向GenBank提交序列
GenBankDNA序列库
GenBankDNA序列库编辑：刘慧萍陈梅红GenBank简介GenBank检索与查询方式向GenBank递交数据GenBank 概况（/Web/Genbank/index.html）•GenBank 是什么?GenBank 是NIH 的基因序列数据库，是所有公开的DNA序列的集合(NucleicAcids Research 1998 Jan 1;26(1):1-7). 截至1998年12月，GenBank大约收集了2,162,000,000 个碱基、3,044,000 个序列。
作为示例，你可以察看一下neurofibromatosis gene的纪录。
也可以阅读关于当前版本的Genbank的完整的release notes（发布说明）。
每两个月会发布一个新的版本（release）。
GenBank 也是国际核酸序列数据库协作（International Nucleotide Sequence DatabaseCollaboration）的一部分，国际核酸序列数据库协作由以下几个部分组成：日本DNA 数据库（DNA DataBank of Japan (DDBJ)），欧洲分子生物学实验室（the European Molecular Biology Laboratory (EMBL)）和NCBI的GenBank ，这三个组织每天都交换数据。
•向GenBank提交数据许多杂志要求在文章发表之前提供相应序列的基因数据库的提交信息（submission of sequence information），因为这样的话，一个序列访问号码（accession number）就可以出现在文章中。
NCBI有一个WWW形式的表格叫做BankIt，它提供了一种快速而简便的序列提交方法。
另一种方法是使用Sequin，NCBI开发的新的可以独立运行于MAC, PC, and UNIX平台的序列递交软件，可以从FTP获得它，使用Sequin 时，用于直接提交的输出文件可以通过E-mail 发送到NCBI，也可以将数据文件拷贝到软盘上邮寄给NCBI。
如何进行GenBank序列提交、详细步骤
向GenBank投递序列
• GenBank提供多种工具投递序列,如
– BankIt (网上投递)
适于少量的、注释简单的序列投递
– Sequin (本地投递;软件)
适于大量的、复杂的序列投递 可投递变异、种系发生、群体数据集 图形界面操作 选项多、功能强 可向GenBank, EMBL, DDBJ中的任一数据库投递
• BankIt（5）
物种名称
7
• BankIt（6）
序列数据来 源
8
• BankIt（7）
序列数据 来源编辑
9
• BankIt（8）
引物信息
10
• BankIt（8）
序列特征
11
• BankIt（9）
序列特征12Fra bibliotek• BankIt（10）
提交任务总览， 确认无误点提
交
提交成13 功后，即刻收到确认邮件，两个工作日内可收到回复。
1
• BankIt（1）
注 册
2
新提交任 务
• BankIt（2）
3
联系人信息
• BankIt（3）
本次提交任务 编号
序列作者姓名
参考文献 参考文献作者
4
• BankIt（4）
序列释放时间
序列相关信息
5
• BankIt（4）
6
预提交序列数 目
按FASTA格式填入 序列
也可直接上传 FASTA 格式文件
#GenBankDNA序列库
GenBankDNA序列库编辑：刘慧萍陈梅红GenBank简介GenBank检索与查询方式向GenBank递交数据GenBank 简况<）•GenBank 是什么?GenBank 是 NIH 的基因序列数据库，是所有公开的DNA序列的集合 (Nucleic Acids Research 1998 Jan 1。
26(1>:1-7>. 截至1998年12月，GenBank大约收集了2,162,000,000 个碱基、3,044,000 个序列。
作为示例，你可以察看一下neurofibromatosis gene的纪录。
也可以阅读关于当前版本的Genbank的完整的release notes <发布说明）。
每两个月会发布一个新的版本< release）。
GenBank 也是国际核酸序列数据库协作<International Nucleotide Sequence DatabaseCollaboration）的一部分，国际核酸序列数据库协作由以下几个部分组成：日本DNA数据库<DNA DataBank of Japan (DDBJ>），欧洲分子生物学实验室< theEuropean Molecular Biology Laboratory (EMBL>）和 NCBI的GenBank ，这三个组织每天都交换数据。
