第七章 外源基因在酵母菌中的表达
外源基因在酵母体系中表达
C.albicans hyphal n.r cell wall Ag
Spinach
2
phosphoribulokinase
S/Mut+ Halaas, et al (1995)
Shiba, et al (1995)
S/Mut+
S/Mut+, S/MutS( 30,000 copies/c ell) S/MutS
fragment C
Pertusis
3
antigen P69
Mouse EGF 0.45
Aprotinin 0.8
Kunitz
1
protease
inhibitor (A-
beta-PP)
Human
4
serum
albumin(HS
A)
HIV-1
1.25
gp120
and
0.02
I/Mut+ and Muts I/Muts S/Muts S/Mut+/Muts S/Mut+
第一代酵母基因工程表达系统是以酿酒酵 母表达系统为典型代表。
第二代酵母基因工程表达系统的典型代表 就是近年来倍受关注的毕赤酵母表达系统 等为代表的甲醇酵母表达系统:
1987年Cregg等首次报道甲醇营养型毕 赤酵母(Methy1otrophic Pichia pastoris)表达 外源蛋白以来,由于它具有表达效率高, 遗传稳定,产物可分泌表达等优点,己成 为近年来极受青睐的真核基因表达系统。
S:284
ds Fv (di-sulfide-bonded n.r S/n.r Luo, et al (1995), J.
single chain antibodies) n.r
甲醇酵母系统表达的影响因素
酵母菌对外源基因的表达也和外源基因密码子的选用有关。
了解表达系统宿主在密码子使用上的偏爱性对从翻译水平分析基因表达的规律有重要意义,也可为改造外源基因或改造宿主细胞提供依据。
如果外源基因密码子中存在过多的宿主低利用密码子,位于起始密码子附近的低利用密码子对基因的表达就会产生很大影响。
解决这一问题的方法有2种:一是通过点突变的方法用同义高利用率密码子替代低利用密码子而不改变氨基酸序列;另一方法是截取基因中影响其生物活性的部分。
目前,这些方法在甲醇酵母表达系统中都能提高表达水平。
外源蛋白的空间构象、糖基化位点、水溶特性、氨基酸组成以及其他的理化特点都会影响毕赤酵母对其分泌,所以应根据外源蛋白自身的理化特点来选择胞内表达或分泌型表达方式。
外源基因在酵母基因组中的整合数也可以影响外源基因的表达水平,应该选用高拷贝整合来提高外源基因的表达水平。
2、表达框的染色体整合位点和方式虽然相对于自主复制载体来讲,整合性载体的转化率较低,但由于Pp没有天然质粒,所以设计表达载体偏向于染色体整合,通过同源重组,载体整合到细胞染色体中间。
整合性载体具有表达框稳定和可控制整合位点等优越性,并且能够发生多位点整合而获得多拷贝。
AOX1和组氨酸脱氢酶(histidinol dehydrogenase,HIS4)基因位点都已被成功用于表达外源蛋白。
Sreekrishna等注意到his基因座的lacZ表达框偶有缺失。
这种缺失源于表达框中his4染色体突变拷贝与完好的his4基因的基因转换。
因此,看起来aox1位点是较为理想的位点。
3、宿主的甲基营养表型:Mut+或Muts用末端与aox1基因5'和3'端同源的线性DNA转化Pp HIS4菌株可导致Mx1结构基因的特异性剔除。
aox1基因缺失的酵母在甲醇限制性培养基上生长缓慢(methanol utilization slow , MutS或Mut-),它们只能利用弱的aox2基因启动合成aox2基因启动合成AOX;而aox1基因完整的酵母则生长正常(Mut+)。
生物制药试题
1.生物技术的核心和关键是(基因工程)2.20世纪40年代,第二次世界大战的爆发,急需疗效好、毒副作用小的抗细菌感染药物,(青霉素 )的出现标志着现代生物技术的开始。
3.1982 年FDA 批准了第一个基因工程药物是重组人工胰岛素4.2003年我国成功研制出了(重组腺病毒p53注射液),成为世界上第一个正式批准的基因治疗药物。
5.1953年美国Watson和英国的Crick共同提出了DNA的双螺旋结构,从而揭开了生命科学划时代的一页,标志着现代生物技术阶段的开始。
(对)6.基因工程药物包括正确答案: ACDA. 单克隆抗体B. 结晶牛胰岛素D. 重组蛋白E. 血液制品7.基因工程操作过程中的四大要素()()()()正确答案:目的基因载体工具酶受体细胞8.真核生物目的基因的获得有哪些方法正确答案: ABDA. 化学合成B. 反转录法C. 直接提取D. RT-PCR9.腺病毒载体疫苗采取接种(单)针?10.中国什么时间正式加入“新冠肺炎疫苗”实施计划(2020年10月8日)11.注射用贝利尤单抗是第一个用于治疗(系统性红斑狼疮)的药物。
12.注射用贝利尤单抗能否通过静脉助推迅速给药?(√)13.贝利尤单抗是首个作用于(B淋巴细胞刺激因子)的抑制剂。
