(完整版)酶学与酶工程总结
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Lecture 1 酶学与酶工程
酶的概念:
酶(enzyme )是一类由活细胞产生的,具有催化活性和高度专一性的
特殊蛋白质,是一类生物催化剂。
酶的分类(6类)、组成、结构特点?和作用机制?
组成:单体酶、寡聚酶、多酶复合体
酶
天然酶
修饰酶
分子水平上改良的酶
化学修饰的酶固定化酶Note:一个酶蛋白可有多种催化活性,相当于多个酶(关注原核和真核生物的差别)除水解酶和连接酶外,其他酶在反应时都需要特定的辅酶。
金属在酶催化中的作用:稳定酶构象、参与酶的催化作用(如激活底物)、电子传递体
酶作为催化剂的显著特点:
强大的催化能力:加快反应速度可高达1017倍;没有副反应;
高度的专一性:各种酶都有专一性,但专一程度的严格性上有所差别;可调节性;
同工酶的概念:
同一种属中由不同基因或(复)等位基因编码的多肽链所组成的
单体、纯聚体或杂交体,其理化及生物学性质不同而能催化相同反应的酶称同工酶。 同一基因生成的不同mRNA 所翻译出来的酶蛋白也列入同工酶的范畴。
酶蛋白合成后经不同类型的共价修饰(如糖基化等)而造成的多种酶分子形式,严格来说不属于同工酶而称为synzyme ,但也有人称其为次生性同工酶(secondary isozyme )。
不同种属中催化相同反应的酶称为xenozyme,也不属于同工酶。
酶的活性中心
指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物
必需基团(essential group):酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中,一些与酶活性密切相关的基团。
活性中心内的必需基团:结合基团(与底物相结合)和催化基团(催化底物转变成产物)
活性中心外的必需基团:维持酶活性中心应有的空间构象所必需;
构成酶活性中心的常见基团:His的咪唑基、Ser的-OH、Cys的-SH、Glu的γ-
COOH。
酶的作用机制
酶活力的调节
酶的应用
食品加工方面:生物技术在食品工业中应用的代表就是酶的应用,目前已经有几十种酶成功用于食品工业。如葡萄糖、饴糖、果葡糖浆的生产、蛋白质制品加工、果蔬加工、食品保鲜以及改善食品品质与风味等。
常用的酶制剂主要有:淀粉酶、糖化酶、蛋白酶、葡萄糖异构酶、果胶酶、脂肪酶、纤维素酶葡萄糖氧化酶等。
酶在轻工业方面的应用:用酶进行原料处理(发酵原料、淀粉原料、纤维素原料、含戊聚糖的植物原料的处理、纺织原料、造纸原料的制浆、生丝的脱胶处理、羊毛的除垢),用酶生产各种产品(L-氨基酸、核苷酸、酱油或豆酱、制革),用酶增强产品的使用效果(加酶洗涤剂;加酶牙膏、牙粉和嗽口水)
酶在医学中的应用:主要的医药用酶、用酶进行疾病的诊断、用酶治疗各种疾病、用酶制造各种药物
酶与食品质量安全
酶制剂作为食品添加剂进入食品的潜在危害
酶催化有毒物质的产生
酶作用导致食品中营养组分的损失
潜在的产毒素性
潜在的致病性
对策:安全菌株,体外基因毒理学测试,酶制剂的安全评价,酶制剂来源安全性的评估标准
Lecture 2 基因工程的酶学基础
核酶(Ribozyme):概念:具有生物催化功能的RNA。
看课件
基因工程的酶学基础
基因克隆表达的过程
基因克隆常用的酶,有什么应用,注意事项(补充后两者
)
Lecture 3 酶促反应
✧酶促反应的特点与机理:极高的效率(降低反应的活化能),特异性和可调节性
特异性:一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一定的化学键,催化一定的化学反应并生成一定的产物。酶的这种选择性称为酶的特异性或专一性。
