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细菌分类环丝菌属(Brochothri)李斯特氏菌属(Literia)(Paenibacillaceae)(Ammoniphilu)(Aneurinibacillu)(Brevib acillu)(Cohnella)(Oalophagu)(Paenibacillu)(Thermicanu)(Thermobac illu)(Planococcaceae)(Filibacter)(Kurthia)(Planococcu)(Planomicrobium)(Sporoarcina)芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae)(Marinococcu)(Sinococcu)芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillu)(Tuberibacillu)葡萄球菌科(Staphylococcaceae)孪生菌属(Gemella)(Joetgalicoccu)(Macrococcu)(Salinicoccu)葡萄球菌属(Staphylococcu)(Thermoactinomycetaceae)(Laceyella) (Mechercharimyce)(Planifilum)(Seinonella)(Shimazuella)(Thermoactinomyce)(Thermoflavimicrobium)(Turicibacteraceae)( Turicibacter)科未定(Pullulanibacillu)乳杆菌目(Lactobacillale)气球菌科(Aerococcaceae)(Abiotrophia)气球菌属(Aerococcu)(Doloicoccu)(Eremococcu)(Facklamia)(Globicatella)(Ignavigran um)肉杆菌科(Carnobacteriaceae)(Agitococcu)(Alkalibacterium)(Allofuti)(Alloi ococcu)(Atopococcu)(Atopotipe)肉杆菌属(Carnobacterium)德库菌属(Deemzia)(DSMZ,德国微生物与细胞保藏中心)(Doloigranulum)(Granulicatella)(Iobaculum)(Lactophaera) (Marinilactibacillu)(Trichococcu)肠球菌科(Enterococcaceae)(Atopobacter)(Catellicoccu)肠球菌属(Enterococcu)(Meliococcu)(Pilibacter)(Tetragenococcu)漫游球菌属(Vagococcu)乳杆菌科(Lactobacillaceae)乳杆菌属(Lactobacillu)(Paralactobacillu)片球菌属(Pediococcu)明串珠菌科(Leuconotocaceae)明串珠菌属(Leuconotoc)(Oenococcu)(Weiella)颤螺旋菌科(Ocillopiraceae)颤杆菌克(Ocillibacter)颤螺旋菌属(Ocillopira)链球菌科(Streptococcaceae)乳球菌属(Lactococcu)(Lactovum)链球菌属(Streptococcu)科未定(Acetoanaerobium)互营球菌属(Syntrophococcu)梭菌纲(Clotridia)梭菌目(Clotridiale)梭菌科(Clotridiaceae)(Acetanaerobacterium)(Acetivibrio)(Acidaminobacte r)(Alkaliphilu)(Anaerobacter)(Anaerotruncu)(Anoynatronum)(Bryant ella)(Caloramator)(Caloranaerobacter)(Caminicella)(Clotridiialibacter)梭菌属(Clotridium)(Coprobacillu)(Dorea) (Ethanoligenen)(Faecalibacterium)(Fatidioipila)(Garciella) (Gracilibacter)(Guggenheimella)(Hepellia)(Natronincola)(Ooba cter)(Paraporobacterium)八叠球菌属(Sarcina)(Soehngenia)(Sporacetigenium)(Sporobacter)(Subdoligranulum)(Tepidibacter )(Tepidimicrobium)(Thermobrachium)(Thermohalobacter)(Tindallia)优杆菌科(Eubacteriaceae)醋杆菌属(Acetobacterium)(Alkalibacter)(Anaerofuti)(Anaerovora)优杆菌属(Eubacterium)(Mogibacterium)(Peudoramibacter)太阳杆菌科(Heliobacteriaceae)太阳杆状菌属(Heliobacillu)太阳杆菌属(Heliobacterium)嗜日菌属(Heliophilum)(Helioreti)毛螺旋菌科(Lachnopiraceae)(Acetitomaculum)(Anaerofilum)(Anaerotipe)丁酸弧菌属(Butyrivibrio)(Catenibacterium)(Catonella)粪球菌属(Coprococcu)(Johnonella)(Lachnobacterium)毛螺旋菌属(Lachnopira)(Moryella)(Oribacterium)假丁酸弧菌属(Peudobutyrivibrio)(Roeburia)瘤胃球菌属(Ruminococcu)(Shuttleworthia)(Sporobacterium)消化球菌科(Peptococcaceae)(Carboydothermu)(Cryptanaerobacter)(Dehalobacter) (Deulfitobacterium)(Deulfonipora)(Deulfoporoinu)(Deulfotomac ulum)(Pelotomaculum)消化球菌属(Peptococcu)(Syntrophobotulu)(Thermincola)(Thermoterrabacterium)消化链球菌科(Peptotreptococcaceae)(Anaerococcu)(Filifactor) (Finegoldia)(Fuibacter)(Gallicola)(Helcococcu)微单胞菌属(Parvimona)(原名Micromona)(Peptoniphilu)消化链球菌属(Peptotreptococcu)(Sedimentibacter)(Sporanaerobacter)(Tiierella)互营单胞菌科(Syntrophomonadaceae)(Aminiphilu)(Aminobacterium)(Aminomona)(Ana erobaculum)(Anaerobranca)(Caldicelluloiruptor)(Carboydocella)(Dethioulfovibrio)(Pelop ora)互营单胞菌属(Syntrophomona)(Syntrophopora)互营热菌属(Syntrophothermu)(Thermaerobacter)(Thermanaerovibrio)(Thermohydr ogenium)(Thermoyntropha)(Thermovirga)韦荣氏菌科(Veillonellaceae)(Acetonema)氨基酸球菌属(Acidaminococcu)(Allionella)(Anaeroarcu)(Anaeroglobu)(Anaeromua) (Anaeroinu)(Anaerovibrio)(Centipeda)(Dendroporobacter)(Dialiter)(Megamona)(Megaphaera)光冈菌属(Mituokella)(Papillibacter)(Pectinatu)(Peloinu)(Phacolarctobacterium)(Propionipira)(Propionipora)(Quinella) (Schwartzia)新月形单胞菌属(Selenomona)鼠孢菌属(Sporomua)(Sporotalea)(Succiniclaticum)(Succinipira)(Thermoinu)韦荣氏菌属(Veillonella)(Zymophilu)科未定(Anaerovirgula)(Dethioulfatibacter)(Geoporobacter)(Howardella)(Proteiniboru)盐厌氧菌目(Halanaerobiale)盐厌氧菌科(Halanaerobiaceae)盐厌氧菌属(Halanaerobium)(Halocella)(Haloincola)(Halothermothri)盐拟杆菌科(Halobacteroidaceae)(Acetohalobium)(Halanaerobacter)盐拟杆菌属(Halobacteroide)(Halonatronum)(Natroniella)(Orenia) (Selenihalanaerobacter)(Sporohalobacter)盐碱厌氧菌目(Natranaerobiale)盐碱厌氧菌科(Natranaerobiaceae)盐碱厌氧菌属(Natranaerobiu)热厌氧杆菌目(Thermoanaerobacteriale)热厌氧杆菌科(Thermoanaerobacteriaceae)(Acetogenium)(Ammonife)(Caldanaerobacter)(Carboydibrachium)(Coprothermobacter)(Deulfovirgula)(Gelria) (Mahella)(Moorella)(Sporotomaculum)(Tepidanaerobacter)(Thermacetogenium)热厌氧单胞菌属(Thermanaeromona)(Thermoanaerobacter)(Thermoanaerobium) (Thermoanaerobacterium)热厌氧菌属(Thermoanaerobium)(Thermobacteroide)(Thermoediminibacter)(Thermo venabulum)热脱硫菌科(Thermodeulfobiaceae)热脱硫菌属(Thermodeulfobium)目未定(Deulfitibacter)(Symbiobacterium)热石杆菌纲(Thermolithobacteria)热石杆菌目(Thermolithobacterale)热石杆菌科(Thermolithobacteraceae)热石杆菌属(Thermolithobacter)梭杆菌门(Fuobacteria)梭杆菌纲(Fuobacteria)梭杆菌目(Fuobacteriale)梭杆菌科(Fuobacteriaceae)梭杆菌属(Fuobacterium)(Ilyobacter)纤毛菌属(Leptotrichia)(Propionigenium)(Sebaldella)(Sneathia) (Streptobacillu)科未定(Cetobacterium)芽单胞菌门(Gemmatimonadete)芽单胞菌纲(Gemmatimonadete)芽单胞菌目(Gemmatimonadale)芽单胞菌科(Gemmatimonadaceae)芽单胞菌属(Gemmatimona)黏胶球形菌门(Lentiphaerae)黏胶球形菌纲(Lentiphaerae)黏胶球形菌目(Lentiphaerale)黏胶球形菌科(Lentiphaeraceae)黏胶球形菌属(Lentiphaera)食物谷菌目(Victivallale)食物谷菌科(Victivallaceae)食物谷菌属(Victivalli)硝化螺旋菌门(Nitropirae)硝化螺旋菌纲(Nitropira)硝化螺旋菌目(Nitropirale)硝化螺旋菌科(Nitropiraceae)钩端螺菌属(Leptopirillum)硝化螺旋菌属(Nitropira)磁杆菌属(Magnetobacterium)热脱硫弧菌属(Thermodeulfovibrio)浮霉菌门(Planctomycete)浮霉菌纲(Planctomycetacia)浮霉菌目(Planctomycetale)浮霉菌科(Planctomycetaceae)(Blatopirellula)(Gemmata)(Iophaera)小梨形菌属(Pirellula)浮霉菌属(Planctomycete)红小梨形菌属(Rhodopirellula)(Schleneria)科未定(均未能分离培养,见厌氧氨氧化菌)(Brocadia)(Kuenenia)(Scalindua)海绵杆菌门(Poribacteria)变形菌门(Proteobacteria)α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