•向GenBank提交数据许多杂志要求在文章发表之前提供相应序列的基因数据库的提交信息<submissionof sequence information），因为这样的话，一个序列访问号码 <accession number）就可以出现在文章中。
NCBI有一个WWW形式的表格叫做 BankIt，它提供了一种快速而简便的序列提交方法。
另一种方法是使用 Sequin，NCBI开发的新的可以独立运行于MAC, PC, and UNIX平台的序列递交软件，可以从FTP获得它，使用Sequin时，用于直接提交的输出文件可以通过 E-mail 发送到NCBI，也可以将数据文件拷贝到软盘上邮寄给NCBI。
如何在NCBI提交序列
打开NCBI主页: /
点击左侧GenBank (Sequence submission support and software)
选择左侧的submit to GenBank
一般来说，有多种提交方法，Bankit是在线提交的，比较方便，如果不是比较长而且比较复杂的序列的话都可以用这种方法提交。
我们只讲该方法。
我们点击页面中蓝色的Bankit,
然后下拉页面到最底层
把你序列的长度填入这个方框里，然后按“New”按钮。
得到了这个界面，里面内容（contents）包括4点，你可以根据自己序列的情况适当进行选择填写，内容不明就先不要写，提交完后还是可以更新的。
这里提供的序列必须单一填写，每个序列有一个Bankit*******号码，这个要注意。
然后就可以根据下面的内容填写了，完毕后在最低下大框里填入序列，最后你可以save 你的这个格式，然后validate and continue。
如果出错就会有红色的提醒，需要重填，因为我没有序列所以就出现下面情况
不过我想这也说明这些信息是必填的，别的看来都不是很重要，您不妨按着这个思路去填，呵呵，祝您好运。
最后会给您发个邮件，等过几个月后如果没有问题就能得到您的登录号了，如果有问题他会
邮件和您联系，再见。
编码蛋白质的基因序列上传GenBank详细教程
翻译蛋白的基因序列提交NCBI教程说明：在上传编码蛋白质的基因到NCBI时，定义基因的CDS区段是非常重要的一步，也是大多数学生所迷茫和不会的地方。
那么，在基因序列上传时，大家还在发愁序列的CDS 编码区段是从多少位碱基到哪吗？这篇教程给大家详细的演示了如何定义手中序列的CDS 区段，轻松上传序列。
注：大家都知道像ITS，18S，28S等这些序列片段不是基因，它们是不翻译蛋白质的，这个教程教大家如何提交能翻译蛋白的基因序列。
提交通道：通过NCBI内的BanKIt进行提交。
1.打开NCBI主页，在搜索框内输入“BankIt”，见下图12.搜索结果见下图23.进入后进行登录，用NCBI的账号和密码登录（注：如果没有，可以使用邮箱注册），登录后的页面见下图3，根据需要点击相应按钮开始进入序列提交界面（注：也可点击下图红色框圈出的位置）4.我们需完成如下图4中的8个步骤，即可完成提交5．完成第一步的Contact Information后，第二步的Reference我们需要填写如下图5的信息6．Sequencing Technology选项，填写如下图67．Nucleotide（这一步需要我们准备上传的序列文件）a.序列文件类型为fasta文件，我们需要先对序列进行定义（也就是介绍该序列，可以先将自己的序列在NCBI里Blast一下，然后再点开Query Cover（可理解为覆盖度）和Per. Ident（可理解为匹配度）都非常高的那个网上的参考序列，然后复制该参考序列的定义内容即可，见下图7-1）b.然后粘贴成为我们手中的序列定义，见下图7-2（注：不要忘记将菌株号改为自己的菌株号，序列开端一定要是“>Seq1 [organism=genus species]”，其中的Seq1可以用你的菌株号，也可以随意编号，只要你自己知道就可，方括号[xxxx]内填写自己序列的菌的拉丁名）c.准备好序列后，我们勾选如下图7-3的选项d.然后这个序列就可以载入了（点击Upload file），或者直接粘贴该序列，见下图7-4单个序列的界面注：这一步上传序列时你也可以将多条序列，包括不同基因的序列都可以准备到同一个fasta文件里，载入后再选择“Batch”（批量提交的意思），界面见下图7-5e.点击Continue8. Organism这一项需输入咱们的菌拉丁名，见下图89. Submission Category 如下图910. Source Modifiers 这一项需要我们输入一些有关咱们的菌的信息，如采集国家，采集人，，isolate，时间等信息，见下图1011. Features (Overview) 这一项是非常重要的一项，也是大家经常有问题的一项，一定要认真学。
向GenBank批量上传序列的方法
向GenBank批量上传序列的方法Qin1.利用DNAstar的editSeq制作待序列的FASTA文档：待上传序列删减至合适长度后，将待上传序列全部打开随后点击File - export as one，保存文件格式为：*.fas ，将待上传序列全部归至一个FASTA 文档。
