galton-watson分枝过程
临床心理学
课程结构临床心理学基础、临床评估、临床干预、儿童临床心理学1.临床心理学概念与发展简史2.临床心理学的研究方法3.临床评估4.行为评估5.临床判断6.心理干预7.心理动力学观点的心理治疗9.现象学与人本存在主义观点的心理治疗11.行为主义和认知-行为主义观点的心理治疗13.团体治疗、家庭治疗、夫妻治疗14.其他心理治疗15.心理督导16.临终关怀与居丧安抚17.儿科心理学与儿童临床心理学第一部分临床心理学基础第一章临床心理学的概念与发展简史概念：什么是临床心理学临床心理学综合运用科学的理论和实践，来理解、预测和改善人们的适应不良、能力缺乏、情绪不适，并促进人们的适应、应对和个人发展。
——APA（2000）临床心理学是运用心理学的知识和原理，帮助心理障碍者纠正自己的心理和行为问题，通过心理治疗和心理咨询，指导和培养健全的人格，以使之有效地适应环境并且更加具有创造力的一门应用心理学的分支学科临床心理学者相关的工作者：精神科医生、咨询心理学工作者、学校心理学工作者、康复心理学工作者、健康心理学工作者、精神科护士、其他人员临床心理学者的主要活动：治疗/干预、诊断/评估、教学、临床督导、研究、咨询、管理从业要求1.美国：科学家开业者训练模式（英、加、澳、新、H、M）Ph.D.; Psy.D.（哲学博士；心理学博士）：课程、实习工作、研究、资格考试、住院医实、习2.德语国家（德、奥、瑞）：（1）指定的学位：社会学、哲学、神学、心理学、医学等（2）培训：心理治疗的理论培训；精神病学诊断培训；关系的培训包括小组督导；治疗实践；自我分析或自我体验。
3.中国大陆：心理治疗师、心理咨询师学科关系：普通心理学、变态心理学、人格心理学、发展心理学、社会心理学、生理心理学、神经心理学、健康心理学、行为医学、咨询心理学临床心理学发展简史：1 历史追溯希腊（神话）；与变态心理学等不相区别；Pinel:临床心理学发展道路的里程碑；Tuke；Dix 2 评估领域的发展史1882 Galton建立了人类测量实验室1890 Cattell发明了心理测验术语1904 Binet开始制定他的智力量表1905 Jung开始使用词汇联想方法1913 Kraepelin在诊断方面的工作1914 Terman 的Binet量表美国版问世1921 Rorschach《心理诊断》一书出版1935 TAT出版1937投射技术项目发明1939 Wechsler-Bellevue智力量表出版1943 Halstead引入神经心理测验包1952 DSM-I出版1968 DSM-II出版1970s 行为评估出现1980 DSM-III出版1980s 评估和计算机测验解释兴趣的兴起1987 DSM-III-R出版1990s 控管卫生保健冲击心理评估1994 DSM-IV出版3 干预领域的发展史1793 Pinel 法国精神病院引入人文关怀1848 Dorothea Dix 在新泽西游说改善精神病人医疗卫生设施1895 Breuer 和Freud 发表了《癔症研究》1900 Freud 《梦的解析》出版1908 Clifford Beers 发起精神卫生运动1909 Healy 在芝加哥建立儿童指导诊所1920 Watson 和Rayner 描述了对恐惧的条件反射形成1932 Moreno 介绍了团体治疗1950 Dollard 和Miller《人格和心理治疗》出版1951 Rogers 发表《来访者中心疗法》1952Eysenck 发表了他的心理治疗评论1953 Skinner 概述了操作条件反射原理的应用1958 Wolpe 描述了系统脱敏疗法1965 在Swampscott（MA）社区心理学的诞生1980s 健康心理学的出现1990s 管控卫生保健对心理治疗的巨大冲击1995 实验支持的心理治疗清单出现4 研究领域的发展史1879 Wundt 在德国的Leipzig 建立了第一个心理诊所1890 William James 出版了《心理学原理》1905 Binet 和Simon 发表了有关他们测验的效度资料1916 Terman对Binet 量表的研究1939 Wechsler发表了对Wechsler-bellevue的研究1943 Hathaway 和Mckinley 发表了MMPI资料1952 Eysenck 对心理治疗的抨击1954 Rogers和Dymond报告了他们对咨询过程的研究；Rotter发表了他的社会学习理论1977 Smith 和Glass 报告了对心理治疗研究的元分析1980S DSM-III出版后精神病理研究的成长1990S 行为遗传学的兴趣增加5 职业化的发展史1892 美国心理学会（APA）成立1896 WITMER 建立第一个“心理”诊所1909 APA临床心理分会成立1930 PSI CHI 建立1935 APA训练标准委员会为该领域定义1936 LOUTTIT的第一部临床心理学课本问世1937 《咨询心理学杂志》创刊1945 康涅狄格州通过第一个执业资格法1946 VA 和NIMH 开始经济资助支持心理学1947 ABEPP/ABPP 创建临床心理工作能力资格认证制度1949 BOUDER 会议颁布科学家-开业者模式1953 APA 发表《伦理规范》1968 建立第一个心理学博士点1981 修改《伦理规范》1988 APA 分裂，APS 成立1992 最新《伦理原则》出版1995 APA 批准研究心理工作的处方权问题临床心理学在我国的发展前景1.临床心理学工作者的系统的专业培训和在校临床心理学专业方向学生的培养将有较快发展2.科研工作的重点将是解决临床实践所面临的问题3.心理测量量表在临床实践中的应用将发生重大变化4.诊断与治疗并重5.本土化的趋势6.普及化是社会需求发展的必然7.职业化将逐步规范思考题：1.你对临床心理工作的哪种活动最感兴趣，如何发展自己这方面的能力？2.举一个临床心理学发展史上的事件拓展阅读，并指出其对临床心理学科的发展的影响，并分析这影响的原因。
教育心理学的起源-学习
教育心理学的起源尽管教育心理学思想古已有之，而且早在1531年，西方学者比维斯（J．L．Vives）的著作中就出现了“教育心理学”这一名词，并谈到了学习的兴趣、主动性、记忆、练习等对掌握新材料的重要性等教育心理学问题（Watson,1913）。
