凝胶成像及QuantityOne使用说明
凝胶成像仪操作说明
伯乐凝胶成像仪操作指南1、翻开仪器电源开关〔在该仪器的左后侧〕2、翻开电脑开关3、根据所需要分析的凝胶的性质，选择适宜的滤光片：a.分析中需要用紫外光时〔如核酸类物质的紫外观测分析〕，将滤光片拨至CCD镜头前。
b.分析中不需要用紫外光时〔如蛋白质类物质的分析〕，将没有滤光片的一档拨至CCD镜头前，或拨至空挡。
4、根据所需要分析的凝胶的性质，选择适宜的凝胶放置方式：a、采用紫外光分析模式时，直接将所需观测的凝胶直接放在观测台上〔小心移至观测台上，注意不要产生气泡，以免影响观测〕。
b、采用透射白光观测模式时，需将白光板放至紫外观测板上，再将凝胶放在白光板上。
5、双击电脑桌面“Quantity One〞软件的快捷方式翻开软件，弹出界面〔未注册软件点击“run〞进入界面或点击“basic〞进入basic模式〕。
单击“File〞，在下拉菜单中选择“Gel Doc〞栏，弹出仪器的图像采集界面。
6、将观测板小心拉出，小心放入凝胶，注意板与胶之间不要产生气泡；如有气泡产生，那么需赶去气泡，以免影响检测结果。
选择仪器右侧的光源模式，分别为：trans UV ：透射紫外光；epi WHITE：侧面〔反射〕白光PREP UV：紫外光准备〔低光照紫外〕；trans WHITE：透射白光；备注：假设用户采用的是白光转换板，需用白光源透射时，仍采用trans UV栏。
7、按照图像采集界面的步骤〔STEP Ⅰ— STEPⅪ〕，a、STEP Ⅰ：单击“live/Focus〞模式，调节“IRIS〞、“ZOOM〞和“FOCUS〞等“↑〞“↓〞调节图像，直到适合自己的要求。
b、STEP Ⅱ：选择光照模式〔UV或White〕。
c、STEP Ⅲ：获取图像，采用自动或手动模式获取图像。
d、STEP Ⅳ：图像优化设置，通过调节按纽，获取最正确图像。
e、STEP Ⅴ：分析。
分析获取的图像或保存后再分析。
f、STEP Ⅵ：保存图像。
将获取的图像保存在电脑硬盘中，作为备案或稍后分析。
凝胶成像系统简易操作说明
凝胶成像系统简易操作说明
∙打开机箱背后下边电源开关，触屏进入初始化界面，点击界面中“”键，界面进入操作界面。
∙①是用来调节工作台的光强，调节范围是：75%—100%。
②是时间设定键，用来设定运行时间的。
注：点击此键从弹出的子菜单中进行运行时间设置，系统工作时间到达此设定值时系统将自动关闭所有的灯管和CAMERA。
③界面中的键是仪器已运行的时间。
④是工作模式选择键，依次点击可以出现四种工作模式（也可按屏幕右边
的F1-F4来选择）。
⑤是复位（Reset）、恢复键。
⑥是运行键。
界面第三排为各个灯和相机的开关和相应状态的指示灯。
其中“light”为上侧单色白光灯（顶灯），“254nm”为波长254纳米的侧灯紫外灯管。
“312nm/white” 为波长312纳米的紫外工作台或白光工作台。
“365nm” 为波长365纳米的侧灯紫外灯管。
“camera”为相机。
“ON”为打开键，OFF为关闭键。
3）四种模式分别为：
①点时，仪器锁定透射台（312nm紫外工作台或白光工作台）和相机camera
两个灯处于工作状态；
②点时，仪器锁定254nm 、365nm两个侧灯和相机camera处于工作状态；
③点时，仪器锁定light灯处于工作状态；
④点时，仪器处于用户自选模式。
用户可以通过用手按住ON或OFF来控制
各个灯或CAMERA的开关。
凝胶成相仪中文教程
Quantity One Demo Script01 Getting Started1. (26 seconds) (Q1.gettingstarted.01.wav)教程开始啦. Quantity One 有一菜单栏和主工具栏。
主工具栏包括：标准文件操作命令，主浏览工具，以及打开次级工具栏和快捷指南的图标。
如果将鼠标指向任一图标，会出现一个浮出式的命令名，相应的在主工具栏中会显示该命令的简短介绍。
Getting Started. Quantity One has a graphical user interface with a menu bar and a main toolbar. The main toolbar is divided into standard file commands, the main viewing tools, and buttons that open the secondary toolbars and quick guides. If you hold your cursor over any button, the name of the command will appear as a popup tooltip, and a short description of the command will be displayed in the status box on the main toolbar.2. (26) (Q1.gettingstarted.02.wav)Quantity One次级菜单包括数组相关的命令。
例如，图象工具栏包括修剪工具，图像旋转工具，过滤指南，数据反转命令等。
揿工具栏中右下脚按钮，可改变它的水平或垂直的分布方式。
对新用户而言，可以采用扩展窗口形式查看命令。
