胎盘组织中总RNA的提取
组织细胞总RNA提取步骤及方法

组织细胞总RNA提取步骤及方法细胞总RNA提取是一种常用的实验技术,用于分离和提取细胞内的总RNA。
以下是一种常用的细胞总RNA提取方法的步骤:1.收集细胞样品:根据实验需要,收集适量的细胞样品。
可以选择培养细胞、悬浮细胞或组织细胞等。
2. 细胞溶解:将细胞样品转移到离心管中,并使用适当的缓冲液(如TRIzol)进行细胞溶解。
缓冲液中的离子和表面活性剂能够破坏细胞膜,使RNA释放到溶液中。
3.加入氯仿:向细胞溶解液中加入等体积的氯仿,并轻轻倒置离心管混匀。
氯仿会与缓冲液中的酚类结合,形成有机相和水相。
4.离心分离:将混合液在高速离心下离心10-15分钟,使其分成有机相(上层)、界面层(中间层)和水相(下层)。
RNA主要分布在界面层和水相之间。
5.收集上清液:使用滴管、移液器等工具小心收集上层的有机相液体,并转移到新的离心管中。
这一步的目的是尽可能减少界面层和下层的干扰物。
6. 沉淀RNA:将等体积的异丙醇(isopropanol)加入上清液中,并轻轻倒置离心管混匀。
异丙醇能够沉淀RNA,将其从溶液中去除。
7.离心分离:将混合液在高速离心下离心10-15分钟,使RNA沉淀在离心管底部形成一个白色沉淀。
8.去除上清液:小心将上清液倒掉,避免损失RNA沉淀。
9.RNA洗涤:使用70%乙醇洗涤RNA沉淀,将沉淀中的杂质去除。
10. 重新溶解:将洗涤后的RNA沉淀用RNase-free水或缓冲液中重新溶解,以便后续实验使用。
注意要避免酶的污染。
以上是一种常见的细胞总RNA提取方法的步骤。
这个方法简单、操作方便,并且能够高效地提取细胞内的总RNA。
根据实验需要,也可以根据具体步骤来进行微调和改进。
提取总rna的方法
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提取总rna的方法
总RNA是指从细胞或组织中提取出的含有所有类型RNA的混合物。
总RNA的提取是RNA研究的重要步骤之一,可以用于分析基因表达、RNA修饰、RNA结构等。
以下是一种常用的总RNA提取方法:材料与试剂:
- 细胞或组织样本
- TRIzol试剂(Invitrogen)
- 氯仿
- 异丙醇
- 离心管
- 离心机
- 热板
步骤:
1. 将细胞或组织样本加入到离心管中,用PBS或生理盐水洗涤
一遍。
2. 加入TRIzol试剂,按照试剂和样本的比例加入。
比例一般为1mL TRIzol/1g细胞或组织。
3. 用均质器将样本均质,使细胞或组织完全破碎,并使其与TRIzol完全混合。
4. 加入氯仿,并彻底混合,使其与TRIzol完全分离。
5. 离心管离心15分钟(4℃,12000rpm),使混合液分为两层,上层为清亮的上清液,下层为混浊的有机相。
6. 将上清液转移至新的离心管中,加入相同体积的异丙醇,混匀。
7. 离心管离心10分钟(4℃,12000rpm),使RNA沉淀在管底。
8. 倒掉上清液,用75%乙醇洗涤RNA沉淀,离心管离心5分钟(4℃,7500rpm)。
9. 将乙醇洗涤RNA沉淀挥干,加入适量的RNase-free水溶解即可。
注意事项:
1. TRIzol是一种强还原剂,需避免与其他化学物质接触。
2. RNA样本处理过程中需注意RNase污染的防止,使用
RNase-free试剂和器材。
3. RNA的保存需避免RNase污染和长时间保存,最好在-80℃低温下保存。
磁珠法动物组织总rna提取试剂
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磁珠法动物组织总rna提取试剂磁珠法动物组织总RNA提取试剂是一种常用于从动物组织中提取总RNA的试剂。
总RNA是指包括mRNA、tRNA、rRNA等各种类型的RNA,它们在细胞中起到重要的生物学功能。
动物组织总RNA的提取对于研究基因表达、生物学功能以及疾病研究等领域具有重要意义。
下面将详细介绍磁珠法动物组织总RNA提取试剂的原理、操作流程以及优缺点。
一、原理:磁珠法动物组织总RNA提取试剂的原理是利用磁珠在磁场中的作用来实现RNA的分离和纯化。
