生物化学蛋白质化学
生物化学总结 蛋白质
蛋白质一、概述1.蛋白质:一切生物体中普遍存在的,由天然氨基酸通过肽键连接而成的生物大分子;其种类繁多,各具有一定的相对分子质量,复杂的分子结构和特定的生物功能;是表达生物遗传性状的一类主要物质。
2.元素组成:CONH。
基本组成单位:氨基酸(氨基酸通过肽键连接为无分支的长链,该长链又称为多肽链)。
一些蛋白质含有非氨基酸成分.3.分类:按形状和溶解性:纤维状蛋白质(形状呈细棒或纤维状,多不溶于水);球状蛋白质(形状接近球形或椭球形,可溶于水);膜蛋白(与细胞的各种膜系统结合而存在。
“溶于膜”)。
4.性质:生物大分子;胶体性质;带电性质;溶解性与沉淀;灼烧时可以产生特殊气味;颜色反应;可以被酸、碱或蛋白酶催化水解。
5.为什么加热降低了蛋白质的溶解性?二、氨基酸1.α-氨基酸结构:2.分类:必需/半必需/非必需~~根据R基团的化学结构:脂肪族/芳香族/杂环~~根据R基团的极性和带电性质:a.非极性氨基酸:Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Met、Pro、Trpb.极性氨基酸:不带电:Ser、Thr、Tyr、Asn、Gln、Cys;带正电:His、Lys、Arg;带负电:Asp、Glu*非极性氨基酸:R基团为一个氢原子/R基团为脂肪烃/R基团为芳香环。
*不带电荷的极性氨基酸:R基团含有羟基/R基团含有巯基(SH)/R基团含有酰胺基。
*带负电荷的极性氨基酸,R基团带有负电。
*带正电荷的极性氨基酸,R基团带有正电。
3.酸碱化学:氨基酸是两性电解质,氨基酸在水溶液中或在晶体状态时都以不带电形式和兼性离子形式离子形式存在,在同一个氨基酸分子上带有能放出质子的-NH3+正离子和能接受质子的-COO-负离子。
氨基酸完全质子化时,可以看成是多元酸,侧链不解离可看作二元酸(阳离子—兼性离子—阴离子)。
氨基酸的解离常数K1/K2可用测定滴定曲线的实验方法求得,二元酸的滴定曲线可大致分解为2条一元酸的滴定曲线。
生物化学-蛋白质化学复习总结
蛋白质化学复习总结1、蛋白质概念:是由20种α-氨基酸通过肽键相互连接而成的具有特定空间构象和生物学活性的高分子有机化合物。
几乎所有的酶都是蛋白质。
2、各种蛋白质的含氮量很接近,平均含氮16%(凯氏定氮),粗蛋白质含量=蛋白氮(样品含氮量)×6.25。
3、氨基酸(amino acids)是蛋白质的基本组成单位。
组成蛋白质的标准氨基酸有20种,19种氨基酸具有一级氨基(-NH2)和羧基(-COOH)结合到α碳原子(Cα),同时结合到(Cα)上的是H原子和各种侧链;Pro具有二级氨基(α-亚氨基酸),各种氨基酸的差别在于侧链R基的不同。
4、20种氨基酸都属于L-构型。
20种氨基酸平均分子量为138。
5、氨基酸的分类:⑴根据R的化学结构:①脂肪族氨基酸;②芳香族氨基酸;③杂环氨基酸;④杂环亚氨基酸。
⑵根据R的极性:①非极性氨基酸;②极性、不带电荷氨基酸;③酸性氨基酸;④碱性氨基酸。
6、一般物理学性质:①形态:均为白色结晶或粉末,不同氨基酸的晶型结构不同。
②溶解性:一般都溶于水,不溶或微溶于醇,不溶于丙酮,在稀酸和稀碱中溶解性好。
③熔点:氨基酸的熔点一般都比较高,一般都大于200℃,超过熔点以上氨基酸分解产生胺和二氧化碳。
④旋光性:除甘氨酸外的氨基酸均有旋光性。
⑤光吸收:氨基酸在可见光范围内无光吸收,在近紫外区含苯环氨基酸有光的吸收。
⑥紫外吸收:蛋白质在280nm波长下的紫外吸收性质绝大部分是由色氨酸和酪氨酸所引起的。
色氨酸:279nm苯丙氨酸;259nm;酪氨酸:275nm。
7、氨基酸的化学性质:⑴两性解离(amphoteric ionization):氨基酸在水溶液中或在晶体状态时都以两性离子形式存在,在同一个氨基酸分子上带有能放出质子的-NH3+正离子和能接受质子的-COO-负离子,所以氨基酸为两性电解质。
氨基酸在酸性环境中,主要以阳离子的形式存在,在碱性环境中,主要以阴离子的形式存在。
生物化学第一章蛋白质化学
组成蛋白质的元素:
主要元素组成: 碳(C) 50% ~ 55% 氧(O) 19% ~ 24% 氢(H) 6% ~ 8% 氮(N) 13% ~ 19% 硫(S) 0% ~ 4%
