免疫共沉淀(CO-IP)实验方法与操作步骤

免疫共沉淀技术原理和操作流程

体反应形成DNA-蛋白质-抗体复合体，然后沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段。
三、纯化与检测经蛋白质与DNA 解偶联，DNA片段纯化
等处理后，用PCR等方法检测DNA与蛋白质的结合情况.
注意事项
条超声波破碎条件的选择
件选
抗体量的选择
择 PCR反应条件的选择
对 Input对照
通过免疫学方法沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段
对目的片断的纯化与检测
操作步骤
一、固定在活细胞状态下，用甲醛固定蛋白质－DNA复
合物，然后用化学（微球菌酶）或者机械（超声波）的手段将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段。
二、免疫沉淀利用目的蛋白质的特异抗体通过抗原-抗
，得到相应肽列标签 4.搜索数据库分析目的蛋白相关数据进行后续研究
染色质免疫沉淀 (CHIP)
➢ 研究体内DNA－蛋白质相互作用的重要工具。它不仅可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA 片段的结合情况，还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。
CHIP原理
在活细胞状态下固定蛋白质－DNA复合物
将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段
优点和不足
优点
1.可以分离到天然状态的相互作用蛋白复合物 2.蛋白的相互作用是在自然状态下进行的，可以避
免人为影响。
缺点和局限性
1.难以检测蛋白质的低亲和力和短暂的相互作用 2.不能够确定第三种蛋白的桥联作用
应用及实例
应用领域：
免疫共沉淀实验用途非常广泛，但一般主要用于低丰度蛋白的富集和浓缩，为SDS-PAGE和 MS质谱分析鉴定准备样品。
免疫共沉淀技术
• 定义及原理 • 操作流程 • 优点和不足 • 注意事项 • 应用及实例 • 展望

Co-IP实验步骤

免疫共沉淀实验步骤：1 将转染质粒48 h后的293T细胞用冰1×PBS洗涤一次，加入1ml预冷的IP buffer裂解液（含PMSF），冰上30min裂解细胞。

2将细胞裂解液收集于1ml EP管中，在4℃12000rpm离心10 min，取上清，加入4μg 抗体于4℃振摇2h（抗体的量和振摇时间可根据抗体特异性适当调整）。

（阴性对照组为相同的种属的抗体）3 样本组和对照组中分别加入50 μl prorein A/G 树脂在4℃振摇过夜。

用IP buffer洗涤3次，每次4℃12000rpm离心5min，弃上清。

加入40μl 2×上样缓冲液。

沸水中煮10 min变性蛋白。

取20μl蛋白样品上样，在SDS-PAGE后，转移质PVDF膜，用相应抗体进行检测。

IP buffer20mM Tric-Hcl137mM NaCl10% Glycerol1% Np-401mM EDTA注意事项：（1）细胞裂解采用温和的裂解条件，不能破坏细胞内存在的所有蛋白质－蛋白质相互作用，多采用非离子变性剂（NP40或Triton X-100)。

（2）使用明确的抗体，可以将几种抗体共同使用（3）使用对照抗体：单克隆抗体：正常小鼠的IgG或另一类单抗兔多克隆抗体：正常兔IgG（4）吸取珠子的枪尖最好将口开大（剪掉尖头部分），以免损伤珠子。

(5) 确保共沉淀的蛋白是由所加入的抗体沉淀得到的，而并非外源非特异蛋白，单克隆抗体的使用有助于避免污染的发生；(6) 要确保抗体的特异性，即在不表达抗原的细胞溶解物中添加抗体后不会引起共沉淀；(7) 确定蛋白间的相互作用是发生在细胞中，而不是由于细胞的溶解才发生的，这需要进行蛋白质的定位来确定。

（8）如何选择prorein A/G 树脂见abcam IP 实验步骤。

免疫共沉淀Co-IP实验步骤

免疫共沉淀Co-IP实验步骤Co-IP实验步骤一、制备细胞样品1.10cm盘细胞用PBS清洗两次，加入1mL RIPA裂解液和10μL PMSF（100mM稀释至1mM）；2.充分混匀吹打后，冰上裂解4h，充分吹打吸入1.5mL EP管中，-80℃保存；3.取出样品，1200rpm离心10min，取上清弃沉淀，测定蛋白浓度。

