PCR实验室操作流程
PCR实验室标准操作规程SOP
一、基因扩增检验实验室基本情况 (一) 实验室所属法人单位名称:________________________________________________
地址:__________________________________________________________________ 邮编:_____________________________________ 法定代表人:_____________________实验室负责人:_________________________ 联系人:_________________________email:_________________________________ 电话:___________________________传真:__________________________________ (二) 实验室总人数:__________________名 (其中初级职称人数人员___名,占____;中级职称人数人员_____名,占______。)
质量手册
一、 管理性程序: 程序文件的管理和维护 ……………………………………………………………………… 1 PCR 实验室管理制度 …………………………………………………………………………… 2 生物安全准则 ………………………………………………………………………………… 4 实验室生物防护措施 …………………………………………………………………………… 7 实验室传染性废弃物管理制度 ………………………………………………………………… 9 PCR 实验室的人员配置及管理制度 …………………………………………………… 12 PCR 实验室的人员培训计划及措施 …………………………………………………………… 14 PCR 实验记录管理制度 ………………………………………………………………………… 15 惠安县医院 PCR 检验报告单保密制度 ……………………………………………………… 17 检验结果的传送管理制度 ……………………………………………………………………… 19 实验室的清洁制度 ……………………………………………………………………………… 20 化学试剂的管理程序 …………………………………………………………………………… 22 实验室消耗品购买、验收和贮存程序 ………………………………………………………… 23 新项目审批程序 …………………………………………………………………………………… 25 仪器设备的管理制度 …………………………………………………………………………… 26 仪器设备的使用制度 …………………………………………………………………………… 28 仪器设备的标准操作制度 ……………………………………………………………………… 29 仪器设备的维护保养程序和制度 ……………………………………………………………… 31 仪器设备的校准制度 …………………………………………………………………………… 34 仪器设备发生故障的应急处理制度 ………………………………………………………… 35 PCR 检测的标本管理制度 …………………………………………………………………… 36
医学生pcr实验室实验报告
医学生pcr实验室实验报告实验目的1、了解PCR技术,掌握最基础的PCR实验步骤实验原理1、PCR全称聚合酶链反应,是体外快速扩增特定基因或DNA序列最常用的方法。
2、基本原理:首先将双链DNA分子在临近沸点的温度下加热分离成2条单链DNA分子,DNA聚合酶以单链DNA为模板并利用反应混合物中的四种脱氧核苷三磷酸合成新的DNA互补链。
PCR反应时,只要在试管内加入模板DNA、PCR引物、四种核苷酸及适当浓度的Mg2+,DNA聚合酶就能在数小时内将目标序列扩增100万倍以上。
实验内容PCR MIX 5ul、F 上游引物1ul、R 下游引物1ul、模板DNA 1ul、H20 2ul共10ul注意事项1、戴一次性手套,若不小心溅上反应液,立即更换手套。
2、使用一次性吸头,严禁与PCR产物分析室的吸头混用,吸头不要长时间暴露于空气中,避免气溶胶的污染。
3、避免反应液飞溅,打开反应管时为避免此种情况,开盖前稍离心收集液体于管底。
若不小心溅到手套或桌面上,应立刻更换手套并用稀酸擦拭桌面。
4、操作多份样品时,制备反应混合液,先将dNTP、缓冲液、引物和酶混合好,然后分装,这样即可以减少操作,避免污染,又可以增加反应的精确度。
5、最后加入反应模板,加入后盖紧反应管。
6、操作时设立阴阳性对照和空白对照,即可验证PCR反应的可靠性,又可以协助判断扩增系统的可信性。
7、尽可能用可替换或可高压处理的加样器,由于加样器最容易受产物气溶胶或标本DNA的污染,最好使用可替换或高压处理的加样器。
如没有这种特殊的加样器,至少PCR操作过程中加样器应该专用,不能交叉使用,尤其是PCR产物分析所用加样器不能拿到其它两个区。
8、重复实验,验证结果,慎下结论。
实验步骤:首先取出所需要的DNA试剂放于ep管盒中将引物与mix放置于带冰的盒中。
利用mix和所需要引物及水配置mis mis组成:320ulmix 64ul上游引物64ul下游引物和64ul的水配置过程中一定要选择正确的引物,否则会对实验结果造成影响Pcr所需要的反应体系为20ul所以可以适当的多配一点避免样品量不够。
PCR实验室标准操作规程
PCR实验室标准操作规程PCR实验室作业指导书⽂件编号:第1版编制:审核:批准:⽣效⽇期:2015年*⽉*⽇质管部PCR实验室公正性声明1、坚持公正⽴场认真对待每⼀例检测,不受任何对检测⼯作质量有不良影响得、来⾃实验室内部或外部得不正当得商业、财务与其她⽅⾯得压⼒与影响。
避免卷⼊任何可能会降低技术能⼒、公正性、判断或运作诚实性得信任得活动。