The secondary toolbars in Quantity One contain groups of related commands. For example, the image toolbar contains the crop tool, image rotating tools, Filter Wizard, and Invert Data command. The toolbars can be reconfigured vertically or horizontally by clicking on the reformat button in the lower right corner. The toolbars can be also be displayed in expanded format for new users.3. (25) (Q1.gettingstarted.03.wav)扩展窗口在每一图标边显示该命令的名称，并有一问号图标可打开相应的在线帮助。
quantityone的使用说明
GEL EQ凝胶成像使用指南1. 打开主机电源与计算机电源.2. 点击凝胶成像软件,进入QUANTITY ONE操作界面.3. 在FILE菜单中,选择GEL EQ菜单,进入图像采集界面4. 点击LIVE/FOCUS菜单,采集图像.(根据被扫胶的要求, 在凝胶成像主机面板上选择UV/WHITE紫外光/白光.(如需使用透射白光,则把白光台电源打开,把白光台放在底板上,把胶放在白光台上.5. 调节光圈大小,点击IRIS下OPEN/CLOSE;调节聚焦,点击FOCUSE下NEAR/FAR按钮;调节远近即大小,点击ZOOM下相应按钮,直到满意为止.6. 爆光时间一般选择自动AUTO EXPOSE即可.7. 若图像上有高亮红点,说明爆光过度,则须缩小光圈.8. 图像调好后,点击SAVE键保存.若需保存为其他格式,则在FILE菜单下选择导出,保存为JPEG/TIFF格式文件.9. 关于分析处理见Quantity One应用讲义Quantity One应用讲义本讲义介绍Quantity One的两个重要分析功能:定量分析和分子量确定。
Quick Quantity One软件Help Guide快捷指南提示如何实现一个功能,如定量分析(Volumes Quick Guide,电泳条带分析(Band Analysis,差显分析(Differential Display Analysis,克隆计数(Colony Counting Analysis等。
快捷指南下有1,2,3…步骤,根据提示完成。
一.定量分析功能快捷指南Volumes Quick Guide,此功能能对任意所选区域进行定量分析,此分析可以报告2个结果:相对浓度和绝对浓度(如有浓度标准样品1.选择成像系统或打开已保存的文件(软件可以控制Bio-Rad所有的成像系统如GelDoc,ChemiDoc,VersaDoc,GS-800,FX,如不是Bio-Rad成像系统所摄取的图象,将图象保存为Tiff文件格式,软件也可进行分析处理2. Zoom Box,缩放,对图象进行放大观察3. Transform转化,调节图象的对比度黑白4. Volume Rect Tool 矩形区域选择,如U15. Volume Free hand Tool自由画笔选择区域,可以勾勒出无规则形状,如U26. Volumn Contour Tool等高线勾勒区域,自动连接浓度浓度相同的点,如U3上面3种方法选择需要定量的区域。
凝胶成像仪(使用方法)
凝胶成像系统
操作规程：
1. 打开成像仪器电源，将样品放入工作台。
2. 双击桌面上图标，打开Quantity One 软件，或从开始-程序-The Discovery Series/Quantity One进入。
3. 从File下拉菜单中选择ChemiDox XRS，打开图像采集窗口。
4. Select Application 选择相关应用：
a UV Transillumination 透射UV：针对DNA EB胶或其他荧光；
b White Transillumination 透射白光：针对透光样品如蛋白凝胶，X-光片；
c White Epillumination 侧面白光：针对不透光样品或蛋白凝胶；
d Chemiluminescnec
e 化学发光，不打开任何光源。
5. 单击Live/Focus按钮，激活实时调节功能，此功能有三个上下键按钮：IRIS（光圈），ZOOM （缩放），FOCUS（聚焦），可在软件上直接调节或在仪器面板上手工调节，调节步骤：a调节IRIS 至适合大小；b点ZOOM将胶适当放大；c调节FOCUS至图像最清晰。
6. 如是DNA EB胶或其他荧光，单击Auto Expose，系统将自动选择曝光时间成像，如不满意，单击Manual Expose，并输入曝光时间（秒），图像满意后保存。
如是蛋白凝胶，接第5步骤直接将清晰的图像保存即可；如是化学发光样品，将滤光片位置换到Chemi位（仪器上方右侧），将光圈开到最大，输入Manual Expose时间，可对化学发光的弱信号进行长时间累积如30min，或单击Live Acquire 进行多帧图像实时采集，在对话框内定义曝光时间长短，采集几帧图像，在采集的多帧图像中选取满意的保存。
ImageLab凝胶成像系统操作手册
时，点击
按钮舍弃其它不适合的图像来完成获取图像的程序。也可在 SAM 获取图
像的过程中或之后来保存需要的所有图像，直接点选右键单点缩图窗口内的图像即可进行存
盘保留下来。在决定获取图像的数量时，记住增加 SAM 图像会导致背景信号的平均。当较
多的图像被获得时，在背景强度水平附近的弱的信号将会变得难以识别。如果辨别最弱的信
或 Ctrl+C 复制/Ctrl+V 粘贴）。
在Band上点击左键两下可将样品定义为标准品、未知样品或背景空白。
（1）Volume Background Subtraction - Local（Local background subtraction）通过我们所圈选的unknown volume 和 standard