二、Co-IP，拉出蛋白1.每管取出少量蛋白样（15~30μL）作为input；2.将磁珠充分混匀后，取出50μL于1.5mL EP管中，置于磁力架上，弃上清。

（有几个样品就准备几管）；3.加入200μL Ab binding&washing Buffer（可用PBST代替），加入对应抗体，加入后轻弹混匀，360°混合仪上旋转30min；4.500rpm离心使管壁液体下来，弃上清，200μL PBS清洗（旋转5min）；5.加入1000μg 蛋白样品于EP管中，轻弹混匀，旋转1h，弃上清；6.加入200μL was hing buffer（或PBST）清洗3次；7.加入100μL washing buffer 悬浮磁珠并将溶液转移至新的EP 管中；8.弃上清，加入6μL 5×loading buffer，24μL Elution buffer （或ddw，洗脱液）；9.100℃煮10min，吸取上清；10.进行WB或SDS-PAGE。

注意事项：1.标记：样品名+抗体名；2.抗体上必须标有“IP”字样，有推荐用量；3.Co-IP中pull down 抗体与WB抗体的来源（M,R）必须不同；4.PBST=PBS + 0.02% 吐温。

深层次了解免疫共沉淀(CoIP)

一、免疫共沉淀实验免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation,Co-IP），是以（抗体和抗原）之间的专一性作用为基础的用于研究（蛋白质相互作用）的经典方法。

是确定两种蛋白质在完整（细胞内生理性）相互作用的有效方法。

如果用蛋白质X的抗体免疫沉淀X，那么与X在体内结合的蛋白质Y也能沉淀下来。

区别于IP实验，CO-IP与IP只取决于检测焦点是初级靶分子（抗原）还是次级靶分子（相互作用蛋白）二实验过程1、提取蛋白。

2、在细胞裂解液中加入抗X的抗体。

3、孵育后再加入ProteinA或G（于Agarose或magneticbeads等介质上）。

若细胞中有与兴趣蛋白结合的目的蛋白，就可以形成复合物：“Y—X—抗X抗体一ProteinA或G"4、经变性、聚丙烯酰胺凝胶电泳，复合物又被分开°（xy抗原、x抗体）。

5、westernblot分析，质谱分析。

三、CO-IP特征优点：1、相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的，处于天然状态。

2、蛋白的相互作用是在自然状态下进行的，可以避免人为的影响。

3、可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。

局限性：1、可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质相互作用2、两种蛋白质的结合可能不是直接结合，有第三者在中间起桥梁作用；3、必须在实验前预测目的蛋白是什么，以选择最后检测的抗体，若预测不正确，实验就得不到结果四、实验的关键1、实验最需要注意点就是抗体的性质。

特别是多抗的特异性是问题。

2、为防止蛋白的分解、修饰，溶解抗原的缓冲液必须加蛋白酶抑制剂，低温下进行实验。

3、考虑抗体/缓冲液的比例。

抗体过少就不能检出抗原，过多则就不能沉降在beads上，残存在上清。

缓冲剂太少则不能溶解抗原，过多则抗原被稀释。

4、确定蛋白间的相互作用是发生在细胞中，而不是由于细胞的溶解才发生的，这需要进行蛋白质的定位来确定。

五、注意的问题：1、裂解液(1)、细胞裂解采用温和的裂解条件,不能破坏细胞内存在的所有蛋白质-蛋白质相互作用，多采用非离子变性剂(NP40或TritonX-100)。

免疫共沉淀Co-IP实验步骤

Co-IP实验步骤
一、制备细胞样品
1.10cm盘细胞用PBS清洗两次，加入1mL RIPA裂解液和10μL PMSF
（100mM稀释至1mM）；
2.充分混匀吹打后，冰上裂解4h，充分吹打吸入1.5mL EP管中，
-80℃保存；
3.取出样品，1200rpm离心10min，取上清弃沉淀，测定蛋白浓度。

二、Co-IP，拉出蛋白
1.每管取出少量蛋白样（15~30μL）作为input；
2.将磁珠充分混匀后，取出50μL于1.5mL EP管中，置于磁力架上，
弃上清。

（有几个样品就准备几管）；
3.加入200μL Ab binding&washing Buffer（可用PBST代替），加入对
应抗体，加入后轻弹混匀，360°混合仪上旋转30min；
4.500rpm离心使管壁液体下来，弃上清，200μL PBS清洗（旋转
5min）；
5.加入1000μg 蛋白样品于EP管中，轻弹混匀，旋转1h，弃上清；
6.加入200μL washing buffer（或PBST）清洗3次；
7.加入100μL washing buffer 悬浮磁珠并将溶液转移至新的EP管中；
8.弃上清，加入6μL 5×loading buffer，24μL Elution buffer（或ddw，
洗脱液）；
9.100℃煮10min，吸取上清；
10.进行WB或SDS-PAGE。

注意事项：
1.标记：样品名+抗体名；
2.抗体上必须标有“IP”字样，有推荐用量；
3.Co-IP中pull down 抗体与WB抗体的来源（M,R）必须不同；
4.PBST=PBS + 0.02% 吐温。

