微阵列比较基因组杂交技术在产科领域推广说明
微阵列比较基因组杂交技术用于植入前胚胎非整倍体筛查的初步观察

吕永焕 宋学茹 鲁琳琳 赵晓徽 吕 睿 白晓红
天津医科 大学总医院妇产科 生殖中心( 3 0 0 0 5 2 )
摘
要 目的 : 探讨微 阵列 比较基 因组杂交 ( a C G H) 技术在植入前胚胎非整倍 体筛查 中的应 用。方法 : 选取 就诊于天
津医科大学总医院生殖 中心行体外受精 一胚胎移植患者冻存 的正常 8细胞胚胎 4枚 , 患者夫妇均 自愿捐献 冻存胚胎
6l 8
中国计划生育学杂志2 0 1 来自年 9月 第 2 1卷 第 9期
C h i
n J F a m P l a n n,Vo 1 . 21,No .9,S e p t e mb e r 2 0 1 3
・
技术与方法 ・
微 阵 列 比 较 基 因 组 杂 交 技 术 用 于 植 入 前 胚 胎 非 整 倍 体 筛
n,3 0 00 52
C o r r e s p o di n n g a u t h o r :B a i X i a o on h g,Ema i l :b x @1 6 3 . c o n
Ab s t r a c t O b j e c t i v e : T o e x p l o r e t h e a p p l i c a t i o n o f a r r a y c o m p a r a t i v e g e n o mi c h y b i r d i z a t i o n( a C G H)i n s c r e e n i n g a n e u p l o i d y
R e p r o d u c t i v e Me d i c a l C e n t e r , D e p a r t m e n t o f G y n a  ̄ c o l o g y a n d O b s t e t r i c s ,G e n e r a l H o s p i t a l o f T i a n i f n Me d i c a l U n i v e r s i t y ,T i a n 一
基因芯片在产前诊断中的应用进展
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基因芯片在产前诊断中的应用进展作者:于璐王琳琳来源:《中国现代医生》2013年第14期[摘要] 产前诊断是一种预防遗传病胎儿出生的主要途径,其最先进的诊断手段是基因诊断。
基因芯片技术应用于产前胎儿基因诊断,对提高人口素质具有重大意义。
基因芯片是近些年高新技术领域的重大研究进展,该技术综合了微电子学、物理学和分子生物学的技术原理和优势,现已成为人们准确获取相关信息的手段之一。
[关键词] 基因芯片;产前诊断;应用进展[中图分类号] R714.5 [文献标识码] A [文章编号] 1673-9701(2013)14-0021-02产前诊断是预防遗传病患儿出生的主要途径。
产前诊断的方法主要有B超等仪器检测胎儿外形、直接采取胎儿的组织或羊水检测及检测母体血液三大类,其中通过检测母体血液中部分胎儿基因的方法无疑是方便快捷且准确度高的可靠方法。
基因芯片是一种基础生物芯片技术,也称为DNA微阵列,是近些年高新技术领域的重大研究进展。
研究证实,基因芯片检测技术的灵敏度比核型分析高100多倍,它能准确检测出碱基对级染色体重复或缺失,尤其是染色体微缺失、重复综合征[1]。
有研究表明核型分析可导致由CNVs(染色体拷贝数异常)引起的疾病[2],所以,基因芯片检测方法是首选,它自动化程度非常高,现已开始广泛应用于产前诊断中,本文就产前诊断中基因芯片的应用情况进行详细论述。
1 基因芯片的发展与分类基因芯片的出现具有时代特征,是近些年高新技术领域的重大研究进展,该技术综合了微电子学、物理学和分子生物学的技术原理和优势,现已成为人们准确获取相关信息的手段之一。
基因芯片研制原理在于应用集成电路微阵列技术在固相支持物(硅片、玻璃、尼龙膜等)的表面规律性合成几万个不同基因的“探针”(也可液相合成探针后通过点样器规律地在固相支持物的表面点样),之后将待研究的样本中已经使用荧光物或同位素标记的DNA、RNA、cDNA与探针进行核酸互补杂交,最后利用聚焦显微镜或放射自显影扫描监测杂交信号并分析获取样品分子数量与序列信息,该技术可以一次分析检测大量核酸分子[3]。
2014年染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识
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染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用协作组目前,G 显带染色体核型分析技术仍然是细胞遗传学产前诊断的“金标准”,但该技术具有细胞培养耗时长、分辨率低以及耗费人力的局限性。
包括荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH) 技术在内的快速产前诊断技术的引入虽然具有快速及特异性高的优点,但还不能做到对染色体组的全局分析。
染色体微阵列分析(chromosomal mlcroarray analysis,CMA) 技术又被称为“分子核型分析”,能够在全基因组水平进行扫描,可检测染色体不平衡的拷贝数变异(copy number variant,CNV),尤其是对于检测染色体组微小缺失、重复等不平衡性重排具有突出优势。
根据芯片设计与检测原理的不同,CMA 技术可分为两大类:基于微阵列的比较基因组杂交(array- based comparative genomic hybridization ,aCGH) 技术和单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array) 技术。