(2) 选择成像曝光（Image Exposure）方法，可以人为评估曝光时间并以手动设定（Manual Exposure），或是使用信号累积模式（Signal Accumulation Mode，SAM）来进行操作。
在建立一个化学发光的程序时最难的任务就是图像曝光的确定，因为您想获得一个充分 利用了相机大的动态范围的图像。过短的图像曝光时间可能使高于膜背景的微弱信号不能被 识别；过长的图像曝光时间能够使得某些条带饱和（也就是说，超出了相机准确报告信号的 能力）。如果这是您第一次用 ChemiDoc XRS+分析化学发光样品，您需要在使用手控或信 号累积模式（SAM）之前决定一个合适的成像时间框架。获得这个信息的最好的方式是取 得一个相对短的手工曝光并利用 Image Lab 里的工具估计最适的曝光时间。
二、使用 Image Lab 软件进行化学发光图像获取流程
1. 建立图像获取程序：
在 凝 胶 成 像 （ Gel Imaging ） 对 话 框 中 选 择 Chemi （ 化 学 发 光 ） 应 用 程 序
BIO－RAD凝胶电泳成像系统的操作方法
BIO－RAD凝胶电泳成像系统的操作方法BIO－RAD凝胶电泳成像系统的操作方法
1.接通电源和照相机电源
2.打开开关，预热30分钟
3.打开软件，文件菜单中gel-doc.xr
4.按live/focus,30s后按autoexpose or manualexpose
5.调iris,zoom ,focus调节图像清晰度，之后按freeze拍照，保存。
BIO-RAD 凝胶成像系统Universal Hood Ⅱ
仪器性能：
拍摄对象：核酸琼脂糖凝胶电泳
X光胶片
软件功能：获取并处理图像
测定图像光密度
操作步骤：
1. 开启成像系统，电脑电源
2. 打开Quality One软件，调整光源所示图像
3. 观察并调整曝光时间，获得图像并保存
4. 调整图像，并对图像进行光密度分析
5. 关闭所有电源。
Quantity One说明
功能强大的操作、分析软件“Quantity One”简介“Quantity One”是Bio-Rad公司图像系列产品的操作和分析软件。
主要用来定量和分析荧光、化学发光、放射性同位素、化学染色物标记的各种单向电泳、杂交点和条带、TCL 板、酶标板、培养皿的克隆斑等。
“Quantity One”能在Windows 98、Windows 95、Windows NT 4.0、Macintosh 9500（或更高）环境下运行。
窗口设计有下拉式菜单、图像工具栏、菜单操作提示栏等，界面设计十分友好、非常简单易学。
“Quantity One”的图像文件以Tiff文本格式输出，可以方便的进入其它的图像处理软件进行更深一步的图像处理和编辑。
同时，分析数据可以直接转入到Micro Excel,以报告形式排版、打印。
每套“Quantity One”软件都有相对应的进入密码(Unique Password)和软件狗(Hardware Protection keys)，并附有详尽的软件操作说明书。
1.“Quantity One”的运行程序打开操作界面输入操作指令，进行图像采集图像初步优化图像处理各种功能分析文字注解和打印格式2.“Quantity One”的主要功能和优势2.1“Quantity One”的图像采集功能步骤一：自动选择仪器的配置根据您的标记信号类型，“Quantity One”能自动选择激光波长和滤波片，使整个光路调整到适当的工作状态。
步骤二：选择扫描范围GelDoc2000提供的最大扫描面积为25cm×26cm，您可以根据样品放置的位置和大小，任意选择所需的扫描范围。
步骤三：扫描、采集图像GelDoc2000的扫描、采集图像和计算机成像同步进行，您可以随时从屏幕上观察到扫描的结果。
2.2“Quantity One”的分析功能及优势1．“Quantity One”的图像优化处理工具栏“Quantity One”的图像处理功能主要移植于Photoshop “Quantity One”可以进行背景噪音过滤，梯度背景扣除，背景灰度调节，图像的放大和缩小，图像旋转，图像修饰等图像优化和处理工作。
BIO-RAD凝胶成像仪简明操作程序
BIO-RAD凝胶成像仪简明操作程序
BIO-RAD凝胶成像仪简明操作程序
一、打开电源（仪器左侧靠后）。
二、将胶放在台面上，点亮Tran UV键。
三、双击电脑桌面上Quantity One图标，启动成像软件，按Fil e→
Gel Doc的流程进入成像界面
四、成像和保存。
调节以下功能键使图像清晰：
Iris：调节光圈（亮度）
Zoom：放大和缩小图像
Focus：聚焦使图像清晰
Auto expose/Manual expose：自动/手动曝光
分析软件还可以进行分子量计算，相对定量等工作，具体操作详见说明书
成像完毕后，Save 保存文件在“常规用户”各自的文件夹下，如需要拷贝文件，则选择Fil e→Export将文件转换后再拷贝，否则文件拷贝后将无法打开
五、关闭电源、清洁台面
注意：
●每次使用要登记，使用完毕后应关闭电源并清洁台面。
●严禁将图像存在桌面上，一经发现，立即删除
●严禁在本仪器计算机上做与成像和分析无关的事情
●未经允许，不得带本实验室以外的人员使用本仪器。
quantity_one_软件使用说明
quantity one 软件使用说明
quantity one软件，对于熟悉分子生物学实验技术凝胶成像操作的各位大侠一定都不陌生，可是这个软件功能非常全面，对于每一个功能不知大家是不是一样的熟悉，我目前正在使用它的一项功能，稍稍了解了一点，希望能讲给大家，不到之处，还请各位指点！