少量的 磷(P)、铁(Fe)、铜(Cu)、锌(Zn)和碘(I)等
蛋白质元素组成特点:
各种蛋白质含氮量很接近,平均为16%
故可根据以下公式推算出蛋白质的大致含量: 样品中蛋白质的含量〔g〕
脱水作用
脱水作用
--
碱
酸-
-
-
-- -
不稳定的蛋白质颗粒
带负电荷的蛋白质
溶液中蛋白质的聚沉
〔三〕蛋白质的变性、沉淀与凝固
1. 蛋白质的变性〔denaturation〕 在某些理化因素作用下,蛋白质的构
象被破坏,失去其原有的性质和生物活性, 称为蛋白质的变性作用。
变性后的蛋白称为变性蛋白质。
常见的变性因素:
2. 极性中性氨基酸
R-基含有极性基团; 生理pH条件下不解离。 包括7个:
甘氨酸(Trp)、 丝氨酸(Ser)、
半胱氨酸(Cys)、 谷氨酰胺(Gln)、 天冬酰胺(Asn)、 酪氨酸(Tyr) 苏氨酸(Thr)
3. 酸性氨基酸
R-基有COOH(COO-)
带负电荷
4. 碱性氨基酸
R-基有NH2(NH3+)
牛胰核糖核酸酶的变性与复性
尿素或盐酸胍 β-巯基乙醇
透析
有活性
无活性
〔二〕一级构造与功能的关系 1.一级构造相似的蛋白质功能相似 一级构造不同的蛋白质功能不同
胰岛素的一级构造及种属差异
一级构造不同的蛋白质功能不同
ACTH 促肾上腺素皮质激素
MSH 促黑激素
基础生物化学知识点
基础生物化学知识点一、蛋白质1. 蛋白质的组成:-主要由碳、氢、氧、氮等元素组成。
-基本单位是氨基酸,氨基酸通过肽键连接形成多肽链。
2. 氨基酸的结构:-具有一个氨基(-NH₂)、一个羧基(-COOH)、一个氢原子和一个侧链(R 基团)。
-根据侧链的性质不同,可分为不同的氨基酸类型,如酸性氨基酸、碱性氨基酸、中性氨基酸等。
3. 蛋白质的结构层次:-一级结构:指多肽链中氨基酸的排列顺序。
-二级结构:主要有α-螺旋、β-折叠等,是通过氢键维持的局部空间结构。
-三级结构:多肽链在二级结构的基础上进一步折叠形成的三维结构,主要由疏水作用、离子键、氢键等维持。
-四级结构:由多个具有独立三级结构的亚基通过非共价键结合而成。
4. 蛋白质的性质:-两性电离:在不同的pH 条件下,蛋白质可带正电、负电或呈电中性。
-胶体性质:蛋白质分子颗粒大小在胶体范围,具有胶体的一些特性。
-变性与复性:在某些物理或化学因素作用下,蛋白质的空间结构被破坏,导致其生物活性丧失,称为变性;变性的蛋白质在适当条件下可恢复其天然构象和生物活性,称为复性。
-沉淀反应:在适当条件下,蛋白质可从溶液中沉淀出来,如加入盐、有机溶剂等。
二、核酸1. 核酸的分类:-脱氧核糖核酸(DNA):是遗传信息的携带者。
-核糖核酸(RNA):参与遗传信息的表达。
2. 核酸的组成:-由核苷酸组成,核苷酸由磷酸、戊糖(DNA 为脱氧核糖,RNA 为核糖)和含氮碱基组成。
-含氮碱基有腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T,DNA 特有)和尿嘧啶(U,RNA 特有)。
3. DNA 的结构:-双螺旋结构:两条反向平行的多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕,由氢键和碱基堆积力维持稳定。
-特点:右手螺旋、碱基互补配对(A 与T 配对,G 与C 配对)。
4. RNA 的种类和结构:-mRNA(信使RNA):携带遗传信息,从DNA 转录而来,作为蛋白质合成的模板。
- tRNA(转运RNA):呈三叶草形结构,在蛋白质合成中负责转运氨基酸。
蛋白质的功能生物化学
蛋白质的功能生物化学
蛋白质是生物体内最重要的有机物质之一,具有多种生物化学功能。
主要功能如下:
1. 结构功能:蛋白质是生物体内构成细胞、组织和器官的重要结构成分,如肌肉中的肌动蛋白和微管蛋白组成肌纤维和细胞骨架,而胶原蛋白是皮肤、骨骼和血管等组织的重要结构蛋白质。
2. 酶功能:许多蛋白质具有酶活性,能够催化生物体内的化学反应。
例如,消化系统中的胃蛋白酶和胰蛋白酶能够分解食物中的蛋白质,将其分解为氨基酸。
3. 运输功能:蛋白质能够通过细胞膜,运输溶解在血液中的物质,如载脂蛋白能够运输胆固醇和脂肪酸。