)柄杆菌目(Caulobacterale)柄杆菌科(Caulobacteraceae)(Aticcacauli)短波单胞菌属(Brevundimona)柄杆菌属(Caulobacter)苯基杆菌属(Phenylobacterium)(Kordiimonadale)(Kordiimonadaceae)(Kordiimona)短小盒菌目(Parvularculale)短小盒菌科(Parvularculaceae)短小盒菌属(Parvularcula)根瘤菌目(Rhizobiale)橙单胞菌科(Aurantimonadaceae)橙单胞菌属(Aurantimona)(Fulvimarina)(Martelella)巴通体科(Bartonellaceae)巴通体属(Bartonella)(Grahamella)(Rochalimaea)拜叶林克氏菌科(Beijerinckiaceae)拜叶林克氏菌属(Beijerinckia)(Chelatococcu)(Methylocapa)(Methylocella)慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)阿菲波菌属(Afipia)农单胞菌属(Agromona)(Balneimona)芽生杆菌属(Blatobacter)(Boea)慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)硝化杆菌属(Nitrobacter)(Oligotropha)(Rhodoblatu)红假单胞菌属(Rhodopeudomona)布鲁氏菌科(Brucellaceae)布鲁氏菌属(Brucella)(Crabtreella)(Daeguia)支动菌属(Mycoplana)苍白杆菌属(Ochrobactrum)(Peudochrobactrum)黏着杆菌科(Cohaeibacteraceae)黏着杆菌属(Cohaeibacter)生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)(Ancalomicrobium)(Angulomicrobium)水杆菌属(Aquabacter)芽绿菌属(Blatochlori)(Devoia)(Dichotomicrobium)(Filomicrobium)(Gemmiger)生丝微菌属(Hyphomicrobium)(Methylorhabdu)土微菌属(Pedomicrobium)甲基杆菌科(Methylobacteriaceae)(Meganema)甲基杆菌属(Methylobacterium)(Microvirga)(Protomona)甲基孢囊菌科(Methylocytaceae)(Albibacter)甲基孢囊菌属(Methylocyti)(Methylopila)(Methyloinu)(Pleomorphomona)(Teraakiel la)叶杆菌科(Phyllobacteriaceae)(Aminobacter)(Aquamicrobium)(Defluvibacter)( Hoeflea)中慢生根瘤菌属(Meorhizobium)(Nitratireductor)叶杆菌属(Phyllobacterium)(Peudaminobacter)根瘤菌科(Rhizobiaceae)土壤杆菌属(Agrobacterium)异根瘤菌属(Allorhizobium)嗜碳菌属(Carbophilu)螯合杆菌属(Chelatobacter)剑菌属(Enifer)(Kaitia)韧皮杆菌属(Liberibacter)根瘤菌属(Rhizobium)中华根瘤菌属(Sinorhizobium)红菌科(Rhodobiaceae)(Andereniella)(Parvibaculum)红菌属(Rhodobium)玫瑰螺菌属(Roeopirillum)黄色杆菌科(anthobacteraceae)(Ancylobacter)(Azorhizobium)(Labry) (Peudolabry)(Starkeya)黄色杆菌属(anthobacter)科未定(Sneathiella)红杆菌目(Rhodobacterale)生丝单胞菌科(Hyphomonadaceae)(Hirchia)生丝单胞菌属(Hyphomona)(Maricauli)(Oceanicauli)(Robiginitomaculum)红杆菌科(Rhodobacteraceae)(Ahrenia)(Albidovulum)(Amaricoccu)(Antarctobac ter)(Catellibacterium)(Citreicella)(Citreimona)(Dinoroeobacter)( Donghicola)(Gemmobacter)(Haematobacter)(Jannachia)(Ketogulonicigenium)(Labrenzia)(Leiingera)(Loktanella)(Maribiu)(Marinovum)(Maritimibacter)(Methylarcula)(Nereida)(Neiotobacter)(Oceanibulbu)海洋生菌属(Oceanicola)(Octadecabacter)(Palleronia)(Pannonibacter)副球菌属(Paracoccu)(Pelagibaca)(Phaeobacter)假红杆菌属(Peudorhodobacter)(Peudovibrio)(Rhodobaca)红杆菌属(Rhodobacter)(Rhodothalaium)小红卵菌属(Rhodovulum)(Roeibacterium)(Roeibium)(Roeicyclu) (Roeinatronobacter)(Roeialinu)(Roeiviva)玫瑰杆菌属(Roeobacter)(Roeovariu)(Rubellimicrobium)(Rubrimona)(Ruegeria)(Sagittula)(Salipiger )(Shimia)(Silicibacter)(Staleya)(Stappia)(Sulfitobacter)(Tateyamaria)(Thalaobacter)(Thalaobiu)(Thalao coccu)(Thioclava)硫球形菌属(Thiophaera)(Weninia)木洞菌属(Woodholea)杨氏菌属(Yangia)红螺菌目(Rhodopirillale)醋杆菌科(Acetobacteraceae)醋杆菌属(Acetobacter)(Acidicaldu)嗜酸菌属(Acidiphilium)酸球形菌属(Acidiphaera)酸胞菌属(Acidocella)酸单胞菌属(Acidomona)(Aaia)(Belnapia)脆弱球菌属(Craurococcu)葡糖醋杆菌属(Gluconacetobacter)葡糖杆菌属(Gluconobacter)(Granulibacter)(Kozakia)鼠球菌属(Muricoccu)(Neoaaia)(Paracraurococcu)红球状菌属(Rhodopila)(Rhodovariu)玫瑰球菌属(Roeococcu)玫瑰单胞菌属(Roeomona)(Rubritepida)(Saccharibacter)(Stella)(Swaminathania)(Teichococcu)(Zavarzinia)红螺菌科(Rhodopirillaceae)固氮螺菌属(Azopirillum)(Conglomeromona)(Defluviicoccu)(Inquilinu)磁螺菌属(Magnetopirillum)(Phaeopirillum)(Rhodocita)红螺旋菌属(Rhodopira)红螺菌属(Rhodopirillum)红弧菌属(Rhodovibrio)玫瑰螺旋菌属(Roeopira)(Skermanella)(Telmatopirillum)(Thalaopira)(Titrella)立克次体目(Rickettiale)无形体科(Anaplamataceae)(Aegyptianella)无形体属(Anaplama)(Cowdria)埃里希体属(Ehrlichia)新立克次体属(Neorickettia)沃巴赫体属(Wolbachia)(enohalioti)全孢菌科(Holoporaceae)全孢菌属(Holopora)立克次体科(Rickettiaceae)(Orientia)立克次体属(Rickettia)SAR11群远洋杆菌属(Pelagibacter)科未定(Lyticum)(Odyella)(Peudocaedibacter)(Symbiote)(Tectibacter)鞘脂单胞菌目(Sphingomonadale)赤杆菌科(Erythrobacteraceae)(Altererythrobacter)赤杆菌属(Erythrobacter)赤微菌属(Erythromicrobium)紫杆菌属(Porphyrobacter)鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)芽单胞菌属(Blatomona)柠檬酸微菌属(Citromicrobium)赤单胞菌属(Erythromona)新鞘脂菌属(Novophingobium)(Sandaracinobacter)(Sandaracinorhabdu)鞘脂菌属(Sphingobium)鞘脂单胞菌属(Sphingomona)(Sphingopyi)(Sphingoinicella)发酵单胞菌属(Zymomona)目未定(Albimona)(Caenipirillum)(Inolitipirillum)(Novipirillum)β-变形菌纲(Betaproteobacteria)伯克氏菌目(Burkholderiale)产碱菌科(Alcaligenaceae)无色杆菌属(Achromobacter)(Advenella)产碱菌属(Alcaligene)(Azohydromona)博德氏菌属(Bordetella)(Brackiella)(Catellaniela)德克斯氏菌属(Deria)(Kerteria)(Oligella)(Pelitega)(Pigmentiphaga)(Puillimona)(Sutterella)(Taylorella)(Tetrathiobacter)伯克氏菌科(Burkholderiaceae)伯克氏菌属(Burkholderia)(Chitinimona)(Cupriavidu)(Lautropia)(Limnobacter)( Pandoraea)(Paucimona)(Polynucleobacter)青枯菌属(Raltonia)(Thermothri)沃特氏菌属(Wauteria)代尔夫特菌属(Delftia)(Diaphorobacter)(Giebergeria)噬氢菌属(Hydrogenophaga)(Hylemonella)(Lampropedia)(Macromona)(Malikia)(O ttowia)(Pelomona)(Polaromona)(Ramlibacter)红育菌属(Rhodofera)(Schlegelella)(Simplicipira)贪食菌属(Variovora)(enophilu)草酸杆菌科(Oalobacteraceae)(Collimona)(Duganella)(Herbapirillum)(Herminiimona)(Janthinobacterium)(Mailia)(Nai bacter)(Oalicibacterium)草酸杆菌属(Oalobacter)(Telluria)(Undibacterium)科未定(Aquabacterium)(Aquincola)(Ideonella)纤发菌属(Leptothri)(Methylibium)(Mituaria)(Paucibacter)(Roeatele)红长命菌属(Rubriviva)(Sphaerotilu)(Tepidicella)(Tepidimona)(Thiobacter)硫单胞菌属(Thiomona)(ylophilu)嗜氢菌目(Hydrogenophilale)嗜氢菌科(Hydrogenophilaceae)嗜氢菌属(Hydrogenophilu)(Petrobacter)(Tepidiphilu)硫杆状菌属(Thiobacillu)嗜甲基菌目(Methylophilale)嗜甲基菌科(Methylophilaceae)(Methylobacillu)嗜甲基菌属(Methylophilu)(Methylotenera)(Methylovoru)奈瑟菌目(Neieriale)奈瑟菌科(Neieriaceae)(Alyiella)(Andreprevotia)水螺菌属(Aquapirillum)(Aquitalea)(Bergeriella)(Chitinibacter)(Chitinilyt icum)色杆菌属(Chromobacterium)(Conchiformibiu)(Deefgea)艾肯氏菌属(Eikenella)(Formivibrio)(Gulbenkiania)(Iodobacter)金氏菌属(Kingella)鸥杆菌属(Laribacter)(Leeia)(Microvirgula)(Morococcu)奈瑟菌属(Neieria)(Paludibacterium)(Prolinoboru)(Silvimona)(Simoniella)(U