我想向大家介绍band analysis功能：
1. 首先打开*.lsc或*.tif等格式的图像文件
2. 用image tool工具中的crop功能选取分析的条带区域
3.用transform功能改变图像的背景
4. 选frame lanes功能，确定分析区域，一条带对应于选择的数字为1
5. 用stretch lanes及add/adjust anchors进行区域的调整，点击每个框架四周的4个小圆圈待光标有变化时，即可拖动调节区域的范围
6. 用lane background substraction功能进行本底剪影
7. 用detect band 功能进行条带的标记，可以通过调节敏感度来使标记的条带认为受到控制，利于对一些结果准确和客观的判读，band 工具栏中有编辑，去除及调整band的工具进行band 的修改
8. 用standards功能，选择合适的standards
9. band attributes 功能了解band 信息描述
10. all lanes report给出关于每一条band的分析结果，可以保存为*. txt文件，常选的指标有峰值，域值，相对量等，条带分析即可完成。
PCR仪 凝胶成像仪使用说明
ABI Veriti 梯度PCR仪使用说明(简版)操作步骤：1、打开PCR仪的热盖，放入0.2ml的样品管（热盖平稳），盖好热盖。
2、打开PCR仪的电源，仪器程序开始初始化，需等待几分钟（此步可提前）。
3、初始化完成后，显示主菜单。
4、点“Browse/New Methods”，进入PCR程序列表：5、可以直接点一个PCR程序，选择“Start Run”运行；点右边的“文件夹”符号，可以选择不同的文件夹。
如要新建一个PCR程序，点“New”，出现PCR程序。
6、添加一段程序：点上方的“Stage”，该位置变红；再点“Add”，软件将加入一段新的程序。
7、修改循环数、温度、时间：点中循环次数、温度或时间位置，下方出现数字键。
依次点数字键，出现合适数字后，点“Done”确定。
8、增加一个步骤：点“Step”位置，该位置变红；再点“Add”，软件将加入一个新的步骤。
9、删除一个步骤：点“Step”位置，在点“Delete”，软件将该步骤删除。
8、建立梯度模式：点中一个步骤，再点“Option”键，出现选项。
点“VeriFlex step”，出现梯度创建窗口：输入6个梯度温度，温度下方的“1－2”是指对应的1、2两行加热孔，全部输好后，点“Done”确定。
注意：相邻的两个梯度温度之差最大不能超过5℃！11、建立渐变模式(如需要请参考使用说明详版)。
12、增加暂停步骤(如需要请参考使用说明详版)。
13、编辑PCR程序完成后，点“Save”保存。
14、回到PCR程序列表界面，选择新建的PCR程序。
15、点“Start Run”，设置参数（反应体积和热盖温度），点“Start Run Now”运行PCR程序。
16、仪器运行选中的PCR程序，显示运行监视窗口。
17、暂停运行：点“Pause Run”，仪器暂停，出现暂停选项栏。
18、终止运行：点“Stop”可以终止整个PCR程序。
19、反应报告：PCR程序结束后，仪器会自动生成反应报告，显示当次反应的各项指数。
凝胶成像及Quantity-One中文操作说明
凝胶成像及Quantity-One中文操作说明第一章简介凝胶电泳是每个做分子生物学的研究者天天都要打交道的基本技术。
电泳之后的信息处理与电泳本身同样重要。
目前有大量软件可以用于分析电泳结果，要向大家介绍的是Bio-Rad公司的1D凝胶分析软件Quantity One（Bio-Rad还有一个做2D凝胶分析的软件PDQuest）。
Quantity One软件是常用1D凝胶分析软件中功能最强大，自动化程度最高的软件。
这个软件的最新版本可以在Bio-Rad的网（）免费下载，以供试用或用户升级之用。
Quantity One软件的主要功能包括定量分析(Volumes Quick Guide)，电泳条带分析(Band Analysis)，差显分析(Differential Display Analysis)，克隆计数(Colony Counting Analysis)等，此外，还可以直接控制Bio-Rad公司的各类图像仪和ExQuest自动切胶仪，使您的凝胶分析工作变得极为轻松。
Quantity One软件拥有与windows操作系统下绝大多数应用软件相同的友好界面。
插入密码狗，打开Quantity One软件，可以看到最上缘蓝色横条幅是标题栏，往下依次是菜单栏和工具栏。
File 图像打开、保存、引入、打印等操作Match分子量估算、条带匹配分析Edit 图像普通编辑操作Volumn定量分析View 图像缩放、三维视图、看光密度值等操作Analysis浓度估算、克隆计数等分析每个菜单的主要功能如下：往下一行是工具栏，上面每个按钮的功能见下表：Quantity One 软件Help àQuick Guide 快捷指南提示如何实现一个功能，如定量分析(Volumes Quick Guide)，电泳条带分析(Band Analysis)，差显分析(Differential Display Analysis)，克隆计数(Colony Counting Analysis)等。
凝胶定量软件QuantityOne使用
凝胶定量软件Quantity One使用简介1 内容简介凝胶电泳是每个做分子生物学的同学天天都要打交道的基本技术。
电泳之后的信息处理与电泳本身同样重要。
目前有大量软件可以用于分析电泳结果，比较有名的比如BandScan、BandLeader、Sigma Gel等等。