14.以下不属于基因工程抗体的优点的是( A)。
A. 基因工程抗体的分子量较大B. 产量多C. 可制备人源性抗体D. 可通过基因工程技术改造15. 以下哪种抗体不属于基因工程抗体( 鼠源性单克隆抗体)A. 人鼠嵌合抗体B. 改型抗体C. 鼠源性单克隆抗体D. 小分子抗体16. 关于单克隆抗体描述下哪项是错误的(D. 具有多种生物学功能)。
A. 特异性强B. 纯度高C. 高度的均一性和可重复性D. 具有多种生物学功能17. 人鼠嵌合抗体是指(将鼠源抗体可变区与人抗体恒定区融合形成的抗体)。
18.将特异性不同的两个小分子抗体连接在一起则得到是(双特异性抗体)。
外源基因在酵母菌中表达讲义课件
• UBI 4 编码泛素五聚体对数生长期关闭稳定期表达
酵母菌共有七个泛素连接酶基因:
• UBC 1、UBC 2、UBC 3、UBC 4、UBC 5、UBC 6、UBC 7
•外源基因在酵母菌中表达讲义
•8
减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌
泛素降解途径衰减的酿酒酵母
• UBI 4缺陷型: 在酿酒酵母菌中,泛素主要由UBI 4基因表达,UBI 4-突变
•外源基因在酵母菌中表达讲义
•12
酵母菌克隆表达质粒的构建
含有ARS的YRpp质粒的构建 • ARS为酵母菌中的自主复制序列,0.8-1.5kb,染色体
上每30-40kb就有一个ARS元件。酵母菌自主复制型
质粒的构建组成包括复制子、标记基因、提供克隆 位点的大肠杆菌质粒DNA。
以ARS为复制子的质粒称为YRp
•外源基因在酵母菌中表达讲义
•27
酵母菌表达系统的选择
酿酒酵母表达系统 • 酿酒酵母的基因表达系统最为成熟,包括转录活性
较高的甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因GAPDH、磷酸甘油 激酶基因PKG、乙醇脱氢酶基因ADH所属的启动子,
多种重组外源蛋白获得成功表达。 • 酿酒酵母表达系统的最大问题在于其超糖基化能力,
基因工程受体系统(Generally Recognized As Safe GRAS) • 酵母菌是最简单的真核模式生物
•外源基因在酵母菌中表达讲义
•2
酵母菌的宿主系统
提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌 抑制超糖基化作用的突变宿主菌 减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌 广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌
列HARS已被克隆,并用于构建克隆表达载体,但与
巴斯德毕赤酵母相似,这种载体在受体细胞有丝分
外源基因在酵母菌中表达讲义
酵母菌的宿主系统
• • • • 提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌 抑制超糖基化作用的突变宿主菌 减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌 广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌
广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌
目前已广泛用于外源基因表达和研究的酵母菌包括: • 酵母属如酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) • 克鲁维酵母属如乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactis) • 毕赤酵母属如巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris) • 裂殖酵母属如非洲酒裂殖酵母(Schizosaccharoyces pombe) • 汉逊酵母属如多态汉逊酵母(Hansenula polymorpha) 其中酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽,但巴斯 德毕赤酵母表达外源基因最理想。
减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌
泛素降解途径衰减的酿酒酵母 • UBI 4缺陷型: 在酿酒酵母菌中,泛素主要由UBI 4基因表达,UBI 4-突 变株能正常生长,但细胞内游离泛素分子的浓度比野生株 要低得多,因此UBI 4缺陷突变株是外源基因表达理想的 受体 • UBA 1缺陷型: UBA1编码泛素激活酶E1,UBA1突变株是致死性的,但 其等位基因缺陷是非致死性的,而且也能削弱泛素介导的 蛋白降解 • Ubc4 - ubc5 双突变型: 七个泛素连接酶基因的突变对衰减蛋白降解作用同样有效
