分子生物学-复习提纲-05.启动子与增强子
医学分子生物学名词解释-1

1.启动子:启动子是基因转录起始所必须的一段DNA序列,是基因表达调控的上游顺式作用元件之一2.增强子:能强化转录起始的序列为增强子或强化子,与启动子一起都可视为基因表达调控中的顺式作用元件。
无论位于靶基因的上游、下游或内部都可以发挥作用。
3.抗终止因子:抗终止因子是指能在特定位点阻止转录终止的一类蛋白。
这些蛋白与RNA聚合酶的核心酶结合,使RNA能越过终止子,继续转录DNA。
4.上游启动子元件:TATA区上游的保守序列称为上游启动子元件,它们决定转录产物产率高低。
5.帽子结构:通过倒扣GTP和特殊的甲基化修饰而加在真核mRNA5′端的特殊结构,可保护mRNA的稳定,形似帽子而得名。
6.顺式作用元件:是指对基因表达有调节作用的DNA序列,如启动子、增强子等。
其活性只影响与其自身同处在一个DNA分子上的基因。
7.反式作用因子:是指远离受影响的基因之外的基因所编码的产物,又称为转录因子(本质是蛋白质)。
有特异性和非特异性之分。
8.结构基因和调节基因结构基因:编码功能各异的蛋白质或RNA的特异DNA序列。
调节基因:编码那些参与基因表达调控的RNA和蛋白质(即调控RNA和调控蛋白)的特异DNA序列。
9.组成蛋白和调节蛋白组成蛋白:细胞内有许多种蛋白质的含量几乎不受外界环境的影响,这些蛋白质称为组成蛋白。
调节蛋白:是一类特殊的蛋白质,是调节基因的产物,它们可以影响一种或多种基因的表达。
有两种类型的调节蛋白,即起正调节作用的激活蛋白和起负调节作用的阻遏蛋白。
10.异染色质:细胞间期核内染色质压缩程度较高,碱性染料着色较深的区域。
着丝粒、端粒、次缢痕, DNA主要是高度重复序列,没有基因活性。
11.核小体:核小体是染色体的基本组成单位,它是由DNA和组蛋白构成的,组蛋白H3、H4、H2B、H2A各两份,组成了蛋白质八聚体的核心结构,大约200bp的DNA盘绕在蛋白质八聚体的外面,相邻两个核小体之间结合了1分子的H1组蛋白。
分子生物学知识点总结

宛本人自己总结, 大家随便一看。
基因与基因组基因(gene): 储存有功能的蛋白质多肽链或RNA序列信息, 及表达这些信息所必须的全部核苷酸序列所构成的遗传单位。
1.顺式作用元件有: 启动子和上游启动子元件, 反应元件, 增强子, 沉默子, Poly加尾信号启动子: 有方向性, 转录起始位点上游, TA TA盒, B地贫, 与RNA聚合酶特异结合及启动转录上游启动子元件: TATA盒上游, 与反式作用因子结合, 调控基因转录效率。
CAAT盒, GC盒, CACA盒—B地贫反应元件: 与激活的信息分子受体结合, 调控基因表达增强子: 与反式作用因子结合, 基因表达正调控, 无方向性沉默子: 与反式作用因子结合, 基因表达负调控Poly加尾信号: 结构基因末端AA TAAA及下游富含GT或T区, 多聚腺苷酸化特异因子, 在3末端加200个A B地贫1.除逆转录病毒外, 通常为单倍体基因组。
逆转录病毒: 单股正链二倍体RNA, 三个结构基因, gag, pol, env, 5端甲基化帽, 3端poly加尾。
HIV免疫缺陷病毒, 白血病病毒, 肉瘤病毒感染细菌的病毒基因组与细菌相似, 基因连续, 感染真核细胞的病毒基因组与真核细胞相似, 有内含子, 基因不连续。
3.基因组连续:冠状病毒, 脊髓灰质炎病毒, 鼻病毒4.编码区占大部分原核生物基因组1.由一条环状双链DNA分子组成, 通常只有一个复制起点。
2.结构基因大多组成操纵子, 形成多顺反子(mRNA)3.非编码区主要是调控序列。
(转录终止区可有强终止子有反向重复序列, 形成茎环结构)4.存在可移动的DNA序列(转座因子:能够在一个DNA内或两个DNA间移动的DNA片段转座因子:插入序列, 转座子, 可转座的噬菌体, 转座作用的机制:复制性转座, 简单转座, 共整合体, 插入突变)5.编码区大于非编码区真核生物基因组1.有同源性的功能相关基因构成基因家族核酸序列相同, 核酸序列高度同源, 编码产物的功能或功能区相同, 假基因2.真核基因为断裂基因, 编码为单顺反子。
启动子和增强子
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为了让RNA聚合酶向
前移动开始转录, 需
要TFIIH的激酶活性 来使CTD磷酸化.
CTD对于招募各 种酶来修饰RNA 是很重要的.
21.13 Short sequence elements bind activators. 短序列元件结合激活剂.
• 短保守序列元件分散地分布在起始点上游的 区域中.
