第1章蛋白质组成成分和氨基酸

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1第一章、氨基酸的结构及性质123

1第一章、氨基酸的结构及性质123

methionine Met
天冬酰胺 asparagine
Asn
N
谷氨酰胺 glutamine
Gln
Q
5.65
苏氨酸
threonine
Thr
T
5.60
3个有个性的氨基酸 个有个性的氨基酸
1)脯氨酸(Pro) 因为是一个环状 )脯氨酸( ) 的亚氨基酸, 的亚氨基酸 它的氨基和其它氨基 酸的羧基形成的肽键有明显的特 较易变成顺式肽键. 点, 较易变成顺式肽键
β -丙氨酸是遍多酸(泛酸,一种维生素)的前体成分 γ –氨基丁酸是传递神经冲动的化学介质
鸟氨酸
胍氨酸
L-鸟氨酸、 L-瓜氨酸是尿素循环的中间体
第二节 氨基酸的重要理化性质和功能 一、一般物理性质 α-氨基酸为无色晶体,熔点极高 一般在 氨基酸为无色晶体 氨基酸为无色晶体,熔点极高(一般在 200℃以上 。有的无味、有的味甜、有的味苦、 ℃以上)。有的无味、有的味甜、有的味苦、 谷氨酸的单钠盐有鲜味 味精的主要成分)。 鲜味(味精的主要成分 谷氨酸的单钠盐有鲜味 味精的主要成分 。
芳香族AA 芳香族 杂环族AA 杂环族
(一)按R基的化学结构分类 基的化学结构分类 可分为三类:脂肪族、 可分为三类:脂肪族、芳香族和杂环族 1、脂肪族氨基酸 、

含一氨基一羧基的中性氨基酸
甘氨酸 Gly, G
丙氨酸 Ala, A
缬氨酸 Val, V
亮氨酸 Lue, L
异亮氨 酸 Ile, I
● ● 含羟基或硫氨基酸 (一氨基一羧基)
1、溶解性 、 氨基酸在水中的溶解度差别很大, 胱氨酸、 溶解度差别很大 氨基酸在水中的溶解度差别很大 除胱氨酸、 半胱氨酸和酪氨酸外 一般都能溶于水, 半胱氨酸和酪氨酸外, 一般都能溶于水 并能溶 解于稀酸或稀碱中, 但不能溶解于有机溶剂 ( 通 解于稀酸或稀碱中 常酒精能把氨基酸从其溶液中沉淀析出 )。 。 脯氨酸和羟脯氨酸能溶于乙醇或乙醚中, 脯氨酸和羟脯氨酸能溶于乙醇或乙醚中 且 二者极易溶于水而潮解。 二者极易溶于水而潮解。

生物化学-生化知识点_第一章氨基酸与蛋白质

生物化学-生化知识点_第一章氨基酸与蛋白质

第一章氨基酸与蛋白质上册 P1231. 1 氨基酸①①①蛋白质水解最后成为氨基酸混合物酸水解得19种 L-AA,色氨酸破坏。

碱水解得色氨酸,其余氨基酸消旋破坏。

酶水解不消旋破坏,但水解不彻底。

①①①α-氨基酸的一般结构生物体内已发现氨基酸180种,常见氨基酸20种1. 2 氨基酸的分类:常见蛋白质氨基酸,不常见蛋白质氨基酸,非蛋白氨基酸①①①常见蛋白质氨基酸,或称基本氨基酸。

每个氨基酸可用三个字母或单字母简写表示。

按侧链R基不同进行分类。

①1①按R基化学结构分类1.脂肪族氨基酸15个①.中性氨基酸5个甘氨酸 Glycine 氨基乙酸 Gly G 无旋光丙氨酸 Alanine α-氨基丙酸 Ala A缬氨酸 Valine α-氨基-β-甲基丁酸 Val V亮氨酸 Leusine α-氨基-γ-甲基戊酸 Leu L异亮氨酸 Isoleucine α-氨基-β-甲基戊酸 Ile I①.含羟基或硫氨基酸4个丝氨酸 Serine α-氨基-β-羟基丙酸 Ser S苏氨酸 Threonine α-氨基-β-羟基丁酸 Thr T半胱氨酸 Cysteine α-氨基-β-基丙酸 Cys C甲硫氨酸 Methionine α-氨基-γ-甲硫基丁酸 Met M③.酸性氨基酸及其酰胺4个天冬氨酸 Aspartic acid α-氨基丁二酸 Asp D谷氨酸 Glutamic acid α-氨基戊二酸 Glu E天冬酰胺 Asparagine α-氨基丁二酸一酰胺 Asn N谷氨酸胺 Glutamine α-氨基戊二酸一酰胺 Gln Q④. 碱性氨基酸2个赖氨酸 Lysine α,ε-二氨基已酸 Lys K精氨酸 Arginine α-氨基-δ-胍基戊酸 Arg R2.芳香族氨基酸3个苯丙氨酸 Phenylalanine α-氨基-β-苯基丙酸 Phe F酪氨酸 Tyrosine α-氨基-β-对羟苯基丙酸 Tyr Y色氨酸 Tryptophan α-氨基-β-吲哚基丙酸 Trp W3.杂环族氨基酸2个组氨酸 Histidine α-氨基-β-咪唑基丙酸 His H脯氨酸 Proline α-吡咯烷羧酸 Pro P①2①按R基极性性质分类1.非极性R基8个Ala(A) Val(V) Leu(L) Ile(I) Pro(P)Phe(F) Trp(W) Met(M)1。

第一章蛋白质的结构与功能蛋白质的...

第一章蛋白质的结构与功能蛋白质的...