今天要向大家介绍的是来自Bio-Rad的1D凝胶定量软件Quantity One（Bio-Rad还有一个做2D凝胶分析的软件PDQuest）。
这个软件的最新版本可以在Bio-Rad的主页免费下载。
目前的最新版本是4.52版2 Quantity One的定量方法Quantity One的分析功能顾名思义主要用来进行凝胶或者培养皿的荧光定量分析。
它的分析功能或者说分析方式主要有4种：泳道/条带轨迹定量法；等高线直接定量法；菌落计数；分子量测定这三种方法中使用最为方便也是最为广泛的应该是等高线定量法（V olumn Contour）。
它通过半自动描绘电泳条带的等高线边缘来得到等高线区域内部面积，再将该面积乘以区域内平均光密度值得到条带内部总的信号量。
当然这种分析方法的弊病显而易见：无法同等得排除不同泳道的背景亮度；等高线的绘制处于“半自动”状态，即需要人为判断作为等高线标准的电泳条带的边缘；最致命的是在几个电泳条带距离十分接近的时候几乎无法绘制单一条带的轮廓（常出现连续的几个条带等高线相连而无法分离出单独条带的轮廓）。
三种方法中个人感觉最为科学和严谨的应该是泳道/条带轨迹定量法（Trace Tracking）。
这种方法使用起来步骤较为繁琐，必须通过泳道识别---电泳条带识别两个连续的步骤才能进行定量。
然而这种方式的最大优点在于它可以完全抛弃人为主观因素进行全自动定量。
他的定量方式为：首先根据不同电泳条带的光密度值绘制光密度曲线，然后计算光密度曲线下面积作为电泳条带的定量根据。
大家可能会问他能不能排除泳道背景？答案是肯定的，它能够最大程度的排除不同泳道之间的背景差异，让各个泳道上的不同电泳条带在一条几乎相同的起跑线上进行对比。
Gel Doc XR+操作说明
Bio-Rad Gel Doc XR 凝胶成像系统Gel Doc XR 是一款快速，简单易用，高分辨率的凝胶成像系统。
系统包括了密封暗箱，摄像头，白光和UV 光源，带琥珀型滤片的滤片环，UV 保护档板。
它还包括了从图象采集到分析打印一体的Quantity One 1-D 分析软件，以及无安装数量限制的QuantityOne Basic软件。
其卓越的性能表现在：1.4M 高像素分辨率马达自动控制镜头使在成像过程中无须手工操作3 个数量级的宽线性范围实时图象采集方便快速对图象进行定位和聚焦在线积累功能能对图象进行不同程度的曝光，只需在选择“Freeze”即可保存最满意的图象 Quantity One 快捷指南方便地引导你用最少的步骤完成分析全过程火线接口保证快速数据传输可升级到ChemDoc XRS 化学发光成像系统操作流程：1、打开成像仪电源开关2、打开电脑开关3、用鼠标双击显示器上的Quantity One 图标，进入控制程序4、用鼠标点击File，在出现的下拉菜单中选择Gel Doc，点击进入后出现成像控制画面5、该成像仪有三种成像方式供选择：透射白光（Trans White）、反射白光(Epi White)、和透射紫外(Trans UV)，分别用于聚丙烯酰胺蛋白胶、膜等不透光物品和琼脂糖凝胶的紫外透射成像，在成像前在成像仪的面板上做出选择，按下相应的按钮6、打开成像仪的门，如用白光，则将白光板取下轻放在紫外灯箱的上面，然后铺上保鲜膜。
如用紫外则直接铺上保鲜膜7、将凝胶放在保鲜膜上，尽量放正，铺展保鲜膜8、关闭成像仪的门9、点击电脑屏幕上成像控制面板里的Auto Expose 选项，自动暴光10、点击IRIS 下的箭头调整暴光强度11、点击ZOOM 下的箭头调整取景的范围12、点击FOCUS 下的箭头聚焦13、点击SAVE 在出现的对话框中选择路径保存成像结果。
14、取出凝胶与保险膜一起处理掉15、如想打印，进入Quantity One 软件，点击File 接Print 接Video Print（事先打开打印机电源）16、如想转存为图片格式，打开文件后，点击File 接Export to TIFF Image 接Export 在出现的对话框中选择存储TIFF 文件的路径，输入文件名后点击确定。
quantityone中文使用说明
quantityone中⽂使⽤说明凝胶电泳是每个做分⼦⽣物学的同学天天都要打交道的基本技术。
电泳之后的信息处理与电泳本⾝同样重要。
⽬前有⼤量软件可以⽤于分析电泳结果，⽐较有名的⽐如BandScan、BandLeader、Sigma Gel 等等。
今天要向⼤家介绍的是来⾃Bio-Rad的1D凝胶定量软件Quantity One（Bio-Rad还有⼀个做2D 凝胶分析的软件PDQuest）。
这个软件的最新版本可以在Bio-Rad的主页免费下载。
⽬前的最新版本是4. 52版。
虽然软件并⾮免费，但是值得⾼兴的是该软件提供了30天的全功能试⽤期，⽽且30天以后仍然可以以Basic Mode继续使⽤，关键功能如Lane、Band、Volume Contour功能⼀个不缺，只是⽆法保存和打印结果（其实这没有很⼤关系，⼤家可以⽤HyperSnap等截屏保存分析结果）。
Quantity One的分析功能顾名思义主要⽤来进⾏凝胶或者培养⽫的荧光定量分析。
它的分析功能或者说分析⽅式主要有4种：泳道/条带轨迹定量法；等⾼线直接定量法；菌落计数；分⼦量测定这三种⽅法中使⽤最为⽅便也是最为⼴泛的应该是等⾼线定量法（Volumn Contour）。
它通过半⾃动描绘电泳条带的等⾼线边缘来得到等⾼线区域内部⾯积，再将该⾯积乘以区域内平均光密度值得到条带内部总的信号量。
当然这种分析⽅法的弊病显⽽易见：⽆法同等得排除不同泳道的背景亮度；等⾼线的绘制处于“半⾃动”状态，即需要⼈为判断作为等⾼线标准的电泳条带的边缘；最致命的是在⼏个电泳条带距离⼗分接近的时候⼏乎⽆法绘制单⼀条带的轮廓（常出现连续的⼏个条带等⾼线相连⽽⽆法分离出单独条带的轮廓）。
