文献检索 第四课 Pubmed
pubmed检索方法
pubmed检索方法Pubmed 检索方法Pubmed 是美国国家医学图书馆(National Library of Medicine)所开发的一个免费的生物医学文献库,包含了全球几乎所有的生物医学文献,是医学研究人员和医生进行搜索和查找相关医学文献的重要工具。
本文将介绍Pubmed 的检索方法。
一、关键词检索关键词检索是 Pubmed 最常用的检索方式,通过输入关键字搜索相关的文献。
在检索时需要注意以下几点:(1)关键词要准确。
Pubmed 检索采用布尔操作符(AND、OR、NOT)连接多个关键词,关键词之间要使用英文逗号(,)隔开。
使用过多的关键词可能会导致检索结果没有想象中的好。
(2)参数设置。
可以根据需求调整相关参数,例如年份、文献类型(Review、Clinical Trial、Randomized Controlled Trial等)、文章作者、机构等。
(3)英文文献。
Pubmed 绝大部分都是英文文献,所以检索时需要使用英文关键词。
(4)筛选性强的关键词。
例如疾病名称、独特的药品名称等。
Pubmed 支持多种文献类型检索,例如:(1)临床试验在 Pubmed 首页上,勾选临床试验会检索到近期的中断临床试验、未发布的临床试验等。
(2)随机对照试验勾选随机对照试验可以检索到已发表的随机对照试验。
(3)综述勾选文章类型为系统综述或综述,可以检索到该领域最新的文献综述。
三、学科分类检索Pubmed 中的文献都会有一个或多个学科分类号(MeSH Terms),用户可以通过选择学科分类号进行检索。
在检索时需要注意以下几点:(1)科学性强的关键词。
例如,临床试验、人类、治疗法等。
(2)与所需内容相关的关键词。
例如,药物作用机制、剂量方案等。
(3)使用适当数量的关键词。
使用过少的关键词会导致检索结果过多,使用过多的关键词会导致检索结果不够全面。
Pubmed 中的文献都会有一个分值,通过分值和其他指标来对文献进行评价。
《pubmed文献检索》课件
我的图书馆和个人账户
1 个人账户
在PubMed上,您可以创建个人账户并保存 有用的文献,以便以后查看和组织。
2 我的图书馆
通过我的图书馆功能,您可以将文献保存到 您的个人图书馆中,并与其他人分享和合作。
最佳检索实践
1研究的目标和问题有清晰的了解。
2
步骤二:构建关键词
根据研究目标,构建与之相关的一组关键词和同义词。
3
步骤三:搜索和筛选
使用合适的检索策略,搜索PubMed数据库,并根据相关性和质量对文献进行筛 选和排序。
常见检索错误和解决方案
错误:关键词选择不当
解决方案:仔细选择与研究主题密切相关的关键 词,避免广泛或模糊的词汇。
错误:忽略相关的过滤选项
解决方案:利用高级搜索功能,使用文献类型和 语言等过滤选项来缩小结果范围。
错误:搜索结果太少或太多
解决方案:调整搜索策略,添加或删除一些筛选 条件,以匹配您的需求。
错误:不使用布尔运算符
解决方案:使用AND、OR、NOT等布尔运算符 来优化您的检索策略。
如何评估PubMed文献的可靠性
同行评审
确保您选择的文献已通过同行评 审,这意味着它已经被其他专家 认可为具有高质量和可靠性。
如何进行PubMed文献检索
关键词搜索
通过输入相关的关键词,我们 可以快速找到与我们研究主题 相关的文献。
高级搜索
高级搜索功能允许我们使用更 多的筛选条件,如作者、期刊、 日期范围等,精确地缩小搜索 结果的范围。
文献类型和语言筛选
通过选择文献类型和语言参数, 我们可以进一步细化我们的搜 索结果,以便找到具体类型和 语言的文献。
引用数量
检查文献的引用数量,高引用数 量通常表示该文献在学术界有一 定的影响力。
医学文献检索(PubMed)
检索方法
基本检索 (search):主界面默认的检索方法
自动词语匹配 (Automatic Terms Mapping) 精确检索 截词检索 字段限定检索 著者检索 期刊检索 逻辑组配检索
Part 2 检索方法 基本检索-自动语言匹配
对输入的有实际意义的检索词、短语,系统会自动进行词语 的匹配转换,并返回检索结果。 匹配原理 输入的检索词、短语依次在多个词表(MeSH转 换表、刊名转换表、著者转换表、著者索引表、合作者转换 表及合作者索引表)中进行搜索、比对,并自动转换为相应 的MeSH词、刊名或著者,再将短语、构成短语的单词分别 在所有字段中检索,输出检索结果。
美国医学文献数据库 PubMed
主要内容
Part 1 Part 2 Part 3 Part 4
了解 PubMed 检索方法
检索结果的解读与处理 同类推荐
Part 1
了解PubMed
P美国国立医学图书馆 NCBI 美国国立生物技术信息中心
检索出篇名中出现 糖尿病的综述文献
Part 2 检索方法 基本检索-著者检索
在检索框中输入著者姓名时,通过“自动词语匹配”,系统 会自动执行著者检索。
检索2002年前的论文时要求姓前名后,姓用全称,名用首字母缩写。 2002年以后的论文还可用姓和名的全称检索,且前后顺序不限。
