原核基因表达及其调控概要
分子生物学第七章原核生物基因表达调控
原核生物基因表达调控的特点
01
原核生物基因表达调控通常由特 定的转录因子、RNA聚合酶以及 其他调控蛋白介导,通过与DNA 的结合或解离来调节基因转录。
02
原核生物基因表达调控具有快速 响应环境变化的特点,能够在短 时间内调整基因表达模式,以适 应外界刺激和压力。
翻译后加工的调控
翻译后加工的调控
在翻译后加工阶段,新合成的蛋白质经过一系列修饰和加工,最终成为具有生物学活性的蛋白质。原 核生物通过控制翻译后加工酶的合成和活性来调控翻译后加工过程。此外,原核生物还可以通过控制 蛋白质的稳定性来影响其功能和表达水平。
总结
翻译后加工是基因表达调控的重要环节,原核生物通过控制翻译后加工酶的合成和活性,以及蛋白质 的稳定性来精细调控基因表达。
翻译延伸的调控
翻译延伸的调控
在翻译延伸阶段,核糖体沿着mRNA移动,将氨基酸组装成蛋白质。原核生物通过控制翻译延伸因子的合成和活 性,以及核糖体的合成和组装来调控翻译延伸。此外,原核生物还可以通过控制mRNA的结构和稳定性来影响翻 译延伸。
总结
翻译延伸是基因表达调控的重要环节,原核生物通过控制翻译延伸因子的合成和活性,以及核糖体的合成和组装, 以及mRNA的结构和稳定性来精细调控基因表达。
翻译起始的调控
原核生物通过控制翻译起始来调控基因表达。在翻译起始阶段, mRNA与核糖体结合,招募翻译所需的起始因子和其他成分。原 核生物通过控制起始因子的合成和活性,以及mRNA与核糖体的 结合来调控翻译起始。
总结
翻译起始是基因表达调控的重要环节,原核生物通过控制翻译起 始因子的合成和活性,以及mRNA与核糖体的结合来精细调控基 因表达。
原核生物基因表达调控分析
Co-repressor
(共阻遏物)
原核生物基因表达调控方式:
负控诱导调节
负控转录调 控系统
调节基因的产物是 阻遏蛋白 (repressor), 阻止了结构基因的 转录。
阻遏蛋白与效应物(诱 导物)结合,使阻遏蛋 白失活,结构基因转录; 阻遏蛋白与效应物(辅阻 遏物)结合,使阻遏蛋白 产生活性,结构基因不转 录。
operon on operon off operon off operon on
Neg.
i- or 不加入I基因产物 I+ or 加入I基因产物
(激活蛋白)
Pos.
●
Repressor binding on O site 阻遏蛋白 阻止转录启动
Expressor binding front p site
安慰诱导物:
如果某种物质能够诱导细菌产生某种酶而本身又不
被分解,这种物质被称为安慰诱导物,如IPTG(异
丙基- β –D-硫代半乳糖苷)。 相反,随环境条件变化而基因表达水平降低的现象 称为阻遏(repression),相应的基因被称为可阻遏的基 因(repressible gene)。 如果某种物质能够阻止细菌产生合成这种物质的酶, 这种物质就是辅阻遏物。(合成代谢)
第一讲 原核生物基因表达 调控
主要内容
一、基因表达调控的基本概念: 二、 基因表达调控的理论与模式;
一、基因表达调控的基本概念:
1、基因表达调控的意义: 原核生物对环境的适应、对营养条件改变适应的 相关应答,都是基因表达的结果;
真核生物的细胞分化, 组织特化 , 个体发育以及 环境对个体表型的影响都是通过基因表达实现的。
组成型突变: lacOc
iC mut. (iC O+P+) constitutive mut. (组成型)
原核生物基因表达调控
Repressor
cAMP
CAP
葡萄糖不存在,乳糖存在,阻遏蛋白失活,cAMP+CAP与CAP位点结合结合,促进基因转录
The Lac Operon: III. 葡萄糖和乳糖都存在
Repressor
RNA Pol.