磁性珠子(磁珠)是一种微米级别的颗粒,表面含有特异性结合分子(如寡聚核苷酸、抗体等),可以与RNA特异性结合。
通过结合物的磁场作用,可以将RNA与其他杂质分离开,并进行纯化。
二、操作流程:磁珠法动物组织总RNA提取试剂的操作流程通常可以分为样品处理、细胞破碎、RNA结合、磁珠分离、洗涤和洗脱等步骤。
(一)样品处理:首先要将收集到的动物组织样品进行样品处理,如清洗、离心等,以去除表面的杂质并提取细胞。
(二)细胞破碎:将经过样品处理的细胞进行破碎,以释放细胞内的RNA。
目前常用的破碎方法包括机械破碎、酶解和超声破碎等。
选择不同的破碎方法需要根据所研究的组织类型、细胞数量以及目标RNA 的适应性来确定。
(三)RNA结合:将破碎后的细胞溶液与磁珠结合试剂加入,并进行混匀。
通过磁性珠子表面的特异性结合分子与RNA结合,使得RNA能够与磁珠结合。
(四)磁珠分离:通过磁力,将含有磁性珠子的RNA溶液与其他不具有磁性的杂质分离。
可以利用磁力器将磁性珠子收集到一侧,将无磁性的溶液倒掉,从而分离纯化RNA。
(五)洗涤:为了去除残留的污染物,可以进行洗涤步骤。
将洗涤缓冲液加入含有磁珠的管中,再次使用磁力使磁性珠子沉淀,倒掉上清液,然后重复该步骤多次以保证洗涤的彻底性。
(六)洗脱:最后,用洗脱缓冲液将RNA从磁珠上洗脱下来。
将洗脱缓冲液加入磁性珠子所在的管中,轻轻摇晃管子,使RNA溶解在洗脱缓冲液中,从而得到纯化的RNA溶液。
总RNA的提取(Trizol法提取)(PDF)
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总RNA的提取(Trizol法提取)在收集到生物材料之后,最好能即刻进行RNA制备工作。
若需暂时储存,则应以液氮将生物材料急速冷冻后,储存于-80℃冷冻柜。
在制备RNA时,将储存于冷冻柜的材料取出,立即以加入液氮研磨的方式打破细胞,不可以先行解冻,以避免RNase的作用。
1.提取组织RNA时,每50~100mg组织用1ml Trizol试剂对组织进行裂解;提取细胞RNA时,先离心沉淀细胞,每5-10╳106个细胞加1ml Trizol后,反复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞;2.将上述组织或细胞的Trizol裂解液转入EP管中,在室温15~30C下放置5分钟;3.在上述EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.2ml氯仿的量加入氯仿,盖上EP管盖子,在手中用力震荡15秒,在室温下(15℃~30℃)放置2~3分钟后,12000g(2℃~8℃)离心15分钟;4.取上层水相置于新EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.5ml异丙醇的量加入异丙醇,在室温下(15℃~30℃)放置10分钟,12000g(2℃~8℃)离心10分钟;5.弃上清,按照每1ml TRIZOL加1ml75%乙醇进行洗涤,涡旋混合,7500g(2℃~8℃)离心5分钟,弃上清;6.让沉淀的RNA在室温下自然干燥;7.用Rnase-free water溶解RNA沉淀。
PCR实验室常用DNA聚合酶有三种:TaKaRa Taq TM,TaKaRa E X Taq TM和Pyrobest TM DNA Polymerase。
TaKaRa Taq TM是一般的DNA聚合酶,保真性较差,但价钱便宜,一般用于基因表达的检测等。
TaKaRa E X Taq TM是具有Proof reading 活性的耐热性DNA聚合酶,具有一定的保真性,而且其扩增得到的PCR产物3’端附有一个“A”碱基,如果希望直接将产物克隆到T-vector可以用此酶。
Pyrobest TM DNA Polymerase也是具有Proof reading活性的耐热性DNA聚合酶,其特点是保真性极高,扩增得到的PCR产物为平滑末端。
动物组织中总RNA的提取教程文件
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(二).鉴定(1.5%琼脂糖电泳鉴定)
操作
1、制胶:1.5%琼脂糖加热溶解冷到