21.2 Eukaryotic RNA polymerases consist of many subunits. 真核生物的RNA聚合酶由多个 亚基组成.
• RNA聚合酶I在核仁中合成rRNA. • RNA聚合酶II在核质中合成mRNA. • RNA聚合酶III在核质中合成snRNA, 5S
RNA和tRNA.
• 序列AAUAAA是一种切割信号, 用于产生多聚 腺苷酸化的mRNA 3'端.
• 特异性因子和核酸内切酶在AAUAAA下游切割 mRNA.
• 特异性因子和poly(A)聚合酶在3'端连续添加约 200个A残基.
序列AAUAAA是 切割产生3'端和多 聚腺苷酸化所必需 的.
24.20 Cleavage of the 3′ end of histone mRNA may require a small RNA. 组蛋白mRNA的3'端 切割可能需要小RNA.
21.10 The basal apparatus assembles at the promoter. 启动子上基本转录装置的装配.
• TFIID结合到TATA盒上是转录起始的第一步. • 其他转录因子以严格的先后顺序结合到复合
体中, 这样, DNA上被保护区域的长度随之延 伸. • 当RNA聚合酶II结合到复合体上时, 它就起始 转录.
分子生物学 复习提纲
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分子生物学复习提纲免责声明:本资料仅供临床医学10级学习交流使用,基本覆盖上课重点。
由于课程的特殊性,特列成专题形式,个专题中重复部分在相应专题中都会覆盖。
凡应只使用本资料应试而造成的一切不良后果,均由使用者承担,本人不承担任何责任。
第一讲基因表达调控(转录水平的调节是基因表达调控的关键)分子生物学:是以生物大分子为研究对象,从分子水平去研究并解释一切生物学现象并在分子水平上改造和利用生物的一门新兴科学。
基因:编码RNA或蛋白质的全部核苷酸序列,包括结构基因和调控基因。
基因组:细胞或生物体中一套完整单倍体的遗传物质的总和,包括所有的基因和基因间区。
结构基因:编码RNA或蛋白质的核苷酸序列。
(原核:多顺反子、无内含子;真核:单顺反子、有内含子)转录单位:从启动子到转录终止子之间的DNA节段。
基因表达:是指DNA携带的遗传信息通过转录传递给RNA,mRNA通过翻译将基因的遗传信息在细胞内得以表达,合成具有生物功能的各种蛋白质的过程。
基因表达调控:是指对基因组中某一基因或一些功能相近的基因表达开启、关闭和表达强度的直接调节。
遗传密码:mRNA上按5’到3’方向排列的每三个核苷酸称遗传密码。
内含子:DNA或RNA中的非编码序列。
外显子:DNA或RNA中的编码序列。
多顺反子:一个结构基因转录产生一条mRNA ,编码几条功能相关的多肽链。
单顺反子:一个结构基因转录产生一条mRNA ,编码一条多肽链的生成。
启动子:是转录开始时RNA聚合酶识别、结合并开始转录起始所需的一段DNA序列。
终止子:提供转录终止信号的一段DNA序列。
增强子:能加强其上游或下游基因转录的DNA序列。
SD序列:mRNA5’端在起始密码子AUG 上游3~11bP处,含A-G 短序列,容易与16S r RNA3’-端含U-C 序列互补配对,称为SD 序列,它对mRNA与核糖体的有效结合并翻译至关重要。
开放阅读框ORF:始于起始密码子并终于终止密码子的一串密码子所组成的核苷酸序列。
分子生物学复习题1
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生物信息的传递(上)——从DNA到RNA一、名词解释1、增强子:DNA上能强化转录起始的序列,能够在启动子任何方向以及任何位置(上游或下游)作用。
2、RNA编辑:某些RNA,特别是mRNA的一种加工方式,发生编辑后,导致DNA所编码的遗传信息的改变。
3、不对称转录:DNA片段转录时,双链DNA中只有一条链作为转录的模板,这种转录方式称为不对称转录。
4、转录泡:是由DNA双链,RNA聚合酶与新合成的转录本RNA局部形成的结构,它贯穿于延长过程的始终。
5、转录单位:DNA链上从启动子直到终止子为止的长度称为一个转录单位。
一个转录单位可以包括一个基因,也可以包括几个基因。
6、选择性剪接:在mRNA前体的剪接过程中,参加剪接的外显子可以不按其线性次序剪接,内含子也可以不被切除而保留,即一个外显子或内含子是否出现在成熟mRNA中是可以选择的,这种剪接方式称为选择性剪接。
二、选择题1、有关RNA转录合成的叙述,其中错误的是 A 。
A、转录过程RNA聚合酶需要引物B、转录时只有一股DNA作为合成RNA的模板C、RNA链的生长方向是5'3'D、所有真核生物RNA聚合酶都不能特异性地识别promoter2、以下有关大肠杆菌转录的叙述,哪一个是正确的? B 。
