免疫组化定量分析-永诺生物-3
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
在count/size窗口中点select color,就调出了这个segmentation工具.
点Histogram Based,还要选HIS.
在弹出的警告上点“是”。
H:0-30,S:0-255,I:0-230
设置好的选色条件也要保存的。
测量光密度时,要测量灰度图片
彩色图象上象点的强度是由红蓝绿三色混合而成,如果直接在彩色图上测量光密度,会有一个系统误差。所以正规的测量需要把图象中选取的区域外部分涂白,然后转换图象为灰度图片,再测量光密度。
选择Transparent on White,只显示选择到的区域。再点create preview image复制出一张。
将复制的图片转换成灰度图片。
对此图片再作一次选色,这次只需选择一个强度了。I:0-230
还要保存一次灰度选色设置。
3.2.2.4 好啦,点count进行测量。
看看测量统计数据。
可以把数据存入excel表格里。
3.2.2.5别急,还没完事呢。
以上测量的是选择区域内的累积光密度值IOD,但同时测量的面积却未必是正确的面积。
测量数据表里的area是图片上选择的染色区域的面积,这不一定就是我们需要的面积。
我们最终要得到的数据应该是一个平均光密度值,是IOD/area。IOD就是前面测量的IOD SUM.但面积是什么则需要认真选择的。
在需要测量整张照片染色的时候,面积就是照片面积。
如果切片只拍摄了一部分,空白处的面积则需扣除。
很多情况下,是要测量某一组织区域内的光密度。
可以使用irregular AOI工具来选择测量区域。
选择一个区域后,点New AOI再选择下一个区域。最后按下图点就行了。
点了convert to object后马上就能看到测量数据。注意这里只有area值有意义。
3.2.3免疫组化照片测量结果的统计分析
一张免疫组化照片一般能得到一个IOD或density值。 一张组织切片一般应选择几个视野,拍摄数张照片。
这样就有了几个IOD或density值。
一个实验对象要作数个组织切片。
一组实验数据应包括数个实验切片。这个实验组就有了上百张照片,它们的IOD或density值就构成了这个实验组的测量数据。可以用来进行统计分析。计算平均值与标准差,并与其他实验组进行t-检验等统计处理。
可见在进行免疫组化照片的数字化分析时,一般是要拍摄很多张照片的。