晶体学软件简介
三维晶体形态绘制软件——xPlane
三维晶体形态绘制软件——xPlane
刘钊;秦善
【期刊名称】《北京大学学报：自然科学版》
【年(卷),期】2006(42)6
【摘要】xPlane是基于VB编写的绘制三维晶体形态及其投影的计算机软件。
对
软件的几何原理、算法以及数据的输入和输出进行了简单介绍。
在表现晶体的立体形态时,仅要求输入点群、晶胞参数和单形符号,就可以显示晶体单形和聚形的立体
形态及其吴氏网投影,并可以实时旋转,也支持多种格式的输出。
xPlane可作为模拟、分析和研究晶体形态的辅助工具以及用于晶体学课程的教学演示。
【总页数】5页(P735-739)
【关键词】xPlane;晶体;三维形态;软件;结晶学
【作者】刘钊;秦善
【作者单位】造山带与地壳演化教育部重点实验室,北京大学地球与空间科学学院【正文语种】中文
【中图分类】P573
【相关文献】
1.西瓜三维形态几何建模和真实感绘制技术研究 [J], 赵春江;陆声链;郭新宇;李长锋;杨月英
2.基于锰配合物为例分析计算机软件绘制晶体结构图可行性 [J], 张璞
3.利用计算机软件绘制晶体结构图--以锰配合物为例 [J], 刘伟;闫丽
4.利用计算机软件Diamond绘制晶体结构图——以锰配合物为例 [J], 刘伟[1];闫丽[2]
5.草莓三维形态几何建模与真实感绘制 [J], 赵丽丽;温维亮;郭新宇;陆声链;肖伯祥;吴升
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SHELXTL程序进行晶体结构分析的方法
数据后处理
对计算结果进行进一步的分析和处理，以满足特定需求或提高结果的可用性。
06
未来发展与展望
新技术与算法的引入
01
人工智能与机器学习
利用机器学习算法对晶体结构数据进行训练，提 高预测精度和效率。
02
云计算与分布式计算
借助云计算资源，实现大规模晶体结构分析的计 算和存储。
程序性能的优化与提升
05
常见问题与解决方案
计算速度慢的解决方法
01 优化算法
采用更高效的算法来加速计算过程。
02 使用更强大的计算机
利用具有更高计算能力的计算机进行计算。
03 并行计算
将计算任务分解为多个子任务，并使用多核处理 器或分布式计算系统同时处理这些子任务。
结果不准确的解决方法
提高输入数据的质量
01
Байду номын сангаас
确保输入数据的准确性，特别是原子坐标和晶胞参数。
晶体结构可以通过X射线晶体学、中子衍射、电子显微 镜等技术进行测定。
晶体结构分析的重要性
晶体结构分析是理解物质性质的基础，有助于揭 示物质的组成、结构和性质之间的关系。
通过晶体结构分析，可以深入了解物质的物理、 化学和生物学性质，为材料科学、药物研发、环 境科学等领域提供重要依据。
晶体结构分析的基本步骤
Shelxtl程序进行晶 体结构分析的方法
目录
• Shelxtl程序简介 • 晶体结构分析基本原理 • Shelxtl程序进行晶体结构分析的方
法 • 实例分析与应用 • 常见问题与解决方案 • 未来发展与展望
01
Shelxtl程序简介
程序起源与历史
起源
Shelxtl程序最初由英国谢菲尔德大学的科学家开发，旨 在提供一种高效、准确的晶体结构分析工具。
关于画晶体结构图相关软件的使用心得-画晶体结构的软件
关于画晶体结构图相关软件的使用心得:画晶体结构的软件看到坛子里经常有人求助画晶体结构的软件及相关的使用说明，通过自己的学习过程写一些心得和大家一起交流。
一般在拿到晶体数据时，我们利用其中的ｃｉｆ文件画图，主要利用的软件有：ｓｈｅｌｘ，ｍｅｒｃｕｒｙ，ｄｉａｍｏｎｄ这三种，以下我来分别介绍一下自己的使用心得：1.shelx的使用，这个软件是大家最为常用的，因为它即可解晶体又可画图，这个软件的使用需要记住相应的命令，早期要在ｄｏｓ下，现在的在ｘｐ下使用已经较方便了。
先总结一下相关的基本命令：read xxx(cif 的文件名) fmol kill $h(若想图看起来清晰，可以不画ｈ原子时用这个命令) ｐｒｏｊ这时看到的是基本的配位环境图若不需要的原子就可用kill删去，若配位环境还达不到你想要说明的可以利用ｇｒｏｗ命令 matr1 pack 这时看到的是从ａ方向的晶胞堆积图，不但可以看到各个原子的配位情况，若有氢键作用，也可以看到；matr2,3是分别从ｂ，ｃ方向，这时就看你的选择是要从什么角度说明了，当然在ｍａｔｒ的命令后，我们看到的图可以通过左手方向的旋转按钮来选择其他的角度，只要能说明问题就好。
ｅｓｃ后ｔｅｌｐ０－３０（数字的选择是在画ｏｒｔｅｐ是的比例一般是３０或５０；若不输入数字，系统会有自动的默认，若想画带有晶胞的图用telp cell 命令）接下来回让你起个name, 什么都好，比如：１ｄｒａｗ１（此时画的就是ａ方向看的堆积图）接下来就是标记各原子的名字（若不想标记在ｔｅｌｐ命令前加ｌａｂｌ０命令）然后问你要画的图存成什么格式，多是选择ｈ再来就是是问你画彩图还是黑白图然后问你选择的纸张大小以上就是ｓｈｅｌｘ的基本命令了，还有一些复杂的大家可以参看陈小明等编写的《单晶衍射分析》这本书。
利用这个软件的好处在与它同时可以解晶体，当数据有些不合理的地方可以在重新解；我觉得最便利的是这个软件在表达氢键作用时非常好，所以我经常利用它画含氢键作用的结构图。
晶体生长计算软件FEMAG系列之晶体生长方法介绍
可扩展性
软件具有开放性和可扩展性， 用户可以根据需要添加新的材 料属性和边界条件。
图形界面
提供友好的图形界面，方便用 户进行模型建立、参数设置和 结果分析。
软件应用领域
半导体晶体生长
用于研究半导体晶体生长过程中的物理和化学行 为，优化晶体质量和性能。
光学晶体生长
用于研究光学晶体的生长过程，优化晶体光学性 能和加工工艺。
增强可视化功能
为了更好地帮助用户理解和分析计算结果，FEMag软件将 增加更强大的可视化功能，如3D图形界面、实时渲染等， 使用户能够更直观地查看和操作计算结果。
拓展应用领域和范围
扩大应用领域
随着晶体生长研究的不断发展，FEMag软件的应用领域将不 断扩大。未来，FEMag软件将不仅应用于传统的晶体生长研 究，还将拓展到其他相关领域，如材料科学、化学、生物学 等。
该软件通过建立数学模型，模拟晶体生长过程中各 种因素对晶体形态、结构和性能的影响。
FEMag软件提供了丰富的材料属性和边界条件设置 ，支持多种晶体结构和生长条件。
软件特点
01
02
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高效计算
采用有限元方法进行数值计算 ，能够快速求解大规模的晶体 生长问题。
精确模拟
能够模拟晶体生长过程中的温 度场、浓度场、应力场等物理 场，以及化学反应过程。
专业和深入。
与实验结果的比较
FEMag与实验的一致性
FEMag软件在模拟晶体生长方面取得了与实验结果高度一致的结果。通过对比实验和模拟数据，可以验证 FEMag软件的准确性和可靠性，进一步推动其在晶体生长研究中的应用。
实验验证的局限性
尽管FEMag软件与实验结果具有较好的一致性，但实验验证仍然存在局限性。实验条件和参数的微小变化可能 会对结果产生显著影响，而模拟结果可能无法完全反映这些细微差异。因此，将实验和模拟结果相结合，进行综 合分析是更为可靠的方法。
materialstudio 计算晶体
近年来，随着计算机技术的飞速发展，计算材料科学成为了材料科学领域中备受瞩目的一个分支。
其中，MaterialStudio计算晶体作为其中的一种重要工具，被广泛应用于材料设计和研究中。
本文将从不同角度探讨MaterialStudio计算晶体的相关内容，以帮助读者更全面地理解这一主题。
一、MaterialStudio计算晶体的基本原理MaterialStudio计算晶体是基于密度泛函理论（DFT）和分子动力学（MD）的计算方法，结合了巨大的晶体数据库和先进的计算技术，可以高效地进行晶体结构的预测和计算。
其原理是通过在计算机上模拟原子之间的相互作用以及结构的动态演化，从而得到材料的结构、力学性能、热学性质等重要信息。
二、MaterialStudio计算晶体的应用领域1.材料设计和优化MaterialStudio计算晶体可以帮助研究人员在计算机上进行大规模的材料结构搜索和优化，以找到具有特定性能的理想材料。
这对于材料设计和新材料的发现具有重要意义。
2.材料性能预测通过MaterialStudio计算晶体，可以准确地预测材料的物理性质，如电子结构、能带结构、光学性质等，对于材料的性能分析和预测具有重要意义。
3.晶体缺陷和界面研究MaterialStudio计算晶体能够模拟材料中的缺陷和界面等微观结构，从而研究材料的稳定性、断裂行为以及晶界对材料性能的影响，为材料改进和优化提供重要参考。
三、MaterialStudio计算晶体在材料科学中的意义MaterialStudio计算晶体的出现极大地促进了材料科学领域的发展和进步。
它不仅提供了一种高效、准确的方法来研究材料的结构和性能，也为材料的设计和优化提供了全新的思路和途径。
通过MaterialStudio计算晶体，研究人员能够更深入地理解材料的微观机制，为新材料的开发和应用提供了有力的支持。
四、个人观点和展望作为一种先进的计算工具，MaterialStudio计算晶体在材料科学领域中具有巨大的潜力和发展空间。
CaRIne Crystallography 使用教程
课程辅助教学软件/《学生自学平台》收集的软件介绍引言：本课程介绍了较多的晶体材料本身及结构转变过程的热力学、动力学、晶体学及组织方面的基本知识。
学生主要的注意力用在理解这些知识上，很少有时间考虑计算机的飞速发展对材料科学教学及研究带来的巨大帮助和便利。
也很少意识到，了解相关的软件不仅可加深对课上内容的理解，还可大大促进将来本科结业中角色的进入，给科研带来大的便利，还锻炼了独立解决问题的能力，以及英语水平。
在《学生自学平台》应用2年多的时间内，因种种原因，我们感觉这些软件并未得到充分的应用。
我们也在思考，在今后的课程学习考核中，以应用这些软件解决一些问题作为成绩的一部分。