第一章蛋白质的结构与功能一.蛋白质的分子组成组成蛋白质的元素主要:C、H、O、N、S,各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%人体蛋白质的氨基酸仅有20种,且均属L-α-氨基酸(甘氨酸除外)氨基酸等电点:在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。

此时溶液的pH称为该氨基酸的等电点(pI)。

色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在280nm附近氨基酸与茚三酮水合物共热,可生成蓝紫色化合物肽键:由一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩合而形成的化学键谷胱甘肽(GSH)是由谷氨酸,半胱氨酸,甘氨酸组成的三肽。

第一个肽键与一般的不同,甘氨酸的γ-羧基与半胱氨酸的氨基组成,分子中半胱氨酸的巯基是主要功能基团。

GSH的巯基有还原性,可作为体内重要的还原剂,保护体内蛋白质或酶分子中巯基免遭氧化,使蛋白质和酶保持活性状态。

二.蛋白质的分子结构α-螺旋的结构特点:1.多个肽键平面通过α-碳原子旋转,相互之间紧密盘曲成稳固的右手螺旋2.主链呈螺旋上升,每3.6个氨基酸残基上升一圈,相当于0.54nm,这与X线衍射图符合3.相邻两圈螺旋之间借肽键中C=O和NH形成许多链内氢健,这是稳定α-螺旋的主要键4.肽链中氨基酸侧链R分布在螺旋外侧,其形状、大小及电荷影响α-螺旋的形成基团影响α-螺旋的稳定性包括以下三个方面:1.酸性或碱性氨基酸集中区域(两种电荷相互排斥)2.脯氨酸不利于α-螺旋的形成3.较大R基团侧链集中区域(空间位阻效应)β-折叠要点:1.是肽链相当伸展的结构,肽链平面之间折叠成锯齿状2.依靠两条肽链或一条肽链内的两段肽链间的C=O与H形成氢键,使构象稳定3.氨基酸残基的R侧链伸出在锯齿的上方或下方4.两段肽链可以是平行的,也可以是反平行的超二级结构有三种基本形式:1.α-螺旋组合(αα)2.β-折叠组合(ββ)3.α-螺旋β-折叠组合(βαβ)三.蛋白质结构与功能的关系镰刀形红细胞贫血:血红蛋白有2个α亚基和2个β亚基组成,其中β亚基的第六个氨基酸谷氨酸突变成缬氨酸。

生物化学第一章蛋白质化学

生物化学第一章蛋白质化学

组成蛋白质的元素:
主要元素组成: 碳(C) 50% ~ 55% 氧(O) 19% ~ 24% 氢(H) 6% ~ 8% 氮(N) 13% ~ 19% 硫(S) 0% ~ 4%
少量的 磷(P)、铁(Fe)、铜(Cu)、锌(Zn)和碘(I)等
蛋白质元素组成特点:
各种蛋白质含氮量很接近,平均为16%
故可根据以下公式推算出蛋白质的大致含量: 样品中蛋白质的含量〔g〕
脱水作用
脱水作用
--

酸-


-- -
不稳定的蛋白质颗粒
带负电荷的蛋白质
溶液中蛋白质的聚沉
〔三〕蛋白质的变性、沉淀与凝固
1. 蛋白质的变性〔denaturation〕 在某些理化因素作用下,蛋白质的构
象被破坏,失去其原有的性质和生物活性, 称为蛋白质的变性作用。
变性后的蛋白称为变性蛋白质。
常见的变性因素:
2. 极性中性氨基酸
R-基含有极性基团; 生理pH条件下不解离。 包括7个:
甘氨酸(Trp)、 丝氨酸(Ser)、
半胱氨酸(Cys)、 谷氨酰胺(Gln)、 天冬酰胺(Asn)、 酪氨酸(Tyr) 苏氨酸(Thr)
3. 酸性氨基酸
R-基有COOH(COO-)
带负电荷
4. 碱性氨基酸
R-基有NH2(NH3+)
牛胰核糖核酸酶的变性与复性
尿素或盐酸胍 β-巯基乙醇
透析
有活性
无活性
〔二〕一级构造与功能的关系 1.一级构造相似的蛋白质功能相似 一级构造不同的蛋白质功能不同
胰岛素的一级构造及种属差异
一级构造不同的蛋白质功能不同
ACTH 促肾上腺素皮质激素
MSH 促黑激素

第一章蛋白质的结构与功能讲述介绍

第一章蛋白质的结构与功能讲述介绍

侧视图
俯视图
β-折叠的结构特点
①多肽链呈伸展状态,肽键平面沿长轴 折叠呈锯齿状,两平面间夹角为110°,R 基交替地伸向锯齿状结构的上下方。 ②若干肽段互相靠拢,平行排列,通过 氢键连接。氢键的方向与长轴垂直。 ③若两条肽段走向一致(N端、C端方向 相同),称为顺向平行;反之,称之为逆 向平行,逆向更稳定。
(二)氨基酸的分类
基本氨基酸的分类方法二: 按侧链R基团极性分类
非极性(疏水)氨基酸(9种)
极性不带电荷氨基酸(6种)
极性带正电荷氨基酸(碱性氨基酸)(3种)
极性带负电荷氨基酸(酸性氨基酸)(2种)
1.非极性疏水氨基酸 侧链为烃基、吲哚环、 甲硫基等疏水性基团。这类氨基酸在水中的溶解度 小于极性中性氨基酸。
要测定生物样品的含氮量就可按下式计算出其蛋 白质大致含量: 100g样品中蛋白质的含量(g%) =每克样品中含氮克数×6.25×100
二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸
蛋白质受酸、碱或蛋白酶水解产生游 离氨基酸。因此,组成蛋白质的基本单位 是——氨基酸(amino acid) 。
(一)氨基酸的结构特点
(一)蛋白质的二级结构
(secondary structure)
概念 是指蛋白质多肽链主链原子局部的空 间排列,不涉及氨基酸残基侧链的构象。 维系蛋白质二级结构的主要化学键是氢键。
蛋白质二级结构的主要形式
α-螺旋
β-折叠 β-转角
无规卷曲
1、α-螺旋 (-helix) ——最常见
肽类激素种类较多,生理功能各异。主要见于下丘脑 及垂体分泌的激素。神经肽在神经传导中发挥信号作用。 促甲状腺素释放激素(TRH):3肽
3.其他
催产素、升压素:9肽 脑肽:种类多,其中脑啡肽重要,为5肽