Co-IP实验

2.2.14 免疫共沉淀
2.2.14.1细胞转染
参照2.11。

2.2.14.2 细胞裂解
转染48h后裂解细胞，细胞用4℃预冷的PBS洗涤两次。

每个培养皿加入400 μL裂解液，充分裂解，用细胞刮子刮下收集细胞裂解液。

冰浴条件下超声破碎，5s×2 次，即细胞总蛋白(Total Lysate)，取50 μL 做为Western blot 的对照，其余350 μL，4℃10000 g 离心10 min，用于下面的步骤。

2.2.14.3 免疫共沉淀
1、取10 µL α-Flag beads加入1.5 mL EP管中，用裂解液漂洗2遍，5000 g离心30 s，弃上清。

2、加入350 µL 实验细胞收集的总蛋白，4℃翻转孵育2 h。

3、孵育结束后，加入约1 mL 裂解液，快速翻转混匀，5000 g离心30s，吸出大部分上清余100 µL左右，注意保护beads沉淀不被吸出。

重复此步骤15遍。

4、用无Rnase的上样扁枪头吸出所有液体，加入15 µL 0.5 mg/mL flag-peptide 洗脱液，室温放置30 min，每隔5 min轻弹试管壁振匀。

5000 g离心1 min，收集上清液。

5、再加入15 µL flag-peptide洗脱液，室温放置15 min，每隔5 min轻弹试管壁振匀。

5000 g离心1 min，收集上清到同一试管中，-80℃冻存备用或立即加入5×SDS加样缓冲液，沸水煮10 min。

免疫共沉淀Co-IP实验操作步骤

免疫共沉淀Co-IP实验操作步骤一、原理：免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。

是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。

其原理是：当细胞在非变性条件下被裂解时，完整细胞内存在的许多蛋白质－蛋白质间的相互作用被保留了下来。

如果用蛋白质X的抗体免疫沉淀X，那么与X在体内结合的蛋白质Y也能沉淀下来。

目前多用精制的prorein A预先结合固化在argarose 的beads上，使之与含有抗原的溶液及抗体反应后，beads上的prorein A就能吸附抗原达到精制的目的。

这种方法常用于测定两种目标蛋白质是否在体内结合；也可用于确定一种特定蛋白质的新的作用搭档。

其优点为：（1）相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的，处于天然状态；（2）蛋白的相互作用是在自然状态下进行的，可以避免人为的影响；（3）可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。

缺点为：（1）可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质－蛋白质相互作用；（2）两种蛋白质的结合可能不是直接结合，而可能有第三者在中间起桥梁作用；（3）必须在实验前预测目的蛋白是什么，以选择最后检测的抗体，所以，若预测不正确，实验就得不到结果，方法本身具有冒险性。

二、准备工作：预冷PBS，RIPA Buffer，细胞刮子（用保鲜膜包好后，埋冰下），离心机1. 用预冷的PBS洗涤细胞两次，最后一次吸干PBS；2. 加入预冷的RIPA Buffer(1ml/107个细胞、10cm培养皿或150cm2培养瓶，0.5ml/5×106个细胞、6cm培养皿、75cm2培养瓶)3. 用预冷的细胞刮子将细胞从培养皿或培养瓶上刮下，把悬液转到1.5EP管中，4℃，缓慢晃动15min（EP管插冰上，置水平摇床上）4. 4℃，14000g离心15min，立即将上清转移到一个新的离心管中5. 准备Protein A agarose，用PBS 洗两遍珠子，然后用PBS配制成50%浓度，建议减掉枪尖部分，避免在涉及琼脂糖珠的操作中破坏琼脂糖珠6. 每1ml总蛋白中加入100μl Protein A琼脂糖珠（50%），4℃摇晃10min（EP管插冰上，置水平摇床上），以去除非特异性杂蛋白，降低背景7. 4℃，14000g离心15min，将上清转移到一个新的离心管中，去除Protein A珠子8. (Bradford 法)做蛋白标准曲线，测定蛋白浓度，测前将总蛋白至少稀释1：10倍以上，以减少细胞裂解液中去垢剂的影响（定量，分装后，可以在-20℃保存一个月）9. 用PBS将总蛋白稀释到约1 μg/μl，以降低裂解液中去垢剂的浓度，如果兴趣蛋白在细胞中含量较低，则总蛋白浓度应该稍高（如10 μg/μl）10. 加入一定体积的兔抗到500μl总蛋白中，抗体的稀释比例因兴趣蛋白在不同细胞系中的多少而异11. 4℃缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温2h，激酶或磷酸酯酶活性分析建议用2h室温孵育12. 加入100μl Protein A琼脂糖珠来捕捉抗原抗体复合物，4℃缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温1h，如果所用抗体为鼠抗或鸡抗，建议加2 μl"过渡抗体"（兔抗鼠IgG，兔抗鸡IgG）13. 14000rpm瞬时离心5s，收集琼脂糖珠-抗原抗体复合物，去上清，用预冷的RIPA buffer洗3遍，800μl/遍，RIPA buffer有时候会破坏琼脂糖珠-抗原抗体复合物内部的结合，可以使用PBS14. 用60μl 2×上样缓冲液将琼脂糖珠-抗原抗体复合物悬起，轻轻混匀，缓冲液的量依据上样多少的需要而定（60 μl足够上三道）15. 将上样样品煮5min，以游离抗原，抗体，珠子，离心，将上清电泳，收集剩余琼脂糖珠，上清也可以暂时冻-20℃，留待以后电泳，电泳前应再次煮5min变性。