酵母菌的转化程序
酵母菌原生质体转化法 • 早期酵母菌的转化都采用在等渗缓冲液中稳定的 原生质体转化法,在Ca2+和PEG的存在下,转化 细胞可达原生质体总数的1-2%。 • 但该程序操作周期长,而且转化效率受到原生质 再生率的严重制约 • 原生质体转化法的一个显著特点是,一个受体细 胞可同时接纳多个质粒分子,而且这种共转化的 原生质体占转化子总数的25-33%
第七八章-外源基因的表达及其优化策略20201112
略 稳定性 翻 译 的
培养基 环境因素对 受体菌生长 的影响
终止
诱导时间和
密码子
诱导剂量
的选择
第三节 外源基因在真核细胞中的表达
一 、真核生物基因表达与调控的特点
一 、真核生物基因表达与调控的特点
二 、真核生物基因表达载体的组成特征
基因组DNA的存在形式可影响基因表达 原核DNA序列
转录与翻译不偶联
启动子
调控是多层次的 具有组织和细胞类型特异性
增强子 终止子 内含子 选择标记基因,
对信号分子反应不同
PloyA加尾信号
第三节 外源基因在真核细胞中的表达
二、真核生物基因表达载体的组成特征
第三节 外源基因在真核细胞中的表达
根据启动子的功能和作用方式不同,真核基因的表达载体 的启动子可以分为几种类型,每一种类型的优缺点是什么? 三、真核表达的受体系统 按照宿主细胞的不同,常用外源基因的真核受体系统可大 致分为酵母、职务、昆虫和哺乳动物等受体系统。 每种受体的系统的特征如下表:
原核生物基因表达一般以操纵子为单位 启动子特征:作用要强;必须表现最低水平的基础转录活性;启动
子具有简便和廉价的可诱导性
原核生物只有一种RNA聚合酶,识别原 特征:SD序列与起始密码子的间距对翻译起始效率影响较大;
核生物的启动子,催化所有RNA的合成 mRNA-rRNA的互补区域越长,基因翻译的概率越大;SD序列与起始
第八章 外源基因表达产物的分离纯化
四 、合适分离纯化介质的选择 1 、分离纯化蛋白质的材料 理想的蛋白质分离纯化应具有以下几个方面的性质: 对目标蛋白具有较高的分离效率;在分离纯化过程中不 会造成目标蛋白的变性;化学性能和机械性能稳定,重 复性好;价格低廉,成本低。
酵母菌表面展示基因的构建和转化
酵母菌表面展示基因的构建和转化酵母菌表面展示基因是一种常用的蛋白表达技术,通过将外源基因插入酵母菌表面展示基因载体中,使其能够在酵母菌细胞表面表达并展示出来。
这一技术可以应用于酵母菌的蛋白质工程和药物筛选等领域。
本文将介绍酵母菌表面展示基因的构建和转化流程。
一、酵母菌表面展示基因的构建1. 选择适合的酵母菌表面展示基因载体。
常用的载体有pCTCON2、pCTPAS2等,这些载体含有表面展示基因所需的信号序列和适当的启动子。
2. 选择合适的启动子和信号序列。
启动子决定了表达基因的强弱,信号序列决定了基因能否正确的表达在酵母菌细胞表面。
3. 将目标基因插入载体中。
可以使用PCR方法扩增目标基因或通过合成基因片段插入载体中。
注意选择合适的引物设计和错配扩增条件。
4. 确认基因插入正确。
可用酶切鉴定、测序和限制性片段长度多态性(RFLP)分析等方法进行确认。
二、酵母菌表面展示基因的转化1. 构建表达酵母菌表面展示基因的受体菌株。
选择合适的酵母菌株,如Saccharomyces cerevisiae。
构建基因敲除/插入的方法可以用来降低背景信号和增加基因表达效率。
2. 转化酵母菌。
可采用化学转化、电击转化或基因枪等方法。
注意转化体系的优化,如转化时间、转化剂的浓度和pH值等因素。
3. 选择性培养和筛选。
转化后的酵母菌需在含所需选择因子的培养基上进行培养,并去除未转化的酵母菌。
可利用选择性培养基或对抗物质的添加进行筛选。
4. 筛选高表达菌株。
通过检测表面展示蛋白的活性、测定蛋白产量或使用特异性抗体等方法进行筛选。
三、酵母菌表面展示基因的应用1. 酵母细胞表面展示蛋白质工程。
通过酵母菌表面展示基因技术可以进行蛋白质工程研究,可以展示和表达各种蛋白质、抗体、酶、蛋白质片段等物质,以便进行蛋白质相互作用研究、蛋白质功能分析等。
2. 药物筛选。
通过酵母细胞表面展示基因的技术,可以用来筛选化合物对目标蛋白的结合能力、激活能力或抑制能力。
基因工程-外源基因在酵母菌中的表达
基因工程刘夫锋2019.11.27基因工程5 2 3 4 1 6789重组DNA 技术与基因工程的基本概念重组DNA技术与基因工程的基本原理重组DNA技术所需的基本条件重组DNA技术的操作过程目的基因的克隆与基因文库的构建外源基因在大肠杆菌中的表达外源基因在酵母菌中的表达外源基因在哺乳动物细胞中的表达外源基因表达产物的分离纯化7.1酵母菌作为表达外源基因受体菌的特征7 外源基因在酵母菌中的表达酵母菌的分类学特征酵母菌(Yeast )是一群以芽殖或裂殖方式进行无性繁殖的单细胞真核生物,分属于子囊菌纲(子囊酵母菌)、担子菌纲(担子酵母菌)、半知菌类(半知酵母菌),共由56个属和500多个种组成。