但是，这并不意味着教育心理学从此就产生了。
事实上，教育心理学是19世纪政治、经济、教育与心理科学发展的产物。
一、教育心理学产生的时代背景（一）19世纪政治、经济和教育的发展19世纪乃是人类社会近代发展史上的一个重要时期，它是“给予全人类以文明和文化的世纪”《列宁全集》第36卷，人民出版社1985年版，第354页。
在西方，这一时期的主要特点是，随着1640年英国资产阶级革命的开始，资产阶级民主革命运动和民族运动蓬勃发展，腐朽的封建制度迅速崩溃，资本主义经济获得了繁荣发展。
到了19世纪后半期，英国已被称为“世界工场”，占据了世界工业的垄断地位。
在北美洲，早在1776年，北美殖民地人民就掀起了推翻英国殖民统治，建立独立民族国家的斗争，并于1783年获得了胜利，成立了美利坚合众国，从而使资本主义经济在北美获得了广泛的发展。
在法国，18世纪末爆发了资产阶级革命，为资本主义经济的发展扫清了障碍。
从19世纪50年代开始，在意大利和德意志，资产阶级革命运动和民族运动走向了新的高潮，于60年代末70年代初完成了国家的统一。
在俄国，沙皇于1861年签署了关于废除农奴制度的宣言和《农民改革法令》。
在美国，1861年爆发的南北内战最终废除了南方的奴隶制度。
在日本，于1868年开始的“明治维新”改革运动，为资本主义的发展开辟了道路。
在中国，从1840年的鸦片战争开始，帝国主义侵略势力打开了中国的门户，中国的领土和主权遭到破坏，从独立的封建国家开始转变为半殖民地半封建国家，直到1949年新中国成立。
总之，到19世纪60年代末，欧美各大国都先后完成了资产阶级的各项革命，确立了资本主义的完全统治；资本主义世界市场的形成过程也大体完成，生产和交换具有了更广阔的国际性质。
遗传学的研究领域及分支
乳糖操纵子模型的建立(Jacob and Monod, 1961) Francois Jacob(1920-) Jacquces Monod(1910-67) 获1965年诺贝尔奖
获1968年 诺贝尔奖
遗传密码的破译 (Nirenberg and Khorana,1964,1965)
2.微生物遗传和生化遗传学时期(1941～1960)
1944年Avery利用细菌转化实验提出遗传的物质基础是DNA。
2.微生物遗传和生化遗传学时期(1941～1960)
Oswald Avery(1877-1955)
1952年赫尔希（Hershey）利用病毒为材料完成噬菌体侵染细菌的实验，再次证实DNA是遗传物质。 获1969年度诺贝尔奖
CLICK TO ADD TITLE
以微生物(细菌、真菌、病毒)、 植物和动物以及人类为对象，研究 其遗传变异规律。
3、现代遗传学主要研究任务
阐明：生物遗传和变异现象及其表现规律； 探索：遗传和变异原因及其物质基础，揭示遗传变异的内在规律； 指导：动植物和微生物遗传育种，提高医学水平。
二、遗传学的发展简史
STEP5
STEP4
STEP3
STEP2
STEP1
1941年， Beadle和Totum在红色面包霉的生化遗传研究中，分析了许多生化突变体, 提出“一个基因一种酶”假说；
1944年பைடு நூலகம்Avery研究肺炎双球菌的转化实验，证明了遗传物质是DNA而不是蛋白质。
1952年，Hershey等用同位素示踪法在研究噬菌体感染细菌的实验中，再次确认了DNA是遗传物质。
Har Gobind Khorana (left) and Marshall Nirenberg
线性回归分析
表：小区超市的年销售额（百万元）与小区常住人口数（万人）统计表
24
10
01-03 回归分析的应用
分析步骤：(一)
11
01-03 回归分析的应用
分析步骤：（二）
反映模型的拟合度
12
01-03 回归分析的应用
分析步骤：（三） • 一元线性回归 y=kx+b
第三组数据的第1个数据（301.665）是回归直线的截距b，第2个数据（ 44.797）也叫回归系数，其实就是回归直线的斜率k。
某一类回归方程的总称回归分析的概念50102?分类1回归分析按照涉及的变量多少分为一一元回归分析多元回归分析2按照自变量和因变量之间的关系类型可分为线性回归分析非线性回归分析回归分析的概念60102?步骤回归分析的概念1
Contents 内 容
01 回归分析的起源 02 回归分析的概念 03 回归分析的应用
22
01-03 回归分析的应用
想一想 做一做：
已 知 2009 — 2015 年 淘 宝 “ 双 11 ” 当天销量统计如图所示，请利用散 点图进行回归分析，模拟淘宝“双 11 ” 的 销 量 变 化 规 律 ， 并 预 测 2016年的销量。
23
01-03 回归分析的应用
两种回归分析工具使用总结： • 利用回归分析工具进行线性回归的优缺点如下： ① 优点：可以进行一元线性回归，也可以进行多元线性回归。 ② 缺点：只能进行线性回归，不能直接进行非线性回归。 • 利用散点图和趋势线进行回归分析的优缺点如下： ① 优点：不仅能进行线性回归，还能进行非线性回归。 ② 缺点：只能进行一元回归，不能进行多元回归。
行为遗传学
14
6 分子遗传学的产生
1869年，瑞士医生米切尔(F. Miescher)宣称从 脓细胞中分离出核酸。
30多年后，美国细胞生物学家威尔逊(E. B. Wilson)再次发现核酸，证明它是染色体的 重要组成成分，并指出它可能是遗传物质。
15
埃弗里和沃特森的研究
1944年，埃弗里(O. T. Avery)等人从肺炎双球 菌的转化试验中证明了脱氧核糖核酸(DNA) 是遗传物质，基因由DNA组成。
1953年，沃特森(J. D. Watson)和克里克 (F. Crick)（二人共获1962年诺贝尔奖）提出了 DNA的双螺旋结构模型，为阐明DNA的结 构、复制和遗传物质如何保持世代连续的 问题奠定了基础，标志着分子遗传学诞生， 而且使整个生物学跨入了一个新纪元。
16
获诺贝尔奖的遗传学家
从1933年摩尔根第一次获得遗传学领域的 诺贝尔奖以来，截止1989年，遗传学领 域共获得17项诺贝尔奖。
33
海斯顿的重要发现
海斯顿寻访了住院精神分裂症女患者 所生、又被别人领养的47个成年子女。他 把这些人患精神分裂的发病率与生父母无 精神疾病的被收养者患此病发病率作了比 较。结果在这47个母亲患有精神分裂症的 人中, 5人曾经因精神分裂住院治疗, 3人因 慢性精神分裂症已住院几年。在控制组中, 没有一个被收养者患精神病.