植物免疫共沉淀coip流程

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IP与CO-IP实验步骤指南：从样本处理到相互作用分析

IP与CO-IP实验步骤指南：从样本处理到相互作用分析生物药物研究中，了解蛋白质之间的相互作用对于理解细胞信号传导、疾病机制以及药物研发具有重要意义。

免疫沉淀（Immunoprecipitation，简称IP）和共免疫沉淀（Co-immunoprecipitation，简称CO-IP）是常用的实验技术，用于检测蛋白质间的相互作用关系。

本文将从样本处理到相互作用分析，为您详细介绍IP与CO-IP实验的步骤与原理。

1. 样本处理在进行IP与CO-IP实验之前，样本的处理是非常重要的。

样本可以是细胞提取物或组织提取物。

以下是样本处理的步骤：1.1 细胞培养与收集。

首先，将目标细胞培养在适当的培养基中，使其达到合适的生长状态。

然后，使用适当的方法（如洗涤、剥离或裂解）收集细胞。

1.2 细胞裂解。

将收集到的细胞进行裂解，以释放细胞内的蛋白质。

常用的裂解方法包括化学裂解、机械裂解和冻融裂解等。

1.3 蛋白质浓度测定。

使用蛋白质浓度测定方法，确定裂解后样本中的蛋白质浓度。

这可以帮助您确定用于后续实验的样本量。

2. 免疫沉淀（IP）实验步骤IP实验是通过特异性抗体与目标蛋白质结合，然后利用抗体的亲和力将目标蛋白质从混合物中沉淀下来。

以下是IP实验的步骤：图1。

2.1 抗体固定。

将特异性抗体固定在适当的固相载体上，如蛋白A/G琼脂糖或磁珠。

这些抗体将与目标蛋白质结合。

2.2 样本孵育。

将裂解后的样本与固定的抗体孵育，使目标蛋白质与抗体结合。

2.3 免疫沉淀。

通过离心或磁力分离的方法，将与抗体结合的目标蛋白质沉淀下来。

这一步骤可以去除其他非特异性结合的蛋白质。

2.4 洗涤。

洗涤沉淀后的蛋白质，以去除非特异性结合的蛋白质和其他杂质。

2.5 蛋白质析出。

将洗涤后的蛋白质从固相载体上析出，以获得纯化的目标蛋白质。

3. 共免疫沉淀（CO-IP）实验步骤CO-IP实验是在IP的基础上，通过特异性抗体结合的目标蛋白质来寻找与其相互作用的蛋白质。

核蛋白co-ip实验步骤

核蛋白co-ip实验步骤核蛋白共免疫沉淀（co-immunoprecipitation，简称Co-IP）是一种常用的生物化学实验技术，用于研究蛋白质相互作用和复合物的组成。