60℃加EB后倒入制胶板中,待凝胶固化
2、加样:15ulRNA提取液+3ul loading buffer
3、电泳80-120v,30分钟
4、紫外灯下观察结果
三.注意事项
防止RNA酶的污染
1、 所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干 烤6hr或更长时间。
3.原理
破碎组织→分离RNA→沉淀RNA→洗 涤RNA→溶解RNA→鉴定RNA → 保存 RNA
1、 破碎组织:可以用盐酸胍、异硫氰酸 胍、SDS、蛋白酶K等破碎组织,加入 β-ME可以抑制RNA酶活性
2、 分离RNA:一般用酚、氯仿等有机 溶剂,加入少量异戊醇,经过此步, 离心,RNA一般分布于上层,与蛋白 层分开
2、 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿冲洗。 3、 有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水 冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室温10min,然 后用0.1% DEPC水冲洗,晾干。
4、 配制的溶液应尽可能的用0.1% DEPC,在37℃处理 12hr以上。 5、 操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中 手套要勤换,避免在操作中聊天。
关于样本保存
用液氮速冻,再放到超低温冰箱中保存。
RNA保护剂,如RNAlater是具有抑制 RNase和稳定RNA作用的试剂,将采集的组织 样本等直接放入到RNAlater中,即可起到稳定 样本中RNA的作用。
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动物组织中总RNA的提取
通过寡聚脱氧胸苷(OligodT)制备 mRNA
磁珠法动物组织总rna提取试剂
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磁珠法动物组织总rna提取试剂动物组织总RNA提取是一项重要的实验步骤,其中磁珠法被广泛应用。
本文将介绍磁珠法动物组织总RNA提取试剂的原理、操作步骤和优势,以及其在科研工作中的应用。
一、磁珠法动物组织总RNA提取试剂的原理磁珠法动物组织总RNA提取试剂是一种基于磁性珠子的提取方法。
其原理是利用磁性珠子表面的羧基与RNA中的氨基结合,形成稳定的结合,从而实现RNA的高效提取。
该试剂具有高选择性和高纯度的特点,可有效去除DNA、蛋白质和其他杂质。
二、磁珠法动物组织总RNA提取试剂的操作步骤1. 准备工作:将动物组织样品切割成小块,并加入适量的细胞裂解缓冲液。
2. 组织裂解:利用机械或化学方法将组织完全裂解,使细胞内的RNA充分释放。
3. 加入磁性珠子:将磁性珠子加入细胞裂解液中,并充分混匀,使珠子均匀分散。
4. 结合RNA:在一定的温度和时间下,RNA与磁性珠子表面的羧基发生结合,形成RNA-磁性珠子复合物。
5. 分离复合物:利用磁性装置将RNA-磁性珠子复合物迅速沉降,然后去除上清液,以实现复合物的分离。
6. 洗涤:用洗涤缓冲液洗涤复合物,去除杂质和残余试剂。
7. 释放RNA:将洗涤后的复合物加入洗脱缓冲液,使RNA从磁性珠子上释放出来。
8. 收集RNA:将释放的RNA收集下来,即可用于后续的实验操作。
三、磁珠法动物组织总RNA提取试剂的优势1. 高效性:磁珠法能够在较短的时间内提取高纯度的RNA,适用于大规模样品的处理。
2. 纯度高:该方法能够有效去除DNA、蛋白质和其他杂质,获得高纯度的RNA。
3. 灵敏度高:磁珠法能够提取低浓度的RNA,适用于少量样品和低表达基因的研究。
4. 操作简便:该方法操作简单,不需要复杂的仪器设备,适用于实验室内各种规模的科研工作。
5. 可靠性强:磁珠法提取的RNA具有较好的稳定性和可靠性,适合多种分子生物学实验的需求。
四、磁珠法动物组织总RNA提取试剂在科研工作中的应用磁珠法动物组织总RNA提取试剂在生物医学研究中广泛应用。
总rna的提取方法