4. 免疫功能:抗体是蛋白质的一种,具有识别和结合抗原的能力,参与机体的免疫反应。
5. 调节功能:蛋白质可以作为激素或激素受体参与体内的信息传递和调节。
例如,胰岛素和胰高血糖素是由蛋白质构成的激素,能够调节血糖水平。
6. 储能功能:蛋白质也可以作为能量储存物质,例如肌肉中的肌球蛋白具有丰富的储能功能。
7. 保护功能:蛋白质能够保护细胞和组织免受外界的损伤和病
原体的侵袭。
例如,抗体能够结合病原体,促使其被免疫系统清除。
总之,蛋白质在生物体内发挥着重要的功能,涉及到生命的各个方面,包括结构、代谢、调节、免疫和保护等。
生物化学第三章蛋白质化学名词解释
第三章蛋白质化学1蛋白质:是一类生物大分子,由一条或多条肽链构成,每条肽链都有一定数量的氨基酸按一定序列以肽键连接形成。
蛋白质是生命的物质基础,是一切细胞和组织的重要组成成分。
2标准氨基酸:是可以用于合成蛋白质的20种氨基酸。
3、茚三酮反应:是指氨基酸、肽和蛋白质等与水合茚三酮发生反应,生成蓝紫色化合物,该化合物在570mm波长处存在吸收峰。
4、两性电解质:在溶液中既可以给出H+而表现出酸性,又可以结合H+而表现碱性的电解质。
5、兼性离子:即带正电和、又带负电荷的离子。
6、氨基酸的等电点:氨基酸在溶液中的解离程度受PH值影响,在某一PH值条件下,氨基酸解离成阳离子和阴离子的程度相等,溶液中的氨基酸以兼性离子形式存在,且净电荷为零,此时溶液的PH值成为氨基酸的等电点。
7、单纯蛋白质:完全由氨基酸构成的蛋白质。
8、缀合蛋白质:含有氨基酸成分的蛋白质。
9、蛋白质的辅基:缀合蛋白质所含有的非氨基酸成分。
10、肽键:存在于蛋白质和肽分子中,是由一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基缩合时形成的化学键。
11、肽平面:在肽单元中,羧基的π键电子对与氮原子的孤电子对存在部分共享,C-N键具有一定程度的双键性质,不能自由旋转。
因此,肽单元的六个原子处在同一个平面上,称为肽平面。
12、肽:是指由两个或者多个氨基酸通过肽键连接而成的分子。
13、氨基酸的残基:肽和蛋白质分子中的氨基酸是不完整的,氨基失去了氢,羧基失去了羟基,因而称为氨基酸的残基。
14、多肽:由10个以上氨基酸通过肽键连接而成的肽。
15、多肽链:多肽的化学结构呈链状,所以又称多肽链。
16、生物活性肽:是指具有特殊生理功能的肽类物质。
它们多为蛋白质多肽链的一个片段,当被降解释放之后就会表现出活性,例如参与代谢调节、神经传导。
食物蛋白质的消化产物中也有生物活性肽,他们可以被直接吸收。
17、谷胱甘肽:由谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸通过肽键连接构成的酸性三肽,是一种生物活性肽,是机体内重要的抗氧化剂。
生物化学蛋白质的化学知识点
生物化学蛋白质的化学知识点一、知识概述《生物化学蛋白质的化学知识点》①基本定义:蛋白质啊,简单说就是由许多氨基酸按一定顺序连起来的大分子。
就好比许多小珠子(氨基酸)串成一条长长的链子(多肽链),然后这些链子还能盘曲折叠,最后就形成了蛋白质。
②重要程度:在生物化学里那可是超级重要的。
像是细胞结构的组成部分啊,很多酶也是蛋白质,有了它们生物体内各种各样的化学反应才能顺利进行呢。
我觉得它就像建筑里的砖块一样,是构建生物体的基础。
③前置知识:咱们得先大概知道氨基酸是啥吧,毕竟蛋白质是由氨基酸组成的。
还有化学键的基本概念,像肽键就是连接氨基酸的重要化学键。
④应用价值:在制药方面,如果了解蛋白质的结构和功能,就能开发出针对特定蛋白质的药物。
在食品行业,像检测食物中的蛋白质含量也是基于这个知识点。
二、知识体系①知识图谱:蛋白质的化学知识点在生物化学学科里算是核心板块了。
它和核酸化学、酶化学等知识点都有联系。
打个比方,蛋白质和核酸就像伙伴,核酸给出指令,蛋白质负责做事。
②关联知识:和生物大分子中的核酸关联密切,核酸指导蛋白质的合成。
而且与新陈代谢的知识点也有联系,因为很多代谢反应是蛋白质(酶)参与催化的。
- 掌握难度:难。
- 关键点:理解蛋白质的一、二、三、四级结构比较难,像是四级结构,好多条肽链怎么组合起来的,得好好琢磨。
④考点分析:- 在考试中的重要性:非常重要。
