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2014-基因组学——最终版
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基因组学题库一基因组学介绍1 基因组与基因组学基因组是指生物的整套染色体所含有的全部DNA序列,是生物体所有遗传信息的总和。
基因组学(Genomics)是以生物信息学分析为手段研究基因组的组成、结构、表达调控机制和进化规律的一门学科,研究对象是基因组结构特征、变演规律和生物学意义。
2 C质与C质悖论C值(C value)通常是指某一生物单倍体基因组DNA的总量。
C值悖论(C Value Paradox):生物的复杂性与基因组的大小并不完全成比例增加。
3 人类基因组计划及其8个目标人类基因组计划(human genome project, HGP)是由美国科学家于1985年率先提出,于1990年正式启动的。
美、英、法、德、日和我国科学家共同参与了这一预算达30亿美元的人类基因组计划。
按照这个计划的设想,在2005年,要把人体内约10万个基因的密码全部解开,同时绘制出人类基因的谱图。
其8个目标:1)人类DNA序列(Human DNA sequence);2)开发测序技术(Develop sequencing technology);3)识别人类基因组序列变异(Identify human genome sequence variation);4)功能基因组学技术(Functional genomics technology);5)比较基因组学(Comparative genomics);6)伦理、法律、社会问题(ELSI: ethical, legal, and social issues);7)生物信息学和系统生物学(Bioinformatics and computational biology);8)Training and manpower。
4 什么是宏基因组(metagenomics)?研究一类在特殊的或极端的环境下共栖生长微生物的混合基因。
生境中全部微小生物遗传物质的总和。
它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因,目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。
生物信息-名词解释
![生物信息-名词解释](https://img.taocdn.com/s3/m/052ff8acd1f34693daef3ec2.png)
逐个克隆法:对连续克隆系中排定的BAC克隆逐个进行亚克隆测序并进行组装(公共领域测序计划)。
全基因组鸟枪法:在一定作图信息基础上,绕过大片段连续克隆系的构建而直接将基因组分解成小片段随机测序,利用超级计算机进行组装。
单核苷酸多态性(SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。
遗传图谱又称连锁图谱,它是以具有遗传多态性(在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因,在群体中的出现频率皆高于1%)的遗传标记为“路标”,以遗传学距离(在减数分裂事件中两个位点之间进行交换、重组的百分率,1%的重组率称为1cM)为图距的基因组图。
遗传图谱的建立为基因识别和完成基因定位创造了条件。
物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。
绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传信息及其在每条染色体上的相对位置线性而系统地排列出来。
转录图谱是在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。
比较基因组学:全基因组核苷酸序列的整体比较的研究。
特点是在整个基因组的层次上比较基因组的大小及基因数目、位置、顺序、特定基因的缺失等。
环境基因组学:研究基因多态性与环境之间的关系,建立环境反应基因多态性的目录,确定引起人类疾病的环境因素的科学。
宏基因组是特定环境全部生物遗传物质总和,决定生物群体生命现象。
转录组即一个活细胞所能转录出来的所有mRNA。
研究转录组的一个重要方法就是利用DNA芯片技术检测有机体基因组中基因的表达。
而研究生物细胞中转录组的发生和变化规律的科学就称为转录组学。
蛋白质组学:研究不同时相细胞内蛋白质的变化,揭示正常和疾病状态下,蛋白质表达的规律,从而研究疾病发生机理并发现新药。
蛋白组:基因组表达的全部蛋白质,是一个动态的概念,指的是某种细胞或组织中,基因组表达的所有蛋白质。
代谢组是指是指某个时间点上一个细胞所有代谢物的集合,尤其指在不同代谢过程中充当底物和产物的小分子物质,如脂质,糖,氨基酸等,可以揭示取样时该细胞的生理状态。
系统与进化生物学名词解释完整版
![系统与进化生物学名词解释完整版](https://img.taocdn.com/s3/m/ab0972582e3f5727a5e96256.png)
第一章:绪论进化生物学Evolutionary Biology:是研究生物进化的科学,不仅研究进化的过程,更重要的是研究进化的原因、机制、速率和方向。
(研究生物进化的科学,包括进化的过程、证据、原因、规律、演说以及生物工程进化与地球的关系等。
)系统学Taxonomy:is the science of defining groups of biological organisms on the basis of shared characteristics and giving names to those groups.根据生物体显现出的的基本特征定义并确定其群体名称的学科。