如果说大肠杆菌是外源基因最成熟的原核生物表达系统,则酵母菌是最成熟的真核生物表达系统。
7.1 酵母菌作为表达外源基因受体菌的特征7 外源基因在酵母菌中的表达酵母菌表达外源基因的优势全基因组测序,基因表达调控机理比较清楚,遗传操作相对简单能将外源基因表达产物分泌至培养基中具有原核细菌无法比拟的真核蛋白翻译后加工系统大规模发酵历史悠久、技术成熟、工艺简单、成本低廉不含有特异性的病毒、不产内毒素,美国FDA 认定为安全的基因工程受体系统,食品工业有数百年历史酵母菌是最简单的真核模式生物7.2 酵母菌的宿主系统7 外源基因在酵母菌中的表达7.2.2提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌7.2.3 抑制超糖基化作用的突变宿主菌7.2.4 减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌7.2.1 广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌7.2.1 广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌目前已广泛用于外源基因表达和研究的酵母菌包括:酵母属如酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae )克鲁维酵母属如乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactis )毕赤酵母属如巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris )裂殖酵母属如非洲酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe )汉逊酵母属如多态汉逊酵母(Hansenula polymorpha )裂殖酵母属如粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe )如解脂耶氏酵母(耶氏酵母属Yarrowia lipolytica )如腺嘌呤阿氏酵母(阿氏酵母属Arxula adeninivorans )其中芽殖型酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽。
课程标准
《基因工程》课程标准课程编号:09060281课程类别:必修课程学时:56(理论32,实验24)学分:3学分一、课程的性质和任务基因工程是获取、整理、破译、编辑和表达生物体遗传信息(基因)的一种操作平台与技术,它以细胞生物学、分子生物学和分子遗传学的基本理论体系为指导,在基因的分离克隆、基因表达调控机制的诠释、基因编码产物的产业化、生物遗传性状的改良乃至基因治疗等方面正日益显示出愈来愈高的实用价值。
本课程的主要内容为基因工程概论、分子克隆单元操作、大肠杆菌基因工程、真菌基因工程、昆虫基因工程、高等动物基因工程、高等植物基因工程、蛋白质工程等,将DNA重组技术归纳为切、接、转、增、检五大基本操作单元,进而按照受体细胞的生物学分类,逐一展开各系统基因工程的原理和应用。
重点讲述基因工程技术应用的策略和思路,并力求以图解的方式取代繁琐的描述。
本课程全程采用多媒体教学手段进行。
根据本科教学加强基础、注重素质、整体优化的原则,本门课程旨在为学生讲述基因工程的基本原理、单元操作与应用策略,学生学好本门课程可为从事生物、农业、环保、医药领域的研究与应用开发工作打下良好基础。
具体任务是:(一)熟悉和掌握基因工程基本概念、基本原理、基本技术和典型设备。
(二)学会根据生产、科研要求和技术选择分子操作的技术和设备。
(三)了解基因工程在各领域的应用、新的知识与技术,了解其最新研究成果和发展状态。
二、本课程的基本内容:第一章基因工程概论(一)教学目的与要求掌握基因工程的含义和主要内容以及基因工程诞生的理论基础与技术突破。
了解基因工程的发展和在社会生产中的应用和安全性的问题。
(二)教学重点与难点1.教学重点:基因工程的含义;基因工程诞生的理论基础与技术突破。
2.教学难点:基因工程诞生的理论基础与技术突破。
(三)课时安排2课时(四)教学内容1. 基因工程的基本概念2. 基因工程的的发展简史3. 基因工程技术研究的主要内容第二章DNA重组克隆的单元操作(一)教学目的与要求掌握载体的基本结构和质粒载体、噬菌体载体的特点、构建原理;掌握限II型制性核酸内切酶的切割原理和部分常用的限制性核酸内切酶的识别位点与切割末端。
影响外源基因在巴斯德毕赤酵母中的表达
影响外源基因在巴斯德毕赤酵母中的表达摘要要在一种宿主表达系统中成功表达外源蛋白并获得较高产量,必须要较为全面地了解影响其表达的诸多因素。