其目的还是培养能运用现代科技手段解决实际问题的人才，而不是仅仅记住一些书本知识。
以下简单介绍我们所收集到的相关软件的用途及使用方法。
一、Materials Science on CD-ROM 说明：这是除教学授课用自编多媒体以外最常用的、也是最适合本课程的辅助教学软件。
其特点是，全部为英文。
因本课程在我校定为双语课程，虽然目前开设了英语教学班，但并未能达到与中文授课内容同样多的程度。
因课程内容较难，大范围直接用英文讲学生难以接受，达不到预想效果。
特点二，该软件是教学用商业软件，动画形象效果很好。
缺点是内容较浅，且与所用教材匹配有一定出入，如再结晶、界面两章内容基本未涉及到。
所以它不可能代替我们自己编写的多媒体，只能是辅助材料。
目前该软件得到较大的扩充，可上网访问。
图2是位错塞积现象的模拟块。
可自行设置晶粒尺寸，应力值，观察位错与障碍物交互作用造成的应力集中。
图3是位错间交互作用及位错运动的模拟块，可观察不同位错的运动结果及形成的位错墙。
图1 MA TTER 软件界面图2图3图4是模拟割阶对位错运动产生的拖曳作用的实验界面。
图5是脱溶过程模拟的界面。
可考察不同冷速对脱溶过程及最终组织的影响。
图4图5二、CaRIne Crystallography晶体学软件使用方法简介说明：这是一个既适合于教学也适合于科研的晶体学计算软件。
晶体学软件简介
晶体学软件简介DISK1绘图类raswin94.zip 绘晶体结构图的原代码,晶体结构绘图,分子3D微观立体结构的软件,可以旋转,以多个模式观看，并可以存成普通图形文件。
晶体绘制F35.ZIP 绘制晶体图（f35_eng.exe f35_doc.exe)icmlited.exe 3维分子浏览工具，是MolSoft公司出品的软件ICM的简化版,免费推出，但功能十分强大。
cosmoplayer21.zip 用WEB显示3D图的插件3D-CRYSTALS.ZIP 3D图形库及说明shdem60.exe 晶体绘图crysconI.exe 用原子坐标画粉末图vmd16.exe 分子绘图（原代码 vmd16sr.zip vmd-1.6.src.tar.gz）acdcs10.exe 二维分子结构绘图程序。
...PWCgraph.exe Crystallographica 根据原子坐标绘晶体图、粉末图等，并对其间的关系进行分析（PASCL方式输入）(Crystallographica v1.6 : Name: Team UCF s/n: 1234567890 Licenses: 9 999 Normal: TRWAAHYHHJIR Student: MWYATPPUHJIR Opal: ABWWKBUVHJIR Lite: CGZNLWITHJIR Teac hing: TJSEMVVBHJIR)PWExPack.exe Crystallographica服务包STRUPLO for Windows (version 1.0) 晶体结构绘图Ortep-3 绘热振动椭圆图DTMM40 是一个简单易用的(有机）3维分子模型显示、编辑与构建程序，可以以各种模式显示3维分子。
dm2demo.exe 绘晶体结构图的DEMOcrystal96.zip 用晶体结构数据生成POV和 VRML文件DRAWv24.zip 用晶体结构数据（ATOM文件）生产POV和 VRML文件的原代码ch20w32.exe IE与NetScape浏览器插件,安装后,可以直接用浏览器观看P DB格式的文件,直接在浏览器中观看3D分子。
小分子晶体结构精修可视化软件ShelXle的技术分析
大 学 化 学Univ. Chem. 2024, 39 (3), 63收稿：2023-02-22；录用：2023-05-09；网络发表：2023-05-26*通讯作者，Email:*****************.cn基金资助：同济大学第十六期实验教学改革专项基金项目(1380104126)•专题• doi: 10.3866/PKU.DXHX202302060 小分子晶体结构精修可视化软件ShelXle 的技术分析淡文彦，李伟捷，王晓岗*同济大学工科化学实验教学示范中心，上海 200092摘要：ShelXle 是一款用于小分子晶体结构精修的专业性可视化软件，在高校群体中拥有相当数量的用户，但目前国内外有关该软件使用研究的文献报道非常少，导致众多师生在精修过程中碰到问题时不知道如何进行应对。
本文详细介绍了ShelXle 的开发背景、基本功能、特色功能及操作方法，结合若干案例，通过与其他软件对比，分析了ShelXle 在小分子晶体结构精修中所具备的技术优势，并就如何利用ShelXle 提升精修效果提出了一些参考性建议。
关键词：晶体结构；结构精修；ShelXle中图分类号：G64；O72；O6The Technical Analysis of Visual Software ShelXle for Refinement of Small Molecular Crystal StructureWenyan Dan, Weijie Li, Xiaogang Wang *Experimental Teaching Demonstration Center for Engineering Chemistry, Tongji University, Shanghai 200092, China.Abstract: Being the professional visual software for the refinement of small molecular crystal structure, ShelXle has a large number of users among college groups. Due to the lack of literature reports on the using and research of ShelXle at home and abroad nowadays, many teachers and students were puzzled on how to deal with the problems encountered in the process of refinement using ShelXle. In this paper, the development backgrounds, the basic and special functions and the using method of ShelXle are presented in detail. Combined with several cases and compared with other visual software, its technical superiorities in the refinement of small molecular crystal structures were analyzed, and some suggestions about enhancing its refinement effect were also illustrated.Key Words: Crystal structure; Structure refinement; ShelXle物质的结构决定物质的性质[1,2]，X 射线单晶衍射法是测定物质结构最权威、最有效的技术手段之一。
晶体生长建模软件FEMAG介绍（八）--FEMAGPVT（物理气相传输法）
晶体⽣长建模软件FEMAG介绍（⼋）--FEMAGPVT（物理
⽓相传输法）
FEMAG/PVT软件的主要功能
FEMAG/PVT软件⽤于模拟物理⽓相传输法（Physical Vapor Transport process，PVT）晶体⽣长⼯艺，可以⽤于碳化硅单晶体、氮化铝、氧化锌多晶体等的PVT法⽣长⼯艺过程的模拟。
FEMAG/PVT软件的典型应⽤
FEMAG/PVT软件的典型应⽤是模拟碳化硅单晶的PVT法⽣长过程。
图1是碳化硅晶⽚。
碳化硅（SiC）是⼀种优质的宽带隙半导体材料，具有宽禁带、⾼击穿电场、⾼热导率、⾼饱和电⼦漂移速率等优点，可以满⾜⾼温、⼤功率、低损耗⼤直径器件的需求。
SiC单晶⽆法经过熔融法形成，⽽基于改进型Lely法的升华⽣长技术——物理⽓相传输法是获得SiC单晶的常⽤⽅法。
PVT法制备SiC单晶的⽣长原理是：⾼纯SiC粉源在⾼温下分解形成⽓态物质（主要为Si、SiC2、Si2C），这些⽓态物质在过饱和度的驱动下，升华⾄冷端的籽晶处进⾏⽣长。
过饱和度是由籽晶与粉源之间的温度梯度引起的。
图2是利⽤FEMAG/PVT软件计算碳化硅沉积腔内的温度梯度的结果。
用mercury导出cif格式文件晶体数据
用mercury导出cif格式文件晶体数据摘要：1.Mercury软件介绍2.CIF格式文件概述3.导出CIF格式文件的方法4.晶体数据处理与分析5.总结与展望正文：一、Mercury软件介绍Mercury是一款专业的晶体学数据处理软件，由英国Daresbury实验室开发。
它具有强大的晶体数据处理、分析和可视化功能，可以帮助用户轻松地从原始数据中提取有价值的信息。
Mercury支持多种数据格式，包括CIF （Crystallographic Information Format）等。
二、CIF格式文件概述CIF（Crystallographic Information Format）是一种用于存储晶体学数据的文件格式。
它具有良好的结构化和可扩展性，可以包含晶体结构的多种信息，如原子坐标、键长、键角、空间群等。
CIF文件广泛应用于晶体学研究、数据交换和出版等领域。
三、导出CIF格式文件的方法在Mercury中导出CIF格式文件的方法如下：1.打开Mercury软件，导入所需晶体数据。
2.在“Data”选项卡中，选择需要导出CIF文件的晶体结构。
3.点击“File”菜单，选择“Export”>“CIF”命令。
4.在弹出的“Export CIF”对话框中，设置文件名、存储路径等参数。
5.点击“OK”按钮，导出CIF文件。