2、严格遵循实验室认可依据得国际标准,严格按标准得管理要素与技术要素得要求建⽴⾃我完善得管理体系与控制检测全过程各环节得机制,所有与检测有关得⼈员熟悉与之相关得质量⽂件,并在⼯作中执⾏这些政策与程序,真正把标准作为科学管理检测实验室得先进管理模式,尽可能把差错降到最低限度,确保检测数据准确可靠,检测结果与技术判断正确有效。
3、坚持以“客户为中⼼、质量第⼀”得服务宗旨,严格保护客户得机密与所有权,热忱提供优质服务,努⼒实现让上级放⼼、客户满意得服务标准。
4、主动开展实验室得⽐对实验与其她有效地检测质量监控⽅案,并通过⽇常检测得监督机制,持续改进、不断完善管理体系,从⽽保证其充分性与有效性、修订页⽬录前⾔ ............................................................................................................................................ 错误!未定义书签。
质量⽅针?错误!未定义书签。
质量管理体系组织结构图?错误!未定义书签。
⼀、⼯作制度............................................................................................................................. 错误!未定义书签。
PCR实验室得设置及管理规程?错误!未定义书签。
PCR实验室操作流程
乙型肝炎病毒(HBV DNA PCR ABI7300)检侧标准操作程序飞INFORMATIONFORTE检测信息二、ANALYTICALPRINCTP检测原理聚台酶链式反应(PCR可对特定核苷酸片段进行指数级的扩增,而实时荧光定量PCF技术,是指在PCF反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
在实时荧光定量PCR反应中,引入了一种荧光化学物质,荧光物质有两种:荧光探针和荧光染料。
我们目前是使用TaqMan荧光探针的检测原理:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。
探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCRT增时,Taq 酶的5' —3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,荧光信号强度也等比例增加(图一)。
这样就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,从而得到一条荧光扩增曲线图3■- atwnch-ftr三、操作步骤(一)试剂配制1、进入试剂准备区,开启冰箱冷冻层取出 HBV-DNA 佥测试剂盒。
查 看外包装盒(包括生产批号、有效期),无误后拆开试剂盒,取出核酸 提取液、反应液及Taq 酶(核对核酸提取液、HBVPC 反应液及Taq 酶 管上批号与试剂外包装盒批号是否一致)(图1),不一致则不可使用, 需更换新的试剂。
室温平衡20min ,完全融化后2000rpm 离心备用。
2、核酸提取液的分装 (1)取0.5ml 离心管架置于超净工作台内(开机前用紫外线消毒30 分钟),用右手拿起镊子逐个将离心管放入离心管架(注意应夹住离 心管外壁,不能碰到管内壁),摆放顺序为横列从左往右摆,竖列为 从上往下隔行排,离心管个数为n (n 二样本数+对照品+质控品)。
PCR实验室标准操作规程SOP
目录申报文件一、临床基因扩增检验实验室技术验收申请表二、《医疗机构执业许可证复印件》三、拟设置基因扩增检验实验室医院的医疗卫生资源状况对临床基因扩增检验的需求情况以及实验室运行的预测分析四、拟设基因扩增检验实验室的设置平面图五、实验室主要负责人简历表六、实验室工作人员一览表七、主要仪器设备表八、拟开展的临床基因诊断项目九、几点说明质量手册一、管理性程序:程序文件的管理和维护 (1)PCR实验室管理制度 (2)生物安全准则 (4)实验室生物防护措施 (7)实验室传染性废弃物管理制度 (9)PCR实验室的人员配置及管理制度 (12)PCR实验室的人员培训计划及措施 (14)PCR实验记录管理制度 (15)惠安县医院PCR检验报告单保密制度 (17)检验结果的传送管理制度 (19)实验室的清洁制度 (20)化学试剂的管理程序 (22)实验室消耗品购买、验收和贮存程序 (23)新项目审批程序 (25)仪器设备的管理制度 (26)仪器设备的使用制度 (28)仪器设备的标准操作制度 (29)仪器设备的维护保养程序和制度 (31)仪器设备的校准制度 (34)仪器设备发生故障的应急处理制度 (35)PCR检测的标本管理制度 (36)二、检测项目操作程序:标本、样本编号唯一性程序 (38)临床标本的采集、运送和接收程序 (39)临床标本的保存程序 (41)临床标本的处理(核酸纯化)程序 (42)核酸扩增及产物分析检测的标准操作程序 (43)I消毒液的配制程序 (45)室内质量控制操作程序 (46)实验室室间质量评价的操作程序 (49)试剂的质检操作程序 (50)带滤塞吸头的质检操作程序 (52)人员流动程序 (53)抱怨处理程序 (54)应急处理程序 (55)生物污染废弃物处理标准操作程序 (57)乙型肝炎病毒DNA-荧光定量PCR测定 (59)沙眼衣原体DNA-荧光PCR测定 (61)结核菌DNA-荧光定量PCR测定 (63)三、仪器设备标准操作程序:GeneLight 9800实时跟踪荧光PCR仪操作程序 (66)Reactor4800加热仪标准操作程序 (67)FX 1200-Ⅱ- B2型生物安全柜操作程序 (68)SpanStar2418台式高速离心机标准操作程序 (70)加样器的操作程序 (71)医用低温冷冻冰箱标准操作程序 (73)移动紫外灯操作程序 (74)四、仪器设备维护保养程序GeneLight 9800实时跟踪荧光PCR仪维护保养程序 (75)Reactor4800器加热仪维护保养程序 (76)FX 1200-Ⅱ- B2型生物安全柜维护保养程序 (77)SpanStar2418台式高速离心机的维护保养程序 (78)医用低温冷冻冰箱保养程序 (79)XW-80A型旋涡混合器的保养程序 (80)移动紫外灯维护保养程序 (81)五、仪器设备校准程序:GeneLight 9800实时跟踪荧光PCR仪校准程序 (82)Reactor4800器加热仪校准程序 (83)FX 1200-Ⅱ- B2型生物安全柜校准操作程序 (84)加样器的校准程序 (85)SpanStar2418台式高速离心机的校准程序 (87)温湿度表的校准程序 (88)六、附相关图表附表001 送检标本接收记录表附表002 送检标本拒收记录表附表003 标本超低温保存及处置记录表附表004 室内质量控制登记表附表005 试剂验收记录表附表006 试剂质检记录表附表007 紫外灯强度监测表附表008 消耗品验收记录表附表009 消耗品质检记录表II附表010 冰箱温度记录表附表011 PCR日常工作核查表附表012 PCR检验结果记录本附表013 移动紫外灯消毒记录表附表014 实验室清洁消毒记录表附表015 实验室紫外灯消毒记录表附表016 垃圾处理记录表附表017 应急处理记录表附表018 PCR室间质量控制登记表附表019 PCR室内质量控制失控及纠正措施记录表附表020 PCR实验室人员培训计划及培训表附表021 仪器故障处理登记表附表022 抱怨记录表附表023 仪器设备维护记录表附表024 实验室工作人员一览表七、附相关复印件:厦门市安普利生物工程有限公司企业法人营业执照复印件;《药品生产企业许可证》、《药品GMP证书》复印件;乙肝病毒核酸扩增(PCR)荧光检测试剂盒新药证书复印件;沙眼衣原体核酸扩增(PCR)荧光检测试剂盒新药证书复印件;结核杆菌核酸扩增(PCR)荧光检测试剂盒新药证书复印件;乙肝病毒核酸扩增荧光检测试剂盒新药证书及生产批件复印件;沙眼衣原体核酸扩增荧光检测试剂盒新药证书及生产批件复印件;结核杆菌核酸扩增荧光检测试剂盒新药证书及生产批件复印件;检验结果报告样单复印件;《临床基因扩增实验室技术人员培训证书》复印件;III临床基因扩增检验实验室技术验收申请表一、基因扩增检验实验室基本情况(一)实验室所属法人单位名称:________________________________________________ 地址:__________________________________________________________________邮编:_____________________________________法定代表人:_____________________实验室负责人:_________________________联系人:_________________________email:_________________________________电话:___________________________传真:__________________________________(二)实验室总人数:__________________名(其中初级职称人数人员___名,占____;中级职称人数人员_____名,占______。
PCR实验室标准操作规程
PCR实验室作业指导书文件编号:第1版编制:审核:批准:生效日期:2015年*月*日质管部PCR实验室公正性声明1、坚持公正立场认真对待每一例检测,不受任何对检测工作质量有不良影响的、来自实验室内部或外部的不正当的商业、财务和其他方面的压力和影响。
避免卷入任何可能会降低技术能力、公正性、判断或运作诚实性的信任的活动。
2、严格遵循实验室认可依据的国际标准,严格按标准的管理要素和技术要素的要求建立自我完善的管理体系和控制检测全过程各环节的机制,所有与检测有关的人员熟悉与之相关的质量文件,并在工作中执行这些政策和程序,真正把标准作为科学管理检测实验室的先进管理模式,尽可能把差错降到最低限度,确保检测数据准确可靠,检测结果和技术判断正确有效.3、坚持以“客户为中心、质量第一”的服务宗旨,严格保护客户的机密和所有权,热忱提供优质服务,努力实现让上级放心、客户满意的服务标准。
4、主动开展实验室的比对实验和其他有效地检测质量监控方案,并通过日常检测的监督机制,持续改进、不断完善管理体系,从而保证其充分性和有效性。
修订页序号文件编号页码需更改的内容更改内容批准人批准日期1234567891011121314151617181920目录前言 (1)质量方针 (2)质量管理体系组织结构图 (3)一、工作制度 (4)PCR实验室的设置及管理规程 (4)PCR实验室内务管理规程 (5)PCR实验室人员的配置及管理规程 (6)PCR实验室管理规程 (8)PCR实验室生物安全防护措施 (11)PCR实验室废弃物的处理管理规程 (12)PCR实验室清洁消毒管理规程 (13)PCR实验室仪器设备的管理规程 (14)试剂管理规程 (15)清洁剂、消毒剂管理规程 (16)异常情况应急处理管理规程 (17)采购管理规程 (20)仓库管理制度 (23)临床标本的管理规程 (26)PCR实验室记录管理规程 (27)检验报告单发放、保密管理规程 (28)PCR实验室岗位责任制 (29)二、操作指导书 (30)PCR实验室的清洁消毒操作规程 (30)冰箱、冷藏柜的使用操作程序 (31)冰箱、冷藏柜的维护保养操作程序 (32)洁净工作台使用操作规程 (34)洁净工作台维护、清洁操作规程 (35)ABI 7500实时跟踪荧光PCR仪使用操作规程 (37)ABI 7500实时跟踪荧光PCR仪维护保养操作规程 (38)高速冷冻离心机使用标准操作规程 (39)高速冷冻离心机维护保养操作规程 (40)生物安全柜使用操作规程 (41)生物安全柜的维护保养操作规程 (42)加样器的使用操作规程 (43)加样器的维护保养操作规程 (44)干式恒温箱的使用操作规程 (45)干式恒温箱的维护保养操作规程 (46)紫外灯的使用操作规程 (47)紫外灯的维护保养操作规程 (48)温湿度计自行检定操作规程 (49)PCR实验室试剂的质检标准操作规程 (50)PCR实验室标本唯一标识编号编制操作规程 (51)临床标本的采集、运送、接收操作规程 (52)临床标本的保存操作规程 (54)清洁剂、消毒剂配制操作规程 (55)乙肝病毒核酸扩增荧光检测操作规程 (56)室内质量控制标准操作程序 (58)室间质评操作规程 (61)三、引用图表 (62)实验室负责人简历 (62)实验室工作人员一览表 (63)北京市医疗机构临床基因扩增检验实验室自查/审核表 (69)前言1。
