第四章基因工程制药

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源。
噬菌体遗传学
细菌抗药性遗传学 限制酶的发现 DNA合成与修复 细菌基因 调节研究 外源DNA 插入载体 哺乳动物表 达载体 细菌表达载体 构建基因文库
噬菌体载体
质粒载体
动物病毒学
反转录病毒 和反转录酶 mRNA结构与 代谢的研究
大规模的蛋白合成 克隆特定 的基因
制备探 针
寡核苷酸合成 蛋白序列分析
Culture Engineering Bacterium
Identification Finished Products
Separate and Purify the Products
Make up or Packaging
基因工程药物的上游技术:
1、基因克隆载体:质粒载体, 2、重组DNA技术的有关工具酶及其应用 3、核酸制备技术:制备纯净、高质量的 载体DNA和待克 隆的 核酸,才能有效地进行后续的酶切、反转录、连接等 分子克隆操作。 1)用碱抽提法分离质粒DNA 原理:细胞pH12.0-12.6线状DNA变性,cccDNA不变性,加酸 恢复pH到中性,变性的染色体DNA交织成网而沉淀,上清 用酚处理使蛋白变性,用醇沉淀质粒DNA。 A)质粒DNA的小量制备 B)质粒DNA的大量制备
T10 Expression in Eukaryotic Cells
1
2
3
1
2
3
Fig. 2A
Fig.2B
Fig. 2A pCMV/myc-T10 expressed in 293T cells. Lane1: Mr; Lane2: negative control; lane3: expressed T10 protein. Fig. 2B pCMV/myc-T10 expressed in 293T cells. Lane1: Mr; Lane2: negative control; lane3: expressed T10 protein.
5、将重组体导入host cell 6、cDNA library identification 7、目的cDNA 克隆的分离和鉴定 (限制酶图谱的绘制、杂交分析、基因定位、基因测 序、确定基因的 转录方向、转录起始点等。)
二、化学合成法
较小的蛋白质和多肽的编码基因可以用人工化学合成 法获得。化学合成法有个先决条件是:必须知道目的基 因的核苷酸排列顺序,或知道目的蛋白质的氨基酸顺序, 再按相应的密码子推导出DNA的碱基系列。
小鼠胚胎学
DNA序 列分析 插入生殖细胞 定点突变改 变基因结构 功能分析 序列分析
RNA序 列分析
9.基因工程的诞生与及其相关学科的关系
“863”高技术计划在生物技术领域研究的三个主
题之一是:新型药物、疫苗和基因治疗,重点是 利用现代生物技术手段,开发化学合成法难以生 产的药品。
“十五”期间,863计划选择了信息技术、生物和现代农业技术、新材料、先进制造与自动 化技术、能源技术、资源环境技术等6个高技术领域 。
7.基因工程技术的应用特点:
A、为癌症、病毒性疾病、心血管疾病和内分泌疾 病的预防、治疗和诊断提供新型疫苗、新型药物和 新型诊断试剂。 B、基因工程技术的最大好处在于它能从极端复 杂的机体细胞内取出所需要的基因,将其在体外进 行剪切拼接、重新组合,然后转入适当的细胞进行 表达,从而生产出比原来多数百、数千倍的相应的 蛋白质。
小量制备
挑单菌落接种在2ml含抗菌 素的 LB中,过夜
将1ml培养物用0.5ml 水和 Solution I 100ul 悬浮 Solution II 200ul冰浴裂解 Solution III 150ul恢复pH 酚/氯仿抽提 乙醇沉淀DNA
大量制备
用10ml过夜培养物接种500ml含抗菌 素的 LB, 37℃,振荡,使OD600为0.8 -1.0。 离心回收菌体,用50ml 水和Solution I 10ml 悬浮,加溶菌酶 Solution II 20ml 冰浴裂解 Solution III 15ml恢复pH 上清加0.6倍异丙醇,得沉淀 70%乙醇洗DNA 酚/氯仿抽提 乙醇沉淀DNA
方法:合成目的基因DNA不同部位的两条链的寡核苷
酸短片段,再退火成为两端形成粘性末端的DNA双链片 段,然后将这些双链片段按正确的次序进行退火连接成 较长的DNA片段,再用连接酶连接成完整的基因。
人工化学合成基因的限制: a. 不能合成太长的基因。最长50-60bp.只适用
于克隆小分子肽的基因。
b. 人工合成基因时,遗传密码的简并会为选 择密码子带来很大困难, 如用氨基酸顺序推测核 苷酸序列,得到的结果可能与天然基因不完 全一 致,易造成中性突变。
8.基因工程技术生产药品的优点:
a. 可大量生产过去难以获得的生理活性多肽和蛋白质,为 临床使用提供有效的保障; b. 可以提供足够数量的生理活性物质,以便对其生理生化 和结构进行深入的研究,从而扩大这些物质的应用范围;
c. 利用基因工程技术可以发现、挖掘更多的内源性生理活性
物质; d. 内源性生理活性物质在作为药物使用时存在的不足之处, 可以通过基因工程和蛋白质工程进行改造; e. 利用基因工程技术可获得新型化合物,扩大药物筛选来
3.基因工程技术最成功的成就:用于新型生物技术药物的研制
4.基因工程技术的主要工具: * Tool enzyme 工具酶:restriction enzyme, ligase, repair. * Nucleic acid and protein sequence:Basis for gene analyze and synthesis. * Transfer vector: gene transfer * Expression vector: Manufacture plant for gene replication and expression target products. Good Vectors: Ecol. ,---- High efficiency expression but glycoprotein Beer yeast , mammalian cell ----glycoprotein
5. 传统制药存在的问题:
A、材料来源困难或制造技术问题而无法付诸应用;
B、从动物脏器中提取出来,也因造价太高,或因来
源困难而供不应求;
C、由于免疫抗原等缘故,使它们在使用上受到限制。
6. 基因工程技术的特点:就是能够十分方便有效地生
产许多以往难以大量获取的生物活性物质,甚至可 以创造出自然界中不存在的全新物质。
2)染色体DNA的制备
3)真核细胞RNA的制备 4) DNA的凝胶(Agarose)电泳和 凝胶中DNA的 回收 5) SDS-PAGE电泳和 凝胶中DNA的 回收
心 肝 脾 肺 肾 胃 脑 大肠睾丸 心 肝 脾 肺 肾 胃 脑 大肠卵巢
第一节 目的基因的获得
问题:来源于真核细胞的产生基因工程药物的目的基因,为什 么不能进行直接分离?