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总rna的提取方法
总RNA(total RNA)是指从细胞或组织中提取出来的包含所有类型的RNA的混合物。
下面是一种常见的总RNA提取方法:
1. 细胞/组织样品准备:收集足够数量的细胞或组织样品,并将其保存在适当的缓冲液中(如RIPA缓冲液)。
2. 细胞破碎:将细胞样品经过离心等步骤,去除缓冲液,然后加入细胞破裂缓冲液(常见的破裂缓冲液成分包括TRIzol、RLT缓冲液等),使用搅拌器或超声波进行细胞破碎。
3. RNA提取:加入氯仿或类似的有机物,进行混匀,离心,使得混合液分为上清液(含有DNA和RNA)和有机相(含有脂质和蛋白质)。
4. 上清液沉淀:将上清液转移至新的管中,加入同等体积的异丙醇,轻轻混匀,离心15分钟以使RNA沉淀。
5. RNA洗涤:轻轻倒掉上清液,用70%乙醇洗涤RNA沉淀,再次离心。
6. RNA溶解:将RNA沉淀干燥,加入适当的RNase-free水溶解RNA。
7. RNA质量检测:使用比色法或荧光法测定RNA浓度和纯度(如比例计算
A260/A280)。
这些步骤是总RNA提取的一般流程,具体的操作步骤可能会因实验目的、样品类型和提取试剂盒等因素而有所不同。
同时,为了确保RNA的完整性和减少污染,实验操作中还应遵循严格的无RNase和无DNA污染的条件。
动物组织中总RNA的提取课件

分溶解RNA。将所得RNA溶液置于-70
度保存待用
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10
(二).鉴定(1.5%琼脂糖电泳鉴定)
操作
1、制胶:1.5%琼脂糖加热溶解冷到
60℃加EB后倒入制胶板中,待凝胶固化
2、加样:15ulRNA提取液+3ul loading buffer
3、电泳80-120v,30分钟
4、紫外灯下观察结果
纤维素柱上,在低盐浓度或蒸馏水中, mRNA可被洗下,经过两次oligo(dT) 纤维 素柱,可得到较纯的mRNA在构建cDNA文 库时, 必须经上述纯化步骤制备mRNA模 板。
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3
3.原理
破碎组织→分离RNA→沉淀RNA→洗 涤RNA→溶解RNA→鉴定RNA → 保存 RNA
1、 破碎组织:可以用盐酸胍、异硫氰酸 胍、SDS、蛋白酶K等破碎组织,加入 β-ME可以抑制RNA酶活性
10min
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9
3.吸取上层水相转移至干净的eppendorf 管中,加入等体积异丙醇,混匀,室温放置 20min
4. 12000rpm离心10min,弃上清
5.加入1ml 75%乙醇洗涤沉淀. 12000rpm离心3min,弃上清,室温干燥5-
10min
6.加入30-50ulRNase-free ddH2O,充
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三.注意事项
防止RNA酶的污染
1、 所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干 烤6hr或更长时间。
2、 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿冲洗。 3、 有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水 冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室温10min,然 后用0.1% DEPC水冲洗,晾干。
组织及细胞总RNA的提取

组织RNA的提取
1)组织切成小块后立即放入液氮中速冻,可于-70℃低温冰箱或液氮中保存待用。
3)室温放置匀浆混合物5分钟,按每1mlTRIZOL加入0.2ml的比例加入三氯甲烷,剧烈混合30s后,室温放置2-3分钟。
4)4℃12,000 rpm离心样品10分钟,可见分层。
将上层无色水相转移至一新的离心管中,每1mlTRIZOL提取的样品中大约可吸出0.5ml水相。