CAP Bindin
g
Promoter
Operator X
LacZ
Repressor负调节与正调节协调合作
• 阻遏蛋白封闭转录时,CAP不发挥作用 • 如没有CAP加强转录,即使阻遏蛋白从操作基因上解聚仍无转录活性
3)正调控和负调控
正调控(positive control)
在没有调节蛋白质存在时基因是关闭的,加入某种调节蛋白后基因活性就被开启,这样的调控为正转录 调控。
调节基因
操纵基因
结构基因
调节蛋白
mRNA 酶蛋白
负调控(negative control)
在没有调节蛋白质存在时基因是表达的,加入这种调节蛋白质后基因表达活性便被关闭,这样的调 控负转录调控。
2)结构基因和调节基因
➢ 组成基因/管家基因(constitutive gene, housekeeping gene)是指不大受环境变动而持 续表达的一类基因。如DNA聚合酶,RNA聚合酶等代谢过程中十分必需的酶或蛋白质的基因 。 ➢调节基因(regulated gene)指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因。如:不同生 长发育时期表达的一些基因。
• 别乳糖是lac操纵子转录的活性诱导物 • 异丙基硫代半乳糖苷(isopropyl thiogalactoside:IPTG)结构上类似于别乳糖,是乳糖操纵
子非常有效的诱导物。可诱导lac操纵子表达,但不能被β-半乳糖苷酶水解。 • 这种能诱导酶合成,但不能被酶分解的分子称为安慰诱导物(gratuitous inducer)。安慰诱导
原核生物基因表达的调控
操纵子学说的基本内容
1961年,法国科学家莫诺(J·L·Monod,1910-1976)与雅可布 (F·Jacob)发表“蛋白质合成中的遗传调节机制”一文,提出操纵子学 说,开创了基因调控的研究。四年后的1965年,莫诺与雅可布即荣获诺贝 尔生理学与医学奖。
莫诺与雅可布最初发现的是大肠杆菌的乳糖操纵子。这是一个十分巧妙的 自动控制系统,这个自动控制系统负责调控大肠杆菌的乳糖代谢。 乳糖可作为培养大肠杆菌的能源。大肠杆菌能产生一种酶(叫做“半乳糖 苷酶”),能够催化乳糖分解为半乳糖和葡萄糖,以便作进一步的代谢利 用。编码半乳糖苷酶的基因(简称z)是一个结构基因(structural gene)。这个结构基因与操纵基因共同组成操纵子。操纵基因受一种叫作 阻遏蛋白的蛋白质的调控。当阻遏蛋白结合到操纵基因之上时,乳糖会起 诱导作用,它与阻遏蛋白结合,使之从操纵基因上脱落下来。这时,操纵 基因开启,相邻的结构基因也表现活性,细菌就能分解并利用乳糖了,这 样,乳糖便成了诱导半乳糖苷酶产生的诱导物。
原核生物基因表达的调控
基因调控
生物体内的每个细胞都有全套的基因,但细胞中的基因并不是同 时表达的。因细胞的类型和执行的功能不同,细胞中有的基因开 启,有的基因关闭,如血红蛋白基因只在红细胞中表达,消化酶 只在消化腺细胞中表达。这其中存在着复杂的基因调控。 某些基因不断地进行转录和翻译,产生出各种蛋白质,通常称之 为基因表达。每个细胞都有一套完整的基因调控系统,使各种蛋 白质只有在需要时才被合成,这样就能使生物适应多变的环境, 防止生命活动中的浪费现象和有害后果的发生,保持体内代谢过 程的正常状态。但是,原核细胞和真核细胞的基因调控有着明显 的区别。 原核细胞表达的基因调控,比真核细胞要相对简单,这里以大肠 杆菌乳糖操纵子为例来说明。
生物学原核生物基因表达的调控
第二节
原核生物基因表达的 转录水平调控
Regulation of Prokaryotic Gene Expression at Transcription Level
目录
一、转录调控是以特定的DNA序列和蛋 白质结构为基础
(一)特定的DNA序列是转录起始调控的结构基础
在基因内和基因外都有一些特定的DNA序列,与结 构基因表达调控相关、能够被基因调控蛋白特异性识别 和结合,这些特定的DNA序列称为顺式作用元件(cisacting elements),亦称为顺式调控元件。在原核生物 中主要是启动子、阻遏蛋白结合位点、正调控蛋白结合 位点、增强子等。
transcription
RNA 5'-AGGUCCACG········-3'
启动子及其与转录的关系 ···
目录
(二)阻遏蛋白结合操纵元件对转录起 始进行负调控