注意序列命名：2.在GenBank的Submission Tools里，下载序列信息编辑软件Sequin。
网址：/Sequin/（下图中点击Instructions下载软件）注意打开安装文件后，程序会自动安装在安装包所在的文件夹。
3.打开Sequin，点击Start New Submission。
4.随后选择序列发布日期，输入论文题目。
若之前保存有模板，可以点击下面的“Click here to import a template”导入。
模板导出在下文的第五点提到。
5.联系人、作者信息、机构或者学校信息建议导出模板，之后修改信息时可以直接导入模板而不需重新输入。
6.选择上传的序列类型。
7.导入之前准备好的FASTA文件：导入之后，输入序列ID（序号ID相当于编号，可以自由命名，只要各个序列的ID不一致即可。
在这里以病人编号作为序列ID）：导入序列成功后，显示各个序列信息如下：点击Sequencing Method，将测序方法输入：选择上传序列的用途：病毒类型：8.编辑每条序列的信息：点击Import Source T able可以导入模板，点击Export This Table 可以输出模板备用。
9.选择核酸类型，序列内容后，点击Open Record Viewer。
10.添加每条序列的信息，包括编码区重复区RNA结构等等。
双击相关信息可进行修改，点击Annotate添加相关信息。
11.检查信息是否有误（也可以点击Search里的Validate检测是否有明显错误）：有些错误是可以忽略的，如上传的序列为CDS序列，那么软件报错”序列无终止子”时可忽略。
怎么向GenBank提交序列-步骤准确、详细
Bankit Submission Guidence王琳2012.5.81.登录网页/WebSub/?tool=genbank2.点击右方Sign in to use BankIt3.首次使用点击Register for an account, 如果已经创建用户名,则输入用户名、密码，登录账号。
4.登录账号后，点击New Submission，输入Contact Information，然后点击Continue。
5.之后界面是输入Reference信息，Sequence Authors, 与之相关的文章题目、文章状态、作者信息，然后点击Continue。
6.Nucleotide界面：选择序列合适公布（一般选Immediately After Processing，处理时间大约需要2-3个月，但是GenBank Accession Number提交完一两天就会邮件收到），然后依次选择Moleculer Type、Topology、Genomic completeness、提交序列数量，然后上传预先准备好的Fasta file。
可以把所有要提交的序列都集中在这个fasta文件中，序列命名方式参照附件，然后根据从GenBank搜出来的相似序列加以调整（编辑过程最好使用Notepad打开修改）。
上传完，点击Continue。
7.在set/batch界面，我一般选择batch（因为是把各种序列混在一起），然后点击Continue。
8.Submission Category, 选择Original，然后Continue。
9.Source Modifiers: 选择Organelle/Location（不适用的话可以不选），上传预先准备好的source modifiers table file（参见附件，tab-delimited text file格式上与一般的txt file看起来不太一样）。
点击continue，source file里的内容会显示在下方。
我国高校向GenBank递交序列数据状况
• (CHINA OR TAIWAN OR “HONG KONG”) NOT "gbdiv est"[Properties] Limits: Modification Date to 2001/12/31，共获得24701个记录
• (CHINA OR TAIWAN OR “HONG KONG”) NOT "gbdiv est"[Properties] Limits: Modification Date to 1996/12/31，共获得915个记录
3000
总数
大学 2500
2000
1500
1000
500
0
省（市） 记录总数 其中大学记录数
上海
2469
1011
北京
3797
645
江苏
656
489
广东
571
388
浙江
297
235
湖北
548
220
山东
213
170
陕西
185
156
福建
149
107
湖南
129
99
四川
171
79
云南
1073
63
辽宁
97
