农田土壤中微生物的检测
土壤微生物量碳氮的测定
土壤微生物量的测定一、土壤微生物生物量碳(氯仿熏蒸-K2SO4提取-碳自动分析法)1、试剂配制(1)去乙醇氯仿制备:市售氯仿一般含有少量乙醇作为稳定剂,所以,使用前必须将其中的乙醇去掉。
方法是量取适量的分析纯氯仿,按1 2(v : v)的比例与蒸馏水或去离子水一起放入分液漏斗中,充分摇动1min,慢慢放出底层氯仿于烧杯中,如此洗涤3次。
得到的无乙醇氯仿中加入无水氯化钙,以除去氯仿中的水分。
纯化后的氯仿置于暗色试剂瓶中,在低温(4℃)、黑暗状态下保存。
注意:氯仿具有致癌作用,所有操作必须在通风橱中进行。
(2)氢氧化钠溶液[c(NaOH)= 1mol L-1](3)硫酸钾浸提剂[c(K2SO4)= 0.5mol L-1]:取1742.6 g分析纯硫酸钾,用研钵磨成粉末装,倒于25L塑料桶中,加蒸馏水至20L,盖紧螺旋盖置于摇床(150 r min-1),溶解24 h。
(4)六偏磷酸钠溶液(5%,pH2.0):50.0g分析纯六偏磷酸钠溶于800ml双蒸水,用分析纯浓磷酸调节至pH2.0,再用双蒸水定容至1L。
注意:六偏磷酸钠溶解速度很慢应提前配制,且由于其易粘于烧杯底部,加热时常因受热不均使烧杯破裂。
(5)过硫酸钾溶液(2%):20.0g分析纯过硫酸钾溶于双蒸水,定容至1L。
注意:过硫酸钾溶液易被氧化,应避光存放,使用期最多为7d。
(6)磷酸溶液(21%):37ml 85%分析纯浓磷酸与188ml双蒸水混合。
(7)邻苯二甲酸氢钾标准溶液[ρ(C6H4CO2HCO2K)= 1000mg C L-1]:2.1254g分析纯邻苯二甲酸氢钾(称量前先经105℃烘2~3h),溶于双蒸水,定容至1L。
2、仪器设备碳–自动分析仪(Phoenix 8000)、真空干燥器(直径22cm)、水泵抽真空装置(图6–1)或无油真空泵、pH–自动滴定仪、塑料桶(带螺旋盖可密封,体积50L)、可密封螺纹广口塑料瓶(容积1.1L)、高温真空绝缘酯(MIST–3)、烧杯(25、50、80ml)。
土壤微生物群落在生态系统中的样品分析与测定
土壤微生物群落在生态系统中的样品分析与测定土壤是生态系统中非常重要的组成部分,同时也是最为丰富复杂的环境之一。
土壤环境中存在着大量的微生物,这些微生物与土壤之间相互作用,对土壤的物质转化、有机质分解和植物生长等方面具有重要的作用。
如何准确地了解土壤微生物群落的数量和多样性,对于揭示土壤生物学的功能和作用,以及发展生态农业,提高土壤质量和农产品产量等都具有重要意义。
一、土壤微生物群落的样品分析方法为了测定土壤微生物群落,必须进行样品的分析和测定。
在对土壤进行样品分析时,需要注意:1.土壤样品的收集在进行样品分析之前,必须进行土壤样品的收集。
土壤样品应该收集大约20-30厘米深度的土壤。
由于土壤菌群、真菌群和放线菌群在不同土层中的数量和种类也不相同,因此,收集的土壤深度需要根据研究的目的而定。
2.土壤样品的处理一般来说,土壤样品要进行粗碎,去杂质、去石头等处理。
此外,还需去除土壤中的植物残渣、动物排泄物等有机物。
在进行处理时,应该注意不破坏土壤结构和微生物活性。
3.土壤样品的储存土壤样品储存的温度和湿度等条件应根据微生物的生长需求而定。
如果储存时间长,应该对样品进行冷冻或低温干燥处理,以防止微生物的生长。
二、土壤微生物群落测定的方法以下是常用的样品测定方法:1.培养计数法该方法是通过使用培养基和适宜环境条件来促进微生物产生可见的生长。
然后通过计数方法确定细菌的数量。
虽然该方法能够对所有培养细菌进行计数,但是只适用于对可培养细菌群的测定,并且样品测定时间较长。
2.生物分子测定法该方法使用了PCR(多聚酶链式反应)等方法,通过分析土壤中微生物的核酸以及基因来测定微生物数量和多样性。
该方法可以对所有微生物进行分析,但精确度受到PCR扩增的准确度和反应的复杂性影响。
3.牢固偏最小二乘回归分析法(PLS-DA)该方法是通过采集土壤样品,并进行数据处理、筛选,最终运用牢固偏最小二乘回归分析法(PLS-DA)来测定微生物数量和多样性。
土壤微生物数量测定方法
土壤微生物数量测定方法土壤微生物是指生活在土壤中的微小生物,包括细菌、真菌、放线菌、古菌等。
土壤微生物在土壤的生物地球化学循环、有机质分解、养分转换和植物健康等过程中起着重要的作用。
因此,对土壤微生物数量的准确测定具有重要意义。
本文将介绍一些常用的土壤微生物数量测定方法。
1.瓶培法:将适量的土壤样品与适量的培养基混合,在37°C下培养约24小时,然后通过平板计数法或最凼稀释法进行测定。
2.膜过滤法:将土壤提取液通过特定孔径的膜过滤器滤过,然后将膜放置在培养基上进行细菌的生长,最后进行计数。
3.间接法:通过测定土壤样品的可培养细菌指标,如氧化还原酶、脱氢酶等的活性,从而推算出土壤中的细菌数量。
4.分子生物学方法:通过PCR扩增土壤DNA中的细菌基因,如16SrRNA基因,再通过测定PCR产物进行细菌数量的测定。
1.直接镜检法:直接在显微镜下观察土壤样品中的真菌,通过计数来估算真菌的数量。
2.平板计数法:将土壤样品均匀撒在培养基上,通过培养方法使真菌生长形成菌落,最后进行计数。
3.膜过滤法:与细菌数量测定相似,将土壤提取液通过膜过滤器滤过,然后将膜放置在适当的培养基上进行真菌的生长,最后进行计数。
4.分子生物学方法:通过PCR扩增土壤DNA中的真菌基因,如18SrRNA基因,再通过测定PCR产物进行真菌数量的测定。
