银染方法总结
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
银染的方法种类很多,目前有文献报道的就有100 多种。
大致的原理是银离子在碱性pH 环境下被还原成金属银,沉淀在蛋白质的表面上而显色。
由于银染的灵敏度很高,可染出胶上低于1 ng/蛋白质点,故广泛的用在2D 凝胶分析上,及极低蛋白含量测定的垂直凝胶中。
这里介绍的是我们实验室成功运用的银染方法,主要是用于垂直凝胶电泳中低丰度蛋白的检测!如内源性GST-Pulldown、Co-IP等实验中相互作用蛋白的研究
银染操作规程
实验原理:在碱性条件下,用甲醛将蛋白带上的硝酸银(银离子)还原成金属银,以使银颗粒沉积在蛋白带上。
染色的程度与蛋白中的一些特殊的基团有关,不含或者很少含半胱氨酸残基的蛋白质有时候呈负染。
试剂:乙醇、冰醋酸、乙酸钠、硫代硫酸钠、硝酸银、碳酸钠、甘氨酸或EDTA.Na2.2H2O、甲醛
实验操作程序:
固定:30min或者更长时间
100ml 乙醇(40% 乙醇)25ml冰醋酸(10% 冰醋酸)加水到250ml
致敏:30min
75ml 乙醇(30% 乙醇)17g乙酸钠或28.2g三水乙酸钠0.5g硫代硫酸钠加水到终体积250ml 水洗:3 x 10min
银染:20min
0.625g AgNO3、100 ul 37%甲醛(在使用前加入)加水到终体积250ml
水洗:2 x 1 min (注意把握时间,水洗时间长显色速度慢,点的颜色偏黄色)
显色:视情况而定
6.25 g Na2CO3、50 ul 37% 甲醛(在使用前加入)加水到终体积250ml
终止:10min
3.65g EDTA.Na2.2H2O 或者1g 甘氨酸加水到终体积250ml
保存:1% 冰醋酸,4 ℃
注意事项:
1.固定时间较长,则加一步水洗30min,以免胶太脆而破碎。
2.甲醛在使用前加入。
3.最好多配制一份显色液,第一次显色到溶液变混浊时换一份显色液,显色到点清晰。
4.显色过程很快,要注意把握时间,避免染色过度。
5.银染液和显色液需要预冷。
6.所用器皿要很洁净,不用手直接接触,以免杂蛋白污染!
7.清洗用水尽量用高纯度去离子水,蒸馏水更佳,可以减少背景着色。
银染注意事项:
1. 银染主要出现在胶的表面,用薄胶(0.5-0.75mm)可以提高灵敏度。
2. 对于考马斯亮蓝染色的胶,可用甲醇将胶漂洗后,继续进行银染。
乙酸会干扰银染,因此要确保将凝胶中的乙酸彻底洗净。
如果凝胶被过度银染,可用Rapid Fix脱色,并用考马斯亮蓝二次染色。
3. 不同蛋白质对银染的反应是不一样的,尤其是碱性蛋白染色效果差。
因此,不宜用银染测定不同蛋白的比例。
4. 染色过程中,缓慢的振荡是必要的,一般选择40-60 rpm.
5. 凝胶表面的裂纹多是由于压力、手印及表面干燥所致,所以全程操作中都应带手套。
6. 凝胶背景呈均一的黑色多是水中的杂质引起的,所以溶液的配制应使用电导率小于1 μS 的去离子水。
7. 如果染色后有呈灰尘或烟雾状灰色或棕色的沉淀出现在凝胶表面,可能是在几步漂洗过程中洗得不够彻底,或是染色过程时温度太低。
8. 较深的银染背景多是丙烯酰胺中的杂质所致。
9. 在最初甲醇洗脱时就应该先除去甘油、尿素、甘氨酸、Triton X-100和两性电解质这些干扰性物质。
10. 室温操作,温度的波动往往会干扰银染的效果,恒温水浴可以解决这个问题。
11. 当蛋白质中含有核酸或金属时,银染则不会奏效。
改变固定剂和染色之前对胶进行漂洗可以改进染色效果。
12. SDS凝胶中的巯基乙醇会导致在60 KDa或67 KDa处出现两条水平线。
减少巯基乙醇的用量即可避免。
13. 凭借戊二醛预处理可以使各种蛋白质的染色提高40倍。
14. 染色使用的玻璃器皿必须非常干净,用酸浸泡可以满足要求。
15. 银染应尽快照相,随着时间延长,蛋白条带会变浅,而背景会加深。
六我发个简单的配方,我一直用还挺好用,
固定甲醇250ml、冰醋酸25ml、加双蒸水至500ml ,30min,水洗2x2min,后水洗1h。
敏化硫代硫酸钠0.1g加双蒸水至500ml,冲洗双蒸水2x30s
银反应硝酸银0.5g加双蒸水至500ml,避光孵育30min,冲洗双蒸水2次x5min
显色碳酸钠10g加双蒸水至500ml,甲醛500ul,现用现加。
终止观察至想要效果,1%的冰醋酸终止,
七银染应该注意的事项:
1. 银染主要出现在胶的表面,用薄胶(0.5-0.75mm)可以提高灵敏度。
2. 对于考马斯亮蓝染色的胶,可用甲醇将胶漂洗后,继续进行银染。
乙酸会干扰银染,因此要确保将凝胶中的乙酸彻底洗净。
如果凝胶被过度银染,可用Rapid Fix脱色,并用考马斯亮蓝二次染色。
3. 不同蛋白质对银染反应不一样,尤其是碱性蛋白染色效果差。
因此,不宜用银染测定不同蛋白的比例。
4. 染色过程中,缓慢的振荡是必要的,一般选择40-60 rpm.
