蛋白质的结构层次

• 结构层次的定义： 结构层次的定义：
1 一级结构：多肽链共价主链的氨基酸顺序。 一级结构：多肽链共价主链的氨基酸顺序。 2 二级结构：由多肽链主链骨架的折叠构象。 二级结构：由多肽链主链骨架的折叠构象。 3 超二级结构：二级结构单元相互聚集，形成更 超二级结构：二级结构单元相互聚集， 高一级的有规律的结构。 高一级的有规律的结构。 标准折叠单位(standard folding unit)或 标准折叠单位 或 折叠花式(folding motif) 折叠花式
ψ源自文库
允许区（ 允许区（7.7%） ） 部分允许区（ 部分允许区（<13%） ） 不允许区（ 不允许区（~80%） ）
N
O
H
φ
（二）多肽链主链的折叠
1 肽平面 肽平面(peptide plane) 二面角： 2 二面角： N–Cα（φ）和Cα–C（ψ） （ 都是单键， 都是单键，可以绕键轴自由 旋转( 除外) 旋转(Pro除外)，其旋转角 除外 度分别用φ 表示， 度分别用φ和ψ表示，称为 二面角(dihedral angle) 二面角
4 结构域： 多肽链在二级结构或超二级结构的基础 结构域： 上形成三级结构的局部折叠区， 上形成三级结构的局部折叠区，它是相 对独立的紧密球状实体。 对独立的紧密球状实体。 5 三级结构：多肽链通过盘旋、折叠，形成紧密的 三级结构：多肽链通过盘旋、折叠， 借各种次级键维持的球状构象。 借各种次级键维持的球状构象。是蛋白 质分子或亚基内所有原子的空间排布。 质分子或亚基内所有原子的空间排布。 6 四级结构：寡聚蛋白质中亚基的种类、数目、空 四级结构：寡聚蛋白质中亚基的种类、数目、 间排布以及亚基之间的相互作用。 间排布以及亚基之间的相互作用。
3
Ramachandran构象图 拉氏构象图 构象图( 拉氏构象图) 构象图
非键合原子间的 允许距离， 最小接触距离 (允许距离， 允许距离 极限距离) 极限距离
Aº º C C 3.20 (3.00) 0.27 (0.26) N O 2.80 (2.70) 0.27 (0.26) 0.24 (0.22) 0.24 (0.22) 0.24 (0.22) 0.24 (0.22) H …
一 蛋白质的结构层次
（一）结构层次: 结构层次 1 一级结构 一级结构(primary structure) 2 二级结构 二级结构(secondary structure) 3 超二级结构 超二级结构(supersecondary structure) 4 结构域 结构域(structural domain) 5 三级结构 三级结构(tertiary structure) 6 四级结构 四级结构(quaternary structure)