60
广西
统计方法说明
• 本文统计了截止1996年12月31日和2001年12月31日由我国大学和其他研究机构直接递交 GenBank国际公共数据库的DNA和基因组序列数量，有关统计方法说明如下：
• 利用NCBI提供的ENTREZ搜索系统进行初步的检索和统计：
• （1） 先将只要含有中国、台湾、香港和澳门字样的非EST记录均下载：
学
安徽
图文讲解如何通过Bankit获取GenBank登录号
用bankit向GenBank 提交序列
获取GenBank登陆号
一、登陆网址
l方式一：
/WebSub/?tool=ge nbank
一、登陆网址•方式二：
①在ncbi点nucleotide；
②找到Submit ；
③点击banklt即可进入界面。
二、点击Sign in to use BankIt
三、先注册一个账号
四、利用注册的账号登陆
五、点击New Submission
六、填写序列递交者的联系方式
七、填写序列递交者的名字及
所要递交的序列发表（待发表）文章的信息（1）
七、填写序列递交者的名字及
所要递交的序列发表（待发表）文章的信息（2）
八、填写测序技术的信息（包括序列的处理）
九、导入序列（1）
九、导入序列（2）方式一
九、导入序列（3）方式二
可以复制序列，
也可以导入文件
（文件的格式要
按BankIt的要求）
十、Organism信息
十一、Submission Category
十二、选择性填写Source Modifiers信息
十三、Features
十四、检查并递交。
如何在NCBI提交序列
如何在NCBI提交序列
在NCBI（National Center for Biotechnology Information）上提交序列是一个相对简单的过程，但是需要按照一定的步骤进行，以下是一些详细的指导步骤：
1. 首先，在浏览器中打开NCBI的主页，并点击"Submit"或"Submit Data"按钮。
2. 进入"Submit Data"页面后，选择要提交的序列类型，比如DNA、RNA或蛋白质序列。
6.在填写完所有必要的信息后，你可以选择是否需要与已有的NCBI 数据库记录进行比对。
这可以帮助你确定你的序列是否已经在NCBI数据库中存在。
7. 最后，你需要选择提交的方式。
你可以选择将序列提交到NCBI的GenBank数据库，或者将其提交到相应的数据库中，如Protein、Nucleotide或Genome等。
8. 完成以上步骤后，点击"Submit"或"Submit Data"按钮将你的序列提交到NCBI。
9.提交成功后，你会收到一封确认邮件，其中包含你的序列提交的相关信息和链接。
需要注意的是，确保你提交的序列是准确、完整和清晰的，并且符合NCBI的提交要求和规定。
此外，你还应该确保你有权提交这些序列，并且没有侵犯其他人的权益。
提交序列到NCBI可能需要一些时间进行处理和审核，你可以在你的NCBI账户中查看你的提交状态和结果。
向GenBank提交序列
GenBank序列提交需要的条件
• 通过登录系统注册MyNCBI • 序列可以通过复制粘贴或文本形式上传（多条序列必须是 FASTA格式） • 提交序列公布的期限（是立即公布还是指定特定日期） • 序列提交者、文章作者、题名等相应的参考文献等基本信 息。 • 序列来源物种名称等描述信息 • 序列特征（例如CDS，gene，rRNA，tRNA，内含子，产 物名称等）
ABI公司的高通量测序平台
测序技术的选择
线粒体
线粒体：动质体 质体：叶绿体、 apicoplast（原生动物 质体样细胞器）、有色 体、蓝色小体、白体、 原生质体、核形体。 前病毒 染色体外的大核。
检查输入信息无误后，点继续。
GenBank 序列提交要求
• 向GenBank提交的序列应该是由提交者确定和注释的新序列。 • 来源于或用于构建非GenBank 的第三方数据库的数据也可能用 Bankit提交。 • 以下几种情形不允许提交到数据库
序列长度小于200bp，除非它是完整的外显子、非编码RNA （ncRNA）、微卫星或古DNA。 人工拼接的不连续的序列：例如拼接了多个外显子而没有内含子序 列，或者内含子区域有误。 仅有引物序列 仅有蛋白质序列 单条序列标注多种分子类型，例如即标注为基因组序列，又标注为 mRNA序列 表达序列标签（EST），ESTs应当通过dbEST系统进行提交。 基因组勘测序列（GSS），GSSs应当通过dbGSS系统提交。 序列标签位点（STS），STSs应当通过dbSTSA系统提交。
点击Continue后会 跳出一个确认窗口， 如果信息准确无误， 则可以点继续，如 果部分信息有误， 则会指出错误位置。
选择提交数据类型：Original 是由提交者直接提交， Third Party Annotation 是从其它数据库中第三方 进行注释的序列。
提交基因序列到genbank的流程