系统生物学Systematic Biology:研究生物系统组成成分的构成与相互关系的结构、动态与发生,以系统论和实验、计算方法整合研究为特征的生物学。
系统与进化生物学Systematic and Evolutionary Biology:分类Classification:provide a convenient method of identification and communication.为生物的辨识与交流提供更便捷方法的学科。
系统发育Phylogeny:the evolutionary relationships among a group of species,provide a classification which as far as possible expresses the natural relationships of organism.研究种群之间进化的联系,尽可能地为解读生物体之间的自然关系提供一种分类方式的科学。
进化Evolution:detect evolution at work,discovering its processes and interpreting its results.(PPT)进化指食物由低级的、简单的形式向高级的、复杂的形式转变过程。
2.1-2.2 遗传作图
![2.1-2.2 遗传作图](https://img.taocdn.com/s3/m/29144415f78a6529657d5308.png)
一旦得到了基因组的图谱,测序阶段可以采用以下方法 进行: 1. 全基因组鸟枪法(whole-genome shotgun method) 全基因组鸟枪法是一种快速获得真核基因组的方法。 2. 克隆重叠群法(clone contig method):(作图法 测序,限制测序)。 这种逐步测序的方法花时间多,但精确。
共显性: (两 个亲本的性 状在一个个 体中同时出 现,没有显 隐关系)
问题:
1. 克隆可表现基因组DNA多态性的探针较为困难
2. DNA需要量大,实验操作较繁锁,检测周期长 成本费用也很高。 3. RFLP分子标记分布密度过于稀疏。 现已逐步被其他类型分子标记所取代。
RFLP是最早发现的分子标记,也被称为第一代分
SNP只涉及单个碱基的变异,这种变异可以由 单个碱基的转换(包括C与T互换,G与A互 换),或颠换(包括C与A、G与T、C与G、A 与T互换)引起。
根据SNP在基因中的位置,SNP可分为:
基因编码区SNP(coding SNP, cSNP)
基因周边SNP(peripheral SNP, pSNP)
length polymorphisms, RFLP)
2. 简单序列长度多态性(simple sequence length
polymorphisms, SSLP)
3. 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,
SNP)
DNA标记具有的优势:
在数量上是巨大的;
大多数SNP位于 非编码序列,不 影响基因功能。 有些SNP位置靠 近特定的基因, 可作为基因的标 志。 其它的SNP位于 编码序列内,可 改变基因表达的 蛋白质,从而影 响人类健康。
《遗传学图谱》课件
![《遗传学图谱》课件](https://img.taocdn.com/s3/m/b225ee684a73f242336c1eb91a37f111f1850dc8.png)
随意交配、自交和杂交
探索随意交配、自交和杂交的作用以及它们在遗传学研究中的应用。
孟德尔的遗传学定律
学习奥地利生物学家格雷戈尔·约翰·孟德尔的遗传学实验和三大基本遗传定律。
遗传变异和基因突变
探索基因变异和基因突变的类型、原因以及对个体和种群的影响。
选择和遗传漂变
了解选择和遗传漂变如何塑造种群的遗传构成,并对进化产生重要影响。
遗传学研究中的实验设计
了解进行遗传学研究时常用的实验设计和方法,以及它们的优缺点。
遗传学模型和统计学方法
介绍遗传学研究中常用的模型和统计学方法,以帮助这是《遗传学图谱》的PPT课件,将为您介绍遗传学的基本概念和应用。让我 们开始探索这个激动人心而又充满潜力的科学领域吧!
遗传学图谱概述
本节将简要介绍遗传学的概念和研究对象,以及遗传学在科学领域中的重要 性。
遗传定位和遗传映射
了解如何通过遗传定位和遗传映射技术来寻找和确定基因在染色体上的位置。
遗传图的名词解释
![遗传图的名词解释](https://img.taocdn.com/s3/m/b01356e10129bd64783e0912a216147916117e55.png)
遗传图的名词解释遗传图,也称遗传关系图或家族图,是一种用来展示家族成员之间遗传关系的视觉图表。
遗传图通常采用符号、线条和文字等元素来描述个体之间的遗传关系,并通过分析家族疾病遗传方式,对家族成员的健康风险进行评估。
下面将详细介绍遗传图的定义、常见符号和使用方法,以便更好地理解和利用这一强大的遗传学工具。
一、遗传图的定义遗传图是一种专门用于描述个体之间遗传关系的视觉工具。
它可以帮助我们更好地理解家族中的疾病遗传方式,识别携带遗传疾病基因的成员,预测子代患病的风险,并为家庭医生和遗传学家提供更准确的诊断和治疗建议。
遗传图通常由一系列符号和线条组成,每个符号和线条都有特定的含义,可以表示不同的遗传信息。
二、常见符号解释1. 圆圈(♀)表示一个女性,方框(♂)表示一个男性,用于代表家族中的成员。
若个体患有特定遗传疾病,通常在符号内部加入斜线或添加特殊标记。
2. 直线用于连接代表家族成员的符号,表示他们之间的亲缘关系。
垂直线表示父子或母子关系,水平线表示兄弟姐妹关系。
3. 箭头表示信息传递的方向,从上至下表示信息的传递从父辈到子辈。
4. 暗色填充或符号上方的星号(*)表示患有特定遗传疾病或携带相关基因突变。
亮色填充则表示已进行基因检测且结果为阴性。
5. 斜线表示已故的家族成员,用来表示已经过世的人。