1.直接镜检法:直接在显微镜下观察土壤样品中的放线菌,通过计数来估算放线菌的数量。
2.平板计数法:将土壤样品均匀撒在培养基上,通过培养方法使放线菌生长形成菌落,最后进行计数。
3.膜过滤法:与细菌和真菌数量测定类似,将土壤提取液通过膜过滤器滤过,然后将膜放置在适当的培养基上进行放线菌的生长,最后进行计数。
4.分子生物学方法:通过PCR扩增土壤DNA中的放线菌基因,如16SrRNA基因,再通过测定PCR产物进行放线菌数量的测定。
通过上述方法测定土壤中微生物的数量,可以了解土壤微生物对土壤生态系统功能的影响,并为土壤质量评价和科学合理利用提供依据。
土壤微生物测定方法
土壤微生物测定方法
目前常用的土壤微生物测定方法主要包括直接计数法、培养法、DNA
分析法和生化方法等。
1.直接计数法:直接计数法是指通过显微镜观察和计数土壤中微生物
的数量。
这种方法简单直观,可以快速测定土壤中微生物的数量。
但是,
由于土壤微生物数量庞大,直接计数方法需要大量的样品和时间,且对操
作者的要求较高。
2.培养法:培养法是指通过将土壤样品接种在富含营养物质的培养基上,并在一定温度和湿度下培养一段时间,通过观察和计数可见的菌落来
测定土壤中微生物的数量和种类。
这种方法可以有效地测定土壤中常见的
细菌和真菌等,但是对于无法培养的微生物种类相对有限。
3.DNA分析法:DNA分析法是指通过提取土壤中微生物的DNA,并通
过PCR扩增和DNA测序等技术来测定土壤中微生物的种类和多样性。
这种
方法可以检测到所有存在的微生物,无论是否可以培养。
因此,DNA分析
法可以更全面地测定土壤中微生物的多样性和种类。
但是,这种方法对实
验条件和技术要求较高。
4.生化方法:生化方法是指通过测定土壤中微生物代谢产物的含量或
活性来测定土壤中微生物的数量。
例如,通过测定脲酶、葡萄糖酶、氧化
还原酶等土壤微生物常见的酶活性来评估微生物的活性和数量。
生化方法
可以快速测定土壤微生物的数量和活性,但是受土壤理化性质的影响较大。
总之,以上所述的方法各有优缺点,可以根据实际情况选择合适的方
法或多种方法相结合来测定土壤微生物的数量和多样性。
此外,测定方法
的选择还要考虑实验所需的样品数量、可行性和经济性等因素。
土壤微生物生物量的测定方法
土壤微生物生物量的测定方法1.直接计数法:直接计数法是通过显微镜观察土壤样品中微生物数量来测定土壤微生物生物量。
常用的直接计数法包括滴定法、薄层计数法和电镜计数法。
滴定法是将土壤样品溶解后,通过滴定法来计数微生物细胞的数量。
滴定法主要包括用荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)作为参比菌,将细菌与土壤样品混合,经一系列稀释后进行滴定。
通过观察滴定液中菌落的数量,可以推算出原始土壤样品中微生物的生物量。
薄层计数法是将土壤样品制成薄层,然后在显微镜下进行计数。
这种方法可以直接观察微生物的形态特征,通过计算单位面积上微生物的数量来估算微生物生物量。
电镜计数法是利用电镜的高分辨率特性,观察土壤样品中微生物的形态和数量。
这种方法可以观察到更小的微生物和微生物的形态细节,但是操作复杂,成本较高。
2.间接测定法:间接测定法通过测定土壤中微生物活性代谢产物来估算微生物生物量。
常用的间接测定法包括ATP测定法、细胞膜脂肪酸测定法和氮素代谢产物测定法等。
ATP测定法是通过测定土壤中的三磷酸腺苷(ATP)含量来估算微生物生物量。
微生物的ATP含量与其生物量有一定的关系,因此可以通过测定ATP含量来间接估算土壤微生物生物量。
细胞膜脂肪酸测定法是通过测定土壤样品中微生物细胞膜中的脂肪酸含量来估算微生物生物量。
微生物细胞膜中的脂肪酸种类和含量与微生物群落的组成和数量有关,因此可以通过测定脂肪酸的含量来间接估算微生物生物量。
氮素代谢产物测定法是通过测定土壤样品中微生物氮素代谢产物的含量来估算微生物生物量。
微生物的氮素代谢活动与其生物量有关,因此可以通过测定氮素代谢产物的含量来间接估算微生物生物量。
3.分子生物学方法:分子生物学方法是利用PCR技术对土壤样品中微生物的DNA或RNA进行扩增和测定来估算微生物生物量。
常用的分子生物学方法包括引物扩增法、荧光原位杂交法和高通量测序法等。
引物扩增法是通过设计特定的引物对微生物的DNA或RNA进行扩增,并通过PCR反应的产物数量来估算微生物生物量。
土壤的微生物检测指标
土壤的微生物检测指标
土壤微生物检测指标主要包括以下几类:
1. 微生物数量指标:主要包括总菌数、细菌数、真菌数、放线菌数等。
这些指标反映了土壤中微生物的数量和多样性。
2. 微生物生物量指标:主要包括微生物生物量碳、微生物生物量氮等。
这些指标反映了土壤中微生物的生物量和活性。
3. 微生物群落结构指标:主要包括微生物群落多样性指数、优势度指数、均匀度指数等。
这些指标反映了土壤中微生物群落的结构和稳定性。
4. 微生物功能指标:主要包括氨氧化菌、硝化菌、反硝化菌、固氮菌、解磷菌、解钾菌等功能菌的数量和活性。
这些指标反映了土壤中微生物的功能和作用。
5. 微生物酶活性指标:主要包括脱氢酶活性、磷酸酶活性、脲酶活性、纤维素酶活性等。
这些指标反映了土壤中微生物的代谢活性和功能。
6. 微生物生态指标:主要包括微生物生态位、微生物生态效率、
微生物生态适应性等。
这些指标反映了土壤中微生物在生态系统中的地位和作用。
7. 微生物污染指标:主要包括病原菌、重金属抗性菌等的数量和种类。