影响外源基因在巴氏毕赤酵母中表达的因素主要包括:外源基因的特性、表达框的染色体整合位点和方式、宿主菌的甲醇利用表型、基因剂量、分泌信号、产物稳定性和翻译后修饰等。
本文就这些因素进行分析,并提出一定的对策和建议。
酵母菌是单细胞真核生物,具有生长快、易于遗传操作、能对外源蛋白进行翻译后加工和修饰、不产生有毒产物等特点,被认为是表达外源蛋白的合适宿主。
几种工业酵母尤其是巴氏毕赤酵母(pichia pastoris, Pp),因具有旺盛的生长力以及其它一些独特的性质,已发展成为较成熟的蛋白生产的表达系统。
已有许多细菌、真菌和高等动植物的基因在Pp中成功表达(如破伤风毒素片段C,12g/L),但也有许多蛋白的表达量并不理想(如多瘤病毒大T抗原,0.5mg/L),甚至不能表达(如HIV表面糖蛋白)。
另外,酵母表达系统的局限性还在于分泌产物的不均一性,包括聚合体的存在、信号肽加工不完全以及内部降解等现象。
所有这些都提醒我们在Pp中表达外源蛋白时,应周密考虑影响其表达的各个因素。
1、外源基因特性外源基因在Pp中表达时,其自身就是影响表达水平的重要因素。
不同的培养基配方、发酵参数和饲养方案主要是通过提高细胞绝对总数而并非单个细胞产率来提高外源蛋白的产量。
Fahnestock等发现随着外源的蛛牵拉丝蛋白基因拷贝数的增加,其生产效率会相对有所降低。
另外,许多高A+T含量的基因常会由于提前终止而不能有效转录引;不合适的mRNA5'非翻译区的核苛酸序列和长度也可能会便基因的表达不尽如人意。
提前终止被认为是一种具有种属特异性的现象,譬如在Pp中不能表达的HIV ENV蛋白在啤酒酵母中却表达良好。
因此,可以通过调整高A+T含量区的核甘酸组成来避免提前终止的发生。
而Sreekrishna 等通过调整人血清白蛋白(human serum albumin,HSA)的mRNA5'非翻译区与醇氧化酶(alcohol oxidase 1,AOX1)的5'非翻译区相同后,HSA的表达量可以提高50倍以上。
酵母菌的基因工程
提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌
能导致酿酒酵母中重组蛋白产量提高或质量改善的突变类型
突变类型 生物效应 改善重组蛋白分泌 提高重组蛋白表达 提高重组蛋白表达 作用位点 钙离子依赖型的ATP酶 转录后加工 转录水平
ssc1 ssc2 rgr1
ose1
ssc11 rho-
提高重组蛋白表达
改善重组蛋白分泌 提高重组蛋白表达
酵母菌表达系统的选择
多型汉逊酵母表达系统
多型汉逊酵母也是一种甲基营养菌。其自主复制序列HARS已被
克鲁维酵母属 如乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactis)
毕赤酵母属
裂殖酵母属
如巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)
如非洲酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)
汉逊酵母属
如多态汉逊酵母(Hansenula polymorpha)
其中酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽,但巴斯德毕赤酵母 表达外源基因最理想。
酵母菌克隆表达质粒的构建
含有ARS的YRp质粒的构建
ARS为酵母菌中的自主复制序列,0.8-1.5kb,染色体上每30-40kb
就有一个ARS元件。酵母菌自主复制型质粒的构建组成包括复制子、标 记基因、提供克隆位点的大肠杆菌质粒DNA。 以ARS为复制子的质粒称为YRp 以2m质粒上的复制元件为复制子的质粒称为YEp 上述两类质粒在酿酒酵母中的拷贝数最高可达200个,但培养几代 后,质粒的丢失率高达50%-70%,主要是由于分配不均匀所致。
酵母菌启动子的可控性
温度控制型启动子
a – a 型启动子:
酿酒酵母有a和a两种单倍 体,分别由MATa和MATa hmla2-102 35℃ Sir3-8TS a2 a1 a 型启动子 MATa 25℃ 受体细胞基因组 Sir3-8TS a1 a 型启动子 重组质粒
外源基因在酵母体系中表达90页文档
38、若是没有公众舆论的支持,法律 是丝毫 没有力 量的。 ——菲 力普斯 39、一个判例造出另一个判例,它们 迅速累 聚,进 而变成 法律。 ——朱 尼厄斯
40、人类法律,事物有规律,这是不 容忽视 的。— —爱献 生
6、最大的骄傲于最大的自卑都表示心灵的最软弱无力。——斯宾诺莎 7、自知之明是最难得的知识。——西班牙 8、勇气通往天堂,怯懦通往地狱。——塞内加 9、有时候读书是一种巧妙地避开思考的方法。——赫尔普斯 10、阅读一切好书如同和过去最杰出的人谈话。——笛卡儿
基因工程 第七章 酵母基因表达体系(55P)