四、晶体数据处理与分析1.原子坐标调整：在Mercury中，用户可以对原子坐标进行调整，以优化晶体结构。
2.计算键长、键角：Mercury可以根据原子坐标计算晶体结构中的键长和键角，以便于分析原子间的相互作用。
3.生成可视化图像：Mercury提供了多种可视化工具，如球棍图、等高线图等，便于用户直观地观察晶体结构。
4.数据统计与分析：Mercury可以生成多种统计报表，如原子分布、空间群分析等，有助于深入了解晶体结构特征。
五、总结与展望通过Mercury软件导出CIF格式文件，用户可以方便地存储和分享晶体结构数据。
geogebra 晶体 公式
【概述】晶体是由原子、离子或分子按照一定规律排列而形成的固体物质，是固体结构与性质研究中的重要对象。
晶体结构的研究是固体物理学和材料科学的重要内容之一。
而在对晶体结构进行研究时，公式是不可或缺的工具和方法之一。
在现代科技发展中，geogebra软件的应用也日益广泛。
本文将探讨geogebra与晶体公式的结合，以及它们在晶体学领域中的应用。
【正文】1. geogebra软件介绍geogebra是一款免费的数学软件，可以用于绘制几何图形、代数方程式和统计图表等多种数学内容。
geogebra的特点是功能强大，界面友好，易于操作，是一款非常适合学习和教学使用的工具。
2. 晶体结构的基本概念晶体结构是晶体中原子、离子或分子排列的规则和周期性。
晶体结构的基本概念包括晶格、元胞、结构因子等。
晶格是晶体中周期性排列的点阵，由于晶体结构的周期性，只需将一个晶胞内的原子位置给出，就可以确定整个晶体的结构。
而结构因子用于描述晶体中原子或离子的位置和数量。
这些基本概念对于理解晶体结构起着至关重要的作用。
3. geogebra在晶体学中的应用geogebra软件可以利用其绘图、计算和可视化的功能，帮助研究者更直观地理解晶体结构的基本概念。
可以通过geogebra绘制晶格的几何图形，进行晶格的操作和变换，从而更好地理解晶格的特点和性质。
另外，geogebra也可以用来绘制晶体的结构模型，帮助研究者分析晶体中原子的排列规律和周期性。
通过geogebra软件，研究者可以直观地感受到晶体结构的规则和美丽。
4. 晶体公式与geogebra的结合晶体公式是描述晶体结构的重要工具，描述了晶体中原子、离子或分子的排列规律。
而geogebra软件可以帮助研究者更直观地理解和应用晶体公式。
通过geogebra绘制晶体结构的图像，可以使晶体公式更加生动和形象化。
另外，geogebra还可以进行晶体结构的计算和模拟，帮助研究者验证晶体公式的正确性和可行性。
(完整)利用晶体生长计算软件FEMAG进行晶体生长计算仿真的结果图精品PPT资料精品PPT资料
FEMAG-CZ直拉法模拟软件用于新的热场设计，并研发新的方法以满足新 的商业需求点，比如：
✓大直径晶锭生长 ✓无缺陷硅晶锭生长 ✓提高成品率 ✓氧含量控制 ✓降低碳含量 ✓晶锭半径和沿轴向的电阻率差异减小 ✓CCZ工艺仿真 ✓磁场设计 ✓蓝宝石生长工艺设计
连续提拉法（CCZ）熔体自由表面上部 的氩气流场分布
在横向磁场作用下的三维熔体流动
在横向磁场作用下的三维等温线分布
FEMAG-FZ软件
FEMAG区熔法软件（FEMAG-FZ）用于模拟区熔法 生长工艺 （FZ, PFZ）
FEMAG区熔法软件专注于设计新的热场，并研发 新的方法以满足新的商业需求点，比如： ✓无缺陷晶锭生长 ✓提高成品率 ✓节省R&D成本
• FEMAG软件拥有国际上最先进、最高效、最全面的晶体生长工艺模拟技术 和多物理场耦合仿真功能，可模拟的晶体生长工艺包括提拉法（柴氏法，Cz 法）、泡生法（Ky法）、区熔法（FZ法）、坩埚下降法（垂直布里兹曼法， VB法）、物理气相传输法（PVT法）等，广泛应用于集成电路、太阳能光伏 、半导体、蓝宝石等领域。ON Semiconductor（安森美半导体）、 Kayex、 Siltronic（世创电子材料）、AXT（ 晶体技术集团）、韩国Nexolon、LG、韩 国汉阳大学、Norut（挪威北方研究所）、 SUMCO集团、Gritek（有研新材 料）、天津环欧半导体材料、中环股份、北京有色金属研究总院、清华大 学等企业和科研机构，均是FEMAG软件的用户。
FEMAG-FZ区熔法模拟软件
VB,
VGF）
直拉法晶体生长的三维应力分布
Crystal软件说明
软件介绍CrystalMaker：晶体和分子结构可视化软件探索晶体世界从金属到沸石，苯到蛋白质, CrystalMaker是了解晶体和分子结构的最简单方法。
什么是CrystalMaker?CrystalMaker软件是一款在创建、显示和操作各种晶体分子结构中屡获好评的软件。
CrystalMaker在生产力方面提供了一个流线型的工作流程，您只需把您的数据文件拖拉到程序中便可即时显示照片般逼真的色彩。
用鼠标就可以实时操作晶体结构。
多视角"bookmarks"和撤销次数鼓励您探索和发现——理想的教学和科研软件。
快速创建晶体和分子结构！使用CrystalMaker软件，您可以轻松快速创建任何晶体或分子结构。
内置的对称处理和美观的空间群浏览器可得到晶体的日志，并且该程序会自动生成所有的键和多面体。
CrystalMaker 提供了广泛的模式类型，包括传统的“ball-and-stick”, space-filling, polyhedral, wireframe 以及thermal ellipsoids模式。
使用photo-realistic simpler和line-art display选项，每种模式类型都可以被广泛地定制。
综合数据的输入和输出负载来自于超过15+ 格式的结构数据，包括Cambridge Structures Database, Protein Data Bank, CIF, GSAS, SHELX等。
您可以操作几乎无限的原子数量。
使用独特的"Depth Profiling"工具，快速扫描大规模结构中有用的，从而能从计算机模式中得到理想的特征结果。
大量的输出选项使您能跟其他程序共享数据、保存结构数据、键长、协调环境，甚至用您的数据创建网页。
出色的3D图片深度渐变和视角转换，加上优美的三维立体结构，使您能看到照片质量的图片。
高分辨率打印并把图片保存成各种文件格式，同时您还可以定义图片的大小。
晶体生长仿真软件FEMAG
晶体生长仿真软件FEMAGF产品与服务FEMAG Soft 擅长所有类型晶体材料生长方面的工艺模拟专业技术，比如： • 直拉法（Czochralski ）• 区熔法（Floating Zone ）• 适用于铸锭定向凝固过程工艺（DS ），Bridgman 法• 物理气相传输法（PVT ）产品模块1. FEMAG/CZ-Czochralski (CZ) Process适用于Czochralski 直拉法生长工艺和Kyropoulos 生长工艺2. FEMAG/DS-Directional Solidification (DS) Process适用于铸锭定向凝固过程工艺3. FEMAG/FZ-Float Zone Process (FZ)适用于区熔法生长工艺FEMAG 软件是由比利时鲁汶大学研发的晶体生长数值仿真软件。
20世纪80年代中期，鲁汶大学François Dupret 教授带领其团队，开始晶体生长的研究，经过10多年的行业研发及应用，FrançoisDupret 教授于2003年成立了FEMAGS.A.（总部设在比利时Louvain-la-Neuve市），正式推出晶体生长数值仿真软件FEMAG 。
如今，FEMAG 软件已成为全球行业用户高度认可的数值仿真工具，在晶体生长数值模拟领域处于国际领先地位。
主要功能1. 全局热传递分析“全局性”即包涵所有拉晶要素在内，并考虑传热模式的耦合。
全局热传递模拟分析，主要考虑:炉内的辐射和传导、熔体对流和炉内气体流量分析。
2. 热应力分析按照经验，一般情况下，晶体位错的产生与晶体生长过程中热应力的变化有着密切的关系。
该软件可以进行三维的非轴对称和非各向同性温度场热应力分析计算，可以提出对晶体总的剪切力预估。
“位错”的产生是由于在晶体生长过程中,热剪应力超越临界水平,被称为CRSS(临界分剪应力)，而导致的塑性变形。
3. 点缺陷预报该软件可以预知在晶体生长过程中的点缺陷(自裂缝和空缺),该仿真可以很好的预测在晶体生长过程中点缺陷的分布。
crystalmaker晶体软件教程
工具面板(Tools Palette)
工具面板中的屏幕工具，可以操作、测量和编辑结构。测量工具加上旋转工具，可以对晶体进行精确位向操作。
用户可以在键盘上输入相应的字母来选择工具。
(9)假定这个晶体有序，我们只需要输入单一的占位率值。此例中我们输入“Al1.0”；
(10)在x, y, z栏中输入0.5，编辑窗口如下：
(11)按Return键完成编辑该位置；
(12)现在，按照结构数据表给出的信息，分别输入Mg和O位置的数据。使用Add按钮添加新位置，或使用Remove删除一个位置；
重新排列视图：
点击并拖动视图，对其进行重排
重命名视图：
点击视图文件，输入新的文件名，按Return或enter键完成设置
更新视图：
用户可以重新生成一个视图，以匹配与现在显示的结构：
右键单击要选择的视图，选择Replace with current view
同步视图
Crystalmaker强大之处在于它能快读的同步多个窗口。这样，如果一个视图和另一个相关，用户可以对它们的显示进行设置，诸如原子颜色、渲染样式、位向、尺寸等。
注意，最大键长应该显示在Bmax栏。Crystalmaker会按照1.15×(rA+rB)计算最大键长，rA和rB分别是From和To原子的半径。
(4)点击Info，检查化学键范围是否足够大。
(5)重复2-4，设置Mg-O化学键。当完成设置后，出现以下对话框：
(6)点击OK按钮，重设有了化学键的结构，出现以下图形：