三、遗传图的使用方法1. 收集家族信息:首先,收集家族成员的基本信息,包括姓名、性别、出生日期、死亡日期(若已故)、相关遗传疾病的诊断日期和遗传检测结果等。
2. 绘制遗传图:根据收集到的家族信息,使用符合约定的符号和线条,将家族成员在图表上进行绘制。
确保每个个体之间的遗传关系清晰可见。
对于患有遗传疾病的个体,标记相关符号以表示其患病状态。
3. 分析遗传关系:通过观察遗传图,根据不同遗传疾病的传递方式,进行分析和推断。
判断是否存在遗传疾病在家族中的传递趋势。
这有助于确定家族成员的遗传风险以及是否需要进行进一步的遗传咨询和检测。
物理图谱与遗传图谱知识总结(doc8)
![物理图谱与遗传图谱知识总结(doc8)](https://img.taocdn.com/s3/m/22135068cf84b9d528ea7a2a.png)
遗传图谱通过遗传重组所得到的基因在具体染色体上线性排列图称为遗传连锁图。
它是通过计算连锁的遗传标志之间的重组频率,确定他们的相对距离,一般用厘摩(cM,即每次减数分裂的重组频率为1%)来表示。
绘制遗传连锁图的方法有很多,但是在DNA多态性技术未开发时,鉴定的连锁图很少,随着DNA多态性的开发,使得可利用的遗传标志数目迅速扩增。
早期使用的多态性标志有RFLP(限制性酶切片段长度多态性)、RAPD(随机引物扩增多态性DNA)、AFLP(扩增片段长度多态性);80年代后出现的有STR(短串联重复序列,又称微卫星)DNA遗传多态性分析和90年代发展的SNP(单个核苷酸的多态性)分析。
物理图谱物理图谱是利用限制性内切酶将染色体切成片段,再根据重叠序列确定片段间连接顺序,以及遗传标志之间物理距离[碱基对(bp)或千碱基(kb)或兆碱基(Mb)]的图谱。
以人类基因组物理图谱为例,它包括两层含义,一是获得分布于整个基因组30 000个序列标志位点(STS,其定义是染色体定位明确且可用PCR扩增的单拷贝序列)。
将获得的目的基因的cDNA克隆,进行测序,确定两端的cDNA序列,约200bp,设计合成引物,并分别利用cDNA和基因组DNA作模板扩增;比较并纯化特异带;利用STS 制备放射性探针与基因组进行原位杂交,使每隔100kb就有一个标志;二是在此基础上构建覆盖每条染色体的大片段:首先是构建数百kb的YAC(酵母人工染色体),对YAC进行作图,得到重叠的YAC连续克隆系,被称为低精度物理作图,然后在几十个kb的DNA片段水平上进行,将YAC随机切割后装入粘粒的作图称为高精度物理作图.因限制性内切酶在DNA链上的切口是以特异序列为基础的,核苷酸序列不同的DNA,经酶切后就会产生不同长度的DNA片段,由此而构成独特的酶切图谱。
因此,DNA物理图谱是DNA分子结构的特征之一。
DNA是很大的分子,由限制酶产生的用于测序反应的DNA片段只是其中的极小部分,这些片段在DNA链中所处的位置关系是应该首先解决的问题,故DNA物理图谱是顺序测定的基础,也可理解为指导DNA测序的蓝图。
遗传标记基因图谱解析
![遗传标记基因图谱解析](https://img.taocdn.com/s3/m/32d89a0758fb770bf78a55bc.png)
鼠或仓鼠的体细胞进行杂交产生杂种细胞。杂种细胞含有
双亲不同的染色体,但会在其繁殖过程中,保留啮齿类一 方的染色体而逐渐丢失人类的染色体,最后只剩一条或几 条。这种仅保留少数甚至一条人染色体的杂种细胞正是进 行基因连锁分析和基因定位的有用材料
个体表型性状组合类型 ① ② ③ ④ ⑤ ⑥ ec + + + sc cv ec sc + + + cv + sc + ec + cv 个体数量 810 828 62 88 89 103
根据这些数据和重组频率公式可计算出每两个基因之间的互换值:
62 88 ec — sc互换值= 100% 7.6% (810 828 89 103) (62 88)
( 5 )对标记基因型数据进行连锁分析, 构建标记连锁图
设计大量的已知连锁基因个体的杂交试 验; 获得的 F1 再同纯隐性个体测交计算重组 频率;
以重组频率的 1% 作为 1 个摩尔根单位 (即1cM)将基因定位在一条直线上。
杂交:♀ec++/ec++ × ♂+sccv/Y ↓ ♀ec++/+sccv ♂ec++/Y 测交:♀ec++/+sccv×♂ecsccv/Y ↓
例如我们根据试验得出如下结果:
人的 标记 基因 人的 染色 体
α β γ ε 1 2 3
A + — + + — + —
B — + — + + — —
遗传-简答题
![遗传-简答题](https://img.taocdn.com/s3/m/7c5a90c97f1922791688e857.png)
1.动物遗传学的意义是什么?答:动物遗传学是动物科学的一个重要分支。
遗传学是研究能够自我繁殖的核酸的性质、功能和意义的科学。
动物遗传学是研究动物遗传物质、遗传规律和遗传变异机理的科学。
动物遗传学是动物育种学最主要的理论基础。
2.动物遗传学的主要研究内容是什么?答:动物遗传学研究内容包括动物遗传的基本原理、遗传的物质基础、遗传的基本规律、质量性状和数量性状的遗传、群体遗传学、数量遗传学基础及分子遗传学基础及在动物中的应用等。
3、动物遗传学与畜禽育种的关系。
答:动物育种首先可以充分利用动物遗传资源,发挥优良品种基因库的作用,提高动物产品产量和质量。
另一方面,以长远的观点,通过合理开发利用品种资源,达到对现有品种资源和以前未利用的动物资源保护的目的。
通过育种工作,扩大优秀种畜使用面,使良种覆盖率提高,进而使群体不断得到遗传上的改良。
通过育种工作,培育杂交配套系,“优化”杂交组合,达到充分利用杂种优势生产商品动物,使工厂化动物生产提高效率,增加经济效益,减少污染,保护生态的目的。
4.从配子发生和受精过程说明减数分裂在遗传学上的意义。
答:减数分裂时核内染色体严格按照一定规律变化,最后分裂成四个子细胞,各具半数的染色体(n),这样经过受精结合,再恢复成全数染色体(2n)。
