高斯软件-基础教程

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GaussView基础教程

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GaussView教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。

除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。

菜单栏▪【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件▪【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。

【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。

1、开启Gview2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯环。

高斯软件入门

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(2). Linux平台: a.编写输入文件: 用vi命令编写或在Windows下编写完毕后ftp至Linux系统; b.运行g98: g98<输入文件名>输出文件名& 说明:1)末尾的&符号表示将作业提交到后台计算,否则 在用户退出Linux时,作业将终止; 2)若运行g98出错,请检查环境变量是否设置正确, 尤其是用户权限上的问题; c.观看计算结果: 使用vi命令,或采用tail命令跟踪计算输出: tail -f 输出文件名 d.运行过程的控制: 采用top命令观察g98运行到那个模块; 通过renice命令改变进程的优先级来调整g98的运行速度; 采用kill命令终止运算,格式为:kill 作业号 (作业号由top命令可得)
电荷和电荷密度
•其它功能 偶极矩和超极矩 热力学参数 适用体系:气相和溶液
2.程序结构: a.由主引导模块(g98.exe)和 各分模块(l????.exe)组成:
b.常用模块的功能:
•L0—初始化模块; •L1—读入输入,根据所给关键词确定将要使用的模块; •L101,102,…—与构型优化和反应过渡态相关的模块; •L202—输出距离矩阵、判断化合物点群及确定新的坐标系; •L301,302…309—与基组和赝势有关模块; •L310,…319—计算单及双电子积分模块; •L401,402—SCF初始猜测模块; •L502,503,508—SCF模块; •L601,608—Mulliken布居以及自然键轨道分析模块; •L701,702…—计算能量一阶和二阶导数模块; •L8??,9??,10??,11??—与Post-SCF方法有关模块; •L9999—进程结束模块;
说明: 1).对于chk文件并不自动产生,需用户自行指定,在大多数情 况下,最好给定chk文件,并在计算结束后保留之; 2).对于rwf文件,在运行过程中,g98会自行产生gxx打头的rwf 文件,当计算非正常 中断后,可通过更改该文件来续算。 但用户在编写输入文件时,最好还是指定rwf文件,在计算 结束后,再删除。

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GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview就是一个专门设计于高斯配套使用得软件,其主要用途有两个:构建高斯得输入文件;以图得形式显示高斯计算得结果。

除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem与晶体数据等诸多格式得文件.从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围.开启GaussView会瞧到一大一小两个窗口,后面灰色背景得窗口为选择窗口,在里面选择要输入得分子或基团;前面紫色得窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制得图形。

菜单栏▪【File】主要功能就是建立,打开,保存与打印当前得文件▪【Edit】完成对分子得剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关得都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后得结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会瞧到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制得元素以及价态。

【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只就是这里提供得都就是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用得R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用得基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次就是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面得所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

3、常用工具栏这两条条工具栏就是最常用得,几乎所有软件都有得新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。

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GaussView教程【1】——界面介绍Gview就是一个专门设计于高斯配套使用得软件,其主要用途有两个:构建高斯得输入文件;以图得形式显示高斯计算得结果。

除了可以自己构建输入文件外,Gview 还可读入Chem3D,HyperChem与晶体数据等诸多格式得文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启GaussView会瞧到一大一小两个窗口,后面灰色背景得窗口为选择窗口,在里面选择要输入得分子或基团;前面紫色得窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制得图形。

菜单栏▪【File】主要功能就是建立,打开,保存与打印当前得文件▪【Edit】完成对分子得剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关得都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后得结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会瞧到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制得元素以及价态。

【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只就是这里提供得都就是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用得R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用得基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次就是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面得所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

3、常用工具栏这两条条工具栏就是最常用得,几乎所有软件都有得新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。