A、-35区和-10区序列间的间隔序列是保守的B、-35区和-10区序列距离对转录效率非常重要C、转录起始位点后的序列对于转录效率不重要D、-10区序列通常正好位于转录起始位点上游10bp处3、真核生物转录过程中RNA链延伸的方向是 A 。
A、5'3'方向B、3'5'方向C、N端C端D、C端N端4、真核生物mRNA转录后加工不包括 A 。
A、加CCA—OHB、5'端“帽子”结构C、3'端poly(A)尾巴D、内含子的剪接5、以下对DNA聚合酶和RNA聚合酶的叙述中,正确的是: B 。
A、RNA聚合酶的作用需要引物B、两种酶催化新链的延伸方向都是5'3'C、DNA聚合酶能以RNA作模板合成DNAD、RNA聚合酶用NDP作原料三、判断题1、在真核生物中,所有rRNA都是由RNA聚合酶Ⅱ转录的。
医学分子生物学名词解释-1
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1.启动子:启动子是基因转录起始所必须的一段DNA序列,是基因表达调控的上游顺式作用元件之一2.增强子:能强化转录起始的序列为增强子或强化子,与启动子一起都可视为基因表达调控中的顺式作用元件。
无论位于靶基因的上游、下游或内部都可以发挥作用。
3.抗终止因子:抗终止因子是指能在特定位点阻止转录终止的一类蛋白。
这些蛋白与RNA聚合酶的核心酶结合,使RNA能越过终止子,继续转录DNA。
4.上游启动子元件:TATA区上游的保守序列称为上游启动子元件,它们决定转录产物产率高低。
5.帽子结构:通过倒扣GTP和特殊的甲基化修饰而加在真核mRNA5′端的特殊结构,可保护mRNA的稳定,形似帽子而得名。
6.顺式作用元件:是指对基因表达有调节作用的DNA序列,如启动子、增强子等。
其活性只影响与其自身同处在一个DNA分子上的基因。
7.反式作用因子:是指远离受影响的基因之外的基因所编码的产物,又称为转录因子(本质是蛋白质)。
有特异性和非特异性之分。
8.结构基因和调节基因结构基因:编码功能各异的蛋白质或RNA的特异DNA序列。
调节基因:编码那些参与基因表达调控的RNA和蛋白质(即调控RNA和调控蛋白)的特异DNA序列。
9.组成蛋白和调节蛋白组成蛋白:细胞内有许多种蛋白质的含量几乎不受外界环境的影响,这些蛋白质称为组成蛋白。
调节蛋白:是一类特殊的蛋白质,是调节基因的产物,它们可以影响一种或多种基因的表达。
有两种类型的调节蛋白,即起正调节作用的激活蛋白和起负调节作用的阻遏蛋白。
10.异染色质:细胞间期核内染色质压缩程度较高,碱性染料着色较深的区域。
着丝粒、端粒、次缢痕, DNA主要是高度重复序列,没有基因活性。
11.核小体:核小体是染色体的基本组成单位,它是由DNA和组蛋白构成的,组蛋白H3、H4、H2B、H2A各两份,组成了蛋白质八聚体的核心结构,大约200bp的DNA盘绕在蛋白质八聚体的外面,相邻两个核小体之间结合了1分子的H1组蛋白。
分析增强子和启动子区别
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分析增强子和启动子的区别在基因组学研究中,增强子(enhancer)和启动子(promoter)是两个重要的概念。
它们都是调控基因表达的元件,但在功能和位置上有着明显的区别。
本文将从不同的角度分析增强子和启动子的区别。
1. 定义•增强子:增强子是一种DNA序列,位于基因或远离基因的染色质上,并能够调控靠近或远离它的基因的表达。
增强子通常能够与启动子和转录因子相互作用,增加或提高靶基因的表达水平。
•启动子:启动子是一种DNA序列,位于基因的上游区域(5’末端),与转录因子及RNA聚合酶结合,开始基因的转录过程。
2. 位置增强子和启动子在基因上的位置有明显的差异。
•增强子:增强子通常位于远离基因的位置(上游或下游数千个碱基对),可以通过DNA环路与靠近的启动子相互作用,调节基因的表达。
增强子的作用与距离基因的远近无关,并可以作用于多个基因。
•启动子:启动子通常位于基因的上游区域(上游200至1000个碱基对),与转录因子和RNA聚合酶结合,开始基因转录过程。
3. 功能增强子和启动子在基因调控中发挥不同的作用。
•增强子:增强子能够增加或提高靶基因的表达水平,使该基因在特定条件下更活跃。
增强子通过与启动子和转录因子相互作用,改变染色质构象和调节转录因子的结合,从而影响基因表达。
•启动子:启动子是基因转录的起始点,能够与RNA聚合酶和转录因子结合,开始基因转录过程。
启动子的功能是启动基因的表达,其活性决定了该基因的转录水平。
4. 结构增强子和启动子在结构上也存在差异。
•增强子:增强子通常是几百个碱基对长的DNA序列,具有丰富的转录结合位点和转录因子结合位点。
增强子并不直接参与基因转录,而是通过与启动子区域相互作用来影响基因的表达。
•启动子:启动子通常包括核心启动子和调控序列。
核心启动子是一个短序列(通常为几十个碱基对),与RNA聚合酶结合,直接参与基因的转录过程。
调控序列位于核心启动子上游,包含转录因子结合位点和其他调控元件,可以进一步影响启动子的活性和基因的表达。