39行为遗传学增强了对智力的研究能力我们有了分开抚养的双生子的新数据有了一起长大的双生子的大型研究的新数据有了设计更好的收养研究发展行为遗传学与纵向研究资料的出现使人们能够考察遗传与环境对智力影响的发展变化对行为遗传学数据进行新的更精细的分析方法也得到发展
1
行为遗传学
陈睿
2
前言、什么是遗传学 一、行为遗传学的产生 二、量化遗传学的研究发现 三、分子遗传学的研究 四、对心理学研究的启示
心理学关于语言、学习和教学的探究
心理学关于语言、学习和教学的探究摘要：心理学就是一门研究人和动物的心理活动和行为规律的科学，至今已有140多年的历史。
心理学在应用上与社会各实践领域建立了广泛的联系，从而形成许多分支学科（如犯罪心理学、教育心理学、变态心理学、医学心理学、认知心理学等），体现了独立的在科学体系上的分类。
本文就心理学中关于语言、学习和教学三大内容进行相关探讨研究，发掘心理学在这些领域中的理论发展状况及其相关的指导意义。
关键词：心理学；语言；教学中图分类号：g644文献标识码：a文章编号：1009-0118（2013）01-0105-02一、语言与心理学在一战前期，心理学家并没有对语言和言语进行过多的关注与研究，但也有如wundt和galton等心理学家做出了重大的学科贡献。
当代科学心理学之父wundt早在1870年便通过缜密地观察与科学全面地理论论辩对儿童言语发展和母语习得问题写成著作并发表。
这些试验对于心理学家理解人类思维活动、掌握人类语言表达能力规律以及进行语言行为研究都具有巨大的意义。
世纪之交，freud的口、笔误研究揭示了语言行为的情感动态问题，jung把语言词汇联想做为“诊断工具”，发掘情感的复杂性。
他认为不正常的词汇联想往往预示着个体的情感纠结或精神压力等一系列情感问题。
一战期间，受美国行为主义理论的影响，儿童心理学家在儿童语言发展的差异性问题上争论不休，出现了“先天论”与“后天论”的两大观点，虽在40年代通过两方的“妥协”达成“一致”，却在60年代由于chomsky的理论宣传推广下烽烟再起。
受binet “智力测试”观念的影响，poaget和cameron为代表的心理学家认为语言做为影响个人认识和情感状态的关键因素而存在。
当然，也有一些心理学家认为语言发展先于智力发展，甚至有的认为语言依赖于认知发展。
在此问题上的争论至今没有一个鲜明一致的答案。
1952年，美国的学者们成立了语言学与心理学委员会。
1954年，osgood和sebeok将讨论会的文件和报告汇编并将其命名为《心理语言学：理论和研究问题评述》。
08相关与回归分析(8)袁卫第八章
3.鹳的数量与丹麦乡间婴儿出生率的关系
4.人的长相与工作业绩 5.学习成绩与上网时间 6.人的相貌与智商
第八章
相关与回归分析
第二节 两变量相关分析
一、相关表与相关图 （一）相关表
表1
账单 （美元） 小费 （美元） 33.5 5.5
账单与小费的成对数据
50.7 5.0 87.9 8.1 98.8 17.0 63.6 107.3 120.7 12.0 16.0 18.6
第八章
相关与回归分析
（二）积差法计算公式
设( xi , yi )是( X , Y )的一组样本观察值则 ,
xy x, y的协方差 xy r 为x与y的相关系数 x y x , y x, y的标准差
r ( x x )( y y ) n ( x x ) 2 ( y y ) 2 n n ( x x )( y y ) ( x x ) 2 ( y y ) 2
相关关系特点
（1）变量间关系不能用函数关 系精确表达； （2）一个变量的取值不能由另 y 一个变量唯一确定； （3）当变量 x 取某个值时，变 量 y 的取值可能有几个； （4）各观测点分布在直线周围。
x
第八章
相关与回归分析
[例]身高y与体重x； A：x=60kg、y=1.70m； B： x=60kg、y=1.72m； C：x=60kg、y=1.68m； D： x=60kg、y=1.65m。 影响身高的因素：体重、遗传、锻炼、睡眠质 量……
第八章
相关与回归分析
本章的重点就是基于成对出现的样本数据做出一些 推论。如上例，我们想要确定账单与小费数额之间是 否存在某种关联，如果存在，我们就想用一个规律来 描述它，这样就能找出人们留小费时遵循的规则。 类似这样的问题还有很多，如：
随机过程第5章(Galton-Waston分支过程)
存在性
对于给定的生育概率函数， Galton-Watson分支过程存在。
唯一性
对于给定的生育概率函数， Galton-Watson分支过程是唯一 的。
灭绝概率
定义
灭绝概率是指种群最终消亡的概率。
计算方法
通过递归方式计算每一代种群数量的概率分布， 最终得到灭绝概率。
应用
灭绝概率在生态学、遗传学等领域有广泛应用， 如评估种群稳定性、预测种群发展趋势等。
计算机科学
在计算机科学中，GaltonWatson分支过程可用于模拟网络 流量、路由协议等。
统计学
在统计学中，Galton-Watson分 支过程可用于估计事件的概率分 布和参数估计。
02
Galton-Watson分支过程的 数学模型
模型建立
01
02
03
定义
初始条件
繁殖规则
Galton-Watson分支过程是一个 离散时间的马尔可夫链，描述了 一代代繁殖的种群数量变化。
01
02
03
无重叠世代
每一代种群与下一代种群 没有重叠，即每一代种群 中的个体不会在下一代中 出现。
无移民和迁出
种群中没有新的个体加入 或离开，即种群数量只受 繁殖和死亡的影响。
独立同分布
每一代种群中个体的繁殖 数量独立且服从相同的概 率分布。
03
Galton-Watson分支过程的 性质与定理
存在性与唯一性
生物多样性研究
通过模拟不同环境下的物种繁殖和灭 绝过程，可以研究生物多样性的形成 和维持机制，为保护生物多样性提供 理论支持。
遗传学中的应用
基因传递模型
Galton-Watson分支过程可以用于描述基因在世代之间的传 递过程，帮助遗传学家理解基因突变和进化的机制。
心理学史-1
第二阶段，20世纪60年代之后