这就保证了子代和亲代间染色体数目的恒定,为后代的性状发育和性状遗传提供了物质基础;同时保证了物种的相对稳定性。
而且由于同源染色体在中期I排列在赤道面上,然后分向两极,各对染色体中两个成员向两极移动是随机的,这样不同对染色体的组合是自由的。
同时,在前期I的粗线期,同源染色体之间可以发生片段的互换,为生物变异提供了物质基础,有利于生物的适应与进化,并为人工选择提供了丰富的材料。
5、请简要说明细胞在机能方面的共同特点:答:(1)细胞能够利用能量和转变能量。
(2)细胞具有生物合成的能力。
(3)细胞还具有自我复制和分裂繁殖的能力。
6、一个典型的染色体包括哪些部分?答:(1)着丝点:在染色体上有一个缢缩而染色较浅的部分称为主缢痕,这是纺缍丝附着的地方,又称着丝点。
基因组图谱
![基因组图谱](https://img.taocdn.com/s3/m/f8852d2e482fb4daa58d4be9.png)
三 点 测 验
P 凹陷、非糯性、有色 × 饱满、糯性、无色 shsh++++ ↓ ++wxwxcc F1 饱满、非糯性、有色 × 凹陷、糯性、无色 +sh+wx+c ↓ shshwxwxcc +wxc 2708 }亲 型 sh++ 2538 ++ c 626 }单交换 shwx+ 601 sh+ c 113 }单交换 + wx+ 116 +++ 4 }双交换 shwxc 2
(2)测定交换值;
(3)绘制连锁遗传图。
植物遗传图谱的构建
选择研究材料(亲本) 构建分离群体 遗传标记检测 标记间的连锁分析
选择亲本
要求亲缘关系远,遗传差异大
但又不能相差太大以导致引起子代不育 对备选材料进行多态 ( 差异 ) 性检测,综 合测定结果,选择有一定量多态性的一对 或几对材料作为遗传作图亲本
再用F1与三隐性基因纯合体测交,通过对测交后代
表现型及其数目的分析,分别计算三个连锁基因之间
的交换值,从而确定这三个基因在同一染色体上的顺
序和距离。通过一次三点测验可以同时确定三个连锁
基因的位置,即相当于进行三次两点测验,而且能在
试验中检测到所发生的双交换。
三点测验
仍以玉米C/c、Sh/sh、Wx/wx三对基因连锁分析为例, 在描述时用“+”代表各基因对应的显性基因。
易位,或多倍体材料存在单体或部分染色
体缺失等问题,其后代就不宜用来构建连
锁图谱。
组合的配制
组合配制过程中最关键的一条是应尽
量保证所用群体起源于同一F1个体,大多 数作物的繁殖系数都较高。如果一定用若 干个F1时,应将不同F1及其所衍生的后代 分开保存。
基因组学 2.遗传作图 3 物理图 (2)
![基因组学 2.遗传作图 3 物理图 (2)](https://img.taocdn.com/s3/m/47927ec46c175f0e7cd137f0.png)
转录本图谱:序列图谱。
精品课件
基本概念
比较基因组学:
精品课件
基因组学
最早1986年,由美国霍普金斯大学著名 人类遗传学家和内科教授McKusick (1921-2008)提出来的
随着人类基因组计划的实施,基因组学逐 渐成为一门以结构基因组学为主的高度综 合和跨学科的科学
功能基因组学、比较基因组学、环境基因 组学、药物基因组学等都纷纷出台。
精品课件
•蛋白质-蛋白质功能研究。
精品课件
基因组学的分类
分类:
结构基因组学(Structural Genomics) 比较基因组学(Comparative Genomics) 功能基因组学(Functional Genomics) 药物基因组学(Medical Genomics) 营养基因组学(Nutritional Genomics) 生物信息学(Bioinformatics) 蛋白质组学(Proteomics)
精品课件
重叠群法:contig,指相互间存在重叠顺序的 一组克隆。根据重叠顺序的相对位置将各个克 隆首尾连接,覆盖的物理长度可达百万级碱基 对。在单个的重叠群中,采用鸟枪法测序,然 后在重叠群内进行组装。由上至下。
直接鸟枪法:首先进行全基因组鸟枪法测序, 再以基因组图的分子标记为起点,将鸟枪法 DNA片段进行组装。根据高密度的基因组图分 子标记,检测组装片段是否处在正确的位置, 校正因重复顺序的干扰产生的序列误排。由下 至上
在基因组图谱和测序基础之上,对已知的基因和基 因组结构进行比较,了解基因的功能、表达机理和 物种的进化的学科。
遗传学图谱
![遗传学图谱](https://img.taocdn.com/s3/m/559d6f9dfd0a79563c1e7280.png)
基因组学
杭州师范大学生命与环境科学学院 向太和
基因组测序的策略---
由上至下(左)和由下至上的测序(右)
克隆重叠群指 导的测序
重叠群(contig): 指相互间存在重叠顺序的一组克隆。
基因组学
杭州师范大学生命与环境科学学院 向太和
Clone-by-clone测序
基因组学
杭州师范大学生命与环境科学学院 向太和
PRINCETON, N.J. -- Princeton University has named David Botstein, a renowned geneticist, educator and pioneer of the Human Genome Project, as the new director of the Lewis-Sigler Institute for Integrative Genomics. Botstein will succeed Shirley M. Tilghman, who was the founding director of the institute and became president of the University in 2001, and James Broach, who is interim director. Botstein's appointment will begin July 1, 2003.
