第三章 人类基因组计划

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转录图谱
又称cDNA图谱,是用基因表达的各种 mRNA产物
在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘 制的结合有关基因序列、位臵及表达模式等信息的 图谱。在人类基因组中鉴别出占具2%~5%长度的全 部基因的位臵、结构与功能,最主要的方法是通过 基因的表达产物mRNA反追到染色体的位臵。 逆转录酶
HGP的目的是解码生命、了解生命的起源、了解生
命体生长发育的规律、认识种属之间和个体之间存 在差异的起因、认识疾病产生的机制以及长寿与衰 老等生命现象、为疾病的诊治提供科学依据。 列分析,遗传图、物理图、序列图是最优先考虑的 目标,必须保质保量完成的是DNA序列图。
HGP的主要任务是人类基因组的基因图的构建和序
在人类基因组计划中,还包括对五种生物基因组的
研究:大肠杆菌、酵母、线虫、果蝇和小鼠,称之 为人类的五种“模式生物”。
HGP的研究进展
1990年10月被誉为生命科学“阿波罗登月计划”的
国际人类基因组计划启动。 1990年8月,NIH对大肠杆菌、酵母、线虫进行大规 模测序。 1992年12月NIH和能源部发布数据和资源共享的规 定,鼓励数据迅速分享,并允许研究者可私自保留 数据6个月。 1993年4月,柯林斯出任“国家人类基因组研究中心” 主任。
人类基因组是全人类的共同财富和遗产。人类 基因组序列图不仅奠定了人类认识自我的基石,推 动了生命与医学科学的革命性进展,而且为全人类 的健康带来了福音,使我们向着更加幸福的未来迈 出了意义非凡的一步。 我们向参与“人类基因组计划”的所有工作人 员致以热烈的祝贺!他们的创新与奉献,在科学技 术发展史上书写了光辉的一页;他们的杰出成就, 将永远成为人类历史上的一个里程碑! 我们积极倡议,全世界来共同庆祝“人类基因 组计划”所取得的科学成就。
1986年3月,美国能源部提出人类基因组计划的草
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
案。 1986年3月,美国科学家、诺贝尔奖获得者杜尔贝克 在《科学》杂志上发表一篇题为“癌症研究的转折 点--人类基因组的全序列分析”的短文,正式以 书面形式提出测定人类基因组全序列的必要性和艰 巨性,文章指出这一计划的意义可以与人类征服宇 宙的计划媲美,这项工作应成为国际级项目。 1986年6月,诺贝尔奖获得者吉尔伯特在美国冷泉港 提出人类基因组计划的实施需要30亿美元。
德国
1995年德国开始HGP,来势迅猛,先后成立了资源
中心和基因扫描定位中心,并开始对21号染色体的 大规模测序工作。
中国
1994年,中国HGP启动。 中国HGP研究机构:以强伯勤为主任的中国人类基因组北方
中心(北京协和医科大学);以陈竺为主任的中国人类基因 组南方中心(上海瑞金医院); 1999 年 7 月,以杨焕明为主 任的中科院遗传所人类基因组研究中心(北京)在国际人类 基因组组织注册。 1999年9月中国获准加入人类基因组计划,负责测定人类基 因组全部序列的1%,也就是3号染色体上的3000万个碱基对。 2004年4月中国科学家完成3号染色体上的3000万个碱基对的 测序。 使中国成为继美、英、日、德、法之后第六个国际人类基因 组计划参与国,也是参与这一计划的唯一发展中国家。
基因组:一个生物体的染色体上完整的一套
遗传物质(DNA上所有基因序列的总和)称为基 因组。人类基因组就是在人类细胞核内23对染色 体上整套的DNA。
人类基因组计划(HGP)启动背景
20世纪80年代,通过大量的实验和研究,科学家们
发现癌症并不是人们想象的那么简单,癌是基因突 变而导致基因调控失灵,从而使正常细胞无序生长 和不断突变。世界各国科学家一致认为:要破译癌 症之谜或生命之谜,首先破译基因之谜。 1984年12月9日-13日,在美国举行的“环境诱变物 和致癌物防护”的国际会议上,美国能源部邀请科 学家讨论测定人类基因组DNA序列的意义和前景 , 由于需要的资金庞大,没有人“敢”向政府提议。 1985年5月,美国加利福尼亚州立大学圣克鲁斯分校 校长辛夏默提出“人类基因组测序”可行性设想。