为什么要以Fusion Protein的形式表达药物基因 许多蛋白质药物与原核生物的蛋白质融合后,能保留原有 的免疫原性。一些免疫原性弱的多肽制成融合蛋白,其免疫 原性能得到加强。用这种融合蛋白免疫动物所制备的抗体, 能够用于检测原来的多肽药物,也可用于药代动力学研究, 药物受体研究以及药物产品的检测。
制 备 基 因 工 程 药 物 的 一 般 程 序
Get Target Gene
Filtration
Bacteria Free
Construction Recombinant Plasmid
Identification
Construction Gene Engineering Bacterium
Semi-manufactured Goods
10. 基因工程药物生产的基本过程
基因工程药物的生产分为上游和下游两个阶段: 上游阶段:主要是分离目的基因、构建工程菌(细 胞)。目的基因获得后,最主要的就是目的基因的表 达。选择基因表达系统主要考虑的是保证表达的蛋 白质的功能,其次是表达的量和分离纯化的难易。 此阶段的工作主要在实验室内完成。 下游阶段:从工程菌的大量培养一直到产品的分离 纯化和质量控制。此阶段是将实验室的成果产业化、 商品化,主要包括工程菌大规模发酵最佳参数的确 立,新型生物反应器的研制,高效分离介质及装置 的开发,分离纯化的优化控制,高纯度产品的制备 技术,生物传感器等一系列仪器仪表的设计和制造, 电子计算机的优化控制等。
目的基因的获取途径: 一、逆转录法
逆转录法就是分离纯化目的基因的mRNA,再反转录成cDNA, 然后进行cDNA 克隆表达。 1、mRNA purification a.细胞内RNA的组成和含量:
DNA:95%核内,5%细胞器 RNA:75%细胞质,10%核内,15%细胞器 rRNA80-85%;tRNA10-15%;mRNA1-5%
3
GST-T10
Glutamic dehydrogenase 53 KD Glyceraldehyde-3-Phosphate 36KD
Trypsinogen
24 KD 17 KD
Fig.2 GST-T10 fusion protein expressed in BL21 induced with 1mM IPTG. Lane 1: Mr; Lane 2: Negative control; Lane 3: expressed GST-T10 fusion protein .
10mM Tris 1mM EDTA
纤维素柱纯化Poly(A)mRNA 流程图
Poly(A)mRNA
2、cDNA第一链的合成:一次好的逆转录反应可使
oligo(dT)选出的mRNA有5—30%被拷贝。
3、cDNA第二链的合成:
4、cDNA cloning:expression vector pUC
b.真核细胞mRNA 的特点及分离纯化方法。 3’-polyA(20-250AAA)-oligo(dT)
Oligo(dT) 纤维素
TTTTTT TTTTTT AAAAA TTTTTT AAAAA TTTTTT 100mM NaCl 洗脱 rRNA/tRNA Total RNA
Poly(A)--Oligo(dT)
第四章
基因工程制药
内容:
• • • • • • 1、目的基因的获得 2、基因的表达 3、基因工程菌的稳定性 4、基因工程菌的发酵 5、基因工程药物的分离纯化 6、基因工程药物的质量控制
基因工程制药的基本概念
Chapter 4 Gene Engineering for Pharmacon
1.定义
基因工程:是通过对Nucleic acid 分子的Insert, Assemble and Recombinant而实现遗传物质(germ plasm)的重新组合, 再借助Virus ,Bacterium ,Plasmid or other Vectors,将 Target gene转移到新的 Host Cell System,并使Target Gene 在新的Host cell system 进行Replication and Expression 的技术。 2.基因工程主要研究任务:Gene isolation ,synthesis , Incision(切割),recombinant ,transformation and expression. Gene Manipulation/Gene cloning/DNA recombination.
c. 费用太高。
第二节
基因表达
克隆蛋白质药物基因的一个主要目的使为了高效的表达该 基因,从而大量地获得原本难以获得的药物。
基因表达是指结构基因在生物体中的转录、翻译以及所有 加工过程。基因高效表达研究是指外源基因在某种细胞中的 表达活动,即剪切下一个外源基因片段,拼接到另一个基因 表达体系中,使其能获得既有原生物活性又可高产的表达产 物。
进行基因表达研究的主要问题是目的基因的表达产量、 表达产物的稳定性、产物的生物学活性和表达产物的分离纯 化。因此,建立最佳的基因表达体系,是基因表达设计的关 键。
GST-T10 Fusion Protein Expression
Leabharlann Baidu
1
Phosphorylase Albumin 97 KD 66 KD
2
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