§2 遗传学图谱
§2.2 遗传作图的标记
同工酶标记和DNA标记都是 分子标记。但目前分子标记一 般指DNA标记。
基因组学
杭州师范大学生命与环境科学学院 向太和
§2 遗传学图谱
§2.2 遗传作图的标记
2.2.3 DNA标记
基因组学考试 名词解释
![基因组学考试 名词解释](https://img.taocdn.com/s3/m/cbf05251caaedd3383c4d3af.png)
武汉大学李阳生老师基因组学考试名词解释名词解释1.基因= 由不同的DNA片段共同组成的一个完整的表达单元,有一个特定的表达产物,表达产物可以是RNA分子,亦可为多肽分子。
2.遗传图谱=以遗传距离表示基因组内基因座位相对位置的图谱。
3.遗传作图= 采用遗传学分析方法将基因或其他DNA顺序标定在染色体上构建连锁图。
4.DNA标记= 一段DNA顺序,具有2个或多个不同的可以区分的版本,即等位形式。
AFLP、STS、RALP、RFLP、SSR、SNP等。
5.重组热点= 染色体的某些位点之间比其他位点之间由更高的交换频率,被称为重组热点。
6.共分离= 在有性繁殖的后代,这种基因附近有一个紧密连锁的分子标记与连锁的基因有最大的可能同时出现在同一个体中,这一现象被称为共分离。
7.物理图谱= 指表示DNA序列上DNA标记之间实际距离的图。
8.物理作图= 采用分子生物学技术直接将DNA分子标记、基因或克隆标定在基因组实际位置。
9.重叠群= 相互重叠的DNA片段组成的物理图称为重叠群。
10.稀有切点限制酶=指该酶识别的碱基顺序在基因组中只有很少数量,可产生较大的DNA片段。
11.DNA指纹= 小卫星DNA具有高度的可变性,不同个体,彼此不同。
但“小卫星DNA”中有一段序列则在所有个体中都一样,称为“核心序列”。
如果把核心序列串联起来作为探针,与不同个体的DNA进行分子杂交,就会呈现出各自特有的杂交图谱,它们与人的指纹一样,具有转移性和特征性,因人而异,因此被称作“DNA指纹”(DNA fingerprint)。
12.染色体步移=从第一个重组克隆插入片段的一端分离出一个片段作为探针从文库中筛选第二个重组克隆,该克隆插入片段含有与探针重叠顺序和染色体的其他顺序。
从第二个重组克隆的插入片段再分离出末端小片段筛选第三个重组克隆,如此重复,得到一个相邻的片段,等于在染色体上移了一步,故称之为染色体步移(Chromosome Walking)染色体步移技术(genome walking)是一种重要的分子生物学研究技术,使用这种技术可以有效获取与已知序列相邻的未知序列。
基因组学考试名词解释
![基因组学考试名词解释](https://img.taocdn.com/s3/m/f8929a7d001ca300a6c30c22590102020740f2e7.png)
武汉大学李阳生老师基因组学考试名词解释名词解释1.基因=由不同的DN A片段共同组成的一个完整的表达单元,有一个特定的表达产物,表达产物可以是RNA分子,亦可为多肽分子。
2.遗传图谱=以遗传距离表示基因组内基因座位相对位置的图谱。
3.遗传作图=采用遗传学分析方法将基因或其他D N A顺序标定在染色体上构建连锁图。
4.DNA标记=一段DNA顺序,具有2个或多个不同的可以区分的版本,即等位形式。
A FLP、STS、RALP、RFLP、SSR、SNP等。
5.重组热点=染色体的某些位点之间比其他位点之间由更高的交换频率,被称为重组热点。
6.共分离=在有性繁殖的后代,这种基因附近有一个紧密连锁的分子标记与连锁的基因有最大的可能同时出现在同一个体中,这一现象被称为共分离。
7.物理图谱=指表示DNA序列上DN A标记之间实际距离的图。
8.物理作图=采用分子生物学技术直接将DNA分子标记、基因或克隆标定在基因组实际位置。
9.重叠群=相互重叠的D NA片段组成的物理图称为重叠群。
10.稀有切点限制酶=指该酶识别的碱基顺序在基因组中只有很少数量,可产生较大的DNA片段。
11.DNA指纹=小卫星DNA具有高度的可变性,不同个体,彼此不同。
但“小卫星DNA”中有一段序列则在所有个体中都一样,称为“核心序列”。
如果把核心序列串联起来作为探针,与不同个体的DNA进行分子杂交,就会呈现出各自特有的杂交图谱,它们与人的指纹一样,具有转移性和特征性,因人而异,因此被称作“DNA指纹”(DNA finger print)。
12.染色体步移=从第一个重组克隆插入片段的一端分离出一个片段作为探针从文库中筛选第二个重组克隆,该克隆插入片段含有与探针重叠顺序和染色体的其他顺序。
基因组学遗传作图物理图
![基因组学遗传作图物理图](https://img.taocdn.com/s3/m/8b2b4a5e844769eae109ed4e.png)
2.2.2 DNA(分子)标记
? 限制性片段长度多态性(restriction fragment length
polymorphisms,RF)LP
? 简单序列长度多态性(simple sequenece length
polymorphisrns,SSLPs) ? 小卫星序列:(Minisatellite DN)A ? 微卫星序列:(Microsatellite DNA, )MS
? 功能蛋白质组 (Functional Proteome) :在特定时 间、特定环境和实验条件下基因组活跃表达的蛋白 质。功能蛋白质组是总蛋白质组的一部分。蛋白质 组和功能蛋白质组是生命科学的新的研究内容。
中英联合实验室
基因组计划
? 模式微生物基因组计划 ? 模式植物基因组计划 ? 模式动物基因组计划 ? 人类基因组计划
中英联合实验室
什么是基因组?