前者需要将待测样本DNA 与正常对照样本DNA 分别标记、进行竞争性杂交后获得定量的拷贝数检测结果,而后者则只需将待测样本DNA 与一整套正常基因组对照资料进行对比即可获得诊断结果。
通过aCGH 技术能够很好地检出CNV,而SNP array 除了能够检出CNV 外,还能够检测出大多数的单亲二倍体(uniparental disomy,UPD) 和三倍体,并且可以检测到一定水平的嵌合体。
而设计涵盖CNV+SNP 检测探针的芯片,可同时具有CNV 和SNP 芯片的特点。
2010 年,国际细胞基因组芯片标准协作组(lntemational Standards for Cytogenomic Arrays Consortium,ISCA Consortium) 在研究了21698 例具有异常临床表征,包括智力低下、发育迟缓、多种体征畸形以及自闭症的先证者的基础上,发现aCGH 技术对致病性CNV 的检出率为 12.2%,比传统G 显带核型分析技术的检出率提高了10%。
染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用指南(2023)解读PPT课件
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高分辨率
该技术具有高分辨率的特点,能 够检测到较小的染色体变异,包
括微缺失、微重复等。
自动化程度高
染色体微阵列分析技术实现了自 动化操作,提高了检测效率和准
确性。
技术优势
检测范围广
该技术能够检测多种类型的染色 体变异,包括数目异常和结构异
常等。
准确度高
与传统的核型分析相比,染色体微 阵列分析技术具有更高的准确度和 灵敏度,能够检测到更小的染色体 变异。
采集时间
孕妇外周血样本应在孕12周后进行采集,以确保胎儿DNA在母 血中达到一定浓度。
采集方法
采用无菌技术抽取孕妇静脉血,避免溶血和污染。
样本制备
将抽取的血液样本进行离心分离,提取血浆中的游离DNA,并 进行纯化和浓缩处理。
芯片杂交与扫描
芯片选择
选择具有高分辨率、高灵敏度和高特异性的染色体微 阵列芯片。
临床应用前景
早期筛查
染色体微阵列分析有望应用于孕早期筛查,实现对染色体异常的 早期发现和干预。
精准诊断
该技术能够对染色体微小变异进行精准检测,有助于实现精准诊断 和个性化治疗。
遗传咨询
通过染色体微阵列分析,可以为孕妇提供更准确的遗传咨询,帮助 她们做出更明智的决策。
挑战与问题讨论
技术成本
目前染色体微阵列分析技术成本较高 ,可能限制其在临床的广泛应用。
杂交过程
将制备好的DNA样本与芯片进行杂交,确保杂交过程 充分且均匀。
扫描成像
使用高分辨率扫描仪对杂交后的芯片进行扫描,获取 高质量的荧光信号图像。
数据分析与解读
01
数据预处理
对扫描得到的荧光信号图像进行 预处理,包括背景校正、信号归 一化等。
2023年版染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用指南解读ppt课件
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技术成本高
数据解读复杂
染色体微阵列分析技术依赖于高通量 测序仪器和专业的生物信息学分析, 技术成本相对较高。
该技术产生大量的基因组数据,解读 这些数据需要专业的生物信息学知识 和经验,对医生和实验室的要求较高 。
检测范围有限
虽然染色体微阵列分析技术可以检测 微小的拷贝数变异,但对于某些点突 变和复杂的基因重排,该技术可能无 法准确检测。因此,在产前诊断中, 染色体微阵列分析技术不能完全替代 传统的细胞遗传学方法和其他分子遗 传学技术,而应作为这些方法的补充 和完善。
早期的染色体微阵列分析技术主要基于比较基因组杂交芯片 (aCGH),它通过将待测样本与参照样本进行杂交,来检 测染色体变异。
第二代技术
随着技术的发展,出现了基于单核苷酸多态性芯片(SNP array)的染色体微阵列分析技术。该技术不仅能够检测染色 体拷贝数变异,还能够检测单亲二倍体(UPD)和三倍体等 复杂遗传事件。
高分辨率
01
染色体微阵列分析技术可以检测染色体上微小的拷贝数变异,
分辨率远高于传统细胞遗传学方法。
快速准确
02
该技术无需细胞培养,直接对DNA进行测序,大大缩短了诊断
时间,并提高了准确性。
能够发现新的遗传变异
03
通过分析全基因组序列,该技术有可能发现以前未知的与疾病
相关的遗传变异。
染色体微阵列分析技术的局限性
。
成功案例分析
1 2
案例一
通过染色体微阵列分析技术,成功诊断出胎儿携 带的某种遗传性疾病,及时进行了医学干预,保 障了母婴健康。
案例二
在产前诊断中,通过该技术发现了染色体异常, 避免了潜在的高风险妊娠,实现了优生优育。
3
案例三
染色体微阵列分析技术在胎儿遗传病诊断中的应用
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·综述·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2016年第8卷第3期染色体微阵列分析技术在胎儿遗传病诊断中的应用顾莹1 黄欢2 孙丽洲2(1.连云港市妇幼保健院生殖遗传科,江苏连云港 222006;2.江苏省妇幼保健院产科,江苏南京 210036)【摘要】 染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrayanalysis,CMA)技术是一种通过对染色体进行全基因组扫描,发现染色体组的数目和结构异常的检测技术。
CMA以其高分辨率、高效率、高自动化操作等优点,不仅能有效检测传统核型分析技术所能检测的染色体数目异常及非平衡性结构异常,还能检测染色体组亚显微结构水平上不平衡重排引起的拷贝数变异(copynumbervariation,CNV),成为现代临床遗传学常规诊断工具,并被引入到产前胎儿遗传疾病检测中。