日本
在美国的推动下于1990年开始的 。
日本对DNA序列图的贡献7%。 但与日本的其它领域的领先地位相比,日本的人类
基因组仍略逊一筹,但这几年进展很快。
法国
“国家人类基因组计划”成立于1990年年底,诺贝
尔奖金获得者道赛特以自己的奖金建立了“人类多 态性研究中心”。法国民众至少捐助了5000万美元。 “人类多态性研究中心”与相关机构为基因组研究, 主要特点是注重整体基因组、cDNA和自动化。尤 其是第一代物理图与遗传图的构建作出了不可磨灭 的贡献。
“人类基因组计划”宣言
我们,美国、英国、日本、法国、德国与中国 的政府首脑,骄傲地向全世界宣布:我们六国的科 学家已完成了人类生命的分子指南——由30亿对碱 基组成的人类基因组DNA的关键序列图。 人类“生命天书”全部章节的解读,适逢 DNA双螺旋结构发表五十周年。五十年前的这个月, 沃森与克里克这一里程碑 的发现,使基因科学与生 物技术取得了举世瞩目的进展;五十年后的这一天, “国际人类基因组测序协作组”公布了人类基因组 序列信息,全世界都可以通过国际互联网从公共数 据库中自由分享,免费使用而不受任何限制。
2000年4月6日塞莱拉公司宣布已破译出一名实验者
的完整遗传密码,并可在3~6星期内拼接成人体基 因组草图。但不少欧美科学家对塞莱拉公司的成果 表示质疑,认为该公司的研究“没有提供有关基因 序列的长度和完整性的可靠参数”,因而是“有漏 洞的”。 将在6月公布第一张人类遗传草图。
2000年5月,国际人类基因组计划完成时间再度提前,
2000年5月8日,由德国和日本等国科学家组成的国
际科研小组宣布,他们已经基本完成了人体第21号 染色体的测序工作。
2000年6月26日,国家人类基因组研究所和塞莱拉公
司在白宫的庆功会上达成协议,允诺同时公布人类 基因组草图及初步分析结果。
2001 年 2 月, HGP 在《自然》杂志( 2 月 15 日),塞
物理图谱
根据DNA序列上的碱基位臵来确定基因的位臵,是
确定基因的顺序和间隔的最基本的工作。 绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传信息及其 在每条染色体上的相对位臵线性而系统地排列出来。
遗传图谱
又称连锁图谱,是根据基因之间的连锁关系构建的。
它是以具有遗传多态性(在一个遗传位点上具有一 个以上的等位基因,在群体中的出现频率皆高于1%) 的遗传标记为“路标”,以遗传学距离(在减数分 裂事件中两个位点之间进行交换、重组的百分率, 1%的重组率称为1cM)为图距的基因组图。 遗传图谱的建立为致病基因识别和基因定位创造了 条件。
我们殷切期盼,生命科学和医学界尽快应用这 些成就,为尽早解除人类病痛再创辉煌! 法兰西共和国总统 雅克〃希拉克 美利坚合众国总统 乔治〃布什 联合王国首相 托尼〃布莱尔 德意志联邦共和国总理 格哈德〃施罗德 日本首相 小泉纯一郎 中华人民共和国总理 温家宝
2003年4月14日
HGP的世界大联盟
HGP从1990年10月1日开始实施,到2000年6月26日人
莱拉公司在《科学》杂志(2月16日)各自公布人类 基因组草图。
大肠杆菌、枯草杆菌等在内的模式生物基因组测序 完成,发现并克隆到许多新基因。 同绘制完成人类基因组序列图。2004年10月,人类 基因组完成图公布。
2001年,包括小鼠、果蝇、线虫、拟南芥、酵母、
2003年4月14日,美、英、日、法、德和中国宣布共
美国
一直是HGP的主角,策划和完成了人类基因组计划
的50%以上。 检测了酵母、线虫的全部基因序列,绘制出大肠杆 菌基因图谱。 美国民营公司 “塞莱拉遗传公司”的参与,使HGP 提前完成。
英国
1989年2月,英国开始了人类基因组计划。它提出全
国协调、资源集中的任务。全国有关的实验室统一 从“英国人类基因组资源中心”获得免费实验技术 和实验材料服务。自1993年开始,伦敦的桑格尔中 心成为全世界最大的测序中心,它独立完成了人类 基因组30%以上的测序任务。