ruburuella)(Vitreocilla)(Vogeella)亚硝化单胞菌目(Nitroomonadale)嘉利翁氏菌科(Gallionellaceae)嘉利翁氏菌属(Gallionella)亚硝化单胞菌科(Nitroomonadaceae)亚硝化叶菌属(Nitroolobu)亚硝化单胞菌属(Nitroomona)亚硝化螺旋菌属(Nitroopira)螺菌科(Spirillaceae)螺菌属(Spirillum)普罗卡杆菌目(Procabacteriale)普罗卡杆菌科(Procabacteriaceae)普罗卡杆菌属(Procabacter)红环菌目(Rhodocyclale)红环菌科(Rhodocyclaceae)固氮弓菌属(Azoarcu)(Azoneu)(Azopira)(Azovibrio) (Dechloromona)(Dechlorooma)(Denitratioma)(Ferribacterium)(Me thyloveratili)丙酸杆菌属(Propionibacter)(Propionivibrio)(Quatrionicoccu)红环菌属(Rhodocyclu)(Shinella)(Sterolibacterium)陶厄氏菌属(Thauera)(Uliginoibacterium)动胶菌属(Zoogloea)δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)蛭弧菌目(Bdellovibrionale)(Bacteriovoracaceae)(Bacteriovora)(Peredibacte r)蛭弧菌科(Bdellovibrionaceae)蛭弧菌属(Bdellovibrio)(Micavibrio)(Vampirovibrio)脱硫盒菌目(Deulfarculale)脱硫盒菌科(Deulfarculaceae)脱硫盒菌属(Deulfarculu)脱硫杆菌目(Deulfobacterale)脱硫杆菌科(Deulfobacteraceae)(Deulfatibacillum)(Deulfatiferula)(Deulfatirh abdium)脱硫杆菌属(Deulfobacter)(Deulfobacterium)(Deulfobacula)(Deulfobotulu)(Deul focella)(Deulfococcu)(Deulfofaba)(Deulfofrigu)(Deulfomua)(Deulfo nema)(Deulforegula)(Deulfoarcina)(Deulfopira)(Deulfotignum)(Deul fobulbaceae)(Deulfobulbu)(Deulfocapa)(Deulfofuti)(Deulfopila)(De ulforhopalu)(Deulfotalea)(Nitropinaceae)(Nitropina)脱硫弧菌目(Deulfovibrionale)(Deulfohalobiaceae)(Deulfohalobium)(Deulfonatronovibrio)(Deulfonauticu)(Deulfothermu)(Deulfover miculu)(Deulfomicrobiaceae)(Deulfomicrobium)(Deulfonatronaceae)( Deulfonatronum)脱硫弧菌科(Deulfovibrionaceae)(Bilophila)(Deulfomona)脱硫弧菌属(Deulfovibrio)(Lawonia)硫还原菌目(Deulfurellale)硫还原菌科(Deulfurellaceae)硫还原菌属(Deulfurella)(Hippea)除硫单胞菌目(Deulfuromonadale)除硫单胞菌科(Deulfuromonadaceae)除硫单胞菌属(Deulfuromona)(Deulfuromua)(Malonomona)(Pelobacter)地杆菌科(Geobacteraceae)(Geoalkalibacter)地杆菌属(Geobacter)(Geopychrobacter)(Geothermobacter)(Trichlorobacter)黏球菌目(Myococcale)孢囊杆菌亚目(Cytobacterineae)孢囊杆菌科(Cytobacteraceae)(Anaeromyobacter)(Archangium)孢囊杆菌属(Cytobacter)(Hyalangium)(Melittangium)(Stigmatella)黏球菌科(Myococcaceae)(Angiococcu)(Corallococcu)黏球菌属(Myococcu)(Pyidicoccu)侏囊菌亚目(Nannocytineae)(Haliangiaceae)(Haliangium)(Kofleriaceae)(Kofleri a)侏囊菌科(Nannocytaceae)(Enhygromya)侏囊菌属(Nannocyti)(Pleiocyti)堆囊菌亚目(Sorangineae)多囊菌科(Polyangiaceae)(Byovora)(Chondromyce)(Haploangium)(Jahnella)多囊菌属(Polyangium)堆囊菌属(Sorangium)互营杆菌目(Syntrophobacterale)互营菌科(Syntrophaceae)(Deulfobacca)(Deulfomonile)(Smithella)互营菌属(Syntrophu)互营杆菌科(Syntrophobacteraceae)(Deulfacinum)(Deulfoglaeba)(Deulforhabdu)( Deulfovirga)互营杆菌属(Syntrophobacter)(Thermodeulforhabdu)ε-变形菌纲(Epilonproteobacteria)弯曲菌目(Campylobacterale)弯曲菌科(Campylobacteraceae)弓形杆菌属(Arcobacter)弯曲菌属(Campylobacter)(Dehalopirillum)硫磺单胞菌属(Sulfuropirillum)螺杆菌科(Helicobacteraceae)螺杆菌属(Helicobacter)(Sulfuricurvum)(Sulfurimona)(Sulfurovum)(Thiovulum)沃林氏菌属(Wolinella)氢单胞菌科(Hydrogenimonadaceae)氢单胞菌属(Hydrogenimona)(Nautiliale)(Nautiliaceae)(Caminibacter)(Lebetimo na)(Nautilia)(Nitratifractor)(Nitratiruptor)(Thioreductor)γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)酸硫杆状菌目(Acidithiobacillale)酸硫杆状菌科(Acidithiobacillaceae)酸硫杆状菌属(Acidithiobacillu)热硫杆状菌科(Thermithiobacillaceae)热硫杆状菌属(Thermithiobacillu)气单胞菌目(Aeromonadale)气单胞菌科(Aeromonadaceae)气单胞菌属(Aeromona)(Oceanimona)(Oceaniphaera)(Tolumona)(Zobellella)琥珀酸弧菌科(Succinivibrionaceae)厌氧螺菌属(Anaerobiopirillum)反刍杆菌属(Ruminobacter)琥珀酸单胞菌属(Succinimona)琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)交替单胞菌目(Alteromonadale)交替单胞菌科(Alteromonadaceae)(Aetuariibacter)(Agarivoran)(Alihewanella)交替单胞菌属(Alteromona)(Glaciecola)(Marinimicrobium)海杆菌属(Marinobacter)海细菌属(Marinobacterium)产微球茎菌属(Microbulbifer)(Saccharophagu)(Salinimona)(Colwelliaceae)(Colwel lia)(Thalaomona)(Ferrimonadaceae)(Ferrimona)(Paraferrimona)(Idiomarinaceae)(Idiomarina)(Peudidiomarina)(Moritellaceae)(Moritella)假交替单胞菌科(Peudoalteromonadaceae)(Algicola)假交替单胞菌属(Peudoalteromona)冷单胞菌科(Pychromonadaceae)冷单胞菌属(Pychromona)希万氏菌科(Shewanellaceae)希万氏菌属(Shewanella)科未定(Teredinibacter)(Endobugula)心杆菌目(Cardiobacteriale)心杆菌科(Cardiobacteriaceae)心杆菌属(Cardiobacterium)(Dichelobacter)(Suttonella)着色菌目(Chromatiale)着色菌科(Chromatiaceae)(Allochromatium)(Amoebobacter)着色菌属(Chromatium)盐着色菌属(Halochromatium)(Iochromatium)(Lamprobacter)(Lamprocyti)(Marichr omatium)亚硝化球菌属(Nitroococcu)芬尼氏菌属(Pfennigia)棍着色菌属(Rhabdochromatium)(Rheinheimera)热着色菌属(Thermochromatium)硫碱球菌属(Thioalkalicoccu)硫橄榄菌属(Thiobaca)硫匣菌属(Thiocapa)硫球菌属(Thiococcu)硫囊菌属(Thiocyti)硫网菌属(Thiodictyon)硫黄球菌属(Thioflavicoccu)硫盐匣菌属(Thiohalocapa)(Thiolamprovum)(Thiopedia)硫红球菌属(Thiorhodococcu)硫红弧菌属(Thiorhodovibrio)硫螺菌属(Thiopirillum)外硫红螺旋菌科(Ectothiorhodopiraceae)碱湖生菌属(Alkalilimnicola)碱螺菌属(Alkalipirillum)(Aquialimona)(Arhodomona)(Ectothiorhodoinu)外硫红螺旋菌属(Ectothiorhodopira)盐红螺旋菌属(Halorhodopira)(Natronocella)硝化球菌属(Nitrococcu)硫碱螺旋菌属(Thioalkalipira)硫碱弧菌属(Thialkalivibrio)硫红螺旋菌属(Thiorhodopira)颗粒状球菌科(Granuloicoccaceae)颗粒状球菌属(Granuloicoccu)盐硫杆状菌科(Halothiobacillaceae)盐硫杆状菌属(Halothiobacillu)(Thiovirga)肠杆菌目(Enterobacteriale)肠杆菌科(Enterobacteriaceae)(Arenophonu)(Brenneria)布赫纳氏菌属(Buchnera)(Budvicia)布丘氏菌属(Buttiauella)(Calymmatobacterium)西地西菌属(Cedecea)柠檬酸杆菌属(Citrobacter)(Dickeya)爱德华氏菌属(Edwardiella)肠杆菌属(Enterobacter)欧文氏菌属(Erwinia)埃希氏菌属(Echerichia)(包含大肠杆菌)(Ewingella)哈夫尼菌属(Hafnia)克雷伯氏菌属(Klebiella)克吕沃氏菌属(Kluyvera)(Leclercia)(Leminorella)(Levinea)(Moellerella)(Morganella)(Obeumbacterium)泛菌属(Pantoea)(Pectobacterium)(Phlomobacter)(Photorhabdu)邻单胞菌属(Pleiomona)(Pragia)变形杆菌属(Proteu)普罗维登斯菌属(Providencia)(Rahnella)(Raoultella)糖杆菌属(Saccharobacter)沙门氏菌属(Salmonella)(Samonia)沙雷氏菌属(Serratia)志贺氏菌属(Shigella)(Sodali)(Tatumella)(Thorellia)(Trabuliella)(Wigglewort