本文将就产前胎儿遗传病、胎儿遗传病检测的技术回顾、CMA技术的发展及在胎儿遗传病检测中的应用、优势和面临的挑战等做一个详细的综述。
【关键词】 染色体微阵列分析;产前诊断;遗传病;遗传咨询【中图分类号】 R714.53 【文献标识码】 A犱狅犻:10.13470/j.cnki.cjpd.2016.03.011 遗传病指人体遗传物质(包括细胞核DNA和核外线粒体DNA)发生变异或可遗传性修饰而导致的疾病,可由亲代遗传给子代,故称遗传病。
在产前胎儿检测的遗传性疾病中主要包括染色体病、基因病、线粒体病等。
目前已发现的人类染色体异常超过10000种[1],主要包括数目异常,如唐氏综合征21号染色体比正常多一条,女性先天卵巢发育不全缺少一条X染色体;部分染色体大片段结构变异,罗氏易位等;染色体亚显微结构的微缺失或重复,如17q21.31微缺失综合征和22q1l.2微重复综合征。
染色体病对胎儿的危害尤其巨大,除极少数三体和性染色体异常可以存活下来,大多数的染色体数目异常均以流产、死胎而告终,而染色体结构异常则是引起新生儿出生缺陷非常重要的原因,包括智力低下、发育迟缓、多器官畸形等[2],而目前尚无有效的治疗措施,因此需要及早准确检测和积极干预。
染色体微阵列芯片分析技术应用于产前诊断为关键问题探讨
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染色体微阵列分析技术(CMA)在产前诊断中的应用
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基因组印记异常的案例分析
总结词
基因组印记异常是指基因组中某些基因的印记表达异 常,可能导致胎儿发育异常或疾病,CMA技术有助于 发现基因组印记异常。
原理
通过微阵列芯片与待测样本DNA进行 杂交,检测基因组中碱基序列的变异, 并将变异结果进行高分辨率的定位和 识别。
CMA技术的优势和局限性
优势
高分辨率、高灵敏度、高特异性、快速检测、可检测多种染色体异常和基因组变异。
局限性
无法检测染色体结构异常、无法检测单基因遗传病、无法检测线粒体基因组变异、存在假阳性或假阴性的可能。
印记异常研究
CMA技术能够用于印记异常 的深入研究,为疾病发病机 制和遗传学研究提供有力支 持。
03
CMA技术在产前诊断中的临床 价值
提高产前诊断的准确性和可靠性
CMA技术通过高分辨率的微阵列芯 片,能够检测到染色体的微小变异, 包括拷贝数变异和单核苷酸变异,从 而提高了产前诊断的准确性。
与传统的染色体核型分析相比,CMA 技术具有更高的灵敏度和特异性,能 够更准确地检测出染色体异常,避免 了漏诊和误诊的情况。
降低假阳性率和假阴性率
CMA技术能够更准确地检测出染色体 异常,从而降低了假阳性率和假阴性 率,避免了不必要的侵入性产前诊断 和终止妊娠。
CMA技术可以检测到染色体的微小变 异,而传统的染色体核型分析可能无 法检测到这些变异,因此CMA技术能 够更全面地评估胎儿的染色体异常风 险。
为遗传咨询和生育建议提供依据
CMA技术能够检测出罕见疾病, 如肌萎缩侧索硬化症、脊髓性肌 萎缩症等。
2023年版染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用指南ppt课件
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技术优势与局限性
局限性-数据分析复杂性:产生大量的数据需要进行专业的生物信息学分析,对 数据解读和结果判断有一定的难度。
请注意,该扩展结果仅提供了染色体微阵列分析技术的概述部分,包括技术原理 、技术发展历程和技术优势与局限性。在实际应用中,还需进一步了解技术操作 细节、数据分析方法以及在产前诊断中的具体应用案例等内容。
分析总结
该案例展示了染色体微阵列分析技术与其他诊断技术联合应用的优势。在临床实践中,综合运用多种 诊断技术,可以更全面、更准确地评估胎儿的健康状况,为孕妇和家庭提供更全面的遗传咨询服务。
05
前景展望与未来研究 方向
技术改进与优化方向
提高分辨率和检测灵敏度
通过优化实验设计和分析算法,提高染色体微阵列分析技术的分辨 率和检测灵敏度,以更准确地检测染色体变异和基因缺陷。
探针杂交和信号检测
该技术利用特定设计的探针与样本DNA进行杂交,通过检测 杂交信号来识别染色体上的变异。
技术发展历程
1 2 3
第一代技术出现
早期的染色体微阵列分析技术主要基于比较基因 组杂交(CGH)原理,用于检测全基因组的拷贝 数变异。
第二代技术革新
随着技术的发展,出现了基于单核苷酸分辨率的 技术,如单核苷酸多态性(SNP)微阵列,提高 了分辨率和检测精度。
VS
分析总结
该案例提示,虽然染色体微阵列分析技术 具有高分辨率,但面对复杂染色体变异时 ,解读结果仍具有一定的挑战性。需要结 合其他临床信息和专业遗传咨询,进行综 合判断和决策。
案例三:与其他诊断技术的联合应用
案例描述
一位孕妇同时接受了染色体微阵列分析技术和超声检查,两者结果相互印证,更全面地评估了胎儿的 遗传和发育状况。
染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识(完整版)
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染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识(完整版)目前,G显带染色体核型分析技术仍然是细胞遗传学产前诊断的“金标准”,但该技术具有细胞培养耗时长、分辨率低以及耗费人力的局限性。
包括荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术在内的快速产前诊断技术的引入虽然具有快速及特异性高的优点,但还不能做到对染色体组的全局分析。