• 成立组织，建立心理学史档案馆，创办专业 杂志。 • 1960年，罗伯特· 华生（R.I.Watson）在《美 国心理学家》杂志上发表《心理学史：一个 被忽视的领域》； • 1965年，APA产生了第26个分会，心理学史 分会； • 1965 年， Akron 大学成立美国心理学历史档 案馆，华生担任主席； • 1965年，专业杂志《行为科学的历史》创刊， 华生担任主编；
史的研究对象，是研究西方心理学的起源、 产生和发展的规律。
第三节
西方心理学的理论与流派
一、概念 • 范式（ paradigm ）的含义：第一，从心 理方面说，范式是科学群体的共同态度和 信念，是从事某一学科的科学家所共同分 享的立场和观点。第二，从理论方法上看， 范式是科学群体所公认的“理论模型”或 “研究框架”。
(2)民族心理学的方法
• 也称为心理产品分析法，是通过人类历史文化 资料来研究社会心理学的一种特殊方法。
三．心理学的任务（目标）
• 心理学的任务是研究心理复合体的元素及其 构造的方式和规律。
第三节
对冯特的评价
(一) 冯特的历史功绩 1．使心理学成为“科学的一个新领域” 2．创立心理学实验室和实验心理学
二、安吉尔
• 安吉尔(James Rowland Angell，1869～1949)， 美国机能主义心理学的主要代表，芝加哥学派 的主要建立者。
（一）理论建树
• 首先，更加明确而系统地提出了机能心理 学的主张。
1．认为机能心理学古代渊源于亚里士多德，近 代可追溯到达尔文的《物种起源》。 2．认为心理学的研究对象是意识，但不只研究 意识内容，主要研究心理操作，即心理过程是 如何进行的。
二、学习和研究心理学理论与流派的必要性
动物遗传学 第一章绪论
遗传学的发展
1927年缪勒（Muller）用X射线诱导果蝇 基因突变获得成功。
1930-1932年Fisher R A，Wright S和 Haldane J B S等利用数理统计方法分析遗 传变异和推断群体遗传参数的理论，奠定 了群体遗传学和数量遗传学基础。
遗传学的发展
第二个时期是微生物遗传学和生化遗传学时期（1941— 1960），进一步研究了基因的精细结构和生化功能，认为 遗传的基本单位是顺反子（cis-trons）。 1941年比德尔（Beadle）提出了“一个基因一个酶”的假说。 证明基因是通过酶而起作用，把基因与蛋白质的功能结合 起来。1944年阿委瑞（Avery）从肺炎双球菌转化试验中， 直接证明DNA是遗传物质。1951年麦克林托克（McClintock） 发现跳跃基因，1952年赫尔歇（Hereshey）和简斯在大肠杆 菌的侵染试验中进一步证明DNA是遗传物质。
动物遗传学
主讲 冯登侦 教材： 《动物遗传学》中国农业出版社 ， 李宁主编
参考书
1《动物遗传学》兰州大学出版社 ，门正明主编 2 《动物遗传学》农业出版社，吴仲贤主编 3《遗传学》上下.高等教育出版社,刘祖洞主编 4《遗传学》兰州大学出版社 ,王亚馥主编 5《遗传学》高等教育出版社,周希澄主编 6《现代遗传学原理》科学出版社，徐晋麟主编
遗传学涉及到社会的许多方面
1 能源开发和环境保护、法律上亲子鉴定、 犯罪嫌疑人的排查、考古中DNA的鉴定等。 2 分子遗传标记在动植物鉴定和选择应用， 利用转基因技术生产转基因动植物，生物 反应器生产，利用核移植技术生产克隆动 物。
在工业中的应用
主要应用于生物制药、化学工业、食品工 业和发酵工业。选用突变的高产菌种可使 抗菌素生产成百倍的提高；在微生物发酵 中应用基因调控技术可大大提高氨基酸和 核苷酸的生产；利用基因重组和基因工程 技术生产干扰素、胰岛素、白细胞介素等。
儿童发展心理学概论
• 双生子研究：1990 （托马斯.保查得& 戴维德.莱肯）；他 们从1983年开始研 究，找到了56对分
开抚养的同卵双胞 胎（MZA），分别 来自美国等8个国家
，将他们与在一起 抚养的双胞胎（MZT
）进行比较，结果 是十分惊人的！
• 研究表明：
主动的还是被动的？
• 一种观点认为儿童是积极的，好奇的生命 个体，由他们自身决定了社会对待他们的 方式。（内因说）
• 另一种观点认为儿童是被动的机体，其行 为主要是由环境中的外部力量塑造。（外 因说）
• 在美国，就有一 个青年将自己的 父母告上法庭， 控告他的父母犯 了渎职罪。
• 你怎看呢，如果 你是法官，你会 怎样为父母辩护 ？
第二节、儿童发展心理学研究的基本问题
• 影响个体发展的因素要么是遗传，要么是 环境，究竟哪一个决定了个体的发展？
• 心理发展的动力是什么？ • 发展是连续的还是分阶段的？ • 发展的过程是否存在关键期？ • （P20）
遗传还是环境？
• 遗传，又可表述为天性、成熟、先天、生 物因素
• 环境，又可表述为教养、学习、后天、社 会因素
早期经验的作用
• 相对于人类而言，在动物身上进行有关早 期经验的剥夺与早期环境条件的丰富性研 究更具有现实可行性。动物繁殖与成长的 周期短，因此能较快地看到研究的结果， 也不受人类道德原则的制约。研究者可以 把动物实验的结果在一定程度上推断到人 类。
动物早期经验剥夺的研究
• 罗森兹韦格等（Rosenzweig et al.）：小鼠生存环境对 大脑发育的比较研究。
• 见右图---尾随反应
• 关键期的最基本特征是，它只发生在生命中一个固定的短 暂时期。如小鸭的追随行为典型地出现在出生后的24小时 内，超过这一时间，“印刻”现象就不再明显。
第一代基因测序流程(英语)
