药物设计的原理及方法优秀课件 (2)

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药物设计课件药物设计原理和方法

药物设计课件药物设计原理和方法
AI辅助药物设计
利用人工智能技术预测和优化药物与靶点的相互 作用,提高药物设计的效率和成功率。
免疫疗法
利用免疫系统攻击疾病细胞,提高药物的特异性 和疗效,减少毒副作用。
THANKS
感谢观看
药物设计的原理
药物与生物体的相互作用原理
药物与受体相互作用
药物通过与生物体内的受体结合,产生药理 作用。了解受体结构和性质是药物设计的关 键。
药物与酶相互作用
药物也可以通过抑制或激活酶的活性来发挥作用。 这涉及到酶的结构和动力学性质。
药物与免疫系统相互作用
一些药物通过影响免疫系统的功能来发挥作 用,这涉及到免疫细胞和分子的相互作用。
药物设计课件药物 设计原理和方法
目录
• 药物设计概述 • 药物设计的原理 • 药物设计的方法 • 药物设计的实践应用 • 药物设计的挑战与未来发展
01
CATALOGUE
药物设计概述
药物设计的定义和重要性
药物设计的定义
药物设计是根据已知的生物活性分子结构特征和生物靶点(受体或酶)的三维 结构信息,设计出具有治疗活性的新分子实体(先导化合物)的过程。
03
CATALOGUE
药物设计的方法
基于结构的药物设计
总结词
基于结构药物设计是根据已知的靶点结构,通过设计或优化小分子化合物,使其与靶点结合并发挥药效的过程。
详细描述
基于结构的药物设计依赖于X射线晶体学、核磁共振和其他结构生物学技术获得的靶点结构信息。通过模拟小分 子与靶点的相互作用,设计出与靶点结合的小分子化合物。这种方法有助于提高药物设计的针对性和成功率。
已有药物的改良
通过对已有药物的化学结构进行 修饰和改造,提高药物的疗效、 降低副作用或改变药物作用机制 。

药物设计 课件 药物设计原理和方法(2) 拼合原理45页PPT

药物设计 课件 药物设计原理和方法(2) 拼合原理45页PPT

37、我们唯一不会改正的缺点是软弱。——拉罗什福科
xiexie! 38、我这个人走得很慢,但是我从不后退。——亚伯拉罕·林肯
39、勿问成功的秘诀为何,且尽全力做你应该做的事吧。——美华纳
40、学而不思则罔,思而不学则殆。——孔子
ห้องสมุดไป่ตู้

29、在一切能够接受法律支配的人类 的状态 中,哪 里没有 法律, 那里就 没有自 由。— —洛克

30、风俗可以造就法律,也可以废除 法律。 ——塞·约翰逊
拼合原理
谢谢!
36、自己的鞋子,自己知道紧在哪里。——西班牙
药物设计 课件 药物设计原理和方法(2)

26、我们像鹰一样,生来就是自由的 ,但是 为了生 存,我 们不得 不为自 己编织 一个笼 子,然 后把自 己关在 里面。 ——博 莱索

27、法律如果不讲道理,即使延续时 间再长 ,也还 是没有 制约力 的。— —爱·科 克

28、好法律是由坏风俗创造出来的。 ——马 克罗维 乌斯

药物设计学(第二章_药物设计原理和方法).pptx

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5-HT3受体拮抗剂
昂丹司琼(Ondansetron),5-HT3受体拮抗剂, 广泛用于肿瘤化疗后抑制恶心呕吐。
吲哚环和环已酮环再稠合成环
CH3 O
NN
CH3 O
NN
N CH3 Ondansetron
构象限制体,提高选择性
柔性分子, 有多种低能 构象,可与 不同受体结 合的缘故。
O
OH H3C N
CH3 CH3
OH
O
OH 水解
O
NH2
N
CH3
a
H3C
O
苯并氮氧杂环辛烯 开链苯乙酮化合物,
强效β受体阻断剂
b O
活性为环状物的25%
O
OH
NC
N
OH NO
苯并二氢吡 喃化合物
消除了β受体阻断作用, 为钾离子通道开放剂, 具有降压活性
第二章 药物设计原理及方法
较高药理活性 复杂、独特化学结构
是生物体为保护自己和繁衍物种而 产生的防御性或引诱性的物质
药 发现(discover):以天然产物为主
物 发
磺胺类药物,
发展(develop):以合成药物为主 药物发展阶
段标志
展 设计(design):基于受体、配体的设计
沙利度胺(反应停):治 疗关节炎和治疗乳腺癌。
药物设计 的经典原 理和方法
相似性原理 拼合原理 物电子等排原理 前药原理 软药原理
此外,还有导向原理、基于受体结构的设计、 基于配体分子的设计等。
一、概述
第一节 类似物
先导化合物
具有相同/相似 的药效基团和/ 或结构骨架
结构改造 相似性原理
类似物
评价活性,建立结构 与活性关系(SAR)