一个物种中所有基因的整体组成。 人类基因组的两层意义:遗传信息和 遗传物质。 揭开生命的奥秘,需要从整体水平研 究基因的存在、基因的结构与功能、 基因之间的相互关系。
中英联合实验室
基因组研究内容
?基因表达研究,即比较不同组 织和不同发育阶段、正常状态与 疾病状态,以及体外培养的细胞 中基因表达模式的差异。 ?基因产物 -蛋白质功能研究,包 括单个基因的蛋白质体外表达方 法。
中英联合实验室
2.2.2 DNA(分子)标记
? 基因标记:有用、有效,并非理想。
? 高等生物,可用作标记的基因十分有限 ? 许多性状都涉及多基因。 ? 高等生物基因组中存在大量的基因间隔区,用基因
标记将在遗传图中留下大片的 无标记区段。 ? 并非所有等位基因可以通过常规实验予以区分,因
遗传图谱
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遗传图谱遗传图谱英文名称:genetic map 它的定义为:由遗传重组测验结果推算出来的、在一条染色体上可以发生的突变座位的直线排列(基因位点的排列)图。
其主要应用学科:禾本科作物遗传育种,水产学(一级学科),水产生物育种学(二级学科)等领域。
遗传图谱是由某一物种的染色体图谱(也就是我们所知的连锁图谱),显示所知的基因和或遗传标记的相对位置,而不是在每条染色体上特殊的物理位置。
如果同一条染色体上的两个基因相对距离越长,那么他们减数分裂发生重组的概率将越大,共同遗传的概率也就越小。
因此可以根据他们后代性状的分离可以判断他们的交换率,也就可以判断他们在遗传图谱上的相对距离。
通过遗传重组所得到的基因在具体染色体上线性排列图称为遗传连锁图。
是指基因或DNA标志在染色体上的相对位置与遗传距离,后者通常以基因或DNA片段在染色体交换过程中的分离频率厘摩(来表示。
遗传图的绘制是人类基因组研究的第一步,即以染色体上某一点为遗传标记,以与之相伴遗传的特征为对象,经连锁分析,将编码该特征的基因定位于染色体特定位置。
厘摩值越大,两者之间距离越远。
通过遗传图分析,我们可以大致了解各个基因或DNA片段之间的相对距离与方向,了解哪个基因更靠近着丝粒,哪个更靠近端粒等。
遗传距离是通过遗传连锁分析获得的,研究中所使用的DNA 标记越多,越密集,所得到的遗传连锁图的分辨率就越高。
绘制遗传连锁图的方法有很多,但是在DNA多态性技术未开发时,鉴定的连锁图很少,随着DNA多态性的开发,使得可利用的遗传标志数目迅速扩增。
早期使用的多态性标志有RFLP(限制性酶切片段长度多态性)、RAPD(随机引物扩增多态性DNA)、AFLP(扩增片段长度多态性);80年代后出现的有STR(短串联重复序列,又称卫星)DNA遗传多态性分析和90年代发展的SNP(单个核苷酸的多态性)分析。
遗传图谱被广泛的应用于禾本科作物的遗传育种,例如用分子标记小麦染色体定位遗传图谱,用于分析禾本科作物遗传育种作物,也可以用于进行禾本科作物和杂交禾本科作物常规育种程序,直至获得可以商品化的新型粮食作物,当然遗传图谱也可以对很多的遗传病进行分析,分析其发病概率的大小。
2016年专升本动植物遗传学答案解析
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2016年专升本动植物遗传学答案解析一、填空1.在动物细胞的细胞器中,含有遗传物质的细胞器是()。
2.根据着丝点位置的不同,染色体可分为()、()、()和()四种类型。
3.基因的相互作用包括()、()、()和()。
4.在性别控制中,精子分离法包括()、()、()、()、()和激光细胞分离器法。
5.证明核酸是遗传物质的实验有()、()、()。
6.DNA二级结构的类型主要有()、()、()、()和()。
7.断裂基因由()和()间隔组成。
8.根据对遗传信息的改变,基因突变可分为()、()()和()。
9.影响群体基因频率的因素有()、()()和()。
10.解释杂种优势产生的学说有()和()。
11. 染色体要确保在细胞世代中的复制和遗传,起码应具备三种功能元件,一个是(),确保染色体在细胞周期中能够自我复制;二是(),使细胞分裂时完成复制的染色体能平均分配到子细胞中;三是(),以保持染色体的独立性和稳定性。
12. 转录时只有一条链为模板,其中将作为模板的DNA单链称为(),而另一条不作为模板的DNA单链称为()。
13. 染色体结构畸变可分为四种类型,分别为缺失、()、()和易位。
14. 在人类中,大约12个男人中有一个色盲患者(色盲是由于性连锁隐性基因引起的)。
则女人中色盲患者的概率为()。
15.数量性状的表型值是由基因型值和环境值共同作用的结果,其中基因型值又可剖分为()、()和(),用公式表示为()。
16.大肠杆菌DNA复制时,DNA的解链需要几种酶和蛋白质的参与,它们分别为()酶、()酶和SSB蛋白质。
17.选择包括()选择和()选择。
18.核酸是一种高分子化合物,是由许多()聚合而成的多核苷酸链,基本结构单元是核苷酸。
核苷酸由核糖、碱基和磷酸组成,核糖的5位上连接着(),3位上是(),1位上是()。
19.真核生物的结构基因是断裂基因,由()和()组成。
每个内含子的5’端起始的两个核苷酸都是(),3’端末尾的两个核苷酸是(),这是()的信号。
