。
梳子不能歪来歪去。
23.上样时,Mark最好标在中间,边上的孔尽量不要上样。
24.制胶时,在加APS前尽量不要搅拌,加入APS后可以轻轻搅拌,不要产生气泡。
注意:温度,时间,光照,APS和TEMED都会对凝胶产生影响。
蛋白质SDS-PAGE电泳实验常见问题及改进措施
聚 丙 烯 酰 胺 凝 胶 电 泳 (ployacrylamidegelelectrophoresis, PAGE)是以聚丙烯酰胺凝胶作为支持介质的一种电泳技术,常 用作蛋白 质 分 离 鉴 定[1]。聚 丙 烯 酰 胺 凝 胶 由 丙 烯 酰 胺 单 体 (Arc)和交 联 剂 甲 叉 双 丙 烯 酰 胺 (Bis)在 催 化 剂 过 硫 酸 铵 (APS)和加速剂四甲基乙二胺 (TEMED)的作用下聚合而成。 十二烷基硫酸钠(Sodium dodecylsulfate,SDS)是一种阴离子蛋 白质变性剂,它能 破 坏 蛋 白 质 分 子 内 和 分 子 间 的 氢 键,并 且 覆 盖在其表面,各亚 基 在 从 电 场 负 极 向 正 极 端 泳 动 时,其 迁 移 率 主要取决于分子量的大小[2]。
Abstract:Asanextremelyimportantbiochemicalexperimentaltechnique,SDS-PAGEelectrophoresisisacommonmethodfor detectingproteinpurity,assessingproteinmolecularweightaswell.Inordertosolvetheproblemsofgelleakage,solidification judgment,longdecolorationtime,anduseofmethanolduringSDS-PAGEelectrophoresis,someimprovementssuchasusingwhite tiptosolvetheproblem ofleakage,establishingacontrolgeltojudgethesolidificationofthegel,aswellasreplacingthe CoomassieBrilliantBlueR250andmethanolwithG250andethanolwasproposed.Theimprovedmethodhasthecharacteristicsof shorttime-consuming,lessuseoftoxicreagents,andismoresuitableforclassteaching. Keywords:polyacrylamidegel;electrophoresis;proteinstaining;CoomassieBrilliantBlueG-250
SDS-PAGE电泳过程中常见问题以及解决方法要点
SDS-PAGE电泳过程中常见问题以及解决方法几乎所有蛋白质电泳分析都在聚丙烯酰胺凝胶上进行,而所有条件总要确保蛋白质解离成单个多肽亚基并进可能减少其相互间的聚集,最常用的就是SDS-PAGE电泳技术,关于大家在此过程中经常遇到的问题进行一些讨论:Q:SDS-PAGE电泳的基本原理?A:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS(十二烷基硫酸钠),SDS会与变性的多肽,并使蛋白带负电荷,由于多肽结合SDS的量几乎总是与多肽的分子量成正比而与其序列无关,因此SDS多肽复合物在丙稀酰胺凝胶电泳中的迁移率只与多肽的大小有关,在达到饱和的状态下,每克多肽可与1.4g去污剂结合。
当分子量在15KD到200KD之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW 为分子量,X为迁移率,k、b均为常数,若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。
Q:配胶缓冲液系统对电泳的影响?A:在SDS-PAGE不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris-HCL缓冲系统,浓缩胶是pH6.7,分离胶pH8.9;而电泳缓冲液使用的Tris-甘氨酸缓冲系统。
在浓缩胶中,其pH环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而CL离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。
由于导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压剃度,压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭窄的区带。
当样品进入分离胶后,由于胶中pH的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接紧随氯离子之后,同时由于分离胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋白分子根据其固有的带电性和分子大小进行分离。
所以,pH对整个反应体系的影响是至关重要的,实验中在排除其他因素之后仍不能很好解决问题的情况,应首要考虑该因素。
sds-page聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质含量实验注意事项
SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质含量的实验注意事项如下:
1. 实验器材的清洁:ACr和BIs是神经性毒剂且对皮肤有刺激作用,配制贮液、配胶、灌胶操作时,要戴上医用乳胶手套或指套,避免与皮肤接触。