4按tab键移至a栏输入808对话框如下5现在我们需要考虑晶体的非对称基元中的三个位置对于每个位置crystalmaker需要以下信息位置标注最多六位字符字符间不能有空格一个或多个化学符号以及它们的占位率值crystalmaker使用元素符号来决定其原子半径和原子颜色元素符号可以是一个或两个字母每个位置的xyz位置坐标
晶体结构可视化软件VESTA入门教程
晶体结构可视化软件VESTA入门教程电影《功夫》里有段话：少年，我看你骨骼惊奇，是万中无一的武学奇才，维护世界和平就靠你了，我这有本秘籍《如来神掌》，见与你有缘，就十块卖给你了！那么，作为材料人的你是否也想看看自己的材料是否“骨骼惊奇”呢，我这里有晶体结构可视化软件VESTA 入门教程，见与你有缘，就分享给你啦，让你也能轻松绘制出如图1所示的漂亮的晶体/材料结构图。
图1 采用Vesta绘制出的材料结构示意图♦目录♦1、软件介绍2、建立晶体结构2.1 导入晶体结构文件2.2 手动建模3、查看晶体结构信息3.1 查看基本信息3.2 查看原子坐标3.3 查看原子距离3.4 查看原子夹角，二面角和界面角4、调整晶体结构4.1 调整晶胞参数4.2 降低晶体对称性4.3 增加原子和调整原子位置4.4 删除原子4.5 构建超晶胞5、美化晶体结构5.1 修改总体外观5.2 修改晶体结构显示方式5.3 调整原子、键和多面体等显示特性5.4 显示晶面6、输出图片或数据7、其他功能1、软件介绍VESTA （V isualization for E lectronic and ST ructural A nalysis）是由日本国立科学博物馆的Koichi MOMMA和京都大学的Fujio IZUMI开发出的一款用于晶体结构和电子结构可视化的专业软件。
VESTA功能十分强大，它可以非常简单地实现晶体结构建模、查看结构信息、调整晶体结构参数和显示外观，输出图片或转换数据格式等一系列功能。
VESTA是一款免费的软件，你可以在学术、科学、教育及非商业应用中尽情使用，但最好在发表时引用下面这个参考文献：K. Momma and F. Izumi, “VESTA 3 for three-dimensional visualization of crystal, volumetric and morphology data,” J. Appl. Crystallogr., 44, 1272–1276 (2011)。
CaRIne Crystallography 使用教程
课程辅助教学软件/《学生自学平台》收集的软件介绍引言：本课程介绍了较多的晶体材料本身及结构转变过程的热力学、动力学、晶体学及组织方面的基本知识。
学生主要的注意力用在理解这些知识上，很少有时间考虑计算机的飞速发展对材料科学教学及研究带来的巨大帮助和便利。
也很少意识到，了解相关的软件不仅可加深对课上内容的理解，还可大大促进将来本科结业中角色的进入，给科研带来大的便利，还锻炼了独立解决问题的能力，以及英语水平。
在《学生自学平台》应用2年多的时间内，因种种原因，我们感觉这些软件并未得到充分的应用。
我们也在思考，在今后的课程学习考核中，以应用这些软件解决一些问题作为成绩的一部分。
其目的还是培养能运用现代科技手段解决实际问题的人才，而不是仅仅记住一些书本知识。
以下简单介绍我们所收集到的相关软件的用途及使用方法。
一、Materials Science on CD-ROM 说明：这是除教学授课用自编多媒体以外最常用的、也是最适合本课程的辅助教学软件。
其特点是，全部为英文。
因本课程在我校定为双语课程，虽然目前开设了英语教学班，但并未能达到与中文授课内容同样多的程度。
因课程内容较难，大范围直接用英文讲学生难以接受，达不到预想效果。
特点二，该软件是教学用商业软件，动画形象效果很好。
缺点是内容较浅，且与所用教材匹配有一定出入，如再结晶、界面两章内容基本未涉及到。
所以它不可能代替我们自己编写的多媒体，只能是辅助材料。
目前该软件得到较大的扩充，可上网访问。
图2是位错塞积现象的模拟块。
可自行设置晶粒尺寸，应力值，观察位错与障碍物交互作用造成的应力集中。
图3是位错间交互作用及位错运动的模拟块，可观察不同位错的运动结果及形成的位错墙。
图1 MA TTER 软件界面图2图3图4是模拟割阶对位错运动产生的拖曳作用的实验界面。
图5是脱溶过程模拟的界面。
可考察不同冷速对脱溶过程及最终组织的影响。
图4图5二、CaRIne Crystallography晶体学软件使用方法简介说明：这是一个既适合于教学也适合于科研的晶体学计算软件。
晶体结构软件—Mercury
晶体结构软件—Mercury利用Mercury软件可以更好的观察研究晶体结构，有利于晶体结构研究。
文章重点介绍利用Mercury软件研究晶体结构。
标签：Mercury；晶体；结构在晶体结构研究过程中，研究者往往要展示晶体的微观内部结构单元，虽然有结构模型，但是数量有限，展示的效果不盡如人意。
随着化学软件技术的发展，已经有很多软件可以很好地为晶体结构研究服务。
Mercury是英国剑桥晶体数据中心Cambridge Crystallographic Data Centre制作的剑桥结构数据库系统Cambridge Structural Database System下的一个软件，用来观察研究晶体的三维结构，时有免费的版本和商业版更新。
Mercury运行在Windows（或Unix平台）上。
下面简单介绍一下利用Mercury软件来研究晶体结构。
1 Mercury软件的主窗口Mercury软件的主窗口比较简单，屏幕中间的黑色区域为显示区，所读入的晶体结构数据输出在这里；标题栏显示程序的名称以及当前打开的晶体编号；菜单栏包含一系列菜单命令；工具栏位于菜单栏的下方，列出常用的工具，例如：显示风格、颜色、选择模式和操作方式等等；位于屏幕右侧的空白区域为结构列表区，列出载入文件或数据库所含的结构列表；处于显示区下方的有接触列表区和选项区，前者与分子间或分子内接触作用相关，而后者包含一些常用选项。
此外，在显示区下方还有一个是否进行晶胞堆积的复选框；屏幕最下方为任务栏，包含与当前状态有关的帮助信息。
2 Mercury软件的简单操作2.1 文件调入mercury软件使用.cif结构文件，要求该结构文件所在的路径不能含中文。
2.2 晶体结构位置调整显示窗口中按住鼠标左键或右键拖动可以随意旋转结构和调整结构大小的缩放率，也可以通过快捷菜单中的快捷命令来调整，以得到较好的结构视图。
2.3 显示样式选择style可以选择原子显示模式，wireframe线框式（默认）、capped stick粗棍式、Ball and Stick球棍式和Spacefill空间堆积模型。
channel5统计晶界密度
channel5统计晶界密度
（原创版）
目录
一、引言
二、channel5 统计晶界密度的概念和方法
三、晶界密度的实际应用
四、总结
正文
一、引言
在材料科学研究中，晶界密度是一个重要的参数。
晶界是晶体内部不同晶粒之间的界面，其数量和分布对材料的性能有着重要影响。
因此，准确地统计晶界密度对于深入了解材料的微观结构和性能至关重要。
本文将介绍如何使用 channel5 对晶界密度进行统计。
二、channel5 统计晶界密度的概念和方法
channel5 是一款功能强大的晶体学数据处理软件，可以方便地对晶界密度进行统计。
晶界密度是指单位晶界长度上的晶界数目。
在 channel5 中，可以通过以下步骤对晶界密度进行统计：
1.首先，对材料进行晶体结构解析，获得其空间群和晶胞参数等信息。
2.利用 channel5 的晶体结构编辑功能，绘制出晶界的位置和方向。
3.利用 channel5 的统计功能，对晶界进行计数，并计算晶界密度。
三、晶界密度的实际应用
晶界密度对于材料的性能有着重要影响。
一般来说，晶界密度越高，材料的强度和硬度越高，但同时塑性和韧性会降低。
因此，通过调整晶界密度，可以实现对材料性能的调控。
在实际应用中，晶界密度的统计结果可以为材料的设计、制备和性能优化提供重要参考。
例如，在钢铁材料中，通过控制晶界密度，可以提高其强度和韧性，从而提高其使用寿命和性能。
四、总结
晶界密度是描述材料微观结构的重要参数，其对材料性能有着重要影响。
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晶体学软件简介作者：liguowu 文章来源：本站原创点击数：21085 更新时间：2007-03-20DISK1绘图类raswin94.zip绘晶体结构图的原代码，晶体结构绘图，分子3D微观立体结构的软件，可以旋转，以多个模式观看，并可以存成普通图形文件。
晶体绘制F35.ZIP 绘制晶体图(f35_eng.exe f35_doc.exe)icmlited.exe 3维分子浏览工具，是MolSoft公司出品的软件ICM的简化版，免费推出，但功能十分强大。
cosmoplayer21.zip 用WEB 显示3D 图的插件3D-CRYSTALS.ZIP 3D图形库及说明shdem60.exe 晶体绘图crysconI.exe 用原子坐标画粉末图vmd16.exe 分子绘图(原代码vmd16sr.zip vmd-16src.tar.gz)acdcs10.exe 二维分子结构绘图程序。
…PWCgraph.exe Crystallographica根据原子坐标绘晶体图、粉末图等，并对其间的关系进行分析( PASCL方式输入)(Crystallographica v1.6 : Name: Team UCF s/n: 1234567890 Licenses: 9999 Normal: TRWAAHYHHJIR Student: MWYATPPUHJIR Opal: ABWWKBUVHJIR Lite: CG ZNLWITHJIR Teaching: TJSEMVVBHJIR)PWExPack.exe Crystallographica 服务包STRUPLO for Windows (version 1.0)晶体结构绘图Ortep-3 绘热振动椭圆图DTMM40 是一个简单易用的(有机)3维分子模型显示、编辑与构建程序，可以以各种模式显示3维分子。