这篇文章将详细介绍核蛋白Co-IP实验的步骤，并一步一步回答。

第一步：制备样品和抗体在进行核蛋白Co-IP实验之前，首先需准备样品和相应的抗体。

样品可以是细胞提取物或组织提取物。

制备提取物的方法取决于研究对象和研究目的。

1. 细胞提取：培养细胞并使用细胞裂解缓冲液（通常包含盐、洗涤剂和其他增效剂）裂解细胞膜并释放细胞质和核质提取物。

2. 组织提取：将组织样品切碎，然后使用相同的细胞裂解缓冲液使组织细胞释放其细胞质和核质提取物。

抗体的选择很重要，应使用特异性高的抗体，以确保Co-IP的特异性和准确性。

第二步：预清洗蛋白质A/G琼脂糖磁珠蛋白质A/G琼脂糖磁珠是一种常用于Co-IP实验的材料，能够特异地结合免疫球蛋白G（IgG）和免疫球蛋白A（IgA）。

在开始Co-IP实验前，需要预清洗蛋白质A/G琼脂糖磁珠。

1. 将蛋白质A/G琼脂糖磁珠分配到各个离心管中，每个离心管中加入适量的洗涤缓冲液（通常为PBS或TBST）。

2. 用转磁器将蛋白质A/G琼脂糖磁珠与洗涤缓冲液充分混合，然后将管离心。

3. 弃去上清液，再次加入洗涤缓冲液，重复该步骤至少三次，以确保蛋白质A/G琼脂糖磁珠彻底清洗。

第三步：共免疫沉淀共免疫沉淀实验重点在于使用抗体结合目标蛋白质，然后将这些复合物沉淀下来。

以下是核蛋白Co-IP的步骤：1. 将预清洗的蛋白质A/G琼脂糖磁珠分配到离心管中，再加入适量的洗涤缓冲液，离心去除上清液。

2. 使用适量的抗体将其与蛋白质A/G琼脂糖磁珠结合，在室温下轻轻摇晃，使抗体充分结合到磁珠上。

3. 将待测样品加入配有抗体的蛋白质A/G琼脂糖磁珠并在常温下摇晃，使目标蛋白质结合到抗体上。

这个步骤可以持续数小时至一夜，以确保适当的结合。

4. 使用磁力架，将含有抗体-样品复合物的磁珠沉淀到管底。

co-ip方法描述

Co-IP（共免疫沉淀）是一种分子生物学实验方法，用于研究蛋白质相互作用。

它可用于确定在细胞或生物样本中特定蛋白质与其他蛋白质的相互作用。

以下是一般性的Co-IP 方法描述：1. 样本准备：-收集细胞或组织样本，并使用适当的缓冲液（如RIPA缓冲液）裂解细胞膜并释放蛋白质。

2. 预处理样品：-加入蛋白酶抑制剂和其他必要的添加剂，以防止蛋白质降解。

3. 免疫沉淀：-添加抗体（已知结合目标蛋白质的抗体）至样品中，进行共免疫沉淀。

此过程中，抗体将与目标蛋白质结合，形成抗体-蛋白质复合物。

4. 加入蛋白A/G琼脂糖：-将蛋白A/G琼脂糖或其他亲和层析介质加入到样品中。

蛋白A/G琼脂糖能够结合抗体，并将其沉淀下来，带走与抗体结合的蛋白质。

5. 洗涤：-对琼脂糖沉淀物进行多次洗涤，以去除非特异性结合的蛋白质和其他污染物。

6. 洗脱：-通过使用洗脱缓冲液，将与抗体结合的目标蛋白质从琼脂糖中洗脱出来。

7. 分析：-对洗脱的蛋白质进行进一步的分析，如Western blotting。

可以使用适当的抗体来检测与目标蛋白质相互作用的其他蛋白质。

8. 对照实验：-进行对照实验，包括使用非特异性IgG作为负对照，以评估免疫沉淀的特异性。

注意事项：-实验中要使用高质量的抗体，以确保实验的准确性和可靠性。

-应用适当的对照实验，以帮助鉴别真正的特异性信号。

-选择合适的洗涤条件，以最大限度地减少非特异性结合和背景信号。

Co-IP 是研究蛋白质相互作用的有力工具，可用于阐明细胞信号传导通路、蛋白质复合物的形成等生物学问题。

免疫共沉淀实验原理及方式

免疫共沉淀实验原理及方式免疫共沉淀（CoIP）概述及原理（Co-Immunoprecipitation，CoIP）是研究蛋白-蛋白间彼此作用的经典方式，属于的一类，常被用于鉴定特定蛋白复合物的中未知蛋白组分。

免疫共沉淀的设计理念是，假设一种已知蛋白是某个大的蛋白复合物的组成成员，那么利用这种蛋白的特异性抗体，就可能将整个蛋白复合物从溶液中“拉”下来（常说的“pull-down”），进而能够用于鉴定那个蛋白复合物中的其他未知成员。

免疫共沉淀的特点能够归纳为两点，第一是天然状态，第二是蛋白复合物。

免疫共沉淀的优势：与其他研究蛋白质彼此作用技术（如GST-Pull down、酵母双杂交等）相较，免疫共沉淀鉴定的彼此作用蛋白是在细胞内与目的蛋白发生的天然结合，幸免了人为的阻碍，因此符合体内实际情形，取得的蛋白可信度更高。

