GaussView高斯软件教程
GaussView基础教程
GaussView教程【1】——界面介绍Gview就是一个专门设计于高斯配套使用得软件,其主要用途有两个:构建高斯得输入文件;以图得形式显示高斯计算得结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview 还可读入Chem3D,HyperChem与晶体数据等诸多格式得文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会瞧到一大一小两个窗口,后面灰色背景得窗口为选择窗口,在里面选择要输入得分子或基团;前面紫色得窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制得图形。
菜单栏▪【File】主要功能就是建立,打开,保存与打印当前得文件▪【Edit】完成对分子得剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关得都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后得结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会瞧到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制得元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只就是这里提供得都就是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用得R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用得基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次就是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面得所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏就是最常用得,几乎所有软件都有得新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
GaussView基础教程
GaussView教程【1】——界面介绍Gview就是一个专门设计于高斯配套使用得软件,其主要用途有两个:构建高斯得输入文件;以图得形式显示高斯计算得结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview 还可读入Chem3D,HyperChem与晶体数据等诸多格式得文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会瞧到一大一小两个窗口,后面灰色背景得窗口为选择窗口,在里面选择要输入得分子或基团;前面紫色得窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制得图形。
菜单栏▪【File】主要功能就是建立,打开,保存与打印当前得文件▪【Edit】完成对分子得剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关得都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后得结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会瞧到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制得元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只就是这里提供得都就是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用得R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用得基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次就是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面得所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏就是最常用得,几乎所有软件都有得新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
GaussView5 基础教程
GaussView教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围.开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。
菜单栏▪【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件▪【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态.【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到.3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
1、开启Gview2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯环。
Gaussview软件使用手册
Gaussview软件使用手册GaussView是一个被设计来帮助准备输入进入高斯软件的文档以及以图形的形式来检验高斯软件完成并输出的结果的图形化的用户界面。
GaussView是不在高斯软件的计算模块中,而是以前端/后端的模式来协助高斯软件的运行。
GaussView为高斯用户提供了三种主要的便利。
首先,通过它先进的可视化工具,GaussView使得用户可以很快的做出大分子的结构图甚至是很大的分子,然后旋转,在这些分子的基础上经过简单的搜寻操作来编译和放大。
它同样可以载入例如PDB类型的标准的分子结构文档。
第二,GaussView使得建立多种形式的高斯计算变得容易。
它使得准备为普通工作模式以及如ONIOM,QST2/OST3转变结构优化方法,CASSCF计算方法,周期边缘状态计算方法(PBC)以及其他的许多前沿方法的复杂的载入更加简单。
如果高斯软件被安装在了同一台电脑上的话,用户同样可以使用GaussView来进行工作。
最后,GaussView使得用户可以通过多种的图形技巧来检验高斯计算的结果。
高斯的计算结果中可以用图形来表示的有下列几种:1. 经过优化的分子结构;2. 分子轨道3. 任何估算密度的电子密度表面;4. 静电潜在表面;5. 原子价;6. 与振动频率相符的一般模型;7. IR,Raman,NMR,VCD以及其他的频谱;8. 结构优化,IRC反应途径的后续,能级表面的扫描以及ADMP和BOMD轨道的模拟;9. 整体能量的小部分以及其他来自于相同工作类型的数据;这本书为所有的GaussView结构提供了一个参考。
该软件的每一个程序的结构都被详细记录。
将项目按照一般目的分类。
在每一个分类中,项目是按照逻辑结构来排列的,开始于最简单的项目,然后是引用最广泛的项目,最后是更加复杂和不经常使用的项目。
为了找出用户感兴趣的特殊信息,可以通过索引来打开有关主题或者是特殊的对话框。