hia)致病杆菌属(enorhabdu)耶尔辛氏菌属(Yerinia)(包含鼠疫杆菌)(Yokenella)军团菌目(Legionellale)柯克斯体科(Coiellaceae)(Aquicella)柯克斯体属(Coiella)立克次小体属(Rickettiella)军团菌科(Legionellaceae)(Fluoribacter)军团菌属(Legionella)(Sarcobium)(Tatlockia)甲基球菌目(Methylococcale)甲基球菌科(Methylococcaceae)甲基杆菌属(Methylobacter)甲基暖菌属(Methylocaldum)甲基球菌属(Methylococcu)甲基盐菌属(Methylohalobiu)甲基微菌属(Methylomicrobium)甲基单胞菌属(Methylomona)甲基八叠球菌属(Methyloarcina)(Methylooma)甲基球形菌属(Methylophaera)甲基热菌属(Methylothermu)海洋螺菌目(Oceanopirillale)食碱菌科(Alcanivoraceae)食碱菌属(Alcanivora)(Fundibacter)(Kangiella)河氏菌科(Hahellaceae)盐单胞菌科(Halomonadaceae)(Carnimona)色盐杆菌属(Chromohalobacter)(Cobetia)(Deleya)盐单胞菌属(Halomona)(Halotalea)(Halovibrio)(Modicialibacter)(Salicola)(Volcaniella)发酵杆菌属(Zymobacter)岸生菌科(Litoricolaceae)岸生菌属(Litoricola)海洋螺菌科(Oceanopirillaceae)(Amphritea)巴氏发菌属(Balneatri)海单胞菌属(Marinomona)海螺菌属(Marinopirillum)(Neptuniibacter)(Neptunomona)(Nitrincola)海洋杆菌属(Oceanobacter)海洋螺菌属(Oceanopirillum)油螺旋菌属(Oleipira)假螺菌属(Peudopirillum)(Reinekea)(Thalaolituu)嗜油菌科(Oleiphilaceae)嗜油菌属(Oleiphilu)糖螺菌科(Saccharopirillaceae)糖螺菌属(Saccharopirillum)巴斯德氏菌目(Pateurellale)巴斯德氏菌科(Pateurellaceae)放线杆菌属(Actinobacillu)(Aggregatibacter)(Avibacterium)(Biberteinia)(Gall ibacterium)嗜血菌属(Haemophilu)(Hitophilu)(Lonepinella)(Mannheimia)(Nicoletella)巴斯德氏菌属(Pateurella)(Phocoenobacter)(Volucribacter)假单胞菌目(Peudomonadale)莫拉菌科(Moraellaceae)不动杆菌属(Acinetobacter)(Alkanindige)布兰汉氏菌(Branhamella)(Enhydrobacter)莫拉菌属(Moraella)(Perlucidibaca)冷杆菌属(Pychrobacter)假单胞菌科(Peudomonadaceae)(Azomona)(Azomonotrichon)(Azorhizophilu)(Azotobacter)纤维弧菌属(Cellvibrio)(Chryeomona)(Flavimona)(Meophilobacter)假单胞菌属(Peudomona)根瘤杆菌属(Rhizobacter)皱纹单胞菌属(Rugamona)蛇形菌属(Serpen)咸水球形菌目(Saliniphaerale)咸水球形菌科(Saliniphaeraceae)咸水球形菌属(Saliniphaera)硫发菌目(Thiotrichale)(Franciellaceae)(Franciella)鱼立克次体科(Picirickettiaceae)(Cycloclaticu)(Hydrogenovibrio)(Methylophaga)鱼立克次体属(Picirickettia)(Sulfurivirga)(Thioalkalimicrobium)(Thiomicropira)硫发菌科(Thiotrichaceae)无色菌属(Achromatium)贝扎托菌属(Beggiatoa)亮发菌属(Leucothri)硫杆菌属(Thiobacterium)硫珠菌属(Thiomargarita)硫辫菌属(Thioploca)硫螺旋菌属(Thiopira)硫发菌属(Thiothri)科未定(Caedibacter)(Fangia)弧菌目(Vibrionale)弧菌科(Vibrionaceae)(Aliivibrio)异单胞菌属(Allomona)(Beneckea)链状球菌属(Catenococcu)肠弧菌属(Enterovibrio)(Grimontia)(Litonella)(Lucibacterium)发光杆菌属(Photobacterium)(Salinivibrio)弧菌属(Vibrio)黄色单胞菌目(anthomonadale)华杆菌科(Sinobacteraceae)(Hydrocarboniphaga)(Nevkia)华杆菌属(Sinobacter)黄色单胞菌科(anthomonadaceae)水单胞菌属(Aquimona)(Arenimona)(Apromona)(Dokdonella)(Dyella)(Frateuria)(F ulvimona)(Ignatzchineria)(Luteibacter)(Luteimona)(Lyobacter)假黄色单胞菌属(Peudoanthomona)(Rhodanobacter)(Silanimona)(Stenotrophomona)热单胞菌属(Thermomona)黄色单胞菌属(anthomona)(ylella)目未定碱单胞菌属(Alkalimona)(Bowmanella)聚集杆菌属(Congregibacter)(Methylohalomona)(Methylonatrum)(Sedimenticola)( Solimona)(Thiohalomona)(Thiohalophilu)螺旋体门(Spirochaete)螺旋体纲(Spirochaete)螺旋体目(Spirochaetale)短螺旋体科(Brachypiraceae)短螺旋体属(Brachypira)小蛇菌属(Serpulina)钩端螺旋体科(Leptopiraceae)纤线菌属(Leptonema)钩端螺旋体属(Leptopira)(Turneriella)螺旋体科(Spirochaetaceae)疏螺旋体属(Borrelia)(Brevinema)(Clevelandina)(Critipira)(Diplocaly)(Hollan dina)(Pillotina)螺旋体属(Spirochaeta)密螺旋体属(Treponema)柔膜菌门(Tenericute)柔膜菌纲(Mollicute)无胆甾原体目(Acholeplamatale)无胆甾原体科(Acholeplamataceae)无胆甾原体属(Acholeplama)植原体属(Phytoplama)厌氧原体目(Anaeroplamatale)厌氧原体科(Anaeroplamataceae)厌氧原体属(Anaeroplama)无甾醇原体属(Ateroleplama)虫原体目(Entomoplamatale)虫原体科(Entomoplamataceae)虫原体属(Entomoplama)中间原体属(Meoplama)螺原体科(Spiroplamataceae)螺原体属(Spiroplama)支原体目(Mycoplamatale)支原体科(Mycoplamataceae)(Allobaculum)(Eperythrozoon)(Haemobartonella)支原体属(Mycoplama)脲原体属(Ureaplama)目未定丹毒丝菌科(Eryipelothrichaceae)(Bulleidia)丹毒丝菌属(Eryipelothri)(Holdemania)(Solobacterium)热脱硫杆菌门(Thermodeulfobacteria)热脱硫杆菌纲(Thermodeulfobacteria)热脱硫杆菌目(Thermodeulfobacteriale)热脱硫杆菌科(Thermodeulfobacteriaceae)(Thermodeulfatator)热脱硫杆菌属(Thermodeulfobacterium)热微菌门(Thermomicrobia)热微菌纲(Thermomicrobia)热微菌目(Thermomicrobiale)热微菌科(Thermomicrobiaceae)热微菌属(Thermomicrobium)热袍菌门(Thermotogae)热袍菌纲(Thermotogae)热袍菌目(Thermotogale)热袍菌科(Thermotogaceae)(Fervidobacterium)(Geotoga)(Marinitoga)(Petrotoga)(Thermoiph o)(注:正确形式似应为Opituti)丰祐菌目(Opitutale)丰祐菌科(Opitutaceae)交替球菌属(Alterococcu)丰祐菌属(Opitutu)紫红球菌目(Puniceicoccale)紫红球菌科(Puniceicoccaceae)(Ceraicoccu)(Coraliomargarita)(Pelagicoccu)突柄杆菌属(Prothecobacter)(Rubritalea)门未定(Jonquetella)纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)纤线杆菌目(Ktedonobacterale)纤线杆菌科(Ktedonobacteraceae)纤线杆菌属(Ktedonobacter)(Fervidobacterium)(Geotoga)(Marinitoga)(Petrotoga)(Thermoiph o)(注:正确形式似应为Opituti)丰祐菌目(Opitutale)丰祐菌科(Opitutaceae)交替球菌属(Alterococcu)丰祐菌属(Opitutu)紫红球菌目(Puniceicoccale)紫红球菌科(Puniceicoccaceae)(Ceraicoccu)(Coraliomargarita)(Pelagicoccu)突柄杆菌属(Prothecobacter)(Rubritalea)门未定(Jonquetella)纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)纤线杆菌目(Ktedonobacterale)纤线杆菌科(Ktedonobacteraceae)纤线杆菌属(Ktedonobacter)。
细菌的分类及命名
细菌分类学包括分类,命名和鉴定
一.细菌分类:根据细菌各自的特征,并按照亲缘关系分类,以 不同等级编排系统。分类有两种:
1. 细菌的生理生化分类法,包括有传统分类法和数值分类法。 细菌核酸、蛋白质结构的同源程度进行分类法,称种系分类或自然分类。
细菌命名:在分类基础上,给每种细菌一个科学名
01
称,便于交流并保证所有的科研工作者给予同样名
○ 学名用拉丁文,遵循“双名法”。 ○ 每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分组成如:产气荚膜梭菌
(Clostridium perfringens) ○ 属名在前,字首字母要大写,其余小写 ○ 整个属名及种名在出版物中应排成斜体 ○ 中文译名,种名在前,属名在后
二.分类学文献中的细菌拉丁文学名, 属名和种名之后,往往还要加上首次 定名人(加括号)、现名定名人和现 名定名年份,这些均用正体排字。
○ 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种, ○ Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。
如果是新种,在新种的 拉丁文学名之后还要加 上“sp.nov。”,nov 是novel的缩写。
例如Lawsonia intracellularis gen.Nov. sp . Nov., 译为:胞内劳森菌,新 属新种。
○ 一般兽医学及医学微生物学文献中,属名和 种名之后的部分均予省略。
○ 如:Escherichia coli
例如
大肠埃希菌的学名全名是:Escherichia coli(Migula) Castellani et Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为Bacillu coli, Castellani及Chalmers于1919年改为现名。
常见细菌分类