酵母菌的宿主系统 1. 广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌 2. 提高重组异源蛋白产率的诱变宿主菌 3. 抑制超糖基化作用的突变宿主菌 4. 减少泛蛋白因子依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌
第六页,编辑于星期三:四点 七分。
广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌
目前已广泛用于外源基因表达的研究的酵母菌包括:
第二十三页,编辑于星期三:四点 七分。
• 酵母复制型质粒来源于大肠杆菌质粒pBR322。 同时加入了一段酵母染色体的自主复制序列。 这种质粒一般不会与酵母染色体发生重组,它 转化酵母的转化率很高,但是不能稳定遗传。
第二十四页,编辑于星期三:四点 七分。
• 酵母着丝粒质粒:来源于酵母染色体的着丝 粒周围的leu2和cdc10之间的一段1.6kb的序 列。带有此着丝粒序列的质粒在酵母中的行 为类似一微型染色体,它可以稳定遗传,并 均匀地分配到子代细胞中,同时在宿主细胞 中的拷贝数很低。
特异性的重组酶,这个酶可以催化反向重复序列之间的遗传重 组。
• 酵母附加型质粒就是在这种质粒的基础上,加入酵母核
DNA序列,以及大肠杆菌pMB9的部分序列组成。故其既可 以在酵母中复制,又可以在大肠杆菌中复制。
第二十二页,编辑于星期三:四点 七分。
• 酵母菌中天然存在的自主复制型质粒并不多, 而且相当一部分野生型质粒是隐蔽型的,因 此目前用于外源基因克隆和表达的载体质粒 都是由野生型质粒和宿主染色体DNA上的自 主复制子结构(ARS)、中心粒序列(CEN)、 端粒序列(TEL)以及用于转化子筛选鉴定的 功能基因构建而成。
第二十一页,编辑于星期三:四点 七分。
• 酵母附加型质粒来源于野生型的酵母质粒,这种质粒存在 于很多啤酒酵母株系中,功能不祥。但有一个重要特点 是,该质粒被一段长度约为599bp的反向重复序列分为 两个部分,每一个部分都含有一个启动子和该启动子控
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生物技术专业核心课程基因工程华东理工大学张惠展基因工程523416789重组DNA 技术与基因工程的基本概念重组DNA 技术与基因工程的基本原理重组DNA 技术所需的基本条件重组DNA 技术的操作过程目的基因的克隆与基因文库的构建外源基因在大肠杆菌中的表达外源基因在酵母菌中的表达外源基因在哺乳动物细胞中的表达外源基因表达产物的分离纯化7外源基因在酵母菌中的表达A 酵母菌作为表达外源基因受体菌的特征B 酵母菌的宿主系统C 酵母菌的载体系统D 酵母菌的转化系统E 酵母菌的表达系统F 利用重组酵母生产乙肝疫苗A 酵母菌作为表达外源基因受体菌的特征酵母菌的分类学特征酵母菌(Yeast)是一群以芽殖或裂殖方式进行无性繁殖的单细)是一群以芽殖或裂殖方式进行无性繁殖的单细胞真核生物,分属于子囊菌纲(子囊酵母菌)、担子菌纲(担子酵母胞真核生物,分属于子囊菌纲(子囊酵母菌)、担子菌纲(担子酵母菌)、半知菌类(半知酵母菌),共由56个属和500多个种组成。
如菌)、半知菌类(半知酵母菌),共由果说大肠杆菌是外源基因最成熟的原核生物表达系统,则酵母菌是最成熟的真核生物表达系统。
A 酵母菌作为表达外源基因受体菌的特征酵母菌表达外源基因的优势全基因组测序,基因表达调控机理比较清楚,遗传操作简便具有原核细菌无法比拟的真核蛋白翻译后加工系统大规模发酵历史悠久、技术成熟、工艺简单、成本低廉能将外源基因表达产物分泌至培养基中不含有特异性的病毒、不产内毒素,美国FDA认定为安全的基因工程受体系统(Generally Recognized As Safe GRAS)酵母菌是最简单的真核模式生物7外源基因在酵母菌中的表达B 酵母菌的宿主系统广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌抑制超糖基化作用的突变宿主菌减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌目前已广泛用于外源基因表达和研究的酵母菌包括:酵母属如酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)如酿酒酵母(克鲁维酵母属如乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactis)如乳酸克鲁维酵母(毕赤酵母属如巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)如巴斯德毕赤酵母(裂殖酵母属如非洲酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)如非洲酒裂殖酵母(汉逊酵母属如多态汉逊酵母(Hansenula polymorpha)如多态汉逊酵母(其中酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽,但巴斯德毕赤酵母其中酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽,但巴斯德毕赤酵母表达外源基因最理想。