第一代测序Sanger法DNA测序流程图（英文）(2011-10-16 12:22:47)DNA sequencing enables us to perform a thorough analysis of DNA because it provides us with the most basic information of all: the sequence of nucleotides. With this knowledge, for example, we can locate regulatory and gene sequences, make comparisons between homologous genes across species and identify mutations. Scientists recognized that this could potentially be a very powerful tool, and so there was competition to create a method that would sequence DNA. Then in 1974, two methods were independently developed by an American team and an English team to do exactly this. The Americans, lead by Maxam and Gilbe rt, used a “chemical cleavage protocol”, while the English, lead by Sanger, designed a procedure similar to the natural process of DNA replication. Even though both teams shared the 1980 Nobel Prize, Sanger’s method became the standard because of its practicality (Speed, 1992).Sanger’s method, which is also referred to as dideoxy sequencing or chain termination, is based on the use of dideoxynucleotides(ddNTP’s) in addition to the normal nucleotides(NTP’s) found in DNA. Dideoxynucleotides are essentiall y the same as nucleotides except they contain a hydrogen group on the 3’ carbon instead of a hydroxyl group (OH). These modified nucleotides, when integrated into a sequence, prevent the addition of further nucleotides. (Speed, 1992).This occurs because a phosphodiester bond cannot form between the dideoxynucleotide and the next incoming nucleotide, and thus the DNA chain is terminated.The MethodBefore the DNA can be sequenced, it has to be denatured into single strands using heat. Next a primer is annealed to one of the template strands. This primer is specifically constructed so that its 3' end is located next to the DNA sequence of interest. Either this primer or one of the nucleotides should be radioactively or fluorescently labeled so that the final product can be detected on a gel (Russell, 2002). Once the primer is attached to the DNA, the solution is divided into four tubes labeled "G", "A", "T" and "C". Then reagents are added to these samples as follows:"G" tube:all four dNTP's, ddGTP and DNA polymerase"A" tube:all four dNTP's, ddATP and DNA polymerase"T" tube:all four dNTP's, ddTTP and DNA polymerase"C" tube:all four dNTP's, ddCTP and DNA polymeraseAs shown above, all of the tubes contain a different ddNTP present, and each at about one-hundreth the concentration of the the normal precursors (Russell, 2002). As the DNAis synthesized, nucleotides are added on to the growing chain by the DNA polymerase. However, on occasion a dideoxynucleotide is incorporated into the chain in place of a normal nucleotide, which results in a chain-terminating event. For example if we looked at only the"G" tube, we might find a mixture of the following products:Figure 1:An example of the potential fragments that could be produced in the "G" tube. The fragments are all different lengths due to the random integration of the ddGTP's (Metzenberg).The key to this