免疫共沉淀的局限性和注意事项：1. 免疫共沉淀是成立在蛋白复合物成员间彼此紧密结合的基础上，意味着松散结合的蛋白组分极可能检测不到；2. 由于蛋白质形成复合物以后，某些表位就会被掩盖，因此可能致使利用某一种pull-down抗体，不管怎么增加抗体浓度，也极少能将不到一半的目标蛋白复合物沉淀出来，如有必要最好利用多种不同抗体别离进行CoIP；3. 由于检测的是天然状态，因此在不同的时刻和不同的处置下，CoIP拉下来的蛋白复合物都可能是不同的，固然随实在验次数的增加，取得的蛋白复合物成员也会愈来愈庞大；4. 若是利用Western Blot的方式检测的蛋白复合物中的目标蛋白，那么需要在实验前进行预测，具有必然的冒险性；固然若是将蛋白复合物直接进行质谱分析就不存在上述问题，但需要取得较高纯度和浓度的蛋白复合物样品也非易事，而且本钱较高；5. CoIP鉴定取得的蛋白间彼此作用可能是直接作用也可能是间接作用，进一步区分还需要进行GST-Pull down等实验检测；6. 为了保证CoIP实验的靠得住性和严谨性，需要利用复合物的不同成员别离独立进行CoIP实验，而且结果应该能够彼此验证，因为原那么上利用复合物的任一成员进行CoIP 都会取得其他所有成员免疫共沉淀的一样操作流程（中英文对照）：1.用预冷的PBS洗涤细胞两次；Carefully wash cultured cells with pre-chilled PBS for 2 times.2. 加入预冷的RIPA裂解缓冲液（107细胞加入1ml）；Add in cold RIPA lysis buffer (1ml for 107cells).3. 用预冷的细胞刮将细胞从培育介质上刮离，并转移到干净的管中。

免疫共沉淀Co-IP

百泰派克生物科技
免疫共沉淀Co-IP
免疫共沉淀，简称Co-IP，是一种广泛应用于发现和检测蛋白质与蛋白质相互作用的技术，优点是可以分离得到天然状态下相互作用的蛋白复合物。

百泰派克生物科技提供Co-IP分析蛋白互作的服务。

Co-IP技术通过利用某一特定蛋白（诱饵蛋白）的特异性抗体间接捕获与该诱饵蛋白结合的蛋白，来鉴定天然状态下的蛋白与蛋白相互作用。

作为免疫沉淀（IP）实验技术的一种，Co-IP实验不仅可以捕获和纯化主要目标-诱饵蛋白，而且还可以捕获和纯化通过天然相互作用与诱饵蛋白结合的其他大分子。

相对于其他鉴定蛋白质互作的方法，Co-IP的优点主要是可以分离得到天然状态下相互作用的蛋白复合物。

免疫共沉淀（Co-IP）实验步骤
免疫共沉淀实验主要包括了4个步骤：1.制备蛋白质混合物（细胞裂解液或组织提取物）；2.用结合有特异性抗体的亲和珠孵育蛋白质混合物；3.通过多个洗涤步骤清除未结合的蛋白质；4.通过SDS-PAGE，蛋白质印迹或质谱（MS）分析检测相互作用蛋白。

免疫共沉淀Co-IP实验操作步骤

免疫共沉淀Co-IP实验操作步骤一、原理：免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。

是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。

其原理是：当细胞在非变性条件下被裂解时，完整细胞内存在的许多蛋白质－蛋白质间的相互作用被保留了下来。

如果用蛋白质X的抗体免疫沉淀X，那么与X在体内结合的蛋白质Y也能沉淀下来。

目前多用精制的prorein A预先结合固化在argarose 的beads上，使之与含有抗原的溶液及抗体反应后，beads上的prorein A就能吸附抗原达到精制的目的。

这种方法常用于测定两种目标蛋白质是否在体内结合；也可用于确定一种特定蛋白质的新的作用搭档。

其优点为：（1）相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的，处于天然状态；（2）蛋白的相互作用是在自然状态下进行的，可以避免人为的影响；（3）可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。

缺点为：（1）可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质－蛋白质相互作用；（2）两种蛋白质的结合可能不是直接结合，而可能有第三者在中间起桥梁作用；（3）必须在实验前预测目的蛋白是什么，以选择最后检测的抗体，所以，若预测不正确，实验就得不到结果，方法本身具有冒险性。