使用著者字段进行限定检索可实现特殊的检索要求。如检索 某著者作为第一作者或排名最后的作者发表的论文时,即可 用字段限定检索来实现。
临床试验(Clinical Trials) 点击Clinical Trials进入Clinical 页面, 可检索来自全球178个国家的12万个实验信息。
临床查询(Clinical Queries) 专为医生设计的检索服务,输入疾病名称后, 可选择查询临床研究分类(Clinical Study Categories)、系统评价 (Systematic Reviews)和医学遗传学(Medical Genetics)三大类文献, 仍可再细分。
医学文献检索(PubMed)
Part 2
检索方法
高级检索
选择其 他检索 方式
检索构建器
检索历史
Part 2 检索方法 高级检索-检索构造器
点击Edit可在文本框内编辑检索式
检索构建步骤:
1 4
5
6
①选择检索选项 ②输入检索词 ③通过索引表正确选词
diabitis
3
④选择逻辑运算符 ⑤点击Search执行检索 ⑥点击Add to history,在下方的检索历史中显示结果数量
相关参见
限定为主要主题词 不进行扩展检索
树状结构
Part 2 检索方法 主题检索-检索界面
勾选要组配的副主题词 ∨
点击此键,将检索式添 加到检索构建器
点击“search pubmed”执 行主题词检索
Part 2 检索方法
主题检索-优点
采用主题词检索能保证较好的查全率
ü 主题词对同一概念的不同表达方式进行了规范。 ü 系统默认对主题词进行扩展检索(Explode),即同时检索该
医学文献检索(PubMed)
本课件仅供大家学习学习 学习完毕请自觉删除
谢谢 本课件仅供大家学习学习
学习完毕请自觉删除 谢谢
主要内容
Part 1 Part 2 Part 3 Part 4
了解 PubMed 检索方法
检索结果的解读与处理 同类推荐
Part 1
了解PubMed
PubMed溯 源
/pubmed
检索出篇名中出现 糖尿病的综述文献
Part 2 检索方法 基本检索-著者检索
在检索框中输入著者姓名时,通过“自动词语匹配”,系统 会自动执行著者检索。
ü检索2002年前的论文时要求姓前名后,姓用全称,名用首字母缩写。 ü2002年以后的论文还可用姓和名的全称检索,且前后顺序不限。
文献检索pubmed讲解资料
PubMed基本检索
smith j
作者姓名检索 按照姓(全写) +名(缩写), 之间不用标点 键入作者姓名
PubMed基本检索
"smith j"[au]
精确检索避免 PubMed自动 词汇转换,实 现精确查找
PubMed基本检索
期刊检索
在检索框中键入期刊名,如:European journal of immunology,系统的“自动词语匹配”功能会将它转换成"Eur J Immunol"[Journal] OR "european journal of immunology"[All Fields]进行检索。
期刊数据库的作用: 1、可以查看期刊的详细信息,包括出版国家,出版社,出版语言, 期刊类目等等; 2、可以根据期刊的主题分类,查看medline收录的各学科的期刊, 比如查看medline收录的关于麻醉学(Anesthesiology)方面的期 刊; 2、方便检索某本期刊上被PubMed收录的所有文章。
• PubMed收录的期刊最早追溯至1865年,共收录了70余个国家
36000余种期刊,1900多万篇文献;
• PubMed 的子集Medline收录的文献最早追溯至1902年,现有
记录1790多万篇;
• 目前每年增加约60余万条文献记录; • 在全部记录中有76%的文献为英文;在2000年以来的记录中
提纲
• PubMed概况 • PubMed功能栏介绍 • 认识PubMed文献 • PubMed基本检索 • PubMed高级检索 • 主题词MeSH检索 • 循证及临床查询检索 • PubMed全文获取 • PubMed RSS学科跟踪
概况
如何使用pubmed进行文献检索
如何使用pubmed进行文献检索使用PubMed进行文献检索是非常重要的,因为它是一个专门为生命科学和医学领域提供的免费文献数据库。
下面是一个详细的步骤指南,以帮助你使用PubMed进行文献检索。
2. 进行关键词:在PubMed首页的框中输入你感兴趣的关键词,可以是疾病名称、特定的治疗方法、生物标志物等。
点击“”按钮。
4.阅读摘要和全文:当你找到感兴趣的文章时,你可以点击标题以查看摘要。
摘要通常提供了关于研究目的、方法、结果和结论的概述。
如果你对文章感兴趣并且有免费全文可用,你可以直接点击“全文”链接以阅读完整的文章。
5. 扩大或缩小范围:如果你的结果不够理想,你可以尝试扩大或缩小范围。
你可以使用更广泛或更具体的关键词来,或者使用PubMed高级功能来更精确地定位你的。
6. 使用MeSH词汇进行检索:MeSH(Medical Subject Headings)是PubMed的一种标准词汇,用于对文章进行分类和索引。