生化第一章蛋白质的结构和功能

生化第一章蛋白质的结构和功能

第一章,蛋白质的结构与功能本章要点一、蛋白质的元素组成:主要含有碳、氢、氧、氮、硫。

各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%,蛋白质是体内的主要含氮物质。

1.蛋白质的动态功能:化学催化反应、免疫反应、血液凝固、物质代谢调控、基因表达调控和肌收缩等。

2.蛋白质的结构功能:提供结缔组织和骨的基质、形成组织形态等。

二、氨基酸1.人体内所有蛋白质都是以20种氨基酸为原料合成的多聚体,氨基酸是组成蛋白质的基本单位。

2.存在于自然界中的氨基酸有300余种,但被生物体直接用于合成蛋白质的仅有20种,且均属L-α-氨基酸(除甘氨酸外)。

3.体内也存在若干不参与蛋白质合成但具有重要作用的L-α-氨基酸,如参与合成尿素的鸟氨酸、瓜氨酸和精氨酸代琥珀酸。

4.20种氨基酸根据其侧链的结构和理化性质可分为5类:⑴非极性脂肪族氨基酸:侧链只有C、H原子。

⑶含芳香环的氨基酸:侧链中有了芳香环。

⑷酸性氨基酸:侧链中有了羧基。

芳香族氨基酸中苯基的疏水性较强,酚基和吲哚基在一定条件下可解离;酸性氨基酸的侧链都含有羧基;而碱性氨基酸的侧链分别含有氨基、胍基或咪唑基。

5.20种氨基酸具有共同或特异的理化性质:⑴氨基酸具有两性解离的性质。

①所有氨基酸都含有碱性的α-氨基和酸性的α-羧基,可在酸性溶液中与质子(H+)结合呈带正电荷的阳离子(),也可在碱性溶液中与(OH-)结合,失去质子变成带负电荷的阴离子()。

②氨基酸是一种两性电解质,具有两性解离的特性。

③在某一PH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的PH称为该氨基酸的等电点。

④取兼性离子两边的pK值的平均值,即为此氨基酸的pI值:pI=1/2(pK1+pK2)⑵含共轭双键的氨基酸具有紫外线吸收性质①含有共轭双键的色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在280nm波长附近。

②由于大多数蛋白质含有酪氨酸和色氨酸残基,所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值,是分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。

临床执业医师生物化学笔记—第一篇第一章氨基酸和蛋白质

临床执业医师生物化学笔记—第一篇第一章氨基酸和蛋白质

第⼀篇⽣物⼤分⼦的结构与功能第⼀章氨基酸和蛋⽩质⼀、组成蛋⽩质的20种氨基酸的分类1、⾮极性氨基酸包括:⽢氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸2、极性氨基酸极性中性氨基酸:⾊氨酸、酪氨酸、丝氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、⾕氨酰胺、苏氨酸酸性氨基酸:天冬氨酸、⾕氨酸碱性氨基酸:赖氨酸、精氨酸、组氨酸其中:属于芳⾹族氨基酸的是:⾊氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸属于亚氨基酸的是:脯氨酸含硫氨基酸包括:半胱氨酸、蛋氨酸注意:在识记时可以只记第⼀个字,如碱性氨基酸包括:赖精组⼆、氨基酸的理化性质1、两性解离及等电点氨基酸分⼦中有游离的氨基和游离的羧基,能与酸或碱类物质结合成盐,故它是⼀种两性电解质。

在某⼀PH的溶液中,氨基酸解离成阳离⼦和阴离⼦的趋势及程度相等,成为兼性离⼦,呈电中性,此时溶液的PH称为该氨基酸的等电点。

2、氨基酸的紫外吸收性质芳⾹族氨基酸在280nm波长附近有的紫外吸收峰,由于⼤多数蛋⽩质含有这些氨基酸残基,氨基酸残基数与蛋⽩质含量成正⽐,故通过对280nm波长的紫外吸光度的测量可对蛋⽩质溶液进⾏定量分析。