药物设计的基本原理和方法 PPT

药物设计的基本原理和方法 PPT

药物的结构与生物活性
• 药物的基本结构和结构改造 • 理化性质对药效的影响
• 电子密度分布和官能团对药效的影响
• 键合特性对药效的影响
• 立体结构对药效的影响
二、新药设计与开发
Drug design and development
• 先导化合物发现的方法和途径
• 从天然产物活性成分中发现先导化合物
四、计算机辅助药物设计
Computer aided drug design
• 对于一个药物分子,分子中的不同基团对其活性影响程度不同。药物活 性分子中对活性起重要作用的“药效特征元素”及其空间排列形式,即 为药效团(Pharmacophore)。 • 从不同类的先导化合物出发可以构建药效团模型,得到与生物活性有关 的重要药效团特征,这些药效团特征是对配体小分子活性特征的抽象与 简化;即小分子拥有药效团特征,就可能具备某种生物活性,而这些活 性配体分子的结构未必相同。因此,药效团模型方法可以用来寻找结构 全新的先导化合物。
二、新药设计与开发
Drug design and development
• 先导化合物的优化
• 前药设计
环磷酰胺是以氮芥为先导化合物改造而来,是临床上最常用的毒性较 低的细胞毒类抗癌药,它本身不具备细胞毒活性,而是通过在体内的代谢 转化,经肝微粒体混合功能氧化酶活化才有烷基化活性。
二、新药设计与开发
Drug design and development
• 先导化合物的优化
• 软药设计
软药是一类本身具有生物活性的药物,在体内起作用后,经人为设计 的可预测的或可控制的代谢途径,生成无毒和无药理活性的代谢产物。软 药用以设计安全而温和的药物,通常是为了降低药物的毒副作用。

药物设计学药物设计原理和方法最全PPT

药物设计学药物设计原理和方法最全PPT

NH2SO2
CH3
O N
Rofecoxib
Celecoxib
Valdecoxib
建立生物学模型,以筛选和评价化合物的 活性。建立的模型可有不内的层次,但均 应反映出是针对所选定的靶标的作用。
新药设计 与研究
靶标的确定
除了建立药效学模型外,还应建
模型的建立
立评价药代动力学性质的模型。
先导化合物的发现
O
O N
哌替啶(杜冷丁)
O
O NH
镇痛作用为哌替啶的2倍
苯丙醇胺的结构修饰:
苯丙醇胺(Phenylpropanolamine):具有β受体阻断、奎 尼丁样、降压和局麻等多种作用。
构象限制体,提高选择性
柔性分子, 有多种低能 构象,可与 不同受体结 合的缘故。
O
OH H3C N
CH3 CH3
OH
O
OH 水解
将两种药物的结构或药效团拼合在一个分子内: ①使形成的药物兼具两者的性质,强化药理作用,减 小各自相应的毒副作用; ②使两者取长补短,发挥各自的药理活性,协同完成 治疗作用。 一般说来,通过拼合原理得到的多数药物都是前药。
二、拼合原理的应用 1、 阿斯匹林-对乙酰氨基酚的拼合:
刺激胃黏膜
C O 2 H
1、对映体活性相似但强度不同 例:氧氟沙星 S-(-)-异构体对各种细菌的抑菌活性强于R-(+)异构体 8-128倍。
手性中心的甲基在母核平 面的取向不同,导致与酶
O
F
CO2H
活性中心结合能力的不同,
决定了它们的抗菌效力的
N
N
差异。
N H3C
O CH3
抗菌药氧氟沙星 (Ofloxacin)