如果你想进行更准确的检索,你可以使用MeSH词汇来。
在框中输入你的关键词,然后点击右侧的“在[MeSH]中”按钮以进一步精确。
7. 使用历史和提示:PubMed提供了历史和提示功能,以帮助你更好地管理和改进你的。
你可以在框下方找到你最近的历史记录,并且当你输入关键词时,PubMed会自动提供相关的建议。
8. 使用PubMed Central进行全文检索:除了PubMed,你还可以使用PubMed Central来全文可用的文章。
PubMed Central是一个免费的全文文献数据库,其中包含了许多生命科学和医学领域的文章。
你可以在PubMed结果页面的右上方切换到PubMed Central进行检索。
总结起来,使用PubMed进行文献检索需要一些技巧和经验。
通过使用关键词、筛选结果、阅读摘要和全文、扩大或缩小范围、使用MeSH词汇、使用历史和提示、使用PubMed Central进行全文检索、导出和管理文献等功能,你可以更有效地利用PubMed来找到相关的研究文献。
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法【原创版4篇】目录(篇1)I.检索PubMed的意义II.PubMed的检索方法III.PubMed检索结果的展示和筛选IV.检索PubMed的注意事项正文(篇1)I.检索PubMed的意义PubMed是全球最大的生物医学数据库之一,提供了大量的生物医学文献资源。
对于研究人员、医学专业人士和学生来说,了解和掌握PubMed的检索方法,可以帮助他们快速找到所需的文献。
II.PubMed的检索方法1.打开PubMed网站,输入网址:https:///2.在页面左侧导航栏中选择“Search”按钮,进入检索页面。
3.在检索页面中,可以选择不同的检索方式,如关键词、作者、出版日期等。
4.输入检索词后,点击“Search”按钮,即可得到相关的检索结果。
III.PubMed检索结果的展示和筛选1.检索结果会按照相关度排序,用户可以选择不同的排序方式。
2.每个检索结果都包含标题、摘要、作者、出版日期等信息。
3.对于需要进一步阅读的文献,可以点击“Open”按钮,查看全文。
4.可以通过筛选条件,如主题、关键词、学科领域等,缩小检索范围。
IV.检索PubMed的注意事项1.避免使用过于具体的检索词,以免得到过多的无关结果。
2.对于复杂的检索需求,可以使用逻辑运算符和短语检索等方式进行组合检索。
目录(篇2)I.引言A.为什么需要pubmed文献检索方法B.pubmed简介II.pubmed文献检索方法A.如何使用pubmed1.输入关键词2.选择检索结果3.查看文献详情B.pubmed的优点1.方便快捷2.检索结果全面3.文献质量较高C.pubmed的不足1.检索结果可能不全面2.文献质量可能较低3.检索结果可能存在误导III.结论A.pubmed文献检索方法的重要性和实用性B.如何利用pubmed进行有效的文献检索正文(篇2)pubmed文献检索方法是一种非常实用的工具,可以帮助科研人员快速、准确地检索到所需的文献。
如何使用pubmed进行 文献检索
[PubMed-indexed for MEDLINE]
[PubMed-as supplied by publisher] [PubMed-in process]
PubMed与MEDLINE的区别
4.4与NCBI其它数据库的链接
Nucleotide:DNA序列数据库 Protein:蛋白质序列数据库 Genome:基因组序列数据库 Structure:分子结构模型数据库 OMIM:人类孟德尔遗传学在线数据库 PMC: PubMed中心,免费全文期刊检索
印刷版 1879 联机版 1971 光盘版 1983 网络版 1997
MEDLINE数据库简介
收录范围:收录7538种(2009.10.11) 权威期刊,包含50种语言,涉及70多个国家 (其中中国48种),约40万篇/年,已经累计 2100余万篇。内容涉及生物医学各个领域; 85%原文为英语。
1998/03[dp]; 1998[dp]; 1996:1998[dp]; 1998/01:1998/04 [dp]
Publication Type[PT]:出版类型 review[pt]
Title[TI] :文章题名 Text Words[TW]:文本词
包括Title, Abstract, MeSH Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等字段
三、检索方式与途径
1、基本检索 2、高级检索 3、主题词检索 4、期刊检索 5、题录检索 6、临床咨询 7、临床试验
1、基本检索
➢ 1.1 自由词检索
在检索栏中输入: ➢ 一个或多个检索词 (系统默认空格为AND检