这些指标反映了土壤中微生物对环境和人体健康的潜在风
险。
土壤微生物测定取样方法
土壤微生物测定取样方法
确定土壤微生物的测定取样方法需要考虑以下几个步骤:
1. 确定取样点:根据研究目的和土壤类型选择取样点。
通常应选择代表性地带土壤、若干个深度(如0-10厘米,10-20厘米,20-30厘米等)的土壤样品。
2. 准备工具:取样时需要准备洁净的工具和容器,如无菌铲子、无菌采样袋或无菌容器等,以避免样品受到外界微生物的污染。
3. 取样方法:将土壤取样器或无菌铲子插入土壤中,以尽量保持样品的代表性。
每次采样之前都应彻底清洗工具,以防止交叉污染。
4. 样品处理:将采样的土壤样品放入无菌容器中,并尽快送至实验室进行分析。
如果不能立即送达实验室,样品应存储在低温环境中,以减缓微生物代谢。
在实验室中,测定土壤微生物的方法可以包括土壤微生物生物量、多样性和功能等方面的分析。
需要注意的是,不同类型的土壤微生物所需的取样方法和处理方式可能有所不同,具体的步骤和要求应根据具体研究的需求和方法的要求进行调整。
分离土壤中微生物的方法
分离土壤中微生物的方法土壤中的微生物是土壤生态系统中非常重要的组成部分,对土壤的物质循环、生态功能以及农田生产等都有着重要的影响。
因此,分离土壤中的微生物并进行研究是了解土壤微生物群落结构和功能的重要手段。
下面将介绍一些常用的分离土壤中微生物的方法。
1.稀释涂平法:稀释涂平法是最为常用的一种分离培养微生物的方法。
首先,将土壤样品稀释成一定的浓度;然后,将适量的稀释液均匀地涂布在培养基平板上;最后,将培养基平板的菌落进行分离鉴定。
优点是简单易行,适用于常见的土壤微生物;缺点是只适用于可培养的微生物。
2.筛选技术:筛选技术通过筛选和培养特定类型的微生物,实现对土壤微生物的分离。
常用的筛选技术有选择性培养基筛选、酶基因筛选、菌落形态和色素筛选等。
优点是可以选择性培养其中一类型的微生物;缺点是存在选择性偏倚和培养基有限性。
3.海绵法:海绵法通过悬浮土壤样品,利用海绵吸附和负压吸附的原理,分离土壤中的微生物。
首先,将土壤样品加入海绵中;然后,通过一定的操作将海绵中的微生物分离出来;最后,对分离出的微生物进行鉴定。
优点是可以分离植物根际微生物和陆地微生物;缺点是操作复杂。
4.聚合物链式反应(PCR)和16SrRNA基因测序:PCR和16SrRNA基因测序是一种通过分子生物学手段分离和鉴定微生物的方法。
首先,从土壤中提取微生物的DNA;然后,利用PCR方法扩增16SrRNA基因片段;最后,对扩增产物进行测序并分析。
优点是可以快速分离和鉴定微生物,无需进行培养;缺点是依赖于标准数据库的准确性。
5.激光共聚焦显微镜技术:激光共聚焦显微镜技术可以直接观察土壤中的微生物,并通过分析其形态特征对微生物进行分类和分离。
优点是可以快速直观地观察微生物;缺点是无法进行鉴定和培养。
综上所述,分离土壤中微生物的方法有许多种,分别适用于不同的研究目的和需求。
可以根据具体情况选择适合的方法。
同时,需要注意的是,单一的方法可能无法完全反映土壤微生物多样性,因此最好结合多种方法进行研究,以全面了解土壤中微生物的群落结构和功能。
土壤中微生物的分离与鉴定实验报告
Sdu微生物大实验土壤微生物的分离纯化与鉴定【实验目的】1、从各地区土壤中筛选含几丁质酶的真菌及含果胶酶的菌株;2、通过从土壤中分离纯化菌株,掌握培养基的制备与灭菌技术、微生物的筛选、分离纯化方法和无菌操作技术。
3、复习以前学过的各种染色方法,掌握生理生化试验的原理与方法。
4、掌握微生物的鉴定技术、菌种保藏技术。
【实验原理】1、微生物的分离与纯化:从混杂的微生物群体中获得只含有某一种或某一株微生物的过程称为微生物的分离与纯化。
此次实验采取平板分离法,该方法操作简便,普遍用于微生物的分离与纯化,其基本原理主要包括两个方面:a.选择适合于待分离微生物的生长条件或加入某种抑制剂造成只利于待分离微生物生长,而抑制其它微生物生长的环境,从而淘汰大部分不需要的微生物。
b.微生物在固体培养基上生长形成的单个菌落可以是由一个细胞繁殖而成的集合体,因此可通过挑取单菌落而获得一种纯培养。
获得单菌落的方法可通过稀释涂布平板法或平板划线法等技术来完成。
微生物的观察可以用显微镜观察其细胞形态,也可以用肉眼观察其菌落形态。
前者是微生物的显微镜观察技术,后者是微生物的肉眼观察技术。
2、霉菌:霉菌可产生复什分枝的菌丝体,分基内菌丝和气生菌丝,气生菌丝生长到一定阶段分化产生繁殖菌丝,由繁殖菌丝产生孢子。
霉菌菌丝体(尤其是繁殖菌丝)及孢子的形态特征是识别不同种类霉菌的重要依据。
霉菌菌丝和孢子的宽度通常比细菌和放线菌粗得多(约 3-10μm ),常是细菌菌体宽度的几倍至几十倍,因此,用低倍显微镜即可观察。
观察霉菌的形态有多种方法,常用的有直接制片观察法、载玻片培养观察法和玻璃培养观察法三种方法,本实验采用载玻片培养观察法。
3、果胶酶筛选培养基:配制以果胶为唯一碳源的筛选培养基,在该培养基上,只有能分解利用果胶的菌株才能够生长,依此来从土壤中筛选出能够产果胶酶的菌株。
刚果红(Congo Red,简称CR)是一种染料,它可与果胶形成红色复合物,但并不和果胶水解后的产物发生这种显色反应,在含有果胶的培养基中加入刚果红时,刚果红能与培养基中的果胶形成红色复合物。
土壤微生物测定方案
