第十二讲美国医学文献数据库介绍
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（三） PubMed收录数据
MEDLINE Inprocess
最新的MEDLINE处理中数据，未标引，无MeSH字 段。每条记录标有： [PubMed-in process]。
Publisher-Supplied
出版商提供的电子文献题录，每条记录标有:
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三、PubMed 基本检索规则
自动转换匹配检索词：
对常用医学名词自动在规范词索引（主题词、 副主题词、物质名称）中转换、并默认在所有记 录字段中匹配。 如：liver cancer "liver neoplasms"[MeSH Terms]
如：aloe AND psoriasis[ti]
如：Stem cell transplantation[ti]
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逻辑运算式输入： aloe AND psoriasis[ti] 银屑病出现在篇名中
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PubMed记录字段说明
文摘 第一著者单位地址 出版商提供文献识别号 著者群 版权说明 参考评论文献 合著者 文献参考评论
定稿版
校样版 输入日期 输入完成日期 电子出版日期
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电子出版日期
文献出版日期
医学文献数据库 MEDLINE
2012.12
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一、数据库概况
（一）编制单位：美国国立医学图书馆(NLM) 。 （二）收录学科内容：
主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关 文献。 包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工 艺学、基础研究；临床、护理、公共卫生、卫生 政策发展或相关教育活动的内容。 2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植 物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学 方面的研究内容。
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三、PubMed 基本检索规则
刊名检索：全称或MEDLINE认可的标准缩写, [so] 如：Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so]
输入刊名检索发表在该刊上 的文献（限定出处字段SO）
数据加入PubMed日期 文献勘误 参考文献勘误 全部著者姓名 全部调研者姓名 作为文章主题的著者全称
文献相关注释
基金编号 基因符号 期编号
资助调研者
资助调研单位 国际标准期刊号 美国立医学图书馆识别号 期刊全称
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最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘
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NCBI提供的数据库
检索大分子生物学数据 获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列； 获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列， 从核酸序列翻译到蛋白质的序列； 获取基因和染色体图谱；蛋白质三维结构数 据及大分子模式（ MMDB ）等其他生物信息 数据库检索。 PubMed等文献数据。
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结果显示页右侧Details 显示系统自动匹配转换 的检索词
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三、PubMed 基本检索规则
自动转换匹配检索词： 如：hypertension therapy Details: ("hypertension"[MeSH Terms] OR "hypertension"[All Fields]) AND ("therapy"[Subheading] OR "therapy"[All Fields] OR "therapeutics"[MeSH Terms] OR "therapeutics"[All Fields])
截词检索：treat* 可检出：treat, treated, treatment... 强迫短语检索：“ ”，不进行自动转换匹配 和扩展检索 如：“acute low back pain” “ang 1”（血管紧张素1缩写）检出1085篇 比较：ang 1 检出9956篇，误检多，其中有：
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校园网内可用平台的Medline
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PubMed数据库检索
http://www.pubmed.gov
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一、 PubMed简介
（一）开发机构： NCBI（美国国立生物技术信息中心） http://www.ncbi.nlm.nih.gov NCBI的任务:
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三、PubMed 基本检索规则
检索栏可输入一个或多个检索词（系统默认空格 为AND检索） 如：aloe psoriasis（芦荟治疗银屑病的文献）
多个检索词输入
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三、PubMed 基本检索规则
检索栏可输入布尔逻辑运算式：（运算符须大写） 如：asthma AND (therapy OR treatment) 字段限定符：[ ]，空格按词组匹配
进入途径：
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进入 MeSH
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MeSH 词表字顺界面
主题词
主题词定义
MeSH详细注释界面
副主题词
同义词
主题词族系
添加检索需求
确定副主题词 之间的关系 选钩副主题词 重要主题词确认
不扩展检索确认
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MeSH词检索
课题：果蝇的神经发育学研究 关键词：Drosophila neural development
主题词结合自由词检索：
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主题词结合 自由词检索
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二、 MEDLINE的检索平台
广域网免费平台：
NCBI-PubMed（含非MEDLINE数据）
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二、 MEDLINE的检索平台
校园网内可用平台（IP控制）：
Ovid SP Web of Knowledge EBSCO OCLC First Search
字段限定 stem cell transplantation[ti]
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三、PubMed 基本检索规则
著者检索：姓全称在前，名首字母在后， [au] 。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au]
逻辑运算式输入： Paulsen E撰写的芦荟 治疗银屑病的文章
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PubMed记录状态子集
PubMed记录状态子集
二、PubMed的检索功能
高级检索
基本检索输入框 检索限制 检索指南 检索工具： 特定文献检索 临床查询 专题查询 个人空间 其他资源： 规范词数据库 期刊数据库 临床试验等
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正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的 分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码 标准期刊缩写 文献标题 翻译标题 更新文献 文献正在更新 期刊卷号
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三、PubMed 基本检索规则
检索历史 其他检索资源
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高级检索界面
检索历史
六、PubMed其他资源
1. Mesh Database（规范化医学主题词表）
功能：