PCR基本操作包括哪些步骤
PCR基本操作包括哪些步骤PCR(聚合酶链式反应)是一种常用的分子生物学技术,用于扩增DNA片段。
它在基因工程、药物研发、疾病诊断等领域具有广泛的应用。
PCR基本操作包括以下几个步骤:1. DNA样本处理与提取PCR反应所需的DNA样本可以从细胞或组织中提取获得。
常用的提取方法包括酚-氯仿法、盐析法、商用DNA提取试剂盒等。
提取的DNA需要进行定量和质量检测,确保PCR反应的可重复性和准确性。
2. 反应体系准备PCR反应体系主要由DNA模板、引物、缩合酶、反应缓冲液和可调节的离子浓度组成。
根据实验需要,可以添加特定的辅助试剂、核苷酸等。
反应体系的设计和优化对PCR反应的灵敏度和特异性有重要影响。
3. PCR反应程序设置PCR反应需要按照一定的温度和时间控制,以使DNA片段在不同温度区间中完成变性、退火和延伸等步骤。
一般情况下,PCR反应的程序包括初始变性、循环反应和最终延伸等阶段。
4. PCR反应条件优化PCR反应的条件优化对于提高扩增效率、特异性和产物纯度至关重要。
优化参数包括反应体系组分、引物浓度、反应温度、扩增周期数等。
通过优化反应条件,可以解决一些常见问题,如非特异性扩增、抑制性物质的影响等。
5. PCR产物分析与检测PCR产物可通过凝胶电泳、定量PCR、测序等方法进行分析和检测。
凝胶电泳是常用的PCR产物分析方法,可以确定目标DNA片段的大小和纯度。
定量PCR则可以精确测量DNA模板的初始量或PCR产物的多少。
通过以上几个步骤,PCR技术可以在较短的时间内扩增目标DNA片段,从而满足各种科研和应用需求。
PCR反应的成功需要仔细的实验操作和条件优化,以保证结果的准确性和可靠性。
荧光定量PCR实验流程图
6
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11
12
5 实验分析: 实验分析:
结果有效性: 有效 无效 (依据 SOP- 中的实验结果有效性判断标准)
见附表(原始结果打印)
6
实验后: 实验后: 填写记录; 打开紫外灯消毒 30′; 70%乙醇消毒实验台面和器具; 按 SOP 文件处理废弃物。
操作者: ______________审核者: 审核者: 操作者: 审核者 ________________
阳性: r 值:是 CT 值:否 失控标准曲线
斜率:
截距:
失控原因及处理: 失控原因及处理: 3 扩增仪:
开机后自检; 按 基 因 扩 增 实 验 室 SOP操作及设定扩增参数;
将样本标识填写于扩增仪相应位置;
仪器状态正常。
4
样本唯一标识和扩增位置:
1 A B C D E F G H
备注:
2
3
4
5
离心是否正常;异常情况及处理 75% 乙 醇 消 毒 实 验 台 面 和 器 具 ; 操作过程是否正常: 打 开 紫 外 灯 消 毒 30 ′ ;
按 SOP 文件处理废弃物;
核酸扩增及产物分析区 三区) 核酸扩增及产物分析区(三区)
1 实验前: 2 室内质控 结 果
打开紫外灯消毒 30′; 质控品结果 阴性: 75%乙醇清洁实验台面; 是 否 失控 记录室内温湿度:
试剂准备区(一区) 试剂准备区(一区)
1 实验前:
打开紫外灯消毒 30′ ; 75%乙醇清洁实验台面; 批号: 数量 配制 70%乙醇 配制 0.1%DEPC 人份 记录室内温、湿度: 有效期限: 清点试剂存量: ml; ml; 打开紫外灯消毒 30′; 人份 _
PCR实验室标准操作规程
PCR实验室作业指导书文件编号:第1版编制:审核:批准:生效日期:2015年*月*日质管部PCR实验室公正性声明1、坚持公正立场认真对待每一例检测,不受任何对检测工作质量有不良影响得、来自实验室内部或外部得不正当得商业、财务与其她方面得压力与影响。
避免卷入任何可能会降低技术能力、公正性、判断或运作诚实性得信任得活动。
2、严格遵循实验室认可依据得国际标准,严格按标准得管理要素与技术要素得要求建立自我完善得管理体系与控制检测全过程各环节得机制,所有与检测有关得人员熟悉与之相关得质量文件,并在工作中执行这些政策与程序,真正把标准作为科学管理检测实验室得先进管理模式,尽可能把差错降到最低限度,确保检测数据准确可靠,检测结果与技术判断正确有效。
3、坚持以“客户为中心、质量第一”得服务宗旨,严格保护客户得机密与所有权,热忱提供优质服务,努力实现让上级放心、客户满意得服务标准。
4、主动开展实验室得比对实验与其她有效地检测质量监控方案,并通过日常检测得监督机制,持续改进、不断完善管理体系,从而保证其充分性与有效性、修订页目录前言 ............................................................................................................................................ 错误!未定义书签。
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一、工作制度............................................................................................................................. 错误!未定义书签。
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PCR实验室程序管理文件及标准化操作程序