药物设计的基本原理和方法2-三节

药物设计的基本原理和方法2-三节

第三节 先导化合物的优化 ( Lead Optimization)或称为药物设计
寻找
药物设计的目的
活性高、选择性强、毒副作用小的新药
在发现了先导化合物后,就要对先导化合物进行合理的结构修饰, 这种过程和方法称为先导化合物的优化(lead optimization)或称为 药物设计。
寻找
优化的目的
更理想的理化性质, 或者具更良好的药物动力学性质, 或者提高了生物利用度, 或者选择性更强而毒副作用减弱。
第一,用生物电子等排体替代时,往往可以得到相 似的药理活 性。通过药物设计可以得到新的化学实体或类似物。
如 N-甲基四氢吡啶甲酸甲酯, 3位是脂肪链状化合物,具有抗炎 活性。它的3位杂环状生物具有相同的抗炎活性.
2019/2/15
11
将组胺结构中的咪唑环分别用吡啶、吡唑、三唑环替代时, 生物活性没有改变,这四种含氮杂环互为生物电子等排体。
那么,插烯后的化合物表达为: A-BI=B2-EI=E2 减少双健及插烯规则后来被广泛用在会成上,在药物 设计中,常用来优化先导化合物。
当减少或插入一个及多个双键后,药物的构型、分子形状和性质发 生改变,可影响药物与受体的作用,进而对其生物活性产生影响。
2019/2/15 4
如胡椒碱是从民间验方得到的抗癫痫有效成分,全合成有 一定困难,经减少一个双键得到栓皮酰胺类的衍生物,合 成简单,而且增强了抗癫痫的活性。
2019/2/15
14
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药物设计原理和方法PPT课件