颜色收集以及对话在索引中的主题菜单下(下面直接中英语)显示了出来。
GaussView5基础教程
GaussView5基础教程GaussView教程【1】——界⾯介绍Gview是⼀个专门设计于⾼斯配套使⽤的软件,其主要⽤途有两个:构建⾼斯的输⼊⽂件;以图的形式显⽰⾼斯计算的结果。
除了可以⾃⼰构建输⼊⽂件外,Gview还可读⼊Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的⽂件。
从⽽使其可以于诸多图形软件连⽤,⼤⼤拓宽了使⽤范围。
开启GaussView会看到⼀⼤⼀⼩两个窗⼝,后⾯灰⾊背景的窗⼝为选择窗⼝,在⾥⾯选择要输⼊的分⼦或基团;前⾯紫⾊的窗⼝为绘图窗⼝,使⽤⿏标绘制想要绘制的图形。
菜单栏【File】主要功能是建⽴,打开,保存和打印当前的⽂件【Edit】完成对分⼦的剪贴、拷贝、删除、抓图等【View】与显⽰分⼦相关的都在这个菜单下,如显⽰氢原⼦、键、元素符号、坐标等【Calculate】直接向Gaussian提交计算【Results】接收并显⽰Gaussian计算后的结果【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等【Help】帮助快速⼯具栏【左⾯第⼀个】选择元素与价键,单击打开会看到⼀个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。
【左⾯第⼆个】环⼯具,作⽤与上⼀个差不多,只是这⾥提供的都是环状化合物残基;【左⾯第三个】提供常⽤的R基团模板,其中包括⼄基、丙基、异丙基、异丁基等【左⾯第四个】氨基酸残基,使⽤它可以迅速绘制氨基酸【左⾯第五个】⽤户⾃定义基团,您可以将常⽤的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键⾓调整】|【⼆⾯⾓调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原⼦】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这⾥⾯的所有选项都可以通过在绘图窗⼝点击右键得到。
3、常⽤⼯具栏这两条条⼯具栏是最常⽤的,⼏乎所有软件都有的新建打开等⼯具GaussView教程【2】——构建分⼦这⾥以构建⼀个间氟苯⼄烷分⼦并从GaussView⾥递交计算为例来说明。
高斯软件基础教程
高斯软件基础教程高斯软件基础教程Revised by BLUE on the afternoon of December 12,2020.GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。
菜单栏【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等【Calculate】直接向Gaussian提交计算【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
高斯软件-基础教程
高斯软件-基础教程GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview就是一个专门设计于高斯配套使用得软件,其主要用途有两个:构建高斯得输入文件;以图得形式显示高斯计算得结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChe m与晶体数据等诸多格式得文件.从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围.开启GaussView会瞧到一大一小两个窗口,后面灰色背景得窗口为选择窗口,在里面选择要输入得分子或基团;前面紫色得窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制得图形。
菜单栏【File】主要功能就是建立,打开,保存与打印当前得文件【Edit】完成对分子得剪贴、拷贝、删除、抓图等【View】与显示分子相关得都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等【Calculate】直接向Gaussian提交计算【Results】接收并显示Gaussian计算后得结果【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会瞧到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制得元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只就是这里提供得都就是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用得R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用得基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次就是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面得所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏就是最常用得,几乎所有软件都有得新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
高斯软件-基础教程
GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。
菜单栏▪【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件▪【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
高斯软件-基础教程
GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。
精心整理菜单栏精心整理精心整理精心整理|精心整理1、2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环精心整理精心整理按住当工作窗口内有多个分子时(在构建大的分子时,这种情况很容易出现) 用Shift+Alt+鼠标左键组合,移动想要移动的分子;用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调节其中一个分子的角度;双击图标(或者左键不放),在元素周期表中选择【F】元素,回到工作窗口在苯的任意一个【H】上单击,使之变成【F】双击精心整理图标,在下面精心整理界面的图标,查看分子的坐标。
精心整理Save】精心整理点击精心整理精心整理精心整理【|【【【其它选择默认即可选好后点击【Submit 】提交至Gaussian ,并保存。
(最好存到安装文件所在磁盘)精心整理精心整理计算完毕后系统会提示关闭Gaussian ,点击【是】【Ok 】接下来我们又一次看到了刚才绘制的那个分子,表面上没什么不同,但这次我们可以预言它的许多性质了,在GView 的主界面点击【Results 】——【Summary 】可以看到刚才的计算总结,点击【View File 】可以看到日志文件。
】右方精心整理精心整理精心整理。
GaussView5 基础教程
GaussView教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。
菜单栏||【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。