method, is that all the reactions start from the same nucleotide and end with a specific base. Thus in a solution where the same chain of DNA is being synthesized over and over again, the new chain will terminate at all positions where the nucleotide has the potential to be added because of the integration of the dideoxynucleotides (Russell, 2002). In this way, bands of all different lengths are produced. Once these reactions are completed, the DNA is once again denatured in preparation for electrophoresis. The contents of each of the four tubes are run in separate lanes on a polyacrylmide gel in order to separate the different sized bands from one another. After the contents have been run across the gel, the gel is then exposed to either UV light or X-Ray, depending on the method used for labeling the DNA.Figure 2:This is a polyacrylmide gel of the reactions in the "G" tube (the same sequences seen in figure 1). The longer fragments of DNA traveled shorter distances than the smaller fragments because of their heavier molecular weight.The blue section indicates the primer, the black section indicates the newly synthesized strand and the red denotes a ddGTP, which terminated the chain (Metzenberg).As shown in Figure 2, smaller fragments are produced when the ddNTP is added closer to the primer because the chains are smaller and therefore migrate faster across the gel. If all of the reactions from the four tubes are combined on one gel, the actual DNA sequence in the 5' to 3' direction can be determined by reading the banding pattern from the bottom of the gel up. It is important to remember though that this sequence is complementary to the template strand from the beginning.Figure 3:This is an autoradiogram of a dideoxy sequencing gel. The letters over the lanes indicate which dideoxy nucleotide was used in the sample being represented by that lane. When you read from the bottom up, you are reading the complementary sequence of the template strand (Metzenberg).Automated SequencingWith the many advancements in technology that we have achieved since 1974, it is no surprise that the Sanger method has become outdated. However, the new technology that has emerged to replace this method is based on the same principles of Sanger's method. Automated sequencing has been developed so that more DNA can be sequenced in a shorter period of time. With the automated procedures the reactions are performed in a single tube containing all four ddNTP's, each labeled with a different color dye (Russell, 2002).Figure 4:In automated sequencing, the oligonucleotide primers can be "end-labeled" with different color dyes, one for each ddNTP. These