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法摘要:一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文:一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个免费生物医学文献数据库,包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。
它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。
二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页,可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。
基本检索的结果会按照相关性排序。
2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮,可以进入高级检索界面。
高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定,从而提高检索的准确性。
3.检索策略在检索过程中,可以采用一些策略提高检索效果。
例如,使用截词符(*)进行词干检索,或将关键词用引号括起来进行精确检索。
三、检索实例以下是的一个检索实例:假设我们想查找关于“新冠病毒”(SARS-CoV-2)的研究文献,可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”,然后点击检索按钮。
检索结果会包括与新冠病毒相关的文章,如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。
四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。
可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等,了解研究领域的主要术语和概念。
2.运用布尔操作符布尔操作符(AND、OR、NOT)在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。
例如,输入“新冠病毒AND 疫苗”,可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。
3.限制检索范围在检索过程中,可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件,缩小检索范围,提高检索的针对性。
五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具,如引文导出、文献收藏、文献标签等。
文献检索 PubMed
PubMed发展过程 发展过程
1997-
PubMed网络数据库 网络数据库
1983-
Medline光盘数据库 光盘数据库
1971-
Medline联机检索系统 联机检索系统
1879-
Index Medicus (IM)检索期刊 )
6
PubMed的收录范围 的收录范围
收录全世界80多个国家 收录全世界 多个国家5200多种生物医学期刊的 多个国家 多种生物医学期刊的 文摘及题录数据 绝大部分可回溯至1948年,最早回溯至 绝大部分可回溯至 年 最早回溯至1865年 年 累积了1900多万条文献记录 累积了 多万条文献记录 部分文献可直接获取全文,包括: 部分文献可直接获取全文,包括:
例如,Cell [TA]可检索出在期刊Cell被PubMed收录的所 有文献
利用PubMed的Journals Database可查找期刊的 的 利用 可查找期刊的 详细信息
短语精确检索 短语精确检索是将检索词加上双引号进行强制 检索 短语精确检索时, 短语精确检索时,PubMed关闭自动词语匹配 关闭自动词语匹配 功能,直接将该短语作为一个检索词进行检索, 功能,直接将该短语作为一个检索词进行检索, 避免了自动词语匹配时将短语拆分可能造成的 误检, 误检,可提高查准率 例如,输入“metabolic syndrome”, PubMed在所有可检索字段中查找含有短语 词组metabolic syndrome的文献
刊名全称:如the American Journal of Pathology 标准的Medline刊名缩写:如Am J Pathol 期刊的ISSN号:如0002-9440, Am J Pathol ISSN号
当刊名与MeSH词相同时,PubMed默认将其作为 词相同时, 当刊名与 词相同时 默认将其作为 MeSH词检索。为避免误检,可采用刊名字段限定 词检索。 词检索 为避免误检, 检索
文献检索课件12116PubMed
美国医学文献数据库
目录
CONTENTS
1 ABOUT PubMed 2 常规检索方法 3 MeSH主题词检索 4 检索结果的解读与处理
01
ABOUT PubMed
PubMed溯源