三种⽅法中个⼈感觉最为科学和严谨的应该是泳道/条带轨迹定量法（Trace Tracking）。
这种⽅法使⽤起来步骤较为繁琐，必须通过泳道识别---电泳条带识别两个连续的步骤才能进⾏定量。
然⽽这种⽅式的最⼤优点在于它可以完全抛弃⼈为主观因素进⾏全⾃动定量。
凝胶成像仪操作规程
凝胶成像仪操作规程
《凝胶成像仪操作规程》
一、凝胶成像仪是一种专门用于电泳凝胶成像的仪器，操作规程如下：
1. 准备样品：将凝胶样品放置在凝胶成像仪的托盘上，并确保凝胶样品完全覆盖。
2. 开启仪器：打开电源开关，调节成像仪的参数，如曝光时间、波长等。
3. 拍摄图像：在参数设置完成后，通过操作仪器上的按钮或者程序，开始拍摄凝胶的图像。
4. 处理图像：将拍摄的图像传输到电脑或其他设备上进行进一步处理和分析。
5. 清洁仪器：拍摄完成后，关闭仪器，清洁托盘和镜头等部件，以确保下次使用时仪器的整洁。
二、凝胶成像仪在操作时需要注意以下几点：
1. 操作人员应该熟悉仪器的使用手册，并按照操作规程进行操作，以免造成不必要的损坏。
2. 在操作时应注意安全，避免发生触电或者碰撞等意外事故。
3. 注意仪器的保养，定期清洁和维护，延长仪器的使用寿命。
4. 在操作过程中，要保持仪器和样品的清洁，避免灰尘和其他杂质进入仪器影响成像效果。
5. 操作人员应保持注意力集中，避免操作失误，影响成像的质量。
通过遵循以上操作规程，能够保证凝胶成像仪的正常使用，提高凝胶成像的效率和质量。
凝胶成像系统使用方法
凝胶成像系统使用方法
1. 首先，将样品放置在凝胶上，并将其放入凝胶槽中。
2. 将凝胶槽放入成像系统中，并确保凝胶表面与成像台底部接触良好。
3. 打开成像软件，并选择适当的成像参数。
这些参数包括激发波长、滤光片、曝光时间等。
4. 调整成像系统的聚焦位置，以确保获得清晰的图像。
5. 开始成像，观察凝胶中的凝胶带或其他目标物的荧光信号。
6. 可根据需要对图像进行处理和分析，例如调整对比度、亮度和图像大小等。
7. 在完成成像后，关闭成像系统并小心取出凝胶槽。
8. 清洗凝胶槽和系统的内部部件，以确保下一次使用时的卫生和正常工作。
凝胶成像系统操作简易说明
凝胶成像系统操作简易说明1.准备凝胶：首先，根据实验需要选择合适的凝胶类型（如聚丙烯酰胺凝胶、琼脂糖凝胶等），并根据目标分子的大小和数量选择适当的浓度和体积。
将凝胶基质（如琼脂糖或聚丙烯酰胺）溶解在缓冲液中并均匀混合。
然后，加热混合液直到溶胶完全溶解，倒入凝胶板或混合至预制凝胶仓中，等待凝胶固化。
2.加载样品：将样品混合物（如DNA片段或蛋白质）与样品缓冲液混合。
使用微量移液器，将样品加载到凝胶井中。
在上好手套的情况下，小心地注入样品，以确保它们均匀分布在凝胶孔中。
3.进行电泳：在凝胶电泳仓中注入电泳缓冲液，确保液面覆盖凝胶完全。
将样品孔两侧分别连接到正极和负极电源。
根据目标分子的大小和电荷，设置合适的电场强度和运行时间。
启动电泳，目标分子将在凝胶中移动。
4.准备成像系统：打开凝胶成像系统，并预热镜头。
根据实验需要，选择正确的滤波器、曝光时间和灯光亮度。
确保在操作前检查系统的光源和过滤器是否正常，以便正确检测样品。
5.拍摄凝胶图像：在电泳结束后，小心地将凝胶转移到凝胶成像系统中。
将凝胶平放在透明玻璃板上，并将玻璃板放置在成像系统的透明窗口下方。
通过系统软件调整凝胶图像至最佳状态，确保样品的清晰可见。
根据需要进行图像剪裁和注释，保存图像以备后续分析。
6.数据分析和解释：使用凝胶图像进行分析，可以测量目标分子的大小，计算相对迁移距离，并与分子量标准相比较。
利用软件工具，在不同样品之间进行荧光密度的定量比较，以获得分析结果。
总结：凝胶成像系统的操作相对简单，但需要谨慎操作，以确保凝胶成像质量。
熟练掌握凝胶成像系统的使用方法，可以帮助研究人员在分子生物学研究中快速、准确地获取数据，并深入了解目标分子的特性和功能。
凝胶成像仪使用方法
凝胶成像仪使用方法凝胶成像仪是一种用于观察和记录凝胶电泳结果的仪器。
它广泛应用于生物医学研究、分子生物学和生物化学实验中。
以下是关于凝胶成像仪的使用方法的详细说明。
一、仪器准备1. 检查凝胶成像仪是否处于正常工作状态，确保所有部件都已连接好。
2. 打开仪器电源并等待凝胶成像仪的启动过程完成。
3. 确保摄像机和转换器已经联接，而且转换器和电脑也已经连接好。
二、凝胶成像条件设置1. 打开图像采集软件，并确保与凝胶成像仪的连接已经建立。
2. 调整摄像机的位置，使其能够对凝胶进行成像。
确保摄像机离凝胶的距离适中，以获得清晰的成像结果。
3. 在软件中选择合适的成像模式，比如亮场或荧光模式。
4. 根据实验需要，设置合适的曝光时间和灵敏度。
较长的曝光时间可以获得更多的细节，但过长的曝光时间可能会导致成像结果过暗或过亮。
5. 调整对比度和亮度，以获得清晰的成像结果。
根据实验需要，可以增加或降低对比度和亮度，以突出或减弱凝胶上的信号。
三、成像操作1. 将凝胶放置在成像台上，并确保凝胶与摄像机的视野完全重叠。
可以使用凝胶对准标记来确保凝胶的位置准确。
2. 调整摄像机的焦距和焦点，以获得清晰的成像结果。
3. 点击软件上的“开始成像”按钮，开始进行成像。
可以选择连续拍摄或单次拍摄，具体视实验需求而定。
4. 在成像过程中，确保凝胶没有发生移动或晃动，以避免成像结果模糊或失真。
5. 成像完成后，保存图像文件，并进行必要的后期处理，如调整亮度、对比度和锐度等。
四、清洁和维护1. 成像结束后，断开凝胶成像仪与电脑的连接，并关闭凝胶成像仪的电源。
2. 清洁摄像机、转换器和镜头等部件，使用适当的清洁剂和柔软的布进行清洁。
避免使用刺激性的化学物质和粗糙的物品，以免损坏仪器。
