课题 基因敲除小鼠的pcr鉴定

基因敲除小鼠pc鉴

一、技术介绍与研究进展

敲除动物技术已经/ 基因、基因敲入转该技术从上世成为现代生命科学基础研究和药物研发领域不可或缺的重要技术，原核显史，经典技术如DNA纪七八十年代诞生以来，至今已有近四十年的历

在小鼠模型构建方面日趋微注射、胚胎干细胞显微注射技术一直以来经久不衰，制备技术一样，逐渐从完善，并且如同剪切酶和抗体等常规分子生物学试剂的

催生了数以百基础研究实验室转向商业模式，成为一项高度标准化的新兴产业，然存在一些难以计的创新药物和数以千计的优秀文章。尽管如此，传统技术仍TALEN和费用高昂等，而ZFN克服的缺陷，如步骤繁琐、周期漫长、成功率低、等新技术的出现，或有可能将这一局面彻底改变。二、同源重组技术原理同源重组的原理发展起来的，年代中后期基于DNA基因敲除鼠技术是上世纪80）homologous recombination1987年根据同源重组（在Capecchi和Smithies），这的外源基因的定点整合（EStargeted integration的原理，首次实现了），gene knockout（基因敲除）或gene targeting（基因打靶一技术称为

利用这种ES的显微注射就可以制作出基因敲出小鼠（KO Mice: knockout mice）;由于这一工作，Capecchi和Smithies于2007年与Evans分享了诺贝

尔医学奖。

同源重组（homologous recombination）定义：是指发生在姐妹染色单体（sister chromatin) 之间或同一染色体上含有同源序列的DNA分子之间或分子之内的重新组合。在基因敲除小鼠制作过程中，需要针对目的基因两端特异性片段设计带有相同片段的重组载体，将重组载体导入到胚胎干细胞后外源的重组载体与胚胎干细胞中相同的片段会发生同源重组，如图1所示：

1.基因敲除鼠制作同源重组原理示意图图制作流程

三、．

基因敲除鼠制作过程示意图图2. 载体设计与构建1. Knockout根据研究项目具体情况和要求把目的基因和与细胞内靶基因特异片段同源的的载体上，成为重

基因等TK )基因，如片段都重组到带有标记基因DNA (neo

Knockout组的载体。

2. Knockout ES细胞筛选

Knockout载体测序验证正确后，将载体线性化，然后电转入ES细胞，通过载体上的正负筛选基因获得阳性的Knockout ES克隆。选取PCR鉴定打靶载体正确插入的ES基因组DNA用于Southern Blot鉴定，将Southern Blot鉴定的Knockout ES扩大培养并液氮保存。

3. Knockout ES细胞囊胚注射得到嵌合体小鼠

扩增经鉴定插入或置换片段位置正确的Knockout ES细胞，以囊胚显微注射的方式将一定数量的Knockout ES细胞注入特定品系小鼠囊胚中，然后将囊胚移植到假孕的小鼠子宫中。待后代小鼠出生后，通过小鼠的毛色中来源于ES细胞毛色的比例判断嵌合程度的高低，以及该小鼠的后代中可能获得生殖系传递能力。

4. 由嵌合体小鼠繁殖出生殖遗传系Knockout 小鼠

将嵌合体小鼠与适当品系的小鼠交配，后代小鼠出生后，通过PCR方式检测小鼠是否含有打靶序列。如有，则该小鼠为具备生殖遗传能力的Knockout小鼠(F1代鼠)。

5. Knockout小鼠生殖系传递鉴定

将嵌合体小鼠和适当品系野生型小鼠交配，通过后代小鼠毛色或PCR基因型鉴定的方法验证嵌合体小鼠生殖系传递能力。

基因敲除常见方法四、．

一、常规基因敲除鼠（Conventional Knockout）

把需要敲除的基因的几个重要的外显子或者功能常规基因敲除是通过基因打靶，这样的小鼠其全身所有的组织和细胞中都不表达替换掉。区域用Neo Cassette 此类基因敲除鼠一般用于研究某个基因在对小鼠全身生理病理的影该基因产物。响，而且这个基因没有胚胎致死性。）Conditional Knockout二、条件性基因敲除小鼠（．

位点放到目的基因一个或几loxP条件性基因敲除小鼠是通过基因打靶，把两个酶小鼠杂交之前，其目的基因表达Cre个重要的外显子的两边。该小鼠和表达酶的小鼠进行杂交后，可以在特定的组织全正常。当和组织特异性表达Cre完或细胞中敲除该基因，而该基因在其他组织或细胞表达正常。）用于研究该2条件性基因敲除鼠适用范围为：（1）该基因有胚胎致死性；（基因在特定的组织或细胞中的生理病理功能。）Knockin三、基因敲入小鼠

（．

使把目的基因序列敲入到小鼠的相应基因位点，基因敲入小鼠是通过基因打靶，用小鼠的表达调控元件指导目的基因表达。此类基因敲入鼠一般用于药物的筛选，信号通路的研究等。获得嵌合体及之后品系纯化详细流程：

基因敲除其他方法五、技术制作基因敲除鼠一、ZFN能够识别并结合指定的基因序列位点，并高效精确地切断。随后细胞利用ZFN的插入、删除和修改，这样研究人员就能够修复过程来实现DNADNA天然的所欲地进行基因组编辑。这在过去是无法想象的，传统的基因敲除技术依随心的基因敲除效ZFN赖细胞内自然发生的同源重组，其效率只有百万分之一，而。利用这些技术进行小鼠基因的定点敲除和敲入，可以把时间从10%率能达到

一年缩短到几个月。．

这项技术中设计特异性的ZFN是最关键的环节，目前研究者采用计算生物学方法设计高特异性的ZFN，但ZFN的脱靶（off target），也就是把不该切的地方切了的问题仍是一个挑战。也正因为这个原因，利用ZFN技术进行小鼠的基因修饰还无法完全取代传统技术。

技术制作基因敲除鼠二、TALEN技术是一种崭新的分子生物学工具。科学家发现，来自一种植物细菌的TALEN

蛋白的核酸结合域的氨基酸序列与其靶位点的核酸序列有恒定的对应关系。TAL 序列的模块化蛋白，从而的序列模块，可组装成特异结合任意DNA利用TAL 方法不能识别任意目标基因序ZFN达到靶向操作内源性基因的目的，它克服了相等或更好的灵ZFN而具有列经常受上下游序列影响等问题，以及识别序列，活性，使基因操作变得更加简单方便。然而同样因为脱靶的问题，利用TALEN 技术进行小鼠的基因修饰仍然无法取代传统技术。

六、常见问题与解答细胞显微注射？ES什么是1.

答：胚胎干细胞显微注射是制作基因敲除小鼠的一个最常用的方法。主要过程是将携带目的基因的胚胎干细胞注射到小鼠的囊胚腔中获得嵌合体小鼠。所得嵌合