dyes fluoresce at different wavelengths, which are read via a machine (Metzenberg).As in Sanger's method, the DNA is separated on a gel, but they are all run on the same lane as opposed to four different ones.Figure 5:Results of gel electrophoresis for the dye labeled DNA in automated sequencing. The image on the left shows what the gel looks like if the four reactions are run indifferent lanes, as opposed to the image on the right which shows a gel where all the DNA is run in one lane (Metzenberg).Since the four dyes fluoresce at different wavelengths, a laser then reads the gel to determine the identity of each band according to the wavelengths at which it fluoresces. The results are then depicted in the form of a chromatogram, which is a diagram of colored peaks that correspond to the nucleotide in that location in the sequence (Russell, 2002).Figure 6:Results from an automated sequence shown in the form of a chromatogram. The colors represent the four bases: blue is C, green is A, black is G and red is T (Metzenberg).References1. Russell, Peter. 2002. iGenetics.Pearson Education, Inc., San Francisco, pp 187-189.2. Metzenberg, Stan. Sanger Method- Dideoxynucleotide Chain Termination./~hcbio027/biotechnology/lec3/sanger.html (Feb. 10th, 2003).3. Speed, Terrence. Sanger's Method.[url=/users/terry/Cla ...b/week8b/node9.html]/users/terry/Classes/s260.1998/Week8 b/week8b/node9.html[/url] (Feb. 10th, 2003).。
galton-watson分枝过程
galton-watson分枝过程
Galton-Watson分枝过程是一种随机模型，用于描述一个繁殖群体，可以用来模拟人口增长，病毒传播，社会网络等。
它模拟一个繁殖群体，每个个体都有一定概率生成子代，并且每个个体的子代数量也有一定的概率分布。
Galton-Watson分枝过程的步骤如下：
1. 从一个初始个体开始，记为第0代。
2. 生成第1代的个体，每个个体都有一定的概率生成子代，这个概率被称为繁殖参数。
3. 对每个第1代的个体，生成其子代，每个子代的数量服从一定的概率分布，这个概率被称为生育参数。
4. 重复步骤2和3，直到繁殖群体达到某个特定数量为止。
第九章 相关与回归
回归分析研究什么？
研究某些实际问题时往往涉及到多个变量。在这些变量中， 有一个变量是研究中特别关注的，称为因变量，而其他 变量则看成是影响这一变量的因素，称为自变量 假定因变量与自变量之间有某种关系，并把这种关系用适当 的数学模型表达出来，那么，就可以利用这一模型根据 给定的自变量来预测因变量，这就是回归要解决的问题 在回归分析中，只涉及一个自变量时称为一元回归，涉及多 个自变量时则称为多元回归。如果因变量与自变量之间 是线性关系，则称为线性回归(linear regression)；如果 因变量与自变量之间是非线性关系则称为非线性回归 (nonlinear regression)
9 章 一元线性回归
9.1 变量间的关系
9.1.1 变量间是什么样的关系？ 9.1.2 用散点图描述相关关系 9.1.3 用相关系数度量关系强度
怎样分析变量间的关系？
建立回归模型时，首先需要弄清楚变量之间 的关系。分析变量之间的关系需要解决下 面的问题
变量之间是否存在关系？ 2. 如果存在，它们之间是什么样的关系？ 3. 变量之间的关系强度如何？ 4. 样本所反映的变量之间的关系能否代表总体 变量之间的关系？
9.2 一元线性回归的估计和检验
9.2.1 9.2.2 9.2.3 9.2.4 一元线性回归模型 参数的最小二乘估计 回归直线的拟合优度 显著性检验
一元线性回归
涉及一个自变量的回归 因变量y与自变量x之间为线性关系
被预测或被解释的变量称为因变量 (dependent variable)，用y表示 用来预测或用来解释因变量的一个或多个变 量称为自变量 (independent variable) ，用 x 表示
子代与父代一样吗？
正如Galton进一步发现的那样，平均来说，非常矮小的父辈倾 向于有偏高的子代；而非常高大的父辈则倾向于有偏矮的 子代。在第一次考试中成绩最差的那些学生在第二次考试 中倾向于有更好的成绩(比较接近所有学生的平均成绩)，而 第一次考试中成绩最好的那些学生在第二次考试中则倾向 于有较差的成绩(同样比较接近所有学生的平均成绩)。同样， 平均来说，第一年利润最低的公司第二年不会最差，而第 一年利润最高的公司第二年则不会是最好的 如果把父代和子代看作两个变量，找出这两个变量的关系，并 根据这种关系建立适当的数学模型，就可以根据父代的数 值预测子代的取值，这就是经典的回归方法要解决的问题。 学完本章的内容你会对回归问题有更深入的理解