肠杆菌1.肠杆菌属产气肠杆菌、阴沟肠杆菌、聚团肠杆菌、阿斯布肠杆菌、河生肠杆菌生物1群、河生肠杆菌生物2群、中间肠杆菌、格高非肠杆菌、阪崎肠杆菌、泰洛肠杆菌2.埃希菌属大肠埃希菌、福格森氏埃希菌、不活跃大肠埃希菌、伤口大肠埃希菌、赫尔曼氏埃希菌3.沙雷菌属粘质沙雷菌、深红沙雷菌、无花果沙雷菌、泉居沙雷菌、芳香沙雷菌1群、芳香沙雷菌2群、晋城沙雷菌、液化沙雷菌4.克雷伯菌属肺炎克雷伯菌、臭鼻克雷伯菌、鼻硬节克雷伯菌、产酸克雷伯菌、解鸟氨酸克雷伯菌5.变形杆菌属奇异变形杆菌属、普通变形杆菌、潘尼变形杆菌6.普罗威登斯菌属产碱普罗威登菌、斯图普罗威登菌、雷极普罗威登菌、拉氏普罗威登菌7.沙门菌属猪霍乱沙门菌、甲型副伤寒沙门菌、伤寒沙门菌、雏白利沙门菌8.枸橼酸杆菌弗旁地枸橼酸杆菌、异型枸橼酸杆菌、丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌美洲爱文菌10.布特维西菌属水生布特维西菌11.爱德华菌属迟缓爱德华菌、保科爱德华菌12.巴提奥杆菌属乡间巴提奥杆菌13.哈夫尼亚菌属蜂房哈夫菌属14.西地西菌属戴氏西地西菌、拉氏西地西菌、奈氏西地西菌15.摩根菌属摩根摩根菌16志贺菌属志贺菌A,B,C 群、宋内志贺菌17.克吕沃菌属抗坏血酸克吕沃菌、栖冷克吕沃菌不脱羧莱克勒菌19 .默勒菌属威斯康星默勒菌20 拉恩菌属水生拉恩菌21.塔特姆菌属、痰塔特姆菌22.耶尔森菌属假结核耶尔森菌、小结肠炎耶尔森菌、中间耶尔森菌、克氏耶尔森菌、费氏耶尔森菌23.不动杆菌属洛菲不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌、醋酸钙不动杆菌24. 寡养单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌非发酵菌1.假单胞菌属铜绿假单胞菌、荧光假单胞菌、恶臭假单胞菌、施氏假单胞菌、门多萨假单胞菌、产碱假单胞菌、假产碱假单胞菌3.丛毛单胞菌属食酸丛毛单胞菌、睾丸酮丛毛单胞菌4.短波单胞菌属缺陷短波单胞菌、波囊短波单胞菌5.窄食单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌6.产碱杆菌属木糖氧化产碱杆菌反硝化亚种、木糖氧化产碱杆菌木糖氧化亚种、粪产碱杆菌7. 不动杆菌属洛菲不动杆菌、醋酸钙不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌8.黄杆菌属脑膜败血性黄杆菌、芳香黄杆菌、Ⅱb群黄杆菌、产吲哆黄杆菌9.威克斯菌属有毒威克斯菌、动物溃疡威克斯菌10.金色单胞菌属浅黄假单胞菌11.黄色单胞菌属12.弧菌属霍乱弧菌、副溶血弧菌、溶藻弧菌、河流弧菌、创伤弧菌13气单胞菌属嗜水气单胞菌、温和气单胞菌、杀鲑气单胞菌、舒伯特气单胞菌、豚鼠气单胞菌14邻单胞菌属类志贺邻单胞菌15巴斯德菌属多杀巴斯德菌、溶血巴斯德菌16莫拉氏菌属莫拉氏菌17谢瓦纳拉菌属腐败谢瓦纳拉菌.葡萄球菌/微球菌1.葡萄球菌属金黄色葡萄球菌,金黄色葡萄球菌厌氧亚种,表皮葡萄球菌,头葡萄球菌,解糖葡萄球菌,华纳葡萄球菌,溶血葡萄球菌,人葡萄球菌、路邓葡萄球菌、斯莱福葡萄球菌、耳葡萄球菌、腐生葡萄球菌、孔氏葡萄球菌、木糖葡萄球菌、阿莱特葡萄球菌、模仿葡萄球菌、中间葡萄球菌、猪葡萄球菌、缓慢葡萄球菌2. 微球菌属微球菌,易变微球菌,玫瑰微球菌,克里斯汀微球菌链球菌/肠球菌1肠球菌属酪黄肠球菌,粪肠球菌,屎肠球菌,鸟肠球菌,母鸡肠球菌,坚韧肠球菌2.草绿色链球菌属牛链球菌,唾液链球菌,血液链球菌,中间链球菌,缓症链球菌,变异链球菌群3.β溶血链球菌群化脓性链球菌,无乳链球菌,马链球菌,兽瘟链球菌,似马链球菌,停乳链球菌,β溶血链球菌4.咽峡炎链球菌群星座链球菌,咽峡炎链球菌5.孪生球菌属溶血孪生球菌,麻疹孪生球菌6.肺炎链球菌属肺炎链球菌7.气球菌属绿色气球菌真菌1.隐球菌属新型隐球菌,白色隐球菌,罗伦隐球菌,地生隐球菌,指甲隐球菌2.假丝酵母菌属白假丝酵母菌,白色假丝酵母菌生物变种,季也蒙假丝酵母菌,乳酒假丝酵母菌,克柔假丝酵母菌,溶脂假丝酵母菌,葡萄牙假丝酵母菌,近平滑假丝酵母菌、伪热带蒙假丝酵母菌、皱褶假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌、涏沫假丝酵母菌3.酵母属酿酒酵母菌4.丝孢酵母属白吉利丝孢酵母菌5.地霉属白地霉菌6.红酵母属粘红酵母菌,深红酵母菌7.毛孢子菌属白杰尔毛孢子菌8.地丝菌属念珠地丝菌。
(完整版)常见细菌分类
肠杆菌1.肠杆菌属产气肠杆菌、阴沟肠杆菌、聚团肠杆菌、阿斯布肠杆菌、河生肠杆菌生物1群、河生肠杆菌生物2群、中间肠杆菌、格高非肠杆菌、阪崎肠杆菌、泰洛肠杆菌2.埃希菌属大肠埃希菌、福格森氏埃希菌、不活跃大肠埃希菌、伤口大肠埃希菌、赫尔曼氏埃希菌3.沙雷菌属粘质沙雷菌、深红沙雷菌、无花果沙雷菌、泉居沙雷菌、芳香沙雷菌1群、芳香沙雷菌2群、晋城沙雷菌、液化沙雷菌4.克雷伯菌属肺炎克雷伯菌、臭鼻克雷伯菌、鼻硬节克雷伯菌、产酸克雷伯菌、解鸟氨酸克雷伯菌5.变形杆菌属奇异变形杆菌属、普通变形杆菌、潘尼变形杆菌6.普罗威登斯菌属产碱普罗威登菌、斯图普罗威登菌、雷极普罗威登菌、拉氏普罗威登菌7.沙门菌属猪霍乱沙门菌、甲型副伤寒沙门菌、伤寒沙门菌、雏白利沙门菌8.枸橼酸杆菌弗旁地枸橼酸杆菌、异型枸橼酸杆菌、丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌9.爱文菌属美洲爱文菌10.布特维西菌属水生布特维西菌11.爱德华菌属迟缓爱德华菌、保科爱德华菌12.巴提奥杆菌属乡间巴提奥杆菌13.哈夫尼亚菌属蜂房哈夫菌属14.西地西菌属戴氏西地西菌、拉氏西地西菌、奈氏西地西菌15.摩根菌属摩根摩根菌16志贺菌属志贺菌A,B,C 群、宋内志贺菌17.克吕沃菌属抗坏血酸克吕沃菌、栖冷克吕沃菌18.莱克勒菌属不脱羧莱克勒菌19 .默勒菌属威斯康星默勒菌20 拉恩菌属水生拉恩菌21.塔特姆菌属、痰塔特姆菌22.耶尔森菌属假结核耶尔森菌、小结肠炎耶尔森菌、中间耶尔森菌、克氏耶尔森菌、费氏耶尔森菌23.不动杆菌属洛菲不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌、醋酸钙不动杆菌24. 寡养单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌非发酵菌1.假单胞菌属铜绿假单胞菌、荧光假单胞菌、恶臭假单胞菌、施氏假单胞菌、门多萨假单胞菌、产碱假单胞菌、假产碱假单胞菌2.伯克霍尔德氏菌属鼻疽伯克霍尔德氏菌、假鼻疽伯克霍尔德氏菌、洋葱伯克霍尔德氏菌、唐菖蒲伯克霍尔德氏菌3.丛毛单胞菌属食酸丛毛单胞菌、睾丸酮丛毛单胞菌4.短波单胞菌属缺陷短波单胞菌、波囊短波单胞菌5.窄食单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌6.产碱杆菌属木糖氧化产碱杆菌反硝化亚种、木糖氧化产碱杆菌木糖氧化亚种、粪产碱杆菌7. 不动杆菌属洛菲不动杆菌、醋酸钙不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌8.黄杆菌属脑膜败血性黄杆菌、芳香黄杆菌、Ⅱb群黄杆菌、产吲哆黄杆菌9.威克斯菌属有毒威克斯菌、动物溃疡威克斯菌10.金色单胞菌属浅黄假单胞菌11.黄色单胞菌属栖稻假单胞菌12.弧菌属霍乱弧菌、副溶血弧菌、溶藻弧菌、河流弧菌、创伤弧菌13气单胞菌属嗜水气单胞菌、温和气单胞菌、杀鲑气单胞菌、舒伯特气单胞菌、豚鼠气单胞菌14邻单胞菌属类志贺邻单胞菌15巴斯德菌属多杀巴斯德菌、溶血巴斯德菌16莫拉氏菌属莫拉氏菌17谢瓦纳拉菌属腐败谢瓦纳拉菌.葡萄球菌/微球菌1.葡萄球菌属金黄色葡萄球菌,金黄色葡萄球菌厌氧亚种,表皮葡萄球菌,头葡萄球菌,解糖葡萄球菌,华纳葡萄球菌,溶血葡萄球菌,人葡萄球菌、路邓葡萄球菌、斯莱福葡萄球菌、耳葡萄球菌、腐生葡萄球菌、孔氏葡萄球菌、木糖葡萄球菌、阿莱特葡萄球菌、模仿葡萄球菌、中间葡萄球菌、猪葡萄球菌、缓慢葡萄球菌2. 微球菌属微球菌,易变微球菌,玫瑰微球菌,克里斯汀微球菌链球菌/肠球菌1肠球菌属酪黄肠球菌,粪肠球菌,屎肠球菌,鸟肠球菌,母鸡肠球菌,坚韧肠球菌2.草绿色链球菌属牛链球菌,唾液链球菌,血液链球菌,中间链球菌,缓症链球菌,变异链球菌群3.β溶血链球菌群化脓性链球菌,无乳链球菌,马链球菌,兽瘟链球菌,似马链球菌,停乳链球菌,β溶血链球菌4.咽峡炎链球菌群星座链球菌,咽峡炎链球菌5.孪生球菌属溶血孪生球菌,麻疹孪生球菌6.肺炎链球菌属肺炎链球菌7.气球菌属绿色气球菌真菌1.隐球菌属新型隐球菌,白色隐球菌,罗伦隐球菌,地生隐球菌,指甲隐球菌2.假丝酵母菌属白假丝酵母菌,白色假丝酵母菌生物变种,季也蒙假丝酵母菌,乳酒假丝酵母菌,克柔假丝酵母菌,溶脂假丝酵母菌,葡萄牙假丝酵母菌,近平滑假丝酵母菌、伪热带蒙假丝酵母菌、皱褶假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌、涏沫假丝酵母菌3.酵母属酿酒酵母菌4.丝孢酵母属白吉利丝孢酵母菌5.地霉属白地霉菌6.红酵母属粘红酵母菌,深红酵母菌7.毛孢子菌属白杰尔毛孢子菌8.地丝菌属念珠地丝菌。
细菌的分类
放线菌、酵母菌与真菌的分类与特点
• 放线菌(Actinomycetes) • 分类:属于放线菌门(Actinomycetes),放线菌纲(Actinomycetales) • 特点:具有分支状菌丝体,需用显微镜观察,具有多种代谢途径,部分放线菌具有致病性,如结核分枝杆菌( Mycobacterium tuberculosis)
生长环境
• 厌氧细菌主要分布在缺氧环境中,如肠道、沼泽、土壤 等 • 厌氧细菌可与其他细菌共生,形成复杂的微生物生态系 统
厌氧细菌的主要类群与代表物种
梭菌科(Clostridiaceae)
• 代表物种:梭状芽孢杆菌(Clostridium)、肉毒梭菌(Clostridium botulinum) 等 • 生理特性:严格厌氧,可产生多种毒素,如肉毒毒素、破伤风毒素等
02 弧菌科(Vibrionaceae)
• 代表物种:霍乱弧菌(Vibrio cholerae)、副溶血性弧 菌(Vibrio parahaemolyticus)等 • 生理特性:好氧或兼性厌氧,代谢多样性,可产生多种 酶和毒素,部分菌种具有致病性
03 嗜血杆菌科(Haemophilusaceae)
生长繁殖方式: 革兰氏阳性细 菌主要通过二 分裂方式进行 生长繁殖,生 长速度较快
革兰氏阳性细菌的主要类群与代表物种
01 链球菌科(Streptococcaceae)
• 代表物种:链球菌(Streptococcus)、乳球菌 (Lactococcus)等 • 生理特性:嗜氧或兼性厌氧,代谢多样性,可产生多种 酶和毒素
细菌分类
⏹G+球菌⏹葡萄球菌属⏹金黄色葡萄球菌-MSSA,MRSA⏹凝固酶阴性葡萄球菌-MSCNS,MRCNS⏹链球菌属⏹化脓链球菌-(b-溶血)⏹草绿色链球菌-(a-溶血)⏹肺炎链球菌(双球菌)⏹粪肠球菌⏹屎肠球菌⏹G+杆菌⏹无芽孢杆菌⏹棒状杆菌-白喉杆菌⏹李斯特菌⏹有芽孢杆菌⏹炭疽杆菌(需氧菌)⏹艰难梭菌(厌氧菌)⏹G-杆菌⏹肠杆菌属:产气、阴沟⏹埃希菌属:大肠埃希菌⏹志贺菌属:痢疾杆菌⏹克雷伯菌属:肺克、产酸克⏹变形菌属:奇异变形杆菌⏹沙门菌属:伤寒、副伤寒沙门菌、肠炎沙门菌⏹沙雷菌属:⏹其它:枸橼酸杆菌属、摩根菌属⏹嗜血杆菌属:流感、副流感嗜血杆菌⏹军团菌属:嗜肺军团菌⏹弯曲杆菌属:空肠、大肠弯曲菌⏹螺旋菌属:幽门螺旋菌⏹弧菌属:霍乱弧菌⏹假单胞属:铜绿假单胞菌、嗜麦芽寡养假单胞菌(嗜麦芽黄单胞菌、嗜麦芽窄食单胞菌)⏹不动杆菌⏹产碱杆菌⏹G-球菌⏹淋病奈瑟菌(淋球菌)⏹脑膜炎奈瑟菌(脑膜炎双球菌)⏹老年患者应用抗生素特点⏹组织器官呈生理性退行性变(肾功能、肝功能)⏹免疫功能也见减退⏹发生不良反应多见,但不典型⏹用药注意事项⏹肾功减退,成人正常剂量,可能造成蓄积→估算肌酐清除率,调整给药方案⏹易发生不良反→选用低毒杀菌剂抗菌药物,毒性大的氨基糖苷类、万古霉素、去甲万古霉素等药物应尽可能避免应用,注意血药浓度监测FDA妊娠期用药分类抗菌药物的分类⏹杀菌剂⏹繁殖期杀菌剂:如青霉素类、头孢菌素类、氟喹诺酮类⏹静止期杀菌剂:如氨基苷类、多粘霉素类⏹抑菌剂⏹快效抑菌剂:如大环内酯类、四环素类、氯霉素类⏹慢效抑菌剂:如磺胺药⏹按抗菌谱⏹窄谱异烟肼、夫西地酸、氨曲南⏹广谱四环素、氟喹诺酮、碳青霉烯类、两性霉素B(此文档部分内容来源于网络,如有侵权请告知删除,文档可自行编辑修改内容,供参考,感谢您的配合和支持)。
食品细菌的分类和鉴定
食品细菌的分类和鉴定
食品细菌可以根据不同的分类方法进行分类和鉴定。
以下是常见的分类方法和鉴定技术:
1. 形态分类:根据细菌的形态特征,如形状、大小和结构等,将细菌分为球形菌(球状、椭圆状)、杆菌(短杆菌、长杆菌)、螺旋菌等。
2. 生理生化分类:根据细菌的生理和生化特性,如营养需求、产生的代谢产物、对环境的适应能力等,将细菌分为革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌,以及其他特定分类。
3. 基于DNA序列的分类:利用细菌基因序列的比较和分析,
如16S rRNA基因序列分析和全基因组测序等,将细菌进行系
统进化分析和分类。
食品细菌的鉴定常用的技术有:
1. 培养和形态学鉴定:通过将细菌分离培养在适宜的富养基上,观察其菌落形态、生长特征、染色性质和形状等,以确定细菌种类。
2. 生理生化鉴定:通过检测细菌的生化酶活性、代谢产物、利用碳源的能力等特性,运用生理生化试剂盒或标准试剂盐评价,进行细菌鉴定。
3. 免疫学鉴定:利用免疫学方法,如免疫沉淀、荧光抗体和酶
标记抗体等,检测细菌的表面抗原、抗体反应和细菌抗原抗体反应,确定细菌的种类。