5. 凝胶表面的裂纹多是由于压力、手印及表面干燥所致,所以全程操作中都应带手套。
6. 凝胶背景呈均一的黑色多是水中的杂质引起的,所以溶液的配制应使用电导率小于1 μS 的去离子水。
7. 如果染色后有呈灰尘或烟雾状灰色或棕色的沉淀出现在凝胶表面,可能是在几步漂洗过程中洗得不够彻底,或是染色过程时温度太低。
8. 较深的银染背景多是丙烯酰胺中的杂质所致。
不要用双蒸水
用去离子的,双蒸水的某些离子会和agno3反应
若用去离子水,也要经常给机器换滤头,以免去离子不净
一步骤溶液时间固定甲醇100ml 冰醋酸25ml 加双蒸水至250ml 30min
冲洗双蒸水3次
敏化甲醇75m 戊二醛(25%w/v)1.25ml 硫代硫酸钠(5%w/v) 10ml 醋酸钠(17g)30min 加双蒸水至250ml
冲洗双蒸水3次
银反应硝酸银溶液(2.5%w/v) 25ml 甲醛(37%w/v) 0.1ml 加双蒸水至250ml 20min
冲洗双蒸水2次
显色碳酸钠(6.25g) 甲醛(37%w/v) 0.05ml 加双蒸水至250ml 2-5min
终止EDTA-Na22H2O(3.65g) 加双蒸水至250ml 10min
冲洗双蒸水3次
二1)PAGE胶切下后用50%乙醇(100ml左右)洗三次,每次20分钟
2)2%硫代乙醇酸钠稀释50倍作用1分钟,双蒸水洗3次,每次20秒
3)2%硝酸银稀释10倍作用20分钟,双蒸水洗3次,每次20秒
4)6%碳酸钠溶液显色,直到条带清晰为止,一般几分钟,大量水冲洗
5)加中止液10%乙酸中止即可
三 1. 固定:100ml MeOH, 24ml H Ac, 56ml 0.04%HCHO, 20ml ddH2O,洗三次,每次>=20分钟;
2. 50%EtOH洗PAGE胶三次,每次20分钟;
3. 预处理:0.02%Na2S2O3 处理一分钟;
4. 水洗:ddH2O漂洗三次,每次20秒;
5. 染色:0.8ml 20%AgNO3+72ml 0.04%HCHO处理PAGE胶20分钟;
6. 水洗:同上;
7. 显色:25ml 12%Na2CO3, 24ml 0.04%HCHO, 1ml 0.02%Na2S2O3, 漂洗10-15分钟;
8. 水洗:同上;
9. 终止:50%MeOH, 12%H Ac,10分钟。
四 1 银染液1(1000ml):甲醇50%乙酸12%(甲醇500ml 冰醋酸120ml)
2 银染液2(1000ml):甲醇30%,乙酸钠0.4M,戊二醛0.5%,硫代硫酸钠0.1%,(含乙酸1-2ml)
甲醇300ml 乙酸钠54.4g 戊二醛10ml 硫代硫酸钠1g 乙酸1-2ml
3 显色液(1000ml) 无水碳酸钠2.5% 甲醛0.02% (无水碳酸钠25g,甲醛1.5ml)
4 硝酸银(100ml):20%硝酸银(过滤后待用)
染色步骤:
1 银染液1 洗2次,每次5分钟
2 银染液2 洗1次,每次30分钟
3 超纯水洗2次,每次1分钟
4 0.5%硝酸银洗30分钟
5 超纯水洗5次,每次1分钟(关键步骤,共计5分钟)显色液显色
6 看到各条带,则倾去显色液, 1%乙酸中止
我感觉浸银后、显色前的水洗非常关键,时间不能太长,次数不能太多,否则可能会染不上颜色。
但水洗不充分又可能导致背景较深。
我个人一般是用水洗三遍,每次半分钟左右。
固定液:50%乙醇,10%冰醋酸,40%水
浸泡液:30%乙醇,6.8% NaAc,50%戊二醛0.625ml,0.2% NaS2O3•5H2O
银染液:0.1% AgNO3,0.02% 甲醛
显色液:2.5% Na2CO3,0.01% 甲醛
终止液:1.46% EDTA-2Na•2H2O。