分子生物学复习资料精选全文
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可编辑修改精选全文完整版分子生物学复习资料名词解释:复制叉:复制时,双链DNA要解开成两股链分别进行,所以,这个复制起点呈现叉子的形式,被称为复制叉。
复制子:单独复制的一个DNA单元被称为一个复制子,是一个可移动的单位。
一个复制子在任何一个细胞周期只复制一次。
Klenow片段:用枯草杆菌蛋白酶处理大肠杆菌DNA聚合酶而从全酶中除去5’-3’外切酶活性的肽段后的大片段肽段。
外切酶:是一类能从多核苷酸链的一端开始按序催化水解3、5-磷酸二酯键,降解核苷酸的酶。
内切酶:是一种能催化多核苷酸的链断裂的酶,只对脱氧核糖核酸内一定碱基序列中某一定位置发生作用,把这位置的链切开。
前导链:在DNA复制过程中,与复制叉运动方向相同,以5'-3'方向连续合成的链。
冈崎片段:在DNA复制过程中,前导链连续合成,而滞后链只能是断续的合成5’-3’的多个短片段,这些不连续的片段称为冈崎片段。
端粒:是真核生物线性基因组DNA末端的一种特殊结构,它是一段DNA序列和蛋白质形成的复合体。
端粒酶:是负责染色体末端(端粒)复制,是由 RNA 和蛋白质组成的核糖核蛋白.其中的 RNA 成分是端粒复制的模板.(因此端粒是逆转录酶) 作用:维持端粒长度.DNA复制参与的酶和蛋白:拓扑异构酶,解链酶,单链结合蛋白(SSB蛋白),引发酶,DNA聚合酶,DNA连接酶。
线性DNA末端复制方式:1)环化;2)末端形成发卡结构;3)某些蛋白质的启动。
DNA修复的方式:错配修复,切除修复,重组修复,DNA直接修复,SOS反应。
AP位点:所有细胞中都带有不同类型、能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。
AP修复:DNA分子中一旦产生了AP位点,AP核酸内切酶就会把受损核苷酸的糖苷-磷酸键切开,并移去包括AP位点核苷酸在内的小片段DNA,由DNA聚合酶Ⅰ合成新的片段,最终由DNA连接酶把两者连成新的被修复的DNA链。
启动子-增强子环三维结构-概述说明以及解释

启动子-增强子环三维结构-概述说明以及解释1.引言1.1 概述引言部分是文章开头的部分,用来引入读者对主题的背景和重要性。
概述部分应该对启动子-增强子环三维结构做一个简要的概括和说明。
以下是一个可能的内容:概述:启动子和增强子是调控基因表达的两个关键元素,在基因调控网络中发挥着重要的作用。
近年来,随着对基因调控机制的深入研究,研究人员开始关注启动子和增强子之间的相互作用及其在基因表达中的功能。
启动子-增强子环三维结构是指启动子与附近的增强子在三维空间中相互接触形成的复杂结构。
这种环状结构在调控基因表达中起着至关重要的作用。
启动子通常位于基因的上游区域,它能够结合转录因子和RNA聚合酶等调节因子,使基因转录开始。
而增强子则可以进一步增强启动子的活性,从而促进基因的高效表达。
传统上,对于启动子和增强子的研究主要集中在它们的序列特征和功能上,但近年来的研究表明,启动子-增强子相互作用在基因调控中发挥着至关重要的作用。
通过结构生物学技术和基因组学方法的发展,我们能够更深入地了解启动子-增强子的相互作用和结构特征。
这些研究揭示了启动子-增强子环的复杂三维结构,并揭示了它们在调控基因表达中的功能。
启动子-增强子环的形成是通过染色质重塑和DNA环绕来实现的,这种环状结构有助于增强启动子和增强子之间的物理接触,从而增强其调控效果。
此外,启动子-增强子环的形成还与转录因子的空间布局和染色质状态密切相关。
本文的目的是系统性地概述启动子-增强子环的三维结构,探讨其在基因调控过程中的重要性,并展望其未来研究的方向。
通过对启动子-增强子环的深入理解,我们将能够更好地把握基因调控的机制,并为疾病治疗和基因工程等领域提供新的思路和策略。
接下来,我们将首先介绍启动子和增强子的定义及其功能,然后重点探讨启动子-增强子相互作用的重要性。
最后,我们将总结启动子-增强子的重要性,并展望其在未来研究中的发展方向。
1.2文章结构1.2 文章结构本文主要包括以下几个部分内容:1. 引言:对启动子-增强子环三维结构的概述和背景进行介绍,明确研究的目的和意义。
分子生物学复习整理

1、增强子:能提高转录起始效率的序列被成为增强子或强化子。
增强子可位于转录起始点的5’或3’末端,而且一般与所调控的靶基因的距离无关。
2、C值反常:也称C值谬误。
指C值往往与种系的进化复杂性不一致的现象,即基因组大小与遗传复杂性之间没有必然联系,某些较低等的生物C值却很大,如一些两栖动物的C 值甚至比哺乳动物还大。
3、DNA重组技术:又称基因工程,将不同的DNA片段(如某个基因或基因的一部分)按照预先的设计定向连接起来,在特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达,产生影响受体细胞的新的遗传性状的技术。