3、茚三酮反应氨基酸的氨基与茚三酮⽔合物反应可⽣成蓝紫⾊化合物,此化合物吸收峰在570nm波长处。

由于此吸收峰值的⼤⼩与氨基酸释放出的氨量成正⽐,因此可作为氨基酸定量分析⽅法。

三、肽两分⼦氨基酸可借⼀分⼦所含的氨基与另⼀分⼦所带的羧基脱去1分⼦⽔缩合成最简单的⼆肽。

⼆肽中游离的氨基和羧基继续借脱⽔作⽤缩合连成多肽。

10个以内氨基酸连接⽽成多肽称为寡肽;39个氨基酸残基组成的促肾上腺⽪质激素称为多肽;51个氨基酸残基组成的胰岛素归为蛋⽩质。

多肽连中的⾃由氨基末端称为N端,⾃由羧基末端称为C端,命名从N端指向C端。

⼈体内存在许多具有⽣物活性的肽,重要的有:⾕胱⽢肽(GSH):是由⾕、半胱和⽢氨酸组成的三肽。

半胱氨酸的巯基是该化合物的主要功能基团。

GSH的巯基具有还原性,可作为体内重要的还原剂保护体内蛋⽩质或酶分⼦中巯基免被氧化,使蛋⽩质或酶处于活性状态。

第一章蛋白质组成及结构讲课文档

第一章蛋白质组成及结构讲课文档
➢ 可与酸性氨基酸残基、 肽链 C 端、核酸中的磷酸基 团形成盐键
➢ 与蛋白质活性有关
Lys 长侧链可自由伸展在外,与蛋白质结合功能有关
Arg 可沿着侧链卷曲成疏水表面埋藏在蛋白质分子内,也可与蛋白质分子内的氧形 成氢键从而稳定蛋白质,与酶的催化功能有关
第20页,共111页。
修饰氨基酸
➢ 翻译后修饰:即肽链中氨基酸残基的修饰,如 O–磷酸化,羟 基化碘化,酰氨化,糖基化等
2.
蛋白质多肽链中氨基酸的序列
3.
包括两个方面
✓ 蛋白质分子中多肽链的数目
✓ 多肽链中氨基酸的精确序列
第25页,共111页。
2. 一级结构与进化
(1)同源蛋白质(homologous protein)
(2)蛋白质家族与超家族(protein family and superfamily) (3)举例:细胞色素 C(cytochrome C)
第5页,共111页。
Ala
➢ 小,侧链只有一个甲基
➢ 无化学活性
➢ 在蛋白质分子中可处于
内部或表面
第6页,共111页。
Val、 Ile、 Leu
➢ 带有分支的支链氨基酸 ➢ 易于在蛋白质分子中固定于一定位置,并有利于链
的折叠
第7页,共111页。
Pro
➢ 一种亚氨酸
➢ 具有固定的构型,很强的立体化学效应
➢ 生物大分子中形成氢键的 主要基团:羟基,氨基,羰基,
脂基
➢ 蛋白质中至少 50% 的内部 极性基团参与形成氢键
➢ 众多的氢键呈直线排列而有较大的键能,为维持蛋白质稳定构 象的重要化学键
➢ 蛋白质侧链残基之间及残基与主链之间形成的氢键很少, 但对维持蛋白质构象起很大的作用

《生物化学》绪论 第1章 蛋白质化学

《生物化学》绪论  第1章 蛋白质化学

定的蛋白质肽键断裂,各自得到一系列大小不同 的肽段。
⑷分离提纯所得的肽,并测定它们的序列。
⑸从有重叠结构的各个肽的序列中推断出蛋白质
中全部氨基酸排列顺序。
一级结构确定的原则
蛋白质一级结构测定的战略原则是将大化小,逐
段分析,先后采用不同方法制成两套肽片断,并 对照两段肽段,找出重叠片断,排出肽的前后位 臵,最后确定蛋白质的完整序列。
α-螺旋结构
每个氨基酸残基的-NH
-与间隔三个氨基酸残 基的=C=0形成氢键。每 个 肽 键 的 =C=0 与 - NH -都参加氢键形成,因 此 保 持 了 α- 螺 旋 的 最 大 稳定性。
绝大多数蛋白质以右手
右手α螺旋
α- 螺 旋 形 式 存 在 。 1978 年发现蛋白质结构中也 有 左 手 α- 螺 旋 结 构 。
第一章 蛋白质化学
第一章 蛋白质化学
蛋白质是由不同的 α-氨基酸按一定
的序列通过酰胺键(蛋白质化学中专 称为肽键)缩合而成的,具有较稳定 的构像并具有一定生物功能的生物大 分子。
1.1 蛋白质的生物学意义
蛋白质是一切生物体的细胞和组织的主要组成成
分,也是生物体形态结构的物质基础,使生命活 动所依赖的物质基础。 蛋白质分子巨大、结构复杂,使得蛋白质的理论 研究及其应用受到限制。近年来在重组DNA技术 基础上发展起来的蛋白质工程为解决这方面的问 题提供了最大的可能性。蛋白质工程可改变蛋白 质的生物活性,改变蛋白质的稳定性,改变受体 蛋白质的特性。通过蛋白质工程可深入地研究蛋 白质的结构与功能的相互关系。
1.2 蛋白质的元素组成
经元素分析,蛋白质一般含碳50%~55%,氢
6%~8% , 氧 20%~23% , 氮 15%~18% , 硫 0%~4%。 有的蛋白质还含有微量的磷、铁、锌、铜、钼、 碘等元素。 氮含量在各种蛋白质中比较接近,平均为16%。 因此,一般可由测定生物样品中的氮,粗略的 计算出蛋白质的含量。(1g的氮≈ 6.25 g的蛋 白质)

生物化学 第一篇 蛋白质的结构与功能

生物化学 第一篇 蛋白质的结构与功能

第一篇蛋白质的结构与功能(第一~四章小结)第一章氨基酸氨基酸是一类同时含有氨基和羧基的有机小分子。

组成多肽和蛋白质的氨基酸除Gly外,都属于L型的α- 氨基酸(Pro为亚氨基酸)。

氨基酸不仅可以作为寡肽、多肽和蛋白质的组成单位或生物活性物质的前体,也可以作为神经递质或糖异生的前体,还能氧化分解产生ATP。

目前已发现蛋白质氨基酸有22种,其中20种最为常见,而硒半胱氨酸和吡咯赖氨酸比较罕见。

非蛋白质氨基酸通常以游离的形式存在,作为代谢的中间物和某些物质的前体,具有特殊的生理功能。

22种标准氨基酸可使用三字母或单字母缩写来表示。

某些标准氨基酸在细胞内会经历一些特殊的修饰成为非标准蛋白质氨基酸。

氨基酸有多种不同的分类方法:根据R基团的化学结构和在pH7时的带电状况,可分为脂肪族氨基酸、不带电荷的极性氨基酸、芳香族氨基酸、带正电荷的极性氨基酸和带负电荷的极性氨基酸;根据R基团对水分子的亲和性,可分为亲水氨基酸和疏水氨基酸;根据对动物的营养价值,可分为必需氨基酸和非必需氨基酸。

氨基酸的性质由其结构决定。

其共性有:缩合反应、手性(Gly除外)、两性解离、具有等电点,以及氨基酸氨基和羧基参与的化学反应,包括与亚硝酸的反应、与甲醛的反应、Sanger反应、与异硫氰酸苯酯的反应和与茚三酮的反应等。

与亚硝酸的反应可用于Van Slyke定氮,与甲醛的反应可用于甲醛滴定,Sanger反应和与异硫氰酸苯酯的反应可用来测定N-端氨基酸。

只有脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质,其余生成蓝紫色物质,利用此反应可对氨基酸进行定性或定量分析。