染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)技术又被称为“分子核型分析”,能够在全基因组水平进行扫描,可检测染色体不平衡的拷贝数变异(copy number variant,CNV),尤其是对于检测染色体组微小缺失、重复等不平衡性重排具有突出优势。
根据芯片设计与检测原理的不同,CMA技术可分为两大类:基于微阵列的比较基因组杂交(array.based comparative genomic hybridization,aCGH)技术和单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array.SNP array)技术。
前者需要将待测样本DNA与正常对照样本DNA分别标记、进行竞争性杂交后获得定量的拷贝数检测结果,而后者则只需将待测样本DNA与一整套正常基因组对照资料进行对比即可获得诊断结果。
通过aCGH技术能够很好地检出CNV,而SNP array除了能够检出CNV外,还能够检测出大多数的单亲二倍体(uniparental disomv,UPD)和三倍体,并且可以检测到一定水平的嵌合体。
而设计涵盖CNV+SNP检测探针的芯片,可同时具有CNV和SNP芯片的特点”。
2010年,国际细胞基因组芯片标准协作组(International Standards for Cytogenomic Arrays Consortium,ISCA Consortium)在研究了2 1 698例具有异常临床表征,包括智力低下、发育迟缓、多种体征畸形以及自闭症的先证者的基础上,发现aCGH 技术对致病性CNV的检出率为12.2%,比传统G显带核型分析技术的检出率提高了10%。
染色体微阵列分析技术(CMA)在产前诊断中的应用
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3. VOUS:应建议父母行CMA 检测,通过家系综合分析以协助对胎儿检测结 11 果的判断。
(1)新发CNV:若有证据表明该区域内有疾病表型相关的功能基因,通常 认为是可能致病性;若该区域内无基因,通常认为是可能良性,也有可能目 前未发现其临床意义。 (2) 遗传性CNV: ①若胎儿父母有临床表型,且该区域内有疾病表型相关的功能基因,通常认 为该CNV 为可能致病性。 ②若胎儿父母无临床表型,通常情况下,可判断该CNV 为家族性良性CNV; 若胎儿CNV与亲代CNV 大小不同,且缺失或重复的范围扩大了,则应考虑 为可能致病性。此外,还需考虑不完全外显、临床表型差异(父母可能有亚 临床表现精选)ppt课的件 可能。
CMA芯片平台选择
5
基于微阵列的比较基因组杂交技术(aCGH)
优势:用户可根据需要设计并制作芯片 可针对特定区域设计高密度探针 以增加在该区域的检测灵敏度和特异性
单核苷酸多态性微阵列技术(SNP array)
优势:SNP 芯片除了带有拷贝数信息外, 还带有SNP 分型的信息; 可检测杂合性缺失(loss of heterozygous,LOH),从而用于检测
1
精选ppt课件
2 主要内容
➢ CMA在产前诊断中的应用概况 ➢ CMA芯片平台选择 ➢ CMA应用于产前诊断的临床指征 ➢ CMA检测前后的遗传咨询及结果解释
精选ppt课件
CMA在产前诊断中的应用概况
3
精选ppt课件
CMA在产前诊断中的应用概况
4 2013 年Hillman 等的meta 分析共涉及25 篇文献共18 113 例个体:
精选ppt课件
8
CMA检测前的遗传咨询
3. 检出疾病的遗传异质性:所检出的某些遗传性疾病由于外显率和表现度的差异, 在不同患者间临床表现可能存在很大的变异。 4. 可能检出与临床表型不相关的CNV:通过CMA 技术检测可能发现非亲生父亲、 近亲婚配、迟发性的遗传病或成人期发病的遗传病(如肿瘤),这些结果应该让孕 妇及家属选择是否被告知。
染色体微阵列技术在胎儿遗传学诊断中的应用
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100·罕少疾病杂志 2023年6月 第30卷 第 6 期 总第167期【第一作者】刘建生,男,副主任技师,主要研究方向:细胞遗传、分子遗传实验室诊断。
E-mail:***************【通讯作者】刘建生·论著·染色体微阵列技术在胎儿遗传学诊断中的应用刘建生*泰安市妇幼保健院产前诊断中心 (山东 泰安 271000)【摘要】 目的 应用染色体微阵列分析技术(CMA),对符合产前诊断指征的孕中期胎儿羊水细胞遗传学诊断。
方法 对2020年1月至2023年2月来本院就诊的675例18~27周孕妇,按照年龄组与诊断指征分组,抽取羊水,分别进行CMA检测及染色体核型分析。
结果 本文共检出染色体异常157例,其中染色体非整倍体97例,检出率为23.3%(97/675),其中以无创产前DNA(NIPT)数目异常组为主,检出率55.6%(84/151);拷贝数变异(CNVs)60例,检出率为8.9%(60/675),其中明确致病35例,占58.3%(35/60),非明确临床意义型 (VOUS)检出25例,占41.7%(25/60),以NIPT提示CNV异常组检出率最高,占13.8%(13/87)。
年龄分组以≥35岁组与30-34岁组为多,分别占39.3%(265/675)与37.5%(253/675)。
染色体非整倍体检出率20-24岁组最高,占21.7%(13/60),其次为≥35岁组,占17%(45/265)。
20-24岁组与30-34岁组比较,χ2=4.5,0.01<P <0.05,两组比较有统计学意义。
产前诊断指征中,NIPT提示胎儿染色体异常组检测人数最多,比占总数的35.3%(238/675),其中NIPT提示染色体数目异常检测率22.4%(151/675),异常检出率58.9%(89/151);超声软指标异常检出率17.6%(27/153),以NT/NF增厚为主,占软指标的37.0%(10/27)。