4、基因家族:在基因组进化中,一个基因通过基因重复产生了两个或更多的拷贝,这些基因即构成一个基因家族,是具有显著相似性的一组基因,编码相似的蛋白质产物。
5、SD序列:存在于原核生物起始密码子AUG上游7~12个核苷酸处的一种4~7个核苷酸的保守片段,它与16SrRNA3’端反向互补,所以可将mRNA的AUG起始密码子置于核糖体的适当位置以便起始翻译作用。
根据首次识别其功能意义的科学家命名。
6、核酶:是一类具有催化活性的RNA分子,通过催化靶位点RNA链中的磷酸二酯键的断裂,特异性的剪切底物RNA分子,从而阻断基因的表达。
7、RNA干扰:是利用双链小RNA高效、特异性降解细胞内同源mRNA,从而阻断体内靶基因表达,使细胞出现靶基因缺失表型的方法。
8、反式作用因子:是指能直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上参与调控靶基因转录效率的蛋白质。
9、操纵子:是指原核生物中由一个或多个相关基因以及转录翻译调控元件组成的基因表达单元。
10、基因组:生物有机体的单倍体细胞中的所有DNA,包括核中的染色体DNA和线粒体、叶绿体等亚细胞器中的DNA。
11、cDNA文库:真核生物基因组DNA非常庞大,而且含有大量重复序列,无论用电泳分离技术还是用杂交方法都难以直接分离到靶基因片段。
为了较快地分离到相关基因,通过反转录mRNA得到的cDNA不含冗余序列,通过特异性探针筛选的cDNA构成的cDNA文库。
启动子与增强子
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枯藤老树昏鸦,小桥流水人家,古道西风瘦马。
夕阳西下,断肠人在天涯。
第三章第二节启动子与增强子教学目标:教学重、难点:教学内容:一、原核生物启动子1 启动子:是一段位于结构基因5 '端上游区的DNA 序列,在转录起始之前被RNA 聚合酶结合的DNA部位称为启动子;启动子的结构影响它与RNA 聚合酶的亲和力,决定基因表达强度。
转录单元:是一段从启动子开始到终止子(terminator )结束的DNA 序列,RNA 聚合酶从转录起点开始沿着模板前进,直到终止子为止,转录出一条RNA 链;在细菌中,一个转录单元可以是一个基因,也可以是几个基因。
2 转录起点:指与新生RNA 链第一个核苷酸相对应DNA 链上的碱基,研究证实通常为一个嘌呤。
上游:常把起点前面,即5 '末端的序列称为(upstream )上游;下游:起点后面即3 '末端的序列称为下游(downstream )。
在描述碱基的位置时,起点为+1 ,下游方向依次为+2 ,+3 ……,上游方向依次为-1 ,-2 ,-3 ……。
3 启动子结构:Pribnow框:在起始点上游,几乎在所有启动子都存在一个6 bp富含A/T区域TATAAT。
通常位于-18位到-9位,称为Pribnow框。
该区域是RNA聚合酶牢固结合位点,RNA聚合酶结合后,这一富含A/T的DNA双链解开。
Sextama框:位于-35区附近有一TTGACA序列,是RNA聚合酶中的σ因子识别位点。
以上这两个位点对于转录起始都是非常重要的。
σ因子识别-35区并与之结合。
由于RNA聚合酶分子覆盖面积能达到70bp,因此酶分子上的一个合适部位能接触-10区。
酶分子一旦与-10区结合以后,就从识别位点上解离下来。
此外,-35序列的重要性还在于在很大程度上决定了启动子的强度。
-10 区和-35 区的最佳距离:在原核生物中,-35 区和-10 区的距离大约是16 ~19bp ,小于15bp 或大于20bp 都会降低启动子的活性;保持启动子这两段序列以及它们之间的距离是十分重要的,否则就会改变它所控制的基因表达水平。
启动子和增强子相互作用
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启动子和增强子是基因调控的重要元件,它们在调控基因表达中扮演着关键的角色。
本文将深入探讨启动子和增强子的概念、结构和相互作用的机制。
启动子和增强子相互作用什么是启动子和增强子启动子的定义和功能•启动子位于基因的上游区域,在转录起始位点附近,一般由一系列特定序列组成。
•启动子是基因转录的起点,它与转录因子的结合使得转录酶能够结合并开始转录过程。
增强子的定义和功能•增强子位于启动子附近的DNA序列,可以远离转录起始位点。
•增强子可以调节基因表达水平,使得启动子的转录效率增加。
启动子和增强子的结构差异启动子的结构•启动子一般包含TATA盒、CAAT盒和GC盒等保守序列。
•TATA盒位于转录起始位点上游,是转录因子结合的重要区域。
•CAAT盒位于TATA盒上游,也可以结合转录因子调控基因转录。
•GC盒则通常位于启动子的下游区域。
增强子的结构•增强子一般由多个转录因子结合位点组成。
•这些结合位点中的DNA序列可以是不规则的,没有严格保守的序列。
三维基因组结构的影响•三维基因组结构中的染色体折叠可以使得启动子和增强子之间产生空间上的靠近。
