生物化学简明教程讲义 电子稿

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第一章蛋白质化学(12学时)

【基本要求】:

1.掌握蛋白质的基本单位-氨基酸的种类、结构特征及其主要的理化性质。

2.掌握蛋白质的一二三四级结构以及稳定其结构的重要作用力。

3.掌握蛋白质的重要性质(两性解离、变性、沉淀、紫外吸收、颜色反应)。

【内容提要与学时分配】

1.蛋白质的生物学功能(1) 2.蛋白质的元素组成与分子组成(2)

3.蛋白质的分子结构(4) 4.蛋白质结构与功能的关系(2)

5.蛋白质的理化性质(2)6.蛋白质的分类与分离纯化简介(1)

第一节蛋白质通论

一、蛋白质的生物学意义(160)

蛋白质是生命的体现者——恩格斯语。Protein —“第一重要的”,“最原初的”。

概括起来,蛋白质主要有以下功能:

1.催化功能(Enzyme)

2.调节功能

3. 运动功能

4. 运输和跨膜转运功能

5. 保护和防御功能

6. 信息传递与识别功能

7. 贮存功能

8. 结构功能

二、蛋白质的分类(158)

(一)按分子形状分类 1.球状蛋白 2.纤维状蛋白

(二)按分子组成分类

简单蛋白:清蛋白、球蛋白、组蛋白、精蛋白、谷蛋白、醇溶蛋白和硬蛋白。

缀合蛋白:核蛋白、脂蛋白、糖蛋白、磷蛋白、血红素蛋白、黄素蛋白和金属蛋白。

三、蛋白质的元素组成与分子量(157)

1.元素组成

蛋白质平均含碳50%,氢7%,氧23%,氮16%。其中氮的含量较为恒定,而且在糖和脂类中不含氮,所以常通过测量样品中氮的含量来测定蛋白质含量。

如常用的凯氏定氮法:蛋白质含量=蛋白氮×6.25(即100/16)。

2.蛋白质的分子量蛋白质的分子量变化范围很大,从6000到100万或更大。

四、蛋白质的水解(123)

蛋白质的水解主要有三种方法:

1.酸水解

2.碱水解

3.酶水解

第二节氨基酸( amino acid)

一、氨基酸的结构与分类(124)

(一)基本氨基酸

组成蛋白质的20种氨基酸称为基本氨基酸,或称为常见氨基酸、蛋白质氨基酸。

基本氨基酸都符合通式,都有单字母和三字母缩写符号。

一般结构特征:

I.它们中除脯氨酸外都是α-氨基酸,即在α-碳原子上有一个氨基。

II.不同的氨基酸,其R侧链不同,对氨基酸的理化性质和在结构中的影响也不同。

III.天然氨基酸都是L-构型的,即羧基在上,氨基在左端。若氨基在右为D-构型(与标准甘油醛的构型参照得出的)。A.按照氨基酸侧链的极性分类(127):

非极性氨基酸:Ala, Val, Leu, Ile, Met, Phe, Trp, Pro共八种

极性不带电荷:Gly, Ser, Thr, Cys, Asn, Gln, Tyr共七种

带正电荷:Arg, Lys, His

带负电荷:Asp, Glu

B.按照氨基酸侧链的化学结构,分为三类:脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸和杂环氨基酸。

1.脂肪族氨基酸共15种。

侧链只是烃链:Gly, Ala, Val, Leu, Ile。侧链含有羟基:Ser, Thr

侧链含硫原子:Cys, Met 侧链含有羧基:Asp(D), Glu(E)

侧链含酰胺基:Asn(N), Gln(Q)侧链显碱性:Arg(R), Lys(K)

2.芳香族氨基酸包括苯丙氨酸(Phe,F)、色氨酸(Trp,W)和酪氨酸(Tyr,Y)三种。

3.杂环氨基酸包括组氨酸(His)和脯氨酸(Pro)种。

(B是指Asx,即Asp或Asn; Z是指Glx,即Glu或Gln。)

C.照酸碱性分类:

酸性氨基酸:Asp, Glu

碱性氨基酸:Arg, Lys, His

中性氨基酸:15种

还有两种新发现的氨基酸: 硒代半胱氨酸(Sci 2002.5.24)吡咯赖氨酸

小结:2酸—3碱—3芳香—2含S—2含OH—2酰胺

甘Gly(最特殊,唯一无旋光性)、丙Ala(顾名思义)//苯丙Phe(顾名思义)、

酪Tyr(有β-苯酚基)、色Trp(β-吲哚基P66)// 甲硫Met(γ-甲硫基)、

半胱Cys(β-巯基)、丝Ser(β-羟基)、苏Thr(β-羟基)// 天冬Asp(酸性氨基酸,β-羧基)、天冬酰氨Asn(β-酰氨)、谷Glu(酸性氨基酸,γ-羧基)、谷氨酰氨Gln(γ-酰氨)// 精Arg(δ-胍基P66)、赖Lys(ε-氨基)、组His(β-咪唑基P66)//缬Val、亮Leu、异亮Ile:都是烷烃链// 脯Pro(亚氨基)。

(二)不常见的蛋白质氨基酸(128)

某些蛋白质中含有一些不常见的氨基酸,它们是基本氨基酸在蛋白质合成以后经羟化、羧化、甲基化等修饰衍生而来的。也叫稀有氨基酸或特殊氨基酸。

如4-羟脯氨酸、5-羟赖氨酸、锁链素等。其中羟脯氨酸和羟赖氨酸在胶原和弹性蛋白中含量较多。在甲状腺素中还有3,5-二碘酪氨酸。凝血酶原种含有γ-羧基谷氨酸。

(三)非蛋白质氨基酸(129)

自然界中还有150多种不参与构成蛋白质的氨基酸,它们大多是基本氨基酸的衍生物,也有一些是D-氨基酸或β、γ、δ-氨基酸,多数以游离态存在。这些氨基酸中有些是重要的代谢物前体或中间产物,如瓜氨酸和鸟氨酸是合成精氨酸的中间产物,β-丙氨酸是遍多酸(泛酸,辅酶A前体)的前体,γ-氨基丁酸是传递神经冲动的化学介质。荧光素含有D-半胱氨酸,青霉素中D-赖氨酸。

二、氨基酸的性质

(一)物理性质

1、水溶性α-氨基酸都是白色晶体,每种氨基酸都有特殊的结晶形状,可以用来鉴别各种氨基酸。一般都溶于水,不溶于有机溶剂。(除胱氨酸和酪氨酸外,都能溶于水中;脯氨酸和羟脯氨酸能溶于乙醇或乙醚中)

2、旋光性除甘氨酸外,α-氨基酸都有旋光性,α-碳原子具有手性。苏氨酸和异亮氨酸有两个手性碳原子。

3、光谱性质(143) 三个带苯环的氨基酸有紫外吸收,F:257nm,; Y:275nm,; W:280nm。通常蛋白质的紫外吸收主要是后

两个氨基酸决定的,一般在280nm,可以定量测定蛋白质.

(二)酸碱性质(129)

氨基酸分子中既含有氨基又含有羧基,所以氨基酸是两性电解质(ampholyte)。

在水溶液和结晶态中都以偶极离子的形式存在。

氨基酸在溶液中的解离方向和解离的程度取决于溶液的PH值。

当氨基酸分子所带的净电荷为零时的pH称为氨基酸的等电点(pI)。

等电点的值是它在等电点前后的两个pK’值的算术平均值。

pI=(pK1 +pK2)/2

注意:pI时净电荷为零,但不是不带电荷;此时其溶解度最小,最容易沉淀析出。

pH>pI时,氨基酸带负电荷,-COOH解离成-COO-,向正极移动。

pH=pI时,氨基酸净电荷为零,溶解度最小

pH

(三)化学性质(135)

1.氨基的反应

(1)与亚硝酸作用

氨基酸在室温下与亚硝酸反应,脱氨,生成羟基羧酸和氮气。常用于蛋白质的化学修饰、水解程度测定及氨基酸的定量。

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