程序文件的管理和维护制度1. 目的:基因诊断程序文件是指导临床基因扩增检验活动的法规性文件,属内部受控文件,不得擅自修改、涂改,不得遗失、外借翻印。
为保持其现行有效和持续适应性,并确立因条件变化进行修改的程序。
2.编写依据:2.1 ISO/IEC170250-1999《检测和校准实验室能力的通用要求》因卫生部《临床基因扩增检验实验室技术验收表(check list)》是根据ISO/IEC17025而设计2.2 卫生部《临床基因扩增检验实验室管理暂行办法》及《临床基因扩增检验实验室工作规范》3.适应范围:临床检验标本4.内容5.编制及职责:程序文件由PCR实验室负责人主持编写、修订、审核并保持它的现行有效性。
由科主任批准和颁布实施,并负责解释。
6.发放与持有者责任:程序文件由科主任批准发放,发放与回收要登记签字,由PCR实验室负责人保管,并组织全室工作人员认真学习,了解内容,熟悉其中各项规定,程序文件执行情况纳入实验室目标管理,与奖惩挂钩。
持有者调任时,要收回该程序文件。
7.修订:科室任何工作人员均可提出对程序文件的修改建议,文件修改须经有关人员讨论,PCR实验室负责人根据条件变化提出是否修改的决定,如作小的修改则可在修改页上进行,修改文件经科主任审核批准后,并填写入程序文件修改页。
如果文件须作重大修改,PCR实验室负责人可进行改版。
新版程序文件经科主任批准后生效,收回旧版,并予以销毁,登记签字后发出新版,保证工作现场只有唯一的,最新的使用版本。
实验室内务管理及清洁制度1 目的:保证实验室日常内务管理及清洁工作顺利进行。
2 范围:实验室相关人员及医院清洁工人。
3 内务管理及清洁制度3.1 内务管理制度a.实验人员要有强烈的时间观念,按时上下班,不迟到、早退。
b.进入实验室的工作人员必须遵守实验室的单一流向的规定,禁止逆向走动。
c.非本室工作人员未经允许不得进入实验室。
d..实验室工作人员应严格遵守各项规章制度和操作规程。
pcr实验室操作流程
pcr实验室操作流程
1.样品制备:将样品按需要提取DNA或RNA,片段化处理,使其适合PCR实验。
2.PCR反应液配制:PCR反应液,含有特定的DNA聚合酶、DNA模板、水、dNTP(核苷酸)和引物,按照需要的比例,进行配制。
3.PCR反应:将PCR反应液加入PCR管中,放入PCR热循环仪中,用
不同温度对样品进行反应,循环多次,以获得期望的扩增结果。
4.模板产物检测:将反应产物加入凝胶电泳中,检测DNA模板产物,
可以检测出被扩增片段的种类和量。
5.结果分析:将凝胶电泳的结果与含有标准核酸的样品进行对比,表
明扩增的项目,对结果进行分析,以获得正确的结论。
PCR实验室临床标本的保存操作程序
PCR实验室临床标本的保存操作程序1.目的:临床标本正确保存,以便必要时复查。
2.适用范围:分子诊断室的所有临床检测标本。
3.负责人:操作人:4.程序:4.1 处理前的标本保存a)HBV:全血标本可4℃下短期(24h内)保存,长期保存则需分离出血清(血浆),保存于-20℃下。
d)HCV:在1小时内分离血清,吸取200µl,加入20u Rnasin,保存于-20℃。
尽可能快的提取RNA。
c)HPV:感觉分泌物标本用于HPV检测的短期保存可置于4℃下,长期保存则于-20℃下。
d)CT:标本短期(24h内)保存置于4℃下,长期保存则需在-20℃下。
4.2 报告发出后的标本保存:a)提取的核酸标本当天检测可置4℃保存,如当天不检测应置-20℃保存。
报告发出后第二天丢弃。
b)原始血清/血浆样本在报告发出后放入低温冰箱-20℃保存1个星期,以备复查。
超过1个星期保存期的标本由室负责人酌情处理,一般按生物传染性物品交医院统一处理。
c)血清/血浆标本放置低温冰箱保存时须有记录,按编号顺序存放,并由专人负责管理。
4.3 特殊标本的处理:对暂不检测的项目和规定时间外收到的零散样本,要随时登记和交班,以免漏检,遗失和延误检验。
对特殊样本或特殊病人的样本,实行“首接”负责制,所谓特殊样本是指难于采集的样本,以及特殊病人的样本一律实行“首接”负责制,无论那位工作人员,一旦收到样本后,均须负其责任,不得以任何借口推托,及时和正确保管和转送样本到有关实验室或有关人员,同时作交班记录和双签名。
对于做长期病情动态考察的病人标本一律置于-20℃下长期保存,使用时再按需取出检测。
临床PCR实验室的分区设计及工作流程
理想的PCR实验室分区设计模式A
产物分析区 扩增区 标本制备区 试剂准备区
空气流向
空气流向
空气流向
空气流向
缓冲间
缓冲间
缓冲间
专用走廊
工作流向
理想的PCR实验室分区设计模式B
产物分析区 扩增区 标本制备区 试剂准备区
空气流向
空气流向
空气流向
空气流向
缓冲间
缓冲间
缓冲间
专用走廊
工作流向
A
扩增区 门
标本制备区
临床标本的接收
通常的工作流程:标本采集
编号 保存或检测
血清分离
应在四个测定区域之外的地方或区域内接 收 接收的标本应收集在原始容器中 在核酸提取时带入至标本制备区
标本的接收区的仪器设备要求
如果在标本接收区分离血清(浆)标本,有1 台分离血清(浆)用离心机、1台生物安全柜、 1台冰箱、加样器及相应一次性经高压处理的 消耗品如带滤芯吸头、标本接收编号记录本以 及记号笔等即可。 如果不在标本接收区分离血清(浆)标本,只 是简单的接收,则就不需要分离血清(浆)用 离心机、生物安全柜、加样器及其消耗品。
标本制备区
经高温温育后的标本,应冷至室温后再离心。 标本制备的全过程中都应戴一次性手套,并经常 更换(感觉有污染时)。 设备都应定期或在有明显已知污染后,使用中性 消毒剂如异丙醇、戊二醇等或10%次氯酸钠溶液 消毒,使用10%次氯酸钠溶液消毒后,应再用 70%乙醇洗涤去除残留的次氯酸钠。 生物安全:洗眼器,并配备一个急救箱,箱内可 放置75%酒精、络合碘、棉签、创可贴等必要的 急用药具。
“十六字口诀”
PCR反应三个步骤依次为哪三步进行
PCR反应三个步骤依次为哪三步进行PCR(聚合酶链反应)是一种常用的分子生物学技术,它可以扩增DNA片段。
PCR 反应的原理是通过不断重复三个步骤,使目标DNA片段得以高度放大。