《高斯软件入门》课件

《高斯软件入门》课件

统计分析实例
通过实例深入理解高斯软件 在统计分析方面的应用和技 巧。
总结与展望
高斯软件的优越性
总结高斯软件的优势和特点,以及为什么它是数据分析的理想选择。
高斯软件的发展趋势
展望高斯软件未来的发展方向和趋势,激发你对技术的好奇心。
学习高斯软件的建议与方法
提供一些建议和学习方法,帮助你更高效地学习和掌握高斯软件。
高斯软件的优点和局 限性
讨论高斯软件的优点和局 限性,帮助你更好地了解 该软件的适用范围和限制。
高斯软件安装与环境配置
1 安装高斯软件的步骤
详细介绍高斯软件的安装过程,帮助你顺利完成安装。
2 配置系统环境变量
指导你如何配置系统环境变量,确保高斯软件可以在你的计算机上正常运行。
3 检查安装是否成功
提供一些简单的检查方法,确保你成功安装了高斯软件。
高斯软件基础知识
1
高斯软件的数据类型
介绍高斯软件支持的不同数据类型,如数值、字符和逻辑。
2
高斯软件的数组与向量
讲解高斯软件中数组和向量的定义、操作和应用。
3
高斯软件的函数与运算符
探索高斯软件提供的丰富函数和运算符,以及它们在数据处理中的作用。
高斯软件高级应用
高斯软件的图形绘制功能
展示高斯软件强大的图形绘制 功能,帮助你更直观地呈现数 据。
高斯软件的数据处理功能
介绍高斯软件用于数据
介绍高斯软件在统计分析方面 的功能和应用,助你深入理解 数据潜在的规律。
高斯软件编程实例
矩阵运算实例
通过实例演示高斯软件中矩 阵运算的基本操作和应用。
数据拟合实例
展示如何使用高斯软件进行 数据拟合和曲线拟合,帮助 你更好地分析数据模型。

GaussView高斯软件教程

GaussView高斯软件教程
在当前工作窗口打开gview时程序自动打开一个工作窗口如下图也可通过filenew路径新建一个工作窗口17在这个窗口中点鼠标左键窗口中就会出现苯分子见下图将鼠标放在分子上按左键左右或前后移动可以调节分子的角度将鼠标放在分子上前后移动可以将分子放大或缩小shiftalt鼠标左键组合可以在窗口内平移分子当工作窗口内有多个分子时在构建大的分子时这种情况很容易出现这时可用以下命令可以用shiftalt鼠标左键组合移动想要移动的分子以调节各个分子间的距离可以用ctrlalt鼠标左键组合调节其中一个分子的角度以调节各个分子间的角度
-
View 这里面的选项都是于分子的显示有关的,如显示氢原子,显示键,显示 元素符号,显示坐标轴等
-
可从Gview中直接向高斯提交计算。这是Gview作为高斯软件配套功能的重要体现。 从所给的对话框中可以选择工作类型Job Type(如优化,能量或频率等);计算方法 Method(如半经验方法,HF方法,DFT方法,MP方法等,还可以选定组);Title(对所 要做的计算给一个说明,以备以后的查看) Link 0(给检查点文件命名,还可以在此用 RWF命令设置临时数据交换文件的大小); General,Guess,(这两个选项主要是给出体 系中各原子的连接关系及如何给出初始猜测);NBO(可在此设定NBO计算),PBC (可在此设定晶体的有关计算), Solvation(可在此设定溶液中的计算,除了选择溶剂 外,还要选择模拟溶剂的理论模型)
GaussView使用简介
Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其 主要用途有两个构建高斯的输入文件以图的形式显示 高斯计算的结果除了可以自己构建输入文Байду номын сангаас外, Gview还可读入CHEM3D,HYPERCHEM和晶体数据 等诸多格式的文件。从而使其可以于诸多图形软件连 用,大大拓宽了使用范围(详见下图)

高斯软件-基础教程

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GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。

除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。

菜单栏▪【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件▪【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。

【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。

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GaussView教程【1】——界面介绍Gview就是一个专门设计于高斯配套使用得软件,其主要用途有两个:构建高斯得输入文件;以图得形式显示高斯计算得结果。

除了可以自己构建输入文件外,Gview 还可读入Chem3D,HyperChem与晶体数据等诸多格式得文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启GaussView会瞧到一大一小两个窗口,后面灰色背景得窗口为选择窗口,在里面选择要输入得分子或基团;前面紫色得窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制得图形。

菜单栏▪【File】主要功能就是建立,打开,保存与打印当前得文件▪【Edit】完成对分子得剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关得都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后得结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会瞧到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制得元素以及价态。

【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只就是这里提供得都就是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用得R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用得基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次就是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面得所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

3、常用工具栏这两条条工具栏就是最常用得,几乎所有软件都有得新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。

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精心整理GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。

除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。

1、开启Gview2在按住用用双击图标(或者左键不放),在元素周期表中选择【【H双击至此,分子式已经构建完成,Gview存储个人常用分子的功能,双击view上的图标,在下面的对话框中键入相关项目,保存即可。

