基因诊断与基因治疗培训课件
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Northern法可用于检测组织细胞中总RNA或mRNA
1/14/2021
基因诊断与基因治疗
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(3)斑点杂交或狭缝杂交法:
基本过程: 将变性的DNA或RNA直接点到固相支持滤膜上→ 用标记探针与之杂交→自显影或显色反应→检测杂 交信号→分析结果。
优点:
简便、快速、灵敏、样本用量少;
缺点:
特异性不高,有一定比例的假阳性。
DNA-DNA RNA-DNA 三类杂交 RNA-RNA 该法优点: 不需提取核酸,故可完整保持组织或细胞的 形1/1态4/202,1 因而更能准确基地因诊反断与基映因治组疗 织细胞的功能状态16。
(二)聚合酶链反应(PCR,polymerase chain reaction)技术
PCR是体外基因扩增技术。它利用体内DNA复制的
A
B
持 物
片断A 检测探针
本法优点: 1/14/2特021 异性强,对样本基因纯诊断与度基因要治疗求不高,定量较准1确5 。
(6)原位杂交(nucleic acid hybridization in situ)
将标记探针与细胞或组织切片中的核酸进行杂交, 进而检测特异的DNA或RNA序列。
细胞原位杂交 有 组织切片原位杂交
本章讨论二大方面内容
基因诊断 基因治疗
1/14/2021
基因诊断与基因治疗
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第一节 基 因 诊 断
一. 基因诊断概念 : 利用现代分子生物学和分子遗传学
的技术方法,直接检测基因结构及其表 达水平是否异常,从而对疾病作出诊断 的方法。
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基因诊断与基因治疗
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二. 基因诊断特点:
针对性强,特异性高 检测灵敏度和精确性高 实用性强,诊断范围广
菌落杂交(colony hybridization)
夹心杂交法(sanwich hybridization)
原位杂交(nucleic acid hybridization in situ)
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(1) Southern 印迹杂交法 (Southern blotting )
进行杂交反应;
• 固相杂交: 待测核酸样本先结合到固相支持物上,再与溶
液中的特异性探针进行杂交反应。
常用固相杂交支持物:
硝酸纤维素膜、尼龙膜等---
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• 2.核酸分子杂交(固相杂交)操作程序
制备待测核酸样品 分离、变性、转移、固化DNA片段
预杂交
制备核酸探针 标记核酸探针 加入标记核酸探针
3’ T A C G G C
DNA:RNA
5’ A T G C G T A 3’ U A C G C A U
RNA:RNA
5’ A U G C U A C G 3’ U A C G A U G C
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利用核酸双链的碱基互补、变性和复性的原理, 可以用已知碱基序列的单链核酸片段作为探针,与待 测样本中的单链核酸互补配对,以判断有无互补的同 源核酸序列的存在。
核酸探针
是指带有标记的某一特定DNA或RNA片断,能与 待测样本中单链核酸分子互补配对结合,进而检测同 源序列。
探针标记物
有放射性核素或非放射性核素(生物素、地高辛、
荧光素等)两大类。
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• 1.核酸分子杂交的分类
• 液相杂交: 待测核酸样本与特异性探针同时溶于杂交液中
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(1)DNA模板的变性
将待扩增DNA加热到950C左右,使双链DNA解开成 为单链(即:使模板DNA或延伸后的双链DNA发生热变性 ), 并游离于反应体系中作为模板;
(2)模板与引物的结合(退火或复性)
Байду номын сангаас
将体系温度降至合适温度(550C左右),使加入
的引物与模板DNA两端(3ˊ端)碱基序列互补结合。
原理和DNA变性与复性的性质进行目的基因DNA的大量 扩增。
1. PCR基本原理:
PCR技术在模板、dNTP、Mg2+等条件下,用耐热 的Taq酶代替DNA聚合酶,用合成的DNA引物代替RNA引 物,经过DNA变性、引物与模板结合(复性)和延伸3 个步骤的循环过程(2530个循环),目的DNA可扩增 100万倍以上。
杂交
漂洗去除未参与杂交的标记探针
检测杂交信号
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3. 常用固相核酸杂交方法
Southern 印迹杂交法(Southern blotting )
Northern 印迹杂交法(Northern blotting )
斑点杂交或狭缝杂交法 (Spot/ Slot blot hybridization)
碱基互补 变性:
DNA与DNA杂交: A=T、 G≡C ; DNA与RNA杂交: A=U、 G≡C ;
在一定温度下,使核酸双链解开为两条单链;
复性:
随温度逐渐恢复,变性的两条单链重新形成互补双链
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hybridization • DNA:DNA 5’ A T G C C G A T
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三. 基因诊断常用技术方法
核酸分子杂交技术 聚合酶链反应(PCR)技术 生物芯片 基因测序
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(一)核酸分子杂交技术
核酸分子杂交
是指单链核酸分子(DNA或RNA)在特定条件下, 与另一条互补的特异核酸链形成稳定双链的过程。
主要依据: 碱基互补、变性和复性
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(4)菌落杂交(colony hybridization)
该法可从大量细菌中筛选含特异的DNA序列及基因工程重组体。
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(5)夹心杂交法(sanwich hybridization)
RE
RE
A
B
A
B
固
片段B捕捉探针
相 支
限制性内切酶酶切 提取DNA
检测杂交信号
Southern 法可用于检测特异的DNA序列片断、
基因定位、分子量测定等。
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(2)Northern 印迹杂交法 (Northern blotting )
(其基本过程类似于上述Southern法)