阻遏蛋白是一类在转录水平对基因表达产生负 调控作用的蛋白质。阻遏蛋白主要通过抑制开放启 动子复合物的形成而抑制基因的转录。阻遏蛋白与 DNA结合后,RNA聚合酶仍有可能与启动子结合, 但不能形成开放起始复合物,不能启动转录;这种 作用称为阻遏(repression),特定的信号分子与阻 遏蛋白结合,使阻遏蛋白失活,从DNA 上脱落下来, 称为去阻遏,或脱阻遏(derepression)。
usually binds to CAAT box
目录
二、特定蛋白质与DNA结合后控制 转录起始
(一)σ因子和启动子决定转录是否能够起始
-35
-10
+1
5'-TAGTGTATTGACATGATAGAAGCACTCTACTATATTCTCAATAGGTCCACG············-·3·'
原核生物基因表达调控概述
原核生物基因表达调控概述基因表达调控是生物体内基因表达调节控制机制,使细胞中基因表达的过程在时间,空间上处于有序状态,并对环境条件的变化做出适当的反应复杂过程。
1.基因表达调控意义在生命活动中并不是所有的基因都同时表达,代谢过程中所需各种酶和蛋白质基因以及构成细胞化学成分的各种编码基因,正常情况下是经常表达的,而与生物发育过程有关的基因则需在特定的时空才表达,还有许多基因被暂时的或永久的关闭而不来表达。
2.原核基因表达调控特点原核生物基因表达调控存在于转录和翻译的起始、延伸和终止的每一步骤中。
这种调控多以操纵子为单位进行,将功能相关的基因组织在一起,同时开启或关闭基因表达即经济又有效,保证其生命活动的需要。
调控主要发生在转录水平,有正、负调控两种机制在转录水平上对基因表达的调控决定于DNA的结构,RNA 聚合酶的功能、蛋白质因子及其他小分子配基的相互作用。
细菌的转录和翻译过程几乎在同一时间内相互偶联。
细胞要控制各种蛋白质在不同时期的表达水平,有两条途径:(1)细胞控制从其DNA模板上转录其特异的mRNA的速度,这是一条经济的途径,可减少从mRNA合成蛋白质的小分子物质消耗,这是生物长期进化过程中自然选择的结果,这种控制称为转录水平调控。
(2)在mRNA合成后,控制从mRNA翻译肽链速度,包括一些与翻译有关的酶及其复合体分子缔合的装配速度等过程。
这种蛋白质合成及其基因表达的控制称为翻译水平的调控。
二.原核生物表达调控的概念(1)细菌细胞对营养的适应细菌必须能够广泛适应变化的环境条件。
这些条件包括营养、水分、溶液浓度、温度,pH等。
而这些条件须通过细胞内的各种生化反应途径,为细胞生长的繁荣提供能量和构建细胞组分所需的小分子化合物。
(2)顺式作用元件和反式作用元件基因活性的调节主要通过反式作用因子与顺式作用元件的相互作用而实现。
反式作用因子的编码基因与其识别或结合的靶核苷酸序列在同一个DNA分子上。
RNA聚合酶是典型的反式作用因子。
第6章原核生物的基因表达调控
一、操纵子(operon)
细菌能随环境的变化,迅速改变某 些基因表达的状态,这就是很好的基因 表达调控的实验模型。人们就是从研究 这种现象开始,打开认识基因表达调控 分子机理的窗口的。
既然从DNA到蛋白质的过程称为基因表达,对这个过程
的调节就称为基因表达调控(gene regulation或gene control)。基因表达调控是现阶段分子生物学研究的中
心课题。
6.1.1基因表达调控的意义
基因组(genome) 是指含有一个生物体生存、发育、活动和 繁殖所需要的全部遗传信息的整套核酸。
一个受精卵含有发育成一个成熟个体的全部遗传信息,在个 体发育分化的各个阶段,各种基因极为有序地表达,一般 在胚胎时期基因开放的数量最多,随着分化发展,细胞中 某些基因关闭(turn off)、某些基因转向开放(turn on), 胚胎发育不同阶段、不同部位的细胞中开放的基因及其开 放的程度不一样,合成蛋白质的种类和数量都不相同,显 示出基因表达调控在空间和时间上极高的有序性,从而逐 步生成形态与功能各不相同、极为协调、巧妙有序的组织 脏器。
组成性基因表达也不是一成不变的,其表达强弱也是受一定机制调控的。
②适应性表达(adaptive expression)指环境的变化容易使其表达 水平变动的一类基因表达。
应环境条件变化基因表达水平增高的现象称为诱导(induction), 这类基因被称为可诱导的基因(inducible gene);
第7章原核生物基因表达的调控
Z编码β-半乳糖苷酶:将乳糖水解成葡萄糖和半乳糖。