•这种靠近为启动子和增强子之间的相互作用提供了可能性。
转录因子的介导•转录因子可以与启动子和增强子的序列特异性结合。
•当转录因子结合在增强子上时,可以通过DNA环路与启动子相互作用。
•这种增强子与启动子的相互作用可以促进转录因子的结合,增强基因表达。
长程相互作用•通过染色质构象的调节,增强子可以与远离的启动子产生相互作用。
•长程相互作用可以调节启动子的活性,影响基因的转录水平。
启动子和增强子的研究方法DNA染色质免疫共沉淀(ChIP)1.转录因子与DNA结合的检测方法。
2.利用特定抗体将转录因子与DNA结合的区域富集,然后进行测序或PCR分析。
Hi-C技术1.用于研究染色质的三维结构。
2.可以发现启动子和增强子之间的空间靠近关系。
CRISPR-Cas9技术1.用于研究启动子和增强子的相互作用及其功能。
分子生物学名词解释和部分习题(精)

1、增强子:就是远离转录起始点、决定组织特异性表达、增强启动子转录活性的特异 DNA 序列,其发挥作用的方式与方向、距离无关。
2、增强子 : 位于真核基因中远离转录起始点, 能明显增强启动子转录效率的特殊 DNA 序列。
它可位于被增强的转录基因的上游或下游, 也可相距靶基因较远。
3、同位酶:识别相同的序列但切割位点不一样的酶。
4、顺反子:产生一条多肽链或功能 RNA 所必需的全部核苷酸序列。
5、回复突变:一个等位基因可以突变为其相对的另一个等位基因,反之,另一个等位基因也可以突变为原来的基因,这种突变叫作回复突变。
6、衰减子:在色氨酸操纵子中的一个区域,此区域以形成不同二级结构的方式,利用原核生物转录与翻译的偶联对转录进行调节。
此区域只存在于原核生物合成代谢的操纵子中。
7、切刻平移:用 DNA 聚合酶 I 在有缺刻的 DNA 双链上一面进行5′→ 3′的外切,一面进行 DNA 合成,使缺刻在 DNA 上发生平移的过程。
此过程也是制备放射性探针的一种方法。
8、减色效应:变性 DNA 复性后 , 在 260nm 的吸收值减少的现象称为减色效应。
9、核受体:细胞内受体分布于胞浆或核内,本质上都是配体调控的转录因子,均在核内启动信号转导并影响基因转录,统称核受体。
10、增色效应:当核酸变性后 , 其 260nm 的紫外吸收增加的现象。
11、负超螺旋:两股以右旋方向缠绕的螺旋在外力向松缠的方向捻转时 , 产生一个右旋的超螺旋以解除外力捻转造成的胁迫,这样形成的超螺旋为负超螺旋。
12、限制性内切核酸酶:是一类能识别和切割双链 DNA 分子中特定碱基顺序的核酸内切酶。
13、复制子:含有一个起点的复制单位。
其长度等于相邻两个复制起点间的距离。
14、半保留复制:在 DNA 复制过程中亲代 DNA 分子的两条链首先解螺旋和分离,然后以每条链为模板,按碱基互补配对原则,合成两条与模板链互补的新链。
这样从亲代的一个双螺旋 DNA 分子形成了两个与原先的碱基序列完全相同的两个子代DNA 分子。
分子生物学期末考试题目及答案
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分子生物学复习提纲一.名词解释(1)Ori :原核生物基因质粒的复制起始位点,是四个高度保守的19bp组成的正向重复序列,只有ori能被宿主细胞复制蛋白质识别的质粒才能在该种细胞中复制。
ARS:自主复制序列,是真核生物DNA复制的起点,包括数个复制起始必须的保守区.不同的ARS序列的共同特征是一个被称为A区的11bp的保守序列。
(2)Promoter:启动子,与基因表达启动有关的顺式作用元件,是结构基因的重要成分,它是位于转录起始位点5’端上游区大约100~200bp以内的具有独立功能的DNA序列,能活化RNA 聚合酶,使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。
(3)ρ—independent termination不依赖ρ因子的终止,指在不依赖ρ因子的终止反应中,没有任何其他因子的参与,核心酶也能在某些位点终止转录.(强终止子)(4)SD sequence:SD序列(核糖体小亚基识别位点),存在于原核生物起始密码AUG上游7~12个核苷酸处的一种4~7个核苷酸的保守片段,它与16SrRNA3’端反向互补,所以可以将mRNA的AUG起始密码子置于核糖体的适当位置以便起始翻译作用.Kozak sequence:存在于真核生物mRNA的一段序列,核糖体能够识别mRNA 上的这段序列,并把它作为翻译起始位点.(5)Operator:操纵基因,与一个或者一组结构基因相邻近,并且能够与一些特异的阻遏蛋白相互作用,从而控制邻近的结构基因表达的基因。
Operon:操纵子,是指原核生物中由一个或多个相关基因以及转录翻译调控元件组成的基因表达单元。
包括操纵基因、结构基因、启动基因。
(6)Enhancer:增强子,能强化转录起始的序列的为增强子或强化子Silencer:沉默子,可降低基因启动子转录活性的一段DNA顺式元件.与增强子作用相反。