提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌能导致酿酒酵母中重组蛋白产量提高或质量改善的突变类型ssc1改善重组蛋白分泌钙离子依赖型的ATP酶ssc2提高重组蛋白表达转录后加工rgr1提高重组蛋白表达转录水平ose1提高重组蛋白表达转录水平ssc11改善重组蛋白分泌羧肽酶Y-rho-提高重组蛋白表达转录水平突变类型生物效应作用位点抑制超糖基化作用的突变宿主菌能抑制超糖基化的突变类型mnn 甘露糖生物合成缺陷型alg 天门冬酰胺侧链糖基化缺陷型och 外侧糖链添加缺陷型突变类型生物效应许多真核生物的蛋白质在其天门冬酰胺侧链上接有寡糖基团,它们常常影响蛋白质的生物活性。
整个糖单位由糖基核心和外侧糖它们常常影响蛋白质的生物活性。
整个糖单位由糖基核心和外侧糖链两部分组成。
链两部分组成。
酵母菌普遍拥有蛋白质的糖基化系统,但野生型酿酒酵母对异源蛋白的糖基化反应很难控制,呈超糖基化倾向,因此超糖基化缺陷株非常重要。
减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌泛素介导的蛋白质降解作用蛋白酶体Lys HOOC Ubiquitin 76 aaubiquitin ligase E3Lysubiquitin ligase E3Lys 靶蛋白靶蛋白靶蛋白酵母菌泛素依赖型蛋白降解系统的编码基因酵母菌共有四个泛素编码基因:UBI 1编码泛素-羧基延伸蛋白52(CEP52)对数生长期表达稳定期关闭编码泛素UBI 2编码泛素-羧基延伸蛋白52(CEP52)对数生长期表达稳定期关闭编码泛素UBI 3编码泛素-羧基延伸蛋白76(CEP76)对数生长期表达稳定期关闭编码泛素UBI 4编码泛素五聚体对数生长期关闭稳定期表达编码泛素五聚体对数生长期关闭酵母菌共有七个泛素连接酶基因:UBC 1、UBC 2、UBC 3、UBC 4、UBC 5、UBC 6、UBC 7泛素降解途径衰减的酿酒酵母UBI 4缺陷型:在酿酒酵母菌中,泛素主要由UBI 4基因表达,UBI 4-突变株能正常生长,但细胞内游离泛素分子的浓度比野生株要低得多,因此UBI 4缺陷突变株是外源基因表达理想的受体UBA 1缺陷型:UBA1编码泛素激活酶E1,UBA1突变株是致死性的,但其等位编码泛素激活酶基因缺陷是非致死性的,而且也能削弱泛素介导的蛋白降解Ubc4 -ubc5 双突变型:七个泛素连接酶基因的突变对衰减蛋白降解作用同样有效7外源基因在酵母菌中的表达C 酵母菌的载体系统酵母菌中的野生型质粒酵母菌克隆表达质粒的构建酵母菌中的野生型质粒酿酒酵母中的2µ环状质粒几乎所有的酿酒酵母中都含有2µ双链同源重组REP1REP1RAF RAF STB STB ori REP2REP2FLP FLP IR IR IR IR A B 环状质粒,拷贝数达50至100个。
IRs 反向重复序列,600 bp ,重组FLP 编码产物驱动IRs 的同源重组REP 编码产物控制质粒的稳定性STB REP 的结合位点接合酵母属中的pSR1和pSB1,以及克鲁维酵母属中的pKD1等均与2µ质粒类似。
酵母菌中的野生型质粒乳酸克鲁维酵母中的线状质粒乳酸克鲁维酵母中含有两种不同pGKL1 8.9 kbDNA聚合酶毒素蛋白αβ 免疫蛋白γ 亚基的双链线状质粒pGKL1和pGKL1拷贝数为50-100个,分别携带K1K2两种能使多种酵母菌致死的毒反向重复序列素蛋白编码基因(α β γ),同时含有毒素蛋白抗性基因。
酵母菌克隆表达质粒的构建含有ARS的YRp质粒的构建ARS为酵母菌中的自主复制序列,0.8-1.5kb,染色体上每30-40kb元件。
酵母菌自主复制型质粒的构建组成包括复制子、标就有一个ARS元件。
酵母菌自主复制型质粒的构建组成包括复制子、标记基因、提供克隆位点的大肠杆菌质粒记基因、提供克隆位点的大肠杆菌质粒DNA。
以ARS为复制子的质粒称为YRp上述两类质粒在酿酒酵母中的拷贝数最高可达200个,但培养几代以2µ质粒上的复制元件为复制子的质粒称为YEp后,质粒的丢失率高达50%-70%,主要是由于分配不均匀所致。
酵母菌克隆表达质粒的构建含有CEN的YCp质粒的构建CEN为酵母菌染色体DNA上与染色体均匀分配有关的序列将CEN DNA插入含ARS的质粒中,获得的新载体称为YCpYCp质粒具有较高的有丝分裂稳定性,但拷贝数只有1 -5个含有TEL的YAC质粒的构建酵母菌克隆表达质粒的构建含有酵母菌染色体DNA同源序列的YIp质粒的构建在大肠杆菌质粒上组装酵母菌染色体DNA特定序列和标记基因,构建出来的质粒称为Yip。