动物遗传学试题(B答案)
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甘肃农业大学成人高等教育(函授)动物科学专业《动物遗传学》课程试卷B 答案名词解释1.核型:把动物、植物、真菌等的某一个或谋一份类群的体细胞中的全部染色体按照他们的相对恒定性特征排列起来的图像。
2.遗传多样性:在广义上是指种内或种间表现在分子、细胞核、个体三个水平的遗传变异程度,狭义上则主要指种内不同群体和个体间的遗传变异程度。
3.剂量效应:某一基因对表型的作用效果随基因数目的增多而呈累加的增长或减少。
4.DNA 复性:当温度减低后,变性的DNA 分子有重新恢复双螺旋结构的过程5.GT-AG 法则:真核生物的基因在每个外显子和内含子的接头区,有一段高度保守的共有序列,即每个内含子的5’端起始的两个核苷酸都是GT ,3’端末尾的两个核苷酸都是AG ,这种RNA 剪接信号的形式称为GT-AG 法则。
6.复等位基因:在一个群体中,同源染色体上同一位点有两个或两个以上的等位基因。
7.基因家族:真核生物基因组中,有许多来源相同、结构相似、功能相关一组基因称为一个基因家族。
8.基因:是有功能的DNA 片段,它含有合成有功能的蛋白质多肽链或RNA 所必需的全部核苷酸序列。
9.基因组印记:是指基因组在传递遗传信息的过程中,对基因或DNA 片段打下标识、烙印的过程。
10.重组率又称交换率,是指重组型配子数占总配子数的百分率:重组率=重组型配子/总配子数=重组型个体数/(重组型个体数+亲本型个体数)×100%。
11.基因定位:就是把已发现的某一突变基因用各种不同方法确定在该生物体某一染色体的一定位置上。
二、选择题1.在DNA 复制过程中,保护单链模板免遭侵害的物质是(D )A.引发酶B.DNA 连接酶C.DNA 聚合酶D.单链结合蛋白2.公鸡的性染色体构型是(C ) A.XY B.XX C.ZZ D.ZW3.下列群体中,处于哈代-温伯格平衡的是(B )A.50AA,2Aa,48aaB.49AA,42Aa,9aaC.100AA,10aD.50AA,50aa4.数量性状的表型值可以剖分为(B )A.基因型值、环境效应和加型效应B.加性效应和剩余值C.加性效应、显性效应和上位效应D.加性效应和环境效应5.在有丝分裂过程中,最适合进行染色体形态和数目考察的时期是(B )A.前期 B.中期 C.后期 D.末期6.在原核生物DNA 复制过程中,负责引物合成的酶是(A ) A.引发酶 B.SSB C.螺旋酶 D.旋转酶7.DNA 复制中RNA 引物的主要作用是(A )A.引导合成冈崎片段B.作为合成冈崎片段的模板C.为DNA 合成原料dNTP 提供附着点D.激活DNA 聚合酶8.下列关于单链结合蛋白的描述哪个是错误的(D )A.与单链DNA 结合防止碱基重新配对B.保护复制中的单链DNA 不被核酸酶降解C.与单链DNA 结合,降低双链DNA Tm 值 D.以上都不对9.紫外线对DNA 的损伤主要是(B )A.引起碱基置换B.形成嘧啶二聚体C.导致碱基缺失D.发生碱基插入10.有关转录的错误描述是(A )A.只有在DNA 存在时,RNA 聚合酶方可催化RNAB.需要NTP 作原料C.RNA 链的延伸方向是3’→5’ D.RNA 的碱基需要与DNA 互补11.下列属于染色体结构变异的是(A ) A.重复 B.基因突变 C.单倍体 D.嵌合体12.鸡的性染色体构型是(B ) A.XY B.ZW C.XO D.ZO13.RNA 与DNA 生物合成相同的是(BDE )A.需RNA 引物B.以3'→5’方向DNA 为模板C.两条模板链同时合成D.新链生成的方向5’→3’E.形成3’,5’-磷酸二酯键三、填空题1.在动物细胞的细胞器中,含有遗传物质的细胞器是(线粒体)2.断裂基因由(外显子)和(内含子)间隔组成。
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DNA 上的物理位置,图距是物理长度单位,如染色体的带区、核苷酸对的数量等。
两者异同: ① 遗传图谱是基于重组频率,物理图谱是基于直接测量的 DNA 结构。 ② 减数分裂重组的频率并不统一沿大多数染色体。有一些热点和冷点在重组和/或突 变。热点和冷点会导致相当大的格律失真时,遗传图谱和物理地图并排排列时。 ③ 遗传图谱表示的是基因或标记间的相对距离,以重组值表示,单位 CM ④ 物理图谱表示的是基因或标记间的物理距离,距离的单位为长度单位,如 μm 或 者碱基对数(bp 或 kp)等。
对应关系:基因组是指一种微生物(包括细菌和病毒)或其它生物体细胞中的总 DNA 或 RNA(是指逆转录病毒),包括核 DNA,细胞器 DNA(动植物线粒体 DNA 和植物叶绿体 DNA)和染色体外遗传成分(如细菌的质粒 DNA)。 转录组即一个活细胞所能转录出来的所 有 mRNA。研究转录组的一个重要方法就是利用 DNA 芯片技术检测有机体基因组中基因 的表达。从基因组 DNA 转录的基因总和,即转录组,也称味表达谱,是研究细胞表型和 功能的一个重要手段。 在生物系统中,基因组是遗传信息的储存体,mRNA(转录组)是基因 表达的中间体,功能性蛋白质(蛋白质组)是基因功能的执行体。
1.基因组研究中的意义何 在?