(注:我的程序此项功能不行,用户自定义基团)查看分子坐标:单击Gview界面的图标,查看分子的坐标。

至此,我们保存一下我们构建好的间氟苯乙烷分子,在绘图界面右键单击【File】——【Save】然后选择保存路径即可。

GaussView教程【3】——向Gaussian提交计算上一讲我们已经构建好了一个间氟苯乙烷分子,现在打开间氟苯乙烷分子。

点击Gview界面上的【Calculate】——【Gaussian Calculate Setup】【|【【【计算完毕后会生成两个文件,.log的是系统日志,便于查看计算结果。

这里我们选择.chk文件【Ok】接下来我们又一次看到了刚才绘制的那个分子,表面上没什么不同,但这次我们可以预言它的许多性质了,在GView的主界面点击【Results】——【Summary】可以看到刚才的计算总结,点击【View File】可以看到日志文件。

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GaussView教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。

除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。

菜单栏▪【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件▪【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。

【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。

1、开启Gview2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯环。

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除了可以自己构建输入文件外,还可读入3D,和晶体数据等诸多格式的文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。

菜单栏▪【】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件▪【】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【】直接向提交计算▪【】接收并显示计算后的结果▪【】控制窗体,如关闭、恢复等▪【】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。

【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从里递交计算为例来说明。

1、开启2、双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中出现苯环在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯环。

单击左键,可以将主程序框体中的分子或基团加入到工作窗口;按上下左右键,或者左键单击不放移动鼠标,可以调节分子的角度;滚动鼠标滚轮,可以放大缩小分子;按住键,左键单击不放移动鼠标,可以移动分子;当工作窗口内有多个分子时(在构建大的分子时,这种情况很容易出现)用鼠标左键组合,移动想要移动的分子;用鼠标左键组合调节其中一个分子的角度;双击图标(或者左键不放),在元素周期表中选择【F】元素,回到工作窗口在苯的任意一个【H】上单击,使之变成【F】双击图标,从链烃库中选择【乙基】(第一个),然后点击间位上的【H】即可至此,分子式已经构建完成,存储个人常用分子的功能,双击上的图标,在下面的对话框中键入相关项目,保存即可。

GaussView高斯软件教程

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Result :显示计算的结果,包括电荷,静电势表示的表面,振动,频率,核磁,势能面 扫描,优化等。注意有些结果只能 用检查点文件才能显示。
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常用功能键的介绍
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以构建一个间氟苯乙烷分子并从 Gview里递交计算为例来说明
(1)双击Gview图标, 打开Gview ,下图就是Gview打开后的窗口 打开Gview ,下图就是Gview打开后的窗口
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(8).单击Gview界面上 图标。然后点击与乙烷正对的苯上的C原子和H原子选择 “None”,乙烷上的C-H键作类似处理然后单击Gview上的 图标,点选工作窗口中的 两个氢原子,即将它们删去
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至此分子构建已完成。
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9).Gview存储个人常用分子的功能。Gview中只有常用的一些环状分子和链状分子, 远不能满足研究特定体系的特殊需要。不过Gview有一个功能可以弥补这个缺憾:可 以把常用的分子或官能团存在制定的文件夹内。在需要时可以直接调用。双击view上 的 图标,在下面的对话框中键入相关项目,保存即可
Z表示时内坐标,C表示直角坐标。可以在里面对坐标做适当的调整
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(12).向Gauss递交计算。点Gview界面上Calculation 会出来一个递交计算的对话框。从所给的对话框中可以选择工作类型Job Type(如优化, 能量或频率等);计算方法Method(如半经验方法,HF方法,DFT方法,MP方法等, 还可以选定基组);Title(对所要做的计算给一个说明,以备以后的查看) Link 0(给检查 点文件命名,还可以在此用RWF命令设置临时数据交换文件的大小); General, Guess,(这两个选项主要是给出体系中各原子的连接关系及如何给出初始猜测); NBO(可在此设定NBO计算),PBC(可在此设定晶体的有关计算), Solvation(可在 此设定溶液中的计算,除了选择溶剂外,还要选择模拟溶剂的理论模型)的Gaussian

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高斯软件基础教程高斯软件基础教程Revised by BLUE on the afternoon of December 12,2020.GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。

除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。

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【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

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高斯软件基础教程 Revised by BLUE on the afternoon of December 12,2020.GaussView界面教程【1】——界面介绍Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。

除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。

菜单栏【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等【Calculate】直接向Gaussian提交计算【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。

【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

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除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。

菜单栏▪【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件▪【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等▪【View】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等▪【Calculate】直接向Gaussian提交计算▪【Results】接收并显示Gaussian计算后的结果▪【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等▪【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。

【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

3、常用工具栏这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具GaussView教程【2】——构建分子这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。

