跨膜区分析

结果显示：
与该蛋白的疏水性区 域分析结果基本一致， 表明P8蛋白可能是一 个与细胞信号传导有 关的膜受体蛋白。
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步骤二：提交序列
步骤三：参数设置
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参数介绍：
Extensive, with graphics（图形化 显示）
Extensive, no graphics （不以图形 化显示）
One line per protein（每个蛋白遵 行显示）
步骤四：显示结果
结果解读
结果显示： P8蛋白的1--405位氨 基酸位于细胞膜表面， 406--426位氨基酸之 间形成一个典型的跨 膜螺旋区。
跨膜区分析(TMHMM）
SIB
跨膜区分析(TMHMM）
蛋白质含有跨膜区，提示它可能作为膜受体起作用，也可能是定位在 膜上的膜蛋白的膜锚定蛋白或离子通道蛋白。 跨膜区常见的分析软件有TMHMM.TMPERD.TMP。TMHMM是一 个基于马尔可夫模型预测跨膜螺旋的程序，它综合了跨膜区疏水性、 电荷偏倚、螺旋长度和膜蛋白拓扑学限制等性质，可对跨膜区及膜内 外区进行整体预测。由于其在区分可溶性蛋白和膜蛋白方面尤为见长， 故常用于判定一个蛋白是否为膜蛋白。