三,土壤微生物数量(细菌,真菌,放线菌)的测定1 培养方法(1)稀释平板涂抹法具体操作如下:①准确称取10g(精确到0.001)采集的鲜土,倒入装有90 ml 无菌水的500 ml 的三角瓶中,置于往返震荡机上(120r/min,常温),震荡20 min,使土壤充分分散成为土壤悬液。
②将上面的土壤悬液用无菌移液管吸取 5 ml 到45 ml 稀释液中,即为10-2稀释度,依次按10倍法稀释,制成10-1~-~10-6稀释度。
(注意:每次吸取悬液时,在稀释液中反复吸入和吹出3-~5 次,减少因管壁吸附而造成的误差,并使悬液进一步分散,每个稀释度需要更换无菌吸管吸取悬液。
)③根据各类微生物在土壤中的数量多少选择适当稀释度的悬液接种。
本实验选择细菌的稀释度为10-3-~10-5,放线菌为10-2~-10-4,真菌为10-1~-10-3。
④土壤悬液的接种方法:在无菌培养皿中倒入15~20 ml 选择性培养基,待凝固后,用0.2 ml无菌移液枪吸取0.2 ml各稀释度的土壤悬液,然后立即用涂抹棒将悬液均匀的涂抹于培养基表面。
用同一支吸管接种时,从高稀释度开始,依次接种到低稀释度。
⑤接种了土壤悬液的培养皿,平放在超净工作台20~30 min,使得菌液渗透入培养基内,然后倒置于28~-30°C 恒温培养箱中培养一定时间:细菌1~-3 天,放线菌10-~14 天,真菌3~-7 天。
⑥培养结束后,取出培养皿计数。
(2)稀释培养法一系列稀释度的制作与稀释平板法相同。
根据各类微生物在土壤中数量的多少选择适当的稀释度,分别接种1 ml 稀释液与制作好的液体培养基中,根据需要做3~4 次重复,适温培养。
2 三大类土壤微生物培养基的分离三大类土壤微生物的分离采用稀释平板涂抹法,每个菌种要求做 3 个稀释度,每个稀释度做3-4 次重复,选取细菌和放线菌的菌落在20~-200 之间的培养皿、真菌的菌落在10-~100 的培养皿计数,并计算三次重复的平均值。
土壤微生物数量的测定方法
土壤微生物数量的测定方法土壤微生物数量的测定方法是指用来确定土壤中微生物的数量的一系列方法。
微生物在土壤中的数量是影响土壤肥力、健康状态以及生物多样性的主要因素,所以对土壤微生物数量的测定十分重要。
目前,有几种常用的测定土壤微生物数量的方法,包括计数法、分子生物学方法和非分子生物学方法。
一、计数法计数法是目前最常用的测定土壤微生物数量的方法。
该方法通过对样本中的细胞进行数目和形态的观察,来获得关于微生物数量的信息,然后通过计算微生物数量来估计土壤微生物总数。
1. 总体计数法总体计数法是使用显微镜观察和计数样品中的微生物,把检测到的微生物总数乘以一定的系数,就可以估算出土壤中的总微生物数量。
该方法是实时性强,耗时少,易于操作,但是由于细胞大小不一,活性差异大,难以检测到的微生物会影响准确性,因此不能精确测定土壤中的微生物数量。
2. 半定量计数法半定量计数法是通过将土壤样品进行细胞悬液制备,然后用显微镜观察和计数,来估算土壤中的微生物总数。
该方法也是实时性强,耗时少,易于操作,但是由于细胞大小不一,活性差异大,难以检测到的微生物会影响准确性,因此也不能精确测定土壤中的微生物数量。
二、分子生物学方法分子生物学方法是指使用基于DNA或RNA的技术来测定土壤中的微生物数量的方法。
目前,常用的分子生物学方法有PCR方法、qPCR方法、FISH方法、DGGE方法和pyrosequencing方法。
1. PCR方法 PCR方法是使用聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction, PCR)技术来检测土壤中的微生物数量的方法。
PCR方法可以快速检测出土壤中的微生物,但它不能检测出细菌的种类。
2. qPCR方法 qPCR方法是使用定量聚合酶链反应(Quantitative Polymerase Chain Reaction, qPCR)技术来检测土壤中的微生物数量的方法。
qPCR技术可以检测出微生物的种类,并且可以准确测定土壤中的微生物数量。
土壤微生物生物量的测定方法
土壤微生物生物量的测定方法土壤微生物生物量是衡量土壤生态系统功能的重要指标之一、测定土壤微生物生物量可以帮助我们了解土壤生态系统的活跃度和健康状况,进而指导土壤环境修复以及农田生产管理。
氯仿熏蒸法是一种常用的测定土壤微生物生物量的方法,本文将对该方法进行详细介绍。
首先,介绍氯仿熏蒸法的原理。
氯仿是一种广谱杀菌剂,可以破坏土壤中的微生物细胞膜,使微生物失去活性。
在测定土壤微生物生物量时,将土壤样品放置在含有适量氯仿的密闭容器中,通过熏蒸的方式杀灭土壤中的活性微生物。
熏蒸时间通常为24小时。
然后,通过测定氯仿熏蒸前后土壤中可溶性氮的浓度差异,计算出土壤微生物生物量。
其次,介绍氯仿熏蒸法的操作步骤。
首先,将采集到的土壤样品通过筛网筛选除去杂质。
然后,将土壤样品平均分配到已预先称量好的量筒中。
每个量筒中的土壤样品重量应保持一致。
为了保证测定的准确性,通常会设置重复样品。
接下来,在密闭容器的底部放置氟化钾和含有适量氯仿的吸附剂。
然后,将装有土壤样品的量筒设置在容器的顶部,将密闭容器封闭并在室内温度下进行熏蒸。
熏蒸时间通常为24小时。
熏蒸结束后,取出含有氯仿的吸附剂,并将土壤样品离心以去除残余的溶液。
最后,用适量的蒸馏水冲洗残留在土壤样品中的溶解态氮,并测定冲洗液中溶解态氮的浓度。
最后,介绍氯仿熏蒸法的数据分析和结果解释。
首先,通过测定熏蒸前后土壤样品中可溶性氮的浓度差异,计算出土壤微生物生物量。
常用的计算公式为:其中,溶液体积为冲洗液的体积,土壤样品质量即为放置在量筒中土壤样品的质量。