染色体微阵列芯片联合核型分析在高龄孕妇产前诊断的应用价值

·论著·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第3期染色体微阵列芯片联合核型分析在高龄孕妇产前诊断的应用价值李熹罛 巫玉婷 孟祥荣 刘建珍 鞠爱萍 覃燕龄(广州市花都区妇幼保健院,广东广州 510800)【摘要】 目的 探讨染色体微阵列芯片联合核型分析在高龄孕妇产前诊断的应用价值。
方法 收集2020年1月至2023年3月在广州市花都区妇幼保健院产前诊断中心就诊的孕妇2175例,其中969例(44.55%)高龄孕妇作为本研究的入选孕妇,分别对入选孕妇进行染色体核型分析或CMA检测,并比较两种检测方法的检出率及差异性。
结果 948例高龄孕妇胎儿染色体核型分析异常检出率为4.11%,607例高龄孕妇胎儿CMA异常检出率为7.58%,586例高龄孕妇胎儿染色体微阵列芯片联合核型分析的异常检出率为8.53%,染色体微阵列芯片的异常检出率高于染色体核型分析的异常检出率(犘=0.003),染色体微阵列芯片联合核型分析的异常检出率高于染色体核型分析的异常检出率(犘=0.000),高于染色体微阵列芯片的异常检出率(犘=0.545)。
结论 染色体微阵列芯片+核型分析联合诊断,能显著提高产前诊断的异常核型检出率,从而避免了漏诊风险,为胎儿预后评估及夫妻再生育提供科学依据,对降低出生缺陷患儿具有重大的社会效益。
【关键词】 高龄孕妇;产前诊断;染色体核型分析;染色体微阵列芯片技术【中图分类号】 R715.5 【文献标识码】 A犇犗犐:10.13470/j.cnki.cjpd.2023.03.009基金项目:广州市花都区医疗卫生一般科研专项项目(22 HDWS 097) 通信作者:李熹罛,Email:lixichong2023@163.com犜犺犲犪狆狆犾犻犮犪狋犻狅狀狏犪犾狌犲狅犳犮犺狉狅犿狅狊狅犿犲犿犻犮狉狅犪狉狉犪狔犮犺犻狆犮狅犿犫犻狀犲犱狑犻狋犺犽犪狉狔狅狋狔狆犲犪狀犪犾狔狊犻狊犻狀狆狉犲狀犪狋犪犾犱犻犪犵狀狅狊犻狊狅犳犪犱狏犪狀犮犲犱犿犪狋犲狉狀犪犾犪犵犲犔犐犡犻犮犺狅狀犵 ,犠犝犢狌狋犻狀犵,犕犈犖犌犡犻犪狀犵狉狅狀犵,犔犐犝犑犻犪狀狕犺犲狀,犑犝犃犻狆犻狀犵,犙犐犖犢犪狀犾犻狀犵犕犪狋犲狉狀犻狋狔犪狀犱犆犺犻犾犱犎犲犪犾狋犺犎狅狊狆犻狋犪犾狅犳犎狌犪犱狌犇犻狊狋狉犻犮狋,犌狌犪狀犵狕犺狅狌;犌狌犪狀犵犱狅狀犵犌狌犪狀犵狕犺狅狌510800【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 Toinvestigatetheapplicationvalueofchromosomemicroarraychipcombinedwithkaryotypeanalysisinprenataldiagnosisofadvancedmaternalage.犕犲狋犺狅犱狊 Atotalof2175pregnantwomenwhovisitedthePrenatalDiagnosisCenterofHuaduMaternalandChildHealthHospitalofGuangzhoufromJanuary2020toMarch2023werecollected,ofwhich969(44.55%)pregnantwomenwithadvancedmaternalagewereselectedastheselectedpregnantwomeninthisstudy.KaryotypeanalysisorCMAwereperformedontheselectedpregnantwomen,andthedetectionrateanddifferenceofthetwodetectionmethodswerecompared.犚犲狊狌犾狋狊 In948casesofadvancedmaternalage,theabnormaldetectionrateofkaryotypeanalysiswas4.11%.TheabnormaldetectionrateoffetalCMAwas7.58%in607casesofadvancedmaternalage,andtheabnormaldetectionrateoffetalchromosomemicroarraychipcombinedwithkaryotypeanalysiswas8.53%in586casesofadvancedmaternalage.Theabnormalitydetectionrateofchromosomemicroarraychipwashigherthanthatofchromosomekaryotypeanalysis(犘=0.003).TheabnormaldetectionrateofCMAcombinedwithkaryotypingwashigherthanthatofkaryotyping(犘=0.000),higherthanthedetectionrateofchromosomalmicroarray(犘=0.545).25《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第3期·论著· 犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀狊 Thecombineddiagnosisofchromosomemicroarraychipandkaryotypeanalysiscansignificantlyimprovethedetectionrateofabnormalkaryotypeinprenataldiagnosis,soastoavoidtheriskofmisseddiagnosis,providescientificbasisforfetalprognosisassessmentandcouplesreproduction,andhavesignificantsocialbenefitsforreducingthenumberofchildrenwithbirthdefects.【犓犲狔狑狅狉犱狊】 Elderlypregnantwomen;Prenataldiagnosis;Chromosomekaryotypeanalysis;Chromosomemicroarraytechnique 随着我国生活水平不断提高,生育政策的调整以及人口结构和婚育观念的改变,35岁及以上的高龄孕妇在孕妇群体所占的比例呈上升趋势,有文献报道约占20%以上,高龄孕妇在占产前诊断比例则高达50%以上[1 2],而胎儿染色体异常与孕妇年龄呈正相关关系[3],高龄孕妇已然成为产前诊断的主要对象。