- 考查方式:会直接考蛋白质的结构层次、氨基酸的组成计算,也会间接考蛋白质在某些生理过程中的作用。
三、详细讲解【理论概念类】①概念辨析:- 蛋白质就是由氨基酸通过肽键相连形成的高分子含氮化合物。
氨基酸好比是字母,按照特定顺序排列就能写出不同的单词(小的肽段),这些肽段再组装就成了蛋白质这个大文章。
②特征分析:- 具有两性电离特性。
这就是说它既能像酸一样给出质子,又能像碱一样接受质子。
比如说,在人体不同的生理pH环境下,蛋白质的带电情况就不一样。
- 有特定的空间结构。
生物化学名词解释——蛋白质
简单蛋白质:完全由氨基酸构成的蛋白质结合蛋白质:由AAs和其他非蛋白质化合物所组成球状蛋白质:多肽链能够折叠,使分子外形成为球状的蛋白质。
纤维状蛋白质:能够聚集为纤维状或细丝状的蛋白质。
主要起结构蛋白的作用,其多肽链沿一个方向伸展或卷曲,其结构主要通过多肽链之间的氢键维持。
单体蛋白质:仅含有AAs寡聚蛋白质:由两个以上、十个以下亚基或单体通过非共价连接缔合而成的蛋白质。
等电点:蛋白质或两性电解质(如氨基酸)所带净电荷为零时溶液的pH,此时蛋白质或两性电解质在电场中的迁移率为零。
符号为pI。
氨基酸残基:在多肽链中的氨基酸,由于其部分基团参与了肽键的形成,剩余的结构部分则称氨基酸残基。
它是一个分子的一部分,而不是一个分子。
氨基酸的氨基上缺了一个氢,羧基上缺了一个羟基。
简单的说,氨基酸残基就是指不完整的氨基酸。
一个完整的氨基酸包括一个羧基(—COOH),一个氨基(—NH2),一个H,一个R基。
缺少一个部分都算是氨基酸残基,并没有包括肽键的。
钛键:氨基和羧基脱去一分子水形成的化学键。
钛键平面:肽键所在的酰胺基成为的刚性平面。
由于肽键具有部分双键性质,使得肽基的六个原子共处一个平面,称为肽平面。
同源蛋白质:在不同有机体中实现同一功能的蛋白质。
(结构和功能类似的蛋白质。
)蛋白质一级结构:蛋白质多肽链的氨基酸通过肽键连接形成的线性序列。
蛋白质二级结构:指多肽链借助H键折叠盘绕成沿一维方向具有周期性结构的构象。
构象:分子的三维结构即分子中的所有原子在空间的位置总和。
构型:分子中的原子在空间的相对取向。
α-螺旋:它是蛋白质当中最为常见、最丰富的二级结构。
多肽主链沿中心轴盘绕成右手或左手螺旋;每个螺旋周期有3.6个氨基酸残基,螺距0.54nm,螺旋直径0.5nm;氨基酸残基侧链伸向外侧;同一肽链上的每个残基的酰胺氢原子和位于它后面的第4个残基上的羰基氧原子之间形成氢键,并且与螺旋轴保持大致上的平行。
此外,肽键上的酰胺氢和羰基氧既能形成内部氢键,也能与水分子形成外部氢键。
《生物化学》绪论 第1章 蛋白质化学
定的蛋白质肽键断裂,各自得到一系列大小不同 的肽段。
⑷分离提纯所得的肽,并测定它们的序列。
⑸从有重叠结构的各个肽的序列中推断出蛋白质
中全部氨基酸排列顺序。
一级结构确定的原则
蛋白质一级结构测定的战略原则是将大化小,逐
段分析,先后采用不同方法制成两套肽片断,并 对照两段肽段,找出重叠片断,排出肽的前后位 臵,最后确定蛋白质的完整序列。
α-螺旋结构
每个氨基酸残基的-NH
-与间隔三个氨基酸残 基的=C=0形成氢键。每 个 肽 键 的 =C=0 与 - NH -都参加氢键形成,因 此 保 持 了 α- 螺 旋 的 最 大 稳定性。
绝大多数蛋白质以右手
右手α螺旋
α- 螺 旋 形 式 存 在 。 1978 年发现蛋白质结构中也 有 左 手 α- 螺 旋 结 构 。
第一章 蛋白质化学
第一章 蛋白质化学
蛋白质是由不同的 α-氨基酸按一定
的序列通过酰胺键(蛋白质化学中专 称为肽键)缩合而成的,具有较稳定 的构像并具有一定生物功能的生物大 分子。
1.1 蛋白质的生物学意义
蛋白质是一切生物体的细胞和组织的主要组成成
分,也是生物体形态结构的物质基础,使生命活 动所依赖的物质基础。 蛋白质分子巨大、结构复杂,使得蛋白质的理论 研究及其应用受到限制。近年来在重组DNA技术 基础上发展起来的蛋白质工程为解决这方面的问 题提供了最大的可能性。蛋白质工程可改变蛋白 质的生物活性,改变蛋白质的稳定性,改变受体 蛋白质的特性。通过蛋白质工程可深入地研究蛋 白质的结构与功能的相互关系。
1.2 蛋白质的元素组成