目的基因表达盒通常插在染色体DNA特定序列中,这样目的基因就能高效整合入酵母菌特定的染色体DNA区域7外源基因在酵母菌中的表达D 酵母菌的转化系统酵母菌的转化程序转化质粒在酵母细胞中的命运用于转化子筛选的标记基因酵母菌的转化程序酵母菌原生质体转化法早期酵母菌的转化都采用在等渗缓冲液中稳定的原生质体转化法,在Ca2+和PEG的存在下,转化细胞可达原生质体总数的1-2%。
2+但该程序操作周期长,而且转化效率受到原生质再生率的严重制约原生质体转化法的一个显著特点是,一个受体细胞可同时接纳多个质粒分子,而且这种共转化的原生质体占转化子总数的25-33%酵母菌的转化程序碱金属离子介导的酵母菌完整细胞的转化酿酒酵母的完整细胞经碱金属离子(如Li+等)、PEG、热休克+处理后,也可高效吸收质粒DNA,而且具有下列特性:吸收线型DNA的能力明显大于环状DNA,两者相差80倍共转化现象极为罕见酵母菌的转化程序酵母菌电击转化法酵母菌原生质体和完整细胞均可在电击条件下吸收质粒DNA,但在此过程中应避免使用PEG,它对受电击的细胞具有较很大的负作用。
电击转化的优点是不依赖于受体细胞的遗传特征及培养条件适用范围广,而且转化率可高达105 / µg DNA。
适用范围广,而且转化率可高达 5转化质粒在酵母细胞中的命运单双链DNA均可转化酵母菌,但单链的转化率是双链的10-30倍含有复制子的单链质粒进入细胞后,能准确地转化为双链并复制不含复制子的单链质粒进入细胞后,能高效地同源整合入染色体这对于体内定点突变酵母基因组极为有利克隆在YIp整合型质粒上的外源基因,如果含有受体细胞的染色体DNA的同源序列,会发生高频同源整合,整合子占转化子总数的50-80%用于转化子筛选的标记基因用于酵母菌转化子筛选的标记基因主要有营养缺陷型互补基因和用于酵母菌转化子筛选的标记基因主要有营养缺陷型互补基因和显性基因两大类显性基因两大类营养缺陷型互补基因主要有氨基酸和核苷酸生物合成基因,如:LEU、TRP、HIS、LYS、URA、ADE但对于多倍体酵母来说,筛选营养缺陷型的受体非常困难营养缺陷型的互补基因用于转化子筛选的标记基因显性标记基因显性标记基因的编码产物只要是毒性物质的抗性蛋白标记基因编码产物遗传表型aph氨基糖苷转移酶抗G418cat氯霉素乙酰转移酶抗氯霉素dhfr二氢叶酸还原酶抗氨甲喋呤和磺胺cup1铜离子螯合物耐受铜离子suc2蔗糖转化酶耐受高浓度蔗糖ilv2乙酰乳糖合成酶抗硫酰脲除草剂7外源基因在酵母菌中的表达E 酵母菌的表达系统酵母菌启动子的可控性外源基因在酵母菌中表达的限制因素酵母菌表达系统的选择酵母菌启动子的可控性TSpho4TS-PHO5启动子:酿酒酵母PHO5启动子在培养基中游离磷酸盐耗尽时才能打开PHO4基因编码产物是PHO5启动子的正调控因子TS因此,装在pho4TS-PHO5启动子下游的外源基因在35℃时关闭23℃诱导表达温度控制型启动子TSPHO4温度敏感型突变基因pho4TS的编码产物在35℃时失活酵母菌启动子的可控性a –α 型启动子:变体,酿酒酵母有a 和α两种单倍体,分别由MAT a 和MAT α两个等位基因决定。
α1因子决定α细胞特征表达α2因子阻遏a 细胞特征表达a1-a2阻遏α细胞特征表达编码α2因子的基因突变型hml α2-102能产生α2变体,它能灭活a1,同时阻遏a 型温度控制型启动子a 型启动子2-102 MATahml α2-102 MATa a1TS Sir3-8TSα型启动子受体细胞基因组重组质粒a 型启动子2-102 MATahml α2-102 MATa a1TS Sir3-8TSα型启动子α2α125℃35℃酵母菌启动子的可控性酿酒酵母超诱导型启动子GAL1GAL1GAL7GAL7GAL10GAL10UASUAS GAL4GAL4GAL80GAL80半乳糖诱导效果不明显,基因基底水平表达GAL1GAL1GAL7GAL7GAL10GAL10UAS UAS GAL4GAL4GAL80GAL80半乳糖诱导时,GAL4高效表达,GAL1、GAL1、GAL10超高效表达GAL10GAL10Promoter Promoter 的半乳糖利用酶系由GAL1 GAL7和GAL10基因编码外源基因在酵母菌中表达的限制因素外源基因稳态mRNA的浓度外源基因mRNA的翻译活性酵母菌对密码子的偏爱性在酿酒酵母中,高丰度的蛋白质(如甘油醛-3-磷酸脱氢酶GAPDH、磷酸甘油激酶PKG、乙醇脱氢酶ADH)中96%以上的氨基酸是由25个密码子编码的酵母菌表达系统的选择酿酒酵母的基因表达系统最为成熟,包括转录活性较高的甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因GAPDH、磷酸甘油激酶基因PKG、乙醇脱氢酿酒酵母表达系统酶基因ADH所属的启动子,多种重组外源蛋白获得成功表达。