3. 定期检查凝胶成像仪的各个部件是否正常，如灯泡、滤光片和镜头等。
如有需要，及时更换或维修损坏的部件。
以上是凝胶成像仪的使用方法的详细说明。
凝胶成像仪的使用需要细心和耐心，以保证获得高质量的成像结果。
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GelDoc TM XRThe Discovery Series Quantity One® 1-D Analysis Software使用说明书昆明友宁科技有限公司2008年9月仪器各组成部分介绍I Universal Hood（正面大体）II控制面板镜头及滤光片位控制面板紫外透射平台III 背面开关及保险丝IV 镜头及CCDV Universal Hood 内顶部图像采集Universal Hood 电源开关（ChemiDoc 另有镜头开关）GelDoc 镜头ChemiDoc 镜头滤光片选择杆用成像仪自带的荧光标尺和带刻度的透明塑料板，参照后文GelDoc XR成像的方法，按紫外透射、白光透射以及侧面白光三种模式分别采集一次图像。
要求成像清晰、明暗适中。
凝胶切割将抽屉式紫外透射平台完全拉开至最大，将待切割的样品放置其上。
安装上有机玻璃保护屏，打开“Trans UV”和“Prep UV”。
操作者戴上手套，站在保护屏后进行切胶操作。
注意事项：1．安装ChemiDoc XRS的图像采集卡时，要先安装其驱动程序，再将图像采集卡插入；2．如果软件的密码狗不能被正常识别，请安装带补丁的驱动程序或向Bio-Rad安装工程师求助；3．在给用户安装图像仪和软件前，先提醒用户保存好申请来的密码、软件序列号和密码狗。
4．培训仪器时，提醒用户不要将潮湿的样品长期放在暗箱内，以防腐蚀滤光片，更不要将液体溅到暗箱底板上，以免烧坏主板。
5．提醒用户仪器用完，及时关上电源，特别是ChemiDoc XRS的CCD电源；6．提醒用户勿用控制成像仪的电脑上网，也不要自行重装电脑操作系统或给操作系统升级。
第二部分仪器及Quantity One软件分析操作简介凝胶电泳是每个做分子生物学的研究者天天都要打交道的基本技术。
电泳之后的信息处理与电泳本身同样重要。
目前有大量软件可以用于分析电泳结果，今天要向大家介绍的是Bio-Rad公司的1D凝胶分析软件Quantity One（Bio-Rad还有一个做2D凝胶分析的软件PDQuest）。
Quantity One软件是常用1D凝胶分析软件中功能最强大，自动化程度最高的软件。
这个软件的最新版本可以在Bio-Rad的网站（）免费下载，以供试用或用户升级之用。
Quantity One软件的主要功能包括定量分析(Volumes Quick Guide)，电泳条带分析(Band Analysis)，差显分析(Differential Display Analysis)，克隆计数(Colony Counting Analysis)等，此外，还可以直接控制Bio-Rad公司的各类图像仪和ExQuest自动切胶仪，使您的凝胶分析工作变得极为轻松。
Quantity One软件拥有与windows操作系统下绝大多数应用软件相同的友好界面。
插入密码狗，打开Quantity One软件，可以看到最上缘蓝色横条幅是标题栏，往下依次是菜单栏和工具栏。
每个菜单的主要功能如下：File 图像打开、保存、引入、打印等操作Match 分子量估算、条带匹配分析Edit 图像普通编辑操作Volumn 定量分析View 图像缩放、三维视图、看光密度值等操作Analysis 浓度估算、克隆计数等分析Image 图像旋转、翻转、裁切等操作Reports 分析结果输出Lane 泳道分析Window 窗口分析Band 条带分析Help 帮助、快捷菜单、软件注册等往下一行是工具栏，上面每个按钮的功能见下表：条带分析工具打开文件图像显示控制匹配工具保存操作显示条带轮廓修改工具打印图像去除分析标记打印快捷指南看全图图像工具定量分析快捷指南局部放大文字工具条带分析快捷指南拖曳定量工具克隆计数快捷指南放大并居中灰度分析工具缩小并居中泳道分析工具Quantity One软件Help Quick Guide快捷指南提示如何实现一个功能，如定量分析(Volumes Quick Guide)，电泳条带分析(Band Analysis)，差显分析(Differential Display Analysis)，克隆计数(Colony Counting Analysis)等。
快捷指南下有1，2，3…步骤，根据提示完成。
使用Quantity One软件进行电泳结果分析，通常包括图像获取、图像优化、分析、结果输出四部分，参考下图：图像获取就是通过软件控制扫描仪（GS-800、PharosFX等）或凝胶成像系统（GelDoc、ChemiDoc、VersaDoc等）获取图像的过程。
图像优化就是将扫描或拍照获得的原始图像进行初步处理，以便更好地进行后续分析。
接下来是分析过程，根据分析的方法和目的不同，又可以分为定量分析、条带分析、克隆计数、差异（聚类）分析等等。
不管如何分析，最终我们都必须通过软件的输出功能，得到我们想要的结果。
Quantity One软件提供了多种结果输出方式。
在接下来的几章里，我们将按照这个思路，一步步引导您使用这一软件。
图像获取Quantity One 4.4－4.6版本可以控制Bio-Rad目前几乎所有的图像仪，如GelDoc XR、ChemiDoc XRS 等。
这些图像仪采集到的图像，可以直接保存成软件可直接分析的图像，即扩展名1sc的原始图像文件。
下面将具体介绍如何通过Quantity One软件从GelDoc XR获取图像。