染色体微阵列分析技术在2600例流产物中的应用

染色体微阵列分析技术在2600例流产物中的应用彭继苹;袁海明【摘要】染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)是一种通过对染色体进行全基因组扫描来筛查染色体数目和结构异常的检测技术,是儿科和产前遗传诊断的常规工具,已被应用于流产病因分析.本研究应用CMA技术在全基因组水平分析引起流产的染色体异常情况,并评估该技术在临床流产中的应用价值.对收集的2600例流产样本进行CMA技术检测,成功检测了2505例,成功率高达96.3%,其中1021例用CytoScan Optima芯片进行检测,1211例用CytoScan 750K芯片进行检测,273例用CytoScan HD芯片进行检测.利用这3种芯片共检出967例(38.60%)样本发生染色体异常,其中通过CytoScan Optima芯片检出506例(50.00%),CytoScan 750K芯片检出388例(32.00%),CytoScan HD芯片检出73例(26.74%).在967例染色体异常中,有801例(82.83%)发生染色体数目异常,94例(9.72%)发生染色体结构异常,56例(5.79%)发生嵌合体,16例(1.65%)检出纯合区域.本研究结果表明,CMA可应用于临床流产物的遗传学诊断,是一种可靠、稳定、高分辨的技术,其检测结果能够对再生育风险评估提供指导.【期刊名称】《遗传》【年(卷),期】2018(040)009【总页数】10页(P779-788)【关键词】流产;染色体微阵列分析;染色体数目异常;染色体结构异常;嵌合体;染色体纯合区域【作者】彭继苹;袁海明【作者单位】北京金域医学检验实验室有限公司,北京 100010;广州金域医学检验中心有限公司,广州 510330【正文语种】中文自然流产是指妊娠不到28周、胎儿体重不足1000 g、胎儿及其附属物脱离母体而妊娠自行终止者。
妊娠12周之内终止者称为早期流产,临床上自然流产多表现为胎儿发育的停止。
微阵列比较基因组杂交技术在产前诊断中的应用

微阵列比较基因组杂交技术在产前诊断中的应用微阵列比较基因组杂交技术(array-CGH)在产前诊断中具有显著的应用价值。
array-CGH技术克服了传统染色体核型分析技术的局限性,具有高通量、高分辨率、快速的优点,一次实验即可检测待测样本整个基因组拷贝数的变化。
在遗传和环境因素共同影响下,大约3%的婴儿有严重的出生缺陷,其中5%~10%将会发展成智力障碍,所以产前诊断是优生优育的必要保障。
从20世纪60年代染色体显带技术发展以来,染色体核型分析就成为产前诊断的金标准。
该技术能够检测到染色体数量变化,平衡/不平衡易位,倒位和显微镜下可见的大片段缺失和重复等问题。
但目前该技术还存在一定的局限,如由于分辨率较低不能够检测出少于5Mb片段的染色体异常;同时,产前染色体(羊水,绒毛染色体)条带较少增加了异常检出的难度;诊断前需要细胞培养的过程延长了出最终报告的时间;对于结果的分析也依赖于检验人员的水平。
array-CGH技术在产前诊断中的应用主要包括以下几个方面:1. 检测染色体拷贝数变异:array-CGH技术可以检测到全基因组的染色体拷贝数变异,包括染色体的缺失和重复,这对于产前诊断具有重要意义,因为这些变异可能导致胎儿出生缺陷和遗传疾病。
2. 辅助诊断染色体疾病:array-CGH技术可以辅助诊断一些染色体疾病,如唐氏综合征、威廉姆斯综合征等。
这些疾病可以通过array-CGH技术检测到相关的染色体片段缺失或重复,从而帮助医生做出准确的诊断。
3. 预测胎儿的遗传风险:对于一些具有遗传风险的家庭,array-CGH技术可以帮助预测胎儿的遗传风险,如染色体微缺失或微重复等。
这些信息可以帮助医生评估胎儿的健康状况,并给出相应的建议和干预措施。
4. 基因定位和突变检测:array-CGH技术还可以用于基因定位和突变检测,对于一些单基因遗传病,如囊性纤维化、亨廷顿氏病等,array-CGH技术可以帮助定位相关基因的位置和检测突变。
应用微阵列比较基因组杂交技术产前检测室间隔缺损胎儿2p16.3微缺失的临床研究
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应用微阵列比较基因组杂交技术产前检测室间隔缺损胎儿2p16.3微缺失的临床研究王红丹;冯战启;娄桂予;刘红彦;黄飞飞;刘石岭【期刊名称】《重庆医学》【年(卷),期】2016(45)23【摘要】目的了解心脏室间隔缺损胎儿基因组拷贝数变化,寻找其致病的遗传学基础,探讨微阵列基因组杂交技术在产前诊断中应用的可行性。
方法用G显带核型分析技术分析胎儿及其父母外周血染色体,用微阵列比较基因组杂交技术(ArrayCGH)进行患儿及其父母DNA拷贝数变异分析,经数据库比对和文献分析明确异常缺失区域的病理意义。
结果患儿父母外周血染色体核型分析未见异常;Array-CGH检测患儿发现染色体2p16.3区存在640×103 bp的缺失,15q11区存在2 028×103 bp的缺失,20p13区存在535×103 b p的重复。