PubMed(Medline)由美国国立医学图书馆(NLM)、国际MEDLARS成员(中国为 第16个成员国)及合作的专业组织共同研制开发,是目前国际上公认的检索生物 医学文献最具权威、利用率最高、影响最广的数据库,也是我国卫生部认定的科 技查新必须检索的国外医学数据库。
精确检索
实际执行 的检索式
检索结果数量
数据库检索功能
基本检索
检索功能3:字段检索
在检索词后输入检索字段标识可进行字段限定,以提高查准率。 输入格式为:检索词[字段标识]。
如检索标题中含Diabetes的论文,可输入Diabetes [TI];要检索综述文献可输入Review[PT]。 字段限定检索时,PubMed会关闭自动词语匹配功能。
①检索词:Alzheimer Disease
②主题词:Alzheimer Disease
③副主题词:mortality
④是否加权:“重点论述”
⑤是否扩展:题干未体现,可选择默认方式
主题词收录时间
主题词
主题词注释
MeSH主题词检索
主题检索:重点论述阿尔茨海默病(Alzheimer Disease)死亡率(mortality)的文献
02
常规检索方法
主页
https:///pubmed/
检索区域
PubMed功能服务区
常用检索方法 – 布尔逻辑
AND
逻辑“与” 表达式:A AND B
PubMed文献检索
保存该检索式 至收藏夹
六、PubMed检索结果的处理
检索结果的处理
显示格式 结果排序 文本显示 保存(最多10000篇) 打印 发送至Email 订购原文
题录格式:作者、题名、出处。
Send to -> text
Send to -> Files
Send to -> Email
的外部链接功能
提供NCBI开发的分子生物学数据库的链接, 如Nucleotide、Protein、Genome、OMIN、 Structure、Taxonomy等。 提供美国国立医学图书馆多种资源的链接 提供相关文献(RELATED ARTICLES)的 链接 提供其它外部资源的链接,如生物医学期 刊网站全文链接、NCBI资源。
Nan fang yi ke da xue xue bao Beijing da xue xue bao Zhonghua nei ke xue za zhi
五、 PubMed特征栏功能介绍
(一) Limits限定检索
作者(Author):系统有提示 期刊(Journal) 全文(Full Text 或 Free Full Text ) 日期(Dates) 人类或动物研究(Humans or Animals ) 文献类型(Type of Article ) 性别(Gender )、语种(Languages )、年 龄(Ages )、文献子集限定(Subsets ) 自由词可以结合以上各种限定进行。
Shizhen Zhong,zhong shizhen→zhong s
检索
3、期刊检索
如何使用pubmed进行 文献检索
一、PubMed简介
3.Pubmed的特点
收录生物医学权威期刊最多
世界上70多个国家的7000多种权威期刊
多种检索方法,多条检索途径 时效性极强(每周更新) 回溯年代久远(1948年至今) 利用MeSH作为转换词表,标引质量高 部分文献可以免费获取全文 检全率、检准率高
一、PubMed简介
1.PubMed基本情况
PubMed是美国NLM所属的国家生物技术信息 中心(NCBI)开发的一个以Web方式向用户 提供服务的生物医学文献检索系统,是继 MEDLINE数据库国际联机检索和光盘检索之 后推出的一种网络免费检索方式。
一、PubMed简介
包括2,100多万篇来自MEDLINE和其他
4.2 PreMEDLINE
是一种由正在加工处理中的文献记录组成
的数据库,这些新记录还未被标引,暂时 存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新, 经过标引(增加主题词、文献类型、数据 库存取号等字段)以后转入Medline,一旦 记录被转入到Medline数据库,就被从 PreMEDLINE数据库中删除。每条记录标
与NCBI其它42个数据库的链接
PubMed主页 /pubmed
高级检索入口
页面介绍
基本检索输入框 个人空间
Pubmed简介
检索指南
检索工具: 特定文献检索
临床咨询 专题咨询
其他资源: 主题词数据库
期刊数据库 临床试验等
二、检索规则及检索技术
[PubMed-indexed for MEDLINE]
[PubMed-as supplied by publisher] [PubMed-in process]
PubMed与MEDLINE的区别
新版PubMed文献检索
收录记录新:
文献类型全:
认识新版PubMed
PubMed首页 PubMed检索结果页 PubMed结果显示 PubMed摘要显示
新版PubMed特色: 简洁、清新 检索速度较快
/pubmed
检索词输入框
Welcome to PubMed
Entrez可以检索的数据库