4. 分子生物学鉴定:利用PCR技术、DNA测序或基因芯片等方法,对细菌的DNA序列进行检测和分析,以获得更准确的细菌鉴定结果。
综合使用这些方法可以对食品细菌进行分类和鉴定,确保食品的安全和卫生。
细菌的生活方式与分类
细菌的生活方式与分类细菌作为生物界中最简单的有机体之一,广泛存在于各个生态系统中,对地球生命的演化和生态平衡起着重要的作用。
本文将探讨细菌的生活方式与分类,深入了解这些微小生物的多样性和适应能力。
一、细菌的生活方式1. 自养细菌自养细菌通过光合作用或化学反应来获取能量和合成有机物质。
光合自养细菌利用光能将二氧化碳和水转化为有机物,并释放氧气。
典型的光合自养细菌包括青藻和细菌类蓝藻。
化学自养细菌则利用无机化合物(如硫化物或氨氮)作为电子供体,进行能量和有机物的合成。
2. 异养细菌异养细菌无法通过光合作用或直接从无机物中获取能量和碳源。
它们依赖于有机物质作为能量来源和碳源,通常在其他生物的周围或内部寄生或共生。
异养细菌可以包括一些致病菌,如结核菌和霍乱弧菌。
3. 极端环境细菌极端环境细菌(又称为古菌)是一类生存在极端环境中的细菌。
它们可以在高温、高压、强酸碱或高盐环境下生存,并拥有独特的代谢途径和酶系统。
极端环境细菌的研究对于我们理解生命的极限和地球生物多样性的演化具有重要意义。
二、细菌的分类细菌的分类是基于细菌的形态、生理特征和遗传信息等方面进行的。
传统上,细菌被分为以下几个主要类群:1. 革兰氏阳性细菌革兰氏阳性细菌的细胞壁结构较为简单,细胞壁属于革兰氏阳性细菌的特征。
这类细菌多数为球状菌,如葡萄球菌和链球菌,也有一些为杆状菌,如炭疽杆菌。
它们在医学、食品工业和生物技术等领域中具有重要的应用价值。
2. 革兰氏阴性细菌革兰氏阴性细菌的细胞壁结构相对复杂,包含外膜和细胞壁的两层膜。
这类细菌构成了细菌界中最多的类群,包括许多人类病原菌,如大肠杆菌和沙门氏菌,以及一些环境细菌,如假单胞菌。
3. 放线菌与真核细胞内共生细菌放线菌是一类特殊的细菌,它们形成复杂的菌丝体结构,并产生多种有机化合物和抗生素。
这些细菌在土壤中起着重要的生态和环境功能。
而真核细胞内共生细菌则居住在其他生物体的细胞内部,并与宿主共生。
细菌的分类和鉴定(2021精选文档)
一、微生物的分类
根据微生物的大小、结构、组成等分三类
原核细胞 如:细菌、放线菌、螺旋体、支原体、 型 衣原体、立克次体。(也称广义的细菌) 如:病毒、亚病毒、朊粒
二、细菌的分类方法
根据每种细菌各自特征,并按照它们的 亲缘关系分类,分类方法有两类
1.生理学与生化学分类法(传统方法)
(二)生理生化特征
包括营养类型、与氧的关系、对温度的适应 性、碳水化合物的代谢试验、蛋白质和氨基酸的 代谢试验及的碳源和氮源利用试验、各种酶类试 验、抑菌试验等等。
生理生化特征特点: 对微生物生理生化特征的比较也是对微生物
基因组的间接比较; 测定生理生化特征比直接分析基因组要容易;
27.生活是公平的,哪怕吃了很多苦,只要你坚持下去,一定会有收获,即使最后失败了,你也获得了别人不具备的经历。 59.生命注定只有一个结果,活好今天才是最重要的。 92.如果你具备开始的勇气,就有了成功的豪情。 68.舞台再大,自己不上台 ,永远是个观众;平台再好,自己不参与,永远是局外人;能力再大,自己不行动,只能看别人成功。只有参与、实干、拼搏的人才会收获! 45.没有一颗珍珠的闪光,是靠别人涂抹上去的。 1.输在犹豫,赢在行动。 51.即使道路坎坷不平,车轮也要前进;即使江河波涛汹涌,船只也航行。 12.你热爱生命吗?那么别浪费时间,因为时间是构成生命的材料。——富兰克林 91.在人生的大海中,我们虽然不能把握风的大小,却可以调整帆的方向。不怕重头再来,就怕没有未来!成功是送给有准备的人,成功是送给有付出的人,相信是成功的开始,让我们携手共进, 创造人生新的辉煌。
1、DNA G+C mol%测定
DNA分子两条链上4种碱基的总分子量 为100,测定其中G+C或A+T摩尔百分比, 能反应出细菌间DNA分子的同源程度,习惯 上以G+C 作为细菌的分类标记。
细菌分类大全
革兰氏阳性菌革兰氏阳性菌革兰氏染色法的意义就在于鉴别细菌,把众多的细菌分为两大类,革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。
大多数化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌,它们能产生外毒素使人致病,而大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌,它们产生内毒素,靠内毒素使人致病。
常见的革兰氏阳性菌有:葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等;常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等。
在治疗上,大多数革兰氏阳性菌都对青霉素敏感(结核杆菌对青霉素不敏感);而革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感(但奈瑟氏菌中的流行性脑膜炎双球菌和淋病双球菌对青霉素敏感),而对链霉素、氯霉素等敏感。
所以首先区分病原菌是革兰氏阳性菌还是阴性菌,在选择抗生素方面意义重大。
革兰氏阴性菌,大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌,它们产生内毒素,靠内毒素使人致病.常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等.革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感,可以选择氟喹诺酮类药物如诺氟沙星,左氧氟沙星等,也可以选择大环内酯类比如克拉霉素、罗红霉素等。
革兰氏阳性菌,大多数化脓性球菌都属于革兰氏阳性菌,它们能产生外毒素使人致病,常见的革兰氏阳性菌有:葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。
可以选择青霉素族,头孢曲松钠等。
革兰氏阴性菌,以[大肠杆菌]为代表。
大肠杆菌为兼气性菌种,一般生存于肠道中及厌氧的还境中.革兰氏阴性菌细胞壁的特征为有一层outer membrane 与阳性菌种不同。
目前对大肠杆菌的研究很多,除了它是一般食物中是否有被污染的指标外,很多分子生物学方面的研究皆需要使用到大肠杆菌当作实验宿主。
除了大肠杆菌外,变形杆菌、痢疾杆菌、肺炎杆菌、布氏杆菌、产气夹膜杆菌、流感(嗜血)杆菌、副流感(嗜血)杆菌、卡他(摩拉)菌、不动杆菌属、耶尔森菌属、嗜肺军团菌、百日咳杆菌、副百日咳杆菌、志贺菌属、巴斯德菌属、霍乱弧菌、副溶血性杆菌、类志贺吡邻单胞菌等也是革兰氏阴性菌革兰氏阳性菌与阴性菌常见的革兰氏阳性菌葡萄球菌属,链球菌属,李式杆菌属,丹毒丝菌属,肾杆菌属,芽孢杆菌属,梭菌属,分支杆菌属,放线菌属,奴卡菌属,棒状杆菌属,红球菌属,炭疽杆菌丹毒杆菌破伤风杆菌李氏杆菌产气荚莫杆菌气肿疽杆菌结核杆菌.当然,也少不了哪些是-—常见的革兰氏阴性菌除了大肠杆菌外,变形杆菌、痢疾杆菌、肺炎杆菌、布氏杆菌、产气夹膜杆菌、流感(嗜血)杆菌、副流感(嗜血)杆菌、卡他(摩拉)菌、不动杆菌属、耶尔森菌属、嗜肺军团菌、百日咳杆菌、副百日咳杆菌、志贺菌属、巴斯德菌属、霍乱弧菌、副溶血性杆菌等也是革兰氏阴性菌。
细菌分类
放线菌纲(Actinobacteria)1. 酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)1. 酸微菌目(Acidimicrobiales)1. 酸微菌亚目(Acidimicrobineae)1. 酸微菌科(Acidimicrobiaceae)1. 酸微菌属(Acidimicrobium)2. (Iamiaceae)1. (Iamia)2. 放线菌亚纲(Actinobacteridae)1. 放线菌目(Actinomycetales)1. 放线菌亚目(Actinomycineae)1. 放线菌科(Actinomycetaceae)1. 放线棒菌属(Actinobaculum)2. 放线菌属(Actinomyces)3. 隐秘杆菌属(Arcanobacterium)4. (Falcivibrio)5. 动弯杆菌属(Mobiluncus)6. (Varibaculum)2. (Actinopolysporineae)1. (Actinopolysporaceae)1. (Actinopolyspora)3. (Catenulisporineae)1. (Actinospicaceae)1. (Actinospica)2. (Catenulisporaceae)1. (Catenulispora)4. 棒杆菌亚目(Corynebacterineae)1. 棒杆菌科(Corynebacteriaceae)1. (Bacterionema)2. (Caseobacter)3. 棒杆菌属(Corynebacterium)4. (Turicella)2. 迪茨氏菌科(Dietziaceae)1. 迪茨氏菌属(Dietzia)3. 分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)1. 分枝杆菌属(Mycobacterium) (含结核杆菌)4. 诺卡氏菌科(Nocardiaceae)1. 戈登氏菌属(Gordonia)2. (Micropolyspora)3. (Millisia)4. 诺卡氏菌属(Nocardia)5. 红球菌属(Rhodococcus)6. 斯科曼氏菌属(Skermania)7. (Williamsia)8. (Smaragdicoccus)5. (Segniliparaceae)6. 束村氏菌科(Tsukamurellaceae)1. 束村氏菌属(Tsukamurella)5. 弗兰克氏菌亚目(Frankineae)1. 酸热菌科(Acidothermaceae)1. 酸热菌属(Acidothermus)2. 弗兰克氏菌科(Frankiaceae)1. 弗兰克氏菌属(Frankia)3. 地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)1. 芽球菌属(Blastococcus)2. 地嗜皮菌属(Geodermatophilus)3. (Modestobacter)4. (Kineosporiaceae)1. (Cryptosporangium)2. (Kineococcus)3. (Kineosporia)5. (Nakamurellaceae)1. (Humicoccus)2. (Nakamurella)3. (Quadrisphaera)6. 孢鱼菌科(Sporichthyaceae)1. 孢鱼菌属(Sporichthya)6. 糖霉菌亚目(Glycomycineae)1. 糖霉菌科(Glycomycetaceae)1. 糖霉菌属(Glycomyces)2. (Stackerbrandtia)7. 微球菌亚目(Micrococcineae)1. 获山氏菌科(Beutenbergiaceae)1. 获山氏菌属(Beutenbergia)2. 乔治菌属(Georgenia)3. 萨勒河菌属(Salana)2. 博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)1. 博戈里亚湖菌属(Bogoriella)3. 短杆菌科(Brevibacteriaceae)1. 短杆菌属(Brevibacterium)4. 纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)1. 纤维素单胞菌属(Cellulomonas)2. 厄氏菌属(Oerskovia)3. (Tropheryma)5. (Dermabacteraceae)1. (Brachybacterium)2. (Dermabacter)6. (Dermacoccaceae)1. (Demetria)2. (Dermacoccus)3. (Kytococcus)7. (Dermatophilaceae)2. (Kineosphaera)8. (Intrasporangiaceae)1. (Arsenicicoccus)2. (Humihabitans)3. (Intrasporangium)4. (Janibacter)5. (Knoellia)6. (Kribbia)7. (Lapillicoccus)8. (Ornithinicoccus)9. (Ornithinimicrobium)10. (Oryzihumus)11. (Serinicoccus)12. (Terrabacter)13. (Terracoccus)14. (Tetrasphaera)9. (Jonesiaceae)1. (Jonesia)10. (Microbacteriaceae)1. (Agreia)2. (Agrococcus)3. (Agromyces)4. (Aureobacterium)5. (Clavibacter)6. (Cryobacterium)7. (Curtobacterium)8. (Frigoribacterium)9. (Frondicola)10. (Gulosibacter)11. (Labedella)12. (Leifsonia)13. (Leucobacter)14. (Microbacterium)15. (Microcella)16. (Mycetocola)17. (Okibacterium)18. (Plantibacter)19. (Pseudoclavibacter)20. (Rathayibacter)21. (Rhodoglobus)22. (Salinibacterium)23. (Subtercola)24. (Yonghaparkia)25. (Zimmermannella) 11. 