经元素分析,蛋白质一般含碳50%~55%,氢
6%~8% , 氧 20%~23% , 氮 15%~18% , 硫 0%~4%。 有的蛋白质还含有微量的磷、铁、锌、铜、钼、 碘等元素。 氮含量在各种蛋白质中比较接近,平均为16%。 因此,一般可由测定生物样品中的氮,粗略的 计算出蛋白质的含量。(1g的氮≈ 6.25 g的蛋 白质)
生物化学第二章 蛋白质
蛋白质
目 录
一、蛋白质的种类、含量与分类 二、氨基酸 三、肽 四、蛋白质的结构 五、蛋白质的性质 六、食物中的蛋白质 七、蛋白质的分离与纯化
一、蛋白质的化学组成与分类
主要组成元素:C、H、O、N、S 及 P、Fe、 Cu、Zn、Mo、I、Se 等微量元素。 百分数约为:碳占50~55%,氢占6~8%, 氧占20~30%,氮占15~18%及硫占0~4%。 大多数蛋白质所含氮素约为16%,因该元素容 易用凯氏(Kjeldahl)定氮法进行测定。 故蛋白质的含量可由氮的含量乘以 6.25(100/16)计算出来: 即:蛋白质含量=6.25×样品含氮量
aa向正极移动 aa向负极移动 aa不移动
pI的测定:
酸碱滴定法; 基于aa所带基团 均可解离; 得到弱酸弱碱曲 线; 根据aa上可解离 基团的pK值计算 等电点: pK:解离常数。 以甘氨酸为例:
由此可知:
在生理pH内,aa 的羧基和氨基全部解离; 具有这种性质的物质称两性电解质; 带有相反基团的分子叫两性离子; 滴定中Gly的阳离子(R+)、阴离子(R-) 和两性离子(R°)的比例随pH而变; 当溶液中只有两性离子时, pH = pI
蛋白质氨基酸
蛋白质中存在的20种氨基酸,除脯氨酸外,在其 α -碳原子上都有一个自由的羧基及一个自由的氨基; 由于脯基酸的α -氨基被取代,它实际上是一种α -亚 氨基酸。此外,每种氨基酸都有一个特殊的R基团。
生物体内常见氨基酸的分类:
蛋白质氨基酸: 蛋白质中常见的20种氨基酸 稀有的蛋白质氨基酸:蛋白质组成中,除上述20 种常见氨基酸外,从少数蛋白质中还分离出一些 稀有氨基酸,它们都是相应常见氨基酸的衍生物。 如4-羟脯氨酸、5-羟赖氨酸等。 非蛋白质氨基酸:生物体内呈游离或结合态的氨 基酸。
生物化学--蛋白质
3.超二级结构和结构域 蛋白质二级结构和三级结构的过渡态。
(1)超二级结构 二级结构组合体,但没有结构域。
胶原蛋白
弹性蛋白
角蛋白
几种超二级结构
• 胶原蛋白 脊椎动物中最多、最普遍的蛋白质 普遍存在于结缔组织、真皮、腱、韧带、骨及软骨、血管壁、角膜 等处的细胞外基质中。
每条肽链是α左手 螺旋
共价键
③加人可与蛋白质结合成不溶解的化合物的物质 (变性)
重金属离子
酸根
4.蛋白质的变构和变性
(1)变构 蛋白质与效应物的结合引起整个蛋白质分子构象发生改变的现象就称为蛋白质的变构作用, 又称别构作用。(只涉及非共价键的断裂,是可逆的) (2)变性 蛋白质分子的空间结构发生改变和破坏从而丧失生物活性的现象叫变性。 一级结构不变,破坏二级结构以上的结构,即氢键等次级键部分或全部断裂。 溶解度降低,易沉淀(内部的疏水基团暴露); 失去结晶能力; 肽链松散,易被水解; 辅酶脱离。 蛋白质复性:如果不过于剧烈,变性后的蛋白质可以在一定的条件下恢复其生物活性。 ②致变因素 高温、振荡、搅拌、超声波、X射线、紫外线; 重金属离子、强酸、强碱、尿素,去污剂以及酒精、丙酮等有机溶剂等。
螺距0.54nm 3.6个氨基酸残基
右手螺旋居多
(2)β-折叠 并列的比α螺旋更为伸展的肽链,互相以氢键连接起来而成片层状的结构。 肽链比较伸展,弹性较差。
(3)β-转角和不规则卷曲 β转角:使多肽链发生180°的回折。 不规则卷曲:使一种没有规律的松散肽链结构。酶的功能部位常常 位于这种构象区域里。
3条α-螺旋共价相 连,形成右手螺 旋。
长, 肽链间的共价键数目增 加,使胶原纤维越来越 硬而脆,结果改变了结 缔组织的机械性能。
生物化学蛋白质化学
蛋白质化学1.简述多肽链α-螺旋和β-折叠两种二级结构的特点。