多数氨基酸的侧链可能发生特殊的反应,可以此鉴定氨基酸。

不同氨基酸在物理、化学性质上的差异可用来分离氨基酸,其中最常见的方法是电泳和层析。

第二章蛋白质的结构肽是氨基酸之间以肽键相连的聚合物,它包括寡肽、多肽和蛋白质。

氨基酸是构成肽的基本单位。

线形肽链都含有N端和C端,书写一条肽链的序列总是从N端到C端。

蛋白质结构与功能-----氨基酸

蛋白质结构与功能-----氨基酸

蛋⽩质结构与功能-----氨基酸蛋⽩质结构与功能——氨基酸2010遗传学Chapter 1 氨基酸I 蛋⽩质的天然组成天然蛋⽩质⼏乎都是由18种普通的氨基酸组成:L-氨基酸,L-亚氨基酸(脯氨酸)和⽢氨酸。

⼀些稀有的氨基酸在少量的蛋⽩质中结合了L-硒代胱氨酸。

II 氨基酸的结果每种氨基酸(除了脯氨酸):都有⼀个羧基,⼀个氨基,⼀个特异性的侧链(R基)连接在α碳原⼦上。

在蛋⽩质中,这些羧基和氨基⼏乎全部都结合成肽键。

在⼀般情况下,除了氢键的构成以外,是不会发⽣化学反应的。

氨基酸的侧链残基(R基)提供了多种多样的功能基团,这些基团赋予蛋⽩质分⼦独特的性质,导致:A.⼀种独特的折叠构象B.溶解性的差异C.聚集态D.和配基或其他⼤分⼦构成复合物的能⼒,酶活性等等。

蛋⽩质的功能是与蛋⽩质氨基酸排列顺序和每个氨基酸残基的特征有关。

那些残基赋予蛋⽩质独⼀⽆⼆的功能。

氨基酸的分类是依照它的侧链性质的A.⾮极性侧链的氨基酸B.不带电的极性侧链氨基酸C.酸性侧链的氨基酸D .碱性侧链的氨基酸A.⾮极性侧链氨基酸⾮极性氨基酸在蛋⽩质中的位置:在可溶性蛋⽩质中,⾮极性氨基酸链趋向于集中在蛋⽩质内部。

⽢氨酸(Gly G ) 结构:最简单的氨基酸,在蛋⽩质氨基酸当中,是唯⼀缺乏⾮对称结构的氨基酸。

特征:⽢氨酸在蛋⽩质结构中起到⼀个很重要的作⽤,与其它氨基酸残基相⽐,由于缺少β-碳原⼦,它在蛋⽩质的构象上有很⼤的灵活性和更容易达到它的空间结构。

功能和位置:1. ⽢氨酸经常位于紧密转⾓;和出现在⼤分⼦侧链产⽣空间位阻影响螺旋的紧密包装处(如胶原)和结合底物的地⽅。

2. 由于缺乏空间位阻侧链,所以⽢氨酸在邻近的肽键的位置有更强化学反应活性。

例如:Asn-Gly3. ⽢氨酸也出现在酶催化蛋⽩质特异性修饰的识别位点,例如N 端的⼗四酰基化(CH2(CH2)12CO -)和精氨酸甲基化的信号序列。

丙氨酸 (Ala A )结构:是20种氨基酸中最没有“个性”的氨基酸,没有长侧链,没有特别的构象性质,可以出现在蛋⽩质结构的任何部位。

第一章蛋白质习题_生物化学

第一章蛋白质习题_生物化学

第一章蛋白质学习要点一、元素组成特点:含氮量较恒定,蛋白质系数( 6.25 )二、氨基酸1.蛋白氨基酸:氨基酸(20种)——组成蛋白质的基本单位(1)特点:—L —型氨基酸;(2 )表示:中,英:三字母;(3)分类:原则:生理pH (中性)条件下R—基的带电性;类别(4类):非极性R基氨基酸,极性不带电荷R基氨基酸,负电荷R基氨基酸(酸性氨基酸),正电荷R基氨基酸(碱性氨基酸)2. 性质:(1)两性解离和等电点:两性解离:氨基酸可酸性和碱性解离,解离状态不同,所带电荷不同,酸正碱负等电点(pl )定义:净电荷等于零时的环境pH值等电点时的特点:溶解度下降pl计算法(2 )重要反应:茚三酮反应(氨基酸定性定量)3. 分离方法分配层析,离子交换层析三、肽1.概念:N端、C端;主肽链2. 书写方式:左T右,N R C四、蛋白质结构 1. 一级结构:定义特点:基础结构,稳定结构一级结构与功能的关系:一级结构不同功能可能不同2. 二级结构:(1)概念:二级结构定义;肽键平面(不能自由旋转)(2)种类(4类):—螺旋:要点:单链、右旋,众多氢键;-折叠:肽链伸展,形成链间氢键(成为片层)有平行和反平行两种;—转角(回折):肽链180°旋转,氢键连接;无规则卷曲。

3. 超二级结构:定义4. 结构域:定义5. 三级结构:定义;特点:外亲内疏6. 四级结构:定义,亚基与肽链的区别7. 维持蛋白质空间结构的作用力:氢键、盐键、疏水作用力、二硫键、范德华引力8. 空间结构与功能的关系:一定的结构,一定的功能;结构变化,功能变化;结构破坏,功能破坏六、蛋白质性质 1.两性解离等电点:(1)两性解离:酸、碱解离,酸正碱负(2)等电点(pl )定义:蛋白质净电荷等于零时的环境pH值特点:溶解度降低(3)电泳:原理:不同蛋白的电荷正负和数量不同,分子量不同,形状不同,因此在电场中的运动速度不同。