Y编码β-半乳糖苷透过酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透过大肠杆
菌细胞壁和原生质膜进入细胞内。
A编码β-半乳糖苷乙酰基转移酶:乙酰辅酶A上的乙酰基转到β-半乳糖苷
上,形成乙酰半乳糖。
gene
正调控
调控蛋白
负调控
结构基因表达
▪ 负调控:抑制基因表达的调控方式 ▪ 正调控:促进基因表达的调控方式
B、特殊代谢物的调控
诱导(induction)
阻遏(repression)
inducer
gene
repressor
gene
特殊代谢物
诱导 阻遏
结构基因表达
诱导物、可诱导基因 阻遏物、可阻遏基因
无葡萄糖、 有乳糖-----cAMP水平高 (2)cAMP与CRP结合形成有活性的
CRP- cAMP 复合物 (3)CRP-cAMP 与Plac结合 (4)增强了RNA聚合酶与启动子的结合
(5)lacZ, lacY 、 lacA高表达
105
40
105
41
乳糖、G存在与否及与操纵子正、负控因素、 基因开放与关闭情况如下:
CRP
Binding
RNA
Promoter
Operator
CRP
Pol. Repressor
cAMP
LacZ
LacY
LacA
Repressor mRNA
STOP
Right there
CRP
Polymerase
cAMP
Repressor
cAMP
CRP
5 第二章 原核生物基因表达调控
2.依赖于Rho因子的终止子
在体外实验中,发现尽管有该类终止子存在,但RNA聚合酶
只在终止子处暂停,转录并不终止。向该反应系统中加入ρ因子,
则可使转录在特定的位点终止。这种终止称为依赖ρ因子的转录
终止。
依赖于Rho因子的终止子不但柄部G•C含量较低,因而暂停
•
枯草杆菌在芽孢形成过程中采取更换σ因子的策略
2. 枯草杆菌噬菌体SP01的感染周期
一组基因的表达导致另一组基因随后表达,称为基因表达的
时序调控或级联调控,这是噬菌体感染周期中的普遍特征。 在枯草杆菌噬菌体SP01的感染周期中,其基因表达的时序调 控是由一系列的σ因子来实现的。 SP01的感染周期经历早中晚三个阶段: i. 刚刚感染时,早期基因被转录。
其一致序列为T80A95T45A60A50T96,又称为Pribnow框.
Pribnow盒是RNA聚合酶的牢固结合位点,又称结合位点,或称
为解链区。
该区域富含AT对,熔点较低, RNA聚合酶的结合使得这个AT丰
富区消耗较低的能量而解旋,此时RNA聚合酶与启动子的复合物便
由封闭复合物(closed-promoter complex) 转变为开放复合物(openpromoter complex) ,转录启动。 (2)-35区 在转录起始点上游-35bp处,有另一个保守序列,称 为-35序列。其一致序列为T82T84G78A65C54A45。该保守序列又称
• 转 录 起 始 主 要 由 DNA 分 子 上 的 启 动 子 (promoter)控制;终止由终止子控制. • DNA链上提供转录终止信号的序列称为终 止子(terminator)。是一个基因的末端或 是一个操纵子的末端的一段特定序列。
第六章 原核生物基因表达调控
图6-7 乳糖操纵子结构模式图
第二节 原核基因表达的调控
乳糖操纵子的上游有一个独立转录的基因lacI,其编码产物LacI 可以结合在乳糖操纵子的操纵基因(lacO)上,即转录控制区,阻抑 下游结构基因的表达。因此,乳糖操纵子是一个负调控系统(图68)。其中,LacI是具有负调控作用的反式作用因子,LacI作用的靶 DNA序列lacO是顺式作用元件。
trpB(UGA处翻译终止) -UGA -GAA-AUC- UGA-UGG-AA A UG-G AAtrpA(AUG处翻译起始)
第二节 原核基因表达的调控
3.稀有密码子对翻译的影响 DNA复制时,引物酶催化一段RNA引物的合成,引物酶 由dnaG编码。rpsU-dnaG-rpoD组成一个转录单位,产生多 顺反子转录物。细胞内三个基因的终产物的浓度相差却很 大,rpsU产物浓度为4×104个/细胞,dnaG产物50个/细胞, rpoD产物2800个/细胞。菌体通过使用稀有密码子,使转 录为一条mRNA链的三个基因的表达产物量可以有很大差异。
第二节 原核基因表达的调控
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