结论经查数据库及相关文献发现染色体2p16.3区域微缺失可能与胎儿室间隔缺损相关。
【总页数】2页(P3256-3257)【关键词】产前诊断;核酸杂交;基因组;可行性研究;微阵列比较基因组杂交;室间隔缺损【作者】王红丹;冯战启;娄桂予;刘红彦;黄飞飞;刘石岭【作者单位】郑州大学人民医院/河南省人民医院医学遗传研究所;河南省郑州市第一人民医院泌尿外科【正文语种】中文【中图分类】R715.5【相关文献】1.微阵列比较基因组杂交技术产前诊断5q35缺失综合征一例 [J], 冯战启;胡和平;毛长青;王定占;刘磊;刘石岭;景治安;刘红彦2.微阵列比较基因组杂交技术产前诊断母源性8p部分三体胎儿一例 [J], 郭彩琴;王峻峰;赵丽;刘俊;王俊;肖建平3.应用微阵列比较基因组杂交技术对胎儿额外小标记染色体及染色体大片段重复进行产前诊断 [J], 江均;梁华4.应用微阵列比较基因组杂交技术对胎儿染色体大片段重复进行产前诊断 [J], 贺选;龚警;王超颖;汤欣祎;夏炎枝5.微阵列比较基因组杂交技术产前检测卡曼综合征胎儿1例 [J], 高越;侯巧芳;廖世秀;王红丹;吴东;霍晓东;张梦汀;杨艳丽因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
孕妇对染色体微阵列分析产前检测技术信息需求的质性研究

孕妇对染色体微阵列分析产前检测技术信息需求的质性研究【摘要】目的探讨染色体微阵列分析技术(chromosomal microarray analysis,CMA)在产前诊断应用过程中,孕妇对CMA信息需求的影响因素。
方法采用半结构式深度访谈方法,现场录音,并以Colaizzi分析法对资料整理归纳和分析。
结果根据受访者对CMA在产前诊断中的认知,提炼出以下主题包括:对CMA产前检测相关知识缺乏,期望获得CMA产前检测相关知识的需求,理想的决策援助方式;对目前价格的接受情况和报告查询途径的需求不一。
结论孕妇对CMA产前检测相关知识缺乏,期望从医院获得专业的健康指导,重点关注的是检测结果对胎儿、妊娠结局的影响;与获得的临床价值比较,检测价格等服务模式的需求,并不是影响孕妇对CMA接受度的主要因素。
【关键词】:孕妇;产前诊断;染色体微阵列分析芯片;质性研究染色体微阵列分析技术(CMA)是是采用微阵列比较基因组杂交(array-based comparative genomic hybridization aCGH )及单核苷酸多态性微阵列技术(single nucleotide pioymophism array ,SNP array)对外周血、羊水、绒毛、流产组织等样本 DNA 进行全基因组拷贝数变异检测。
近年来,随着二胎政策的开放,高危孕妇的增加,发生胎儿出生缺陷的高危人群随之增加[1],CMA在产前诊断领域中,主要对核型分析无法确认异常片段的来源;产前超声发现胎儿结构异常者而核型分析结果正常的胎儿进一步遗传学检测;提供更多的遗传咨询信息[2],对降低缺陷儿的出生,提高人口素质,发挥重要作用。
由于分子产前诊断技术迅速发展,孕妇群体文化背景、认知水平、经济收入差异,获取知识途径不同,决策接受度各不相同,作者对我院2019年来院的部分孕妇作了深入访谈,总结如下:1 资料与方法一般资料采取目的抽样法,选取来我科室就诊预约羊膜腔穿刺行染色体微阵列分析芯片技术产前检测的孕妇12例,作为质性访谈对象。
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(3)曾生育出生缺陷的夫妻再生第二胎的遗传咨询。
定位:为妇产科医生提供最全面精细的遗传诊断方法,为不孕不育诊断指明方向。 策略: 优先推荐首选aCGH技术,配合外周血染色体核心分析使用。 提供后期“辅助生殖技术”绿色通道等增值支持。 市场培育 :各级学术活动铺开,主要目标客户。
市场细分、目标市场选择、市场定位策略
流产组织是最快上量的切入点。
可用CytoScan750K芯片,收费相对较低。 发病率高,可推范围广(二三级医院)。 阳性率很高:流产组织中有一半存在染色体异常。 阳性后的遗传咨询:可带动夫妻同做,带动三个标本。
谢谢
微阵列比较基因组杂交技术 (aCGH)在产科领域的推广
总部市场部 伍世兴
产品概况
1、产品属性
定义:通过对所有染色体中的基因进行扫描,检测其中片段的拷贝数目变异(CNV) 的技术,有别于细胞核型分析的分子核型分析。
染色体核型分析 技术原理 检测范围 分辨率 检测效能 显带技术 46条染色体 5-10Mb 全部染色体 aCGH 基因芯片技术 46条染色体 低于50Kb 全基因组覆盖
4、aCGH技术不能检测出平衡易位,若怀疑夫妻双方存在平衡易位,建议加做外周血
染色体核型分析。
建议检测流程
原发性不孕不育、曾生育过出生缺陷、需进行辅助生殖技术的夫妻
夫妻双方同做 aCGH(最好采用 HD芯片) 夫妻双方结果 遗传咨询
流产组织
流产组织做 aCGH(最 好采用 750K芯片) 流产物异常 结果 夫妻双方同 做 夫妻双方结 果 遗传咨询
市场细分、目标市场选择、市场定位策略
第二类目标市场——延伸导入
科室:三级医院的妇产科/不孕不育专科/遗传咨询专科/男科 数量:1043家
特点:较多疑难杂症;多数不具备遗传学诊断技术;医生对新事物的接受度较高
需求点: (1)各种疑难不孕不育症诊断:原发不孕、男子无精子症、性发育障碍等。 (2)流产组织检查:死胎或流产需要查明原因。
市场环境
3、市场竞争情况
(2)金域与贝瑞和康的竞争对比
金域检验 贝瑞和康
芯片所含探针数 CytoScan HD芯片:270万
CytoScan750K芯片:75万 覆盖基因 价格 12000个 CytoScan HD芯片:6000元
CMA-HR180K芯片:18万。
1714个 CMA-HR180K芯片:4500元
第三类目标市场——扩大应用面
科室:各地二级医院的产科/不孕不育专科