药物设计原理和方法PPT课件

.
19
➢适宜衍生化的功能基及衍生化物:
✓醇羟基或酚羟基可衍生成酯或活泼醚; ✓羧基可衍生成酯或酰胺; ✓氨基(包括胺、酰胺和亚胺)可衍生成烷氧 羰 ✓酰胺
.
20
➢2.4.1 提高生物利用度的前药
✓若原药分子中含有羟基、羧基或磷酸基,会因极 性强或带有电荷而难以吸收。应用前药原理引入 酯键可提高脂溶性,改善了脂/水分配系数,有利 肠道吸收,或克服了首过效应。
H3 C O H
+
H3 CN C H3
C O O-
H3 C N H2
+
H3 CN
C O O-
C H3
H3 C N H2 C O O-
H3 C
C H3
10
11 .
12 9
➢3.5 环和非环的电子等排体 ➢雌激素激动剂 ➢雌二醇的开环类似物已烯雌酚同样具有雌激素活性。为了 维持两个酚基和两个乙基在空间适宜的配置,以便与雌激素 受体结合,已烯雌酚分子中间的反式双键是非常重要的。
✓帕瑞昔布(Parecoxib)是戊地昔布(Valdecoxib) 的水溶性非活性前体药物,系非肠道给药的选择性 COX-2抑制剂,用于治疗手术后疼痛。
NH2SO2
CH3
O N
Na CH3CH2CO-N-SO2
CH3
O N
Valdecoxib .
Valdecoxib 29
➢2.4.2.5 UR-14048
OH
HO
HO
.
HO
11
§2.4 前 药 原 理
.
12
➢前药(Prodrug):是指体外活性较 小或无活性,在体内经酶促或非酶化 学反应,释放出活性物质而发挥药理 作用的化合物。
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OO S
H2N
Cl
OO S N H
利尿剂
H OH
N
O
NH
β-受 体 拮 抗 剂
Cl N
PAF拮 抗 剂
N CH3
O
H1受 体 拮 抗 剂
3、类型
❖ 利用拼合法可得到两种化合物,其中一类一般在 体外无生物活性,进入体内后,经相关酶的酶促 作用后分解成原来的两种药物,分别发挥相应的 药理作用(相当于前药),从而改善药学和药物 动力学性质;第二种是在体内不分解,以整个分 子起作用,进行多靶点调节,即多靶点配体药物 (Multi-Target Ligand Drug)。其设计思路是通 过综合分析,设计出能够选择系地同时作用于同 一种疾病的多个不同靶点的药物。
拼合操作
(1)连接方式
D1
Cn
D2
链接基模式
D1
D2
无连接基模式
D1
重叠模式
CH3 N
O
O
O HO O
O OH O
D2
D1 D2
OH O O
H N CH3
O
类山梗酮碱(Lobelanine)
双香豆素(Dicumarol)
醋氨沙罗(Acetaminosalol)
(2)相同孪药与双效作用药物
❖ 两个相连接的分子可以相同(相同孪药, D1=D2,Identical Twin Drug,如Lobelanine), 也可以不相同(相相异孪药,Nonidentical Twin Drug 或Dual-Acting Drug,又称双效作用药物 。
药物设计的原理及方法
Contents
拼合原理 局部修饰 生物电子等排 药物的潜伏化(前药原理)
软药
本章目的
在于介绍如何通过化学操作和生物学评 价,发现决定药理作用的药效团、药效片 段或基本结构,最终得到高效、低副作用、 具有特异性并且易服用、化学稳定、方便 易得的目标物。
第一节 药物设计的基本原则
tail
head head
tail
HO O O O
O O HO O
head
tail
tail
OO OH
OH OO
head
tail
head
tail
head
OH
O
HO
O
HO
O
OH
Oห้องสมุดไป่ตู้
OH
HO
双阿司匹林(Diaspirin) 鹰爪豆碱(Sparteine) 3’-8’’-双-4’,5,7-三羟基黄酮
头对头
尾对尾
❖ 同生型有时又称为分子重复(Molecular Replication),即两个或多个相同的分子或片段 经共价键结合形成的分子 。
❖同生型的连接方式包括头-头(Head-Head) (如双阿司匹林,Diaspirin);尾-尾(TailTail)(如鹰爪豆碱,Sparteine);头-尾 (Head-Tail)(如3’-8’’-双-4’,5,7-三羟基黄 酮,Amentoflavone)等三种
发现,金黄色葡萄球菌等产生的青霉素酶或β-内
酰胺碱,能催化氨苄西林的β-内酰胺环开裂而丧
失抗菌活性。舒巴坦(青霉烷砜,Sulbatactam)是
β-内酰胺酶抑制剂,对革兰阳性菌或阴性菌均有
作用,将二者通过次甲基拼合成双酯,由于舒巴
坦分子中的砜基的氧原子与碳6原子上的α-构型的
氢形成氢键,增加了β-内酰胺环上羰基碳原子的
拼接原理的应用实例
1、早期的设计实例
❖ 贝诺酯的设计实例——阿司匹林和对乙酰氨基酚 (扑热息痛)的拼合。阿司匹林和对乙酰氨基酚 (扑热息痛)都是解热止痛药,阿司匹林分子中 的羧基对胃黏膜有刺激性,长期服用易引起溃疡。 由于酚羟基的作用,长期服用对乙酰氨基酚,易 导致肾脏毒性。将前者的羧基与后者的酚羟基作 用成酯,口服对胃无刺激,在体内经酯酶分解后, 又重新分解为原来的药物,共同发挥解热镇痛作 用,用药剂量小,毒副作用大大降低。该物已用 于临床即贝诺酯( Benorilate)。
正电性,与β-酶的负电中心结合力提高,导致β-
内酰胺酶失活,从而保证了氨苄西林抗菌活性的
(Amentoflavone) 头尾相连
对称连接
不对称连接
双效作用药物是利用共生型设计法(Symbiotic Approach)设计的,该法有两种基本策略。
第一种策略
将两个不同的药效结构单元 结合在一起形成
第二种策略
将具有两种药理作用的化合物 作为先导化合物,再对其进行 结构优化,最终得到本质上的 双效药物
第二节 拼合原理
❖拼合原理的定义
所谓的拼合原理是将两种药物的药效结构单 元拼合在一个分子中,或将两者的药效基团通过 共价键兼容于一个分子中,使形成的药物或兼具 两者的性质,强化药理作用,减少各自相应的毒 副作用,或是两者取长补短,发挥各自的药理活 性,协同完成治疗作用。因为多数情况下是将两 个药物结合在一起,所以有时将其称为孪药 (Twin Drug)。
❖ 通过对疾病机理的研究发现,疾病的产生可能与 多个靶点(受体、酶等)有关,根据各个靶点和 相应的内源性配基的空间结构和性质,设计出可 选择性地作用于多个靶点,又具有药理活性的先 导化合物,这种基于结构和作用机制的药物设计 方法得到的化合物往往活性强,作用专一,副作 用较少。
❖ 利用拼合原理还可以设计出能够与两个不同受体 作用、或与一个受体的两个不同结合位点作用、 或与两个不同的酶作用以及于一个酶和一个受体 同时作用等的多靶点配体药物(有时称为双效药 物,Dual-Acting Drug)。
O
H3C
N H
扑热息痛
O O
O
CH3
O
阿司匹林
贝诺酯(Benorilate)
NH2 H N
O O
S N
CH3 CH3
H3C O
OOO
N
CH3 O
SO
氨苄西林
青霉烷砜
❖ 舒它西林(Sultamicilin)的设计
氨苄
西林(Ampicilin)是半合成β-内酰胺类广谱抗生素。
由于其耐酸可用于口服而广泛用于临床。但研究
清楚先导化合物的性质 明确优化目的,确定优化目标
制定具体路线
优化前的 准备工作
2、优化的准则
(1)准确利用最小修饰原则 (2)灵活运用与先导物相关的生物化学知识 (3)结果参数的应用与取代基的选择 (4)从经济和快速角度考虑
另外,对于光学异构体的药物(包括外消旋体和单一 对映体),一般只有在进行了药理、毒理和临床研究后才 能决定那一种更好,Soudijin认为如果分子中既不存在不 对称中心或不对称面,又有类似亲和力的药物,将会大幅 度地减少研究工作量,就是说如果能够去掉手性中心又保 持活性将是最佳设计。实际上,非对称性并不是活性绝对 必需的 。
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