图6-10 色氨酸操纵子的负调控
第二节 原核基因表达的调控
4.阿拉伯糖操纵子 阿拉伯糖与乳糖一样,可替代葡萄糖作为碳源物质被 菌体利用。大肠杆菌中,阿拉伯糖(Ara)代谢所需酶的 三个基因分别是:核酮糖激酶基因( araB)、L-Ara异构 酶 基 因 ( araA)、L- 核 酮 糖 - 5 - 磷 酸 差 向 异 构 酶 基 因 ( araD),组成一个基因簇,有共同的启动子 PBAD。与其 它操纵子不同的是,操纵序列位于 PBAD 上游,操纵序列左 端有另一方向转录的启动子 PC,负责调节基因araC的转录, 其产物AraC蛋白有两种活性形式,Pr 对 PBAD 的表达起阻遏 作用,Pi对PBAD的表达起激活作用(图6-11)。
原核生物基因表达调控
20
同位素示踪实验
把大肠杆菌细胞放在加有放射性35S标记的氨基酸,但没 有半乳糖诱导物的培养基中繁殖几代然后再将这些带有 放射活性的细菌转移到不含35S、无放射性的培养基中 随着培养基中诱导物的加入, β-半乳糖苷酶便开始合成。 分离β-半乳糖苷酶, 发现这种酶无35S标记说明酶的合 成不是由前体转化而来的, 而是加入诱导物后新合成的。
• Jacob和Monod认为诱导酶(他们当时称为适应酶)
现象是个基因调控问题, 可以用实验方法进行研究, 因此
选为突破口, 终于通过大量实验及分析, 于1961年建立
了该操纵子的控制模型。
-
21
酶的诱导
-
22
• 酶的诱导现象是生物进化过程中出现的一种合理、 经济地利用有限资源的本能。
• 酶诱导已证明是低等生物的普遍现象。
倒位片段
鼠伤寒沙门菌鞭毛素基- 因的调节
H1鞭毛素
10
鼠伤寒沙门氏菌(S.typhimrium)的相转变(phase variation)
-
11
2.σ 因子对原核生物转录起始的调控
σ因子:原核生物RNA聚合酶的一个亚基,是转录起 始所必需的因子,主要影响RNA聚合酶对转录起始 位点的正确识别,这种σ因子称σ70,此外还有分子量 不同,功能不同的其他σ因子 。
PO
操纵子可视为原核生物的转录单位,它可以逐个
地从原核生物基因组中分离出来,对其结构功
能加以研究。
-
15
3.乳糖操纵子
1) 乳糖操纵子的结构
启动子 操纵基因
调节蛋白
(阻遏蛋白)
-
结构基因
16
3个编码的结构基因
• Z编码β-半乳糖苷酶: 将乳糖水解成葡萄糖和半乳糖,还能 将乳糖转变为异构乳糖
分子生物学第七章原核生物基因表达调控
(三)、阻遏物 lac I 基因产物及功能
Lac 操纵子阻遏物 mRNA 是由弱启动子控制下组 成型合成的,该阻遏蛋白具有4个相同的亚基,每个亚 基均含347个氨基酸残基。
lacI 基因为组成型,通过启动子的上升突变体可获 得较多的阻遏蛋白;
阻遏物 2022/10/18
β-半乳糖苷酶 透过酶 转乙酰3酶2
2022/10/18
16
调节机理:
细胞中某一氨基酸或嘧啶的浓度发生改变
氨酰 – tRNA的浓度变化
核糖体在转录产物RNA上的结合位置不 同,使得RNA形成特定的二级结构 由RNA的二级结构判断基因能否继续转录
2022/10/18
17
3、降解物对基因活性的调节P252
葡萄糖效应或降解物抑制作用:细菌培养基中在 葡萄糖存在的情况下,即使加入乳糖、半乳糖等 诱导物,与其对应的操纵子也不会启动,这种现 象称为葡萄糖效应或降解物抑制作用。
这是通过阻止乳糖操纵子表达来完成的,这种 效应称为降解物抑制(catabolite repression)。
2022/10/18
35
(五)、cAMP与代谢物激活蛋白
葡萄糖
葡萄糖-6-磷酸
甘油 某些代谢产物抑制活性
腺苷酸环化酶
ATP
cAMP
编码
cAMP-CAP
Crp基因
代谢物激活蛋白 CAP
葡萄糖对其它糖的代谢抑制,是通过对 cAMP的抑制完成的。
2022/10/18
22
一、酶的诱导 ——
lac 体系受调控的证据
两种含硫的乳糖类似物:
异丙基巯基半乳糖苷
(IPTG)
巯甲基半乳糖苷(TMG)
E. coli 在不含乳糖的培养基生 长时,β-半乳糖苷酶含量极低;
原核生物的基因表达和调控机制
原核生物的基因表达和调控机制原核生物是指不含细胞核和其他复杂的细胞器官的生物,包括细菌和蓝藻等。
这些生物虽然简单,但仍具有复杂的基因表达和调控机制,通过调控基因的转录和翻译来响应环境变化和完成生物学功能。
本文将探讨原核生物的基因表达和调控机制。