dm2demo.exe绘晶体结构图的DEMOcrystal96.zip 用晶体结构数据生成POV和VRML文件DRAWv24.zip用晶体结构数据(ATOM文件)生产POV和VRML文件的原代码ch20w32.exe IE与NetScape浏览器插件，安装后，可以直接用浏览器观看PDB格式的文件，直接在浏览器中观看3D分子。
WLViewerLite35.exe 3维分子浏览工具，是分子模拟公司出品的软件Weblab ViewPro的简化版，免费推出，但功能也十分强大。
可读取PDB格式及其他数种格式的分子文件ATOMWIN40 atoms中文汉化版结构分析与解析晶体结构测定软件包(zaoscail.exe)—套包含了以下全部解结构程序的程序包，ABSEN, GETSPG, GENINS, SHELXS-86, SHELXS-97, SHELXL-97-2,ORTEX, CIFTAB, RASTEP and RENDER, FORMATS, Powdis, PowutlCiftab and Psicalc.非常超值。
zaoscail.exe晶体结构测定软件包wcromer.zip 计算散射因子zthma32.zip 热振动分析laue.zip 根据HKL确定空间群setup-beta1-dec00.exe (crystals.exe) 自动晶体结构测定及分析软件(很好用)刼渤洪皐dio sxs dio^iOMd'毒滋誓宙祟多以宙歎旧'切站詛章44視£占阴丄soa < 出MNI丄畀萃'毋切站阴係£因 '更谄£占鳶44 '刑畀甘区渤孫£占出占共工酉9—者-|O^IN3dOO9X90LU9PS0 dO 丄鳶44韜£占d!zz厂uois 8X97O_sn0B>|| djzunxsnqdizoopg£；d6 9X97£ui/v\-q i，^-ssn^iadlZU9|BA|eO W® BMrS djzieoiOAai3A13ld djz ssepdizsiuudj dizjiodss3XV 9X9 £2MS9Xe 苜工ses6 9X9 ；i>|ses6區苗切站渤孫孫半禺^Wses6 9X9 ses6-odispoiu 9ui||e;sXjo bu屮E】S e LUOJJ us>|e; sjsisiuejed IQO pue ss;euipjooo OILUOIB sq; jo lusiusuipj 9dX;-p|9A；9iy e Xq ssjnpnj;s dVa>1SVlSMOaNIM w NO丄bid djzimd'(penis $」6||E/S)uoipsjjoo uoi;djosqe leouidius JOJ snbiuqos; SEVdia o 屮'6 s) sj3；m IBJ9A9S pue (NO丄Did LUBJ6OJC I soiqdej6 JB|no9|oiu sq; pue s;o|d o”!|E”oo|-dm丄占O, P9||9qe| o!；eiuo;ne 6 s) soiqdej6 '(〜旧;ndui 1X13HS 'UOIIBLUJOJSUBJ; ||so) S3i；!i!；n 33!ue| sq; ui spiOA 'X JISLULU X S B UISSILU」oj s i) s;ss; '(oi。
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渤孫勃暫皐酗身'章渤聃曾瑟 '堪询笨宙'自畐宙⑥smopujM ①一者04 OJURS X JO djz djziQzmoilin.exe 分子构建与观察软件，是Tinker软件的Windows界面程序dtmm4setup.exe是一个简单易用的3维分子模型显示、编辑与构建程序，可以以各种模式显示3维分子，并能进行编辑。
本版本为时间限制版，只可在2000年内使用。
gopenmol.win32.1.4.zip —个显示并分析分子结构及其特性，计算分子轨道、电子势的软件包icmlited.exe 3维分子浏览工具，是MolSoft公司出品的软件ICM的简化版，免费推出，但功能十分强大。
可读取PDB格式及其他数种格式的分子文件java3d-1_2-win.exe使用JAVA技术编写的三维分子查看器，需要安装Java3D，2.1M，后才能执行，此版本使用浏览器执行m2m34dem.exe主要用来进行各种分子文件的转换，支持30种主要分子格式，也可以用来进行3维分子的简单显示。
可将PDB格式输出为P OV格式后，用POV-RAY进行渲染，生成非常漂亮的三维图形。
演示版只支持样板文件与原子数小于20的分子文件格式的转换。
Mage_5_75.exe 读取并演示Kinemage格式文件的专用软件。
Kinemage格式是一种电脑图像交互式演示格式MP2install.exe MolPOV是PDB格式至POV格式转化工具，可以将大分子PDB格式文件转化为POV格式DISK2粉末衍射软件pcw23.exe根据结构绘粉末图，计算晶粒度和畸变，晶胞参数精修，结构尝试（很好用）powder2.zip （powder1.zip）晶胞参数计算，指标化wincell.zip零点校正、晶胞参数精测、根据晶胞参数计算指标chekcell.zip晶胞参数计算，对称测试celref.zip精测晶胞参数（与chekcell.zip相同，功能更强）UnitCell.zip 晶胞参数计算Xrayscan.zip 指标化程序（DOS）relatedwin32.zip 指标化程序（DOS）crysinst.exe 指标化软件包（DICVOL，ITO，TREOR90）indx.zip根据晶胞参数、空间群计算指标poudrix.zip根据原子坐标计算粉末图index.zip 未知晶胞的粉末法指标化Pulwin1.zip 图谱拟合gemstone.zip 宝石鉴定pearson.xls EXCEL的谱线拟合（可以用于分析拟合方法）derb.zip粉末PDF数据分析（原代码）PXALL.zip POWDER5rietan94.exe Rietveld精修软件，94版带原代码wgetspec.zip查空间群的对称坐标equiv.zip查找空间群的对称坐标（与wgetspec.zip相似）wulff.zip 画赤平投影圆truecell.zip复合晶胞查找lepage.zip格子转换dispano.zip散射因子F系数查找convert301.zip 文件转化orientex.zip 劳挨法晶体定向scatfac.zip计算原子散射因子gretep.zip 绘热振动参数图overlap.zip提取合法结构因子峰getspec.zip计算对称操作gfour.zip 傅立叶计算（可与FULLPROF连用）winplotr.zip FULLPROF 软件包（是winfp98 的2001 新版本）valence.exe键价计算getspec.for计算对称操作gtsplb.for计算特定位置表coue.zip a program that converts Crystal atomic constraintsinto GSAS constraints in a forn that can becut and pasted into the GSAS atom menu in EXPEDT.rietan2000.zip 粉晶全谱拟合晶胞参数精修RIETAN-2000 is a multi-purpose pattern-fitting systemdrxwin2245_demo.zip 粉晶图形处理寻峰、拟合等DRXWIN Windows-based graphical and Analytical Tools for XRD Powder Patterns. Works with files from several diffractometers.powder18.zip 粉末拟合软件dosrietq23.zip 粉末拟合，结构精修程序（windows）diffuse.zip 粉末拟合原代码（for）ARITVE is 粉末法进行结构和晶胞参数精修 a program for modelling amorphousWinMProf.exe 粉末法结构精修程序Rietveld profile refinement programjanainst_new_pentium.zip jana2000用粉末数据解结构和精修结构程序k-inst8.zip 粉末谱线拟合An interactive and graphical X-ray line profile fitting program XFITtracdemo.exe 粉末图处理，寻峰、指标化、晶胞参数精修、晶粒度及定量分析winfit.zip x 射线图谱线拟合，晶粒度、晶格畸变分析软件package for complete profile-analysis of x-ray reflectionsrenexe.zip 编辑分析衍射图（拟合等，用于分析峰形较弥散的衍射图）Renex is diffraction patterns editor and analyser for Windows.It has b een specifically designed to works with overlapped peaks and "non-ideal" or "noisy" patterns. X-ray diffraction data.hklgen.zip 根据晶胞参数生成HKL指标sginfo_1_01.zip空间群信息winfp98.zip多相全谱拟合，结构精修、定量分析ConvX.exe 文件格式转换xry96dos.zip DOS的粉末法结构精修程序zefsaII99.zip粉末法结构测定程序（C原代码）SWS.zip 一组DOS程序（包括对称群投点，等效点对称，点群晶面，元素周期表，衍射仿真，2D绘图，赤平投影，傅立叶变换演示，晶体习性图，晶体结构图，Rietveld仿真图，平面群，劳埃衍射仿真等16个程序，含说明）Maud.zip Maudgl.zip updateMaud.zip 衍射谱拟合分析babel94.zip 文件转换、查找Program designed