1、开启Gview2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯环。
单击左键,可以将主程序框体中的分子或基团加入到工作窗口;按上下左右键,或者左键单击不放移动鼠标,可以调节分子的角度;滚动鼠标滚轮,可以放大缩小分子;按住用用双击【H双击图标,在下面的图标,查看分子的坐标。
Save】然后选择保存路径即可。
GaussView教程【3】——向Gaussian提交计算上一讲我们已经构建好了一个间氟苯乙烷分子,现在打开间氟苯乙烷分子。
点击Gview界面上的【Calculate】——【Gaussian Calculate Setup】从对话框中我们可以选择许多参数,下面依次选择一下【Job Type】工作类型:【Energy能量】|【Optimization优化】|【Frequency频率】|【Opt+Freq优化+频率】|【Scan扫描】|【Stability稳定性】|【NMR核磁】,这里我们选择【NMR】核磁【Method】方法:每种计算模式都提供了若干种方法,这里选择默认值即可【Title】题目:这项可以根据自己的项目自行命名【置而异【Ok】【View File】右方选择【H。
GaussView高斯软件教程PPT学习教案
结算结果可视化的ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ现
1.几何构型 2.分子振动 3.轨道 4.电荷密度 5. 静电势
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选择File,打开一个已经正常计算完的 结果,然 后选择 Results ,就可 以出现 以下选 项 见下图
主菜单
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选择Vibrations选项,就可以直接查看分 子的振 动模式 (见下 图)
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(10).查看分子的对称性 从Edit-Point group路径可以查看所构建分子的点群 。点击Point group后,出现如下窗口:为C1点群 ,其下 拉菜单 中的为 可能的 点群( 改变Tolerance, 也可帮 助我们 判断所 构建体 系可能 有的点 群)
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Edit: 在这里可以完成对分子的剪贴,拷贝,删 除 和 抓图等。 Atom List,显示当前分子的内坐标,笛卡儿坐 标,分 数坐标 等。 Point Group 可以显示当前分子的点群及可能有的点 群。 PBC显示晶体文件(可以将CIF文件转换为图 形,在 点PBC按钮后 所给并 的对话 框中根 据选项 调节具 体显示 的格式 。 Mos用于显示分子轨道(只有检查点 文件, 此选项 才能给 出分子 轨道图 。 Sy mmetrize,对当前体系进行对称性控制。
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(3).在当前工作窗口(打开Gview时程 序自动 打开一 个工作 窗口, 如下图 )也可 通过Fil e-new 路径 新建一个工作窗口
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在这个窗口中点鼠标左键窗口中就会 出现苯 分子, 见下图
将鼠标放在分子上,按左键左右或前 后移动 ,可以 调节分 子的角 度将鼠 标放在 分子上 ,前后 移动, 可以将 分子放 大或缩 小Shift+ Alt+鼠 标左键 组合可 以在窗 口内平 移分子 当工作窗口内有多个分子时[在构建大 的分子 时,这 种情况 很容易 出现]这 时可用 以下命 令可以 用Shift+Alt+ 鼠标左 键组合 移动想 要移动 的分子 ,以调 节各个 分子间 的距离 可以用C trl+Alt+鼠标 左键组 合调节 其中一 个分子 的角度 ,以调 节各个 分子间 的角度 。Ctrl+ Alt+鼠 标左键 这个组 合常和[将鼠标 左键放 在分子 上,左 右或前 后移动 ,可以 调节分 子的角 度]这个 功能连 用。
GaussView高斯软件教程
Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其 主要用途有两个构建高斯的输入文件以图的形式显示 高斯计算的结果除了可以自己构建输入文件外, Gview还可读入CHEM3D,HYPERCHEM和晶体数据 等诸多格式的文件。从而使其可以于诸多图形软件连 用,大大拓宽了使用范围(详见下图)
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(10).查看分子的对称性 从Edit-Point group路径可以查看所构建分子的点群。点击Point group后,出现如下 窗口:为C1点群,其下拉菜单中的为可能的点群(改变Tolerance,也可帮助我们判断 所构建体系可能有的点群)
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(11).查看分子坐标。单击Gview界面上的 图标。出现下面窗口
在构建分子前,应对分子的键长,键角和点群等有一个详细的了解。这样在构建过程 中才能更好的把握细节,如构建大分子时,各个集团间的键长,键角和二面角一定要 给的准确。相当一部分的错误(如SCF不收敛,1502报错等)都是分子建模不合理 造成的。分子模型不合理导致程序根据分子模型所得的薛定鄂方程不合理,也就导致 了对方程的解不能顺利完成,所以报错。对于大分子,不会出现分子直线排步的情况, 链烃通常为锯齿型的排列,环之间总是有一定的夹角,共面情况虽有但不多见,这些 都是在构建分子模型的过程中需要注意的。再者,分子建模是量化计算的一个难点, 特别是对金属配合物,块状体系和纳米体系的构建。只有给出合理的结构,程序才能 给出合理的解。如果不能体现出分子的对称性,则程序不能正确判断分子轨道的对称 性,这在涉计到反应机理和轨道相互作用的研究中可能会导致错误的判断。
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(8).单击Gview界面上 图标。然后点击与乙烷正对的苯上的C原子和H原子选择 “None”,乙烷上的C-H键作类似处理然后单击Gview上的 图标,点选工作窗口中的 两个氢原子,即将它们删去
GaussView5基础教程
GaussView5基础教程GaussView教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。
除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。
从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。
开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。
菜单栏【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等【Calculate】直接向Gaussian提交计算【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。
【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。
3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。