二、准备工作：预冷PBS，RIPA Buffer，细胞刮子（用保鲜膜包好后，埋冰下），离心机1. 用预冷的PBS洗涤细胞两次，最后一次吸干PBS；2. 加入预冷的RIPA Buffer(1ml/107个细胞、10cm培养皿或150cm2培养瓶，0.5ml/5×106个细胞、6cm培养皿、75cm2培养瓶)3. 用预冷的细胞刮子将细胞从培养皿或培养瓶上刮下，把悬液转到1.5EP管中，4℃，缓慢晃动15min（EP管插冰上，置水平摇床上）4. 4℃，14000g离心15min，立即将上清转移到一个新的离心管中5. 准备Protein A agarose，用PBS 洗两遍珠子，然后用PBS配制成50%浓度，建议减掉枪尖部分，避免在涉及琼脂糖珠的操作中破坏琼脂糖珠6. 每1ml总蛋白中加入100μl Protein A琼脂糖珠（50%），4℃摇晃10min（EP管插冰上，置水平摇床上），以去除非特异性杂蛋白，降低背景7. 4℃，14000g离心15min，将上清转移到一个新的离心管中，去除Protein A珠子8. (Bradford 法)做蛋白标准曲线，测定蛋白浓度，测前将总蛋白至少稀释1：10倍以上，以减少细胞裂解液中去垢剂的影响（定量，分装后，可以在-20℃保存一个月）9. 用PBS将总蛋白稀释到约1 μg/μl，以降低裂解液中去垢剂的浓度，如果兴趣蛋白在细胞中含量较低，则总蛋白浓度应该稍高（如10 μg/μl）10. 加入一定体积的兔抗到500μl总蛋白中，抗体的稀释比例因兴趣蛋白在不同细胞系中的多少而异11. 4℃缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温2h，激酶或磷酸酯酶活性分析建议用2h室温孵育12. 加入100μl Protein A琼脂糖珠来捕捉抗原抗体复合物，4℃缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温1h，如果所用抗体为鼠抗或鸡抗，建议加2 μl"过渡抗体"（兔抗鼠IgG，兔抗鸡IgG）13. 14000rpm瞬时离心5s，收集琼脂糖珠-抗原抗体复合物，去上清，用预冷的RIPA buffer洗3遍，800μl/遍，RIPA buffer有时候会破坏琼脂糖珠-抗原抗体复合物内部的结合，可以使用PBS14. 用60μl 2×上样缓冲液将琼脂糖珠-抗原抗体复合物悬起，轻轻混匀，缓冲液的量依据上样多少的需要而定（60 μl足够上三道）15. 将上样样品煮5min，以游离抗原，抗体，珠子，离心，将上清电泳，收集剩余琼脂糖珠，上清也可以暂时冻-20℃，留待以后电泳，电泳前应再次煮5min变性。

免疫共沉淀(Co-IP)

1免疫共沉淀一、实验原理免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP），是利用抗原A 与蛋白B 结合，通过A 的抗体（钥匙）沉淀A （锁），再利用精制的prorein A/G （钥匙链）预先结合到磁珠上，使之与含有抗原的溶液及抗体反应后，磁珠上的prorein A/G 就能吸附抗原，从而获得抗原A 与蛋白B 的复合体，之后就可以对B 进行检测，从而获得蛋白质与蛋白质相互作用的信息。

二、Co-IP 标准化操作流程样品裂解（裂解液）→样品的预纯化（normal IgG/微珠）→与目标蛋白抗体共孵育（IP 抗体、Normal IgG ）→免疫共沉淀（微珠）→微珠清洗（裂解液）→洗脱→WB 分析或其他分析（WB/一抗、二抗）（一）样品裂解 1.温和裂解（1）温和的裂解液进行裂解，常用的去垢剂成分：NP-40、TritonX-100、IGEPAL CA-630、CHAPS ；（2）成品buffer ；（3）添加蛋白酶抑制剂（防止蛋白被降解）。

2.样本制备流程（1）去掉培养基，用冰PBS 清洗一次。

2（2）去掉PBS，每个板（10cm ）中加0.5mL 冰预冷的1×细胞裂解液，在冰上孵育5min 。

（3）将所有细胞刮下，收集到离心管，置于冰上。

（4）冰浴中对样品用超声处理3次，每次5s 。

（此步骤对膜蛋白提取有较好作用）（5）4 ℃，14000g 离心10min ，将上清转移到新的离心管中，即为细胞裂解物。

（6）BCA 测定浓度。

3.注意事项（1）整个过程冰上操作。

（2）IP 样本一般建议新鲜制备并立即使用，如有需要，可保存在-80 ℃。

（二）预纯化 1.阴性对照的选择与IP 抗体同源同型（亚型）的抗体：如 Rabbit IgG ；Mouse IgG1等。

取与IP 实验等量的裂解液，使用Isotype Control 孵育；与IP 抗体孵育同时进行。

2.Isotype Control 选择3.预纯化的目的（1）减少裂解混合物中的非特异性蛋白的含量。

免疫共沉淀实验原理及详细步骤

免疫共沉淀实验原理及详细步骤研究蛋白之间相互作用必不可少的实验是免疫共沉淀(CoIP)，常被用于鉴定特定蛋白复合物的中未知蛋白组分，因其具有可信度高的优点，在现在基础医学研究中广泛应用，本文将为您详解CoIP的实验原理和操作步骤，实验刚入门的同学必看哦。