微球菌科(Micrococcaceae)1. (Acaricomes)2. 节杆菌属(Arthrobacter)3. (Citricoccus)4. (Kocuria)5. 微球菌属(Micrococcus)6. (Nesterenkonia)7. (Renibacterium)8. 罗氏菌属(Rothia)9. 口腔球菌属(Stomatococcus)10. 刘志恒菌属(Zhihengliuella)12. (Promicromonosporaceae)1. (Cellulosimicrobium)2. (Isoptericola)3. (Myceligenerans)4. (Promicromonospora)5. (Xylanibacterium)6. (Xylanimonas)13. (Rarobacteraceae)1. (Rarobacter)14. (Sanguibacteraceae)1. 血杆菌属(Sanguibacter)15. (Yaniaceae)1. (Yania)16. 科未定1. (Actinotalea)2. (Demequina)3. (Phycicoccus)4. (Ruania)8. 微单孢菌亚目(Micromonosporineae)1. 微单孢菌科(Micromonosporaceae)1. (Actinocatenispora)2. (Actinoplanes)3. (Amorphosporangium)4. (Ampullariella)5. (Asanoa)6. (Catellatospora)7. (Catenuloplanes)8. (Couchiolanes)9. (Dactylosporangium)10. (Krasilnikovia)11. (Longispora)12. (Luedemannella)13. 微单孢菌属(Micromonospora)14. (Pilimelia)15. (Planopolyspora)16. (Polymorphospora)17. (Salinispora)18. (Spirilliplanes)19. (Verrucosispora)20. (Virgisporangium)9. 丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae)1. (Nocardioidaceae)1. (Actinopolymorpha)2. (Aeromicrobium)3. (Friedmanniella)4. (Hongia)5. (Kribbella)6. (Marmoricola)7. (Micropruina)8. (Nocardioides)9. (Pimelobacter)10. (Propionicicella)11. (Propionicimonas)2. 丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)1. 河口微菌属(Aestuariimicrobium)2. (Arachnia)3. (Brooklawnia)4. (Granulicoccus)5. 江氏菌属(Jiangella)6. (Luteococcus)7. (Microlunatus)8. 丙酸杆菌属(Propionibacterium)9. (Propioniferax)10. (Propionimicrobium)11. (Tessaracocccus)10. (Pseudonocardineae)1. (Actinosynnemataceae)1. (Actinokineospora)2. (Actinosynnema)3. (Lechevalieria)4. (Lentzea)5. (Saccharothrix)6. (Umezawaea)2. (Pseudonocardiaceae)1. (Actinoalloteichus)2. (Actinobispora)3. (Amycolata)4. (Amycolatopsis)5. (Crossiella)6. (Faenia)7. (Goodfellowia)8. (Kibdelosporangium)9. (Kutzneria)10. (Prauserella)11. (Pseudoamycolata)12. (Pseudonocardia)13. (Saccharomonospora)14. (Saccharopolyspora)15. (Streptoalloteichus)16. (Thermobispora)17. (Thermocrispum)11. 链霉菌亚目(Streptomycineae)1. 链霉菌科(Sterptomycetaceae)1. (Actinopycnidium)2. (Actinosporangium)3. (Chainia)4. (Elytrosporangium)5. 北里菌属(Kitasatoa)6. 北里孢菌属(Kitasatospora)7. (Microellobosporia)8. (Streptacidiphilus)9. 链霉菌属(Streptomyces)10. (Streptoverticillium)12. (Streptosporangineae)1. (Nocardiopsaceae)1. (Nocardiopsis)2. (Streptomonospora)3. (Thermobifida)2. (Streptosporangiaceae)1. (Acrocarpospora)2. (Herbidospora)3. (Microbispora)4. (Microtetraspora)5. (Nonomuraea)6. (Planobispora)7. (Planomonospora)8. (Planotetraspora)9. (Sphaerisporangium)10. (Streptosporangium)11. (Thermopolyspora)3. (Thermomonosporaceae)1. 珊瑚状放线菌属(Actinocorallia)2. (Actinomadura)3. (Excellospora)4. (Spirillospora)5. (Thermomonospora)2. 双歧杆菌目(Bifidobacteriales)1. 双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)1. (Aeriscardovia)2. (Alloscardovia)3. 双歧杆菌属(Bifidobacterium)4. (Gardnerella)5. (Metascardovia)6. (Parascardovia)7. (Scardovia)2. 科未定3. (Coriobacteridae)1. (Coriobacteriales)1. (Coriobacterineae)1. (Coriobacteriaceae)1. 奇异菌属(Atopobium)2. (Collinsella)3. (Coriobacterium)4. (Cryptobacterium)5. (Denitrobacterium)6. (Eggerthella)7. (Olsenella)8. (Slackia)4. 红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)1. 红色杆菌目(Rubrobacterales)1. 红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)1. (Conexibacteraceae)1. (Conexibacter)2. (Patulibacteraceae)1. (Patulibacter)3. 红色杆菌科(Rubrobacteraceae)1. 红色杆菌属(Rubrobacter)4. (Solirubrobacteraceae)1. (Solirubrobacter)5. (Thermoleophilaceae)1. (Thermoleophilum)5. 球形杆菌亚纲(Sphaerobacteridae)1. 球形杆菌目(Sphaerobacterales)1. 球形杆菌亚目(Sphaerobacterineae)1. 球形杆菌科(Sphaerobacteraceae)1. 球形杆菌属(Sphaerobacter)。
细菌的分类与命名
一、生物的分类 六界:动物界、植物界、真菌界、
原生生物界、原核生物界、病毒界。 细菌分类层次与其他生物相同,即:
界 、 门 、 纲 、 目 、 科 (Family) 、 属 (Genus)、种(Species)。
二、细菌分类的指征
1. 形态学特性 2. 培养特性
3. 生活方式
(二) 种以下的分类单位
1.亚种(subspecies):种内可能存在一些
在某些性状上相互差异的类别。
2.型(type)与亚型(subtype):仅仅是某一 方面的性状, 如血清型。型内还可按 进一步的性状差异区分为不同亚型。
3.菌株(strain)(品系):是指同种细菌 中不同来源的纯培养物。
2.分子生物学分类法 (种系发生)
1)DNA中G+C摩尔百分数(%)含量测定
(G+C)mol%含量:某一生物 DNA中的 G+C配对碱基按摩尔数计算占全部碱基的 百分数。(反映该生物遗传性能的一种本 质特征)。
测定方法:梯度密度离心法、解链温度法 (Tm)等。
2)DNA或RNA同源性的测定
DNA-DNA杂交试验(hybridization)
未确定种名的细菌命名 :在属名后加 上sp.或spp.。
新种的命名:在学名之后加注sp. nov. (novo species)。
亚种的命名:subsp.
4. 生理生化特性
5. 抗原构造
6. 对噬菌体的敏感性
7.对抗生素及其他化学物质的敏感性
8.病原性
9.遗传学特征。
三、细菌分类的方法
1、数值分类法 2.分子生物学分类法 3.血清学方法: 共同抗原 4.化学分类法:比较细菌各种细胞成分
细菌种属分类
细菌种属分类细菌(Bacteria)是生物的主要类群之一,属于细菌域。
细菌是所有生物中数量最多的一类依据分类标准不同,细菌的分类有所差异。
1、根据形状分为三类,即:球菌(包括单球菌、双球菌、链球菌、葡萄球菌等)、杆菌(比如肠杆菌)和螺旋菌(包括弧菌、螺菌、螺杆菌)。
2、按细菌的生活方式来分类,分为两大类:自养菌和异养菌,其中异养菌包括腐生菌和寄生菌。
3、按细菌对氧气的需求来分类,可分为需氧(完全需氧和微需氧)和厌氧(不完全厌氧、有氧耐受和完全厌氧)细菌。
4、按细菌生存温度分类,可分为喜冷、常温和喜高温三类。
5、根据细菌阴阳分类:革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。
例如:化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌,它们能产生外毒素使人致病,而肠道菌多属于革兰氏阴性菌,它们产生内毒素,靠内毒素使人致病。
常见的革兰氏阳性菌有:葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。
补注:①国际上最具权威性的细菌分类系统专著有“伯杰氏系统细菌学手册”和“伯杰鉴定细菌学手册”。
②细菌的分类层次与其他生物一样,也是界、门、纲、目、科、属、种,但细菌常用的是“属和种”,种是细菌分类的基本单位。
③细菌的结构分为基本结构和特殊结构。
基本结构是各种细菌都具有的结构,包括细菌的细胞壁、细胞膜、细胞质、核质。
某些细菌特有的结构称为特殊结构,包括细菌的荚膜、鞭毛、菌毛、芽胞。
④细菌主要以无性二分裂方式繁殖(裂殖),即细菌生长到一定时期,在细胞中间逐渐形成横隔,由一个母细胞分裂为两个大小相等的子细胞。
⑤微生物划分为以下8大类——细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体。
细菌的分类
细菌分类
细菌分类涉及广义细菌的分类。 细菌划为原核生物,分类单元也与其他生物 一样,分为七个基本的分类等级:界、门、 纲、目、科、属、种。 最重要、最基本的单元是属、种,种以下还 有亚种、型以及菌株等。
细菌分类地位
细菌作为另一个系统进行类别的原核生物,包括 对动物和人具有致病作用的 衣原体、立克次体、
霉形体、螺旋体、放线菌等
此外还涉及蓝细菌,紫色光合细菌。
分类单元
▲属 具有共性的若干种的组合,应与其他属有明显 的差异。不同属之间的16S rRNA序列有较大的 差异。