通过计算,可以得出土壤微生物生物量的结果。
根据测定结果,我们能够了解土壤微生物的数量和活性程度。
较高的土壤微生物生物量通常表示土壤中的微生物丰富多样且活跃,土壤生态系统功能较好。
而较低的土壤微生物生物量则提示土壤中微生物数量和活性较低,土壤生态系统功能受到一定程度的抑制。
因此,通过氯仿熏蒸法测定土壤微生物生物量,可以为土壤环境修复和农田生产管理提供科学依据。
土壤微生物生物量的测定方法氯仿熏蒸
土壤微生物生物量的测定方法氯仿熏蒸氯仿熏蒸法是一种在实验室中用氯仿处理土壤样品,然后测定氯仿处理前后土壤微生物生物量差异的方法。
通过加入氯仿,能够杀死土壤中的微生物,从而减少微生物的数量,然后利用一些生物学或化学方法来测定残留的微生物生物量。
氯仿熏蒸法的步骤如下:1.准备土壤样品:将采集到的土壤样品经过干燥和破碎,使其能够尽可能均匀地参与后续的熏蒸过程。
2.加入氯仿溶液:将准备好的土壤样品分装到烧杯或烧瓶中,加入一定比例的氯仿溶液。
氯仿的浓度一般为10%~30%,取决于土壤类型和研究目的。
3.熏蒸土样:将装有土壤和氯仿溶液的容器密封,熏蒸一定的时间。
通常熏蒸时间为24~48小时。
4.蒸发氯仿:打开容器,在通风条件良好的环境中将氯仿挥发,一直蒸发到气味完全消失。
5.提取微生物细胞:将氯仿处理后的土壤样品用适当的提取剂提取,以从土壤中提取微生物细胞。
6.测定微生物生物量:使用适当的方法,如直接计数法、生物量焦磷酸法或基于生物标记物的测定法,来测定氯仿处理前后土壤样品中微生物生物量的差异。
氯仿熏蒸法的优点是操作简单、成本低廉,并且对土壤样品中的细菌、真菌和原生动物等各类微生物都具有较好的破壁效果,能够有效地杀灭土壤中的微生物。
同时,氯仿处理还可以去除土壤样品中的有机物质,从而减少后续测定中的干扰。
然而,氯仿熏蒸法也存在一些局限性。
首先,由于氯仿是一种有机溶剂,熏蒸过程中可能对土壤样品的结构和性质造成一定的改变。
其次,氯仿处理只能杀灭土壤中的微生物,对于土壤中的其他生物物种如线虫、螨虫等则不具备同样的杀灭效果。
此外,氯仿熏蒸法只能提供微生物生物量的总量信息,无法区分不同类群的微生物。
总结起来,氯仿熏蒸法是测定土壤微生物生物量的一种常用方法,其操作简便、费用低廉,且能够有效地杀灭土壤中的微生物。
但需要注意的是,在实际应用中要综合考虑其局限性,并根据研究目的选择合适的测定方法。
土壤微生物量及土壤酶活性测定方法
土壤微生物量及土壤酶活性测定方法土壤中的微生物是维持土壤生态系统健康的重要组成部分,土壤酶活性则可以作为评价土壤肥力和生物活性的重要指标。
因此,在土壤微生物量和土壤酶活性测定方面的研究非常重要。
本文将介绍几种常用的土壤微生物量和土壤酶活性的测定方法。
一、土壤微生物量测定方法1.铺平法:将土壤样品铺平在玻璃板上,使用显微镜对土壤中的微生物进行直接观察和计数。
这种方法的优点是简单易行,但需要大量的时间和人力。
2.累积碳法:通过测定土壤中的有机碳含量来间接估算土壤微生物量。
有机碳水平与微生物量密切相关,所以可以通过测定土壤中的有机碳来推测微生物的数量和活性。
3.培养法:将土壤样品接种到适当的培养基上进行培养,然后通过菌落计数或直接计数来估算微生物的数量。
这种方法适用于数量较多的微生物,如细菌和真菌。
4.傅里叶变换红外光谱法(FTIR):通过测量土壤样品的傅里叶变换红外光谱,分析土壤中的微生物量。
该方法具有快速、准确、非破坏性等优点。
1.浊液法:通过观察测定液中的混浊度来测定土壤中的脲酶、过氧化氢酶等氧化酶的活性。
这种方法简单易行,但对于不同种类的土壤酶效果不一样。
2.比色法:采用酶底物与酶催化产物之间的化学反应,通过测定反应产物的颜色来估算土壤酶活性。
比色法可以用于测定脱氢酶、脱氢酶、脱氧核苷酸酶等酶的活性。
3.荧光法:将有机物和荧光试剂一起加入土壤样品中,经过反应后,在荧光分析仪中测定产生的荧光强度来测定土壤酶的活性。
荧光法适用于测定蔗糖酶、酚氧化酶和脱氢酶等酶的活性。
4.比浊法:通过加入酶底物后,观察土壤样品的混浊度来测定土壤中酶的活性。
比浊法适用于黄酶、脱氢酶等酶的活性测定。
5.电导法:通过测定土壤样品溶液中的电导率变化来估算土壤中酶的活性。
电导法适用于磷酸酶和脱氢酶等酶的活性测定。
总结起来,土壤微生物量和土壤酶活性的测定方法多种多样,选择合适的方法需要考虑样品特性和实验条件等因素。
每种方法都有其优点和局限性,研究者应根据需要选取合适的方法进行测定。
土壤微生物功能基因丰度检测方法
土壤微生物功能基因丰度检测方法一、土壤样本采集土壤样本采集是微生物功能基因丰度检测的第一步,需要选取具有代表性的土壤样品。
采集时应避免人为因素对土壤微生物群落的影响,同时注意保持土壤的原有结构和活性。
采集后的土壤样品应立即进行保存,以避免微生物群落的改变。
二、基因提取基因提取是微生物功能基因丰度检测的重要环节,主要目标是提取出土壤微生物的基因组DNA。
在这一步,需要采用有效的DNA提取试剂盒,按照试剂盒的操作说明进行操作,以保证基因提取的质量和效率。
三、基因扩增基因扩增是通过PCR技术,将特定的基因片段进行扩增的过程。
在此步骤中,需要根据所检测的微生物功能基因设计特异性引物,以便对目标基因进行选择性扩增。
同时,要控制好PCR反应的条件,确保扩增的准确性和特异性。
四、测序分析测序分析是对扩增后的基因片段进行序列测定,以获得目标基因的准确序列。
目前常用的测序技术包括Sanger测序和下一代测序(NGS)技术。