维纳过程和伊藤引理
Weak-Form Market Efficiency
市场弱式有效
This asserts that it is impossible to produce consistently superior returns with a trading rule based on the past history of stock prices. In other words technical analysis does not work. 这表明不可能利用基于历史股价的交易规则来获取持续的超额 收益
12
Generalized Wiener Processes
广义维纳过程
A Wiener process has a drift rate (i.e. average change per unit time) of 0 and a variance rate of 1 维纳过程的漂移率（即变量每单位时间的平均变 化）为0，方差率为1
In this respect, stochastic calculus is analogous to ordinary calculus 随机微积分可以类比于普通微积分
15
Taking Limits . . .取极限
16
The Example Revisited 回到上面例子
A stock price starts at 40 and has a probability distribution of f(40,100) at the end of the year 股票价格开始为40美元，年末股票价格服从f(40,100) 的正态 分布
为什么广义维纳过程对股票不合适
For a stock price we can conjecture that its expected percentage change in a short period of time remains constant (not its expected actual change) 对于股票价格，我们可以猜测在短期内股票价格百分比变化的期望 保持不变（不是实际价格变化的期望）
认知心理学第一章 认知心理学绪论
认知心理学
（二）人类的认知系统及其特征
1、人类的认知系统
• 人由两大系统组成，一个是维持生存的系统， 它涉及到人类的情绪、需要、动机、意志以及 维持生命与延续生命的部分
• 另一个是认知的系统，它涉及到个体获取知识 和经验的内部心理操作过程，以及个体学习与 运用知识的过程
• 这两个系统相互联系、相互作用（见图1-1）
Cognition is therefore the activities and processes concerned with the acquisition, storage, retrieval and processing of knowledge.
认知心理学
What is Cognitive Psychology?
Function more important than content – Method:
• Introspection in natural settings
– Must study the whole organism in real-life situations – Must get out of the laboratory!
第
（一）、认知心理学的涵义 1、1967年，美国心理学奈塞尔（Neisser）
一
出版了名为《认知心理学》的专著，标
章
志着认知心理学的确立。 在书中他认为认知心理学是研究信息
经感觉输入的转换、加工、存储、恢复、
绪
提取与使用的过程，他把认知心理学划
论
分为视认知、听认知和记忆与思维高层
次心理过程三大部分。
• Nativism:
– Plato, Descartes, Kant – emphasis: that which is innate
回归与Galton1
“回归”是由英国著名生物学家兼统计学家高尔顿（Galton）在研究人类遗传问题(2008-01-09 14:38:01)转载标签：杂谈“回归”是由英国著名生物学家兼统计学家高尔顿（Galton）在研究人类遗传问题时提出来的。
为了研究父代与子代身高的关系，高尔顿搜集了1078对父亲及其儿子的身高数据。
他发现这些数据的散点图大致呈直线状态，也就是说，总的趋势是父亲的身高增加时，儿子的身高也倾向于增加。
但是，高尔顿对试验数据进行了深入的分析，发现了一个很有趣的现象—回归效应。
因为当父亲高于平均身高时，他们的儿子身高比他更高的概率要小于比他更矮的概率；父亲矮于平均身高时，他们的儿子身高比他更矮的概率要小于比他更高的概率。
它反映了一个规律，即这两种身高父亲的儿子的身高，有向他们父辈的平均身高回归的趋势。
对于这个一般结论的解释是：大自然具有一种约束力，使人类身高的分布相对稳定而不产生两极分化，这就是所谓的回归效应。
高尔顿与回归分析的起源弗朗西斯·高尔顿（Francis Galton，1822--1911），英国人类学家、生物统计学家，著名生物学家达尔文的表弟，1822年2月6日生于伯明翰。
早年在剑桥学习数学，后到伦敦攻读医学，1860年当选为皇家学会会员，1909年被封为爵士。
共发表了200余篇论文，出版十几部专著，内容涉及人体测量学、实验心理学、生物统计学等诸多领域。
高尔顿是生物统计学派的奠基人。
达尔文的鸿篇巨著《物种起源》问世以后，触动他用统计方法研究智力遗传进化问题，第一次将概率统计原理等数学方法用于生物科学，明确提出“生物统计学”的名称，现在统计学上的“相关”和“回归”的概念就是由高尔顿最先作为统计学术语使用的。
1855年，高尔顿发表《遗传的身高向平均数方向的回归》一文，他和他的学生K·Pearson通过观察1078对夫妇，以每对夫妇的平均身高作为自变量，取他们的一个成年儿子的身高作为因变量，分析儿子身高与父母身高之间的关系，发现父母的身高可以预测子女的身高，两者近乎一条直线。