GaussView高斯软件教程PPT学习教案

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结算结果可视化的ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ现
1.几何构型 2.分子振动 3.轨道 4.电荷密度 5. 静电势
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选择File,打开一个已经正常计算完的 结果,然 后选择 Results ,就可 以出现 以下选 项 见下图
主菜单
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选择Vibrations选项,就可以直接查看分 子的振 动模式 (见下 图)
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(10).查看分子的对称性 从Edit-Point group路径可以查看所构建分子的点群 。点击Point group后,出现如下窗口:为C1点群 ,其下 拉菜单 中的为 可能的 点群( 改变Tolerance, 也可帮 助我们 判断所 构建体 系可能 有的点 群)
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Edit: 在这里可以完成对分子的剪贴,拷贝,删 除 和 抓图等。 Atom List,显示当前分子的内坐标,笛卡儿坐 标,分 数坐标 等。 Point Group 可以显示当前分子的点群及可能有的点 群。 PBC显示晶体文件(可以将CIF文件转换为图 形,在 点PBC按钮后 所给并 的对话 框中根 据选项 调节具 体显示 的格式 。 Mos用于显示分子轨道(只有检查点 文件, 此选项 才能给 出分子 轨道图 。 Sy mmetrize,对当前体系进行对称性控制。
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(3).在当前工作窗口(打开Gview时程 序自动 打开一 个工作 窗口, 如下图 )也可 通过Fil e-new 路径 新建一个工作窗口
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在这个窗口中点鼠标左键窗口中就会 出现苯 分子, 见下图
将鼠标放在分子上,按左键左右或前 后移动 ,可以 调节分 子的角 度将鼠 标放在 分子上 ,前后 移动, 可以将 分子放 大或缩 小Shift+ Alt+鼠 标左键 组合可 以在窗 口内平 移分子 当工作窗口内有多个分子时[在构建大 的分子 时,这 种情况 很容易 出现]这 时可用 以下命 令可以 用Shift+Alt+ 鼠标左 键组合 移动想 要移动 的分子 ,以调 节各个 分子间 的距离 可以用C trl+Alt+鼠标 左键组 合调节 其中一 个分子 的角度 ,以调 节各个 分子间 的角度 。Ctrl+ Alt+鼠 标左键 这个组 合常和[将鼠标 左键放 在分子 上,左 右或前 后移动 ,可以 调节分 子的角 度]这个 功能连 用。

GaussView高斯软件教程

GaussView高斯软件教程
GaussView使用简介
Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其 主要用途有两个构建高斯的输入文件以图的形式显示 高斯计算的结果除了可以自己构建输入文件外, Gview还可读入CHEM3D,HYPERCHEM和晶体数据 等诸多格式的文件。从而使其可以于诸多图形软件连 用,大大拓宽了使用范围(详见下图)
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(10).查看分子的对称性 从Edit-Point group路径可以查看所构建分子的点群。点击Point group后,出现如下 窗口:为C1点群,其下拉菜单中的为可能的点群(改变Tolerance,也可帮助我们判断 所构建体系可能有的点群)
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(11).查看分子坐标。单击Gview界面上的 图标。出现下面窗口
在构建分子前,应对分子的键长,键角和点群等有一个详细的了解。这样在构建过程 中才能更好的把握细节,如构建大分子时,各个集团间的键长,键角和二面角一定要 给的准确。相当一部分的错误(如SCF不收敛,1502报错等)都是分子建模不合理 造成的。分子模型不合理导致程序根据分子模型所得的薛定鄂方程不合理,也就导致 了对方程的解不能顺利完成,所以报错。对于大分子,不会出现分子直线排步的情况, 链烃通常为锯齿型的排列,环之间总是有一定的夹角,共面情况虽有但不多见,这些 都是在构建分子模型的过程中需要注意的。再者,分子建模是量化计算的一个难点, 特别是对金属配合物,块状体系和纳米体系的构建。只有给出合理的结构,程序才能 给出合理的解。如果不能体现出分子的对称性,则程序不能正确判断分子轨道的对称 性,这在涉计到反应机理和轨道相互作用的研究中可能会导致错误的判断。
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(8).单击Gview界面上 图标。然后点击与乙烷正对的苯上的C原子和H原子选择 “None”,乙烷上的C-H键作类似处理然后单击Gview上的 图标,点选工作窗口中的 两个氢原子,即将它们删去
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GaussView界面教程【1】——界面介绍
Gview是一个专门设计于高斯配套使用的软件,其主要用途有两个:构建高斯的输入文件;以图的形式显示高斯计算的结果。