(7)cis-acting element :顺式作用元件,存在于基因旁侧序列中能影响基因表达的序列,包括启动子、增强子、调控序列和可诱导元件,本身不编码任何蛋白质,仅仅提供一个作用位点,与反式作用因子相互作用参与基因表达调控.trans—acting factor:反式作用因子,是指直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上参与调控靶基因转录效率的蛋白质。
增强子和启动子的相互作用
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增强子和启动子的相互作用增强子和启动子的相互作用,这个话题听起来有点高深,但其实就像是个小故事。
想象一下,一个乐队的演出,增强子就像是乐队的音响设备,而启动子则是指挥。
没有指挥,乐队的乐器虽然都在,却没有人带动节奏。
指挥可不能缺少,毕竟他负责让每一个音符都能和谐地响起。
增强子则负责让声音更大、更好。
要是没有它,乐队再怎么努力,效果也差强人意。
想象一下,一个小小的增强子,可能就是那种特别劲爆的音响,能把你从椅子上震起来,简直太给力了。
好吧,咱们把这个乐队的比喻放一放,来聊聊它们的真正职责。
增强子可不是简单的“开关”,它就像个小助手,能让启动子发挥得更出色。
启动子负责启动基因的转录,但要想让这个过程进行得顺利,增强子就是必不可少的好帮手。
想象一下,在一个晚会上,启动子穿着礼服,优雅地走到舞台,准备开始表演。
这时,增强子就在后台默默地调整着音响,确保每一个音符都能传到每一个角落。
没有增强子的助力,启动子就算再有风度,也难免显得有些冷清。
说到相互作用,这就好比两个好朋友,彼此之间有着微妙的默契。
增强子和启动子之间的关系就像是兄弟般的情谊。
增强子通过结合转录因子,提升启动子的活性,确保基因能顺利被表达。
这种互动简直像是在跳舞,增加了基因表达的节奏感。
启动子就像舞者,而增强子则是那种能够让舞蹈更加绚丽的灯光。
它们的配合,让整个过程显得生动有趣。
有趣的是,增强子并不局限于离启动子很近的地方。
它们可以在基因组的不同位置相互作用,像是在一个大舞台上,调皮地穿梭,时而靠近,时而远离。
这种灵活的关系让基因的表达变得更加多样化。
想想看,如果每一次的演出都能根据观众的反馈进行调整,那该多好啊!增强子就是那种能够不断适应、不断改变的灵活角色。
而且增强子和启动子的结合并不是一成不变的。
随着时间的推移,细胞的需求也在不断变化。
增强子可能会根据环境的变化,调整与启动子的结合方式,就像是乐队会根据现场观众的反应来调整曲目。
这种动态的互动关系,让整个基因表达的过程充满了可能性。
启动子与增强子
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启动子与增强子枯藤老树昏鸦,小桥流水人家,古道西风瘦马。
夕阳西下,断肠人在天涯。
第三章第二节启动子与增强子教学目标:教学重、难点:教学内容:一、原核生物启动子1 启动子:是一段位于结构基因5 '端上游区的DNA 序列,在转录起始之前被RNA 聚合酶结合的DNA部位称为启动子;启动子的结构影响它与RNA 聚合酶的亲和力,决定基因表达强度。
转录单元:是一段从启动子开始到终止子(terminator )结束的DNA 序列,RNA 聚合酶从转录起点开始沿着模板前进,直到终止子为止,转录出一条RNA 链;在细菌中,一个转录单元可以是一个基因,也可以是几个基因。
2 转录起点:指与新生RNA 链第一个核苷酸相对应DNA 链上的碱基,研究证实通常为一个嘌呤。
上游:常把起点前面,即5 '末端的序列称为(upstream )上游;下游:起点后面即3 '末端的序列称为下游(downstream )。
在描述碱基的位置时,起点为+1 ,下游方向依次为+2 ,+3 ……,上游方向依次为-1 ,-2 ,-3 ……。
3 启动子结构:Pribnow框:在起始点上游,几乎在所有启动子都存在一个6 bp 富含A/T区域TATAAT。
通常位于-18位到-9位,称为Pribnow框。
该区域是RNA聚合酶牢固结合位点,RNA聚合酶结合后,这一富含A/T的DNA双链解开。
Sextama框:位于-35区附近有一TTGACA序列,是RNA聚合酶中的σ因子识别位点。
以上这两个位点对于转录起始都是非常重要的。
σ因子识别-35区并与之结合。
由于RNA聚合酶分子覆盖面积能达到70bp,因此酶分子上的一个合适部位能接触-10区。
酶分子一旦与-10区结合以后,就从识别位点上解离下来。
此外,-35序列的重要性还在于在很大程度上决定了启动子的强度。
-10 区和-35 区的最佳距离:在原核生物中,-35 区和-10 区的距离大约是16 ~19bp ,小于15bp 或大于20bp 都会降低启动子的活性;保持启动子这两段序列以及它们之间的距离是十分重要的,否则就会改变它所控制的基因表达水平。
增强子和启动子真的是两种完全不同...