NGS技术具有高通量、高灵敏度等优点,适合对大量样本进行测序分析。
五、数据处理与丰度计算数据处理是对测序得到的原始数据进行处理和清洗,去除低质量的数据和噪音。
随后,根据特定的算法和计算模型,对目标基因的丰度进行定量分析。
这一步骤中,可以采用一些生物信息学软件和工具,如QIIME、PICRUSt等。
六、结果解读与报告结果解读是根据丰度计算的结果,对土壤中微生物功能基因的分布和丰度进行解释和分析。
在报告中,需要详细说明检测方法、数据分析和解读过程,并给出明确的结论。
同时,要结合实际情况,对微生物功能基因的生态学意义进行阐述。
七、质量控制与误差分析为保证检测结果的准确性和可靠性,需要进行严格的质量控制和误差分析。
这包括对实验过程的监控、重复实验的验证以及对不同实验结果的分析和比较。
通过质量控制和误差分析,可以及时发现并纠正实验中的问题,提高检测结果的可靠性。
八、生物信息学分析生物信息学分析是对测序得到的基因序列进行系统的分析和解释。
土壤微生物生物量的测定(滴定法)
土壤微生物生物量(碳、氮)的测定(滴定法)一、实验目的和内容土壤微生物生物量是指土壤中体积小于5~10μm3活的微生物总量,是土壤有机质中最活跃的和最易变化的部分。
耕地表层土壤中,土壤微生物量碳(Bc)一般占土壤有机碳总量的3%左右,其变化可直接或间接地反映土壤耕作制度和微生物肥力的变化,并可以反映土壤污染的程度。
近30年来,国外许多学者对土壤微生物生物量的测定方法进行了比较系统的研究,但由于土壤微生物的多样性和复杂性,还没有发现一种简单、快速、准确、适应性广的方法。
目前广泛应用的方法包括:氯仿熏蒸培养法(FI)、氯仿熏蒸浸提法(FE)、基质诱导呼吸法(SIR)、精氨酸诱导氨化法和三磷酸腺苷(ATP)法。
氯仿熏蒸浸提法(FE)的原理是:土壤经氯仿熏蒸处理,微生物被杀死,细胞破裂后,细胞内容物释放到土壤中,导致土壤中的可提取碳、氨基酸、氮、磷和硫等大幅度增加。
通过测定浸提液中全碳的含量可以计算土壤微生物生物量碳。
二、实验材料和用具仪器:培养箱;真空干燥器;真空泵;往复式振荡机(速率200次每min);1L广口玻璃瓶;定量滤纸;紫外分光光度计;LNK-872型消煮炉(江苏省宜兴市科教仪器研究所)试剂:1.无乙醇氯仿:市售的氯仿都含有乙醇(作为稳定剂),使用前必须除去乙醇。
方法为:量取500ml氯仿于1000ml 分液漏斗中,加入50ml硫酸溶液[ρ(H2SO4)=5%],充分摇匀,弃除下层硫酸溶液,如此进行3次。
再加入50ml去离子水,同上摇匀,弃去上部的水分,如此进行5次。
将下层的氯仿转移存放在棕色瓶中,并加入约20g无水K2CO3,在冰箱的冷藏室中保存备用。
2.硫酸钾溶液[c(K2SO4)=0.5mol·L-1]称取硫酸钾(K2SO4,化学纯)87.10g,先溶于300ml去离子水中,加热,转移溶液至容器中,再加少量去离子水溶解余下的部分,转移溶液至同一容器中,如此反复多次。
最后定容至1L;3.重铬酸钾[c(1/6 K2Cr2O7)=0.4000mol·L-1]:称取经130℃烘干2~3h的重铬酸钾(K2Cr2O7,分析纯)19.622g,溶于1000ml去离子水中;4.邻啡罗啉亚铁指示剂:称取邻啡罗啉(C12H8N2H2O,分析纯)1.49g,溶于含有0.70gFeSO4·7H2O的100ml 去离子水中,密闭保存于棕色瓶中;5.硫酸亚铁溶液[c(FeSO4·7H2O)=0.0667mol·L-1]:称取硫酸亚铁(FeSO4·7H2O,化学纯)18.52g,溶解于600ml~800ml去离子水中,加浓硫酸(化学纯)15ml,搅拌均匀,定容至1000ml,于棕色瓶中保存。
土壤微生物实验报告
土壤微生物实验报告一、实验背景土壤是地球上生命存在的重要基础之一,其中栖息着丰富多样的微生物群落。
这些微生物在土壤的生态系统中发挥着至关重要的作用,如养分循环、有机物分解、土壤结构形成等。
了解土壤微生物的种类、数量和活性对于评估土壤质量、生态平衡以及农业可持续发展具有重要意义。
二、实验目的本实验旨在探究不同土壤类型中微生物的数量和种类差异,以及环境因素对土壤微生物群落的影响。
三、实验材料与方法(一)实验材料1、采集自不同地点的土壤样本,包括农田、森林、草地等。
2、培养基:牛肉膏蛋白胨培养基(用于细菌培养)、马丁氏培养基(用于真菌培养)、高氏一号培养基(用于放线菌培养)。
3、实验仪器:无菌操作台、恒温培养箱、显微镜、移液器、灭菌锅等。
(二)实验方法1、土壤样本采集选择具有代表性的采样地点,使用无菌采样工具采集表层(0 20 厘米)土壤,每个地点采集多个重复样本。
将采集的土壤样本放入无菌袋中,标记好采样地点和时间,迅速带回实验室进行处理。
2、微生物的分离与培养称取一定量的土壤样本,加入无菌水制成土壤悬液。
通过系列稀释法将土壤悬液稀释至合适的浓度。
分别取不同稀释度的悬液涂布于相应的培养基上,每个稀释度设置多个重复。
将涂布好的培养基倒置放入恒温培养箱中培养,细菌培养温度为 37℃,培养时间为 1 2 天;真菌培养温度为 28℃,培养时间为 3 5 天;放线菌培养温度为 28℃,培养时间为 5 7 天。
3、微生物的计数与鉴定培养结束后,对培养基上的菌落进行计数,并根据菌落的形态、颜色、大小等特征初步判断微生物的种类。
选取典型的菌落进行进一步的显微镜观察和生理生化实验,以确定微生物的种类。