确定规范化主题词 查看主题词词义注释、树状结构表 选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词
MeSH Database链接：PubMed主页，Advanced Search 界面 MeSH选项：基本检索框前Search下拉菜单的 35
MEDLINE
Indexed
1966 to prensent的MEDLINE已标引数据， 有MeSH字段和摘要，每条记录标有： [PubMed-indexed for MEDLINE]
OldMEDLINE
1946-1965年间的MEDLINE数据，无 MeSH字段和摘要，每条记录标有： [PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]
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（二） PubMed的特点
广域网免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取） 提供检索词智能转换匹配 界面简洁，操作简便(须IE7.0以上版本)
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（三） PubMed收录数据
2Hale Waihona Puke Baidu18/10/21
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四、PubMed 检索滤过( filter) ：
PubMed结果显示页
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五、PubMed 高级检索功能
一个网页中集多种功能于一体
基本检索
检索细节
结果预览
显示转换规范词及运算的详细过程，可确定规范词
版权拥有者
题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录
其他关键词
提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国 数据库文献编号
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作为主题词的个人姓名
出版状态 文献类型 出版模式（纸张或电子） 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码
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检索结果
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[PubMed-as supplied by publisher]，分为两类： MEDLINE 收录，逐步转为In Process, Indexed状态。 Not MEDLINE：PubMed 收录，MEDLINE不收录， 一直标注[PubMed-as supplied by publisher]或[PubMed]
OR ("liver"[All Fields] AND "neoplasms"[All Fields]) OR "liver neoplasms"[All Fields] OR ("liver"[All Fields] AND "cancer"[All Fields]) OR "liver cancer"[All Fields]
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一、数据库概况
（三）文献来源：
70多个国家和地区；近5600种生物医学期刊 美国卫生研究院文献选择技术评估委员会 Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选 NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。 近年数据涉及39种语种，回溯至1946年的数据涉及 60种语种。45%为美国本土出版文献，91%为英文文 献，83%的文献有文摘。(根据2012年数据库help文 档）
检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。 检索式编制 在 History 中快速显示检索式与检出篇数 可组配检索式，如： #1 OR #2，#1 AND child 检索框中只能输入检索词，不能输入检索式。 点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。 多个字段检索要分多次输入。
利用计算机信息处理技术，建立分子生物学、生物化 学、遗传学知识的自动存储和分析系统，并开展相关 先进方法的研究。 促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件 的使用。 促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。
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NCBI网站
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（三） PubMed收录数据
MEDLINE Inprocess
最新的MEDLINE处理中数据，未标引，无MeSH字 段。每条记录标有： [PubMed-in process]。
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出版商提供的电子文献题录，每条记录标有:
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三、PubMed 基本检索规则
自动转换匹配检索词：
对常用医学名词自动在规范词索引（主题词、 副主题词、物质名称）中转换、并默认在所有记 录字段中匹配。 如：liver cancer "liver neoplasms"[MeSH Terms]
如：aloe AND psoriasis[ti]
如：Stem cell transplantation[ti]
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逻辑运算式输入： aloe AND psoriasis[ti] 银屑病出现在篇名中
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PubMed记录字段说明
文摘 第一著者单位地址 出版商提供文献识别号 著者群 版权说明 参考评论文献 合著者 文献参考评论
定稿版
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电子出版日期
文献出版日期
医学文献数据库 MEDLINE
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一、数据库概况
（一）编制单位：美国国立医学图书馆(NLM) 。 （二）收录学科内容：
主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关 文献。 包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工 艺学、基础研究；临床、护理、公共卫生、卫生 政策发展或相关教育活动的内容。 2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植 物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学 方面的研究内容。
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三、PubMed 基本检索规则
刊名检索：全称或MEDLINE认可的标准缩写, [so] 如：Journal of investigative dermatology[so] J invest dermatol[so]
输入刊名检索发表在该刊上 的文献（限定出处字段SO）
数据加入PubMed日期 文献勘误 参考文献勘误 全部著者姓名 全部调研者姓名 作为文章主题的著者全称
文献相关注释
基金编号 基因符号 期编号
资助调研者
资助调研单位 国际标准期刊号 美国立医学图书馆识别号 期刊全称
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最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘
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NCBI提供的数据库
检索大分子生物学数据 获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列； 获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列， 从核酸序列翻译到蛋白质的序列； 获取基因和染色体图谱；蛋白质三维结构数 据及大分子模式（ MMDB ）等其他生物信息 数据库检索。 PubMed等文献数据。
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结果显示页右侧Details 显示系统自动匹配转换 的检索词
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三、PubMed 基本检索规则
自动转换匹配检索词： 如：hypertension therapy Details: ("hypertension"[MeSH Terms] OR "hypertension"[All Fields]) AND ("therapy"[Subheading] OR "therapy"[All Fields] OR "therapeutics"[MeSH Terms] OR "therapeutics"[All Fields])