基因表达和调控的基本概念基因是指DNA分子上编码一个蛋白质的序列,是生物体内传递遗传信息的基本单位。
基因表达指的是将基因的信息转化为蛋白质的过程,包括转录和翻译两个步骤。
其中,转录是指将DNA序列转化为mRNA(信使RNA)的过程,而翻译是指将mRNA上的三联体密码子翻译为相应的氨基酸序列的过程。
基因表达的过程涉及到基因启动子、转录因子、RNA聚合酶等多个分子的相互作用,需要经过复杂的调控机制来保证在特定的时空条件下进行。
原核生物中基因的表达和调控原核生物虽然没有细胞核和其他复杂的细胞器官,但其基因的表达和调控机制同样有其特殊性。
以下将从基因的结构、转录、RNA的修饰和翻译等方面探讨原核生物中基因的表达和调控。
基因结构原核生物中,基因通常呈现为一条连续的DNA链,其中编码区域与非编码区域相互交错,没有剪切和剪接等后加工处理。
编码区通常以ATG作为起始密码子,以TAG、TAA或TGA作为终止密码子。
在非编码区,存在启动子、转录因子结合位点、RNA剪切位点和终止符等辅助元素,有助于调控基因的表达。
相比于真核生物中复杂的基因结构,原核生物中基因的紧凑结构为调控提供了更多的可能性。
转录的调控在原核生物中,转录的调控可以通过多种方式实现,包括转录起始的选择、负向调控和正向调控等。
转录起始的选择:在原核生物中,转录的起始位点可以在基因内或外,不同的起始位点可以产生不同长度的转录产物,从而产生不同的蛋白质或非编码RNA。
此外,在一些条件下,同一基因的多个启动子甚至可以同时被使用,进一步增加了基因表达的多样性。
负向调控和正向调控:在原核生物中,负向调控指的是一些转录抑制因子的作用,可以通过抑制转录因子的结合来阻止基因的转录。
原核生物基因表达调控概述
原核⽣物基因表达调控概述原核⽣物基因表达调控概述基因表达调控是⽣物体内基因表达调节控制机制,使细胞中基因表达的过程在时间,空间上处于有序状态,并对环境条件的变化做出适当的反应复杂过程。
1.基因表达调控意义在⽣命活动中并不是所有的基因都同时表达,代谢过程中所需各种酶和蛋⽩质基因以及构成细胞化学成分的各种编码基因,正常情况下是经常表达的,⽽与⽣物发育过程有关的基因则需在特定的时空才表达,还有许多基因被暂时的或永久的关闭⽽不来表达。
2.原核基因表达调控特点原核⽣物基因表达调控存在于转录和翻译的起始、延伸和终⽌的每⼀步骤中。
这种调控多以操纵⼦为单位进⾏,将功能相关的基因组织在⼀起,同时开启或关闭基因表达即经济⼜有效,保证其⽣命活动的需要。
调控主要发⽣在转录⽔平,有正、负调控两种机制在转录⽔平上对基因表达的调控决定于DNA的结构,RNA 聚合酶的功能、蛋⽩质因⼦及其他⼩分⼦配基的相互作⽤。
细菌的转录和翻译过程⼏乎在同⼀时间内相互偶联。
细胞要控制各种蛋⽩质在不同时期的表达⽔平,有两条途径:(1)细胞控制从其DNA模板上转录其特异的mRNA的速度,这是⼀条经济的途径,可减少从mRNA合成蛋⽩质的⼩分⼦物质消耗,这是⽣物长期进化过程中⾃然选择的结果,这种控制称为转录⽔平调控。
(2)在mRNA合成后,控制从mRNA翻译肽链速度,包括⼀些与翻译有关的酶及其复合体分⼦缔合的装配速度等过程。
这种蛋⽩质合成及其基因表达的控制称为翻译⽔平的调控。
⼆.原核⽣物表达调控的概念(1)细菌细胞对营养的适应细菌必须能够⼴泛适应变化的环境条件。
这些条件包括营养、⽔分、溶液浓度、温度,pH等。
⽽这些条件须通过细胞内的各种⽣化反应途径,为细胞⽣长的繁荣提供能量和构建细胞组分所需的⼩分⼦化合物。
(2)顺式作⽤元件和反式作⽤元件基因活性的调节主要通过反式作⽤因⼦与顺式作⽤元件的相互作⽤⽽实现。
反式作⽤因⼦的编码基因与其识别或结合的靶核苷酸序列在同⼀个DNA分⼦上。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
质粒pKN402的复制起始位点是耐温型的,在42C时仍然 有很强的复制起始的功能。
电泳后回收片段c
电泳后回收片段1和3 连接
温度对3种表达载体质粒拷贝数的影响
由于pKN402和pCP3的复制子在42C时仍然具有很强的起 始复制能力,因此当培养温度升高到42C时,细胞中的 pKN402和pCP3的拷贝数要比pPLc2833高5~10倍。
Ptac 启动子:
是来自于lac和trp的一组杂合启动子,但是比lac和trp都强 得多,是一组强启动子。包括:
(1) PtacI:PlacUV5的-10区 + Ptrp的-35区; (2) PtacII:Ptrp的-35区(一段合成的包括Pribnow框在
内的46bp的DNA) + Plac的操纵基因; (3) Ptac12:Plac的-10区 +Ptrp的-35区
trp promoter色氨酸启动子 由色氨酸阻遏蛋白进行调控:正调控作用。可 形成启动子-阻遏蛋白复合物。
trp 启动子的脱阻遏可通过:
(1)移除色氨酸; (2)加入色氨酸结构类似物,如吲哚丙烯酸( 3indoleacrylic acid). 3’--吲哚丙烯酸
trpR 阻遏蛋白 Trp
色氨酸操纵子(trp operon)
第二章 原核微生物的基因表达与操作
2.1 原核微生物的基因表达及其调控 2.2 原核微生物的基因表达产物的分离纯 化
第一节 原核生物的基因表达与调控因素
(1)转录因素; (2)翻译因素; (3)蛋白质的稳定性; (4)胞外分泌的特性
一、原核生物的基因表达
(一)、转录对基因表达的影响
新生RNA序列与模板链 互补;与编码链相同。
(1)为pBR322衍生质粒,插入 了强启动子PlacUV5并在其下 游加入了-半乳糖苷酶的 编码序列( -gal)21 bp 片断和一个EcoRI位点;
(2)其融合蛋白的N端为-半乳 糖苷酶的前7个氨基酸和 EcoRI接头编码的少数几个 氨基酸,其C端为完整的外
源蛋白。
2、含trp 启动子的表达载体:
(四)大规模培养系统
小规模培养(1~5L)含表达载体的重组菌株时,其调控可以直 接向培养基中添加诱导物,或者升高温度,但是在半工业化(20~ 200L)或者工业化大规模(大于200L)生产时,不能采用小规模的 方法:
(1)直接向培养基中添加诱导物如IPTG,由于需要量较大,成本 高,不经济;
(2)即使是使用温度敏感的表达载体,升高温度既需要较长的时 间,又需要很大的能源消耗,成本也很高。
-半乳糖苷酶在不同受体菌中的表达:
携带包含大肠杆菌 lacZ 基因和异源启动子的质粒载体的不同革兰氏阴性菌
受体菌中测定的-半乳糖苷酶活性
Promoter
-Galactosidase activity (U) in:
Escherichia Rhizobium
Rhizobium
Pseudomonas
coli
子T1和T2,以避免其它 基因的过度转录。
4、含PL 启动子的表达载体:
是一种极强的启动子,所以被广泛用于各种载体的 构建; 如:pPL-; (1)来源于pBR322, pBR322的EcoRI/BamHI位点
被PL 和N基因取代; (2)外源基因可以插入到N基因中的HpaI位点; (3)当培养温度为29-31C时,PL启动子处于阻遏
meliloti
leguminosarum
putida
None
16
110
130
150
Nm
1,400
21,800
13,900
16,300
lac
2,000
9,050
6,250
9,800
tac
11,300
2,850
1,150
2,950
S1
40
3,300
1,200
3,350
大肠杆菌
苜蓿根瘤菌
豌豆根瘤菌
恶臭假单胞菌
3、含tac 启动子的表达载体:
高表达效率启动子;受IPTG的诱导。 多种商业化的载体。如: pKK223-3; pBADHis-A, B, C; pTrcHis-A, B, C; pSE420
特点:
1)Ampr; 2)tac启动子; 3)lacZ核糖体结合部位; 4)ATG起始密码子,位于
RBS下游8bp处; 5)来源于-噬菌体的终止
所有Ptac都受IPTG的诱导,同时受到阻遏蛋白的阻遏调控。
PL 启动子:
阻遏蛋白: cI,来源于噬菌体 . cI857 : 为 cI温度敏感突变体. (1) 将携带敏感的cI857 的细菌细胞首先在28 to 30C条件下
培养,此时cI857 阻遏PL启动子的转录; (2) 当细菌细胞被培养至特定浓度时(一般是到达平衡
一种解决的途径:使用“双质粒系统”:用trp启动子带动编码cI阻遏 蛋白的基因,然后将它们置于一个弱启动子的载体上;将要表达的外源基 因置于强启动子PL之下,使其受PL启动子的控制。
A 培养基中不存在色氨酸
cI蛋白合成 (脱阻遏)
B 培养基中存在色氨酸
cI蛋白不合成 (阻遏)
无克隆基因蛋白 合成(阻遏) “双载体系统”特点:
-半乳糖苷酶在不同受体菌中的表达分析:
(1) 所有启动子在受体菌中都有一定的活性; (2) tac启动子在大肠杆菌中活性最高,但是在其它 受体菌中活性最低; (3) 新霉素基因启动子(Nm)是在大肠杆菌中活性 最低的启动子,但是在其它受体菌中驱动转录的活性 却最高。
广 宿 主 载 体
4) 启动子(A promoter);
9) 转录起始位点 (Startsite);
5) 终止子(A terminator);
10) 初始转录产物 A primary transcript
RNA聚合酶 可形成1个中 间管道
(二)、原核生物基因的翻译
起始因子Initiation factors (IFs) 可稳定自由状态的 30S 亚基;以及结合起始 tRNA 到 30S-mRNA复合物上
(2)容易被大肠杆菌的RNA聚合酶全酶所识 别。
四种简单类型控制通路
诱导作用是指存在诱导 物能使阻遏蛋白失活,或 者可激活一个激活蛋白而 解除阻遏蛋白对转录起始 过程的阻遏;
阻遏作用是指一个辅阻 遏物激活一种阻遏蛋白, 或者使一种激活蛋白失活 而对转录过程发生阻遏作 用。
: lac 启动子
(1)lac启动子来源于大肠杆菌的乳糖操纵子,包括启动子、 活化蛋白(catabolite activator protein, CAP)结合位点、操 纵基因和lacZ组成。 (2) lac启动子受到阻遏蛋白(repressor)的负调控,而受到 CAP和cAMP的正调控。其中CAP的正调控是通过增加启动子 与RNA聚合酶的亲和性而起作用。 (3) lac 启动子由于与阻遏蛋白相结合而处于关闭状态,但当 加入乳糖或者半乳糖苷结构类似物,如异丙基硫代半乳糖苷 (IPTG)、硫甲基半乳糖苷(TMG)和邻硝基苯基半乳糖苷 (ONTG)后可发生脱阻遏作用。
期),将培养温度升高至42C, 此时cI857 不再发生阻 遏作用,PL启动子开始启动转录过程。
PL 启动子
噬菌体左向操纵子结构示意图 PL为噬菌体左向早期启动子,控制基因从N到att的早期转录,受 到cI所编码的阻遏蛋白的调控。
优良表达载体的性能
(1)强转录启动子和终止子; (2)核糖体结合位点(RBS)的强弱; (3)质粒载体及其质粒的拷贝数;是否整合到来自pOP203-13特点
表达载体pOP203质粒结构示意图
pOP203系列表达载体:A family of cloning vectors containing the lacUV5 Promoter
pOP203-1,2,3、pOP203-13、pOP203-24、 pOP203-27、pOP203-28、pOP203-29
乳糖操纵子基因产物:
1) lacI: 阻遏蛋白; 2) lacZ:-半乳糖苷酶; 3) lacY:透性酶; 4) lacA:硫代半乳糖苷转乙酰基酶
cAMP参与乳糖操纵子的调控:
(1)cAMP通过与cAMP受体蛋白(CRP)结合,引起CRP构 象变化,形成一种有活性的cAMP-CRP复合物;
(2)乳糖操纵子启动基因(O)有2个位点:一个与RNA聚合 酶结合;另一个与cAMP-CRP结合,而且只有后者结合 后才能与启动基因结合,启动转录过程;
(1)产生的表达蛋白的量高于lac启动子;
(2)所有含trp启动子的表达载体都受到3--吲哚丙烯
酸(IAA)的诱导。
如:pDR720
质粒载体pDR720结构示意图
质粒pDR720是一个含trp启动子的表达载体,它 来源于p51,trp启动子在Sma I位点插入,在启动子 的下游有3个位点,Sal I、BamH I和Sma I,可以插 入外源基因。
要注意的关键名词术语:
1) 编码链(有义链,the coding strand); 6) 转录单位(A transcription unit);
2) 反义链(模板链,the template strand); 7) 上游(Upstream);
3) RNA聚合酶(RNA polymerase);
8) 下游(Downstream);
E. coli用作受体菌的优势:
(1)对其遗传学背景、分子生物学、生物化学和生 理学方面的了解较为深入;
(2)很多目的基因能在E. coli中迅速而有效地表达;
(3)其培养条件易于掌控,培养费用相对较低。。
非调控启动子:对细胞产生伤害 (1) 持续性地高水平表达某一目的基因会过分消耗宿
主细胞的营养和能源,最终造成致死效应;
(2) 由于使宿主细胞处于生长的逆境,容易发生载体 质粒的丢失;