!!! 若蛋白较多,可用等体积酚、氯仿再抽提一次水相。
5)在吸取的水相中加入0.5ml异丙醇,混合均匀,室温静置10分钟。
或-20 1h 6)4℃12,000 rpm离心样品10分钟,可见少量RNA沉淀。
7)弃上清,用1ml 75%的乙醇洗涤沉淀两次。
然后4℃7,12000rpm离心沉淀3-5分钟,弃上清并尽可能地去除残留在管壁上的液体。
8)空气中干燥RNA沉淀5-10分钟,以适量DEPC水(20-30μl)溶解RNA 沉淀。
9)取1μl 进行常规电泳(1%Agrose,洁净梳子,新换电泳液),观察RNA 的质量(28S :18S = 2:1)。
注意事项:
玻璃器皿需干烤,180度10小时或250度 5 小时。
枪头、离心管需经过DEPC处理,并高压消毒。
DEPC处理方法:将1ml DEPC加到1L水中,DEPC为油珠状,37度左右晃动一天即可溶。
用此水浸泡处理各种物品,此水经高压消毒后可用于溶解RNA或者用于RT反应。
DEPC对很多种酶有灭活作用,经高压消毒后失活。
不同组织总rna提取
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不同组织总rna提取
总RNA是一种包含所有转录本的RNA样品,对于许多生物学研究非常重要。
不同组织中的总RNA提取方法可能略有不同,以下是一些常见的总RNA提取方法:
1. 经典酚/氯仿法:该方法适用于多种组织,包括动物和植物组织。
它利用酚和氯仿的不同溶解度将RNA从DNA和蛋白质中提取出来。
它需要耗时且冗长的样品制备步骤,但可以获得高质量的RNA。
2. Trizol法:该方法是一种常用的RNA提取方法,适用于多种组织和细胞类型。
它使用一种酚-胍-氯仿混合物将RNA从细胞和组织中提取出来。
这种方法比经典酚/氯仿法更快,也可以获得高质量的RNA。
3. 氯化锂法:该方法适用于小型样品和细胞类型,例如酵母细胞。
它使用氯化锂和酒精的不同溶解度来提取RNA。
这种方法需要较短的制备时间,但可能会影响RNA的质量。
4. 柱式RNA提取法:该方法使用酚/氯仿或Trizol提取RNA,
并通过硅胶柱纯化步骤来去除杂质。
这种方法可以获得高质量的RNA,并且适用于各种组织类型。
总之,不同组织中的总RNA提取方法略有不同,但通常都可以使用上述方法之一。
选择合适的方法取决于实验的具体需求和样品类型。
- 1 -。
总RNA提取的原理步骤
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总RNA提取的原理步骤
1.细胞破碎:首先需要破坏细胞膜以释放细胞内的RNA。
这可以通过
物理方法(如机械破碎或超声波破碎)或化学方法(如细胞裂解酶或去涂
膜剂)来实现。
2. 去除DNA:细胞内还存在DNA,因此需要使用RNase-free DNase
对DNA进行降解,以避免后续的RNA提取过程中DNA的污染。
3.分离RNA:接下来需要将RNA与其他细胞组分分离。
这可以通过加
入异丙醇或酚/氯仿混合物等有机溶剂,使RNA以水相形式存在并与有机
相相分离。
4.沉淀RNA:将有机相中的RNA沉淀下来,可以通过离心或使用醇沉
淀法实现。
有机相中的RNA会以颗粒状沉积于管壁上。
5. 洗涤和溶解:沉淀下来的RNA还会残留有一些污染物,因此需要
进行洗涤以去除这些污染物。
通常使用乙醇洗涤来去除盐和其他杂质。
最后,RNA可以通过溶解于适当的缓冲液中,如TE缓冲液或RNase-free水。
6.RNA质量检测:为了评估RNA的质量和纯度,一般会使用紫外吸收
光谱仪测定RNA的吸光度比值(A260/A280),以确定是否含有污染物。
总RNA提取的效率和纯度取决于多种因素,包括样本类型、细胞破碎
方法、RNase的去除和混合物分离的效果等。
因此,在总RNA提取过程中,需要注意严格控制废液的处理、采用无RNase酶的耗材和试剂、严格遵循
操作规程等。
总体而言,总RNA提取是从细胞或组织样本中提取总碱基为基础的RNA混合物的过程,它为后续的转录组学研究、基因表达分析等提供了重要的基础。
总RNA提取实验原理

总RNA提取实验原理、步骤和问题解答Trizol 试剂是直接从细胞或组织中提取总RNA的试剂。