α-螺旋:1)主链形成紧密的螺旋,侧链伸向外侧2)每一圈包含3.6 个氨基酸残基,每个残基跨距为0.15nm,螺旋上升一圈的距离(螺距) 为0.54nm3)螺旋通过氢键维持稳定:第一个肽键的NH 和第四个肽键的CO 形成氢键,第n 个肽键的NH 和第n+4 个肽键的CO 形成氢键β-折叠:1)多肽链充分伸展,肽平面折叠成锯齿状;2)侧链交错位于锯齿状结构的上下方;3)氢键维系:氢键的方向垂直长轴;4)可有顺平行片层和反平行片层结构。
2. Gly的pK1=2.34(-COOH), pK2=9.60(-N+H3);Glu的pK1(-COOH)为2.19,pK2(-N+H3)为9.67,pK3(γ-COOH)为4.25,计算其pI(1)pI=1/2(pK1+ pK2)=5.97 (2)pI=1/2(pK1+ pK3)=3.223. 某八肽的氨基酸组成为:Asp,Ser,Gly,Ala,Met,Phe,2Lys。
(1)DNFB与之反应后酸水解,得DNP-Ala。
(2)胰凝乳蛋白酶消化后分出一个四肽,其组成为Asp,Gly,Met,Lys,此四肽与DNFB反应产生DNP-Gly。
(3)胰蛋白酶消化八肽后,得到组成为Lys,Ala,Ser及Phe, Lys,Gly两个三肽及一个二肽,此二肽被CNBr处理游离出Asp。
请写出该八肽的顺序及推理过程。
1、DNFB与之反应后酸水解,得DNFB水解N端为Ala。
2、胰凝乳蛋白酶水解Tyr,Trp,Phe之C端,得Asp及1个四肽(Lys,Ser,Phe,Ala)和一个三肽确认序列为Ala-Ser-Lys-Phe Gly-Lys-Tyr Asp3、胰蛋白酶断Lys or Arg之C端,得Lys,Ala,Ser Gly,Phe,Lys Asp, Tyr确认序列为Ala-Ser-Lys Gly,Phe,Lys Asp, Tyr4、三肽与DNFB反应释放DNP-Gly,符合预期,即Gly-Lys-Tyr结论,蛋白质序列为Ala-Ser-Lys-Phe-Gly-Lys-Tyr-Asp核酸化学1、RNA分哪几类?各类RNA的结构特点和生物功能是什么?2、简述影响DNA的复性过程的因素1)DNA浓度较高时,两条互补链彼此相碰的机会增加,易于复性2)2)因加热变性的DNA,当温度超过T后,即迅速冷却到低温时,不能复性,但当溶液维持在T的较高温时,则可能复性,一般比T低25摄氏度左右时最佳。
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一、填空题1.构成蛋白质的氨基酸有种,一般可根据氨基酸侧链(R)的大小分为侧链氨基酸和侧链氨基酸两大类。
其中前一类氨基酸侧链基团的共同特怔是具有性;而后一类氨基酸侧链(或基团)共有的特征是具有性。
碱性氨基酸(pH6~7时荷正电)有两种,它们分别是氨基酸和氨基酸;酸性氨基酸也有两种,分别是氨基酸和氨基酸。
2.紫外吸收法(280nm)定量测定蛋白质时其主要依据是因为大多数可溶性蛋白质分子中含有氨基酸、氨基酸或氨基酸。
3.丝氨酸侧链特征基团是;半胱氨酸的侧链基团是;组氨酸的侧链基团是。
这三种氨基酸三字母代表符号分别是、、、4.氨基酸与水合印三酮反应的基团是,除脯氨酸以外反应产物的颜色是;因为脯氨酸是a—亚氨基酸,它与水合印三酮的反应则显示色。
5.蛋白质结构中主键称为键,次级键有、、、、;次级键中属于共价键的是键。
6.镰刀状贫血症是最早认识的一种分子病,患者的血红蛋白分子b亚基的第六位氨酸被氨酸所替代,前一种氨基酸为性侧链氨基酸,后者为性侧链氨基酸,这种微小的差异导致红血蛋白分子在氧分压较低时易于聚集,氧合能力下降,而易引起溶血性贫血。
7.Edman反应的主要试剂是;在寡肽或多肽序列测定中,Edman反应的主要特点是。
8.蛋白质二级结构的基本类型有、、和。
其中维持前三种二级结构稳定键的次级键为键。
此外多肽链中决定这些结构的形成与存在的根本性因与、、有关。
而当我肽链中出现脯氨酸残基的时候,多肽链的a-螺旋往往会。
9.蛋白质水溶液是一种比较稳定的亲水胶体,其稳定性主要因素有两个,分别是和。
10.蛋白质处于等电点时,所具有的主要特征是、。
11.在适当浓度的b-巯基乙醇和8M脲溶液中,RNase(牛)丧失原有活性。
这主要是因为RNA酶的被破坏造成的。
其中b-巯基乙醇可使RNA酶分子中的键破坏。
而8M脲可使键破坏。
当用透析方法去除b-巯基乙醇和脲的情况下,RNA酶又恢复原有催化功能,这种现象称为。