提交基因序列到genbank的流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成，希望大家下载以后，能够帮助大家解决实际的问题。
文档下载后可定制随意修改，请根据实际需要进行相应的调整和使用，谢谢!并且，本店铺为大家提供各种各样类型的实用资料，如教育随笔、日记赏析、句子摘抄、古诗大全、经典美文、话题作文、工作总结、词语解析、文案摘录、其他资料等等，如想了解不同资料格式和写法，敬请关注!Download tips: This document is carefully compiled by theeditor.I hope that after you download them,they can help yousolve practical problems. The document can be customized andmodified after downloading,please adjust and use it according toactual needs, thank you!In addition, our shop provides you with various types ofpractical materials,such as educational essays, diaryappreciation,sentence excerpts,ancient poems,classic articles,topic composition,work summary,word parsing,copy excerpts,other materials and so on,want to know different data formats andwriting methods,please pay attention!提交基因序列到GenBank的详细流程GenBank是一个全球性的公开数据库，由美国国立生物技术信息中心（NCBI）维护，用于存储和分享各种生物体的DNA和蛋白质序列信息。
GeneBank提交数据类型简介PublicLibraryofBioinformatics
GeneBank提交数据类型简介PublicLibraryofBioinformatics向GenBank提交数据提交序列有两种方式，一个是在线的页面提交序列bankit，另一个是通过NCBI的Sequin软件提交序列。
从使用方便性上来说，两者均需要填写所必须的各项资料，也都是很麻烦，但后者也以同时提交多项序列，而且不会因为网络错误而导致已填写的数据丢失，还是更有利一些。
使用起来都是比较简单的，按照页面或者软件的说明一步一步填写即可。
提交序列后，系统会暂时给你分配一个临时的序列号，等到你的序列经过初步审核后会得到正式的Genbank序列号或登录号。
你可以对你的序列随时进行修改和补充其他相关资料。
关于提交序列数据，收到 accession number，和对纪录作更新的一般信息。
·BankIt - 用于一条或者少数条提交的基于WWW的提交工具软件。
（请在提交前用VecScreen 去除载体）·Sequin - 提交软件程序，用于一条或者很多条的提交，长序列，完整基因组，alignments，人群/种系/突变研究的提交。
可以独立使用，或者用基于TCP/IP的"network aware"模式，可以链接到其他NCBI的资源和软件比如Entrez和PowerBLAST。
（请在提交前用VecScreen去除载体）· ESTs - 表达序列标签，短的、单次（测序）阅读的cDNA序列。
也包括来自于差异显示和 RACE 实验的 cDNA 序列。
·GSSs - 基因组调查序列，短的、单次（测序）阅读的cDNA序列，exon trap 获得的序列，cosmid/BAC/YAC 末端，及其他。
·HTGs - 来自于大规模测序中心的高通量基因组序列，未完成的（阶段0，1，2）和完成的（阶段3）序列。
（注意：完成的人类的HTG序列可以同时在 GenBank 和 Human Genome Sequencing页面上访问。
细菌分类鉴定规程
细菌分类鉴定规程细菌分类鉴定规程杜艳、余翔、罗国升新菌鉴定主要流程：1、潜在新菌的确定拿到拼接好的16Sr RNA gene序列后，进入NCBI blastN ()或EzTaxon server 2.1() 进行比较，同源性低于98%的序列(同源性处于98-97%之间的序列最好少于3株)，可初步判断存在新菌的可能。
2、选择标准菌株构建进化树选择参考菌株构建三种进化树(NJ、MP和ML)，构建进化树是需要注意以下几点：1）所选择的序列必须都是在IJSEM上正式发表的序列，2）所选择的参考菌株必须包含新菌所在属的所有标准菌株，3）需要选择新菌所在科的一些与新种所在属相近的属的type species作为参考菌株，4）需要选择一个远源的菌株作为参考菌株，如：E. coli。