它在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性,裂解细胞并释放出RNA,酸性条件使RNA与DNA分离, 加入氯仿后离心,样品分成水样层和有机层。
RNA存在于水样层中。
收集上面的的水样层后,RNA可以通过异丙醇沉淀来还原。
在除去水样层后,样品中的DNA和蛋白也能相继以沉淀的方式还原。
乙醇沉淀能析出中间层的DNA,在有机层中加入异丙醇能沉淀出蛋白。
共纯化DNA对于样品间标准化RNA的产量十分有用。
无论是人、动物、植物还是细菌组织,各种样品最大使用量( 1ml Trizol ),动物组织( 50mg) ,植物组织(100 mg) ,丝状真菌( 100mg) ,动物细胞(5 ×106~1×107) ,酵母(1 ×107) 。
TRIZOL试剂能促进不同种属不同分子量大小的多种RNA的析出。
例如,从大鼠肝脏抽提的RNA琼脂糖凝胶电泳并用溴化乙啶染色,可见许多介于7 kb 和15 kb 之间不连续的高分子量条带, ( mRNA和hnRNA成分) 两条优势核糖体RNA条带位于~5 kb (28S) 和~2 kb (18S) ,低分子量RNA介于0.1 和0.3 kb 之间(tRNA, 5S) 。
当抽提的RNA用TE稀释时其A260/A280比值≥1.8 。
[ 实验用品]【实验耗材】1、移液枪:1ml、200μl 、20μl 、10μl 、2μl 。
酒精擦拭,头部重点,紫外线照射。
2、吸头:1ml、200μl 、20μl3、匀浆管:5ml4、吸头台:放置1ml 吸头的一个,放置20μl 吸头的一个5、EP管:1.5ml 、0.2ml 、100μl6、试剂瓶:2个60ml 的棕色广口试剂瓶。
青霉素小瓶(分装无水乙醇,高压的DEPC水,-20°C保存)。
7、量筒:50ml、250ml、500ml8、容量250ml、500ml、1000ml9、试管架:5ml、1.5ml 、20μl10、盐水瓶:250ml、500ml 各2个备用,一个装无水乙醇,另一个装DEPC水11、铝制饭盒:4个12、塑料小饭盒:1个13、大瓷缸:2个14、锡泊纸:一卷15、卷纸:2 卷16、三角烧瓶:带盖,稍大(融琼脂糖)【实验仪器】天平、振荡器、高速离心机、0.5 ~10ul 、20~200ul 、100~1000ul 加样器。
不同组织总rna提取

不同组织总rna提取
本文介绍总RNA的提取方法,适用于不同的组织样本。
总RNA提取步骤如下:
1. 样品处理:将组织样品切碎并加入荷叶酸/酶混合液,破坏细胞结构,使总RNA易于提取。
2. 离心:将样品离心,得到上清液。
3. 加入异丙醇:将异丙醇加入样品中,使得RNA分子成为可见的粘稠团块,方便后续的提取。
4. 待沉淀:将样品放置在室温下,待RNA沉淀至底部。
5. 去除上清液:将上清液从样品中取出。
6. 加入乙醇:加入乙醇,使RNA固定在底部,最终形成白色固体。
7. 洗涤:用70%的乙醇洗涤RNA,去除杂质和其他污染物。
8. 干燥:将RNA干燥至完全失去水分。
9. 重溶解:将RNA重新溶解在板管中的去离子水中,可用于后续实验。
总RNA提取方法的步骤比较繁琐,但在实验过程中一定要注意严格控制样品温度和处理时间,以避免RNA的降解和污染。
动物组织总RNA提取实验操作
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常规动物组织总RNA提取
(Trizol法)
实验操作流程
1摘要
本标准操作规程适用于一般动物组织的总RNA提取,一般情况下能得到高质量的总RNA。
2提取步骤
a)用液氮预冷研钵,组织样品放入加有液氮的研钵中,在液氮下把组织样品充分研磨成
粉末。
b)把样品粉末转入到装有TRIzol裂解液的2.0mL EP管中,(每mL裂解液可加50mg组
织样品)剧烈震荡,充分混匀,平放室温静置5-10min。
c)10000rpm,4℃离心5min。
d)吸取上清液至新的2.0mL EP管中,每毫升裂解液加入200μL氯仿/异戊醇,剧烈颠倒
混匀。
e)10000rpm,4℃离心10min。