方向与速度的鉴别:pl —pH,正负决定方向,数值为速度。

蛋白质-氨基酸、肽、蛋白分子结构

蛋白质-氨基酸、肽、蛋白分子结构

•肽键:
一个氨基酸的羧基与另 一个氨基酸的 a-氨基脱 去一分子水缩合后形成 的酰胺键,也称为肽键 (peptide bond.)
•肽的命名与方向 残基
N→C
丝氨酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸
•天然多肽
新陈代谢的产物, 具有特殊的生物学 功能。
•天然多肽



a
b g
g-肽键
•天然多肽
新陈代谢的产物,具有 特殊的生物学功能。
一、基本认识 ★
二、入手点?
★ 入手点:
1.蛋白质是大分子多聚物!
2.结构物质的基本特性? 3.生理环境因素的影响—水?! 4.各种作用力的相互平衡?
5.多肽链中可能存在的有组织的 局部排列?
蛋白质结构层次的推测
第四节 蛋白质的分子结构
一、基本认识
二、入手点
三、蛋白质空间构象 的形成与蛋白质的结 构层次
多肽链折叠的 空间限制
二面角
F=180° y=180°
a-C
a-C
a-C
R
空多 间肽 限链 制折
叠 的
180°=
角 =0°
氨基酸
a-碳原子
八、氨基酸的重要化学反应
◆茚三酮反应: -水合茚三酮试剂 ◆桑格(Sanger)反应: -DNFB (2,4-二硝基氟苯) ◆艾德曼(Edman)反应: –PITC (苯异硫氰酸)
Peptide
成 肽

酰胺键 肽键 应
第 一、蛋白质基本氨基酸
二 节
二、基本氨基酸的分类 三、蛋白质的稀有氨基酸
氨 四、非蛋白质氨基酸
五、氨基酸的酸碱性
基 六、氨基酸的立体化学
酸 ………
苯丙氨酸 酪氨酸 色氨酸

第一章 蛋白质的结构与功能

第一章 蛋白质的结构与功能
18
蛋白质分子中的非共价键(次级键)
1. 氢键: 氢键 (hydrogen bond) 的形成常见于连接在一电负 性很强的原子上的氢原子,与另一电负性很强的 原子之间。 氢键在维系蛋白质的空间结构稳定上起着重要的 作用。 氢键的键能较低(~12kJ/mol),因而易被破坏。
19
蛋白质分子中氢键的形成
(三) 三级结构
蛋白质的三级结构是 指在二级结构、超二级 结构和结构域基础上, 肽链进一步盘绕、折叠 形成的包括主链和侧链 构象在内的三维结构。 二硫键 —— 共价键 疏水键(主要) 氢键 离子键 范德华力 非共价键(次级键)
36
肌红蛋白 三级结构
维持三级 结构的力
(二)球状蛋白的三级结构特怔
26
(一) 二级结构
定义:肽链主链的空间折叠和盘绕方式。
-螺旋 -折叠 -转角 无规则卷曲
类型
27
1 -螺旋
1950年美国Pauling等人提出
结构特点:
①天然蛋白质几乎所有的α-螺 旋都是右手螺旋,在嗜热菌蛋白 酶中发现了一段左手螺旋。 ②螺旋的每圈有3.6个氨基酸, 螺旋间距离为0.54nm ,每个残 基沿轴旋转100°。 ③氨基酸残基的侧链伸向外侧, 每个氨基酸残基NH上的氢与前
结构特点:
① ② ③ ④ 通常是几个超二级结构的组合 一般由100-200个氨基酸残基组成 结构域之间常形成裂隙,比较松散 酶的活性中心往往位于两个结构域 的界面上 ⑤ 结构域之间有一定的柔性,通过相 对运动,实现一定的生物功能 ⑥ 水解出来后仍能维持稳定的结构, 甚至保留某些生物活性
两个结构域
35
O H2N OH
5
2.氨基酸的光吸收
构成蛋白质的20种氨基酸

蛋白质

蛋白质

谷胱甘肽(glutathione, GSH)
γ-肽键
还原型
氧化型
(1) 体内重要的还原剂 保护蛋白质和酶分子中的巯基免遭氧化, 使蛋白质处于活性状态。 (2) 谷胱甘肽的巯基作用 可以与致癌剂或药物等结合,从而阻断这 些化合物与DNA、RNA或蛋白质结合,保护机体免遭毒性损害。
第二节 蛋白质的分子结构
无规卷曲泛指那些不能被归入明确的二级结构 如折叠或螺旋的多肽区段。实际上这些区段大多数 既不是卷曲,也不是完全无规的。这些“无规卷曲” 也像其它二级结构那样是明确而稳定的结构,但是 它们受氨基酸残基侧链R基相互作用的影响很大。这 类有序的非重复性结构经常构成酶活性部位和其它
蛋白质特异的功能部位。
模体是具有特殊功能的超二级结构
(一)α-helix
① 多个肽平 面通过Cα的 旋转,相互之 间紧密盘曲成 稳固的右手螺 旋。
α-helix
② 主链螺旋 上升,每3.6个 氨基酸残基上 升一圈,螺距 0.54nm。肽平 面和螺旋长轴 平行。
α-helix
③ 相邻两圈螺旋之间 借肽键中羰基氧 (C=O)
和亚氨基氢(NH)形成许
多链内氢键,即每一个
氨基酸残基中的亚氨基
氢和前面相隔三个残基 的羰基氧之间形成氢键, 这是稳定α-螺旋的主要 化学键。
α-helix
④ 肽链中氨基酸残基侧链R基, 分布在螺旋外侧,其形状、大小 及电荷均会影响α-螺旋的形成。
(二)β-pleated sheet
①是肽链相当伸展的结构,肽平面之间折叠成锯齿状,相邻肽 平面间呈110°角。 ②依靠两条肽链或一条肽链内的两段肽链间的羰基氧与亚氨基 氢形成氢键,使构象稳定。也就是说,氢键是稳定β-折叠的主 要化学键。

《生物化学与分子生物学》(人卫第八版)-第一章蛋白质的结构与功能归纳总结

《生物化学与分子生物学》(人卫第八版)-第一章蛋白质的结构与功能归纳总结

第一章蛋白质·蛋白质(protein)就是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(prpide bond)相连形成得高分子含氮化合物。

·具有复杂空间结构得蛋白质不仅就是生物体得重要结构物质之一,而且承担着各种生物学功能,其动态功能包括:化学催化反应、免疫反应、血液凝固、物质代谢调控、基因表达调控与肌收缩等;就其结构功能而言,蛋白质提供结缔组织与骨得基质、形成组织形态等。