绝对特异性(absolute specificity):酶只作用于特定结构的底物,进行一种专一的反应,生成一种特定结构的产物
相对特异性(relative specificity):酶作用于一类化合物或一种化学键。立体结构特异性(stereo specificity):酶仅作用于立体异构体中的一种。
机理:酶-底物复合物的形成与诱导契合假说(酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、相互变形和相互适应,进而相互结合)可调节性:对酶生成与降解量的调节
酶催化效力的调节
通过改变底物浓度对酶进行调节等
✧两个假说:锁钥假说,诱导契合假说
✧酶促反应动力学:研究各种因素对酶促反应速度的影响①影响酶促反应的因素,Km 值的意义,测定(双倒数作图法)
影响因素包括有:
酶浓度、底物浓度、pH 、温度、抑制剂、激活剂等。(具体见课件)Km 的意义和作用:
1.Km 值等于酶促反应的初速度为Vmax 的一半时所需的底物浓度。
2.Km 值近似等于ES 的解离常数,1/ Km 近似地表示酶对底物亲和力的大小。
3.Km 是酶的特征性常数,在一定程度上代表酶的催化效率。
4.当、温度和离子强度恒定时, Km 只和酶及底物的性质有关,而与酶的浓度无关。
5.一种酶能催化几种底物时就有不同的Km ,其中Km 最小的底物一般认为是该酶的
天然底物或最适底物。
6.当Km 已知时,可求得任何底物浓度下酶活性部位被底物分子饱和的分数(FES )。
7.分辨同工酶:测定几个同工酶对同一底物的Km ,可估计这组同工酶是原级同工酶
还是次生性同工酶,前者的Km 常有差异,后者的则比较接近或相同。
8.探讨代谢规律:肌肉中的A 型醛缩酶,对果糖-1,6-二磷酸的Km 为3µmol/L ,对3-磷酸甘油醛和磷酸二羟丙酮的Km 分别为1mmol/L 和2 mmol/L ,可知其在体内主要催化糖酵解而难于参与糖异生。
9.有助于寻找代谢的限速步骤:如酶1,2,3分别催化A B C D 三步
连续反应,三个酶的Km 分别为10 mmol/L , 1 mmol/L , 0.1 mmol/L ,而细胞内A ,B ,C 的浓度相同,可推知酶1催化的A B 为限速反应。
10.指导生化实验:利用工具酶来测定某一底物的浓度时,可根据米式公式的积分式来
计算工具酶的用量。工具酶的 Km 越大,所需加入的酶量也越大。
鉴别抑制类型
V m 是酶完全被底物饱和时的反应速度,与酶浓度成正比。
②有哪些抑制类型,与Km 之间的关系
不可逆性抑制:抑制剂通常以共价键与酶活性中心的必需基团相结合,使酶失活,不能用透析、超滤等方法予以除去。碘乙酸(ICH2COOH )是一种烷化剂,可使巯基烷化。有机磷化合物(丝氨酸的-OH 磷酯化)、重金属离子及砷化合物 可逆性抑制:抑制剂以非共价键与酶或酶-底物复合物可逆性结合,使酶的活性降低或丧失;抑制剂可用透析、超滤等方法除去。
竞争性抑制:
抑制剂与底物的结构相似,能与底物竞争酶的活性中心,从而阻碍酶底物复合物的形成,使酶的活性降低。(丙二酸是琥珀酸脱氢酶的竞争性抑制剂/磺胺药对细菌FH 2合成酶的抑制).
抑制程度取决于抑制剂与酶的相对亲和力及[S ];动力学特点:V max 不变,表观K m ↑。可通过增加底物浓度而使整个反应平衡向生成产物的方向移动,因而能削弱或解除这种抑制作用。
非竞争性抑制:
抑制剂与酶活性中心外的必需基团结合,底物与抑制剂之间无竞争关系。
抑制剂并非结合于活性中心的底物结合位点,而是此位点以外的基团,如催化基团等。
抑制剂与活性中心结合后也不引起底物结合的立体障碍。
如别嘌呤醇竞争性抑制黄嘌呤氧化酶,其氧化产物别黄嘌呤非竞争性抑制黄嘌呤氧化酶。
非竞争性抑制的特点
S 和E 或ES 都能结合,两者结合的亲和力相等,I 也能和E 或ES 结合,两者的亲和力相等。