病原分子生物学-总论

Rodents(?)
C
u r
HIV-1
Chimpanzees
r
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HIV-2
Primates
t
I Hendra virus
s
Bats
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vCJD
Cattle
e
| Australian bat lyssavirus Bats
1982 1983 1986 1994 1996 1996
A r
H5N1 influenza A virus
• Recently emerging or re-emerging pathogens most often are RNA viruses having a taxonomically broad host range, using a phylogenetically conserved cell receptor, being transmissible between humans, and occurring in regions undergoing ecological, demographic or social change.
3. Amornrat Kanjanahaluethai, Zhongbin Chen, Dalia Jukneliene and Susan C. Baker. Membrane topology of murine coronavirus replicase nonstructural protein 3. Virology. 2007 May 10;361(2):391-401. Epub 2007 Jan 12. (IF=3.1)
• 国家自然科学基金项目(30870536)： 冠状病毒PLP蛋白酶去泛素酶 (DUB)特性及其对p53-PML通路调节作用机制. 2009.1-2011.12，负责
• 国家自然科学基金项目(30671843)：人类新型冠状病毒NL63 PLpro蛋 白酶特性与病毒复制酶复合体形成机制研究. 2007.1-2007.12，负责 (完成项目)
Of the catalogued pathogen species that infect humans
• 538 are bacteria(细菌). • 317 are fungi（真菌）. • 287 are helminths(蠕虫). • 208 are viruses（病毒）. • 57 are protozoa（原虫）.
2011年硕士研究生分子生物学课程
感染性疾病分子机制
陈忠斌 博士 军事医学科学院放射与辐射医学研究所 The Graduate School of AMMS. Dec 20, 2011
工作简历
• 1999年7月 军事医学科学院 生物化学 博士学位
• 2002.8－至今 军事医学科学院放射医学研究所 副研究员
2. Santhana G. Devaraj, Nan Wang, Zhongbin Chen, Zihong Chen, Monica Tseng, Naina Barretto, Rongtuan Lin, Clarence J. Peters, Chien-Te K. Tseng, Susan C. Baker, and Kui Li. Regulation of IRF-3-dependent Innate Immunity by the Papain-like Protease Domain of the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. J. Biol. Chem., Vol. 282, Issue 44, 32208-32221, November 2, 2007 (IF:6.6)
Examples of human pathogens emerging via species jump
Pathogen
Original host
Year reported
Ebola virus
Bats(?)
1977
Escherichia coli O157:H7 Cattle
1982
Borrelia burgdorferi
ຫໍສະໝຸດ Baidu病原
人类嗜T淋巴细胞病毒-I(HTLV-I) 伯氏包柔螺旋体 人类免疫缺陷病毒（HIV-1 HIV-2） 大肠杆菌O157:H7 幽门螺杆菌 人类疱疹病毒-6(HHV-6) 丙型肝炎病毒 戊型肝炎病毒 霍乱弧菌O139:H7 巴尔通体 Sin nombre病毒 庚型肝炎病毒 阮粒（阮毒体） 禽流感病毒（H5N1） 西尼罗河样病毒 SARS病毒 人猪源H1N1 NDM-1耐药细菌(Superbugs)
5. John Bechill, Zhongbin Chen, Joseph W. Brewer and Susan C. Baker. Coronavirus infection activates the unfolded protein response and inhibits translational recovery. Journal of Virology. 2007(Submitted) (IF=5.2)
Mark E. J. Woolhouse. Microbe, November 2006 ,Vol.1:511
Most emerging diseases are of animal origin
Rino Rappuoli. Nature Medicine 10, 1177 - 1185 (2004)
Robert Gallo, MD
Director, Institute of Human Virology and Division of Basic Science, University of Maryland Biotechnology Institute snallo@ihv.umaryland.edu
疾病
成人T细胞白血病/淋巴瘤 莱姆病 艾滋病（AIDS） 出血性肠炎 溶血尿毒综合征 胃炎 胃出血 胃癌 幼儿急疹（婴儿玫瑰疹） 肠道外传播非甲非乙型肝炎 肠道外传播非甲非乙型肝炎 新类型霍乱 猫抓病 细菌性血管瘤 汉坦病毒肺综合征 非A-C肝炎 新型变异克鲁兹非德得-雅柯病 流感 脑炎
SARS 甲流 细菌感染
4. Zhongbin Chen, Yanhua Wang, Kui Li, Keith D. Wilkinson, and Susan Baker. Deubiquitinase Activity and Inhibition of Interferon Production of Papain-Like Proteases of Human Coronavirus NL63. Journal of Virology. 2007(Submitted) (IF=5.2)
c
h Nipah virus
i
v e
SARS coronavirus
s
Chickens Bats Bats(?); Palm civets(?)