四、实验结果(一)不同土壤类型中微生物的数量在农田土壤中,细菌数量最多,其次是放线菌,真菌数量相对较少。
在森林土壤中,真菌的数量相对较多,细菌和放线菌的数量相对较少。
草地土壤中的微生物数量介于农田和森林土壤之间。
(二)微生物的种类通过显微镜观察和生理生化实验,鉴定出了多种细菌、真菌和放线菌。
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农田土壤中微生物的检测01农田土壤中微生物的检测及探究;摘要:土壤微生物是土壤的重要组成部分,其群落结构;土壤的质量,是土壤生态系统稳定性的重要指示因子;Microbiologyinthesoilisa;关键词:农田土壤微生物检测展望;土壤微生物是生态系统的重要组成部分,其数量和种类;材料和方法1)材料;1.1仪器和其他用品三角烧瓶培养皿,吸管试管涂布;1.2培养基牛肉膏蛋白胨培养基农田土壤中微生物的检测及探究摘要:土壤微生物是土壤的重要组成部分,其群落结构多样性及变化在一定程度上反映了土壤的质量,是土壤生态系统稳定性的重要指示因子。
通过对农田土壤中微生物的检测,了解农田中微生物的多样性,并从生态功能方面阐述了土壤微生物多样性的作用,并探讨其发展前景。
Microbiology in the soil is a important part of the soil . The diversity and chang eable of its community reflect the quality of the soil to some extend .It is the import ant factor of the soil’steady .we can know the diversity of soil by detect the farmlan d’soil .and account the function of the microbiology from the aspect of ecology. Final ly ,we researched the future of microbiology.关键词:农田土壤微生物检测展望土壤微生物是生态系统的重要组成部分, 其数量和种类受耕作制度、地理位置、土壤层次、植被、土壤肥力、气候变化及土壤类型等诸多因素的影响, 在土壤环境中起着重要作用。
微生物在土壤中的数量、分布与活动情况, 反应了土壤肥力的高低。
不同的土地利用方式导致土壤环境不同。
农田中含有着许许多多的微生物,千百年来,微生物在默默的为人类服务而不为人知。
了解农田土壤中微生物的种类,从而能够更好的为人类做贡献。
通过不同的培养基对土壤中的微生物进行测定,从未得到微生物的种类,为进一步研究做准备。
土壤微生物多样性多以土壤生物区系的变化和生物化学过程间的相互关系为指示。
土壤微生物多样性研究在探索自然基因资源、开发超常微生物资源、维持生态服务功能、促进土壤可持续利用方面均有重要的意义。
材料和方法 1)材料1.1仪器和其他用品三角烧瓶培养皿,吸管试管涂布棒水浴锅,酒精灯高压灭菌锅恒温培养箱超净工作台等1.2 培养基牛肉膏蛋白胨培养基高氏一号合成培养基查式合成培养基 1.3 材料该研究中采用的土壤取自于宜春学院校门口前面的大片农田中,,采用棋盘法或蛇形取样法采集土壤样品,每个样地采集2个混合土样。
取样时,先除去表层枯叶、表面1 am左右的表土,以避免地面微生物与土样混杂,然后向下取0~15 am土壤,置于无菌自封袋中,带回实验室,当日分析,以免微生物区系组成发生变化。
2)方法采用稀释平板计数法,定量分析土壤细菌、真菌、放线菌数量。
其中,土壤中细菌数量测定采用营养琼脂平板稀释法;真菌数量测定采用虎红琼脂平板稀释法;放线菌数量测定采用高氏1号琼脂平板稀释法。
每个类群设3次重复,选取3个稀释度,分别接种后置无菌培养室培养。
其中,细菌3 7度下培养1 d,真菌28 度下培养4 d,放线菌28度下培养7 d 。
2.1 将装有200ml的蒸馏水的三角瓶,装好培养基的三角瓶,27个培养皿,13只试管,1只1 0ml的移液管放入高温灭菌锅中在121°C中灭菌20min2.2 在超净工作台上,把试管分成2组A B(除一只对照),对应不同的两份土壤。
对试管进行标号,123456。
对土壤稀释成不同的浓度,0.1 ,0.01 , 0.001 , 0.0001 ,0.00001,0.000001. 2.3 点燃酒精灯,把灭好菌的培养基分别加到各自的培养皿中,一种培养基加入9个培养皿,对培养皿进行编号,做最后两个浓度,分别作两个个重复2.4 用移液枪从各试管中分别取100ul加入到各自编好号的培养皿中,然后在培养基上用涂布棒进行涂布,留一个为对照2 结果和分析结果:分析:1)表中有多个为空格的,原因是没有得到结果。
在培养基上出现了一大片一大片的情况,菌落情况不明显,很难分辨出到底为什么微生物。
很有可能是在操作中出现了染菌的情况。
在高压锅杀菌的过程中可以肯定没有问题,因为在规定的温度内进行了20min的杀菌。
分析原因有这几点:1,培养基倒完后没有立即盖上,装培养基的棉塞用后直接放在操作台上,塞子里面与台面有接触。
2,超净工作台没有进行很好的杀菌,可能是时间不够或者是没有密闭杀菌。
3,倒平板时没有靠近酒精灯,导致在空气中染菌。
4,没有用酒精洗干净自己的双手,还残留少量的微生物在手上。
5,没有开单面风,没能把超净工作台里面的微生物给吹走。
6,操作中和同学有说话,把嘴里的微生物给吹到了培养基中。