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM),人类遗传疾病相关文献 数据库 PopSet,族群演化分析相关研究资料 Protein sequence database,蛋白质序列数据库(包含Swiss-Prot、PIR、 PRF、PDB等数据库与从GenBank、RefSeq核酸序列转译之蛋白质序列资料) PubChem BioAssay,化学成分之生物活性筛选资料 PubChem Compound,小分子化学物质结构 PubChem Substance,具生物活性之化学物质筛选数据 PubMed,科学文献报导数据库 PubMed Central,科学文献数字全文数据库 Site Search,可搜寻NCBI的网页与FTP SNP,单点核酸多样性数据库(dbSNP) Structure,分子模型数据(MMDB) Taxonomy,以核酸或蛋白质为基础的分类学信息 UniGene,人类unique基因序列数据库 UniSTS,unique序列卷标地址数据库
处理运算、数学及分子生物、生物与遗传学理 论问题的基础与应用研究,包括基因体分析、 序列比对、序列搜寻方法、巨分子结构、动力 学与交互作用、结构/功能预测等。 建立NIH实验室、政府机构、学术单位与产业界 之生物学家、化学家、数学家与计算机科学家 间的计算分子生物合作研究计划。 提供研究分子生物分析工具的咨询与建议。 与分子生物社群互动,利用计算与理论方法提 高实验研究质量。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
温州医科大学图书馆
林薇
Contents
初识PubMed PubMed基本检索 PubMed高级检索 PubMed主题词检索 PubMed期刊检索 PubMed检索结果处理
初识 PubMed
标引质量高
更新速度快 使用方便
信息量大
选择PubMed的n个理由
/pubmed
Pubmed基本检索
一、Pubmed检索系统
(三)Pubmed基本检索 基本检索
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
1.
逻辑运算符: AND OR NOT
AND diabetes therapy NOT nifedipine
将检索出同时包含阿司匹林和糖尿病两个检索词的文献。
/美国国立卫生研究院
/美国国立医学图书馆
/国家生物技术信息中心
Entrez资源整合系统
NCBI资源整合系统,基于Web界面的综合生物信 息数据库,可实现跨库检索,包括
GenBank和Nucletide (2) Genoma (3) OMIM (4) Protein (5) Structure (6) Pubmed (7) PMC
(1)
初识Pubmed
一、Pubmed检索系统
(一)Pubmed收藏范围:
(1)
(P46)
Medline:标注为[Pubmed-indexed for Medline] (2) OldMedline:标注为[Pubmed-OldMedline] (3) In Progress Citations:标注为[Pubmed-in Process] (4) Publisher Supplied Citation:标注为[Pubmed-as supplied by Publisher]
Subheadings
款目词
树状词表
检索
检索结果
Pubmed主题词检索
举例
2. 主题数据库(Mesh Database)检索:艾滋病(AIDS )预防和控制(Prevention and Control)(习题4)
Pubmed期刊检索
期刊数据库检索
通过输入刊名、缩写名、ISSN等,浏览期刊文献 提供电子原文的超链键 两个方面
Pubmed高级检索
1. 检索构建器 search builder 2. 检索历史
Pubmed高级检索
高级检索
Advanced Search
高级检索习题
1. 检索作者姓为Black,且标题中有Hypertension 的文献(习题3) 2. 检索题目或摘要中有中医Chinese Traditional Medicine 和药理学pharmacology 的中文文献
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
5.著者检索
姓前名后,姓用全称,名用首字母。全称。缩写。
Smith SR
6.字段限定检索
[ ] P47不同字段
作者[AU] 语种[LA ]
7.期刊检索
基本检索习题
习题1: 基本检索:肺癌和吸烟关系的文献 lung cancer, smoke ,smoking, smoked(用截词符*)
检索该期刊被Pubmed收录的文献 检索该期刊的信息 举例:the new england journal of medicine
Pubmed期刊检索
期刊数据库
期刊检索习题
习题5:期刊数据库(Journals Database)检索: PubMed 中收录关于视力测定(Optometry)的期刊有哪些?