截词检索：treat* 可检出：treat, treated, treatment... 强迫短语检索：“ ”，不进行自动转换匹配 和扩展检索 如：“acute low back pain” “ang 1”（血管紧张素1缩写）检出1085篇 比较：ang 1 检出9956篇，误检多，其中有：
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校园网内可用平台的Medline
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PubMed数据库检索
http://www.pubmed.gov
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一、 PubMed简介
（一）开发机构： NCBI（美国国立生物技术信息中心） http://www.ncbi.nlm.nih.gov NCBI的任务:
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三、PubMed 基本检索规则
检索栏可输入一个或多个检索词（系统默认空格 为AND检索） 如：aloe psoriasis（芦荟治疗银屑病的文献）
多个检索词输入
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三、PubMed 基本检索规则
检索栏可输入布尔逻辑运算式：（运算符须大写） 如：asthma AND (therapy OR treatment) 字段限定符：[ ]，空格按词组匹配
进入途径：
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进入 MeSH
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MeSH 词表字顺界面
主题词
主题词定义
MeSH详细注释界面
副主题词
同义词
主题词族系
添加检索需求
确定副主题词 之间的关系 选钩副主题词 重要主题词确认
不扩展检索确认
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MeSH词检索
课题：果蝇的神经发育学研究 关键词：Drosophila neural development
主题词结合自由词检索：
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主题词结合 自由词检索
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二、 MEDLINE的检索平台
广域网免费平台：
NCBI-PubMed（含非MEDLINE数据）
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二、 MEDLINE的检索平台
校园网内可用平台（IP控制）：
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三、PubMed 基本检索规则
著者检索：姓全称在前，名首字母在后， [au] 。 如: smith ab[au] “paulsen e”[au]
逻辑运算式输入： Paulsen E撰写的芦荟 治疗银屑病的文章
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PubMed记录状态子集
PubMed记录状态子集
二、PubMed的检索功能
高级检索
基本检索输入框 检索限制 检索指南 检索工具： 特定文献检索 临床查询 专题查询 个人空间 其他资源： 规范词数据库 期刊数据库 临床试验等
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正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的 分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码 标准期刊缩写 文献标题 翻译标题 更新文献 文献正在更新 期刊卷号
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三、PubMed 基本检索规则
检索历史 其他检索资源
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高级检索界面
检索历史
六、PubMed其他资源
1. Mesh Database（规范化医学主题词表）
功能：
确定规范化主题词 查看主题词词义注释、树状结构表 选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词
MeSH Database链接：PubMed主页，Advanced Search 界面 MeSH选项：基本检索框前Search下拉菜单的 35
MEDLINE
Indexed
1966 to prensent的MEDLINE已标引数据， 有MeSH字段和摘要，每条记录标有： [PubMed-indexed for MEDLINE]
OldMEDLINE
1946-1965年间的MEDLINE数据，无 MeSH字段和摘要，每条记录标有： [PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]
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（二） PubMed的特点
广域网免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取） 提供检索词智能转换匹配 界面简洁，操作简便(须IE7.0以上版本)
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（三） PubMed收录数据
2Hale Waihona Puke Baidu18/10/21
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四、PubMed 检索滤过( filter) ：
PubMed结果显示页
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五、PubMed 高级检索功能
一个网页中集多种功能于一体
基本检索
检索细节
结果预览
显示转换规范词及运算的详细过程，可确定规范词
版权拥有者
题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录
其他关键词
提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国 数据库文献编号
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作为主题词的个人姓名
出版状态 文献类型 出版模式（纸张或电子） 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码
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[PubMed-as supplied by publisher]，分为两类： MEDLINE 收录，逐步转为In Process, Indexed状态。 Not MEDLINE：PubMed 收录，MEDLINE不收录， 一直标注[PubMed-as supplied by publisher]或[PubMed]
OR ("liver"[All Fields] AND "neoplasms"[All Fields]) OR "liver neoplasms"[All Fields] OR ("liver"[All Fields] AND "cancer"[All Fields]) OR "liver cancer"[All Fields]
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一、数据库概况
（三）文献来源：
70多个国家和地区；近5600种生物医学期刊 美国卫生研究院文献选择技术评估委员会 Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选 NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。 近年数据涉及39种语种，回溯至1946年的数据涉及 60种语种。45%为美国本土出版文献，91%为英文文 献，83%的文献有文摘。(根据2012年数据库help文 档）
检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。 检索式编制 在 History 中快速显示检索式与检出篇数 可组配检索式，如： #1 OR #2，#1 AND child 检索框中只能输入检索词，不能输入检索式。 点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。 多个字段检索要分多次输入。
利用计算机信息处理技术，建立分子生物学、生物化 学、遗传学知识的自动存储和分析系统，并开展相关 先进方法的研究。 促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件 的使用。 促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。
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