3、购买标准菌株根据进化树位置和同源性高低选择标准菌株作为参考菌株，联系相关保藏机构购买标准菌株。
具体信息可以在上查找。
标准菌株的选择需遵循以下几点：1) 如果要用到不同的属但不是用这些属的所有的种，则要选择这些属的模式种，并且要选择模式种的模式菌株。
2) 一个属的模式种是最重要的参照微生物，如果一个新种被认为属于这个属，就一定要与该属的模式种进行比较，而其他的种可能分类时出现错误，可能将来会被重新分类。
总之，进行种、属、甚至是科的比较研究时，都要用模式微生物，这就涉及到模式属的模式种，模式种的模式菌。
4、表型特征实验培养特征：菌落特征(如菌落的形状、大小、颜色、隆起、表面状况、质地、光泽、水溶性色素等)。
细胞形态：形态(球形、杆状、弧形、螺旋形、丝状、分枝及特殊形状)，大小，排列(单个、成对、成链或其他特殊排列方式)。
特殊的细胞结构：鞭毛(着生位置、数量)，芽胞(形状、着生位置、是否膨大)，孢子(孢子形状、着生位置、数量、排列)，其它 (荚膜、细胞附属物为柄、丝状物、鞘、蓝细菌的异形胞、静止细胞和连鞘体等)。
超微结构：细胞壁、细胞内膜系统、放线菌抱子表面特征等。
Genbank,EMBLE,DDBJ
一前言Genbank核酸序列数据库是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的。
它包含了所有已知的核酸序列和蛋白质序列，以及与它们相关的文献著作和生物学注释。
它的数据直接来源于测序工作者提交的序列。
EMBL数据提交方式主要有三种，即通过Webin、Sequin或 Data Submission Form三种方式提交数据，目前EMBL数据库已停止接受email 格式的提交方式。
日本DNA数据库DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年建立，是世界三大DNA 数据库之一。
二本论2 Genbank简介Genbank核酸序列数据库是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的。
它包含了所有已知的核酸序列和蛋白质序列，以及与它们相关的文献著作和生物学注释。
它的数据直接来源于测序工作者提交的序列；由测序中心提交的大量EST序列和其它测序数据；以及与其它数据机构协作交换数据而来。
2.1GenBank的序列提交提交序列有两种方式，一个是在线的页面提交序列bankit，另一个是通过NCBI的Sequin 软件提交序列。
Sequin也是一种很好的利用了NCBI数据模型ASN.1编辑工具。
BankIt 用于一条或者少数条提交的基于WWW的提交工具软件，适合于独立测序工作者提交少量序列，而不适合大量序列的提交，也不适合提交很长的序列，EST序列和GSS序列也不应用于BankIt提交。
BankIt是一系列表单，包括联络信息、发布要求、引用参考信息、序列来源信息、以及序列本身的信息等。
并且在提交前用 VecScreen 去除载体。
1、进入GenBank /genbank/ 点击BankIt2、在BankIt使用的时候先进行注册，点击右上角的Sign in to NCBI,在如果使第一次使用则需要注册，点击Register for an account, 如果已经创建用户名，则输入用户名、密码直接登录即可。
NCBI序列提交方法
NCBI序列提交方法NCBI提交序列有两大类方式，一个是批量提交一个是单个序列提交。
下面说的就是单个序列提交方式，这是最新的提交方式，由于NCBI更新很快，也许过段时间又不一样了，主要是按钮位置可能会变。
首先要注册一个自己的NCBI账号：点击此处注册然后登陆账号：在已登陆状态下点击Submit：点击图中标记处选择GengBank：点击GO：选择：Banklt：建议认真阅读填写要求等：点击Sign in to use Banklt点击New Sub,下面是你提交的记录，即使你提交过程中中断了，也可以Continue!以下是具体提交过程：一．.填写基本信息二．1.图中1是作者名字，可以添加作者名，First和Last Name，填了就可以，其他可以不填。
2.图中2是填是否出版，有三个选项：未出版，正在出版，已经出版。
需要注意的是，如果选则未出版，需要在Title中注明，否则无法提交。
3.可以添加作者，然后Continue即可。
三.这是选择是用生么测序方法后的的序列1.现在我们用的一次只能测一条序列的都是Sanger测序，下面的454等都代表仪器型号，是我们现在说的高通量测序，简单的书不同型号灵敏度不同。
2.这是选择你测序是一个反应还是几个反应，就是你这条序列是一个测序结果就出来了，还是几个测序结果拼在一起得到的结果，一代测序一个反应最可信的测序范围是50-750bp,根据实际选择，然后继续。