提取RNA样本→RNA变性→琼脂糖凝胶电泳分离→ 转移至膜→探针(标记DNA或RNA)与之杂交→显影 或显色→检测信号。
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(3)斑点杂交或狭缝杂交法:
基本过程: 将变性的DNA或RNA直接点到固相支持滤膜上→ 用标记探针与之杂交→自显影或显色反应→检测杂 交信号→分析结果。
优点:
简便、快速、灵敏、样本用量少;
缺点:
特异性不高,有一定比例的假阳性。
DNA-DNA RNA-DNA 三类杂交 RNA-RNA 该法优点: 不需提取核酸,故可完整保持组织或细胞的 形1/1态4/202,1 因而更能准确基地因诊反断与基映因治组疗 织细胞的功能状态16。
(二)聚合酶链反应(PCR,polymerase chain reaction)技术
PCR是体外基因扩增技术。它利用体内DNA复制的
A
B
持 物
片断A 检测探针
本法优点: 1/14/2特021 异性强,对样本基因纯诊断与度基因要治疗求不高,定量较准1确5 。
(6)原位杂交(nucleic acid hybridization in situ)
将标记探针与细胞或组织切片中的核酸进行杂交, 进而检测特异的DNA或RNA序列。
细胞原位杂交 有 组织切片原位杂交
本章讨论二大方面内容
基因诊断 基因治疗
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第一节 基 因 诊 断
一. 基因诊断概念 : 利用现代分子生物学和分子遗传学
的技术方法,直接检测基因结构及其表 达水平是否异常,从而对疾病作出诊断 的方法。
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二. 基因诊断特点:
针对性强,特异性高 检测灵敏度和精确性高 实用性强,诊断范围广
菌落杂交(colony hybridization)
夹心杂交法(sanwich hybridization)
原位杂交(nucleic acid hybridization in situ)
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(1) Southern 印迹杂交法 (Southern blotting )
进行杂交反应;
• 固相杂交: 待测核酸样本先结合到固相支持物上,再与溶
液中的特异性探针进行杂交反应。
常用固相杂交支持物:
硝酸纤维素膜、尼龙膜等---
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• 2.核酸分子杂交(固相杂交)操作程序
制备待测核酸样品 分离、变性、转移、固化DNA片段
预杂交
制备核酸探针 标记核酸探针 加入标记核酸探针
3’ T A C G G C
DNA:RNA
5’ A T G C G T A 3’ U A C G C A U
RNA:RNA
5’ A U G C U A C G 3’ U A C G A U G C
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利用核酸双链的碱基互补、变性和复性的原理, 可以用已知碱基序列的单链核酸片段作为探针,与待 测样本中的单链核酸互补配对,以判断有无互补的同 源核酸序列的存在。
核酸探针
是指带有标记的某一特定DNA或RNA片断,能与 待测样本中单链核酸分子互补配对结合,进而检测同 源序列。
探针标记物
有放射性核素或非放射性核素(生物素、地高辛、
荧光素等)两大类。
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• 1.核酸分子杂交的分类
• 液相杂交: 待测核酸样本与特异性探针同时溶于杂交液中
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(1)DNA模板的变性
将待扩增DNA加热到950C左右,使双链DNA解开成 为单链(即:使模板DNA或延伸后的双链DNA发生热变性 ), 并游离于反应体系中作为模板;
(2)模板与引物的结合(退火或复性)
Байду номын сангаас
将体系温度降至合适温度(550C左右),使加入
的引物与模板DNA两端(3ˊ端)碱基序列互补结合。
原理和DNA变性与复性的性质进行目的基因DNA的大量 扩增。
1. PCR基本原理:
PCR技术在模板、dNTP、Mg2+等条件下,用耐热 的Taq酶代替DNA聚合酶,用合成的DNA引物代替RNA引 物,经过DNA变性、引物与模板结合(复性)和延伸3 个步骤的循环过程(2530个循环),目的DNA可扩增 100万倍以上。
杂交
漂洗去除未参与杂交的标记探针
检测杂交信号
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3. 常用固相核酸杂交方法
Southern 印迹杂交法(Southern blotting )
Northern 印迹杂交法(Northern blotting )
斑点杂交或狭缝杂交法 (Spot/ Slot blot hybridization)
碱基互补 变性:
DNA与DNA杂交: A=T、 G≡C ; DNA与RNA杂交: A=U、 G≡C ;
在一定温度下,使核酸双链解开为两条单链;
复性:
随温度逐渐恢复,变性的两条单链重新形成互补双链
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hybridization • DNA:DNA 5’ A T G C C G A T
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三. 基因诊断常用技术方法
核酸分子杂交技术 聚合酶链反应(PCR)技术 生物芯片 基因测序
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(一)核酸分子杂交技术
核酸分子杂交
是指单链核酸分子(DNA或RNA)在特定条件下, 与另一条互补的特异核酸链形成稳定双链的过程。
主要依据: 碱基互补、变性和复性
1/14/2021
基因诊断与基因治疗
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(4)菌落杂交(colony hybridization)
该法可从大量细菌中筛选含特异的DNA序列及基因工程重组体。
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(5)夹心杂交法(sanwich hybridization)
RE
RE
A
B
A
B
固
片段B捕捉探针
相 支
限制性内切酶酶切 提取DNA
检测杂交信号
Southern 法可用于检测特异的DNA序列片断、
基因定位、分子量测定等。
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基因诊断与基因治疗
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(2)Northern 印迹杂交法 (Northern blotting )
(其基本过程类似于上述Southern法)
提取RNA样本→RNA变性→琼脂糖凝胶电泳分离→ 转移至膜→探针(标记DNA或RNA)与之杂交→显影 或显色→检测信号。