·显而易见,普遍存在于生物界得蛋白质就是生物体得重要组成成分与生命活动得基本物质基础,也就是生物体中含量最丰富得生物大分子(biomacromolecule)·蛋白质就是生物体重要组成成分。

分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细胞得各个部分都含有蛋白质含量高:蛋白质就是细胞内最丰富得有机分子,占人体干重得45%,某些组织含量更高,例如:脾、肺及横纹肌等高达80%。

·蛋白质具有重要得生物学功能。

1)作为生物催化剂(酶)2)代谢调节作用3)免疫保护作用4)物质得转运与存储5)运动与支持作用6)参与细胞间信息传递·氧化功能第一节蛋白质得分子组成(The Molecular Structure of Protein)1、组成元素:C(50%-55%)、H(6%-7%)、O(19%-24%)、N(13%-19%)、S(0-4%)。

有些但被指含少量磷、硒或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别还含碘。

2、各蛋白质含氮量接近,平均为16%。

100g样品中蛋白质得含量(g%)=每克样品含氮克数*6、25*100,即每克样品含氮克数除以16%。

凯氏定氮法:在有催化剂得条件下,用浓硫酸消化样品将有机氮都转化为无机铵盐,然后在碱性条件下将铵盐转化为氨,随水蒸气蒸馏出来并为过量得硼酸液吸收,再以标准盐酸滴定,就可计算出样品中得氮量。

此法就是经典得蛋白质定量方法。

一、氨基酸——组成蛋白质得基本单位存在于自然界得氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质得氨基酸仅有20种,且均属L-氨基酸(甘氨酸除外),手性,具有旋光性(甘氨酸除外,甘氨酸R基团为-H)。

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二肽
肽键
⑤两性解离和等电点
氨基酸的兼性离子形式
氨基酸在晶体和水溶液中主要以兼性离子 形式存在。 ①晶体熔点高→离子晶格,不是分子晶格。 ②不溶于非极性溶剂→极性分子 ③介电常数高→水溶液中的氨基酸是极性分子。
氨基酸的等电点
当溶液为某一pH值时,氨基酸分子 中所含的-NH3+和-COO-数目正好相等,净 电荷为0。这一pH值即为氨基酸的等电点 (pI)。在等电点时,氨基酸既不向正 极也不向负极移动,即氨基酸处于两性 离子状态。 不同的氨基酸,其等电点(pI)不同。
二、肽的命名及结构
肽链中的氨基酸由于参加肽键的形成已 经不是原来完整的分子,因此称为氨基 酸残基(amino acidresidues)。肽的 命名是从肽链的N-末端开始,按照氨基 酸残基的顺序而逐一命名。氨基酸残基 用酰来称呼,称为某氨基酰某氨基酰… 某 氨基酸。 例如,由丝氨酸、甘氨酸、酪氨酸、丙 氨酸和亮氨酸组成的五肽就命名为丝氨 酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸。
一、蛋白质的功能多样性
1.催化功能 2.结构功能 3.运输功能 4.贮存功能 5.运动功能 6.防御功能 7.调节功能 8.信息传递功能 9.遗传调控功能 10.其它功能
二、蛋白质的分类
(一)按分子组成特点分类: 单纯蛋白质
结合蛋白质 (二)按分子形状分类: 球状蛋白质 纤维状蛋白质 (三)按生物学功能分类:活性蛋白质 非活性蛋白质 可溶性蛋白质 醇溶性蛋白质 不溶性蛋白质
(四)按溶解度分类:
二、蛋白质的分类 (一)按分子形状分类
1.球状蛋白 球形,多溶于水, 多具有活性,长度 与直径之比一般小 于10。 如酶、转运蛋白、 蛋白激素、抗体等。 2.纤维状蛋白 细长,分子量大,多 是结构蛋白。 如胶原蛋白,弹性蛋 白,角蛋白等。
二、蛋白质的分类
(二)按分子组成分类
1.简单蛋白 由氨基酸组成 7类: 清蛋白 球蛋白 组蛋白 精蛋白 谷蛋白 醇溶蛋白和硬蛋白。 2.结合蛋白 由蛋白质和非蛋白成分组 成,后者称为辅基。 7类: 核蛋白 脂蛋白 糖蛋白 磷蛋白 血红素蛋白 黄素蛋白和金属蛋白。
★Sanger
反应

O2N-F | NO2
与2,4-二硝基氟苯反应
COOH | COOH | - NH-CH | | NO2 R
+ H2N-CH
| R
在弱碱中
O2N-
2,4-二硝基氟苯 (DNFB或FDNB)
2,4-二硝基苯-氨基酸 (DNP-氨基酸) 黄色
+HF
★Sanger 反应
2.4一二硝基氟苯(DNFB)
R1
R2

H2N—CH—COOH R1 ﹢

H2N—CH—COOH - H2O R2


H2N—CH—CO—HN —CH —COOH
肽键
二肽
一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基 之间失去一分子水相互连接而成的化合物称为肽 (peptide),由2 个氨基酸缩合形成的肽叫二 肽(dipeptide),由3 个氨基酸缩合形成的肽 叫三肽(tripeptide),少于10 个氨基酸的肽 称为寡肽(oligopeptide),由10个以上氨基酸 形成的肽叫多肽(polypeptide)。
第一章 蛋