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增强子和启动子真的是两种完全不同...这篇文献学习笔记分享的是一篇有关于增强子和启动子的综述。
文章在今年2月发表在了Nature Reviews Genetics。
这是一篇长笔记,没有时间看的同学可以收藏起来慢慢看,对于认识启动子和增强子的作用还是很有帮助的。
当然更推荐大家下载英文原文阅读。
题目:Determinants of enhancer and promoter activities of regulatory elements国内下载不了的童鞋请在这里下载文章:here摘要增强子的活性和基因启动子的活性,对于细胞内的协调转录过程是非常重要的。
虽然有一些方法学可以用来鉴定增强子和启动子,目前大家一般默认的是这两种元件是不同的。
然而,一些研究表明,基因的调控元件可能同时具备增强子和启动子的功能。
在这篇综述里,作者主要总结一些研究结果,集中讨论决定调控元件活性的启动子和增强子。
本文还讨论了目前一些通过DNA可接近性和非互斥能力起始(或增强)转录来鉴定调控元件的方法。
正文转录调控元件在复杂的基因组里担任了一个重要的角色,在分化、细胞组织稳态、对外界刺激的应答和疾病里有着动态的作用。
在病理相关的细胞类型中有相当一部分性状相关的遗传变异,并且它们的改变与一些先天性疾病和癌症有关。
因此,了解调控元件及其功能的决定因素是一个重要挑战。
起激活作用的调控元件主要有两种:启动子和增强子。
前者定义了转录的起始,后者决定了转录的加强。
但是,现在在回顾这两个定义,其实是很模糊的。
因为我们是根据区域的大小,而武断的把它们分成两种调控元件。
随着基因组技术的驱动,人们已经对生物过程中鉴定启动子和增强子有了很大的进展。
虽然这些技术使得在全基因组范围内识别调控元件成为可能,但它们也使得增强子和启动子具有一些共同的特性和功能。
举个例子,它们的染色质结构和序列结构是非常相似的,有一些研究表明启动子也有着增强子的活性,另一些研究也表明,活化的增强子可以启动在其边界的转录的起始,从而扮演了启动子的角色。
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■ 启动子基本结构:
━ 位于结构基因5'端上游的一段DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地结合并具有转录起始的特异性。
━ 转录的起始关键问题:RNA聚合酶与启动子的相互作用。
^其结构影响了它与RNA聚合酶的亲和力,从而影响了基因表达的水平。
━ 转录单元:一段从启动子开始至终止子结束的DNA序列。
━ 转录起点:与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基,通常为一个嘌呤。记作+1。
━ 上游:起点前面,即5' 末端的序列,依次为-1、-2、-3……
━ 下游:起点后面,即3’末端的序列,依次为+2、+3……
━ RNA聚合酶与启动子结合序列的实验提取:RNA聚合酶全酶与模板DNA结合后,用核酸酶水解DNA,用酚抽提,沉淀纯化DNA,得到被RNA聚合酶保护的DNA片段。
━ 该序列与RNA聚合酶紧密结合点中央区为:TATA区(位于转录起始点上游)
^ 原核生物:-10bp
^ 真核生物:-25~-30bp处 TATAAA,也称TATA区
整理:灵魂的心碎 更多内容请联系 linghundexinsui@
━ 另一结合位点:
^ 原核生物:-35bp TTGACA区
^ 真核生物:-70~-78bp处 CCAAT,也称CAAT区
━ 启动子与RNA聚合酶的结合位点,与σ因子相互识别且具有较高的亲和力。
^ 原核生物: -10bp TATA区 -35bp TTGACA区
^ 真核生物:-25~-30bp TATA区 -70~-78bp CAAT区
━ 启动子的识别:氢键互补
━ 增强子:强化转录起始的序列为增强子或强化子
^ 转录起始位点上游约200bp
■ 放在转录起点上游1400bp或下游3300bp处,它都有转录增强作用。
■ 机制:影响染色质DNA-蛋白质结构并改变超螺旋而改变模板的整体结构,使得RNA聚合酶更容易与模板DNA相结合,起动基因转录