12.细胞色素C,血红蛋白的等电点分别为10和7.1,在pH8.5的溶液中它们分别荷的电性是、。
13.在生理pH条件下,蛋白质分子中氨酸和氨酸残基的侧链几乎完全带负电,而氨酸、氨酸或氨酸残基侧链完全荷正电(假设该蛋白质含有这些氨基酸组分)。
14.包含两个相邻肽键的主肽链原子可表示为,单个肽平面及包含的原子可表示为。
15.当氨基酸溶液的pH=pI时,氨基酸(主要)以离子形式存在;当pH>pI时,氨基酸(主要)以离子形式存在;当pH<pI时,氨基酸(主要)以离子形式存在。
16.侧链含—OH的氨基酸有、和三种。
侧链含—SH的氨基酸是氨基酸。
17.人体必需氨基酸是指人体自身不能合成的、必须靠食物提供的氨基酸。
这些氨基酸包括、、、、、、、等八种。
18.蛋白质变性的主要原因是被破坏;蛋白质变性后的主要特征是;变性蛋白质在去除致变因素后仍能(部分)恢复原有生物活性,表明没被破坏。
这是因为一级结构含有的结构信息,所以蛋白质分子构象恢复后仍能表现原有生物功能。
19.盐析作用是指;盐溶作用是指。
20.当外界因素(介质的pH>pI、电场电压、介质中离子强度、温度等)确定后,决定蛋白质在电场中泳动速度快慢的主要因素是和。
二、选择填空题1.侧链含有咪唑基的氨基酸是()A、甲硫氨酸B、半胱氨酸C、精氨酸D、组氨酸2.PH为8时,荷正电的氨基酸为()A、GluB、LysC、SerD、Asn3.精氨酸的Pk1=2.17、Pk2=9.04(a-NH3)Pk3=12.48(胍基)PI=()A、1/2(2.17+9.04)B、1/2(2.17+12.48)C、1/2(9.04+12,48)D、1/3(2.17+9。
04+12。
48)4.谷氨酸的Pk1=2.19(a-COOH)、pk2=9.67(a-NH3)、pk3=4.25(g-COOH) pl=()A、1/2(2.19+9。
67)B、1/2(9.67+4.25)C、1/2(2.19+4.25)D、1/3(2.17+9.04+9.67) 5.氨基酸不具有的化学反应是()A、肼反应B、异硫氰酸苯酯反应C、茚三酮反应D、双缩脲反应6.当层析系统为正丁醇∶冰醋酸∶水=4∶1∶5时,用纸层析法分离苯丙氨酸(F)、丙氨酸(A)和苏氨酸(T)时则它们的R f值之间关系应为:()A、F>A>TB、F>T>AC、A>F>TD、T>A >F7.氨基酸与亚硝酸反应所释放的N2气中,氨基酸的贡献是()A、25%B、50%C、80%D、100%8.寡肽或多肽测序时下列试剂中最好的是()A、2,4-二硝基氟苯B、肼C、异硫氰酸苯酸D、丹酰氯9.下列叙述中不属于蛋白质一般结构内容的是()A、多肽链中氨基酸残基的种类、数目、排列次序B、多肽链中氨基酸残基的键链方式C、多肽链中主肽链的空间走向,如a-螺旋D、胰岛分子中A链与B链间含有两条二硫键,分别是A7-S-S-B7,A20-S-S-B1910.下列叙述中哪项有误()A、蛋白质多肽链中氨基酸残基的种类、数目、排列次序在决定它的二级结构、三级结构乃至四级结构中起重要作用B、主肽链的折叠单位~肽平面之间相关一个C a碳原子C、蛋白质变性过程中空间结构和一级结构被破坏,因而丧失了原有生物活性D、维持蛋白质三维结构的次级键有氢键、盐键、二硫键、疏水力和范德华力11.蛋白质变性过程中与下列哪项无关()A、理化因素致使氢键破坏B、疏水作用破坏C、蛋白质空间结构破坏D、蛋白质一级结构破坏,分子量变小12.加入下列试剂不会导致蛋白质变性的是()A、尿素(脲)B、盐酸胍C、十二烷基磺酸SDSD、硫酸铵13.血红蛋白的氧合动力学曲线呈S形,这是由于()A、氧可氧化Fe(Ⅱ),使之变为Fe(Ⅲ)B、第一个亚基氧合后构象变化,引起其余亚基氧合能力增强C、这是变构效应的显著特点,它有利于血红蛋白质执行输氧功能的发挥D、亚基空间构象靠次级键维持,而亚基之间靠次级键缔合,构象易变14.下列因素中主要影响蛋白质a-螺旋形成的是()A、碱性氨基酸的相近排列B、酸性氨基酸的相近排列C、脯氨酸的存在D、甘氨酸的存在15.蛋白质中多肽链形成a-螺旋时,主要靠哪种次级键维持()A、疏水键B、肽键C、氢键 D、二硫键16.