这三个步骤依次为:变性、退火和延伸。
变性(Denaturation)在PCR反应的第一个步骤中,目标DNA的双链结构被加热至高温(通常为94-98°C),使其双链分离成两条单链DNA。
这个步骤的目的是打开DNA的双链结构,使其在后续步骤中可以作为模板参与扩增。
退火(Annealing)在退火步骤中,反应体系中的温度降低至适宜的退火温度(通常为50-65°C)。
在这个温度下,引物(primers)与目标DNA的互补序列结合,形成DNA引物与模板DNA的复合物。
引物是PCR反应中的两个短链DNA分子,它们分别与目标DNA序列的两端互补结合,为DNA扩增提供起始点。
延伸(Extension)在延伸步骤中,反应体系中的温度升高至适宜的延伸温度(通常为65-72°C)。
在这个温度下,Taq DNA聚合酶(一种热稳定酶)在引物的诱导下,开始沿着模板DNA链合成新的DNA链。
这个步骤的完成意味着扩增目标DNA的片段已被合成出来。
PCR反应的这三个步骤通常被不断地重复,以实现对目标DNA的高度扩增。
一个PCR反应循环包括以上三个步骤,通常一个循环的时间约为1-3分钟。
根据需要,PCR反应可以进行多个循环,每个循环都会使目标DNA的数量成倍增加。
通过PCR反应,我们可以快速而准确地从一个较小的DNA样本中扩增大量的目标DNA片段。
PCR技术的应用非常广泛,涵盖了生命科学的各个领域。
例如,在基因检测中,PCR可以被用来检测特定序列的基因突变或变异。
在遗传学研究中,PCR可以用来验证基因型或分析个体之间的遗传关系。
此外,PCR还可以应用于重组DNA技术、病原体检测、DNA测序等众多领域。
总结起来,PCR反应的三个步骤依次为变性、退火和延伸。
PCR实验室室间质量控制操作程序
PCR实验室室间质量控制操作程序一、目的:二、范围:本程序适用于PCR实验室室间质量控制的操作。
三、定义:1.PCR实验室:进行PCR实验的专用实验室。
2.室间质量控制操作:对PCR实验室进行质量控制的一系列操作,包括设备校准、环境监测、试剂品质检查等。
四、程序:1.PCR实验室设备1.1定期校准PCR仪和热盖加热装置,确保温度准确无误。
1.2检查PCR仪、热盖加热装置的温度传感器,确保传感器工作良好。
1.3定期维护PCR仪的铜块组件和热盖加热装置的矽胶垫,确保其表面平整无磨损。
1.4检查PCR仪和热盖加热装置的控制面板、显示屏等部件,确保其正常工作。
2.PCR实验室环境2.1定期监测PCR实验室的温度和湿度,确保其符合实验要求。
2.2定期检查PCR实验室的通风设备,确保其正常工作。
2.3检查PCR实验室的灭菌设备,确保其有效杀灭细菌和病毒。
2.4清洁PCR实验室的工作台、操作台和实验设备,确保无灰尘和杂质。
3.试剂品质检查3.1定期检查PCR反应试剂盒的保存条件,确保其处于推荐温度范围内。
3.2检查PCR反应试剂盒的有效期,确保试剂的有效性。
3.4校正试剂的浓度,确保PCR反应的准确性。
五、操作流程:1.PCR实验室设备1.1按照设备厂商提供的操作手册进行校准操作。
1.2使用温度计等工具检测温度传感器的准确性。
1.3定期更换铜块组件和矽胶垫。
1.4定期进行控制面板和显示屏的检查。
2.PCR实验室环境2.1每天记录PCR实验室的温度和湿度。
2.2定期检查通风设备的运行状况。
2.3每天使用生物指示剂测试灭菌设备的杀菌效果。
2.4每天清洁工作台、操作台和实验设备。
3.试剂品质检查3.1每天检查PCR反应试剂盒的存储温度。
3.2每天检查PCR反应试剂盒的有效期。
3.4每天进行试剂浓度的校正。
六、记录:1.PCR实验室设备的校准记录。
2.PCR实验室环境的温湿度监测记录。
3.PCR实验室环境的通风设备检查记录。
临床基因扩增PCR实验室SOP标准操作程序文件(32项)
临床基因扩增实验室标准操作程序编写人:审核人:批准人:启用日期:年月日XXX医院前言为使基因扩增检验技术有效地应用于临床,更好地为疾病的预防、诊断和治疗服务,保证检验质量,严格按照《临床基因扩增检验实验室管理暂行办法》(卫医发[2002]10号文)附件《临床基因扩增检验实验室基本设置标准》要求,制定本实验室管理文件,本实验室任何实验均需遵循本管理文件中规定执行。
临床基因扩增检验技术指以临床诊断治疗为目的,以扩增检测DNA或RNA 为方法的检测技术,快速、可靠、准确、安全、收费合理方式下,以规范的操作对临床标本进行分析。
本室采用经国家药品监督管理局批准的试剂盒。
开展的检测项目:1、乙型肝炎病毒(HBV)核酸定量检测2、人巨细胞病毒(HCMV)核酸定量检测标准操作程序文件1.目的:为了分子实验室的规范管理,特制订本程序。
2.范围:分子实验室。
3.职责:3.1临床PCR检验实验室工作人员共同遵守、相互督促。
3.2因科研活动需要,进入实验区域(试剂准备区、样本准备区、PCR扩增区)的非本室人员需首先熟悉本程序的各项规定并严格遵守执行。
4.实验室设置:4.1实验室设计为:专用走廊、试剂准备区、样本制备区、PCR扩增区组成。
三个区域各有一个缓冲间。
(见设置图)4.2三个工作区各配备专用的设备、仪器、辅助设施、耗材、清洁用品、办公用品、专用工作服,并有明显的区分标识。
试剂准备区—白色、样品处理区—兰色、基因扩增区—红色。
4.3工作区的配置、功能、内务管理制度见各工作区文件。
4.4 实验室须严格遵守试剂区→样本区→扩增区的流向制度,严禁误入和逆进入各工作区。
4.5实验室流程:1)PCR室工作人员上班后,由过道走廊→试剂区→样本区→扩增区流向,打开排风、光源、温控装置。
2)标本接收区接收标本、验收登记后离心(不开盖),由内走廊入口将标本送入标本制备区缓冲间(标本制备区内门关闭)。
3)PCR工作人员按从试剂区→样本区→扩增区更衣开始流水操作。
PCR实验室标准操作规程
PCR实验室作业指导书文件编号:第1版编制:审核:批准:生效日期:2015年*月*日质管部PCR实验室公正性声明1、坚持公正立场认真对待每一例检测,不受任何对检测工作质量有不良影响的、来自实验室内部或外部的不正当的商业、财务和其他方面的压力和影响。
