siRNA化学合成(生物谷)
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siRNA化学合成
化学合成siRNA简介
化学合成siRNA是应用起来最方便的方法,客户只需提供siRNA序列或者GeneID、Accession Number、基因名称等。
百奥迈科(Biomics)公司的siRNA使用国外最先进的仪器合成,同时配备了高容量的HPLC纯化仪。
单个靶点siRNA合成量一次性可放大到克(g)级,年产更达到公斤(Kg)级。
产品经过严格质检,确保质量并提供质量检查报告。
化学合成的siRNA与生物合成siRNA相比,有以下优点:
●操作简便,研究人员得到合成好的siRNA后,进行简单的稀释处理即可实验。
●转染效率高,相对于分子量较大的DNA质粒,其转染效率高。
●对细胞的或者组织的毒副作用小。
●可大规模制备,本公司的合成规模可达到克级(一次合成量1 - 100 g)。
●特别适用于基因靶位点已确定,需要大量siRNA进行siRNA动物实验研究。
欢迎您使用Biomics的siRNA产品,我们始终为您提供优质热诚的服务!
siRNA设计
siRNA序列的结构对RNAi实验的成功与否起着至关重要的作用。
不同的siRNA序列,对基因的沉默效率差异很大。
因此,理性设计有效的siRNA就成为实验成功的关键因素之一。
本公司推荐考虑如下设计思想:
●从起始密码子下游50 - 100个nt开始,避免5'端或3'端的UTRs,搜索AA (N19) 序
列。
因为这些区域结合了大量的调控蛋白,可能会影响siRNA发挥作用。
●分析siRNA两端能量分布
●N19序列3'端垂悬两个dTdT,该垂悬不与mRNA序列互补,使有义链3’端更容易
解链,从而增加其沉默效率。
21个碱基的siRNA单链序列如:5'-GGCCAGAGGUUGAAAGUGAdTdT-3'
●对mRNA目标区域进行二级结构预测,排除作用复杂的二级结构的siRNA序列。
因为二级结构越复杂,siRNA沉默效率越低。
下图表明设计的siRNA结构优势依次递增a) < b) < c)
●在NCBI数据库(/Blast.cgi)中进行Blast对照,排除设计
的序列和其他基因的同源性,降低脱靶效应。
●避免出现连续的多个G或C,GC含量最好在30 – 55 %之间。
●设计中,对siRNA两端的错配可以高度容忍,但中间的5 - 11位碱基的错配,对沉
默效应会有较大影响。
本公司专业技术人员免费帮您针对同一个基因设计3 - 4对siRNA,您只需提供基因的Accession Number、mRNA序列或者Gene ID等信息即可,设计好后交您确认,如果抑制效率达不到70 % (转染效率至少90 %),我们免费重新设计和合成。
百奥迈科(Biomics) siRNA产品简介
● siRNA合成:
本公司拥有siRNA合成所有核心技术和专业合成团队,合成规模达到克级(一次合成量1 - 100 g),不但能够满足细胞水平实验小试,更能满足动物实验中中试放大的要求。
●标记
可对siRNA两条链的4个末端进行多种标记物的标记,包括FAM、Cy3、Cy5、胆固醇(cholesterol)、Biotin等,以便根据实验要求监测siRNA抑制特异性基因表达的效果。
●修饰:
提供siRNA的化学修饰,主要有2’-羟基甲基化修饰,磷酸硫代修饰,氟代修饰等。
●纯化:
HPLC纯化。
●长度:
19-23nt,亦可根据设计要求合成相应长度的siRNA。
●产品形式:
冻干粉
●储存和稳定性:
建议在- 20 °C的环境中贮存,避免反复冻融,可保存6个月。
荧光标记的RNA 必须避光保存。
●技术数据表:
技术数据表与siRNA oligo一同交付,包括名称、序列、浓度、OD和nmols的精确数量及纯化类型。
●个性服务:
按照客户要求分装。
免费设计。
●运输:
1.5mL冻存管,快递寄送。
普通siRNA oligo
Biomics公司普通的siRNA oligo根据客户要求,采用脱盐、PAGE或HPLC纯化的方法,有效去除短、杂片段。