GelDoc XR是Bio-Rad凝胶成像系统中最常用，操作最简便的仪器，它可以用来拍摄EB、SYBR Green等染料染的核酸电泳凝胶；Sypro Ruby、银染、考马斯亮蓝等方法染的蛋白电泳凝胶；以及化学显色的印记膜等。
使用GelDoc XR之前，先接通电源，打开位于仪器背面右下角的电源开关；然后根据具体的应用选择合适的照明和滤光片位置。
原则如下：不管使用何种模式，基本的操作过程都是这样的：1．将样品置于适当的载物平台上2．关闭暗箱门3．调整滤光片4．打开相应光源5．接下来打开Quantity One软件，选择XR，按以下顺序操作：1白光转换屏有自己的电源开关，位于屏下方，打开后不必每次都关闭这个开关。
① 按下Live/Focus ，成像仪进入实时成像；② 选择照明模式，一般荧光样品选择UV,普通透射或反射样品选择White 模式注意：该选项对图像数据格式有影响，但不能代替光源选择。
③ 此功能有三个上下键按钮：IRIS （光圈），ZOOM （缩放），FOCUS （聚焦），您可在软件上直接调节或在仪器面板上手工调节 调节步骤： a 调大IRIS ，以看到图像b 点ZOOM, 将胶适当放大c 调节IRIS 至合适大小（一般情况下尽量选择小光圈，因为小光圈景深大，图像更清晰)d 调节FOCUS ，至图像最清晰 ④ 单击Auto Expose,系统将自动选择曝光时间成像（系统默认0.15%的像素饱和的成像时间为最佳时间，在Options 对话框中可以修改该项设置），如不满意，单击Manual Expose ，并输入曝光时间（秒）① ③ ② ④⑤⑥ ⑦ ⑧⑤图像曝光满意后，按下“Freeze”按钮。
⑥按下“Analyze”按钮，将弹出一个新窗口显示图像，以供分析。
⑦第5步结束后，也可以按下“Save”键，保存图像。
基本图像优化通过图像仪采集的图像，可能会有偏斜、对比度不佳、数据关系错误等问题影响分析。
所以新采集的图像应经过优化后再进行分析。
优化的基本过程是：Rotate（旋转）》Crop（裁剪）》Transform（转化）。
另外，当数据关系错误的时候，需要改变之。
详细步骤见下。
1．旋转（Rotate）在Image》Rotate菜单中选择适当的旋转角度，其中“Custom Rotation”工具可以实现任意角度的旋转，点击后，图像上出现如下图所示的情况：图中出现一个白圈和黄色十字，鼠标靠近黄色箭头，可以任意角度拖动这个箭头。
旁边有个小窗口显示所需要旋转的角度和弧度，点击“Rotate”按钮旋转即可完成，请保存旋转后图像。
2．裁剪（Crop）裁剪的目的是去掉电泳区域以外的部分，仅保留从电泳起点到前缘有泳道的部分。
选择Image》Crop，在图像适当的范围内画一个方框。
鼠标移动到框边变成双向的箭头，可以改变框的大小和形状。
最后鼠标移动到框内，当鼠标变成一剪刀形的时候，单击，选择“拷贝并裁剪”。
3．转化（Transform）优化图像显示，便于肉眼观察。
选择Image》Transform，会弹出右图所示窗口：选择“Auto-scale”，软件会自动调整对比度至最优2。
除此之外，有时还必须检查数据关系是否正确。
即图中黑色部分的数据是否高于白色部分。
正常情况下是的，但有时会反过来。
这种情况往往出现在用软件分析其它公司的图像仪时或者使用GelDoc XR，第二步“Image Mode”选错的情况下。
方法是：1．选择View》Plot Density》Density at Cursor，在图像中颜色较深的地方点击一下，观察弹出的灰度数值2．再在颜色较浅的地方点击一下，观察灰度数值。
3．比较前次数值是否大于后次的，如果是，则不用再进行任何改动；如不是，选择Image》Invert Data…，按弹出的对话框的提示一步步往下做。
最后进行一次“Transform”。
图像分析Quantity One的图像分析功能相当强大，根据不同的需要，可以分为定量分析、条带分析、相似性分析以及克隆计数(用于蓝白斑筛选)等等，而且每种分析法都有独特的优点和输出方式。
本章重点介绍常用的定量分析和条带分析方法，其余更细更深的功能请参考软件自带的用户手册。
一．定量分析（Volumn Analysis）定量分析是计算选定区域内信号强度的总和，是Quantity One最方便的定量工具。
这种分析方式考虑全定区域的真实形状，可用于电泳条带、斑点、大型芯片以等图像的定量。
这种定量的方法可以扣除背景，可以按照用户的标准曲线计算出条带或斑点的浓度，但它不能计算分子量，也不能进行条带匹配和相似性分析。
Quantity One软件称这类定量的结果为Volume。
Volume＝选定区域内所有像素信号强度的总和×像素面积Volume的单位：int×mm2快捷指南Volumes Quick Guide，能够指导您对任意所选区域进行定量分析,此分析可以报告多种结果，常用的结果是相对浓度和绝对浓度（须提供标准品）。
具体的操作方法如下：2这种对比度调整并不改变具体的灰度数据，只是将图中最“淡”的点显示成白色，最“深”的点显示成黑色。
1．选择成像系统或打开已保存的文件(软件可以控制Bio-Rad所有的成像系统如GelDoc,ChemiDoc,VersaDoc,GS-800,FX,如不是Bio-Rad成像系统所摄取的图象，将图象保存为Tiff 3文件格式，软件也可进行分析处理)2．Zoom Box，缩放，对图象进行放大观察3．选择待分析区域：Volumn Contour Tool等高线勾勒区域，自动连接浓度浓度相同的点，如U1Volume Free hand Tool自由画笔选择区域，可以勾勒出无规则形状,如U2Volume Rect Tool 矩形区域选择，如U3Volumn Circle Tool圆形选择区域，如U4按上面4种方法选择需要定量的区域。