除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。

从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。

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开启GaussView会看到一大一小两个窗口,后面灰色背景的窗口为选择窗口,在里面选择要输入的分子或基团;前面紫色的窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制的图形。

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菜单栏
【File】主要功能是建立,打开,保存和打印当前的文件
【Edit】完成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等
【View 】与显示分子相关的都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等
【Calculate】直接向Gaussian提交计算
【Results 】接收并显示Gaussian计算后的结果
【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等
【Help】帮助
快速工具栏
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【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会看到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制的元素以及价态。

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【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只是这里提供的都是环状化合物残基;
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【左面第三个】提供常用的R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等
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【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用的基团存放到此处
这条快速编辑栏中从左到右依次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查询已有结构】|【增加化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】
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这里面的所有选项都可以通过在绘图窗口点击右键得到。

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3、常用工具栏
这两条条工具栏是最常用的,几乎所有软件都有的新建打开等工具
GaussView 教程【2】——构建分子
这里以构建一个间氟苯乙烷分子并从GaussView 里递交计算为例来说明。

1、 开启
Gview 2、 双击按钮,选择苯基(第一个),会看到主程序框体中
出现苯环
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在工作窗口单击,可以看到工作窗口也出现了一个苯环。

单击左键,可以将主程序框体中的分子或基团加入到工作窗口;
按上下左右键,或者左键单击不放移动鼠标,可以调节分子的角度;
滚动鼠标滚轮,可以放大缩小分子;
按住shift键,左键单击不放移动鼠标,可以移动分子;
当工作窗口内有多个分子时(在构建大的分子时,这种情况很容易出现)
用Shift+Alt+鼠标左键组合,移动想要移动的分子;
用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调节其中一个分子的角度;
双击图标(或者左键不放),在元素周期表中选择【F】元素,回到工作窗口在苯的任意一个【H】上单击,使之变成【F】
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双击
图标,从链烃库中选择【乙基】(第一个),然后点击间位上的【H 】即可
至此,分子式已经构建完成,Gview
存储个人常用分子的功
能,双击view上的图标,在下面的对话框中键入相关项目,保存即可。

(注:我的程序此项功能不行,用户自定义基团)
查看分子坐标:单击Gview界面的图标,查看分子的坐标。

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至此,我们保存一下我们构建好的间氟苯乙烷分子,在绘图界面右键单击【File】——【Save】然后选择保存路径即可。

GaussView教程【3】——向Gaussian提交计算
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上一讲我们已经构建好了一个间氟苯乙烷分子,现在打开间氟苯乙烷分子。

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点击Gview界面上的【Calculate】——【Gaussian Calculate Setup】
从对话框中我们可以选择许多参数,下面依次选择一下
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【Job Type】工作类型:
【Energy能量】|【Optimization优化】|【Frequency 频率】|【Opt+Freq优化+频率】|【Scan扫描】|【Stability 稳定性】|【NMR核磁】,
这里我们选择【NMR】核磁
【Method】方法:每种计算模式都提供了若干种方法,这里选择默认值即可
【Title】题目:这项可以根据自己的项目自行命名
【Link 0】给检查点文件命名
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其它选择默认即可
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选好后点击【Submit】提交至Gaussian,并保存。

(最好存到安装文件所在磁盘)
系统会询问是否提交至Gaussian,选择【OK】,Gaussian 会自动开启并计算,计算时间因硬件配置而异
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计算完毕后系统会提示关闭Gaussian,点击【是】
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计算完毕后会生成两个文件,.log的是系统日志,便于查看计算结果。

这里我们选择.chk文件【Ok】
接下来我们又一次看到了刚才绘制的那个分子,表面上没什么不同,但这次我们可以预言它的许多性质了,在GView的主界面点击【Results】——【Summary】可以看到刚才的计算总结,点击【View File】可以看到日志文件。

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因为我们刚才选择计算模式是【NMR】核磁,所以我们点击【Results】——【NMR】,随即我们看到了很熟悉的核磁图谱,但似乎很乱,因为这是所有元素的核磁谱图,在左下方【Element】右方选择【H】,即H谱,旁边【Reference】选择【TMS HF/6-31G(d)】,这次我们就可以看到间氟苯乙烷分子理论计算的核磁谱图了。

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在绘图界面右击【View】——【Labels】可以看到每个H原子对应场中的位置。

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如有侵权请联系告知删除,感谢你们的配合!![30508 772C 眬z32656 7F90 羐=20516 5024 値34888 8848 衈30339 7683 皃29892 74C4 瓄$,22471 57C7 埇28637 6FDD 濝31232 7A00 稀
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