to interconvert a number of file formats currently used in molecular moldeling. rpm for Linux available at ftp site.Db2di.zip db 计算（dos）Db9807a2.zip DB 粉末法软件（DOS）Dmplot3.48.zip BD9411 粉末绘图kriber_1.0.zip 计算键长键角的原代码ensetup.exe 粉末法解结构（DEMO ）farhan.zip 定性定量分析（dos）qfact.zip 粘土001衍射宽化因子theta.zip 2o-d 值转换lpdfdemo.exe （lookPDF）查PDF 卡片zpowder.exe结构精修程序Diffuse-4.0-beta.exe结构精修全谱拟合绘图软件包（dos）bgmnwin32.zip 解结构程序（dos demo）crossbed.zip 测量层旋转度struct.zip 计算001结构因子superlat.zip反射曲线计算x-ray.zip又是一个反射曲线计算txrddemo.zip PDF 查找程序（DEMO 版）db9411.zip windows 界面的Rietveld 程序DISK3C原代码diff.zip 拟合c原代码gnuplot.zip 曲线绘图gpcontrib.zip 数据拟合绘图函数库raswin-94 绘3d结构图graph.zip 绘图c原代码viewtools.zip 3d图形的观看和打印xnd118.zip 多相粉末法晶体结构精修 1.18xnd120.zip 多相粉末法晶体结构精修 1.20xnd_1.zip 多相粉末法晶体结构精修 1.0xnd95.zip 多相粉末法晶体结构精修win95atominfo96.zip 原子散射因子crystal96.zip 晶体结构绘图（球、键、多面体）并生成VRML文件DRAWv24.zip 将晶体结构文件生成VRML文件drawxtl96.zip 生成POV 和VRML 文件cc3d_src,lib,doc VRML 查看原代码sourc106.zip晶体结构绘图vmd16sr.zip 3d绘图原代码wcromer.zip 计算f' f"因子的原代码csize.c晶粒度计算zefsaII99.zip沸石结构分析程序atoms.zip蛋白结构显示原代码c语言gcube2plt.c立方高斯算法babel-94mm2_params.cmmconv.zipmoldy.zip 分子动力学仿真程序multi.zipRaster3D_2.4b.zip 绘3d 分子图rayshade40.zip射线跟踪程序react.zip 化学反应动力模拟程序react2.zipreg_sub.zip 由分子振动产生xyzsginfo96.zip 空间群信息表simpro.zip 拟合程序simref1.zipEspoir.zip Espoir 分子图形绘图包MS Visual C++ 6 Compaq Visual Fortran 6.1 spectrum.c产生光谱频率和振幅steric.zip分子参数计算配位键角等translit.zipvaxtostd.cnab5.zip 创建描述高分子核酸nab5_v10.zip创建描述高分子核酸 1.0nab5_v11.zip创建描述高分子核酸 1.1otf.zip 高分子绘图程序otf-0.2.zip高分子绘图程序0.2viewmol-221.zip 蛋白分子绘图periodic.zipvisad1_1.zip交互式运算系统cod14src.exe自动代码生成器quatfit.c四元素法添加原子拟合mmio.zip 宏模型结构输入输出MMIO stands for "MacroModel Input-Output" documentation.zip ps 宏代码dsql.3.zip分布式SQL C原代码dynal.zip 窗体库fda.zip fda输入程序gs7.zip GS原代码tinkersource.zip 晶体结构建模tinker原代码及说明Fortran原代码ccp4-4.1.1.zip ccp4晶体学原代码库Db9807d.for 著名的Rietveld精修程序（98版）dbws94.zip 著名的Rietveld精修程序（94版）dbw89.zip 著名的Rietveld精修程序（89版）camel1975.txt 吸收校正75camel1977.txt 吸收校正77atom.zip计算原子电荷密度reci.zip电子衍射指标化fousyn.zip最大熵分析原代码treor.zip未知晶胞参数的指标化原代码prium.zip指标化和晶胞参数精修cif_rho.dic 创建CIF数据目录ciftbx.zip CIF 文件转换FATRIET.zip Rietveld精修软件原代码al3_f矩阵运算derb.zip粉晶定量分析（PDF法）diffuse.zip PDF法全谱拟合结构精修espoir00.zip ESPOIR3.5 WINDOWS 版fullprof97.zip rietveld 全谱拟合getspec.zip计算对称操作mprof96.zip Rietveld 的拟合程序ortep00.zip ORTEP-III热椭球绘图程序overlap.zip 用Le Bail法产生结构因子powder91.zip粉末图指标化程序sir92.zip结构解析程序sirpow92.zip粉末法结构解析xdgeom.zipxdini.zip小分子晶体结构分析软件xtal00.zip小分子晶体结构分析软件gn21.zip 神经网络演示PASCALgtsplb.for计算特定位置表Tools工具xc1.zip x —windows 系统原代码XWIN32.zip x —windows 系统原代码F2C FORTRAN 到C的转换，不熟悉fortran程序者的福音kriber_1.1.zip pascal 到C 的转换程序晶体学经典Fortran原代码fordap-70 exfft-80 treor-90 espoir-00reduce-70 multan-80 dicvol-91 ortep-00ortep-71 normal-80 powder-91 xtal-00sadiana-71 search-80 rmca-92 diffax-01wilson-72 dicvol-82 pluto-92xanadu-73 xrs-82 sir-92#agnost-74 mprof-83 sirpow-92#icon-74 ito-84 stidy-92linex-74 orffe-84 tmacle-92camel-75 struplo-84 xyz-92latcon-75 treor-84 absorb-93dls-76 block-85 parst-93shelx-76 exfft-85 sbgbbg-93camel-77 getspec-85 strumo-93lazy-77 geom-85 aritve-94louv-77 lsq-85 dbws-94 xfls-77 ortep-85 cascade-95 celref-78 rbls-85 difabs-95 fordap-79 search-85 gtsym-95 shelx-79 sort-85 ccsl-96 volcal-79 wtanal-85 lhpm-96 hole-86 mprof-96 powd12-86 ortep-96 shadow-86 struvir-96 shelxs-86 caos-97 visser-86 cif2sx-97 appleman-87 difrac-97 ito-87 dirdif-97 patsee-87 fullprof-97 pawley-87 glassvir-97 wppf-87 laue-97 dragon-88 tessel-97 mcmag-88 xhydex-97 pro-fit-88 iucrval-98 xlat-88 lapod-98 dbw-89 thma-98 fullprof-89 espoir-99 rietan-89 hydrogen-99 pluto-?? promet-99DISK 4粉末法软件winfp99.zip WINFITPROF99 粉末法解结构软件winmprof.zip 粉末法结构精修程序（2001版）ensetup.exe 粉末法结构分析程序zpowder.exe粉末衍射分析软件（新版）simref.zip 粉末法结构精修程序（含原代码）simpro.zip粉末衍射结构精修（含原代码）xrs-dist.zip XRS82粉末衍射结构分析，DOS含原代码xrc32.zip 粉晶X射线数据绘图、排序分析等El_dens.zip粉末数据电子密度计算xfit32 全谱拟合傅立叶分析（FOURYA+XFIT）DBWS9807.zip 粉末法Rietveld结构分析程序最新全套软件（含原代码，说明和示例）arit.zip Rietveld 程序ARIT is a Rietveld method software including the original Le Bail method （1987）, working with a curious profile shap e description by Fourier series.aritve.zip 玻璃型结构的Rietveld 分析，ARITVE models glass structures by a Rietveld-typexraydraw.zip 李国武开发的粉晶X射线衍射图形处理软件ED9214.zip 带WINDOWS数据编辑程序的晶胞参数精修及指标化程序X射线粉晶衍射程序包.zip本人开发的包含绘图xraydraw和晶胞参数精修ED9214的粉晶衍射软件包searchmooth_scr.zip本人开发的采用新算法的衍射数据平滑寻峰原代码（c函数）ED9214_SCR.zip本人开发的9214程序的WINDOWS数据编辑程序原代码rmcaw95.zip 