琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段
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2.实验原理
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琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳是分离、鉴定和纯 化DNA片段的标准方法。该技术操作简便快捷,可以分辨用其他 text1 text2 text3 方法(如密度梯度离心法)无法分离的DNA片段。用低浓度的嵌 入式荧光染料溴乙锭(EB以确定DNA片段在凝胶中的位置。聚丙烯酰胺凝 胶电泳分离1kb以下的小片段DNA效果较好,甚至可以分辨相差 1bp的DNA片段。聚丙烯酰胺凝胶电泳速率快,容量相对较大,采 用垂直装置进行电泳,但制备和操作比琼脂糖凝胶电泳困难,常 用于核酸的序列测定。琼脂糖凝胶电泳的分辨率比聚丙烯酰胺凝 胶电泳低,但其分离范围广,不同浓度的琼脂糖凝胶电泳可分离 DNA片段的范围为200bp~50kb,通常在水平装置上进行,操作简 便。
WARNING
(2)紫外光对眼睛有害, 观察电泳结果时最好戴上 防护镜或眼镜,或隔着玻 璃或有机玻璃观察。
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6.思考题
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简述琼脂糖凝胶和EB染料 在电泳分离DNA中的作用。
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3.仪器与试剂
仪器
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试剂
(1)0.5 × TBE 电泳缓冲液:54g
(1)天平 (2)电炉 (3)制胶槽 (4)电泳仪 (5)电泳槽 (6)荧光成像仪 (7)移液枪
Tris、27.5g硼酸、3.72g二水合EDTA 二钠盐,用水定容至1000mL。使用 时稀释10倍。 (2)EB溶液:称取EB溶于无菌水 中,母液浓度1mg/mL,4℃避光保 存。
4.实验步骤
(5)开启电源开关,接通电泳槽和电泳 仪,注意DNA向正极移动,加样端要接负 极。调节电泳电压为100V。在电泳途中 可用紫外灯直接观察,DNA各条区带分开 后,电泳结束。
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5.注意事项
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(1)EB为强致癌物,注意 避免接触皮肤,使用时一定 要戴手套。
4.实验步骤
(3)室温下放置30~40min,使凝胶完全 凝固后,加入少量0.5×TBE电泳缓冲液 ,小心拔出梳子,将胶膜放入电泳槽中 (注意加样端接负极),加入适量0.5× TBE电泳缓冲液,使液面高出胶面约1mm
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4.实验步骤
(3)相对分子质量标准(100bp, DNA标准物)
(4)6 × 点样缓冲液(0.25%溴酚 蓝,400g/L蔗糖) (5)琼脂糖 (6)扩增好的毛囊DNA样品
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4.实验步骤
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(1) 溶解
(2) 制胶
(3) 装配
(4) 点样
(5) 电泳
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(4)用移液枪取10μL PCR扩增样品和2μL点 样缓冲液混匀,用移液枪将样品加入凝胶的加 样孔中,注意枪头不可穿透孔底。另取10μL 相对分子质量标准液(已和加样缓冲液混匀) ,同法加样至另一泳道的加样孔。记录样品点 样顺序(泳道)与点样量。
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琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段
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琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段
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实验目的
实验原理 仪器与试剂 实验步骤 注意事项
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1.实验目的
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学习用琼脂糖凝胶电泳检测DNA 的纯度、浓度、构型及其相对分子质量 大小的方法。
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4.实验步骤
(1) 称取0.4g琼脂糖于150mL三角瓶中,加 入20mL 0.5×TBE电泳溶液,置电炉上加热溶 解(注意要经常晃动,避免过热溢出!),制 成2%琼脂糖溶液。 琼脂糖
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4.实验步骤
(2)将琼脂糖溶液冷却 至60℃左右,加入5μL浓 度为1mg/mL的EB溶液(戴 手套!),摇匀,立即小 心倒入准备好的胶模槽中 (已插好梳子),使琼脂 糖溶液在槽中的厚度为 3~5mm,排除梳齿上的气 泡(一般轻轻抖动梳子或 用小针头挑一下即可)。
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