类基因组草图的初步绘制完成,历时10余年。 期间共有6个国家的16所实验室的1100多名生物学家 和计算机专家参与了这一人类有史以来最为庞大的 科学研究计划。 6个国家分别为:美国、英国、日本、法国、德国、 中国,测序所占份额依次为:54%、33%、7%、3%、 2%、1%。 加拿大、丹麦、以色列、瑞典、芬兰、挪威、澳大 利亚、新加坡、前苏联和东德也都开始了不同规模、 各有特色的人类基因组研究。
1994年9月,美国完成人体基因组的完整遗传连锁图。 1995年12月,美、法科学家公布一张含有15000个标
记的人体基因物理图。 1996年10月,国际研究联盟发表酵母菌的全基因组 序列。 1998年5月一批科学家在美国罗克威尔组建“塞莱拉 遗传公司”,目标是投入3亿美元,到2001年绘制出 完整的人体基因图谱,与国际人类基因组计划展开 竞争。
1987年初,美国能源部和国立卫生研究院(NIH)
为HGP下拨了启动经费约550万美元(全年1.66亿美 元)。 1988年9月,“国际人类基因组组织”成立,旨在协 调全球范围内的人类基因组研究。 1989年,美国成立了“国家人类基因组研究中心”, 由Watson 出任第一任主任,Watson提出从基因组预 算中取出3%用于社会和伦理学研究。 1990年10月1日,经美国国会批准,美国HGP正式启 动,计划在15年内(1990~2005年)投入至少30亿美 元,进行人类全基因组的分析。
国际人类基因组计划 负责人柯林斯
塞莱拉公司总裁文特尔(基因 魔鬼),采用测序方法“霰弹 法”,被评为“2000年度全球最 杰出的科学家”,被誉为“人类 基因组序列测序的开拓者”。
人类只有一个基因组,基因组信息是全人类
的。2003年4月14日,六国政府首脑共同发表 了“人类基因组计划”宣言,认为:人类基因 组是全人类的共同财富和遗产,全世界都可 以通过国际互联网从公共数据库中自由分享, 免费使用而不受任何限制。
序列图谱
序列图谱是指完整的人类基因组图谱,是人类基因
组计划中最重要、最难“画”的一张图。 DNA序列分析技术是一个包括制备DNA片段化及碱 基分析、DNA信息翻译的多阶段的过程,通过测序 得到基因组的序列图谱。 HGP能提前完成,在一定程度上也是分子生物学技 术的迅速发展,尤其是DNA测序的自动化和生物芯 片技术的问世。
1998年10月23日,美国国家人类基因组研究所在美
国《Science》杂志上发表声明说,人类基因组计划 的全部测序工作将比原计划提前两年,即在2003年6 月完成。
1999年3月15日,美国国家人类基因组研究所宣布,
由于科学家加快工作步伐,人类基因组工作草图将 提前至2001年6月完成。
人类基因组计划和 后基因组时代
20世纪,人类科学历程中的三大研究计划将 永垂史册:
40年代的曼哈顿原子弹计划 60年代的阿波罗登月计划 90的人类基因组计划(生命科学登月计
划)
基因、基因组的概念
基因:是遗传的基本物质和功能单位,DNA序列
中的一段脱氧核苷酸序列,是DNA分子中最小 的 功能单位。或者说,基因是决定一个生物物种的 所有生命现象的最基本的因子。
1999年12月1日,英国、日本、美国科学家完整地译
出人体第22对染色体的遗传密码,这是人类首次成 功地完成人体染色体基因完整序列的测定。
2000年3月,塞莱拉遗传公司不同意对HGP数据的开
放政策,终止合作计划。3月14日美国总统克林顿和 英国首相布莱尔发表联合声明,呼吁将人类基因组 研究成果公开,以便世界各国的科学家都能自由地 使用这些成果。
欧共体
1990年6月欧共体通过了“欧洲人类基因组研究计
划”,主要资助23个实验室重点用于“资源中心” 的建立和运转。还有丹麦、俄罗斯、日本、韩国、 澳大利亚等。
HGP的研究内容
HGP的主要任务是人类的
DNA测序,内容是完成4 张图谱:物理图谱、遗传 图谱 、序列图谱 和转录 图谱,这四张图称为“人 类基因解剖图” 。 样本选择人种:白种、黑 种和黄种3大人种,并在样 本选择前,移除所有的标 识物。
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