▲种
是微生物学分类的最基本单元,种是一群性质相
似的菌株。
▲菌株
是不同来源的某一种细菌的纯培养物。
细菌的分类体系
细菌分类体系主要是美国细菌学家 Holt 主编的“ 伯吉氏系统细菌学手册 ” (共 5 卷),该系统应用 DNA rRNA 蛋白 质序列分析方法,在细菌的鉴定分类方面 积累了丰富的资料。
生物学 细菌有哪些分类
生物学细菌有哪些分类?细菌是一类原核生物,按照细菌的形态、代谢方式、生态特征和遗传关系等方面的差异,可以将细菌分为多个分类单位。
目前,细菌的分类系统主要基于其基因序列和进化关系的研究结果。
下面将介绍细菌的主要分类单位及其特征。
1. 基于形态特征的分类:-球菌(Coccus):球状细菌,以分裂方式繁殖,如链球菌(Streptococcus)和葡萄球菌(Staphylococcus)等。
-杆菌(Bacillus):长条状细菌,以分裂方式繁殖,如大肠杆菌(Escherichia coli)和炭疽杆菌(Bacillus anthracis)等。
-螺旋菌(Spirillum):螺旋状细菌,如螺旋菌属(Spirillum)和钩端螺旋体属(Leptospira)等。
2. 基于代谢方式的分类:-厌氧菌(Anaerobes):在缺氧条件下生长和繁殖的细菌,如产乙酸菌(Acetobacterium)和产丙酸菌(Propionibacterium)等。
-好氧菌(Aerobes):需要氧气进行呼吸作用的细菌,如假单胞菌属(Pseudomonas)和链霉菌属(Streptomyces)等。
-兼性厌氧菌(Facultative anaerobes):既可以在有氧条件下进行呼吸作用,也可以在无氧条件下利用发酵代谢,如大肠杆菌(Escherichia coli)和黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)等。
3. 基于生态特征的分类:-水生细菌(Aquatic bacteria):生活在水体中的细菌,如水藻细菌(Cyanobacteria)和水生放线菌(Actinobacteria)等。
-土壤细菌(Soil bacteria):生活在土壤中的细菌,参与了土壤有机物分解和养分循环,如枯草杆菌属(Bacillus subtilis)和拟杆菌属(Pseudomonas)等。
-肠道细菌(Gut bacteria):寄生在动物消化道内的细菌,与宿主的消化和免疫系统密切相关,如乳酸菌属(Lactobacillus)和肠球菌属(Enterococcus)等。
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细菌的分类?100[ 标签:细菌]分别从细菌的培养特性,生化反应进行分类总结。
要求详细。
根据所提供答案的详细程度和全面程度,可以追加200分!!!!!星空回答:14 人气:14 解决时间:2009-04-28 15:34网友完善的答案好评率:60% 查看完善答案历史>>细菌界* 芽生细菌:螺菌科,假单胞菌科,固氮菌科,根瘤菌科,甲基单胞菌科,肠杆菌科,柄杆菌属科,硫细菌,鞘细菌,弧菌科,拟杆菌科,奈瑟氏菌科,韦荣氏球菌科,硝化杆菌科,铁细菌,鞘铁细菌科,甲烷杆菌科,微球菌科,链球菌科,消化球菌科,芽孢杆菌科,乳杆菌科,棒状菌群,丙酸杆菌科* 放线菌:放线菌科,公枝杆菌科,诺卡氏菌科,嗜皮菌科,弗兰克氏菌科,小单孢菌科,高温放线菌科,高温单胞菌科,小荚孢囊菌科,小多胞菌科,链霉菌科,鱼孢菌科,流动放线菌科,枝杆菌科,嗜热放线菌科等。
* 光细菌纲 * 暗细菌纲 * 滑行细菌 * 细菌素真菌界* 真菌:虫道真菌,水生真菌,粪生真菌,昆虫寄生真菌,霉菌,捕食性真菌,污水真菌,土壤真菌,海洋真菌,药用真菌,菌根等。
* 粘菌门:集孢粘菌纲,粘菌纲,根肿菌纲等。
* 鞭毛菌亚门:壶菌纲,丝壶菌纲,卵菌纲(水节霉目、霜霉目、水霉目)等。
* 接合菌亚门:接合菌纲、毛霉目、虫霉目,毛菌纲* 子囊菌亚门:半子囊菌纲(内孢霉目、外囊菌目,不整囊菌纲、散囊菌目,核菌纲、白粉菌目、小煤炱目、球壳目,腔菌纲、多腔菌目、座囊菌目、半球腔菌目,虫囊菌纲),盘菌纲(块菌目、盘菌目)等* 担子菌亚门:冬孢菌纲、锈菌目、黑粉菌目,层菌纲(银耳目、木耳目、隔担菌目、外担菌目、多孔菌目、伞菌目),腹菌纲(鬼笔目、马勃菌目、鸟巢菌目、硬皮马勃目、柄灰包目)等。
* 半知菌亚门:丝孢纲,腔孢纲等。
* 真菌门 * 地衣评价答案●您已经评价过!好:3●您已经评价过!一般:0●您已经评价过!不好:2●您已经评价过!原创:1●您已经评价过!非原创:2最小的布头 2010-03-15 20:16满意答案好评率:66%哇塞,全是复制啊回答人的补充2009-04-22 08:02微生物的已知种数和估计总种数类群已知种数估计总种数已知种百分数(%)病毒 5000 130000 4 细菌 4760 40000 12 真菌 72000 1500000 5 细菌按其外形主要有三类,球菌、杆菌、螺形菌。
一、球菌(Coccus)呈圆球形或近似圆球形,有的呈矛头状或肾状。
单个球菌的直径约在0.8~1.2um左右。
由于繁殖时细菌细胞分裂方向和分裂后细菌粘连程度及排列方式不同可分为:(一)双球菌(Diplococcus):在一个平面上分裂成双排列,如肺炎双球菌、脑膜炎双球菌。
(二)链球菌(Streptococcus):在一个平面上分裂,成链状排列,如溶血性链球菌。
(三)四联球菌(Micrococcus tetragenus):在两个相互垂直的平面上分裂,以四个球菌排呈方形,如四联加夫基菌。
(四)八迭球菌(Sarcina):在三个互相垂直的平面上分裂,八个菌体重叠呈立方体状,如藤黄八叠球菌。
(五)葡萄球菌(Staphylococcus):在几个不规则的平面上分裂,则菌体多堆积在一起,而呈葡萄状排列,如金黄色葡萄球菌。
球菌是细菌中的一大类。
对人类有致病性的病原性球菌(Pathogenic coccus)主要引起化脓性炎症,又称为化脓性球菌(Pyogenic coccus),其中革兰氏阳性菌主要包括葡萄球菌、链球菌、肺炎球菌;革兰氏阴性菌包括脑膜炎球菌和淋球菌等。
二、杆菌(Bacillus)各种杆菌的大小、长短、弯度、粗细差异较大。
大多数杆菌中等大小长2~5um,宽0.3~1um。
大的杆菌如炭疽杆菌(3~5um×1.0~1.3um),小的如野兔热杆菌(0.3~0.7um×0.2um)。
菌体的形态多数呈直杆状,也有的菌体微弯。
菌体两端多呈钝圆形,少数两端平齐(如炭疽杆菌),也有两端尖细(如梭杆菌)或未端膨大呈棒状(如白喉杆菌)。
排列一般分散存在,无一定排列形式,偶有成对或链状,个别呈特殊的排列如栅栏状或V、Y、L字样。
回答人的补充2009-04-22 08:10细菌按其外形主要有三类,球菌、杆菌、螺形菌。
一、球菌(Coccus)呈圆球形或近似圆球形,有的呈矛头状或肾状。
单个球菌的直径约在0.8~1.2um左右。
由于繁殖时细菌细胞分裂方向和分裂后细菌粘连程度及排列方式不同可分为:(一)双球菌(Diplococcus):在一个平面上分裂成双排列,如肺炎双球菌、脑膜炎双球菌。
(二)链球菌(Streptococcus):在一个平面上分裂,成链状排列,如溶血性链球菌。
(三)四联球菌(Micrococcus tetragenus):在两个相互垂直的平面上分裂,以四个球菌排呈方形,如四联加夫基菌。
(四)八迭球菌(Sarcina):在三个互相垂直的平面上分裂,八个菌体重叠呈立方体状,如藤黄八叠球菌。
(五)葡萄球菌(Staphylococcus):在几个不规则的平面上分裂,则菌体多堆积在一起,而呈葡萄状排列,如金黄色葡萄球菌。
球菌是细菌中的一大类。
对人类有致病性的病原性球菌(Pathogenic coccus)主要引起化脓性炎症,又称为化脓性球菌(Pyogenic coccus),其中革兰氏阳性菌主要包括葡萄球菌、链球菌、肺炎球菌;革兰氏阴性菌包括脑膜炎球菌和淋球菌等。
二、杆菌(Bacillus)各种杆菌的大小、长短、弯度、粗细差异较大。
大多数杆菌中等大小长2~5um,宽0.3~1um。
大的杆菌如炭疽杆菌(3~5um×1.0~1.3um),小的如野兔热杆菌(0.3~0.7um×0.2um)。
菌体的形态多数呈直杆状,也有的菌体微弯。
菌体两端多呈钝圆形,少数两端平齐(如炭疽杆菌),也有两端尖细(如梭杆菌)或未端膨大呈棒状(如白喉杆菌)。
排列一般分散存在,无一定排列形式,偶有成对或链状,个别呈特殊的排列如栅栏状或V、Y、L字样。
评价答案您已经评价过!好:2●您已经评价过!一般:0●您已经评价过!不好:1●您已经评价过!原创:2●您已经评价过!非原创:1身若芥弥回答采纳率:28.4% 2009-04-21 19:12满意答案好评率:20%一、生物的分类动物界、植物界、真菌界、原生生物界、原核生物界、病毒界细菌分类场次层次与其他生物相同,即:界、门、纲、目、科(Family)、属(Genus)、种(Species)。
在细菌分类中常用属和种。
广义的细菌即细菌、放线菌、螺旋体、霉形体、立克次氏体和衣原体(原核生物界)二、细菌分类的指征1. 形态学特性2. 培养特性 3.生活方式4.生理生化特性 5.抗原构造 6.对噬菌体的敏感性7.对抗生素及其他化学物质的敏感性。
8.病原性 9.遗传学特征。
三、细菌分类的方法1.数值分类法,自50年代以来与计算机同步发展起来的细菌分类法。
其分类范畴的基本单位是种,它根据比较细菌在形态、生理和生化等方面的特性,计算出相似值来确定种的分类归属。
2.分子生物学分类法基于基因相关性的分类法。
① DNA中G+C(摩尔)百分数(%)含量测定G+C%含量:某一生物DNA中的G+C配对碱基按摩尔数计算占全部碱基的百分数。
(反映该生物遗传性能的一种本质特征)。
其测定方法:梯度密度离心法、解链温度法(Tm)等。
② DNA或RNA同源性的测定DNA-DNA杂交试验(hybridization)原理:同源DNA单链或非同源DNA单链,只要它们彼此在核苷酸排列顺序上有相应互补的部分,就可产生不同程度的结合。
应用:通过在体外测定菌株间DNA的杂合率,据此推算出DNA的相似程,判断它们在亲缘关系上的亲疏,帮助分类鉴定。
③ rRNA的分析:rRNA在遗传信息传递中起重要作用,特别是16srRNA能反映各种细菌间在系统发生方面的关系。
从该rRNA的碱基序列可绘制系统发生树。
3.血清学方法共同抗原4.化学分类法比较细菌各种细胞成分(细胞壁)四、细菌的分类体系细菌分类现代有三个主要体系(前苏联、法国、美国)《伯杰氏分类系统细菌学手册》,该手册共四卷(1984-1989)。
并于1994年出版了《伯杰氏鉴定细菌学手册》第9版,将细菌门分为33个部分,其中与兽医学和医学有关的计13个部分。
五、细菌种的划分和种以下的分类单位(一) 种(Species)的划分种是生物分类的基本单位。
凡属同种的生物,均具有共同的基本性状特征。
它是生物在一定演化阶段,具有相对稳定的一定性状特征的实体。
(二) 种以下的分类单位1.亚种(subspecies):种内可能存在一些在某些性状上相互差异的类别(正式分类等阶)。
2.变种(variety):在个别主要基本性状上与种的典型特征不符的类别(非正式分类等阶)。
1.型(type)与亚型(subtype):仅仅是某一方面的性状(正式分类等阶)。
如血清型(serotype),噬菌体型(phage-type)。
型内还可按进一步的性状差异、区分为不同亚型。
2.株(strain)(品系):是指同种细菌中不同来源的纯培养物。
具有典型特征的菌株称为典型株(typestrain)或代表株或标准株。
不同菌株可能性状完全相同,也可能有某种微小差异。
六、细菌的命名采用“双名法”命名(国际细菌命名规约)由属名和种名两部分组成。
属名(第一字母大写)在前,种名在后。
均用拉丁文或拉丁化的文字表示。
翻译时,种名在前,属名在后。
如Staphylococcus aureus通常,细菌命名方法有三种:1.新种的命名在学名之后加注n. sp.(novo species)。
属名后加上sp.或spp.。
科名字尾为-aceae,目为-ales,纲为-tes,门为-phyta。
2.变种的命名在学名之后加上变种名称,在变种之前加注var.(variety),若为新变种,注以n.var.。
3.习惯通用的俗名。
如typhoid bacillus伤寒杆菌评价答案●您已经评价过!好:1●您已经评价过!一般:1●您已经评价过!不好:3●您已经评价过!原创:0●您已经评价过!非原创:3匿名回答采纳率:36.6% 2009-04-21 13:57 我有更好的回答收藏转载到QQ空间相关内容● ?请给下列细菌分类08.05.04● ?现在发现的细菌有多少种?10.10.01● ?细菌的分类哦09.12.14● ?超级细菌是怎么回事10.09.26● ?关于细菌的分类08.09.22●细菌娃娃的公司●超级细菌的症状●细菌的基本结构●刘惜君吧最优秀的细菌●超级细菌●手机细菌●巴黎婚纱细菌●超级细菌蔓延全球其他答案微生物的已知种数和估计总种数类群已知种数估计总种数已知种百分数(%)病毒 5000 130000 4 细菌 4760 40000 12 真菌 72000 1500000 5 细菌按其外形主要有三类,球菌、杆菌、螺形菌。