避免卷入任何可能会降低技术能力、公正性、判断或运作诚实性的信任的活动。
2、严格遵循实验室认可依据的国际标准,严格按标准的管理要素和技术要素的要求建立自我完善的管理体系和控制检测全过程各环节的机制,所有与检测有关的人员熟悉与之相关的质量文件,并在工作中执行这些政策和程序,真正把标准作为科学管理检测实验室的先进管理模式,尽可能把差错降到最低限度,确保检测数据准确可靠,检测结果和技术判断正确有效。
3、坚持以“客户为中心、质量第一”的服务宗旨,严格保护客户的机密和所有权,热忱提供优质服务,努力实现让上级放心、客户满意的服务标准。
4、主动开展实验室的比对实验和其他有效地检测质量监控方案,并通过日常检测的监督机制,持续改进、不断完善管理体系,从而保证其充分性和有效性。
修订页目录前言 (1)质量方针 (2)质量管理体系组织结构图 (4)一、工作制度 (5)PCR实验室的设置及管理规程 (5)PCR实验室内务管理规程 (6)PCR实验室人员的配置及管理规程 (7)PCR实验室管理规程 (10)PCR实验室生物安全防护措施 (14)PCR实验室废弃物的处理管理规程 (16)PCR实验室清洁消毒管理规程 (17)PCR实验室仪器设备的管理规程 (18)试剂管理规程 (20)清洁剂、消毒剂管理规程 (21)异常情况应急处理管理规程 (22)采购管理规程 (25)仓库管理制度 (28)临床标本的管理规程 (31)PCR实验室记录管理规程 (32)检验报告单发放、保密管理规程 (33)PCR实验室岗位责任制 (34)二、操作指导书 (36)PCR实验室的清洁消毒操作规程 (36)冰箱、冷藏柜的使用操作程序 (37)冰箱、冷藏柜的维护保养操作程序 (38)洁净工作台使用操作规程 (40)洁净工作台维护、清洁操作规程 (41)ABI 7500实时跟踪荧光PCR仪使用操作规程 (43)ABI 7500实时跟踪荧光PCR仪维护保养操作规程 (44)高速冷冻离心机使用标准操作规程 (45)高速冷冻离心机维护保养操作规程 (46)生物安全柜使用操作规程 (47)生物安全柜的维护保养操作规程 (49)加样器的使用操作规程 (50)加样器的维护保养操作规程 (51)干式恒温箱的使用操作规程 (52)干式恒温箱的维护保养操作规程 (53)紫外灯的使用操作规程 (54)紫外灯的维护保养操作规程 (55)温湿度计自行检定操作规程 (56)PCR实验室试剂的质检标准操作规程 (57)PCR实验室标本唯一标识编号编制操作规程 (58)临床标本的采集、运送、接收操作规程 (59)临床标本的保存操作规程 (61)清洁剂、消毒剂配制操作规程 (62)乙肝病毒核酸扩增荧光检测操作规程 (64)室内质量控制标准操作程序 (66)室间质评操作规程 (69)三、引用图表 (70)实验室负责人简历 (70)实验室工作人员一览表 (72)拟开展的临床基因扩增检验项目 (75)实验室质量管理程序文件和作业指导书(SOP)目录 (76)北京市医疗机构临床基因扩增检验实验室自查/审核表 (78)前言1.临床基因扩增实验室质量管理手册由以下部分组成:管理性程序;仪器设备标准操作程序、维护保养程序;检测项目操作程序;相关图表;相关复印件2.现有文件编号与本公司现行ISO9001质量体系一致;3.文件管理:现有的文件由公司行政办公室负责管理;实验室主任保存全套文件一份;各工作区保存该区使用的文件,以方便工作人员随时使用。
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乙型肝炎病毒(HBV DNA PCR ABI7300)检侧标准操作程序一、INFORMATIONFORTEST检测信息
项目名称乙型肝炎病毒核酸
方法聚合酶链反应
方法依据卫生部《全国临床检验操作规程》第三版(2006)
第七篇第六章第一节
二、ANALYTICALPRINCTPLE检测原理
聚台酶链式反应(PCR〕可对特定核苷酸片段进行指数级的扩增,而实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
在实时荧光定量PCR反应中,引入了一种荧光化学物质,荧光物质有两种:荧光探针和荧光染料。
我们目前是使用TaqMan荧光探针的检测原理:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。
探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’一3’外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,荧光信号强度也等比例增加(图一)。
这样就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,从而得到一条荧光扩增曲线图。
三、操作步骤
(一)试剂配制
1、进入试剂准备区,开启冰箱冷冻层取出HBV-DNA检测试剂盒。
查看外包装盒(包括生产批号、有效期),无误后拆开试剂盒,取出核酸提取液、反应液及Taq酶(核对核酸提取液、HBVPCR反应液及Taq酶管上批号与试剂外包装盒批号是否一致)(图1),不一致则不可使用,需更换新的试剂。
室温平衡20min,完全融化后2000rpm离心备用。
2、核酸提取液的分装
(1)取0.5ml离心管架置于超净工作台内(开机前用紫外线消毒30分钟),用右手拿起镊子逐个将离心管放入离心管架(注意应夹住离心管外壁,不能碰到管内壁),摆放顺序为横列从左往右摆,竖列为从上往下隔行排,离心管个数为n(n=样本数+对照品+质控品)。
完成后将镊子放回原位(图2)。
(2)用移液器准确吸取核酸提取液50ul分装至0.5m1离心管中(左上角第一排开始,从左住右依次加入)。
因核酸提取液内含固体沉淀颗粒物,为使颗粒均匀分布,故每次取样时都要用移液器反复吸打3-4次(图3)。
分装完毕后将移液器量程归位。