1997(1950S) 1999 2003
|
A
S M
Mark E. J. Woolhouse. Microbe, November 2006 ,Vol.1:511
Mark E. J. Woolhouse. Microbe, November 2006 ,Vol.1:511
年份
1980 1982 1983 1983 1983 1988 1989 1990 1992 1992 1993 1993 1996 1997 1999 2003 2009 2010
近30年来新发现病原体
近10年人类传染病发生的主要变化
Origins of Pathogens
• Species jumps by pathogens require both the opportunity and capacity to infect a new host species. Recent species jumps have usually involved RNA viruses, perhaps because their genetic lability allows them to adapt quickly to anew host species.
For the discovery of :
• Human papilloma virus (HPV) causing cervical cancer.
• Human immunodeciciency virus (HIV) causing AIDS.
HIV
HPV
Nature Medicine, November 2008 volume 14 | number 11
课程内容
• 病原分子生物学总论（2课时） • HBV分子生物学（ 2课时） • HCV分子生物学（２课时） • 冠状病毒分子生物学（２课时）
病原分子生物学 ----总论
陈忠斌 博士 军事医学科学院放射与辐射医学研究所
电磁与激光生物学研究室
艾滋病毒
The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2008
2011 Nobel Prize in Physiology or Medicine
Bruce Beutler（the Scripps Research Institute in California） Jules Hoffmann （French National Center for Scientific Research ） and Ralph Steinman （French National Center for Scientific Research ）
• 2003.5－2003.6 美国Columbia大学公共卫生
学院
SARS合作研究
• 2004.2－2007.3 美国Loyola大学医学院 访问 学者
• 现为二所电磁与激光生物学研究室 副主任, 副研究 员
课题组研究方向
感染与免疫调节机制及其医学（军事医学）应用研究. 目前研究方向有:
（１）病毒蛋白酶结构与功能; （２）抗病毒天然免疫调节分子机制; （３）基于天然免疫调节信号通路的药物研究
share the Nobel Prize in Physiology or Medicine for their eludication of the complex workings of the immune system
Bruce Beutler
Jules Hoffmann
Ralph Steinman
• 国家自然科学基金项目(30000146)：应用基因芯片技术研究流感病毒 感染致病分子机理. 2001.1-2003.12， 负责(已完成项目)
• 国家自然科学基金重点项目（3053065）：乙型肝炎病毒受体的筛选 与验证研究。起止年限：2006.1-2009.12. 第二负责人 (在研项目)
发表论文
1. Zhongbin Chen, Yanhua Wang, Kiira Ratia, Andrew D. Mesecar, Keith D. Wilkinson, and Susan C. Baker. Proteolytic Processing and Deubiquitinating Activity of Papain-Like Proteases of Human Coronavirus NL63. Journal of Virology, June 2007, p. 6007-6018, Vol. 81, No. 11(IF=5.2)
承担的各类科研项目
国家863项目2项；国家自然科学基因项目5项；北京 市自然科学基金项目1项
• 国家“863”高技术项目(2006AA02Z412)：人类新发冠状病毒蛋白酶 免疫抑制机制和靶向蛋白酶的新型药物筛选模型研究。2006.12.12008.12.31，负责 (在研项目)
• 国家“863”高技术项目(2001AA215261)：抗肿瘤反义寡核苷酸药物的 实验与临床前研究。2001.01-2003.12，负责(已完成项目)