衍射拟合程序（含原代码）PkChopr.zip excel宏代码的拟合Stepcon.zip excel宏代码拟合绘图mudmastr.zip 计算晶粒度和晶格畸变的excell宏代码xray96.zip A program for producing idealised powder diffraction lineprofiles from overlapped powder diffraction patterns.This program may be used as a preliminary to the programCRYSIZ, for computing crystallite size and strain fromthe broadening of powder diffraction lines.winplotr.zip 粉末法绘图（新版）InstMsi.exeInstMsi_v1.1_ForWin9x.zipisopro3.zip Isopro is an isotopic distributionMagePak.011011.win.zip 动力学绘图A "kinemage" （kinetic image） is an authored illustration presented as an interactive computer display.MCE_VR_v11_exe.zip 3D 绘图程序MCE_beta7_distribution.zipprobe.2.1_6.000114.win.exe.zip "probe" generates "contact dots" at points on the van der Waalssurface of atoms which are in close proximity to other atomsreduce213_2.991005.win.exe.zip 加H 程序IdentificationTable.pdf 沸石衍射鉴定数据一组有机分子结构图形显示程序（DEMO）democisi.exe Chemistry 4D- Drawcarined.exe CARINE Crystallographycof45net.exe ChemOfficecd45wn32.exe ChemDrawcon50.exe E-Lab Notebook Full Version - 14 Days Trialmol2mol40demo.execft.exe Chemical Formula Tutordmupack.exe 绘图DRAWmolULTRApackecelpre.exe Electrochemical Cells Proezellen.exe Elektrochemische Zellen Pro - Deutschhchem5.exe 图片演示ultradem.exe 绘3D分子结构图umy2k.exe UltraMol 2000 版PoleMic.zip 矿物鉴定程序（利用矿物的特征数据库鉴定矿物）x-ray-b_5.zip X射线反射仿真phasanxdemo粉末法软件newwx20.ZIP a XAS data analysis program（DEMO）breadth.zip线宽分析程序（DOS）eracel.exe晶胞参数精修程序（DOS）superlat.zip X射线衍射曲线计算（应变评估）perlib18.zip 元素周期表plvinst.exe 一个粉晶分析软件（DOS）原代码partsys_O.1.zip 3D 绘图cpp 原代码xdini FOR原代码xdgeom FOR原代码gdis-0.74.zip 绘图原代码atomos.tgz建立初始结构的C原代码mmdist.zip 微分子结构分析原代码ciflib-v3-prod.zip CIFLIB - Class Library and C APIescher.src.zip等效点系演示（JAVA 程序）gromacs-305.zip 原代码xtal-370.orig.zip VRML 生成原代码crystal.zip 晶体结构显示原代码shadow-232.zip shaow 原代码Atom.zip 计算原子电荷密度Dhklm.zip 计算调制结构的D值fousyn.zip差值傅立叶和帕特森合成Lazy.zip 计算理论衍射图Pirum.zip 指标化和精修晶胞参数Profit.zip 单峰拟合程序Reci.zip 电子衍射相分析Treor.zip 未知晶胞参数的指标化Espoirsource.zip Espoir for Windows complete source code wulff.c Draw a Wulff Netpgplot.zip 图形显示（for原代码）C原代码atoms.zip 蛋白结构显示原代码c语言diff.zip 拟合c原代码dsqL3.zip 分布式SQL C原代码dynal.zip 窗体库fda.zip fda输入程序gcube2plt.c立方高斯算法gnuplot.zip 曲线绘图gpcontrib.zip数据拟合绘图函数库graph.zip 绘图c原代码mm2_params.c SIFT THROUGH MM2/MM3 OUTPUT FILE FOR ERRORS REGARDING MISSING PARAMETERS AND DERIVE THOSE PARAMETERS BASED ON SIMILARITIESBETWEEN THE INVOLVED ATOM TYPES AND EXISTING PARAMETERS FOR OTHERATOM TYPES (OR BY ASKING USER IF NO SIMILAR CASES EXIST).mmconv.zip mol/mol2 and MM2/MM3 file conversionsmmio.zip 宏模型结构输入输出MMIO stands for "MacroModel Input-Output"moldy.zip分子动力学仿真程序multi.zip 分子绘图nab5.zip创建描述高分子核酸nab5_v10.zipnab5_v11.zipotf.zip 高分子绘图程序otf-0.2.zipperiodic.zipquatfit.c四元素法添加原子Raster3D_2.4b.zip 绘3d 分子图rayshade40.zip射线跟踪程序react.zip化学反应动力模拟程序react2.zipreg_sub.zip 由分子振动产生xyzThis program produces XYZ animation files for molecular vibrations represented by normal modes taken from output files from Aces2,Gamess, and Gaussian.spectrum.c产生光谱频率和振幅steric.zip分子参数计算配位键角等translit.zip 数据转换The TRANSLIT program is a powerful tool for such tasks. It converts an input file in one representation to the output f ile in another representation usingan appropriatevaxtostd.cviewmol-221.zip 蛋白分子绘图viewtools.zip 3d图形的观看和打印visad1_1.zip交互式运算系统atomos.zip PIMM molecular mechanics package worldwide as an efficient tool for thecreation of starting structures.atvolV1.2.zip "atvol" calculates the volumes of atoms in a PDB file by splitting the atoms along the bonds (at the seams) and performing M onte Carlo integrationreduceV2.15.source.zip 原代码program for adding hydrogens to a Protein DataBank (PDB) molecular structure file. It was developed at Duke University in the lab of David and Jane Richardsonprobe28.011009.source.zip readingatomic coordinates in protein databank (PDB) format files and writingcolor-coded dot lists (spikes where atoms clash) for inclusion in akinemageplaton.zip 原代码(FOR)vbrun60sp5.zipMCE_VR_v11_src.zip 3D 绘图原代码MCE_beta7_source.zipmage602.020211.zip 动力学绘图C原代码GX_src.zip GS结构分析程序原代码fragpro1.zipdang1.6src.zip 原代码Dang is a simple UNIX C++ program to read a Protein DataBank (PDB)molecular structure coordinate file and generates a table of severaluseful geometric measurements for each residue or base.cluster.1.1.011024.zip C++ program to build lists of