(3)加完一架后用右手拿镊子将离心管拿起,左手大拇指和中指夹紧离心管下部,然后用食指将盖子盖上,顺序为:从右下角第一个开始,从右住左依次盖上(图4),离心管盖全部盖完后,通过传递窗转移至标本处理区。
3、HBV-DNA反应液的配制
每批需设置空白对照、阴性对照、临界阳性对照(同时检测低值阳性质控品,则无需再检测临界阳性对照〕、阳性质控品、阳性标准品。
所需每批需配制数n=样本数+对照品+阳性标准品+质控品,每个测试反应体系配制如下表:
试剂HBV PCR反应液Taq酶用量(ul)35.7 0.3
(1)每盒HBV-DNA试剂可检测32人份,根据每日需检测标本份数计算出每批所需HBV PCR反应液和Taq酶用量(例有111人份需要进行检测,则有3盒试剂可直接使用10ul移液器将Taq酶加入HBV PCR 反应液中,另有111-3*32=15人份试剂需将HBV PCR反应液和Taq酶使用移液器按反应体系比例吸取至1.5m1离心管中配制(图5)。
(2)取出离心后备用的HBV PCR反应液和Taq酶,按上述要求配制后用旋涡振荡器振荡混匀5-10sec,然后再用离心机2000rpm离心10sec备用(图6)。
(3)从操作台面上拿取HBV-DHA试剂配制盒(可选用空余的200u1枪头盒)至超净工作台内,打开配制盒并用记号笔在相应的孔位右旁按顺序编号(图7)。
编号规则为:样本扩增反应管对应的孔位按相应的样本流水号编写、阳性质控品反应管对应的孔位编“Q”(如有高值则标为H,低值为L),阴性对照品孔位编“-”,临界阳性对照对应的孔位编“±”,空白对照对应的孔位编“B”,1号标准品对应的孔位
编“S1”,2号标准品对应的孔位编“S2”,依此类推。
(4)编号完毕后,用右手拿起镊子夹起反应管(ABI7300使用的是八联一薄壁反应管,镊子应夹住反应管外壁,不可接触到内壁。
按(图8)所示方向依次将所有反应管(反应管数=n)隔列摆放到配置盒上。
(5)从离心机中取出已混好Taq酶的PCR反应液,用移液器(量程调至36ul),准确吸取反应液并按从上到下、从左至右的顺序依次加至反应管中,注意:吸头应深入到反应管底部,放液时应缓慢,切勿形
成气泡(图9)。
全部加样完毕后将配制盒通过传递窗转移至样本处理区。
(二)标本处理
1、标本、质控品及对照品的处理
(1)从冰箱冷冻室取出HBV DNA阳性质控品、阴性对照品,室温平衡20min待其完全融化。
(2)核对标本和原始申请单的条形码和检验项目,无误后依次粘贴上相应的流水号,如
2、从传递窗中取出试剂准备区分装好核酸提取液的离心管架,移至生物安全柜内在管盖上用记号笔写上阿拉伯数字1、2、
3、......,阳性质控管标上“Q”(如有高值则标为H,低值为L),阴性对照管标上“-”,临界阳性对照管标上“±’,。
离心管盖上标记的是1,就表示该管要加入流水号为P0001的标本(图10)。
注意:每个离心管的编号方向都应朝向管口开启的方向。
(图11)
3、去除标本管盖:将标本从前处理取至标本准备区,按排列顺序依次去除样本管上的橡胶塞。
具体操作为:在生物安全柜中,左手拿起血清管并固定,右手拇指和中指涅紧橡胶塞,右手食指轻轻顶住橡胶塞顶部凹面,逆时针方向轻轻旋下橡胶塞后废弃于装有消毒液的垃极桶(图12)。
(注意:手指切勿接触到血清管口或碰触到血清,如手套上有血清则需及时跟换新的手套;待所有样本管盖都去除完毕后,也需更换新的手套。
)
4、样本及对照品的处理:
a、左手拿起样本,用量程为200u1调至50u1的移液器准确吸取样本(注:为保证样本的均一性和吸样准确,每次取样时需用移液器将样本吸打3-5次;吸样时移液器套筒不可接触到样本管内壁)(图13)
b.吸样完毕后,将样本管放至另一试管架中(切勿不可将样本放回原试管架位)(图14)。
c.再用左手按前面所述样本流水号和离心管编号的对应关系拿起相应的离心管,打开离心管盖(注:单手操作,食指和中指固定离心管,拇指稍向后上方发力打开管盖,手指切勿碰到离心管口和管盖内侧)(图15)。
d.管盖完全打开后,用左手食指、拇指和中指固定离心管,将吸头中的样本全部打入离心管底部,轻轻吸打混匀3-5次。
(图16)
e.加样完毕后弃枪头干盛有消毒液的垃极桶中(注:一个吸头只能用于一个样本的吸样,禁止使用一个吸头重复吸取不同样本)。
同时盖上离心管盖并放回离心管架(放回的位置需另起一行,切不可放回原位),继续处理下一个样本。
对照品和质控品同病人样本一样处理。
(图17)
f.待一架离心管全部加样完成后用振荡混匀器充分振荡混匀10-15秒。
g.左手将混匀后的离心管转移至恒温金属浴上(注:离心管需对称的放置在恒温金属浴相匹配的孔槽内),用计时器计时,100℃误差不超过±1℃〕干浴10min(误差不超过±30sec)。
(图18)
干浴时用离心管架置于加热的离心管上,防止离心管盖因加热爆开导致标本间的污染(图19)。
h.十分钟后〔前后不超过半分钟),右手用摄子夹起橡皮垫从恒温金属浴中拿出离心管(图20)。
I.将上述离心管按顺序对称放入低温高速离心机转子孔内,摆放离心管时要将离心管开口朝内,盖上转子盖及离心机盖后,12,OOOrpm离心10min(注:离心时需在转子孔内放置0.5m1离心管专用适配器(图21)。
j.待离心结束后,取出离心管并按编号顺序依次摆放在离心管架上(参照(图10)的排列方式)并4'C冰箱保存备用;若当夭不使用,则应保存在一20'C条件下,使用前置室温平衡20min,再以12,OOOrpm 离心10min。
5、待全部样本加样完毕更换手套,左手用镊子夹起反应管盖的一侧的延伸段(不要碰到管盖),然后用右手大拇指从左住右依次盖紧管盖(不要碰到其他未盖的反应管口)(如图22)。
6、将反应管连同试剂配置盒通过传递窗传至扩增分析区。
(三)扩增分析
1、打开扩增仪专用电脑,待电脑完全启动进入操作界面后再开启定量PCR仪主机电源。
a.按压托盘以打开它(图23)。
b.将反应管按顺序纵向放置放入反应板架(注:在反应管总数不足96个时,应对称的将反应管放置在反应板架上,两边放置要求尽可能对称,可以防止热盖下压时发生倾斜,也可以使各反应管受力和受热都比较均匀)(图24)。
c.按压托盘以关闭它。