答:遗传图谱:某一物种的染色体图谱(也就是我们所知的连锁图谱),显示所知的基因和 /或遗传标记的相对位置,而不是在每条染色体上特殊的物理位置。采用遗传学分析方法将 基因或其它 DNA 标记按一定的顺序排列在染色体上,这一方法包括杂交实验,家系分析。 标记间的距离(遗传图距)用减数分裂中的交换频率来表示,单位为厘摩(Centi-Morgan, cM), 每单位厘摩定义为 1%交换率。遗传学图谱的解像度(分辨率)低,大约只能达到 100 万碱基对(1Mb)的水平。
差异: ① 基因组是一个十分稳定的体系,同一种系不同个体之间的染色体数目是相同的,各染
色体上有相同数量的基因和基因分布,也有基本相同的核苷酸顺序,即基因组是一个 相对静态的概念,一个有机体从它的发生、发展到衰老、死亡,不同细胞、组织和器 官的基因组是基本稳定不变的。 ② 转录组和基因组水平不同,转录组是高度动态的,当细胞受到侵犯时,甚至当细胞处
对全部高中资料试卷电气设备,在安装过程中以及安装结束后进行高中资料试卷调整试验;通电检查所有设备高中资料电试力卷保相护互装作置用调与试相技互术关,系电通,力1根保过据护管生高线0产中不工资仅艺料可高试以中卷解资配决料置吊试技顶卷术层要是配求指置,机不对组规电在范气进高设行中备继资进电料行保试空护卷载高问与中题带资22负料,荷试而下卷且高总可中体保资配障料置23试时23卷,各调需类控要管试在路验最习;大题对限到设度位备内。进来在行确管调保路整机敷使组设其高过在中程正资1常料中工试,况卷要下安加与全强过,看2度并55工且22作尽2下可护1都能关可地于以缩管正小路常故高工障中作高资;中料对资试于料卷继试连电卷接保破管护坏口进范处行围理整,高核或中对者资定对料值某试,些卷审异弯核常扁与高度校中固对资定图料盒纸试位,卷置编工.写况保复进护杂行层设自防备动腐与处跨装理接置,地高尤线中其弯资要曲料避半试免径卷错标调误高试高等方中,案资要,料求编5试技写、卷术重电保交要气护底设设装。备备4置管高调、动线中试电作敷资高气,设料中课并3技试资件且、术卷料拒管中试试调绝路包验卷试动敷含方技作设线案术,技槽以来术、及避管系免架统不等启必多动要项方高方案中式;资,对料为整试解套卷决启突高动然中过停语程机文中。电高因气中此课资,件料电中试力管卷高壁电中薄气资、设料接备试口进卷不行保严调护等试装问工置题作调,并试合且技理进术利行,用过要管关求线运电敷行力设高保技中护术资装。料置线试做缆卷到敷技准设术确原指灵则导活:。。在对对分于于线调差盒试动处过保,程护当中装不高置同中高电资中压料资回试料路卷试交技卷叉术调时问试,题技应,术采作是用为指金调发属试电隔人机板员一进,变行需压隔要器开在组处事在理前发;掌生同握内一图部线纸故槽资障内料时,、,强设需电备要回制进路造行须厂外同家部时出电切具源断高高习中中题资资电料料源试试,卷卷线试切缆验除敷报从设告而完与采毕相用,关高要技中进术资行资料检料试查,卷和并主检且要测了保处解护理现装。场置设。备高中资料试卷布置情况与有关高中资料试卷电气系统接线等情况,然后根据规范与规程规定,制定设备调试高中资料试卷方案。
意义:通过遗传图谱,我们可以大致了解各个基因或 DNA 片断之间的相对距离与方向,如 哪个基因更靠近着丝粒,那个更靠近端粒等。遗传图谱不仅是现阶段定位基因的重要手段, 即使在人类基因组全物理图谱建立起来之后,它依然是研究人类基因组遗传与变异的重要 手段。
2. 基因组和转录组有什么对应关系?两者的差异何在? 答:
对全部高中资料试卷电气设备,在安装过程中以及安装结束后进行高中资料试卷调整试验;通电检查所有设备高中资料电试力卷保相护互装作置用调与试相技互术关,系电通,力1根保过据护管生高线0产中不工资仅艺料可高试以中卷解资配决料置吊试技顶卷术层要是配求指置,机不对组规电在范气进高设行中备继资进电料行保试空护卷载高问与中题带资22负料,荷试而下卷且高总可中体保资配障料置23试时23卷,各调需类控要管试在路验最习;大题对限到设度位备内。进来在行确管调保路整机敷使组设其高过在中程正资1常料中工试,况卷要下安加与全强过,看2度并55工且22作尽2下可护1都能关可地于以缩管正小路常故高工障中作高资;中料对资试于料卷继试连电卷接保破管护坏口进范处行围理整,高核或中对者资定对料值某试,些卷审异弯核常扁与高度校中固对资定图料盒纸试位,卷置编工.写况保复进护杂行层设自防备动腐与处跨装理接置,地高尤线中其弯资要曲料避半试免径卷错标调误高试高等方中,案资要,料求编5试技写、卷术重电保交要气护底设设装。备备4置管高调、动线中试电作敷资高气,设料中课并3技试资件且、术卷料拒管中试试调绝路包验卷试动敷含方技作设线案术,技槽以来术、及避管系免架统不等启必多动要项方高方案中式;资,对料为整试解套卷决启突高动然中过停语程机文中。电高因气中此课资,件料电中试力管卷高壁电中薄气资、设料接备试口进卷不行保严调护等试装问工置题作调,并试合且技理进术利行,用过要管关求线运电敷行力设高保技中护术资装。料置线试做缆卷到敷技准设术确原指灵则导活:。。在对对分于于线调差盒试动处过保,程护当中装不高置同中高电资中压料资回试料路卷试交技卷叉术调时问试,题技应,术采作是用为指金调发属试电隔人机板员一进,变行需压隔要器开在组处事在理前发;掌生同握内一图部线纸故槽资障内料时,、,强设需电备要回制进路造行须厂外同家部时出电切具源断高高习中中题资资电料料源试试,卷卷线试切缆验除敷报从设告而完与采毕相用,关高要技中进术资行资料检料试查,卷和并主检且要测了保处解护理现装。场置设。备高中资料试卷布置情况与有关高中资料试卷电气系统接线等情况,然后根据规范与规程规定,制定设备调试高中资料试卷方案。