客户只需用无RNA酶水稀释后即可使用。
我们为客户设计合成四个靶点的普通siRNA,提高筛选出潜在的特异性抑制效
荧光标记siRNA oligo
本公司可对siRNA两条链的4个末端进行多种标记物的标记,包括FAM、Cy3、Cy5、胆固醇(cholesterol)、Biotin。
相对于未标记的siRNA具有转染情况可视的优点,通过流式细胞仪、荧光显微镜、激光共聚焦显微镜等可以观察到荧光标记的siRNA,方便优化转染条件、siRNA胞内定位等,同时可根据对转染过程的全程追踪来分析转染和蛋白表达下调的关系。
研究表明,反义链5'端标记会影响干扰效果,其他三个末端修饰后对沉默活性几乎没影响,目前公认最好的是将荧光修饰标记在正义链的5'端位点。
5'-荧光标记的siRNA有助于直接观察siRNA oligo的转染效率。
本公司提供的5'-荧光标记的siRNA oligo通常用FAM进行标记。
化学修饰siRNA oligo
根据客户的要求,Biomics公司可提供siRNA的化学修饰,主要有2’-羟基甲基化修饰,磷酸硫代修饰,氟代修饰等。
本公司拥有先进的siRNA化学合成的核心技术,特别是普通和修饰的siRNA oligo合成技术、核酸荧光标记技术、多种核酸化学修饰技术等。
合成的化学修饰siRNA解决了siRNA在转染实验中的稳定性问题,尽可能的使实验一次性获得最佳数据。
miRNA的化学合成
miRNA mimics
模拟生物体内源的miRNAs,运用化学合成的方法合成,能增强内源性miRNA 的功能。
本公司可以为客户提供不同长度、不同形式,由客户自行设计的miRNA。
我们公司也可以根据客户需要,提供来自sanger miRNA 数据库的miRNA序列(/sequences)。
miRNA inhibitor
化学修饰的专门针对细胞中特异的靶miRNA的抑制剂。
应用该产品可检测miRNAs所调节的基因表达和对信号通路的影响,对阐明miRNA在诸如细胞发育、增殖、分化和凋亡中的机理有重要意义,加速miRNA基因沉默效应的研究。
它可以特异的靶向和敲除单个的miRNA分子。
使用miRNA inhibitor可以用筛选miRNA靶位点;筛选调控某一基因表达的miRNA;筛选影响细胞发育过程的miRNA。
RNAi系列优惠套餐
客户只需要提供基因序列、GeneID或者Accession Number,我们免费设计、选择合适的位点,保证至少一对可以有效的抑制相应基因的表达,抑制效率在70 %以上(转染效率至少达90 %)。
若未筛选出有效的siRNA片段,本公司为您免费再次设计和合成!
Biomics silence siRNA Set I:
Biomics silence siRNA Set II:
Biomics silencer siRNA Set III:
Biomics silencer siRNA Set IV:
siRNA对照
一个完整的siRNA干扰实验必须使用阴、阳性对照以及转染试剂等来确定设计的siRNA序列对于基因的特异性沉默。
阴性对照
阴性对照siRNA,是不会引起任何基因的沉默。
实验中使用阴性对照能够帮助我们确认基因表达水平的降低是否是序列特异性的RNAi的结果。
由于siRNA的合成方法、工艺以及转染试剂等因素可能导致广泛的基因沉默现象。
如果没有阴性对照,研究人员很可能错误地将广泛的、非特异性基因沉默当作由RNAi引起的基因特异性沉默。
本公司提供
●和哺乳动物基因序列无同源性的通用阴性对照。
●和哺乳动物基因序列无同源性的末端荧光标记(5' - FAM) 的通用阴性对照,方便
我们使用流式细胞仪、荧光显微镜、激光共聚焦显微镜等观察siRNA的转染情况,从而优化转染条件,提高转染效率。
●与靶点siRNA序列有相同碱基组成,但排序不同且和mRNA无同源性的阴性对照;
根据客户要求进行合成。
阳性对照
阳性对照是已知的可以高效沉默特定基因的siRNA,阳性对照作为一个实验的系统检查是很重要的。
当siRNA阳性对照达到预期实验结果时,就能说明转染、RNA的提取和基因表达检测方法是可靠的。
本公司提供多种阳性对照,具体见下表:。