第一节
蛋白质通论
蛋白质存在于所有的 生物细胞中,是构成 生物体最基本的结构 物质和功能物质。 蛋白质是生命活动的 物质基础,它参与了 几乎所有的生命活动 过程。
蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽
键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物。
5- 羟 基 赖 氨 酸 I CH3NHCH2CHCH2CH2CHCOOH HO CH2CHCOOH NH2 NH2 I 6-N- 甲 基 赖 氨 酸 3,5- 二 碘 酪 氨 酸
4- 羟 基 脯 氨 酸
r-氨基丁酸(GABA)
谷氨酸脱羧酶
谷氨酸
CO2
r-氨基丁酸
r-氨基丁酸的功能: 它是一种抑制性神经递质,对中枢神经 原有普遍抑制作用,对突触前、突触后也有一定抑 制作用。
★内消旋物:分子内消旋 胱氨酸有三种立体异构体:L-胱氨酸、D-胱氨酸、内 消旋胱氨酸。 L-胱氨酸和D-胱氨酸是外消旋物
2、氨基酸的光吸收性
构成蛋白质的20种氨基酸 在可见光区都没有光吸收, 但在远紫外区(<220nm)均 有光吸收。 在近紫外区(220-300nm)只 有酪氨酸、苯丙氨酸和色 氨酸有吸收光的能力。 酪氨酸的max=275nm, 275=1.4x103; 苯丙氨酸的max=257nm, 257=2.0x102; 色氨酸的max=280nm, 280=5.6x103;
(三)氨基酸的生物学功能
1、合成蛋白质,以满足机体生长发 育和组织的更新修复等需要。 2、转变成具有重要生理功能的含氮 化合物(如核苷酸、尼克酰胺、儿茶酚 胺类激素、甲状腺素等)。 3、转变成糖类或脂肪。 4、氧化供能。
二、氨基酸的重要理化性质
(一)物理性质 (二)化学性质
(一)物理性质
氨基酸的构型、旋光性和光吸收
-OH 羟基 -SH 巯基 -CO-NH 酰胺基
-COOH 羧基
-NH2
氨基 胍基 咪唑基
根据氨基酸的侧链R基团的极性分类: ①极性氨基酸:
⑴极性不带电荷:甘、丝、苏、天酰、 谷酰、 酪、半胱 ⑵极性带负电荷:天、谷 ⑶极性带正电荷:组、赖、精 ②非极性氨基酸:丙、缬、亮、异亮、 苯丙、蛋、脯、色
2.蛋白质一级结构的测定 蛋白质一级结构的测定就是测定蛋白质 多肽链中氨基酸的排列顺序,这是揭示生命 本质,阐明结构与功能的关系,研究酶的活 性中心和酶蛋白高级结构的基础,也是基因 表达、克隆和核酸顺序分析的重要内容。
1、氨基酸的构型与旋光性
Gly一种构型,无旋光性 Thr和Ile有四种光学异构体。 其余17种氨基酸有两种光学异构体: L型、D型。
构成蛋白质的氨基酸均属L-型(L-苏氨酸)。
氨基酸的旋光性(符号和大小)取决于 它的R基的性质,并与溶液的PH值有关。 外消旋物:D-型和L-型的等摩尔混合物。 L-苏氨酸和D-苏氨酸组成消旋物。
DNP- 氨基酸,黄色,层析法鉴定,被 Sanger 用来测定多 肽的NH2末端氨基酸
③ 与茚三酮的反应
O ‖ NH2
2
‖ O 沸腾

OH OH
+
R—CH—COOH

氨基酸
蓝紫色化合物
④成肽反应
R1 R2

H2N—CH—COOH
R1

﹢ H2N—CH—COOH
- H2O R2


H2N—CH—CO—HN —CH —COOH
2、碱水解
5 mol/L NaOH
蛋白质
煮沸10h-20h
氨基酸混合物
四、蛋白质的水解
3、酶水解
蛋白酶 (proteinase)
蛋白质
肽段
第二节 氨基酸
一、氨基酸的结构与分类 (一)基本氨基酸 (二)不常见的蛋白质氨基酸 (三)氨基酸的生物学功能 二、氨基酸的性质 (一)物理性质 (二)化学性质
氨基酸的等电点
侧链不含离解基团的中性氨基酸,其等电点是它的pK’1 和pK’2的算术平均值: pI = (pK’1 + pK’2 )/2 对于侧链含有可解离基团的氨基酸,其pI值也决定于两 性离子两边的pK’值的算术平均值。 酸性氨基酸:pI = (pK’1 + pK’2 )/2 碱性氨基酸:pI = (pK’2 + pK’3 )/2
对于丙氨酸等一氨基一羧基的中性型氨基酸来说,由于羧 基电离度略大于氨基电离度,所以溶于水时,其负离子数 将多于正离子数,因而在纯水中显微酸性.
CH2—SH
HS CH2
CH—NH2 +
COOH
CH—NH2
COOH +2H
-2H
CH2—S
CH—NH2 + COOH
S
CH2
CH—NH2 COOH
第三节 肽
氨基酸的分类
根据氨基酸的侧链R基团的化学结构分类: ①脂肪族氨基酸:甘、丙、缬、亮、异亮、 蛋、半胱、丝、苏、谷、 谷酰、天、天酰、赖、精 ②芳香族氨基酸:苯丙、酪、色 ③杂环氨基酸: 组、脯 ④杂环亚氨基酸:脯
氨基酸
R基团
R基团上有功能基团
丝Ser 半胱Cysh 天酰Asn 谷酰Gln 天冬Asp 谷Glu 赖Lys 精Arg 组His
谷胱甘肽的功能
GSH可与氧化剂如H2O2起反应,从而保护 一些含巯基的蛋白质或酶免遭氧化而丧 失正常结构与功能。 如红细胞中的GSH可以保护细胞膜上含巯 基的蛋白质和酶,以维护膜的完整性和 酶活性。
谷胱甘肽的功能
H2O2 2GSH NADP+
GSH还原酶
GS#43;H+
(二)化学性质 Edman反应
① 与苯异硫氰酸酯(PITC )的反应
-N=C=S COOH | -NH-C-NH-CH-COOH 在弱碱中 S | R
+ H2N-CH 苯异硫氰酸酯 | R (PITC )
O H+ C -N
苯氨基硫甲酰氨基酸 (PTC-氨基酸)
CH-R
环化
C
S
NH
苯乙内酰硫脲氨基酸 (PTH-氨基酸) 无色
三、蛋白质的元素组成与分子量
元素组成: C、H、O、N 含N量 : 16% 1克N= 6.25克 蛋白质
每克样品中含N克数×6.25×100 =100克样品中蛋白质的含量(克%)
四、蛋白质的水解
1、酸水解
6 mol/LHCl或 4 mol/L的H2SO4 105℃ 20小时
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