只要细心操作,一般不会引起损伤。
2. 严谨操作:SDS-PAGE 测定分子量有误差,不可完全信任。
有必要时,应同时作标准曲线。
并且SDS—PAGE 测定分子量有10%误差,不可完全信任。
3. 注意个人安全:在实验过程中请注意个人安全,避免直接接触化学试剂。
以上就是用SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质含量的注意事项,如果您对实验步骤有疑问或者想了解更多信息,请咨询专业人士。
SDS-PAGE蛋白电泳手册
蛋白电泳手册SDS-PAGE及Western blot蛋白电泳蛋白质的电泳分离是重要的生物化学分离纯化技术之一,电泳是指带电粒子在电场作用下,向着与其电荷相反的电极移动的现象.根据所采用的支持物不同,有琼脂糖凝胶电泳,淀粉凝胶电泳,聚丙烯酰胺凝胶电泳等。
其中,聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)由于无电渗作用,样品用量少(1-100μg),分辨率高,凝胶机械强度大,重复性好以及可以通过调节单体浓度或单体与交联剂的比例而得到孔径不同的凝胶等优点而受到广泛的应用.PAGE原理聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺(简称Acr)和交联剂N,N’—亚甲基双丙烯酰胺(简称Bis)在催化剂作用下,聚合交联而成的具有网状立体结构的凝胶,并以此为支持物进行电泳。
聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)可根据不同蛋白质分子所带电荷的差异及分子大小的不同所产生的不同迁移率将蛋白质分离成若干条区带。
SDS—PAGE原理SDS是一种阴离子表面活性剂,能打断蛋白质的氢键和疏水键,并按一定的比例和蛋白质分子结合成复合物,使蛋白质带负电荷的量远远超过其本身原有的电荷,掩盖了各种蛋白分子间天然的电荷差异。
因此,各种蛋白质—SDS 复合物在电泳时的迁移率,不再受原有电荷和分子形状的影响,而只是棒长的函数。
这种电泳方法称为SDS—聚丙烯酰胺凝胶电泳(简称SDS—PAGE).实验使用过程中,还加入DTT或者***,以打开蛋白间的二硫键,破坏蛋白质的四级结构。
SDS—PAGE最常采用垂直板不连续系统(分离胶与浓缩胶)。
索引蛋白电泳(SDS—PAGE)……………………电泳试剂总表……………………………………………………制胶………………………………上样及电泳……………………染色蛋白提取蛋白定量Bradford蛋白浓度测定试剂盒使用说明BCA蛋白浓度测定试剂盒使用说明Lowry蛋白浓度测定试剂盒使用说明蛋白分子量标准(图)考马斯蛋白胶快速染色液Western blotWestern blotting DAB检测试剂盒Western blotting ECL化学发光检测试剂盒Western blotting 试剂盒使用说明蛋白电泳试剂(部分试剂可以相互替换)系号货号名称1T8060TRIS 三羟甲基氨基甲烷2G8200Glycine 甘氨酸3S8010SDS 十二烷基硫酸钠4A8080Acrylamide 丙烯酰胺5M8200N,N-Methylene Bisacrylamide甲叉双丙烯酰胺6A8090Ammonium Persulfate 过硫酸胺7D8220DTT 二硫苏糖醇8M8210β—Mercaptoethanol β—***9T8090TEMED 四甲基***10A101030%丙烯酰胺(29:1)11S10514XSDS-PAGE分离胶缓冲液(PH=8。
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匀浆:
1.匀浆缓冲液含有多种蛋白酶抑制剂,降低蛋白酶活性,以防蛋白降解。
2.SDS在匀浆以后再加入,以防起沫。
3.所有操作尽量在冰上进行。
4.94℃水浴(或沸水浴)处理的作用是为了是蛋白变性,以防降解(水浴锅事
先要打开升温)。
5.PMSF是有毒试剂,处理时注意。
6.操作过程尽量带上手套,以防人手表面的蛋白和脂肪的污染。
7.热水浴后,离心是用的可以控温的离心机,使用前15分钟打开使温度降到
4℃,即可。
8.离心后分装,可以用枪头先把表面的一层吸走,换取新的枪头在分装。
9.SDS,DDT,PMSF是用时临时加入缓冲业的,根据母液的浓度计算所需的量。
制胶:
10.APS和TEMED是促凝的,根据温度加入的量是可以变动,一般不超过30%。
11.玻璃板一定要洗干净,否则制胶是会有气泡。
12.丙烯酰胺是有毒的,操作时注意安全。
(凝胶以后,聚丙烯酰胺毒性降低。
)
13.1.5mm的玻璃板有黑色条带封低,1mm的玻璃板用白色条带封底。
(封紧以防
漏胶)
14.凝胶的时间要严格控制好,一般在20-30min。
15.样品处理时,沸水浴使蛋白充分变性以防在电泳时产热蛋白质降解。
一般要
5-10分钟。
而且要注意把样品的管口封好,以防沸水浴时冲开(出错了)。
16.点样时,如果孔比较多,尽量点在中央。
(点在边上时,跑出的带是斜的)
17.点样前要排尽胶底部的气泡,防止干扰电泳。
18.开始电泳时,电压调到80V,当跑过浓缩胶时电压调到100V。
19.电泳结束后,取胶时,小心把玻璃板翘起(防止再次落下)
20.脱色时,尽量多次进行换水。
21.上样量不宜太高,蛋白含量每个孔控制在10μg-50μg,,一般<15μl.
22.做胶时,凝胶时间控制在25min。
梳子不能歪来歪去。
23.上样时,Mark最好标在中间,边上的孔尽量不要上样。
24.制胶时,在加APS前尽量不要搅拌,加入APS后可以轻轻搅拌,不要产生气
泡。
注意:温度,时间,光照,APS和TEMED都会对凝胶产生影响。