7,倒好时,没有立即拿到培养箱中,中间有污染的过程。
2)从数据中可以看出农田土壤中含有比较多的微生物,特别是细菌,放线菌,霉菌等。
土壤微生物是土壤有机质转化的执行者,又是植物营养元索的活性库。
可以看出微生物的种类与农田的有机质有很大的关系。
特别是施肥等措施,改变了土壤微生物的组成。
土壤微生物量碳是土壤有机碳的灵敏指示因子.土壤微生物量氮是土壤氮索矿化势的重要组成部分.土壤酶活性在一定程度上表征了植物物质在土壤中的分解特征及添加植物物质后土壤有效养分的变化。
3)土壤微生物量碳是土壤有机碳的灵敏指示因子,土壤微生物量氮是土壤氮素矿化势的重要组成部分。
土壤酶参与土壤的许多重要生物化学过程和物质循环,可以客观地反映土壤肥力状况。
土壤微生物与土壤酶密切相关,土壤酶活性常被作为微生物活性的指示物。
土壤酶对因环境或管理因素引起的变化较敏感,具有时效性,土壤酶活性的高低可以反映土壤养分(尤其是N、P)转化的强弱讨论我国人多地少的现状决定复垦土地最好向着耕地发展,因而最受人们关注的也是耕地复垦。
耕地与土壤微生物关系密切。
土壤是微生物的大本营,1 g沃土中含菌量高达几亿甚至几十亿。
有了微生物,自古以来的动植物尸体才能被分解。
而动植物残体是土壤有机质的主要来源,土壤有机质又是植物养分的主要来源。
它可改善土壤的物理和化学性质,促进耕地质量的提高。
所以我们在改变种子来增加作物产量的同时,也应该把注意力放到土壤上面来,不仅仅是关注土壤的肥力,还需要关注土壤中微生物的含量以及从微生物的分布和含量中得知更多关于他们之间的信息。
从而更好的利用他们,得到更理想的产量。
还有就是从土壤的微生物中得到作物含毒量,从而得到更绿色的食物。
让我们活的更加健康。
微生物的多样性以及作用探究土壤微生物是土壤的重要组成部分,是生态系统中重要的消费者和分解者,其群落结构多样性及变化在一定程度上反映了土壤的质量,是土壤生态系统稳定性的重要指示因子。
土壤微生物多样性是指微生物生命的丰富性及在遗传、种类、生态系统层次上的变化,反映微生物群落的稳定性。
土壤微生物多样性多以土壤生物区系的变化和生物化学过程间的相互关系为指示。
土壤微生物多样性研究在探索自然基因资源、开发超常微生物资源、维持生态服务功能、促进土壤可持续利用方面均有重要的意义。
1 农田土壤微生物多样性的影响因素1.1 土壤类型土壤是土壤微生物的主要生活场所,土壤有机质、矿物质含量、pH、机械组成等理化特征都能影响土壤微生物的种类和数量。
据报道,富含有机质的土壤微生物多样性好于砂土。
我国土壤微生物数量及种类分布较多的为黑土、黑钙土、草田土,而棕钙土、红壤、硅红壤及滨海盐土相对较少。
1.2 耕作方式土壤微生物多样性受耕作方式的影响也比较明显。
免耕土壤中的微生物生物量和多样性比传统耕作土壤中的高。
减少耕作可以增加团聚体,增加微生物多样性。
对微生物的分布也有影响,免耕农业系统中微生物的活动在土层不同深度差异很大,土壤表层的活力最强,而传统耕作系统中耕作层内微生物分布则比较均匀。
1.3 种植制度在维持土壤微生物的多样性及活性方面,轮作种植方式优于采用单一栽培的耕作方式,并且能够提高农作物产量,抑制在单一栽培系统中易产生的有害微生物。
Alvey等研究指出,连续种植的土壤中,谷物的根际能产生较相似的微生物群落,轮作土壤中的微生物群落变异较大。
轮作还能够改善土壤的通气性,有利于自生固氮菌、硝化细菌、氨化细菌等多种微生物数量的增加引。
1.4 植被类型土壤微生物的多样性也间接受到植被类型的影响。
植被的生长发育影响着植物所生长的土壤环境,从而影响到土壤微生物群落的多样性和结构。
植被通过影响土壤通气性、含水量、温度、pH及有机碳和氮的水平而影响土壤中的生物区系,丰富土壤中的微生物种类,进而提高其群落多样性农田土壤中微生物的作用探究土壤微生物多样性的生态作用微生物是地球生物演化进程中的先锋种类,在生物发展进化的初始阶段起着不可替代的作用。
从有机物分解、物质循环和生态安全调控方面看,土壤微生物多样性在生态系统中有3种服务功能。
土壤微生物对有机物的分解作用微生物是生态系统中重要的分解者。
它们分解生物圈内动植物和微生物的残体,还有各种复杂的有机物质,能够吸收某些分解产物,最终将有机物分解成简单的无机物,这些无机物又可以被初级生产者利用,再次参与物质循环。
特别是腐殖质和蜡只有微生物才能分解。
土壤微生物在物质循环中的作用生命物质的主要组成元素(C、N、P、S)的循环主要涉及2个生物过程:光合生物对无机营养物的同化和有机物的生物矿化。
基本所有生物都参与生物地球化学循环,但在有机物的矿化中微生物起着决定性的作用,大多数有机物的矿化均是由微生物完成的。
土壤微生物的生态安全调控机能土壤微生物多样性对生态安全也起着重要的作用。
它有利于保持土壤肥力,防控土传病害,促进农业增产、保障农产品质量。
在修复污染环境方面土壤微生物也起着重要的作用,尤其在土壤修复、水体治理、固废处理等方面表现突出。
利用微生物分解有毒有害物质的生物修复技术是一种有价值的方法,在治理大面积污染区域中的作用效果显著,已被公认。
展望土壤微生物多样性研究是当今较为热门的课题,目前已经取得了长足的进展。
土壤微生物与生物地球化学循环、土壤的生态安全、植物的生产力、农业的可持续发展有着密切的关系,对于缓解人类在粮食、能源、资源和环境等方面的危机均起着重要的作用。
微生物是地球生物化学循环的主要推动者,在生物圈的维持中起中枢作用,鉴于这一作用其可用于环境变化监控和环境污染治理。