f)吸取上清液至新的1.5mL离心管,注意不要吸到中间蛋白层,加入等上清液体积的异
丙醇,轻轻颠倒混匀。
g)放入-20℃冰箱沉淀1h。
h)13600rpm,4℃离心20min。
i) 吸弃上清,加入1mL 75%乙醇,用移液器吹洗沉淀。
j) 10000rpm,4℃离心3min,吸弃上清,短暂离心,吸去残留液体,晾干3-5min。
k)用30-100μL DEPC水或者RNase-free水溶解沉淀。
3设备与试剂
3.1设备
3.2试剂。
动物组织细胞总RNA的提取实验原理及步骤
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实验十一动物组织细胞总RNA的提取一、实验原理RNA是基因表达的中间产物,存在于细胞质与核中。
对RNA进行操作在分子生物学中占有重要地位。
获得高纯度和完整的RNA 是很多分子生物学实验所必需的,如Northern杂交、cDNA合成及体外翻译等实验的成败,在很大程度上取决于RNA的质量。
由于细胞内的大部分RNA是以核蛋白复合体的形式存在,所以在提取RNA时要利用高浓度的蛋白质变性剂,迅速破坏细胞结构,使核蛋白与RNA分离,释放出RNA。
再通过酚、氯仿等有机溶剂处理、离心,使RNA与其他细胞组分分离,得到纯化的总RNA。
在提取的过程中要抑制内源和外源的RNase 活性,保护RNA分子不被降解。
因此提取必须在无RNase的环境中进行。
可使用RNase抑制剂,如DEPC是RNase的强抑制剂,常用来抑制外源RNase活性。
提取缓冲液中一般含SDS、酚、氯仿、胍盐等蛋白质变性剂,也能抑制RNase活性。
并有助于除去非核酸成分。
本实验介绍异硫氰酸胍法和TRIzol法提取动物组织总RNA并通过电泳进行鉴定。
二、仪器和试剂1.仪器:超净工作台、高速冷冻离心机、电泳仪、紫外分光光度计、凝胶成像系统、振荡器、移液器、吸头、Ep管、玻璃匀浆器、试管、玻璃器皿洗净后置180℃烘烤8h;不耐高温的器皿(如塑料制品)应用0.1% DEPC浸泡2h,70~80℃烘烤干燥,120℃高压20min,再70~80℃烘烤干燥方可使用。
2.试剂:(1)细胞裂解液:异硫氰酸胍 4mol/L柠檬酸钠(pH7.0) 25mmol/L十二烷基肌氨酸钠 0.5%β-巯基乙醇 0.1mol/L称取柠檬酸钠0.64g,十二烷基肌氨酸钠0.415g,吸取β-巯基乙醇0.7ml,用无Rnase的蒸馏水溶解,定容至50ml。
然后取以上配制的溶液(CBS液)33ml,异硫氰酸胍 25g,混合,完全溶解后4℃保存备用。
(2)10×凝胶缓冲液:吗啉代丙璜酸(MOPS)(pH7.0) 200mmol/LNaAc 100mmol/LEDTA(pH 8.0) 10mmol/L过滤除菌后避光保存。
常见提取总DNARNA的方法与注意事项
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常见提取总DNARNA的方法与注意事项提取总DNA和总RNA是分子生物学实验中常见的步骤之一、这些提取方法非常重要,因为它们为后续的分子生物学实验提供了所需的DNA和RNA样品。
下面是一些常见的总DNA和总RNA提取方法以及需要注意的事项。
常见的总DNA提取方法:1. 酚/氯仿提取法(Phenol/Chloroform Extraction):这是一种经典的总DNA提取方法。
简言之,样品首先通过细胞壁的破碎,并使用蛋白酶和溶液进行蛋白酶消化,然后通过酚酊提取DNA,接着使用氯仿酊沉淀DNA。
注意事项:此方法需要小心使用酚和氯仿,因为它们是有毒的。
同时,操作过程中要注意避免DNA污染,并保持无菌环境。
2. 盐提取法(Salt Precipitation):这是一种简单且经济高效的总DNA提取方法。
在此方法中,样品首先通过细胞壁的破碎,并且添加了表面活性剂SDS和蛋白酶,然后通过添加高盐浓度的溶液,使DNA沉淀。
最后,使用乙醇洗涤和溶解DNA。
注意事项:在此方法中,需要注意加入足够的高盐浓度缓冲溶液,以确保DNA的完全沉淀。
此外,尽量避免使用SDS和蛋白酶过量,以免残留物干扰后续试验。
3. 硅胶修复法(Silica Method):这是一种常见且高纯度的总DNA提取方法。