关于蛋白质结构的叙述,哪项不恰当()A、胰岛素分子是由两条肽链构成,所以它是多亚基蛋白,具有四级结构B、蛋白质基本结构(一级结构)中本身包含有高级结构的信息,所以在生物体系中,它具有特定的三维结构C、非级性氨基酸侧链的疏水性基团,避开水相,相互聚集的倾向,对多肽链在二级结构基础上按一定方式进一步折叠起着重要作用D、亚基间的空间排布是四级结构的内容,亚基间是非共价缔合的17.有关亚基的描述,哪一项不恰当()A、每种亚基都有各自的三维结构B、亚基内除肽键外还可能会有其它共价键存在C、一个亚基(单位)只含有一条多肽链D、亚基单位独立存在时具备原有生物活性18.关于可溶性蛋白质三级结构的叙述,哪一项不恰当()A、疏水性氨基酸残基尽可能包裹在分子内部B、亲水性氨基酸残基尽可能位于分子内部C、羧基、氨基、胍基等可解离基团多位于分子表面D、苯丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸等残基尽可能位于分子内部19.蛋白质三级结构形成的驱动力是()A、范德华力B、疏水作用力C、氢键D、离子键20.引起蛋白质变性原因主要是()A、三维结构破坏B、肽键破坏C、胶体稳定性因素被破坏D、亚基的解聚21.以下蛋白质中属寡聚蛋白的是()A、胰岛素B、RnaseC、血红蛋白D、肌红蛋白22.下列测定蛋白质分子量的方法中,哪一种不常用()A、SDS-PAGE法B、渗透压法C、超离心法D、凝胶过滤(分子筛)法23.分子结构式为HS-CH2-CH-COO-的氨基酸为()A、丝氨酸B、苏氨酸C、半胱氨酸D、赖氨酸24.下列氨基酸中为酪氨酸的是()25.变构效应是多亚基功能蛋白、寡聚酶及多酶复合体的作用特征,下列动力学曲线中哪种一般是别构酶(蛋白质)所表现的:()18.为什么鸡蛋清可用作铅中毒或汞中毒的解毒剂?六、计算题1.测得一种蛋白质分子中Trp残基占分子量的0.29%,计算该蛋白质的最低分子量(注:Trp的分子量为204Da)。
2.一种蛋白质按其重量含有1.65%亮氨酸和2.48%异亮氨酸,计算该蛋白质最低分子量。
(注:两种氨基酸的分子量都是131Da)。
3.某种氨基酸a-COOHpK=2.4,a-N+H3pK=9.6,w-N+H3pK=10.6,计算该种氨基酸的等电点(pI)。
4.某种四肽a-COOHpK=2.4,a-N+H3pK=9.8,侧链-N+H3pK=10.6侧链-COOHpK=4.2,试计算此种多肽的等电点(pI)是多少?5.有一种多肽,其侧链上羧基30个(pK=4.3),嘧唑基有10个(pK=7),e-N+H3(pK =10),设C末端a-羧基pK=3.5,N-末端氨基pK=9.5,计算此多肽的pI。
6.已知氨基酸平均分子量为120Da。
有一种多肽的分子量是15120Da,如果此多肽完全以a -螺旋形式存在,试计算此a-螺旋的长度和圈数。
答案:一、填空 1. 20 非极性极性疏水亲水赖精天冬 2.色苯丙酪 3. -OH -SH -COOH N NH 4.氨基紫红亮黄 5.肽氢键二硫键疏水作用(键)范德华力二硫键 6. 谷缬极非极 7.异硫氰酸苯酯从N-端依次对氨基酸进行分析鉴定 8. a-螺旋b-折叠b转角无规卷曲氢氨基酸种类数目排列次序中断 9. 分子表面的水化膜同性电荷斥力10.溶解度最低电场中无电泳行为 11.空间结构二硫氢复性 12.正电负电13.谷天冬赖精细15. b a c二、选择填空 1.D 2.B 3.C 4.C 5.D 6.A 7.B 8.C 9.C 10.C 11.D12.D 13.B 14.C 15.C 16.A 17.C 18.B 19.B 20.A 22.B 23.C 24.B 25.B 26.D三、判断题 1.× 2.√ 3.√ 4.× 5.√ 6.×7.×8.×9.×10.√11.×12 .√13.×14.√15.√16.×17.√18.√19.√20.×21.×22.√六、计算题1.解:Trp残基MW/蛋白质MW=0.29%,蛋白质MW=64138Da。
2.解:异亮氨酸/亮氨酸=2.48%/1.65%=1.5/1=3/2所以,在此蛋白质中的亮氨酸至少有2个,异亮氨酸至少有3个。
由此推理出:1.65%=2×(131-18)/蛋白质MW答案:蛋白质MW=13697Da。
3.答案:pI=10.14.答案:pI=7.05.解:要计算多肽的等电点,首先应该找到静电荷为零的分子状态。