四．填写序列信息：1.选择什么时候公布你的序列信息，你可以选怎立刻，也可以选择在以后的某一时间，如果你选择了时间，那么即使你已经上传序列，有了序列号，在时间未到的时候你也是找不到的。
2.选择你的序列是不是16SrRNA基因是细菌上编码rRNA相对应的DNA序列,可能有一个专门的库，所以一般选择NO3.选择你的序列类型，1.我选了cDNA ,然后选择是什么类型：是线性，我们一般的都是线状的，还是环状一般想线粒体，叶绿体或者各种质粒都是现状的。
基因序列注册步骤
如 何 在 GenBank 中 注 册 基 因 序 列
卢洪洲 , 汤一 苇
1 2
1. 上海市( 复旦大学附属) 公共卫生临床中心, 上海 201508 2. 美国范德堡大学医学中心, 田纳西州 37232
很多杂志要求论文提供所涉及的新基因序列具 有 GenBank 编 号, 以下是 如何向 GenBank 递交新 基 因序列的 一 些 建 议。在 GenBank 中 注 册 新 基 因 的 网 址 为: http: / / www. ncbi. nlm. gov /Genbank / submit. html, 该网站提 供 Bankit 和 Sequin 两个 路 径 进行新基因注册。通常 采取 Sequin 路径 进行 注册。 注册后, 在 2 个工作日内, GenBank 会向作 者提供 序 列编号( accession number) , 这个序 列编 号能够 证 明 作者曾经向 GenBank 递 交基 因信 息, 使读 者在 阅 读 相关论文前就能够获得该基因的相关数据。论文发 表后, 作者再次将论文所发表的杂志名、 期、 卷、 页码 等具 体 信 息 发 送 给 gb-admin@ ncbi. nlm. nih. gov。 GenBank 管理 人 员 确 认 后 将 该 信 息 输 入 此 序 列 编 号, 以供其他科学 人 员及 时发 现和 引用。 这一 过 程 对尚未被 Medline 引 用 的 非 SCI 杂 志 尤 为 重 要, 因
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- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
依次填入：名、姓、 部门、机构、街道 地址、城市、省份、 邮编、国家、电话、 传真、电子邮箱信 息。点击继续 continue
参考文献信息：填写 序列提交者姓名、文 章题名、发表状态等
在该页面中，可 以指定序列信息 公布时间、说明 序列是否为16S rRNA，序列分子 类型、拓扑结构、 基因组信息完整 性。分子类型分 为基因组DNA， 由cDNA到mRNA， 基因组RNA， RNA前体，转运 RNA，非编码 RNA，小胞浆 RNA，cRNA， 其他RNA和其他 DNA。 拓扑结构为线性 或环形BI • 序列可以通过复制粘贴或文本形式上传（多条序列必须是 FASTA格式） • 提交序列公布的期限（是立即公布还是指定特定日期） • 序列提交者、文章作者、题名等相应的参考文献等基本信 息。 • 序列来源物种名称等描述信息 • 序列特征（例如CDS，gene，rRNA，tRNA，内含子，产 物名称等）
序列的提交
/WebSub/?tool=genbank
GenBank 序列提交要求
• 向GenBank提交的序列应该是由提交者确定和注释的新序列。 • 来源于或用于构建非GenBank 的第三方数据库的数据也可能用 Bankit提交。 • 以下几种情形不允许提交到数据库
点击Continue后会 跳出一个确认窗口， 如果信息准确无误， 则可以点继续，如 果部分信息有误， 则会指出错误位置。
选择提交数据类型：Original 是由提交者直接提交， Third Party Annotation 是从其它数据库中第三方 进行注释的序列。
传统的桑格的双脱氧测序方法，一般单 条短序列测定都采用此方法。 罗氏公司的高通量测序平台
序列长度小于200bp，除非它是完整的外显子、非编码RNA （ncRNA）、微卫星或古DNA。 人工拼接的不连续的序列：例如拼接了多个外显子而没有内含子序 列，或者内含子区域有误。 仅有引物序列 仅有蛋白质序列 单条序列标注多种分子类型，例如即标注为基因组序列，又标注为 mRNA序列 表达序列标签（EST），ESTs应当通过dbEST系统进行提交。 基因组勘测序列（GSS），GSSs应当通过dbGSS系统提交。 序列标签位点（STS），STSs应当通过dbSTSA系统提交。
ABI公司的高通量测序平台
测序技术的选择
线粒体
线粒体：动质体 质体：叶绿体、 apicoplast（原生动物 质体样细胞器）、有色 体、蓝色小体、白体、 原生质体、核形体。 前病毒 染色体外的大核。
检查输入信息无误后，点继续。