NIH、NLM、NCBI与pubmed
– NIH(National Institute of Health):美国 国立卫生研究院 – NLM(Natioanl Library of Medicine):美国 国立医学图书馆 – NCBI(National Center for Biotechnology Information) :美国生物技术信息中心
习题6:找出肾性高血压(renal hypertension)的主题词, 以及其上位主题词和下位主题词。
第二节 Pubmed与NCBI
三、其他工具和链接
(一)My
1.
NCBI个性化功能
保存检索策略及E-mail发送功能 2. 保存检索结果 3. 过滤检索结果
(二)Linkout:全文链接 (三)批量引文匹配器 (四)临床试验数据库
由丁香园创建,基于Pubmed数据。
高级搜索
图库搜索
The end
See you next time!
"diabetes mellitus"[MeSH Terms] OR ("diabetes"[All Fields] AND "mellitus"[All Fields]) OR "diabetes mellitus"[All Fields] VS diabetes
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
摘自上海交通大学-生命医药学科博客: /lam/article.asp?id=269
GoPummed
PMCቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
PubMed Central:免费全文数据库
Pubmed Central
/pmc/
Pubmed与Gopubmed
Gopubmed知识挖掘分析工具
Gopubmed概述 2. Gopubmed的分类统计功能
1.
(1) 主题分布 (2) 作者分布 (3) 文献来源分布 (4) 年度分布
3.
Gopubmed与SCI信息分析功能比较
Gopubmed是一种Pubmed检索工具,是对于 Pubmed资源的另一种组合检索方式,它比 Pubmed的优点集中在于对于某一方面的研究我 们能够直观得知研究时间、研究者、地域、研 究过程、研究动态和各种信息之间的相关性
如:aspirin
如:hypertension
将检索关于高血压治疗但不含硝苯地平的文献
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
2.词语自动转换:自然语言转换
Mesh转换表、刊名转换表、短语表、著者索引 对常用医学名词进行自动在MeSH转换表 、刊名转换表、 短语表、著者索引及所有记录字段中转换匹配。 如: diabetes mellitus (糖尿病) 转换为
Pubmed检索结果
检索结果的显示、评价、分析与管理 1. 结果显示: 2. 检索结果的保存及输出 3. 检索结果的记录显示 4. 检索结果的限定和过滤
检索结果
显示方式
保存方式
详细显示
结果限定
作业习题
习题2:检索2007年以来2岁(即出生至23个月)小儿哮喘 的综述文献(asthma)
Pubmed主题词检索
二、Pubmed检索系统
(四)Pubmed主题词检索
主题词概念与优势:统一概念,可扩展 检索方法
例:欲查肾衰竭(renal failure)饮食疗法(diet therapy) 的相关 文献?
Mesh Search
Pubmed主题词检索
举例
1.
欲查肾衰竭(renal failure)饮食疗法(diet therapy) 的 相关文献? 注意:主题检索优缺点
3.截词检索功能
截词符:”*”作为通配符进行截词检索。 例如:bacter* (系统会找到前一部分是bacter的单词, 如: bacteria、bacterium等) 用双引号来强制系统进行短语检索。 例如:“oxygen free radicals” (不再自动转换匹配和 扩展检 索)
4.短语精确检索