数量:6468家 特点:多以流产为主,疑难病人较少;普遍缺乏遗传病诊断技术;专科医生较少,诊 断和治疗盲目混乱;对于高端项目的接受度较低。 需求点:
流产病因的检查
定位:为妇产科医生提供最全面精细的遗传诊断方法,为不孕不育诊断指明方向。
CytoScan HD芯片:探针覆盖整个基因组范围,没有遗漏,为业界探针密度最高的芯片。
CytoScan750K芯片:探针主要覆盖疾病相关区域。
3、产品临床应用 产前诊断 不孕不育辅助诊断 遗传病、肿瘤等疾病诊断 新生儿筛查
产品概况
4、检测样品及要求
外周血: 2ml 枸橼酸钠抗凝。
CytoScan750K芯片:4500元
市场环境
金域细胞遗传实验室数据
来自妇产科的标本占外周血染色体核型分析总标本的40%以上。目前
送检量最大的科室。
array CGH在产科领域将有非常广阔的市场空间。 同行“贝瑞和康”主要在产科领域进行推广。
市场细分、目标市场选择、市场定位策略
第一类目标市场——快速进入
市场环境
2、产前诊断市场
目前产前诊断的“金标准”为染色体核型分析。 aCGH技术可多检出2.9%的染色体异常。
3、市场竞争情况
(1)竞争概况 主要第三方机构未开展:艾迪康、迪安、达安、华大基因
目前开展的外包单位:贝瑞和康
全国多数三级医院及生殖医学中心未开展,部分高校开展。
aCGH是金域具有差异化竞争优势的项目。
操作性
出报告时间 价格
需细胞培养,存在 人为的误差
长 低
无需细胞培养,人为误差小
短 高
简而言之,是染色体核型分析的升级版,细致到基因层面,可检测出染色体的 微缺失和微重复。最全面、最精细、最可靠的核型分析技术。
产品概况
2、产品定价 项目名称 微阵列比较基因组杂交染色体 分析(CytoScan HD) 微阵列比较基因组杂交染色体 分析(CytoScan750K) 检测方法 CytoScan HD芯片 CytoScan750K芯片 收费(元) 6000 4500 发报告时间 21天 21天
流产组织:绒毛或流产物,放入生理盐水内保存,冷藏(2~8℃) 保存运输,采样后48小时内送达本实验室。不可冷冻。
市场环境
1、不孕不育市场
(1)发病率
第三大疾病:世界卫生组织预测,不孕不育将成为仅次于肿瘤和心脑血管的第三大疾病。 15%:《中国不孕不育现状调研报告》显示,中国不孕不育症发病率占总人口的15%。 1/8:平均每8对育龄夫妇中就有1对面临生育方面的困难。 7000万:卫生部最新统计数据显示,目前国内不孕不育群体数量已经高达7000万。
精确定位疾病基因,带来疾病关联性最强的遗传性分析。
aCGH技术为不孕不育诊断指明方向 用aCGH技术对原发性不孕不育及习惯性流产的夫妻或流产组织进行检测, 可发现传统方法难以发现的根本病因或进行鉴别诊断,为不孕不育的诊治指明方 向,避免盲目治疗,使不孕不育治疗取得实质性效果。 aCGH指导“辅助生殖技术”前的遗传咨询 可指导生殖医学中心应用辅助生殖技术前的遗传咨询、植入前遗传学诊断或
科室:各省生殖医学中心(多数设于省级三甲医院内) 数量:356家(见名单) 特点:100%为不孕不育患者;具备辅助生殖技术,可形成诊治一体化。 需求点:刚性需求 (1)不明原因不孕不育:原发、习惯性流产、已做常规染色体。
(2)严重男性不育:无精子症、严重少精。直接做array。
(3)辅助生殖技术前的遗传咨询。 (4)具有两次及以上的试管婴儿种植失败史(20%的成功率)。 定位: 为生殖医学工作者提供行业内最先进、最全面、最精细、疾病关联性最强的不 孕不育遗传学诊断方法,并指导应用“辅助生育技术”的遗传咨询工作。 策略——快速建立联系、紧抓刚性需求。
1、产前超声检查异常,但核型分析正常者。
2、胎儿有先天异常但胎死宫内无法进行常规染色体核型分析者。
定位:对目前传统染色体核型分析技术的补充 策略:针对死胎或引产胎儿的病因诊断。
以上为“美国妇产科医师协会”建议。
产品卖点综合描述
探针密度最高,全面覆盖,没有遗漏: 业界探针密度最高的芯片,100%覆盖国际细胞遗传学会ISCA认可的所有基 因,均匀分布于人类基因组的整个范围。
(2)遗传因素所导致的不孕不育
20%:遗传因素导致的比重占20%。 一半:自发流产儿约1/2存在染色体异常。
临床症状:原发性不孕、婚后多次流产以及生育畸形儿的概率增加。
市场环境
1、不孕不育市场
(3)不孕不育治疗情况 据《中国不孕不育现状调研报告》,不孕不育患者治疗失败的约占66%; 在治疗失败 的人群中98.9%没有进行全面、科学的检测,以致没能查清、查准病因或所有病源。 通过遗传学检查可发现其他方法难以发现的病因,从而指导不孕不育症更有效的治疗 和处理。处理包括:辅助生殖技术、药物治疗等。 中国生殖医学中心情况:目前全国生殖医学中心共356家,国内可开展的辅助生殖技 术包括:夫精人工授精技术、供精人工授精技术、体外受精-胚胎移植技术 、卵胞浆内 单精子显微注射技术、植入前胚胎遗传学诊断技术。
策略 1、挑选重点客户进行推广。 2、对依从性较低客户,可优先推荐使用“外周血染色体核型分析”,再根据结果有选 择性地使用aCGH技术。
市场细分、目标市场选择、市场定位策略
特需市场——产前血核型分析,存在检测失败的情况。 需求点:刚性需求
产前诊断工作。
推广过程中的注意事项
1、原发性不孕不育不是女性单方面原因,不孕夫妇双方应视为一个整体,在同时检
查诊断的基础上同时治疗,辨病和辨证相结合是提高诊治不孕症疗效的关键。建议采
用CytoScanHD芯片。 2、流产组织由于本身存在异常,较容易检测出致病的CNV,因此流产组织建议采用 CytoScan750K芯片,避免出现过多的临床意义不明的CNV,造成解读困难。 3、当流产组织检测到致病性CNV时,需要对其父母进行检测,以判断其遗传方式。 如果流产组织CNV是新生突变,那么生育下一胎遗传病风险就会很低。如果流产组织 CNV是遗传于父母,那么生育下一胎仍然具有再发该遗传病的风险,建议及早做产前 诊断或 遵从医嘱。