首先,样品通过细胞壁的破裂,然后将DNA结合到硅胶膜上。
接着,通过洗涤步骤去除杂质,最后使用洗脱缓冲液去除DNA。
注意事项:在进行硅胶修复时,要避免DNA的过度结合,以免影响后续的DNA洗涤和洗脱。
此外,使用高质量的硅胶膜可以提高DNA的纯度。
常见的总RNA提取方法:1. 酚/氯仿提取法(Phenol/Chloroform Extraction):这种方法不仅适用于总DNA提取,也适用于总RNA提取。
与总DNA提取类似,总RNA样品也先通过细胞壁破裂,并使用酚酊和氯仿酊消除蛋白质和残余的DNA,最后通过洗涤步骤提取RNA。
注意事项:和总DNA提取相似,酚和氯仿也是有毒的,操作时要小心。
Agilent实验原理及步骤
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Agilent 实验原理及步骤一、总RNA抽提(TRIzol法)1.每2×107细胞加入1 ml Trizol,在旋涡震荡器上混匀;对于组织样品,每100mg组织可以加入1 ml Trizol,用液氮研磨或采用电动匀浆器充分打碎组织块。
2.加入约1/5体积的氯仿,上下颠倒充分混匀1 分钟左右,室温下静置5 分钟。
3.4℃,12,000 rpm 离心15 分钟后小心取出上清液,将上清夜转入新的1.5 ml离心管,加入等体积的异丙醇,轻轻颠倒混匀,室温静置5 分钟。
(15ml离心管用7,500rpm离心20min)4.4℃,12000 rpm离心10 分钟后,去上清,向沉淀中加入2/5体积的70% 乙醇, 4℃,12000 rpm离心洗涤沉淀15 分钟。
(15ml离心管用7,500rpm离心20min)5.去上清,沉淀室温晾干后加入适量无RNA酶的水充分溶解沉淀,测定OD260和OD280值。
(optional)对于从组织样本抽提的总 RNA,为了更好的去除基因组DNA 的污染,可以采用无RNA 酶的DNA酶I 处理,从而提高样品纯度。
二、总RNA质量检测(琼脂糖电泳以及Lab-on-a-chip电泳检测)(一)琼脂糖胶电泳1、配置用DEPC处理的电泳缓冲液50⨯TAE,高压灭菌后待用。
2、使用电泳槽前用3%H2O2浸泡15min,然后用DEPC处理的水冲洗,倒入适量1⨯TAE电泳缓冲液。
3、称取适量琼脂糖,加入1⨯TAE电泳缓冲液,制备1%的胶(注意使用专用的溶液和相关设备,避免引入外源RNA酶)。
4、用专用6⨯Loading buffer做指示剂,取10µl上样电泳(电压100伏)15min。
5、关闭电源,取出电泳胶,在凝胶成像仪上观测、拍照,保存图像。
6、评价总 RNA或 mRNA质量(见FAQ)。
通过目测28S和18S的亮度比例可以初步评价总RNA的质量。
一般认为28S:18S ≥2可以初步判定总RNA 质量较好,如图1所示。
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胎盘组织中总RNA的提取
1:将适量的胎盘组织放入研钵中,加入液氮后研磨至粉末,移入玻璃匀浆器中后,Trizol试剂2ml左右,室温放置5min。
12000rpm、4℃、离心10min。
将上清移入另一离心管中。
2:加入200μl氯仿,小心的盖上离心管,剧烈地振荡30sec混匀,室温放置5min.
3: 12000rpm、4℃、离心样本10min。
此时混合物分成三部分:底层为苯酚-氯仿相层,中间层和上层水相层。
RNA完全存在于水相中,收集上清,用氯仿重复一次,离心15min。
4:RNA的沉淀。
把小于80%的水相转移至一新的离心管中,并弃去下面的有机相(小心避免吸到中间层)。
往水相中加入等体积的异丙醇,混匀,室温下放置样本5min,12000rpm、4℃、离心10min。
5:弃上清,防止RNA沉淀丢失。
6:洗涤RNA。
用1mlDEPC水配制的70%的乙醇洗涤二次。
涡旋混匀样本,7500g、4℃、离心10min。
7:RNA沉淀的溶解。
小心的吸走乙醇,短暂地在室温下置2-5min让RNA风干。
不要用离心干燥装置或真空干燥装置,因为过度干燥会导致很难用水重新溶解RNA。
稍微干燥后,用30μl DEPC水后放入60℃水浴锅内温预10min,并存于-70℃。