一、实验目的1)检测两种目标蛋白是否在体内相互作用;2)找到与目标蛋白在体内存在相互作用的新蛋白。

运用这项技术，说不定你会有新的发现哦!二、实验原理CoIP是利用抗原蛋白和抗体的特异性结合、以及“Protein A/G"特异性地结合抗体(免疫球蛋白)FC段的现象开发出来的方法。

目前多用Protein A/G预先结合在Argarose Beads上，使之与含有抗原蛋白的溶液(如细胞裂解液)及抗体(诱饵蛋白X抗体)反应后，Beads上的Prorein A/G就能通过抗体吸附诱饵蛋白X，诱饵蛋白X通过与靶蛋白Y相互作用将其从细胞裂解液中分离出来，从而达到免疫共沉淀的目的。

三、实验材料细胞、RIPA缓冲液(RIPA buffer)、偶联有Protein A/G的免疫磁珠(Protein A/G Beads)、诱饵蛋白X与靶蛋白Y的抗体、IgG对照抗体、移液枪、4度冰箱以及低温离心机等。

四、实验步骤(不同实验室略有差异)1) 制备细胞裂解液：收集4x107细胞，用PBS洗涤后，加入1 ml RIPA buffer(含蛋白酶抑制剂)，充分混匀，冰上裂解30 min;4℃，12000 rpm离心10 min，收集上清液。

2) 免疫共沉淀：在细胞裂解液中加入50 μl 50% Protein A/G Beads，4℃翻转混合孵育1 h进行预清除，离心后取0.5 ml上清液，加入3 μg诱饵蛋白X抗体，另取0.5 ml上清液加入等量同源的IgG抗体作为对照，4℃摇晃结合过夜;第二天每管加入50 μl 50% ProteinA/G Beads，4℃摇晃结合3 h;用RIPA Buffer洗涤5次，每次5 min。

泛素化coip免疫共沉淀步骤 -回复

泛素化coip免疫共沉淀步骤-回复泛素化co-IP（免疫共沉淀）是一种常用的实验技术，用于研究细胞中蛋白质的相互作用以及泛素修饰的机制。

在这篇文章中，我们将一步一步地介绍泛素化co-IP的操作步骤。

第一步：细胞的处理和裂解在进行泛素化co-IP实验之前，我们首先需要处理和裂解细胞。

细胞可以通过机械剪切、化学裂解剂或超声波等方法进行裂解。

这个步骤的目的是破坏细胞膜，并释放细胞内的蛋白质。

第二步：抗体的选择和固定在本实验中，我们的目标是研究泛素修饰的蛋白质。

因此，我们需要选择一种针对泛素的抗体以进行免疫共沉淀实验。

先进行预先固定泛素抗体，可选择将其与蛋白A/G磁珠/琼脂糖绑定，然后用磷酸盐缓冲液将其洗净。

第三步：抗体的交联和洗脱将固定的抗体与大肠杆菌表达的GST-泛素或HA-泛素融合蛋白质进行反应，以形成抗体-蛋白质复合物。

然后，使用交联剂将复合物固定在琼脂糖珠上。

接下来，使用酸洗脱剂洗脱非特异性吸附的蛋白质，并用洗涤缓冲液冲洗珠子。

第四步：细胞裂解物的孵育和免疫共沉淀将处理好的细胞裂解物加入到经交联的琼脂糖珠上，并进行孵育。

这样，目标蛋白质和与之相互作用的蛋白质可以与泛素抗体结合。

孵育完成后，使用洗涤缓冲液反复洗涤琼脂糖珠，以去除非特异性结合的蛋白质。

第五步：泛素化蛋白质的检测将免疫共沉淀得到的复合物进行蛋白质分析。

可以通过Western blotting 等方法检测泛素化蛋白质的存在与数量。

如果要进一步分析蛋白质相互作用，还可以使用质谱分析等方法鉴定免疫共沉淀得到的蛋白质。

第六步：数据分析和结果解读最后，我们需要对实验结果进行数据分析和解读。

通过比较实验组和对照组的差异，我们可以确定特定蛋白质与泛素修饰的相互作用。

此外，我们还可以进一步研究这些相互作用的生物学功能以及与疾病相关的影响。

总结：泛素化co-IP是一种用于研究蛋白质相互作用和泛素修饰机制的重要实验技术。

通过细胞的处理和裂解、抗体的选择和固定、抗体的交联和洗脱、细胞裂解物的孵育和免疫共沉淀、泛素化蛋白质的检测以及数据分析和结果解读等步骤，我们可以获得有关泛素化蛋白质相互作用的宝贵信息。