collectionsof interacting items from records containing interacting pairsand larger fragments.It reads in lines consisting of two or more names and outputconnected clusters of namesciftbx.zip (For)This is a version of CIFtbx which has been extended to work with DDL 2 and mmCIF as well as with DDL 1.4 and core CIF dictionaries. bndlstV16source.zip 文件转换"bndlst" lists connectivity information for atoms in a PDBfile. It puts the information out in a tabular formkalkulator.zip 计算器kalkulator-inst.exe 化学计算器2.37thechemicalcalculator.exe 化学计算chemxb.zip 原子、化学键和结构学习软件(含解密程序)DISK 5单晶软件zrasmov.exe 结构分析dirdif99.zip 晶体结构分析XTAL_GX.zip 晶体结构分析gsaskit.exe 单晶结构程序(新版)Xhydex.zip (dbos.zip) 氢原子定位XHYDEX is a program written in a simple subset of Fortran (designed to be reasonably machine independe nt) which uses crystallographically determined molecular parameters to infer the positions of hydride ligands in metal cluster complexes zwingx32.zip 晶体结构解析软件包(内含注册文件WinGX-license)2001.5.7版crystals-b1170-jan02-setup.exe 晶体结构解析程序2002.1 版zthma32.zip 热震动分析For thermal motion analysis, including internal torsionpgms_ntp6.zip GAMESS -半经验计算及从头计算免费软件包topkat.exe TOPKAT DEMO 程序diva.exe 生物化学结构分析DEMO程序SWS.zip 一组DOS程序(包括对称群投点，等效点对称，点群晶面，元素周期表，衍射仿真，2D绘图，赤平投影，傅立叶变换演示，晶体习性图，晶体结构图，Rietveld仿真图，平面群，劳埃衍射仿真等16个程序，含说明)jana2000.zip jana2000 ( Version : 09/01/2002)crystinfo.zip 晶体软件nochaos.zip 用距离约束法一般位置laue.zip T his program will read a SHELX formatted .HKL file and calculate theR（int） based on F （or on F A2 as in SHELXL93） for all Laue groups.Volcal.zip 多面体体积和扭曲参数计算程序ster1_12.zip 分子键计算spg.zip Space Group Explorer（国际表空间群）atomic11.zip 元素周期表（各种有关元素的数据，物理数据，X射线参数，同位素，电子层结构等，含解破程序）labdemo2.exe 质构分析软件（demo）formula_en.zip 分子量计算虚拟现实（VRML ）及绘图工具类struvir.zip vrml 制作软件Win_xtl.zip VRML绘图（DEMO绘五个独立原子）vmt.zip The VRML Molecule ToolboxMoDL2VRML.zip 网站上用的分子结构转换软件（原代码）imwrm.zip 一组WRML 的工具xtaldraw.zip 3D VRML 生成程序im2wrl.tar.gz Convert an image to a VRML file 原代码pivoron10B3.exe vrml 插件wvSetup-21.exe 又一个VRML 插件glview.zip VRML 浏览器查件quaref.zip QuaRef creates lists of reflections for dihedral （octagonal, decagonal, dodecagonal） and icosahedral quasicrystals. It displays the Oth.layer as a static image and the the whole set of reflections in an interactive 3D viewerdraw24.zip 图形观察软件（看mol文件）setupov.zip原子轨道结构sda130.exe绘图程序tess2src.zip 原代码Tessel2 is a 3D "compiler" to produce crystal and molecular models, parametric surfaces and several forms of sphere tesse lationsopenxtal.exe Xtaldraw is an interactive computer graphics program that displays, manipulates and analyzes ball and stick, polyhedral and ther mal ellipsoid colored drawings of any crystal structure or molecule.cn3d.win32.exe 有机数据库图形显示程序Cn3D is a helper application for your web browser that allows you to view 3-dimensional structures from NCBI's Entrez retrieval servicextaldist.exe 晶体结构绘图（美国矿物学家数据库绘图draws crystal and molecular structures as ball and stick）TrueShadingdemo.zip TrueShading 1.0 is a new rendering tool for CaRIne Crystallography to create high quality graphics to be included in c ourses, posters, papers,...xpowinst.exe 绘理论衍射图is a program that plots theoretical diffraction patterns of crystalline materialscrxp.zip crystal painter v2.1 绘制3D 晶体图Prax216.exe PRAX is molecular graphics programstereo30.zip StereoNet is a program for plotting on stereonets and performing 3D analysis and recalculations.diamond21c.zip 晶体结构绘图（DIAMOND2.1c 含解密程序）patch21e.zip DIAMOND2.1c 的2.1e 升级程序mercury_1_0.exe 3d晶体结构绘图Atomwin.zip ATOMS 4.0最好的晶体结构绘图软件（李国武汉化的ATOMS windows正式版）Atdem51.exe ATOMS 5.1 晶体结构绘图软件（DEMO）ATOMS60.exe ATOMS 6.0 版（注册码QXAFK-BZNR）6.1 版OUZKB-LMXASHAPE70.exe 晶体绘图（注册码AQZ-BDNVV , AQZ-BDNWW ）Shdem60.exe 晶体晶形绘图（demo）carined.exe CaRIne Crystallography （DEMO ）晶体结构绘图lkaGus_02.exe 绘图程序texture.exe 绘极图PCM2Dzip.zip 绘分子结构图（demo）MoldaBeans1_0a.exe 分子建摸和绘图Molecular modeling and molecular graphicsmorphy98_NT（demo）.zip MORPHY is a program to perform a topological analysis as formulated by the theory of "Atoms in Molecules" （AI M） developed by Bader and co-workers [1,2,3]. It can analyze a wave function of a molecule or complex in terms of charge transfer molda65e.exe molda72a2-02-11.zip MOLDA Molecular modeling and molecular graphics文件转换convert301.zip 文件转换cif2pdb_shar.zip cif 转换为pdbpdb2cif_shar.zip pdb 转换为cifConvX.exe 文件格式转换csdshl.zip 剑桥结构数据库FDAT转换为SHELX格式（原代码）。